4Z2IA

Serratia marcescens chitinase b complexed with macrolide inhibitor 30
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Creation of Customized Bioactivity within a 14-Membered Macrolide Scaffold: Design, Synthesis, and Biological Evaluation Using a Family-18 Chitinase
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Serratia marcescens
molecule keywords Chitinase B
total genus 162
structure length 498
sequence length 498
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 4z2iA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4z2iA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4z2iA01
3EMQA 1E40A 4P7RA 5KEZA 1KCLA 4M56A 1XSKA 2A3EA 4IPNB 1B9ZA 4PCTA 4YHGA 1WP6A 2VZUA 2ZX7A 3APGA 3VMNA 4MNMA 4ZE4A 1G94A 4AIEA 1W32A 1JNEA 1HF6A 1UR9A 5HBFA 1EQPA 2QLYA 4H04A 2GK1A 1OT1A 2FGLA 3UEQA 3ARYA 4D6FA 3GTNA 1QBAA 3WQWA 1PBGA 2GJXB 1Q6GA 3VIFA 1K9TA 1KFWA 1DWHM 3A4WA 2ZOXA 5M3WA 1VJZA 3KE0A 2WLYA 1OIFA 2QMKA 4X9YA 1TA3A 2XYLA 1BG9A 1W9UA 5DO8A 4W7WA 3L2MA 4PSRA 2IXVA 1EQCA 3F5KA 2DSZA 3AS2A 1HJWA 1BG4A 5FD0A 3NCOA 1E6PA 1DTUA 1V6XA 2XPKA 1L0PA 3EDJA 1H0GA 1G1YA 1E43A 3LPFA 5M03A 3VGEA 1NP0A 1V6YA 3POHA 1FH7A 4CN4A 8CGTA 3B8SA 1H1NA 4GO9A 4KGLA 3ARSA 1JNDA 3RDKA 4OZOA 3M6DA 3WUEA 4XV0A 5GNZA 1H0IA 3VM5A 2W66A 3OLIA 4D1IA 3VD4A 3U7BA 4WIWA 1HJXA 2W63A 4PMZA 1RPKA 3VDCA 1GOOA 1DWAM 4H8VA 2Y2WA 1K9FA 2VQTA 1GHSA 4U33A 1FHDA 2E9BA 1ZBWA 1OINA 2DH2A 2XTKA 3A3HA 1QNSA 4OKDA 2C8NA 3SCWA 5AC4A 2WCAA 1V0NA 3OG2A 3WMSA 3WEOA 2NT0A 1CXIA 4CVWA 4K68A 3QOMA 2J8FA 2W5FA 4HU8A 1HL9A 2E8YA 2CESA 1KBBA 1ISXA 1C3FA 3VINA 3WBAA 2WPGA 4J7RA 2ZUWA 1E6RA 4W88A 4ZEPA 4HA1A 2VR4A 1E4IA 4JIEA 1KQYA 5E6ZA 4UFHA 1JDAA 5GQBA 3VPLA 1PIFA 1B3YA 3WUFA 4Z2GA 1UA3A 4D6IA 1EDGA 1OCQA 1XH0A 2J77A 3CHDA 4JZ5A 5ECUA 1W1TA 1PIGA 4L4OA 1C8YA 4AD4A 3J7HA 3PZIA 1C92A 1WO2A 1VF8A 5DF0A 2JE8A 4PMOA 3WNLA 3T2PA 1BGAA 2JIEA 2DEPA 3ARXA 1GCYA 5CG0A 2E9MA 2CHNA 1UWTA 1V6UA 2ZX6A 2YBTA 2OYKA 1UD6A 3VGBA 4MB3A 3ZR6A 1ZS2A 1UKQA 1GQLA 4UOQA 5BXPA 2XVLA 3QR3A 2EXOA 1A47A 2EPNA 2BY3A 4U3AA 3T0BA 3ZSSA 2XSBA 2WCSA 3N1AA 1CTNA 1JGIA 4FLQA 1GPFA 4QLKA 2Z1KA 1K9DA 1MVYA 1V3IA 1PX8A 2J7EA 4OBSA 4QP0A 3RIKA 1KXHA 1JI2A 1XYZA 1QHPA 2V5CA 2WYSA 5A94A 4B15A 4E4PA 4P8VA 3W4RA 5I0DA 3SCUA 1TFVA 4D1JA 2VO5A 1R7AA 5JIPA 2WMIB 2XVNA 1UWQA 5FOOA 2WBKA 3CUFA 1E1EA 4GQQA 1IV8A 1W2PA 2VCBA 5FKYA 4PMUA 2J62A 4RE3A 1DWFM 3KL3A 5CPQA 3FW6A 4PYSA 1MW1A 1UWRA 2XWEA 1IZJA 3T2OA 5BYWA 3GBEA 1LG2A 3UR8A 3RM4A 4MB4A 1U2YA 2WMHA 1HP5A 4H41A 1HVQA 1WNOA 2VR5A 1CIUA 1JZ5A 3SUUA 4Z2HA 2EPKX 3I3EA 1CDGA 1GOQA 1NWTA 3N17A 2FH6A 3LMYA 1CEOA 2ZXBA 4S3JA 4AZBA 1R87A 1NH6A 4ATWA 3CLWA 1J0ZA 1UR0A 4PTVA 1UH3A 4TVDA 5EB8A 3CUIA 2BVDA 1OWQA 1KWGA 2QPUA 4B3LA 3CZEA 3ARPA 4W7UA 4TOQA 3UERA 5JBEA 3CMJA 3WQ8A 2OWXA 3WL0A 4JAWA 1C8XA 4GZJA 3AHYA 3GZAA 4FF5A 3ARRA 5A2AA 1CGXA 3ARUA 3MUY1 3O6AA 3FNDA 1XGZA 1AVAA 3KZSA 4B9YA 4EAMA 3AS1A 2Y24A 1XD0A 1XD1A 1V02E 1UKTA 2PWEA 4BQ4A 2WANA 3PZTA 1UD4A 3ZJ7A 1QHZA 5D9MA 2XWDA 3CGTA 3GXIA 3WDHA 4NRSA 4U3CA 4PCSA 1E55A 1KGXA 4AISA 1PX4A 5C70A 3AMLA 4DM1A 3AOFA 4PTXA 3VKKA 1KQZA 1WDRA 2J7FA 3BMVA 7TAAA 2D3LA 3GNOA 2YLAA 2VTFA 4UR9A 1E0WA 3L2LA 4AWEA 4HA4A 1KR1A 1PJ9A 4GINA 2VURA 1OGSA 4XZWA 3WSUA 3T0DA 2D1ZA 2JF6A 3RM9A 4TX8A 4AY1A 2VC9A 2WVVA 1HKIA 3EDEA 1V3HA 5E6YA 1IZKA 4HOXA 2CITA 1R8LA 4WF7A 4AD3A 1HXJA 4CCEA 3VMOA 3MKKA 3ZT6A 1NP2A 1V08A 1FH8A 4J3SA 4AZ7A 4J3WA 3WD4A 5E70A 1NWSA 2JFEX 3AIWA 3WF1A 3VDBA 3VD7A 1ESWA 2HISA 4V28A 3ZJ6A 2OYLA 4QAWA 5A6AA 4U2ZA 3K8LA 4MPKA 5EMYA 3BLKA 1HJSA 3OLDA 3BAWA 1V3LA 4J28A 3DHUA 2VZOA 2YL6A 3O9NA 4C7DA 4GI8A 3A47A 1WZMA 3DECA 4Z2IA 3RCNA 2XJ7A 3GXFA 4C7FA 5GNYA 3VIMA 5LA0A 1FA2A 4GO8A 1UH2A 2BVTA 3HN3A 1UHVA 4GQRA 4BCEA 1LLOA 4QLLA 3WNPA 3PTQA 1TE1A 1MFVA 2PWFA 1US2A 1MWOA 1BYBA 3AFBA 3OLGA 4D71A 2O9PA 3PZ9A 5CQ1A 2X8RA 2CKRA 4W89A 3KWXA 4KH2A 3WFLA 1UQZA 2VVSA 2VCAA 4Z2KA 4H8UA 1E4MM 3ZMRA 4NSBA 1AQMA 1EHAA 2BHZA 1RH9A 3OGSA 1B0IA 4PMQA 4TTUA 3W0KA 2E0PA 1BYAA 5M17A 4E8CA 1ODZA 1C7TA 1Q6FA 1VFFA 4ACYA 4GKLA 1PEZA 1JZ6A 1J0KA 2WZHA 3QGVA 1J9YA 1W3HA 4CD6A 1JDDA 2IXUA 4XX6A 1G9HA 3BAYA 2CBIA 4Z2JA 3L4TA 4BQ5A 3SUTA 1J11A 1JZ7A 2ZUMA 3SUVA 2WVSA 1Q6DA 4M80A 3NJ3A 3SCVA 1A3HA 1KXQA 4QDMA 7A3HA 3WUBA 1C90A 1BFNA 3GDBA 4W5ZA 2JALA 4JHOA 3E1F1 3WMCA 4CKQA 4HPGA 3UR7A 2VNCA 1ZJAA 2D0HA 1GHRA 3PN8A 2D22A 4BZYA 4UFMA 3BC9A 1GJWA 1E4NA 4JFVA 3N15A 3AJ7A 4BQ2A 2ZUVA 3UG5A 2WKLA 5CJ5A 5A6JA 3BLPX 1M01A 5C8BB 2A3HA 2EO7A 5DMYA 3BCFA 1G0CA 4JCMA 4BQ3A 3SCOA 3WIJA 3UCQA 4E8DA 1WPCA 1RP9A 3TTYA 5DEZA 2DDXA 1E3XA 3SCQA 4LXFA 4LYPA 4AZ5A 4WJXA 3AZTA 4UQ9A 5I2UA 2ZXQA 3TOPA 5E9AA 5EFDA 2XFFA 1HX0A 1KGWA 4D72A 1ITCA 3EDKA 1GOIA 1SYTA 4WLCA 1MQPA 1QHOA 1V02A 3MO4A 5E0FA 5BRPA 1DWIM 2ZX5A 1O7AA 4ML4A 4P7LA 3O2LA 3ZOAA 3ZR5A 3LPGA 4CUCA 3ARQA 3MUIA 2WHLA 4HZ8A 5I5RA 4WKFA 4DM2A 1J18A 3JUGA 4GI6A 5CGMA 3AIVA 1GJUA 1HT6A 1BVNP 2CXGA 3MMWA 4FLRA 4J3VA 2X1IA 4W8BA 2EBNA 2J7CA 1JF6A 5I24A 1Q6CA 2UY2A 1MQQA 3PZNA 4M82A 4YPJA 1GONA 2B31A 1JG9A 3G6LA 3ZIZA 1UD3A 2DSUA 1CBGA 4ZXLA 2DH3A 1VBUA 5D9OA 5ABHA 4MJ4A 4P7QA 2OWCA 2ZE0A 4OOZA 1G5AA 4WK9A 2MANA 4U5IA 4JCLA 3WENA 1JYNA 5GPRA 1EHNA 2BXYA 5CSUA 3BSHA 3U57A 3WNNA 1C8QA 5AYBA 3VIHA 2X0YA 3SCRA 2QMJA 3NDZA 5HPCA 3OBAA 5I6SA 4PTMA 3AMDA 1GQJA 1WZLA 3WF4A 1W1PA 2DT1A 4MJ2A 4KGJA 3WDIA 1MQRA 4WKAA 1PX3A 5A1AA 4DWSD 1DEDA 4NRRA 3CUHA 1HKJA 1Q6EA 1J0IA 1KB3A 3NSNA 2PWHA 4ZENA 1TUXA 3AISA 1EA9C 2W62A 2EPLX 4AZHA 3SEPA 3KEHA 3EDDA 3RMEA 5E09A 2VRQA 4AZCA 1TVNA 5DT5A 1CXLA 2D3NA 2VUYA 4W8LA 5M5DA 3AMKA 1HJQA 2VX7A 2VVNA 5LA1A 1OB0A 1BQCA 3VGFA 1MXDA 3AI0A 1QNRA 5ABFB 4AD0A 4J3UA 1D3CA 1LWHA 2XSAA 3VIOA 1ITXA 3ZQ9A 3W25A 4UCFA 5EBAA 4P7NA 1G01A 4AYSA 4CD4A 3FAXA 5BXRA 4HMEA 1FP9A 1E6NA 7CGTA 4WSJA 4QCFA 1JDCA 2BY0A 3WD3A 4YHEA 4LYRA 4TX6A 5D4YA 3AS3A 1I1WA 2O9OA 2X0HA 5EFFA 1E5JA 1W2VA 3IAQA 4W85A 1DHKA 3M07A 2X09A 3WH8A 1EXPA 2Z1SA 2Y8KA 3BAXA 3TONA 5FL1A 1O6IA 2WM0A 1NOWA 2UY3A 1HKMA 4B16A 3AMCA 3L4YA 1E71M 4W86A 2WWDA 4UZUA 5GNXA 3ZM8A 5KZ6A 3VD9A 4PMYA 3VD5A 2CCRA 2W67A 2O9TA 3GBDA 1JFHA 3IANA 5CPSA 5BCAA 1SMAA 1V6VA 3WF3A 2BNJA 4N42A 3VTRA 3AXHA 3MUAA 2XFRA 1GORA 5CPTA 3GH5A 1HP4A 4AD2A 1KXTA 3MSGA 2YBUA 4KWUA 1US3A 3N13A 4JFTA 3ALFA 1QNOA 5I77A 4PMDA 1VFOA 3VX0A 1D7FA 3PTMA 2YL9A 3POCA 1WKYA 2VCCA 2XIBA 1VEOA 1WZKA 2D20A 3IJ8A 2DQXA 1CENA 4MTVA 2WHKA 5A6SA 3VIKA 4TVUA 2WMJA 2D0FA 1IT0A 4J3TA 4D6CA 4R27A 2WKGA 3CIVA 4HOWA 3PZUA 1E9LA 1GUVA 1HJUA 1YQ2A 4RE2A 4X0NA 4JL2A 2WLZA 2EEXA 5HNNA 3RPMA 1UR1A 2CBUA 1B1YA 1KBKA 4AEEA 1E6SM 3ARWA 2G8ZA 4ATLA 4YN5A 2VQUA 3W81A 1LWJA 1CYGA 1JD7A 1AMYA 1BF2A 1YHTA 3W24A 1LG1A 4AD1A 3SUWA 2Y8VA 2WK2A 3EBVA 4HP5A 2BHUA 4PRWA 1OD8A 3OLEA 3ZT7A 1V3KA 3AHVA 2BHYA 4ACZA 3SUSA 1W3LA 4JFUA 5A2CA 2XVGA 2XM2A 1XC6A 1GVYA 1VEPA 2NSXA 2GK1B 3A6OA 2PWGA 1FOBA 1JAKA 2CNCA 1WAWA 1CWYA 1E4LA 3VIJA 4PMVA 4N0RA 4XB3A 4M1RA 4AW7A 2OWWA 4KRTA 4GI9A 3WD1A 1M53A 2WZIA 1NOUA 4DUVA 2BS9A 2JEQA 3WF2A 1CECA 1E6QM 2W92A 2WMGA 4F9JA 4LX4A 2BV9A 1Q4NX 5CXPA 2PBGA 2CERA 1TA3B 4F8XA 1CLVA 3CPUA 5IFPA 3W6MA 3MSDA 2YIHA 1HNYA 1UYQA 5DT7A 2D49A 4AZ6A 3UG3A 1TMQA 3W82A 2J79A 2WC3A 3VNZA 1KCKA 4Z2LA 1QVBA 2V5DA 1UKPA 1BHGA 2W61A 4BA0A 1B3ZA 1VAHA 5C71A 2NW0A 4CCDA 1S46A 1K6AA 1UZ4A 1P6WA 1VFUA 4MNJA 1I75A 1CGYA 2ZX8A 3ARZA 1W9XA 4TVCA 3VGHA 1H5VA 1ZBKA 2GJXA 4AEFA 2CBJA 2NT1A 5BROA 2J7GA 3PZQA 1BGGA 9CGTA 1C93A 4AZCB 1OIMA 3L4WA 1U30A 2G3MA 2RGMA 2XM1A 5BWFA 4B9ZA 2XIIA 4A3HA 4AIOA 2VL4A 3WNMA 4Q22A 2V3GA 2XVKA 2ZICA 1JZ3A 2FHCA 2ZXDA 1E0XA 2UWFA 3W37A 3ZJKA 2OSWA 3HMCA 3WMBA 3WQ4A 5BXSA 3VVGA 4CVUA 4J3XA 4EE9A 3U5YA 4W87A 1MW3A 2FGZA 2UY4A 3WDPP 4U31A 3ZSTA 1PZ2A 1QW8A 1XSJA 2YL5A 4CU7A 1J0JA 3GXMA 5CGTA 1JYVA 1NQ6A 2VMFA 3F5JA 4PMNA 3AYRA 5A3HA 3EDFA 1M03A 4V2XA 1GQIA 1D2KA 2DGAA 2A3AA 1NWUA 3W26A 3PHAA 2WWCA 4MDOA 3AYSA 4RE4A 3RO8A 1WB0A 2RTSA 1SR0A 3MV01 5ABGA 2PB1A 3CZLA 1V0MA 3WD2A 1VBRA 2CIPA 3T09A 4HTYA 1E5NA 2J7DA 2VT0A 4F79A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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