4Z2IA

Serratia marcescens chitinase b complexed with macrolide inhibitor 30
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Chitinase B
publication title Creation of Customized Bioactivity within a 14-Membered Macrolide Scaffold: Design, Synthesis, and Biological Evaluation Using a Family-18 Chitinase
pubmed doi rcsb
source organism Serratia marcescens
total genus 162
structure length 498
sequence length 498
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 4z2iA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4z2iA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4z2iA01
1GQKA 5A2BA 1C91A 1OGGA 5BCAA 3CHEA 3W26A 2ZUNA 1WDSA 1Q6DA 2YKKA 4E4PA 1NM9A 3DECA 1JAKA 2ZXQA 1KQYA 2X2YA 4CUCA 2YDRA 2J74A 3EBVA 5HPCA 4HU8A 3ZMRA 2WVSA 3FXYA 4AEEA 4JAWA 2DSUA 5I6SA 1DTUA 1E70M 1EDTA 3AHZA 3KWXA 1NP2A 2W62A 1V3KA 1C7SA 2D49A 1JDAA 2UWFA 5E0FA 3AIBA 2PWHA 4M82A 3AHXA 4UR9A 3WH9A 1BSIA 4J27A 1WE5A 3LMYA 1JD9A 4U33A 1QI0A 2A3CA 2BVDA 4D6JA 1MWOA 2J79A 1G94A 3WQ5A 2XWEA 2EPLX 1O7AA 3VGBA 4JIEA 1GVYA 1R85A 4MDPA 2UY4A 3GH5A 4PMXA 4XB3A 3MMDA 4ZFMA 2XGBA 3GBEA 3B9EA 1PJ9A 1TFVA 2D0GA 2A3BA 5IDIA 3M07A 4C7GA 4TTGA 2VNCA 4GI6A 3ZT5A 1J0HA 1E6ZA 4NRSA 4MNLA 1F4AA 4L4PA 4OJYA 1O6IA 2XVPA 1TMQA 2WM0A 2X09A 1B3VA 3OLEA 2BY0A 3UCQA 4D6GA 1J11A 2CBVA 3II1A 1JZ7A 3GH4A 1BYBA 3F5LA 5M03A 3KL5A 2D22A 1E15A 3K46A 2NT0A 4MB1A 1D2KA 3GH7A 1IZKA 1PAMA 1NWRA 2ZE0A 1K9EA 3PZ9A 1NWUA 4C7FA 2OSYA 1HNYA 3SCNA 1QI5A 3CZEA 1V6VA 4AW7A 4AMCA 3WEZA 1ISVA 3A4WA 2VX6A 4UFLA 1GONA 1Q6CA 3K8KA 1PBGA 1U2YA 3VDAA 3BSGA 2DT1A 3BAIA 3GXMA 1EO5A 1VFUA 3BMVA 5JUVA 4UFMA 4GKLA 4CKQA 5BWFA 2UY2A 1KGWA 2XSBA 3PZVA 3W24A 1FP9A 2VZUA 1E4LA 5A6LA 5CSYA 3QHOA 1BFNA 3WH7A 4P8WA 1C93A 3VNYA 2E0PA 3ZR6A 2FHFA 2YIHA 4HA3A 4P7RA 5M17A 1G1YA 2ZOXA 1KXVA 4HPHA 1HKJA 3W27A 3D3AA 1QW8A 1W9DM 3WSUA 3CHCA 3L4TA 4H8VA 1DWIM 2ZUMA 3UESA 4QLKA 3ARWA 1XGZA 3ZJ6A 3VGDA 1B3WA 3CUFA 3NJ3A 3UG4A 2YBTA 1ZB5A 1HXJA 4CU7A 5CG0A 5A8QA 2VT0A 4FLSA 4PMOA 4MB4A 3O2LA 3L2LA 4UQCA 1TCMA 1W1PA 1JGIA 4Z2JA 3NSMA 5JIWA 1XD1A 3BAKA 1W32A 1HKKA 1AVAA 2CIPA 3VIHA 1HIZA 4CD6A 1CXHA 1ZBVA 2W67A 3O9NA 1B0IA 2D0HA 4P7LA 4UQEA 1NWSA 3NYDA 4W5UA 4ACZA 1MQRA 5A1AA 1NH6A 2ZX7A 4PMRA 4RE4A 1WB0A 5HDRA 4M80A 4B15A 1CYGA 1I1WA 2VQUA 3WL1A 3AXXA 5BRPA 3IK2A 2VURA 1MFVA 2VX7A 4H41A 4FK9A 1KR1A 1UH4A 4CU8A 1C7TA 1AQHA 1V02A 3VU2A 4B9YA 1H11A 3WQVA 2OYMA 3N04A 3WDPP 1E55A 2EBNA 2DGAA 4PYSA 5KZ6A 1BAGA 3MUAA 1SR0A 4BF7A 2B31A 3EYPA 3IJ8A 3VIKA 1CTNA 3PZMA 1ZBCA 3AISA 3WBAA 3HJEA 4Y7EA 4PTXA 3HN3A 3K8LA 4D1IA 3N12A 2E8ZA 1QVBA 3L4WA 1LG1A 4CD4A 1K6AA 1JDCA 4PTWA 4WSKA 1JZ2A 4UOQA 3T0BA 2O9PA 1OIFA 2WVUA 1B90A 1XC6A 5F7UA 3W53A 2C7FA 1UWQA 1DWJM 1JG9A 1KXQA 3RM8A 1VIWA 3AZSA 2GVYA 3OZOA 5LYRA 2CXGA 2J75A 2XUCA 4JFTA 1B9ZA 4U2ZA 3VD9A 3GTNA 2DSKA 1JXKA 1B3YA 1NQ6A 3OB8A 4NRRA 1UQZA 3QOKA 2FH8A 1AQMA 1DWGM 1KCLA 3U5UA 1FA2A 4JHZA 1JZ5A 1XSIA 4MAVA 2YJQA 4AY1A 1GQJA 1MW2A 3WQ8A 1W9VA 3ZIZA 2A3HA 2UY5A 4D6FA 4J3VA 2ZUSA 1XH0A 5A6JA 1UQYA 4OIFA 3N11A 3T2QA 1E1EA 3SCPA 4OOUA 1S46A 3OG2A 4OUEA 2FHBA 2ZWZA 2G41A 2OWCA 2VZOA 2E9BA 1AIWA 4JCLA 1CGTA 2WMKA 2YDSA 4NSBA 1XCXA 1RP8A 3AXHA 1PX3A 2Z1KA 4MNJA 4JL2A 3VGFA 1UR0A 1ED7A 2VTFA 4RL3A 3WUEA 5IFPA 1EXPA 3TTSA 1EH9A 3N9KA 4LXFA 3SUVA 5ABHA 1OWQA 4UOZA 3BXWA 2A3AA 1TA3B 4UFIA 4JHOA 3I3EA 2QMJA 4X0NA 5A95A 2E9LA 4Q7NA 1LWJA 3SCUA 4PUEA 3B9DA 3CZGA 3GBDA 1JXJA 1LG2A 3W4RA 1W2VA 1V3JA 4XX6A 3MMWA 3WEMA 3ALGA 3OLGA 2WHMA 5I78A 4WK9A 1V6XA 3CZJA 1H41A 3T09A 4J3WA 1XYFA 1TVNA 3ZT7A 3W6LA 1FFQA 3KL0A 1C90A 1CXLA 2WMJA 4EK7A 3CMGA 2XVKA 3QGVA 1W3KA 2QF8A 1Z32X 3DYMA 1W9UA 3ZJ8A 1JAEA 3WNNA 3GYCA 4GI9A 1K9FA 3CPUA 3VO0A 3SCRA 1OCQA 3FAXA 1QPKA 5E09A 2XVNA 2DIEA 2WMHA 1EQCA 1ESWA 3CUGA 1M7XA 4Z2LA 3WF2A 4ZXOA 1E0XA 2XPKA 4W8AA 1IZJA 4HTYA 1UKTA 3BAJA 4PMQA 1B1YA 4OBRA 1UYQA 5E0CA 1GPFA 3DYPA 4AIUA 3BSHA 1WZMA 2YA1A 4UFHA 3AHVA 3WD1A 2QHAA 1MQQA 1OBAA 4ATWA 2WAGA 1JYWA 5DF0A 3O6AA 1BF2A 1C92A 2PWFA 2WKGA 3AOFA 1HT6A 3TONA 2BXZA 2WSKA 5AYIA 4HOZA 4J28A 3N15A 5C71A 2WXDM 4ATLA 3OLDA 5BXTA 1K9TA 3T08A 1LL6A 1XSJA 3EMQA 3I3DA 1GUVA 2PBGA 1Q4NX 3MUY1 2V5CA 3WDRA 1ITCA 4UQBA 5D8WA 2J7CA 1GOQA 3WELA 5ABFB 4UZUA 5CPSA 4H7VA 2VMFA 3VOCA 3AMKA 2OYLA 5E6YA 4MPKA 3MANA 1XV8A 1V03A 5IFTA 2J7BA 1WNOA 4QAWA 2YL5A 1BGAA 2IXUA 4AC1X 4XUYA 4P7OA 3AIUA 3OZPA 3PBGA 1EHAA 3AMDA 4TX6A 2EXOA 4YHGA 5I3DA 3EMCA 3WDQA 3EMZA 1UWTA 4PMUA 2OWWA 4HP5A 4W89A 1TUXA 1UKOA 3WNOA 4TVCA 2WC4A 3L4VA 3WUGA 1E43A 1PIFA 1QHZA 1QI4A 4AZCA 4C7DA 2WHKA 3ZOAA 2X1IA 3PZUA 1HX0A 2VRKA 2J47A 3SURA 3KE0A 4P7QA 2ZWYA 2YBUA 1SMAA 4PTVA 2BVTA 4W84A 2VQTA 1SFSA 4PMZA 5CLWA 1JFHA 3APGA 2WANA 2ZICA 1NP0A 2WC7A 3AYSA 4BQ2A 2WCAA 1JNDA 4W7WA 4M29A 2XSAA 2XFRA 3B8SA 3WNPA 5AC4A 1W3JA 3VX1A 4B3LA 2VZTA 1IT0A 1DWAM 1HJUA 5CZKA 4KRTA 3VNZA 5IHRA 4CN4A 1CGYA 2E40A 2XVGA 4AZ6A 1QI2A 4ATDA 1MFUA 1TVPA 4UZSA 1HVQA 3LPFA 4YN5A 4DM2A 2BHYA 1WO2A 1OD8A 1E6NA 2F61A 1CLVA 4JZ5A 3WD2A 1GCYA 3AICA 1QHPA 4UTFA 3WQ6A 2G3NA 1E0WA 3A47A 1XHGA 2V3FA 3FW6A 3TTOA 3SUWA 4NZCA 1E6QM 2VX5A 2ZUUA 4AYSA 3VIIA 3GNPA 4MADA 2XWDA 4W87A 2GDUA 2VCAA 3F5KA 1WZLA 3MSGA 4F79A 3L4ZA 4ACYA 1OINA 4Z2IA 4A3HA 1PX8A 5DT7A 4AD3A 3K4AA 2D0FA 5AY7A 5GNXA 1JD7A 4U3AA 3MU7A 3VMNA 2DT3A 1JFXA 1KR0A 1TZ7A 1X6NA 4IPLA 2A3EA 2DT2A 1W9BM 2FGZA 5A6BD 4R5EA 1BGGA 4LYPA 1DEDA 2GJRA 3W38A 2WLYA 5A6KA 3WNKA 3WKZA 2XVLA 4MNMA 4B3KA 3SIMA 3ZT6A 1AMYA 4OKDA 3ARUA 1HKMA 3UR7A 1BVZA 4LQ1A 3AJ7A 1EOMA 2WCGA 4W85A 3FHQA 4UNIA 1UWIA 3PTQA 2XG9A 1QBBA 3MUIA 3AI0A 1VRXA 4E8DA 2WZEA 4DUXA 1BLIA 4U31A 4CD7A 4GIAA 4GI8A 4M8UA 1W1YA 4TOQA 3RPMA 5M3WA 3PTMA 8CGTA 3QHMA 4HOXA 5JBFA 2FGLA 5BROA 6CGTA 3BLPX 4WF7A 2Y5EA 5A69A 2JE8A 4GPNA 3WF0A 1UA7A 3ARTA 4ZE4A 2HISA 4AWEA 3RCNA 2PWDA 3SCOA 2OSWA 4GXPA 2VJXA 3MSDA 4XV0A 2E9MA 3VX0A 1E3ZA 4V28A 3VGGA 1BVNP 2UY3A 2V3GA 3K8MA 2ZX5A 3N17A 2JIWA 4FLOA 2YA0A 1FP8A 3TTYA 3BGAA 3GM8A 3D5HA 3RM9A 2W91A 4GQRA 1XCWA 4ACZB 4TUFA 1CENA 2WSPA 3W82A 4GZJA 3NSXA 3G6LA 1PZ3A 3IAQA 2F2HA 1BG9A 2DQXA 1GJUA 3L4XA 4GINA 2YOCA 4TVUA 4RE3A 3AIVA 1R7OA 1HJVA 2PB1A 2O92A 1UD6A 5LA0A 4AZIA 4NI3A 2ESCA 5HBFA 3UG3A 1N82A 3A6OA 1J9YA 1E1FA 1ZU8A 3M46A 5BXRA 2RGMA 5A6BA 4QP0A 1OB0A 1I75A 1ITXA 3PZTA 1M01A 2CYGA 4LYRA 2OLHA 1GQLA 5BYWA 2YA2A 5HNNA 2D3LA 3ARPA 5I2UA 2NSXA 3B9AA 1NOFA 3WFZA 1VEOA 1CPUA 3KL3A 2XFFA 2GJXB 2WHLA 3AMLA 5FOOA 4DWSD 1QNSA 1QNOA 1XD0A 1KQZA 2VOTA 1EO7A 2GK1A 5DFAA 3RO8A 3GXIA 1JZ6A 2O9OA 1HL9A 1DP0A 5AC5A 4M24A 1UH3A 3SEPA 4BCEA 3WDJA 4ML4A 5CPQA 1CDGA 3WD3A 1B2YA 3A4AA 3K4DA 1V6YA 2WMFA 4FLQA 2ZUWA 5JH8A 3T2OA 3OIHA 3VMOA 4B16A 4WKHA 2GJXA 4V27A 1VAHA 4JL1A 4UQAA 1J18A 1D7FA 1QOXA 4D6HA 4URIA 2IXVA 4JFUA 2PWEA 3N1AA 1DWFM 4IUGA 2WB5A 2WWCA 3MMUA 2VZVA 1JYVA 2CBIA 2XIBA 1SMDA 4CU6A 4H04A 5A8NA 4AISA 1E6SM 4DWSB 3AHTA 1E9LA 3MV01 5E9AA 1GW1A 4WJXA 4PTMA 4YHEA 3RJYA 1CGXA 1V0MA 2W5FA 2WVTA 3VINA 5I5RA 4CVUA 3W25A 3PZGA 3TA9A 3AZTA 3AFBA 3KEHA 1E71M 1VBUA 1ZJBA 3VMPA 4P8XA 1E5JA 1C3FA 3WL0A 1CEOA 1L8NA 3EDEA 1UKPA 1VFFA 2WLZA 4M56A 1CBGA 1QW9A 4PMDA 3W81A 4R27A 4MTVA 2BY1A 1KFWA 3AXIA 5D4YA 4TX8A 2WYSA 3F5JA 1WDQA 5C70A 1LQ0A 4J3XA 5CJ5A 3AS1A 4U5IA 4N42A 4DWSA 2QLYA 3ARRA 1VEMA 2BFGA 4QLLA 3ZM8A 1XSKA 2DPEA 4W8LA 4D6CA 5DEZA 3GXFA 4HMEA 3WF4A 3VD3A 2VRQA 2QPSA 1KXTA 1VEPA 4UQDA 1H0GA 1KBBA 4MAZA 4BQ4A 5JIPA 4HMDA 4Z2KA 3TOPA 1XH2A 3WIJA 4PMVA 1EDQA 2J77A 3CZLA 4WIWA 5DO8A 2WCSA 2J7EA 2PI6A 1V02E 3W37A 2BHZA 2OWXA 1E0VA 3ZJ7A 3EDDA 1M53A 5CQ1A 4P8UA 5AYBA 2G3MA 2YLLA 4GQQA 1HJXA 2VVSA 3LPPA 1BYDA 1V3IA 1IV8A 4MB5A 2XFYA 2DIJA 1Q6FA 4BS0A 3QR3A 1GOWA 4WLCA 5D8ZA 2CBJA 1KGXA 5A94A 4W88A 1A47A 4PRWA 3WH5A 1EIBA 1V3LA 3I3BA 1J0JA 1NOUA 1UD8A 3AIWA 2BNJA 1VB9A 5A8MA 4PCSA 1HVXA 2E4TA 1JZ8A 2G4FA 2D1ZA 1OT2A 2J7GA 4PUDA 3AIEA 2VL4A 1V08A 3SUSA 4WKAA 1J01A 1Q6GA 3WH8A 2GJPA 4M81A 3OBAA 4AZHA 1SYTA 3U7BA 1C8YA 5ABGA 4F66A 4HOWA 3BAXA 1GHRA 3WN6A 1LL7A 2WMGA 7A3HA 3WF1A 4TTUA 1CWYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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