4Z2HA

Serratia marcescens chitinase b complexed with macrolide inhibitor 29
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Chitinase B
publication title Creation of Customized Bioactivity within a 14-Membered Macrolide Scaffold: Design, Synthesis, and Biological Evaluation Using a Family-18 Chitinase
pubmed doi rcsb
source organism Serratia marcescens
total genus 163
structure length 498
sequence length 498
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 4z2hA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4z2hA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4z2hA01
2YA1A 2CHOA 2AAAA 1HKMA 3VIGA 2OSWA 2W67A 5C71A 4AC1X 3SCVA 1J01A 4FK9A 3VGBA 1E73M 2DH3A 2XVGA 1KGUA 4OZOA 4P7LA 2Y2WA 4IPNB 1E5JA 5FD0A 4WF7A 2VRQA 1FA2A 2YL8A 1W9XA 2CKRA 3I3BA 3ARSA 2WKGA 1OGSA 1KWKA 3WH6A 3AZTA 3WD3A 4UFJA 1JZ6A 2YL6A 3F4VA 4AW7A 4WKHA 3BAJA 2D0HA 4HZ6A 4MJ4A 1FH8A 1GOIA 1BGAA 3RMEA 1RD6A 1QI5A 3WNMA 1XRVA 1KQZA 3FHQA 4U2ZA 1UHVA 3OG2A 1BLIA 2OSXA 4J3TA 5I23A 3E1F1 4QP0A 4B9YA 4H2CA 1O6IA 4HTYA 3IJ7A 3AIBA 3SCTA 3AHZA 3T2OA 3MMDA 4W7VA 1CGWA 5JIWA 1FH7A 2PBGA 5C70A 3SUVA 3F5KA 3MMWA 5ABFB 1C8YA 4LX4A 3WIJA 4PMQA 4NI3A 2GSJA 2BFGA 1W32A 3VD7A 3AS2A 5HXMA 1JL8A 2D0FA 3RIKA 3W26A 3BXWA 4WKAA 1JAKA 1C8QA 4JL2A 3WL0A 2WCGA 3GM8A 5A6JA 2Y5EA 3THCA 3S6TA 1I1WA 3RJXA 3EDEA 3ZJ7A 3PZNA 2ZX5A 2RGMA 2VZVA 5EFDA 4HPGA 2XTKA 3EMCA 5C8BB 3BGAA 3W27A 2DSUA 3WMBA 2DSVA 3TA9A 3NJ3A 1MQPA 5LA1A 1EQPA 4MNMA 5DF0A 3MS8A 3OA5A 1QW8A 4CVUA 2G8ZA 3HN3A 4AZCB 1HJSA 2ZUMA 4JFWA 1V6YA 4UFMA 2BXZA 2X0YA 1J10A 3GNRA 4GZEA 4UOQA 5CSYA 2J7GA 5EB8A 2ZICA 5I79A 3DHPA 2CXGA 3VNZA 3CBWA 3WDPP 3WEZA 3VM7A 1B1YA 4DUVA 3OGRA 1LG2A 1IT0A 3IAPA 4J3WA 1EHAA 1E1EA 2V3EA 4CCCA 1E15A 3O9NA 3RO8A 1CLVA 3ZR6A 1P6WA 1UWRA 4AISA 9CGTA 5D9OA 5CLWA 2CETA 2NSXA 4PMRA 4W84A 4ATDA 2VR4A 2Z1SA 1GCYA 4W8BA 4LQ1A 3KL0A 3VDHA 2VR5A 1PZ2A 1UWIA 1JF6A 4GO9A 4D6FA 2WVTA 2Y8KA 2WC3A 2J75A 2VX6A 1DWJM 4M8UA 4ZE4A 1NOUA 1GNXA 1NWSA 2PWEA 4AZ6A 2ZUNA 1V3IA 1GOKA 3VD3A 1VEPA 1ODUA 4OIFA 1V3MA 4AMCA 4LYPA 4UZUA 5CGMA 4UQCA 1Z32X 3L4UA 3O6AA 3AS1A 4B15A 1JIBA 1UD6A 2WZIA 1M03A 1KXQA 1Q6EA 2VCAA 3CZLA 2E8YA 1KR1A 1QNSA 3CUFA 1WDSA 3ARRA 4GPNA 3ZJ6A 3WUBA 2O92A 3ARUA 1N82A 2DT2A 1LQ0A 1NWUA 5A2BA 1WZLA 4D6GA 2VX5A 2EO7A 3RM8A 1QOXA 3LPPA 3CZGA 5FL0A 3VIJA 2VUYA 1XCXA 2G3MA 3GZAA 4EE9A 4PBGA 5D9PA 3MMUA 2A3EA 1B9ZA 4RE4A 2WB5A 4NSBA 3VILA 3DC0A 3WQ8A 2WVVA 4TX8A 1EIBA 2VZOA 4F9DA 1CDGA 2MANA 4U2YA 1D2KA 2J77A 4TVDA 3VIPA 4AZGA 3CPUA 4W5UA 3VKKA 4HU8A 2W66A 3WELA 5I24A 2CBUA 2BVYA 1UKPA 1C90A 4X0NA 2WVSA 5IHRA 1BYBA 3OLEA 5KZ6A 2EJ1A 3EDFA 4P7QA 4LYQA 3HJEA 1MVYA 4KRUA 1MW1A 1GVIA 1PX4A 3BMVA 2UY3A 4P7OA 3FAXA 3QHMA 4H8VA 5TD4A 1JYXA 1VRXA 5BCAA 5D9NA 5HNNA 4UR9A 4HP5A 1TFVA 1AIWA 1ECEA 3RPMA 2JEQA 4ZFMA 1KGWA 2XYLA 4PYSA 4CD6A 4R5EA 1R7OA 3A4WA 5FOOA 1E70M 2XIBA 3AICA 5IFPA 1VFFA 3T2PA 2XM2A 1C8XA 4N42A 1NP0A 3WH5A 1W9PA 4P7RA 2AMGA 4JKMA 4MB3A 2YBUA 1XV8A 2VTFA 4MPKA 2J74A 1K9TA 1PPIA 4AZBA 3CMGA 3WQ5A 5A8OA 2EPLX 4IISA 2QV4A 2E9LA 1E4IA 1ZBKA 1KWGA 2D23A 1DP0A 3BAYA 3SIMA 1UR8A 5E70A 3ZR5A 5I77A 1B2YA 1GOMA 3VGGA 2WMIB 2D20A 1E72M 1KB3A 3WQVA 2VX4A 5GNXA 2XFRA 4BQ3A 4UFIA 1WAWA 3WD4A 2CKSA 3BLKA 3CHFA 4YHEA 3SCNA 4J3UA 2PWFA 3VGFA 1CXFA 1QI2A 4PMZA 4ACZB 3VMNA 2DH2A 4W5ZA 6A3HA 1GONA 4UFKA 3ZT7A 3MU7A 2WHMA 4CN6A 1M04A 5A6KA 4KGJA 4PSRA 2GVYA 3VD9A 2G3NA 1OD8A 1KCKA 1G01A 3VD4A 1B3YA 1V0NA 5D9MA 2XVKA 1X6NA 1TA3B 4OUEA 2BY2A 3W38A 3SUUA 1UQZA 2XVNA 1UD2A 2VC9A 3ZSSA 2QMJA 4ZEPA 4UTFA 3PZVA 1CXLA 2X05A 1JGIA 1W1PA 2NW0A 4MDOA 3WMCA 4A4AA 1VFMA 4QLLA 4GZJA 1Q4NX 1QHOA 1E56A 3AHTA 1ZL1A 5A69A 3ZMRA 1W9UA 1HT6A 5ABHA 3PTKA 3WH8A 1K9DA 1QHPA 3KEHA 1V0LA 1JYNA 4GIAA 1FHLA 2W4XA 1E71M 1DWIM 3UETA 4UOZA 2XGIA 3CZKA 3K4AA 1QPKA 4TXEA 3A4XA 3WUFA 1U30A 1E4MM 3AZRA 1JXKA 3AIWA 4PTVA 3VGEA 3GNPA 3I3EA 1LL6A 3B9DA 1WPCA 1VEMA 1WP6A 3WQWA 5BXRA 1MXDA 4EANA 3ARVA 3TTYA 1SR0A 4BQ5A 4E2OA 2V3DA 1WZAA 1HX0A 2DGAA 3UR7A 4PMDA 4HOWA 3L4XA 1WZKA 1D3CA 1US2A 1CGXA 1UH2A 2D3LA 3VIOA 1CGYA 3AYSA 3FAWA 1ISZA 8A3HA 2DT1A 3PN8A 2VL4A 2OSYA 2XWEA 1EDQA 1OD0A 2CESA 1XH0A 1BQCA 1C7TA 4WKFA 1ZB5A 1V3JA 1HJQA 2V38A 3QOKA 4H8HA 1GORA 3F5LA 2ZX9A 1ESWA 2UWFA 2QMKA 4NF7A 1PX8A 1Q6FA 2AOSA 1TUXA 1ITXA 1EXPA 1CBGA 2J4GA 2E3ZA 4RE3A 1XD1A 4HMDA 3SUWA 3L2MA 3N1AA 1E6QM 1GQJA 2JEPA 3CTTA 5EBAA 3MV01 1B3VA 1V6WA 3VDBA 1JZ3A 5A1AA 1JYWA 1K9FA 4D6EA 4Z2JA 2WMHA 4H04A 4JFVA 3VD5A 1AQ0A 5A6BD 1UR9A 1UD4A 2W91A 5HDRA 2ZX8A 4MNLA 1W9DM 3WF4A 1J0KA 4Q22A 3UEQA 1Q6DA 4KMQA 1TMQA 1DTUA 3K46A 4BF7A 3SCUA 2E4TA 1VEOA 3MUAA 2ZE0A 1E55A 2WAGA 3N11A 2XFFA 4DM2A 5HPOA 3SUTA 4GI8A 1UKQA 4H7VA 1CLXA 4MB1A 2VZSA 1UZ4A 5BXPA 2DDXA 2J8GA 3GDBA 2HVMA 3VNYA 3GNOA 4FF5A 1VENA 3MV11 4PN2A 3WDJA 3MSGA 3AFBA 2E9BA 3NDYA 2OYKA 3FXYA 3PZQA 4GI9A 4CVWA 1FHDA 1R85A 3PHAA 2J7CA 1NWTA 5M5DA 3GH5A 3CHDA 2WMKA 2X1IA 5AY7A 4AD0A 5I2UA 1W9VA 4D1JA 1ZBWA 1G1YA 3BAXA 4FLSA 3SCSA 4XZWA 3WNLA 4S3JA 1UH4A 5E6ZA 3VMOA 3WQ4A 2CITA 5BXTA 5M03A 4ML4A 1L8NA 3UR8A 4KGLA 3POHA 2EPKX 3MANA 1MWOA 4HA4A 5JUVA 2BS9A 4AY1A 3K4DA 3BC9A 1XHGA 4CN4A 1UOKA 1V02A 2WLZA 3BCFA 3WEMA 3L4TA 5E9AA 3KZSA 3RJYA 4CCDA 2J8FA 5AYBA 1JDCA 5KEZA 4BQ2A 2PI6A 1LWJA 5EMYA 3RCNA 4KRTA 2CIPA 4HA1A 1K9EA 4U5KA 2XVPA 2JFEX 2WSPA 3WD2A 2G41A 2WHLA 2WNWA 3GXMA 3A47A 3BLPX 1BYDA 3DYMA 5I6SA 2ZWZA 2EPMX 3ALGA 1VAHA 1GOOA 2ZXAA 2E8ZA 3D3AA 2CEQA 4S3KA 2WBGA 1BG9A 1PIFA 2YLAA 1GUVA 4DWSD 2VJXA 3PTQA 2WPGA 3CZ8A 3QOMA 1OINA 1JFHA 3KWXA 3B9EA 4D6CA 1NM9A 1UR4A 5LA0A 3CLWA 4W87A 4JKKA 5CXPA 4AD4A 2ZX7A 4MADA 1W1VA 2JF6A 5JH8A 1KXTA 3OLIA 3W53A 1DWAM 2BV9A 2PF0A 1HKJA 3OLDA 1I75A 1MW2A 4PCSA 2GJRA 3W37A 7CGTA 1UYQA 2GJXA 3AIUA 1J12A 3WUGA 2FHCA 5IHSA 4GQQA 2DEPA 2OWWA 3T0DA 1HL8A 2EBNA 3VDAA 2VZTA 4PEEA 1BVZA 2XSBA 4HZ7A 3WY1A 1V0MA 1UWUA 3MUY1 4DWSB 2E0PA 2WZEA 5BYWA 3AHYA 4YPJA 4DUXA 2A3BA 1HJUA 3N04A 1LL4A 1C92A 2IUZA 4CU8A 2EQDA 4HPHA 3ARXA 1V02E 3CIVA 3K8KA 4D71A 1XCWA 2ZXQA 1GPFA 4BS0A 1J9YA 1BYCA 4TX6A 2W61A 2FH8A 5CLTA 1E4LA 3VPLA 1HXJA 4MB5A 3N17A 1R8LA 3PZMA 1ZU8A 3AS3A 5I3DA 3M6DA 1L0PA 5DT7A 4FLRA 1UWTA 5F7UA 1J11A 1CXIA 3WDHA 2EPNA 5E0CA 3ARQA 3KE0A 1H3GA 3B9AA 2Y8VA 4H41A 4AD2A 1KCLA 3SCOA 4AIOA 1XYZA 1GQIA 4D6DA 3UESA 1C91A 1BF2A 1BPLB 2J25A 4QLKA 3VGHA 5DMYA 1OGBA 1LLOA 1UZ1A 4HU0A 1HF6A 1JZ8A 4LYRA 3WN6A 3NCOA 2FGZA 1U33A 5FCZA 1OCQA 1U2YA 2V5CA 2G4FA 2GK1A 4MAZA 4PSPA 3APGA 2NT0A 3BAIA 1OT2A 2FHFA 4U5IA 1HJXA 4D72A 4W89A 3A3HA 2IXVA 5GNZA 4B3KA 1TCMA 2WMGA 3OZPA 3N13A 3NDZA 2XG9A 1OT1A 4IUGA 5A8MA 4D1IA 2XPKA 1EH9A 3T08A 1G9HA 2Z1KA 4N0RA 1NOWA 2PBOA 4GQRA 4D6JA 5M3WA 2GJPA 2UY4A 2CYGA 1BVNP 2WZHA 2BVDA 3PZGA 1WB0A 2JIEA 1CZ1A 1I1XA 4AYSA 5DFAA 2RGLA 5GNYA 4P8UA 3WNKA 2VRKA 4H8UA 2OYMA 5CGTA 4XUYA 1TE1A 1W3KA 1J0YA 2OWXA 3TTOA 3UG5A 3WQ6A 1UKSA 3VMPA 1EQCA 1OIFA 1OSEA 1UR0A 4KWUA 1C3FA 1HJWA 3CZEA 1FOBA 4PMXA 4IPLA 4Z2IA 5I78A 1LL7A 4Y7EA 4CD7A 2VQTA 1GQKA 4WSKA 2PWGA 2D0GA 3VOCA 3TONA 2ZXBA 4D6IA 3AOFA 4QAWA 3SCRA 4JAWA 1JD7A 5A6SA 4DUWA 1OB0A 4PMNA 1MYRA 1UQYA 3K1DA 3VDCA 4CN1A 1KXVA 4UQDA 3MKKA 1R87A 1HVQA 4RE2A 3PZUA 2W92A 3IJ8A 1QNQA 3AQUA 2XGBA 3WDQA 2Y4SA 3AIVA 2DSWA 4BZYA 1E0XA 2A3HA 5A3HA 4M81A 4P8VA 1B31A 4W8LA 3W0KA 5CJ5A 4W88A 1EA9C 1ZBVA 2OWCA 2ZOXA 3D5HA 1HVXA 3SCWA 1SYTA 1M01A 3BH4A 1VBUA 2BXYA 1H5VA 1QVBA 4C7FA 1ISWA 2VVSA 3UERA 1B3ZA 4AEFA 4JCLA 6TAAA 5JBFA 2DSZA 4C7DA 3AIEA 3O2LA 2YL9A 2BY1A 3W82A 1W1YA 1W9BM 2ZUTA 1X1NA 1VFOA 2WVVB 1UR2A 1V03A 5LYRA 3L4VA 2XM1A 3K8MA 1E3XA 3NIYA 3VX1A 1V3LA 4M1RA 2X0HA 2GDVA 5A6LA 3FN9A 2WBKA 2JALA 3DHUA 2O9OA 4WLCA 1HN1A 2J7FA 4JFUA 1J0JA 2WLYA 2CBVA 2YIHA 3AJ7A 4AZ7A 1JNDA 3WNPA 4NRSA 1FP9A 2QHAA 3AROA 1BSIA 2A3CA 1EOKA 3CUIA 1YQ2A 2WMJA 2WMFA 1CGVA 2J62A 4V28A 4JFTA 1PX3A 2PWHA 2UY2A 5LA2A 5DT5A 3CHCA 3CMJA 4L4OA 3AI0A 3VGDA 3ZJ8A 2WW5A 1KQYA 3S2CA 3W25A 3AMCA 4MB4A 3ZJKA 4WJXA 3RM9A 1GOQA 3ARTA 1XSJA 3MUIA 2FH6A 1VBRA 2WWCA 4XB3A 1IV8A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1MXG A;  1HP4 A;  2D2O A;  2EXO A;  4J7R A;  3WH9 A;  3AMG A;  3PZT A;  2PWD A;  2BNJ A;  3BMW A;  3U5Y A;  2DT0 A;  4M29 A;  4MTV A;  3MO4 A;  4URI A;  3AS0 A;  1TVP A;  2QPS A;  1UA7 A;  4FLQ A;  2X8R A;  4F79 A;  4PMV A;  3GBD A;  4W93 A;  4OOU A;  1WO2 A;  1E6R A;  1UWQ A;  2CNC A;  4U3C A;  2VZU A;  1S46 A;  3RM4 A;  2VVN A;  2YBT A;  3GXD A;  1M53 A;  2J7D A;  2TAA A;  3DYP A;  2G3I A;  2ZXD A;  1VJS A;  5ABG A;  4CCE A;  4QLJ A;  2BY0 A;  4GI6 A;  1E6Z A;  1BYA A;  2XWD A;  1E0W A;  3LMY A;  3AMD A;  1H0I A;  2ZUU A;  1E6X M;  2VNC A;  3ZO9 A;  4UFH A;  3U7V A;  1C7S A;  1UH3 A;  3WH7 A;  1HNY A;  1V6U A;  4MNK A;  1UD5 A;  3T09 A;  3PZ9 A;  3EDJ A;  3WF1 A;  1DWH M;  4CU7 A;  1C93 A;  1Q6C A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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