4Z2GA

Serratia marcescens chitinase b complexed with macrolide inhibitor 26
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Creation of Customized Bioactivity within a 14-Membered Macrolide Scaffold: Design, Synthesis, and Biological Evaluation Using a Family-18 Chitinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase B
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Serratia marcescens
total genus 156
structure length 498
sequence length 498
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 4z2gA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4z2gA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4z2gA01
2ZOXA 3BSHA 3ARUA 4BQ4A 2BXZA 4KRUA 4AEFA 2ZX9A 1ITCA 1OD8A 4DWSB 1ISXA 1UWQA 5C71A 4CU7A 1MW2A 1DTUA 3ARSA 1TA3A 3AIWA 3WFLA 1OD0A 4PSRA 5C8BB 2W66A 1UD6A 4BQ2A 2J62A 2DSWA 4QCFA 1UR2A 2JIEA 3IAQA 2NW0A 4PRWA 3F4VA 1KCKA 5D9PA 2FHCA 3K46A 2WNWA 4PSPA 4W88A 2WMJA 4CN4A 4ZEPA 4GI6A 1E15A 2WAGA 3KL5A 4UFMA 5IFTA 4W84A 4D6FA 3AISA 4MNJA 4YHGA 3WENA 5LA0A 4J7RA 4PBGA 4OKDA 4EKJA 3ZT6A 3AIQA 2EO7A 3WKZA 3WF1A 3UG5A 1JYVA 3W25A 2EJ1A 4M29A 3CTTA 4Z2GA 3GNPA 2YDRA 1ODUA 3QR3A 5FD0A 5GPRA 1MYRA 2Z1SA 2YL6A 1OGGA 2GJRA 5AC5A 1OWQA 4QLLA 4J3UA 5BXRA 1V6YA 2Y8VA 1W9UA 1XH1A 2G3JA 2WSPA 5M03A 5FCZA 2WVTA 2AOSA 5JBDA 2XFRA 2X8RA 2X09A 4RE2A 4F9JA 1VF8A 3WH6A 1VBRA 2DPEA 4WF7A 1BQCA 3WQ4A 3VM5A 1J0KA 1QI5A 7A3HA 1G1YA 3IK2A 3WQ5A 4NRSA 3B8SA 2WVSA 4UQ9A 2GDVA 3K1DA 4KH2A 2BHUA 1G94A 5DMYA 1MQQA 1JZ4A 4PUEA 5A8OA 2J7BA 3GYCA 1TVNA 3BAYA 3GNRA 5CSYA 2VTFA 4H41A 4NI3A 1LL7A 4ZE4A 3DYPA 4IPLA 2Q8XA 1DWIM 2AAAA 1CENA 3L4ZA 3QHMA 4CD7A 1V3HA 1JZ3A 1I75A 3THCA 3VIJA 3WN6A 2Y4SA 1O6IA 5A94A 1KXVA 5LA1A 2XVNA 3MS8A 2OWCA 1PJ9A 2BVTA 2UY5A 1BGGA 3D5HA 1MWOA 4A3YA 4OUEA 4B15A 3VM7A 1HN1A 4BZYA 3PTQA 3VPLA 3L4YA 4X9YA 3K8KA 1UUQA 1PZ3A 1XYZA 4WLCA 3FHQA 2XJ7A 1VBUA 1C7SA 4AMCA 4JHZA 2QF8A 1BVNP 1HX0A 2VX7A 4F9DA 3SUWA 2WZHA 1ZBVA 2XM2A 5JBEA 3U5YA 5FL1A 3MKKA 1E5NA 2VRJA 2A3EA 1JNEA 2WWDA 3EMCA 2D23A 2XUCA 3FN9A 2WZEA 5M5DA 4P7LA 1VFUA 1UWUA 1UWIA 5CPTA 4ZFMA 3FXYA 4IISA 2J4GA 2VX5A 3OZOA 2G4FA 1OCQA 2D0FA 3WDRA 9CGTA 1ESWA 5E0FA 3FW6A 2XVPA 2ZUVA 1MW1A 3VMPA 3UERA 1KB3A 3NIYA 2RGMA 4M81A 1B9ZA 3AICA 5A2AA 2XM1A 3IANA 1UWRA 2VZSA 3NJ3A 2EPKX 1E0WA 1HJWA 2XSAA 2VMFA 4AC1X 2DH3A 4TX6A 4PMRA 2VX4A 1RD6A 1WZAA 2DIJA 4D6DA 4TOQA 3RM4A 1JI2A 2YJQA 2NSXA 4CU6A 1FFQA 1V02A 1JFHA 2FGLA 2BNJA 2W61A 1VFOA 1O7AA 5D4YA 1LJYA 1CTNA 1HKKA 5M17A 4LGXA 4URIA 5AY7A 1QNRA 3CUIA 4N0RA 1VIWA 4UFJA 4CCCA 3UETA 1V0LA 3WQWA 2YOCA 4N42A 4EK7A 1BVZA 1FH8A 1W1TA 1UQZA 1S46A 5E0CA 3SCTA 5A1AA 1PX4A 4FF5A 2DGAA 4L4OA 3N1AA 1UR9A 1QHPA 1KGUA 1R8LA 2XIBA 2PBGA 4ZENA 4JZ5A 1KXHA 1AQMA 2G3MA 1VEMA 1TMQA 5HPCA 5I3DA 4E2OA 3MV01 5A8QA 4BQ5A 4U2YA 1AQHA 1XSIA 2E40A 2XFYA 3ARXA 1UKPA 2CBIA 2DT0A 1XGZA 4GQRA 1Q4NX 2PWHA 2VURA 3POCA 3QHNA 1UA3A 3GXDA 4LYRA 4D1JA 2J7FA 3RDKA 2O9OA 4D71A 2BY2A 2C7FA 5I2UA 2CYGA 3VOCA 3SCNA 3T0DA 1KXTA 4DM2A 3VDAA 2VZOA 2WSKA 2WB5A 7TAAA 5I6SA 2YDQA 4NF7A 1HKIA 4MAZA 3ECQA 1I1WA 3VDBA 3BAIA 4H8HA 3VTRA 4E8DA 2Y5EA 1GCYA 1UH3A 3GZAA 4W86A 4ZXOA 3W6LA 3EDDA 3CH9A 3MU7A 1HF6A 3OLDA 3WBAA 4GO9A 3WF3A 3WUFA 3AS2A 4DM1A 2DT2A 4HOWA 3SCRA 4M56A 5A6KA 2RTSA 4HU0A 1W2PA 2WVVB 4QFUA 3VD5A 5JIPA 3VD4A 5A6SA 3UR7A 1X1NA 3PZIA 1QI0A 5A6AA 1CDGA 1VFFA 1MQPA 3TA9A 4TTGA 1C90A 3CO4A 3FY1A 2CXGA 5BXPA 1QI3A 3OB8A 1K9FA 4WSJA 1HKJA 1M53A 3VO0A 1ZS2A 1OM0A 2JF6A 3AHZA 2CHOA 1HL8A 2WYSA 4XZBA 3SCWA 1J9YA 3WL0A 1KCLA 1XD1A 3DC0A 4JIEA 4MAVA 3SCVA 1CYGA 5A6BD 3AZTA 5E09A 3WNOA 3BAKA 2E9MA 1CGYA 2XWEA 1CNVA 3VINA 1C92A 3QHOA 3I3EA 4H8UA 1J11A 1GOQA 4PMOA 4J3WA 1NOWA 1UH4A 1LWJA 1QPKA 1CZ1A 5AYIA 2EPNA 2OYMA 3PZQA 3WY1A 3VD7A 2VRKA 1ZBWA 4H7VA 4XX6A 4A4AA 5GNYA 3K4AA 3CBWA 4GI9A 6TAAA 1GZJA 4JCMA 2O9RA 4P7QA 2VR4A 3ARQA 3AMCA 1AMYA 1H0IA 3WQ8A 3UG3A 4GI8A 4Q22A 4CD4A 4HA1A 1JYWA 2CHNA 1WO2A 2JFEX 3M07A 5F7UA 2VQTA 3PN8A 1EO5A 4UFKA 1V3LA 2EPLX 4PMXA 1JI1A 4IUGA 1HP5A 3GXIA 3WQ6A 2YLAA 3AI0A 1W91A 3OLGA 4V2XA 3TTOA 3N12A 1UH2A 1C91A 2CIPA 4F79A 2OSWA 2ZICA 3TOPA 1CGVA 1J10A 4U33A 5HDRA 2VCCA 2BS9A 3WL1A 2EPMX 3MUAA 1GQJA 3KZSA 1NOFA 1VEOA 2AMGA 1H49A 1DEDA 4UQAA 4W85A 4XUYA 3IJ9A 3ARTA 2E0PA 1W3LA 3CZJA 1JDAA 2J7CA 4FLQA 1EDGA 1JYXA 3AHVA 3OGRA 4JKLA 2D1ZA 3VDHA 1R7AA 4XV0A 4LXFA 3N11A 4WIWA 3WUBA 1W9XA 1A3HA 3MO4A 3EDFA 7CGTA 4HMCA 3N15A 2XHYA 2ZUUA 4LYPA 3WDPP 1EOMA 2GJPA 4GZEA 2YBTA 3II1A 5ABGA 4AZCB 3A4XA 2QV4A 2ZX6A 3WD1A 4YHEA 1WDQA 3IJ8A 4CU8A 1GOWA 3E1F1 2WHLA 1BTCA 2DH2A 3NSNA 1NP0A 1JZ2A 3N13A 4TUFA 4U3CA 4D6CA 3CMJA 5CGMA 1EHAA 3AS3A 1OGBA 2WLZA 3SUVA 1TR1A 3BMWA 3PZ9A 2DDXA 4JAWA 4J3XA 1QHOA 1J01A 4UZUA 5TD4A 4MNMA 1W9BM 1ISVA 5JIWA 4CD6A 2W63A 2WW5A 1ZB5A 1MFUA 4M82A 3WMBA 1KWGA 1KQZA 2YA1A 4K68A 2WPGA 5GNZA 1UD2A 4DWSD 1U33A 2PBOA 4PUDA 3HJEA 1W3JA 3N17A 2YL8A 3F5KA 4P8VA 4P7OA 1OIFA 1VB9A 1GUVA 1NWUA 1PAMA 1TG7A 4PTWA 1XCWA 1NM9A 2QLYA 4W93A 2VZUA 2OSYA 3VMOA 3PTMA 2WMIA 1J18A 1QNQA 2OSXA 1B2YA 1TA3B 1E6RA 5A69A 1XCXA 1KBKA 5D8WA 3T0AA 3A6OA 2PWDA 5JBFA 2EQDA 2DSVA 1GOIA 3VNZA 4D6HA 2WMIB 1KGWA 4M1RA 2WWCA 5DFAA 2CNCA 3WQVA 1V6XA 2J74A 3FHAA 1H41A 2Y24A 5A2CA 2PI6A 1FH7A 3GNOA 2VX6A 3NSXA 4P8WA 3AHXA 3QGVA 4UTFA 1QI4A 2DSZA 5A3HA 2WM0A 1ODZA 3T09A 2XSBA 5HXMA 4PMDA 2BFGA 5I5RA 2QHAA 3TONA 3VKKA 4W8BA 2DSKA 1FFRA 1UR0A 3PZUA 4W8LA 1UR4A 1D3CA 1KR0A 3K4DA 2A3AA 1QHZA 1CGTA 1RPKA 5BYWA 1WCGA 4UR9A 2UY4A 1E6SM 1W1VA 4UFLA 3ZJKA 1NQ6A 2D22A 1OT1A 1JD9A 1J0JA 1LLOA 4F66A 4HPGA 1RP9A 3T0BA 3ZSTA 5CLWA 4UNIA 5FIPA 2OYLA 2EEXA 5M3WA 1JG9A 1HT6A 3SURA 3SUTA 4C7DA 2VCAA 1EA9C 3RCNA 4MB3A 1RP8A 2VZTA 1CGXA 4NZCA 2G41A 4PTVA 3LPOA 2WK2A 1HJSA 2J7DA 4UQCA 2NT0A 1BHGA 5A6JA 5A8MA 2CESA 3BXWA 2TAAA 3AQUA 3LPGA 4C7FA 1UG6A 2WHJA 2ZUSA 5I23A 3WNMA 5C70A 2GK1A 3W24A 2DSUA 5I24A 1V0KA 5GNXA 1JFXA 2FHBA 4OOUA 4CCEA 4AIOA 1NWSA 1AVAA 4PEEA 1CXIA 5EB8A 4E4PA 3OIHA 1FH9A 3VUPA 4PMVA 1B3YA 4HTYA 2GK1B 1BG4A 2CETA 4X0VA 2IUZA 3W37A 3VGGA 3A4AA 4AZHA 2W91A 3PZMA 2OYKA 2DQXA 1TFVA 4V28A 2YL5A 3PZOA 5BRQA 1GNXA 2J7GA 6CGTA 4QLKA 1DP0A 2UY3A 2XYLA 4TVUA 2WKLA 4UOZA 2WMHA 1CIUA 2YA0A 2DT1A 3ARYA 3VGFA 4LYQA 1WPCA 1FOBA 3ARVA 1VJZA 4AD2A 5ECUA 3A4WA 2V3GA 1Q6GA 1E6PA 3PTKA 4HP5A 4X0NA 3O9NA 3ZR6A 4UCFA 5JH8A 1FHDA 3MV11 4U3AA 1JZ6A 1H1NA 2W92A 3K8MA 4M80A 3AZRA 4MDOA 5CQ1A 1TCMA 4ATWA 3FAWA 4PN2A 4QCEA 1H11A 1JL8A 1H0GA 1E1FA 3VGHA 1M04A 3L4VA 4PCSA 3CGTA 4S3JA 4ATDA 4DUVA 1W32A 1US3A 1GW1A 1C7TA 2J7EA 1GQLA 3WD4A 2WZIA 2W5FA 4H04A 4CD8A 1B90A 3CZGA 4GIAA 3WH8A 4Q7NA 1KFWA 3N18A 3HU7A 4JCLA 1QBBA 3RJYA 1E4LA 2VQUA 3WEOA 4MNLA 1L8NA 1NP2A 1JIBA 1NOUA 4DUXA 2XPKA 3WNKA 1WAWA 4OBRA 4Z2IA 1CXEA 1CPUA 1AIWA 1V6VA 1B3XA 2CPUA 4P7NA 4JL1A 3SCOA 2FH8A 3AS1A 4PMUA 1OSEA 1J0HA 1V6UA 1PEZA 2WVUA 4U5KA 3AIBA 2YLLA 4H8VA 3W0KA 1CBGA 3GXMA 1CEOA 3KL0A 5A2BA 3WD2A 4TVDA 5IHRA 3PZGA 4UQDA 5CSUA 3VIMA 2GSJA 1E1EA 4BQ3A 3EBVA 2VUYA 1WDRA 2X0HA 1W3KA 2Y8KA 3VIKA 1MXDA 2J78A 5IHSA 4Z2KA 1R85A 1Q6DA 4WJXA 3G6LA 1JAEA 2ZUNA 3G6MA 4GZJA 2X05A 2JEQA 5D9MA 1C8YA 3CHCA 3VX1A 4CGTA 1PX3A 3WUEA 1HIZA 2E9BA 1QNOA 1VAHA 2ZXBA 3EYPA 3W38A 3PZVA 1H5VA 5DEZA 3BAJA 2YBUA 2V5CA 2D24A 1GOOA 2WXDM 3MSDA 1HJXA 3I3BA 1IV8A 2G3IA 3GH7A 1HJVA 2PWEA 3VGBA 3HMCA 1X6LA 2ZE0A 1WDSA 3WEMA 3PHAA 1US2A 5BXSA 1HJQA 3TTYA 3AIEA 4GZIA 3ZOAA 1E40A 1NH6A 1E43A 2WCGA 1N82A 4AD1A 1JD7A 3BSGA 4D6JA 4S3KA 2D2OA 4Z2JA 2X1IA 1FP9A 1W1PA 2MANA 1XV8A 4B3LA 1OB0A 1LG2A 1V3IA 1VRXA 4AYSA 2UWFA 5EBAA 3BC9A 4AD4A 1MFVA 5ABFA 2W62A 5HPOA 2XFFA 5DO8A 4OZOA 4YPJA 4LQ1A 3J7HA 1LG1A 1LL6A 3W26A 1CGUA 3TTSA 2YL9A 2FHFA 1JZ7A 2VL4A 1W9VA 3BLPX 1J0ZA 2WMFA 5ABFB 1F4HA 2V5DA 1IT0A 4AZBA 4AZIA 1XH2A 4BF7A 4EE9A 4EAMA 1HXJA 2WBKA 3RM8A 3OBAA 1QVBA 2QPUA 5A6MA 1GHRA 2JALA 2J75A 5BROA 4H2CA 3WDJA 4UQEA 5JUVA 1OIMA 5FOOA 2WBGA 1QI2A 4R27A 2ZX5A 5I78A 5CLTA 3UG4A 2BHZA 1Z32X 2VR5A 1YQ2A 4JFSA 5LYRA 3NDYA 3SUSA 1BPLB 2WHMA 1G9HA 1D7FA 1JF5A 1UYQA 4HMEA 4CVUA 3W4RA 2BXYA 1WZMA 1ITXA 1CLXA 4W7WA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3DAQ A;  2XVG A;  2GYI A;  3BW3 A;  3R11 A;  2NVD A;  4PMQ A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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