4Z2GA

Serratia marcescens chitinase b complexed with macrolide inhibitor 26
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Chitinase B
publication title Creation of Customized Bioactivity within a 14-Membered Macrolide Scaffold: Design, Synthesis, and Biological Evaluation Using a Family-18 Chitinase
pubmed doi rcsb
source organism Serratia marcescens
total genus 156
structure length 498
sequence length 498
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 4z2gA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4z2gA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4z2gA01
2DT1A 2VUYA 2CBJA 2BHZA 2J78A 5BWFA 3NDZA 2PBGA 3WMSA 2E40A 2VX4A 3WBAA 2J7HA 3AIEA 4RE4A 3PZMA 4AD2A 4KRUA 4U31A 2J25A 1MW3A 4ZFMA 9CGTA 3CHFA 1ITCA 1WB0A 5A3HA 2O9OA 2QV4A 3WNOA 2WMKA 4UFLA 1QBBA 4GZEA 4HMEA 5BROA 4J3VA 2ZX7A 1DTUA 3VU2A 1UWUA 1HIZA 1J01A 1JG9A 2EO7A 3WNPA 4XZBA 2WLYA 4CVUA 3AHZA 3WH9A 1HKMA 1V0MA 1KBBA 1O6IA 2ZUVA 3UG4A 4D6EA 5A6KA 3ZT7A 4EKJA 4IPNB 5D9OA 1MXGA 1VIWA 2XPKA 4MB3A 3L4ZA 1XGZA 2D0FA 1B3YA 4QP0A 4GQRA 1QW8A 4XX6A 1GONA 2DQXA 1UR2A 3W28A 1KB3A 2VOTA 4W85A 4AC1X 5ABFB 2VCAA 1PZ3A 1Z32X 2V5DA 1HL8A 1HN1A 1RP8A 3GNPA 2DSUA 3CUFA 5A8MA 1JZ2A 3CZJA 4H8HA 3T2OA 1BG4A 1E72M 1WDSA 4IPLA 3CHCA 1D3CA 4L4PA 1E6XM 4FLSA 5HPOA 2D49A 4AIOA 3EDEA 1GQKA 3AS2A 2D23A 4AZGA 1PX3A 4OJYA 5ABGA 3WD1A 2IXUA 3AIRA 2UY4A 2DSKA 3PHAA 1G9HA 4W7WA 3BSHA 3VIFA 1XCWA 1V3LA 1K9TA 4AZHA 3VVGA 2XSAA 3PZGA 3OLIA 2GK1B 2VZVA 2A3BA 2AOSA 3ARTA 1EA9C 3VX0A 1F4AA 1UG6A 3MANA 1CGXA 2J62A 1WP6A 4DUXA 3RM8A 1Q6CA 3VGBA 1RPKA 1CZ1A 2BNJA 1CYGA 4PMQA 3W25A 2YBUA 2CNCA 3TA9A 1XH2A 4HU0A 1KWKA 2YDSA 1ECEA 1JF6A 3WQWA 5D9NA 3AIWA 4CVWA 2QMKA 1M01A 3SUSA 5IFPA 4Z2IA 3AHYA 5CJ5A 2DPEA 4E4PA 4KGJA 1TMQA 3CTTA 1B3VA 3WD0A 2BY3A 1CGYA 4BQ3A 1E73M 1CXKA 3LMYA 2VZSA 1CXEA 2IUZA 5BXTA 4H8UA 1GORA 1GOIA 1ISYA 1E4IA 3KWXA 1AVAA 2WMJA 1KR1A 5A8NA 2G41A 1WDRA 2F61A 3POHA 3U5UA 3ARZA 1CGUA 5HXMA 1I75A 1OD0A 2UY3A 2NSXA 1JDAA 2W91A 4AWEA 1QNRA 2XIIA 3T2QA 1VBRA 1UA7A 3MU7A 4NF7A 2WZHA 3F5LA 3IJ8A 2ZXAA 3IAPA 3MUY1 2D3NA 3CUHA 4JKKA 1LF1A 5A6LA 2WXDM 3DHPA 1QI3A 1XSKA 1W1YA 2CHNA 2VJXA 4EK7A 5LA0A 3QHOA 2FDMA 4BQ4A 2VX5A 3MSDA 5EMYA 1HNYA 4W7VA 1IZJA 2VVSA 4JFVA 1ODUA 4J28A 2XFFA 4H2CA 1VJZA 3LPGA 2W63A 1XYZA 1TZ7A 4JKMA 2GJRA 5D9PA 4OKDA 5DT7A 1E5JA 2G3IA 1X1NA 4PMXA 1JL8A 1GOWA 2XYLA 1G1YA 1WZLA 4U33A 1QI0A 3A6OA 2CYGA 1G5AA 2V3FA 4M8UA 3WKZA 1F4HA 2ZXDA 2J79A 6TAAA 3K4DA 2OSXA 1XD0A 3CUJA 4GINA 5HPCA 3IJ7A 1R85A 2J7FA 4MJ4A 1CXLA 1DWHM 1MW0A 1ODZA 3EDDA 4LQ1A 3EMZA 3THDA 4N42A 1ZJAA 2A3AA 1CGTA 3RO8A 3VIHA 3B9DA 4ATLA 1XSIA 2GDVA 4RE2A 4JHZA 2G3NA 4AZCA 1LG2A 4ACZA 2DSZA 2CXGA 2OYLA 1ZBKA 1EOKA 3BXWA 2FGLA 2NT0A 2WKGA 3CUGA 5CLTA 4ZE4A 1UWRA 1UD2A 1GVIA 2XJ7A 3GXDA 5C71A 3SUVA 1HF6A 1XYFA 1EDGA 4JFWA 4LPCA 4PMOA 4KRTA 4CGTA 3IK2A 5A8QA 4AISA 1NWTA 4EE9A 3FY1A 1QNOA 1B30A 1UR8A 1CBGA 4MNLA 1MW1A 3KL5A 3AS1A 5DEZA 3HU7A 2WBGA 2JF7A 5LYRA 1V3HA 1QI4A 1XRVA 3KZSA 2QHAA 1KQYA 3WY1A 1W1TA 5BCAA 2CCRA 2WCAA 3OLEA 2ZX5A 1E6ZA 1WZMA 5KZ6A 3W38A 2G3MA 2VO5A 1GQJA 1QOXA 1WAWA 2CPUA 1E56A 3VUPA 2W61A 1V6WA 3AFBA 3GBEA 1V0LA 1CWYA 1QI2A 4ZE5A 3CZ8A 1U33A 2ZXQA 3B9AA 4BZYA 2J7EA 3U5YA 4KH2A 1GCYA 5A2BA 4OBSA 5GNYA 7A3HA 2YL6A 5FCZA 3GBDA 1TA3A 3SCNA 1KCKA 1BYDA 4L4OA 7CGTA 1ZBWA 2VRQA 4J3UA 4MNMA 2Z1SA 3MS8A 2WVTA 5E0FA 1X6LA 3F5JA 4NI3A 3SIMA 1KGXA 2WYSA 3D5HA 1E71M 2J7BA 2VR5A 3GXIA 1KFWA 4WJXA 1A3HA 5I2UA 3WMBA 1SMDA 3AMKA 3W4RA 1FFQA 1W32A 3CZLA 2D0HA 3ZIZA 4CKQA 3CHEA 5D4YA 1BSIA 3VNYA 4TXEA 1R7AA 3W27A 4FLRA 2V38A 2XWEA 4W86A 3AHVA 3T08A 1HKKA 3VGFA 1V6UA 2EJ1A 4BA0A 4LYPA 1AQHA 1AIWA 3DC0A 3KE0A 1FP9A 4S3JA 3BLPX 3ARXA 1ESWA 4LYRA 4D6JA 2VCBA 2VRKA 4W7UA 3I3EA 4OOZA 4J3SA 4P7RA 1V02A 2RGLA 4DUVA 4MJ2A 4WSKA 4AD4A 3NJ3A 4YN5A 5AYBA 4MPKA 3N13A 1NOWA 1UYQA 2WZEA 1JXJA 1D7FA 3MO4A 1JAEA 4R27A 2OLHA 3AI0A 4Q22A 1SMAA 1WZKA 3O2LA 3WSUA 1OWQA 3OG2A 1FHDA 3N17A 5LA2A 2J8FA 3SEPA 1MQRA 4GKLA 5DF0A 3ZQ9A 1MVYA 1B3WA 1CENA 1D2KA 2E4TA 1MQQA 3L2MA 1HJXA 4U3AA 2VQTA 4BS0A 2WMHA 4F79A 2YBTA 1ED7A 3WNKA 4D6FA 3NYDA 3UR7A 2YL8A 1G01A 3OGSA 3W26A 2V3DA 1JYVA 5FOOA 5BXSA 3WELA 3BAWA 4N0RA 2BVDA 5ECUA 2V5CA 1UQYA 5DMYA 4MB5A 1HJSA 4CN6A 3A4XA 1JYNA 1W91A 1PPIA 1OGBA 1UWIA 4FK9A 3BAIA 1CNVA 3T0AA 4JL1A 1W2VA 4HA3A 3AS0A 3ALFA 3AIUA 2FH6A 4M24A 4M56A 3I3BA 4QCFA 4D6GA 3EYPA 2WHKA 4RL3A 3TONA 4D6CA 3L4VA 3WDQA 4Z2HA 3L4YA 4QCEA 4U2YA 5IHRA 2WVVA 1H49A 2ZUTA 1R86A 3VNZA 3MUAA 4QLKA 3ZMRA 2WCSA 5M03A 1BGAA 5CGMA 5CSUA 3WUEA 1UHVA 3BAXA 4LXFA 4AZ7A 1NWUA 1QHPA 4MDOA 3OLDA 4B3KA 4PUDA 2J7GA 5A95A 4PSPA 3L4WA 2YA0A 4OUEA 1EGZA 4LYQA 5AC5A 1E5NA 4PSRA 3B8SA 5DFAA 3WQ5A 1VB9A 1DP0A 4D1IA 4HZ7A 1OGSA 2QLYA 2J8GA 1VFFA 1UKPA 2GDUA 3AZSA 1MYRA 1M03A 1UH2A 3M46A 3CHDA 3FNDA 1QVBA 1BFNA 5A6MA 1WDPA 5M3WA 4H7VA 3SCPA 2Z1KA 3VMNA 2WLZA 1UOKA 4YHGA 4W88A 4PMNA 4E8CA 3S6TA 5AY7A 1FH9A 2E9MA 3WL0A 3WNMA 2GJXA 6CGTA 4IISA 4XZWA 4F8XA 2GUYA 3ARWA 5HNNA 4P7NA 1WO2A 3VGDA 3VMPA 2XM1A 2EQDA 3AICA 4W87A 5M5DA 5GNXA 1FA2A 4F66A 3ZSSA 4Z2JA 2DH3A 4AIEA 2VQUA 3W37A 1DHKA 1WPCA 3VGHA 4AZ6A 2WM0A 1NM9A 1EO5A 3DYOA 3HN3A 4MTVA 2DT3A 4HZ6A 2O9RA 3VINA 4JAWA 3G6MA 3GM8A 4P7LA 4PCSA 2DH2A 1NOFA 3MV01 3WFLA 4PCTA 4PMVA 1CEOA 1R7OA 3WH5A 1GNXA 3ALGA 1KXHA 2NW0A 3WF1A 1KXTA 1H0GA 2EXOA 3WDIA 1E0WA 2GVYA 1B9ZA 1MW2A 1OB0A 2E3ZA 2E8ZA 1QPKA 1KCLA 4HMDA 3GNRA 5A8OA 1G0CA 4AW7A 5FD0A 2D1ZA 3T0BA 4D6HA 1FHLA 1H1NA 1BTCA 4AZCB 1DEDA 1V0NA 4DWSD 5BXRA 1KGWA 4HPHA 3PZQA 5A6JA 3N04A 2BS9A 2CEQA 3SCQA 2YA1A 3UCQA 1QNSA 3VTRA 2YKKA 3EMQA 1UWSA 4J3XA 1UR0A 2W66A 3GNOA 2VZUA 3WH8A 2WC4A 4OBRA 4P7QA 1JI1A 4JKLA 1HVQA 5CQ1A 1WKYA 2WZIA 5I6SA 1HXJA 2BY1A 4UOZA 1AQ0A 2CERA 2E0PA 1TFVA 3FXYA 1CXIA 4MNJA 3IANA 4U5KA 1SYTA 5FL1A 1FFRA 4AIUA 3CIVA 4WF7A 2WAGA 1VENA 1UWTA 2VX7A 4U2ZA 3RCNA 1UH4A 2ZICA 3TP4A 1K9DA 1OSEA 1FOBA 1LG1A 3II1A 1E1EA 4P8UA 2JIEA 4ZXLA 3RDKA 1KGUA 3WIJA 1GOOA 4X0NA 4NZCA 5A6BA 5CZKA 4W8AA 3W0KA 3WD4A 1HT6A 4GO8A 2FHCA 1TA3B 2EPKX 2JIWA 1J10A 2Y4SA 3A4WA 3W29A 3PBGA 3OZPA 3LPPA 1E9LA 4HPGA 2EBNA 1CDGA 4DUWA 1C3FA 4CD6A 2JEPA 4PEEA 5HDRA 1JZ8A 3ECQA 2WPGA 3WUBA 1S46A 3WENA 1VFUA 4B16A 1LL7A 3MUIA 2C8NA 4D72A 3G6LA 3AMGA 1W3LA 1HKJA 4C7DA 2OWWA 5C70A 3N15A 1ZBVA 1KXVA 3VDAA 2EEXA 4HOZA 4CCCA 4UCFA 1UKOA 2ZUWA 1BLIA 4M80A 3AMCA 4UTFA 3L4XA 1MFUA 1KWGA 4CCEA 3U7BA 1JD9A 3DYMA 1IZKA 3PN8A 2X2YA 2OYMA 2CBIA 4CD7A 3AOFA 1ZU8A 1OM0A 1UH3A 1V03A 4DM2A 3WF4A 1TR1A 2OYKA 3AIVA 5GPRA 1B0IA 1UR1A 5A2CA 1ZJBA 2WANA 2BFGA 3BAJA 4AD1A 3WQ8A 1J0HA 1DWAM 4TTUA 4CN4A 3AZRA 3PTQA 1OIFA 2XGIA 3PZ9A 2WMFA 1CGWA 3ARYA 2PF0A 3MUZ1 2GJPA 1R87A 2Q8XA 1KXQA 4E8DA 3KL0A 4FMVA 1YQ2A 2XVPA 2HVMA 3ZT5A 3W6MA 4NSBA 4AZBA 2XTKA 3AXIA 2VURA 4TX6A 1SR0A 1H09A 3ZO9A 3D3AA 3W6LA 1V3IA 4PMRA 3OIHA 4P7OA 1E4NA 1CLVA 1V3JA 4QDMA 5C8BB 3CMJA 2OWCA 3AIBA 1VEMA 3VDBA 4GI6A 2VT0A 4OIFA 5CGTA 1W9XA 3SUTA 1E4LA 3BCFA 3A4AA 1JFXA 3WQ4A 5HOSA 2WC3A 2YL5A 3JUGA 1C92A 1AMYA 1E0VA 5I0DA 4JCMA 3WDJA 5I3DA 1ITXA 4UFMA 3B9EA 5EB8A 3WF3A 3UG5A 2J7CA 1XH0A 2OSYA 4CN1A 4Z2KA 3BLKA 3HJEA 3VMOA 1V02E 1JNEA 4UZUA 1UR9A 4H04A 1M04A 4HMCA 2EPMX 4H8VA 3ARQA 2J77A 3GH7A 1UUQA 3RIKA 3OA5A 3SCRA 5A1AA 2VRJA 2VZTA 1LJYA 2WVVB 2XGBA 1UD5A 1OBAA 1DWGM 3VM5A 4F9DA 2CESA 3RMEA 1IT0A 2ZUNA 4Z2LA 1PX4A 4W93A 1ZBCA 3VKKA 3CZEA 2W67A 2BY0A 5JH8A 1PEZA 2G3JA 3BSGA 4IUGA 3GDBA 3NDYA 4A3YA 2DT2A 5A94A 1V6YA 2W62A 4ZXOA 4PTMA 1E15A 5BYWA 1LL4A 3MSGA 5A8PA 2ZX9A 4S3KA 1K9FA 3ARSA 4W84A 3ZR5A 5IHSA 4W8LA 3QHNA 1ISVA 1W1VA 2D22A 2YLLA 5E9AA 1OIMA 2YJQA 3WUFA 1JFHA 3W24A 1UQZA 3L4UA 5ABEA 2XVNA 3SCSA 5BXPA 4BQ5A 1ISZA 1NWRA 2EPOA 2GJXB 3VIKA 1UA3A 1BAGA 3BMWA 1TE1A 3RJYA 3ARVA 4AD5A 3VX1A 2XG9A 1UR4A 1E3XA 5I79A 2DSWA 1E6QM 2VL4A 3VIPA 1C8YA 1I1XA 2C7FA 2WHMA 1C93A 5E0CA 1H5VA 1HKIA 5JIWA 1JDCA 3NSMA 4R5EA 4E2OA 2Y5EA 2WHJA 3VD3A 4HOXA 1CLXA 8A3HA 2VI0A 1XD1A 4JIEA 4OOUA 1BGGA 1NWSA 4UNIA 4AEFA 3NUKA 2VX6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3POC A;  2J47 A;  5CPQ A;  5E70 A;  2VMF A;  1E6N A;  1TUX A;  1Q6F A;  2ZXB A;  1VRX A;  2XVG A;  1QHO A;  1QBA A;  1TVN A;  1JIB A;  3MMU A;  3WQV A;  1L0P A;  3VO0 A;  1TG7 A;  4AZ5 A;  3OGR A;  2DIE A;  4A3H A;  3SUR A;  4TTG A;  4W89 A;  1E4M M;  1OIN A;  5D9M A;  3SCV A;  3F4V A;  1NP0 A;  4W8B A;  3MV1 1;  2J4G A;  2J7D A;  2Y8K A;  2QPS A;  1O7A A;  1E43 A;  3VM7 A;  1J0K A;  1EHN A;  1VFO A;  4Y7E A;  4IM4 A;  4FLO A;  2YLA A;  3WNL A;  1JAK A;  3BAK A;  2BHY A;  1GW1 A;  5JIP A;  4B9Y A;  3N12 A;  5A6S A;  5A6A A;  3PZT A;  5BRQ A;  2YDQ A;  3NIY A;  1I1W A;  4UQC A;  2ZX6 A;  5ABH A;  2WC7 A;  3KL3 A;  1MQP A;  1UWQ A;  2AAA A;  4PTV A;  2WCG A;  3O9N A;  1E70 M;  3VIO A;  1JZ6 A;  1PX8 A;  2DSV A;  3AXH A;  1JND A;  2OWX A;  2XWD A;  3GZA A;  1EDT A;  2D2O A;  4KMQ A;  1GOK A;  4RE3 A;  3GH4 A;  4PTX A;  1J0I A;  1FP8 A;  3FHQ A;  2D24 A;  2MAN A;  3CBW A;  5EBA A;  3W82 A;  1PJ9 A;  5I24 A;  5I5R A;  1A47 A;  1C8X A;  1EHA A;  2PBO A;  3WFZ A;  2AMG A;  4PMZ A;  4UOQ A;  3ZOA A;  3SUU A;  3F5K A;  2F2H A;  1Y7V A;  1H0I A;  4FF5 A;  1XV8 A;  4GZJ A;  1HJQ A;  2XVK A;  4UFJ A;  2X0H A;  1GHR A;  2VC9 A;  1G94 A;  2CBV A;  4HZ8 A;  2PWE A;  4GO9 A;  2CET A;  1UD6 A;  2FHB A;  1C7S A;  3CO4 A;  1GQI A;  2PC8 A;  2TAA A;  3EBV A;  1Q6D A;  3A47 A;  3PZN A;  4TVC A;  2VR4 A;  1BYC A;  3APG A;  4AD3 A;  3WH6 A;  2X09 A;  2D0G A;  3E1F 1;  1BVZ A;  4DWS B;  1PAM A;  1UD4 A;  2UWF A;  4JZ5 A;  4WK9 A;  1BF2 A;  3AML A;  1GVY A;  2YIH A;  3L2L A;  4JCL A;  4ACY A;  1C7T A;  3PZV A;  1US2 A;  2RGM A;  2FH8 A;  3WF0 A;  1DWJ M;  1EO7 A;  2XFR A;  1GZJ A;  1PIF A;  4LGX A;  3OGV A;  2RTS A;  2XIB A;  5HBF A;  3HMC A;  1W9V A;  4DWS C;  4BCE A;  4AMC A;  3RM4 A;  4PBG A;  1R8L A;  2A3H A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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