4Z2GA

Serratia marcescens chitinase b complexed with macrolide inhibitor 26
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Creation of Customized Bioactivity within a 14-Membered Macrolide Scaffold: Design, Synthesis, and Biological Evaluation Using a Family-18 Chitinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase B
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Serratia marcescens
total genus 156
structure length 498
sequence length 498
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 4z2gA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4z2gA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4z2gA01
1O7AA 4L4PA 4PUDA 2BHZA 1EHAA 2RTSA 2CXGA 5EB8A 4HMEA 1O6IA 1HP5A 1Q6EA 4JAWA 3N13A 5BYWA 2UY5A 1OINA 3AHYA 3AMDA 5TD4A 4AMCA 3E1F1 3VVGA 4PMZA 1JZ3A 2VVNA 4AY1A 3NSXA 1KBKA 4Z2HA 1CGTA 2GK1B 1GQJA 1KQYA 4KRTA 1D7FA 3BMWA 2BY3A 1K9EA 1AQHA 1JNEA 4MJ4A 3UG3A 3VIFA 2IUZA 2JIEA 2PWFA 3ZJKA 4H41A 1HJXA 5DT5A 1H49A 1E71M 1I1WA 1JNDA 1J10A 2J79A 3IJ8A 3VIJA 2GFTA 3F5JA 4CCEA 3MUZ1 1JZ7A 3K46A 5D8ZA 1A47A 3VINA 3IJ7A 2XGBA 2WVVA 4PTXA 2PB1A 2VOTA 1VFOA 3VNZA 1JDCA 4MDPA 2ZX9A 4Z2LA 3VMOA 3AXIA 2WK2A 3B9DA 4RE2A 1EHNA 1W1VA 2EQDA 3VIIA 1HJQA 3EYPA 1UD3A 4XZWA 1GONA 1UZ4A 1FFRA 4KRUA 2Y5EA 2JF7A 1GVYA 2DSVA 2X09A 4HA4A 1E6XM 4W7UA 2QMKA 4LYQA 2A3AA 3UERA 1VAHA 1VEPA 1BHGA 1EH9A 4P7OA 1ZBCA 3SUWA 1DTUA 4PUEA 1UYQA 1US3A 3WUEA 1JYXA 2XWDA 1GQLA 3OGVA 5ECUA 2GDUA 2CKRA 1FFQA 2CYGA 3NIYA 2PWDA 3ZJ6A 1V03A 1J0HA 3AICA 5ABEA 1C8QA 1JYNA 3O9NA 4R5EA 1UG6A 3B8SA 3CPUA 2GJRA 3VX1A 3MSGA 4YHGA 2VRJA 1CGVA 1CNVA 3IK2A 3M7SA 1E1EA 3FY1A 3BCDA 1H41A 3WMBA 1MQQA 1UUQA 3SUSA 6CGTA 2OWXA 3PZ9A 2D0FA 3BMVA 3AXHA 1AVAA 1NWUA 1DWFM 1UR2A 4HOZA 3AIEA 4AZBA 1R87A 1JYVA 3MS8A 3CO4A 2XVPA 1ZBWA 1SFSA 4CU6A 5A6MA 1JDDA 2XYLA 4DWSA 3JUGA 3SCQA 5DF0A 1J0ZA 1QVBA 3N18A 3T0AA 3WEOA 2JFEX 1VFUA 3PZQA 1CECA 3SCRA 3UR7A 4W8LA 7CGTA 1KXTA 2DIJA 3A4XA 4AIOA 4BF7A 3VGEA 2EPMX 1EDGA 4HOXA 4AEEA 3A4WA 3IAPA 3WQ4A 1V0LA 1W2PA 1MW1A 4R27A 1WDSA 1UKPA 1UKOA 2J7DA 4KH2A 1XYFA 2BHYA 1HN1A 1UR4A 2W67A 1E6RA 1NP2A 4XZBA 4D6IA 3GDBA 3AIBA 4CD6A 1E0XA 4JHOA 1XV8A 3SCSA 3ARRA 1JZ6A 4FLQA 3WD1A 1M53A 3CHEA 2WC7A 1EQPA 4CD5A 5JBDA 1ITXA 1ECEA 2ZE0A 4AIUA 2DH3A 1NP0A 2GJXB 1AMYA 2WLZA 1C90A 3K8KA 1CXHA 5A6JA 3ALFA 4S3JA 3SIMA 1FH7A 2BXYA 2VQUA 2D2OA 5A8QA 3AS1A 1EOKA 4D6FA 4PMYA 4AISA 1XH1A 1J0JA 1R7AA 8A3HA 1UQYA 4HU8A 2Z1SA 1QNRA 1OT1A 2YA1A 5HDRA 1VFMA 2D1ZA 4QLKA 3J7HA 4AZIA 5C70A 2OYLA 2OLHA 4TVUA 2BFGA 1V3JA 3WH9A 1HIZA 1M04A 2WVTA 4JFWA 2WMIB 2XTKA 3APGA 1PIFA 2BV9A 2IXVA 3K4AA 2NT1A 2VUYA 1KGUA 3GH4A 3IJ9A 2WPGA 2F61A 2YBUA 5FL1A 2GSJA 3GH5A 1R8LA 2V38A 2YLLA 3QHMA 3EMQA 3QOKA 5BXRA 3WMCA 4E8CA 2Y24A 4PMRA 1J0IA 4AYSA 1QHZA 4PMNA 1XSJA 4JL2A 4S3KA 4BQ3A 2WM0A 2C8NA 3QHNA 5E09A 5FOOA 5CPSA 4BQ2A 5I78A 2VT0A 2W92A 4P8UA 2ZUSA 3VUPA 4JCLA 1EXPA 2QV4A 3BSGA 1FP8A 3OB8A 5A6BD 1GJWA 1CYGA 3OZPA 5IFPA 3A6OA 3BAIA 4PMUA 2CBUA 2YBTA 3OLIA 4YN5A 2D0HA 3OIHA 5BXSA 1TR1A 1IT0A 2WCSA 3A4AA 3WDIA 3VIGA 1GCYA 4AZ7A 3AMLA 5I6SA 4TX8A 1CXFA 4QLLA 1NARA 1XH2A 1G9HA 1ZU8A 3VNYA 2E9LA 4BS0A 2DIEA 4QFUA 1D3CA 4HZ7A 4JHZA 1JD9A 1QW9A 2DT3A 2YJQA 1CXIA 2CETA 3EMCA 4IUGA 4CD4A 5F7UA 1JF5A 4C7DA 3ARSA 2CHNA 3THCA 5E9AA 1VRXA 4OOUA 9CGTA 4C7GA 5CG0A 3L4TA 1KWGA 3DHPA 4DWSC 2WVVB 2HVMA 1NOUA 4UR9A 4F66A 2FGZA 4Q7NA 3ARPA 1WZAA 1N82A 2F8QA 3POHA 4M81A 4BQ4A 4OBSA 2Y2WA 1FH8A 3ZJ7A 1JZ4A 5CQ1A 4H04A 5GNZA 4AZ5A 2A3BA 1B3XA 4ZEPA 1GJUA 3AHVA 5A8PA 1C8YA 2WHJA 1BSIA 5I79A 2IXUA 2QPUA 4MNKA 1DWIM 5A3HA 1CXKA 1PIGA 2ZUWA 2OYMA 2ZWZA 5A8OA 2QF8A 4PMQA 4X0VA 3RJYA 3BAWA 2XJ7A 2WMJA 3HJEA 1BLIA 4EK7A 1LQ0A 1OT2A 1CLVA 1NQ6A 5DMYA 3SURA 3WN6A 1TZ7A 3UEQA 1AQ0A 2D24A 2CIPA 3GTNA 1E6NA 1I75A 3CHFA 2W66A 3U57A 3VD7A 2EO7A 5CPTA 1VF8A 3RM9A 2W61A 3SCWA 4UZUA 1R7OA 4M24A 4M80A 1E4NA 3T0BA 3G6LA 2X8RA 1BG9A 3EMZA 4OZOA 1XSIA 3GXMA 3QR3A 1BAGA 1OSEA 2VR4A 5AYBA 1PJ9A 4AZCA 1B0IA 3ZJ8A 2DT0A 2WBKA 3VX0A 4J3UA 3SUVA 5CSYA 3WDJA 4D6JA 2X05A 1E15A 3CUFA 3CZJA 1OGSA 2GVYA 2VZTA 1GHRA 5AYIA 3MMWA 2GUYA 1LWHA 2WC3A 4A3YA 1NM9A 3AS0A 1HVQA 4V27A 3VIPA 1W32A 3DC0A 4DWSB 1JYWA 1VBRA 4FK9A 3BGAA 1E4LA 1DP0A 3PZMA 4UOQA 3ZM8A 4QCFA 1GQIA 1UR8A 3BSHA 1KXVA 4QLJA 3RM4A 5HBFA 4AD0A 3AZSA 4MB4A 2DT2A 2RGLA 4CCDA 1RP9A 2Y4SA 3ZOAA 1UOKA 3WL1A 3VD4A 3WNPA 3VMNA 1UD4A 2UY2A 1VIWA 2XFRA 2V3FA 2A3HA 3ECQA 4AWEA 3ALGA 1R85A 2YL6A 3WFZA 2WSKA 5I3DA 4EE9A 1VEMA 1OB0A 3TA9A 2BY2A 4GO8A 1CGYA 4XX6A 1XGZA 2WCGA 1ZJBA 2V3GA 3LPOA 4LPCA 2XIBA 1OCQA 3ZMRA 1WPCA 4CD8A 3NDZA 3UETA 1VFFA 5CGMA 2J7GA 2YIHA 2CEQA 2VQTA 1XCXA 2D3NA 2VURA 1V0MA 3SUUA 2WLYA 1UD8A 1HF6A 1PX8A 4M29A 3TTOA 2DGAA 4HOWA 3CUJA 4AD4A 1PX4A 3T2QA 2XFFA 2J78A 3LPFA 3ARUA 4JKKA 1JIBA 1UKQA 1FHDA 1UH2A 4H2CA 3VILA 5BWFA 1V6XA 4TTUA 1CXEA 1MQPA 1W1TA 1V3HA 4PCTA 3ZT7A 1W3KA 3CMJA 2VR5A 3FN9A 4WSJA 4PTMA 1FOBA 2PWEA 1W9VA 4W8BA 1TE1A 1G0CA 2YL8A 2QPSA 2DSUA 4ML4A 3VDHA 4GKLA 3VDAA 2OSXA 1E1FA 3SCNA 1NWTA 1A3HA 4ZE5A 1VJZA 1YHTA 4RL3A 5M3WA 3RJXA 3D3AA 4HZ8A 1JAKA 3RM8A 1WAWA 3WBEA 1JDAA 4B9YA 5HXMA 3I3EA 4NRSA 1ZBKA 5IDIA 2DQXA 2E9MA 3WD4A 5A8MA 4UFJA 2BVYA 1OWQA 3SCOA 3W82A 4PN2A 1UZ1A 3AS2A 8CGTA 4FMVA 4U5IA 3VD5A 3PN8A 4W5ZA 3W37A 3K8LA 3W29A 4Z2IA 2D23A 3CLWA 3CIVA 4W5UA 5I0DA 4PTWA 5A6SA 2PF0A 3CHDA 3AIQA 3TTSA 3ARZA 3N12A 1SR0A 4UQEA 4TXEA 3GBEA 3AMCA 1BPLB 1UD5A 1U2YA 2XVLA 1GZJA 3CUIA 5DFAA 4WIWA 3PZIA 1MW3A 1LG1A 2QLYA 2TAAA 5A8NA 1E4IA 3ARVA 1KWKA 4GZEA 4KGJA 3KZSA 2W62A 4BA0A 1JI2A 5E6ZA 2GJPA 1MW2A 4MDOA 2ZXQA 1H0IA 2Z1KA 1GHSA 1HVXA 2VZOA 5CLTA 1RH9A 2J75A 4GI9A 1H0GA 2CPUA 1EO5A 2FHBA 2J7FA 1Q6CA 3CH9A 1ISVA 4W89A 2OWWA 2WKLA 3VIOA 1KGWA 1U30A 2WHLA 3SCTA 4ACZB 1PPIA 4U3AA 3LMYA 4E2OA 1RPKA 3BXWA 1MW0A 2XFYA 2YA2A 3RPMA 1X1NA 2VZUA 2WC4A 3SCUA 1QW8A 1CGUA 2BVDA 3WH8A 2VX6A 5A6KA 4MTVA 3SEPA 1E5JA 4NI3A 5E70A 3L2LA 2Y8VA 4PMVA 3WH6A 4NZCA 4U33A 1BGGA 1IZKA 1HT6A 1W9DM 4UFHA 1Q6FA 3OLDA 3W24A 3CZEA 1HJVA 5M17A 4CKQA 3MV11 1MFUA 4GZIA 4J27A 1CDGA 4CN4A 1MFVA 3PZGA 5CZKA 1TUXA 4AZCB 1XH0A 4PSPA 3GZAA 1AQMA 5AC5A 2ZXBA 1KQZA 4KWUA 3ZT6A 1QI3A 1WE5A 1LWJA 4HMCA 4HTYA 3FXYA 3WDRA 4UCFA 1W3HA 2O9PA 1B1YA 1JXKA 4WKFA 1XRVA 1B3ZA 7TAAA 4QCEA 1QHOA 4Q22A 2VX5A 5JH8A 5JIPA 4RE3A 1UR1A 3AI0A 4MB1A 3N11A 4V28A 1W2VA 3L2MA 4J7RA 1WB0A 5CPQA 1K9TA 2VVSA 4PBGA 3AMGA 2QHAA 2CHOA 2BY0A 1TVPA 1JFXA 2JE8A 2CBVA 1E6QM 4WLCA 1V0NA 1E70M 3FAXA 1XC6A 4ACYA 3W4RA 1XD1A 2VRKA 5BRPA 1NOFA 3WNMA 3WDQA 1SMAA 4M56A 1GOKA 5BRQA 2ZIDA 4LX4A 4XV0A 1E56A 1UA3A 3L4WA 2O9RA 1CLXA 3KL0A 1OIFA 3WUGA 1DWJM 2ZX5A 3CTTA 4U2ZA 3K8MA 3CBWA 4IPLA 2XSBA 1GOIA 4PMXA 3VGBA 3TTQA 4PYSA 2J4GA 1WCGA 2BY1A 1Q4NX 3MU7A 1HKKA 1V6UA 4GQQA 3L4ZA 1WZLA 2VI0A 3PTMA 4E4PA 1B2YA 2W63A 3ZSSA 1FHLA 3F5LA 4GO9A 3OZOA 4W93A 3BLPX 2JALA 4GI8A 4JKMA 2BHUA 1OGGA 3NJ3A 4M1RA 1K9FA 2XG9A 1X6LA 1GORA 5I23A 5CJ5A 2D49A 2VZVA 2WWDA 4UQCA 1J9YA 4ZFMA 4WSKA 2XVGA 1LLOA 2DDXA 3VD9A 2A3EA 2FH6A 4L4OA 1B3WA 1HL9A 1W9PA 2VL4A 3OGSA 1QI2A 2CESA 5JBEA 2W5FA 7A3HA 4WJXA 1UWRA 3WL0A 4UQBA 1DWAM 1QI4A 4TVCA 2PI6A 3POCA 4CN1A 3PTQA 3CUGA 1M7XA 3LPGA 3PHAA 5E0FA 4Y7EA 3AIWA 1WP6A 4TOQA 2W4XA 3UG5A 2PWHA 5A6LA 2E4TA 2J7CA 1C7SA 3VPLA 1PAMA 3ARYA 1GOWA 4W84A 3TONA 4DM1A 1TG7A 2ZX8A 1WDQA 5A6BA 1C91A 3ARWA 1J11A 3NDYA 1XCWA 1Q6GA 2EXOA 3AIRA 3KE0A 2O9TA 1E0VA 3T2OA 2V5CA 1E73M 4JCMA 1G5AA 3AQUA 4FLSA 1HKIA 3AXXA 4GPNA 2ZXAA 4GXPA 3WH7A 3SCVA 3DYOA 5FIPA 4FLRA 1EIBA 4OIFA 4QDMA 3RCNA 4Z2JA 4C7FA 1KR1A 1W3JA 4TVDA 3WNLA 2BNJA 2EPNA 1YQ2A 1HNYA 3AISA 5D9NA 2EPLX 3TOPA 3U7VA 4U31A 4MAVA 4LYRA 1B9ZA 5EFDA 3WQ6A 4A4AA 4CD7A 1GUVA 4J3WA 4KMQA 3RDKA 2HISA 5FKYA 1BVZA 1BG4A 4QAWA 3WQ5A 5LA2A 1MXGA 1K6AA 2JEQA 1D2KA 2C7FA 3UR8A 3VGFA 4ACZA 4J3XA 4H8VA 2XVNA 3MMUA 1FH9A 4RE4A 2FHFA 3WKZA 2J62A 5CLWA 2OSYA 1JI1A 1KBBA 5D9MA 5HOSA 4JIEA 3VU2A 3NUKA 2QMJA 3LPPA 1G01A 4UOZA 1CXLA 5IXEA 4AC1X 1CGXA 1HP4A 2XGIA 3UCQA 3W27A 5DEZA 3PZTA 1JZ2A 3VGHA 2WHMA 5C71A 3HU7A 1E0WA 5HPCA 1JFHA 1KCLA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3U8G A;  3TNO A;  1YU4 A;  2HVN A;  4ZXL A;  3W7C A;  5KZ6 A;  4DM2 A;  3IV3 A;  2R94 A;  3AJX A;  1KFE A;  2OYK A;  3HB9 A;  3OLE A;  4UR7 A;  1R86 A;  3AWN A;  4NAF A;  2FYM A;  2PF8 A;  1OFO A;  3EY6 A;  2I9U A;  8TIM A;  1OVD A;  1TKK A;  2X0Y A;  1TJP A;  1DIO A;  4IBB A;  4MB3 A;  4LW7 A;  1FWC C;  1XIN A;  3MSY A;  4IT6 A;  3T08 A;  4LAO A;  5HJY A;  4DXK A;  5T91 A;  1FWB C;  4LU0 A;  5IHS A;  4YL2 A;  2I5Q A;  4IMC A;  3PUL A;  4PCS A;  4BWL A;  1AD1 A;  2DY3 A;  1CWY A;  2WZH A;  2DZV A;  1YNP A;  5AYY A;  4RNH A;  3TJI A;  4DBE A;  2ZR4 A;  4NU7 A;  1QBB A;  3HGS A;  4IIC A;  1KBI A;  1HKJ A;  4P8W A;  4XD5 A;  1VBG A;  3MV0 1;  1VCV A;  1Z32 X;  4LSB A;  5HPO A;  1Q6L A;  2J9Z A;  5A2C A;  2WPB A;  4Y90 A;  4H9V A;  3AZT A;  1QNP A;  1MZH A;  4OUI A;  3FXG A;  3TK7 A;  5EML A;  4F9D A;  2AMG A;  3AZR A;  4UNK A;  4MWA B;  2G97 A;  4B3K A;  2VMF A;  4DI8 A;  1YTD A;  4MNL A;  4W85 A;  3GZ3 A;  3SRK A;  1QBA A;  3GD6 A;  2XII A;  1QZ2 A;  5D04 C;  1KM5 A;  4D6H A;  1ALD A;  2VNC A;  3RX3 A;  5EGR A;  2HV5 A;  1K8Y A;  3LGG A;  1BFN A;  2BWG A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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