4Z2JA

Serratia marcescens chitinase b complexed with macrolide inhibitor 31
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Creation of Customized Bioactivity within a 14-Membered Macrolide Scaffold: Design, Synthesis, and Biological Evaluation Using a Family-18 Chitinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase B
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Serratia marcescens
total genus 161
structure length 498
sequence length 498
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 4z2jA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4z2jA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4z2jA01
1VEOA 4EE9A 5A2CA 1G0CA 3GM8A 4KRTA 1V6VA 4ZXLA 1LL7A 1Q6CA 2J78A 3B9EA 3KE0A 3FN9A 4ATLA 3U7VA 2DSZA 3U7BA 2J75A 2XTKA 5JUVA 4H2CA 3GBEA 4Q7NA 4LXFA 1RP9A 2PI6A 4XZBA 2V3FA 1A3HA 5A2AA 4Z2LA 4AIEA 4HOWA 4MB1A 1B0IA 3S6TA 3MANA 2WHLA 1GHSA 4J3SA 3SCPA 4HU0A 2BY3A 4FLOA 3ZO9A 2FHCA 2EPLX 3GYCA 3PBGA 1JZ6A 3F5LA 3T2QA 1W1YA 1CGTA 1GOQA 4UFLA 4NRRA 1B3XA 4UCFA 1H11A 1E73M 3NJ3A 2EPMX 3WF0A 1PEZA 4OBSA 4AZBA 4H04A 4B16A 3ARQA 2XIBA 1BAGA 1OSEA 1VAHA 2BS9A 1V3HA 5CGMA 4CU6A 3VGBA 1C8XA 1M03A 2X2YA 2WCGA 4QDMA 5DFAA 3OB8A 2W62A 4UQ9A 2D0HA 1H41A 3ZJ8A 1BLIA 3G6LA 2XVNA 3W6LA 4PMRA 2YL8A 1MW1A 5FIPA 3CTTA 1HN1A 2EBNA 2VRKA 1EGZA 3BXWA 4NF7A 5GNXA 2ZUUA 4JL1A 1UOKA 1IZJA 3PZVA 4TTGA 2VZTA 3N9KA 5JBDA 3VTRA 5A6JA 4R5EA 1UD3A 5GNYA 1B3WA 1GOKA 3GH7A 2XGBA 1M53A 4MNLA 3AZTA 1G9HA 1LWHA 5C8BB 1JGIA 3HU7A 3WUFA 3AYSA 4TVCA 4M8UA 2D23A 4DWSB 4ZXOA 4OOZA 1VEMA 1CPUA 2GJXB 4PBGA 4UZSA 1E0WA 3SIMA 3N11A 1J0ZA 2ZX7A 4F9JA 3WD0A 2E9BA 3ZT5A 4Z2JA 4P7OA 5DT7A 2FH8A 3N17A 3AFBA 3RJYA 1E6XM 4UNIA 2OWWA 3T2PA 3ZT6A 1PBGA 3GH4A 1GOOA 3AHXA 1OIFA 4JCMA 4BQ5A 4AD5A 3VM7A 1E5NA 1FH8A 4RE4A 2OSYA 4HA4A 4UTFA 1M01A 1NP0A 4TX6A 5C70A 2D22A 3EDKA 1E5JA 2XFRA 3UR7A 2XSBA 2DSVA 1KBBA 4J3XA 5HNNA 5A6BD 1U33A 5D9MA 1XYZA 4ZEPA 4ZENA 4QP0A 3EMCA 1PZ2A 4PCTA 3RDKA 3WBAA 4HP5A 1GOWA 3F4VA 2BY0A 1KXHA 2AMGA 2JIEA 2JF7A 1Z32X 1E70M 2DT2A 1WNOA 3LMYA 2WVSA 2CKSA 3WNMA 3TTOA 1KB3A 3WF2A 4CGTA 1J9YA 3ARUA 3KZSA 4NI3A 1ZB5A 3CUHA 5CLTA 5FD0A 1LJYA 4W7VA 2OLHA 1JZ8A 3VGFA 4W8AA 3MO4A 2WSPA 3OZPA 4GO8A 5A8NA 1HVXA 2WMJA 1BFNA 1YHTA 1JDAA 4TTUA 2GDVA 1TA3A 2VCBA 4H8VA 5ABEA 2C0HA 2ZUMA 1RD6A 5LA2A 8CGTA 1CXEA 3POCA 3W53A 1E4NA 4B9YA 1PJ9A 3WH9A 1ZBCA 3WD2A 3I3BA 2WVUA 1UWQA 5TD4A 4E8CA 3EDFA 5BRPA 1YQ2A 2DSUA 3M46A 3DC0A 4UQEA 5I3DA 1BGGA 4KGLA 1W1VA 1KGWA 3MSGA 3SUSA 2YLAA 4URIA 4HPGA 2EXOA 6A3HA 3WDRA 4HMEA 1NQ6A 2RGLA 3TTSA 4PTWA 3CZ8A 2GSJA 1W9BM 2CKRA 1J0YA 3AMGA 3AIQA 3VIGA 2O9OA 1XCWA 1UG6A 4GZEA 4PSPA 2X05A 4AC1X 1MW3A 1XC6A 2E8ZA 3LPGA 4RE3A 1W32A 1TVPA 4AZ7A 1ISVA 1X6NA 1ZBWA 1XYFA 4Z2HA 4TVDA 5LA0A 1WB0A 4MDPA 1V0NA 3CHCA 3AMKA 4FMVA 1JYXA 3BLKA 3ALGA 1WDSA 2DSKA 1E6ZA 2OWXA 2D1ZA 3VIPA 2J79A 1AIWA 3EDEA 1CGWA 1K6AA 2WKGA 1B31A 3NSNA 4WJXA 1E4MM 3BCFA 3ZIZA 4P7RA 4CD7A 2D0GA 5A6BA 5CPTA 4AD0A 4PTMA 3QGVA 1EA9C 2CESA 2EQDA 1KXVA 4OUEA 4UQAA 4W8LA 4AMCA 3AOFA 2YKKA 3CMGA 4PMZA 1FP9A 4H8HA 1JNDA 3RM8A 1UWUA 3WQ4A 2PF0A 3T2OA 4EANA 4C7DA 4MTVA 1VENA 1JAEA 1AQHA 1VIWA 2VURA 4D6GA 1J11A 4X0VA 4BQ3A 2EEXA 2ZX6A 1V3JA 1JZ3A 1TVNA 4RE2A 2BVTA 1E72M 3VMPA 1UH2A 4XUYA 1EDGA 3W28A 5BXPA 3KEHA 4M56A 3VUPA 1M7XA 3WD3A 1QI2A 3L4WA 5DEZA 2CHNA 3MMWA 3ARXA 4KRUA 3MU7A 3PZOA 2X09A 3F5KA 3AHVA 3OGSA 5E6YA 1NWUA 1B90A 1CECA 3VINA 4JFWA 4S3KA 5LA1A 2ZWZA 5ABHA 1JZ2A 1TUXA 5A95A 4X0NA 3KWXA 2ZIDA 3K46A 5DO8A 5BWFA 1UZ4A 3BSHA 2XVGA 4S3JA 2Y4SA 5GQBA 5FCZA 2FGLA 3K4DA 7A3HA 2GJPA 2QF8A 3O9NA 1JXJA 5M5DA 2O9PA 4GQQA 1DTUA 2D20A 3GDBA 1JNEA 1VBRA 3W38A 1WZMA 4NSBA 5A1AA 3WD4A 4JZ5A 1HKJA 4U3CA 4HPHA 1TG7A 4PYSA 2GDUA 1E1EA 1GPFA 3MV11 1UKOA 1V02E 1FFQA 4JIEA 2WHJA 1CXHA 4U5KA 2XWDA 2EPNA 2ZUTA 1IV8A 2BNJA 2G3JA 2YL6A 4FLRA 3M6DA 2QMJA 1NM9A 1GZJA 1OT1A 2YA1A 3WDJA 4AW7A 4CD5A 4CUCA 5I79A 3K4AA 1QOXA 1UYQA 2PWGA 1W9UA 1M04A 1JI1A 1PZ3A 4E8DA 1N82A 1UD6A 3VILA 3OGRA 3AROA 1HNYA 4J3WA 2EJ1A 3DYMA 1W3HA 1XHGA 2YOCA 3FHQA 3WF1A 4CN1A 4J3VA 2G3IA 1V03A 6TAAA 3ZR6A 1MYRA 1G1YA 2E9MA 1I1XA 3PZIA 5E9AA 5I23A 2OSXA 2ZX5A 3NDZA 3HMCA 4W5UA 3WFZA 4YN5A 2QV4A 2DT1A 2J8GA 1B2YA 1BF2A 4N0RA 1BYAA 3W26A 1ED7A 3SCTA 3EDDA 5D4YA 3WNOA 4ZFMA 2ZXBA 3SUTA 4HA1A 1CZ1A 3GXDA 3MSDA 1KGUA 3ARWA 2BFGA 4OBRA 4BQ4A 4N42A 4HU8A 3A4XA 1MQPA 4HZ8A 3CUFA 4PRWA 4AZ5A 3AHZA 1MQRA 1EDTA 1E15A 3W4RA 1V3IA 3AICA 3VD4A 3BAWA 4IPLA 2Q8XA 4YHGA 5E6ZA 5BRQA 1HL9A 1U2YA 5BROA 4WKHA 3WUBA 4UQBA 4D6JA 5IHRA 3WDIA 1OT2A 2XYLA 3N13A 2YJQA 1VBUA 2J7GA 1GONA 4CD6A 1QI5A 3B9AA 2XVLA 3WUEA 1EO5A 2E4TA 1Q6DA 4J3UA 4JCLA 4PMYA 3VIFA 1U30A 1NWRA 5EBAA 5FOOA 3AQUA 2C8NA 2PWFA 4M1RA 5D8WA 5CSYA 3SCOA 1OGBA 1UQZA 4MNKA 4GI9A 2VOTA 3OZOA 4FLSA 1NOWA 4UFMA 3UETA 3ZJ6A 2HISA 4WLCA 1W3KA 2BHUA 2AOSA 3AIWA 1FHLA 2XM2A 3UESA 2WKLA 5JH8A 1GOIA 1C7TA 1JD9A 2YBTA 4LPCA 1KXQA 5GNZA 1XH0A 4FK9A 3VDAA 4UQDA 2X8RA 3VPLA 1ITCA 1MWOA 1MW2A 2W4XA 3MMUA 3FW6A 3AIBA 2BY1A 1E55A 4XV0A 1ZBKA 3O6AA 2WC3A 3WH8A 5ECUA 1JI2A 2JFEX 3RM9A 1C7SA 3AISA 3N1AA 4UZUA 1F4HA 1OGSA 4E2OA 1ESWA 4UOJA 5IFPA 2ZX8A 2XIIA 1QW9A 2BY2A 1JL8A 3VX1A 5JIPA 2D24A 1QW8A 5BCAA 2VQTA 1FA2A 3MUIA 4PTXA 1E56A 2E3ZA 2XGIA 3N12A 5BXTA 3AXHA 4GI8A 2WZEA 4MJ4A 1WE5A 2V3GA 3TTYA 3RIKA 1HJVA 4D6CA 1W9XA 1GW1A 4H41A 1GNXA 3ECQA 1RP8A 3HN3A 3WQ8A 4F66A 3BAKA 1JFXA 1AQ0A 3OLDA 2GK1B 5M3WA 2ZOXA 1BG9A 3A4WA 3T08A 2FDMA 3TOPA 4AZGA 4WKAA 1Q4NX 1ISWA 3GXMA 3OG2A 2XVKA 3WEOA 2WXDM 2IUZA 4C7FA 2ZE0A 1GJWA 1QBAA 4MJ2A 1ECEA 1K9EA 1KCLA 4AZCA 2B31A 3ARRA 1UA7A 2XFFA 1XSKA 2A3CA 3IK2A 4P7NA 4UFIA 4IPNB 1JFHA 3BAYA 3MV01 1E6RA 2WB5A 3M07A 4CN6A 5ABGA 5A8OA 3B8SA 3BGAA 3HJEA 4DM2A 1F4AA 2J7FA 3LPOA 4ACZB 3EMZA 1MQQA 2VX6A 2VNCA 3VIMA 1VEPA 4GZJA 1GOMA 1BPLB 1JDCA 4CVUA 1HL8A 5BYWA 1VFOA 2JALA 2CCRA 2XSAA 3GNRA 3WH6A 3W29A 1ZU8A 1C90A 2W61A 4EAMA 3TA9A 1O7AA 5A6KA 2VX5A 2VCAA 3AHTA 5HPOA 4V27A 4FF5A 2VX4A 2F2HA 4GIAA 5FL1A 3AIVA 3WD1A 1J0HA 1E0VA 4H8UA 3VX0A 1V3LA 1Y7VA 4M80A 1E6SM 1H5VA 1E1FA 4AZ6A 1B3VA 2IXVA 4W87A 2WLYA 3WNLA 5CSUA 5IHSA 1H0IA 1C8YA 4BS0A 3A6OA 3T09A 4D6IA 3CZEA 3U57A 2CNCA 1H0GA 2WYSA 1LL4A 1MXGA 3K1DA 1B9ZA 2WVVB 2BVYA 4J28A 4AY1A 3OA5A 1W3LA 3VVGA 1QHZA 5ABFB 3CIVA 2VQUA 5CZKA 3L2LA 1NOUA 5AC5A 2W92A 1GUVA 4HA3A 3TP4A 1WZKA 4GO9A 1MW0A 1FFRA 2OYKA 2DIJA 4W86A 2CITA 1HT6A 1QBBA 1V02A 1CLXA 1DWGM 5AYBA 3WNNA 2WM0A 5JIWA 4D72A 4FLQA 4JFTA 3PZUA 1P6WA 2W67A 1FHDA 3K8LA 4AZHA 5EFFA 3BMWA 2O92A 4AEEA 3QR3A 2D3LA 1HVQA 1KR0A 1IT0A 2UY3A 4AWEA 4V2XA 4AD2A 3WDPP 2UY4A 1W2VA 2DQXA 2JEPA 3N04A 2ZUSA 4M29A 1CXLA 1R86A 3L4VA 4CCEA 1W9PA 1ISYA 5CGTA 2NW0A 2J4GA 3WIJA 1UH3A 2XG9A 3II1A 3M7SA 1W1TA 2Y8KA 1HIZA 2E40A 4IUGA 1NH6A 2DH2A 3ZOAA 4ZE5A 1MFUA 3AI0A 1JZ4A 3O2LA 5I24A 3VO0A 1BG4A 3NSMA 2WWCA 2VRQA 4F8XA 5JBFA 2W91A 3U5UA 3VGEA 3SCQA 1XH2A 3LPFA 1KWGA 1CXIA 2AAAA 2G3NA 1DHKA 4PEEA 1R7OA 4KWUA 4TOQA 4PMDA 5I0DA 3BC9A 3WNKA 4JHOA 1GVYA 1J0KA 4GXPA 3NDYA 4D71A 2J7HA 3ZSSA 1S46A 3POHA 3EYPA 3SCUA 1CDGA 2EO7A 4EK7A 3WBEA 5A3HA 3RJXA 2DDXA 1QNQA 5D9OA 2ZXDA 2J47A 3OIHA 3QHNA 2WW5A 3W6MA 2CXGA 4Z2GA 1VF8A 1ISXA 2X0YA 1CLVA 3AYRA 2OSWA 3ARYA 1E3XA 2BHZA 3WKZA 4AEFA 1XV8A 2D2OA 1JF5A 5IXEA 1SYTA 3T0BA 1GCYA 3AMLA 1BSIA 1HF6A 1JIBA 3IAQA 4CU8A 4MAVA 1WP6A 1KQZA 4D6FA 1UWRA 1RPKA 4U2ZA 3ARVA 4UR9A 1TE1A 1WPCA 4V28A 1WDPA 1EH9A 1FH9A 2QMKA 1ZJAA 1AMYA 1I75A 4BF7A 3PZGA 1UWSA 2GK1A 1RH9A 4JKMA 1H3GA 2ZX9A 1CYGA 1PX4A 2YA2A 1VB9A 4L4PA 3ZT7A 3IAPA 3CGTA 3WQVA 1BVZA 1LWJA 1CGVA 2VL4A 1UR2A 1UR0A 1TFVA 2CIPA 2VT0A 3PZMA 1KR1A 1E43A 4QLKA 1J12A 3ZJ7A 2VJXA 4BA0A 3NIYA 3VDCA 1VFMA 3ZR5A 5AYIA 1UZ1A 3CH9A 3NSXA 1UKTA 1J0IA 3AIRA 4W84A 3VGGA 4PMQA 1B1YA 2CBUA 1C91A 3B9DA 3WH7A 4AZIA 4ACZA 4GINA 4JKKA 5A6AA 3IJ9A 4DUXA 1OINA 4W89A 1V6YA 1QNOA 1XRVA 3SCNA 2DH3A 4WKFA 5JBEA 3WL1A 1OB0A 3RM4A 2V5DA 1EOKA 1CNVA 2W66A 1UR1A 2VR4A 3RMEA 3WMSA 2VMFA 2J25A 1TMQA 3GTNA 4CU7A 4AZCB 2Y24A 1ODUA 4JL2A 1H2JA 2V3DA 3K8MA 4JKLA 3WNPA 1HKMA 1BYCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1KBK A;  2DZW A;  3WEZ A;  1B3O A;  1HO1 A;  3ELF A;  2UWF A;  5H8P A;  1HKI A;  2OKT A;  1H49 A;  3ART A;  3CAS A;  5JH1 A;  2QII A;  3U2C A;  3APG A;  3M6Y A;  1QPL A;  5G4E A;  2G41 A;  4HCH A;  1A5C A;  1PAM A;  4IJC A;  1X6L A;  1HX0 A;  2CBJ A;  1OQF A;  2A7R A;  3KM8 A;  2J74 A;  2M1I A;  1BYB A;  1RJQ A;  1IWP A;  2A3H A;  3LCW A;  4N19 A;  4LGX A;  3IGH X;  4YPJ A;  3B8U A;  4PZV A;  3W25 A;  3AC0 A;  1HKK A;  3RFW A;  1YU0 A;  2GOU A;  1GRJ A;  2HEJ A;  5CPM A;  2FHB A;  1FH7 A;  2AL2 B;  3PUG A;  4HPX A;  3UXL A;  3EOU A;  2I9U A;  4MB3 A;  1SO4 A;  4C5Y A;  4OGZ A;  1A5M C;  1XH1 A;  3C4U A;  3STP A;  1ZCN A;  2IPF A;  4IH3 A;  4CQ8 A;  4ZTX A;  2Z2A A;  3K1G A;  5CC3 A;  4IUO A;  4G50 A;  3SUW A;  3AMC A;  1FCU A;  3GZA A;  3SCV A;  1R87 A;  4MIM A;  1UAS A;  5JXQ A;  1DBT A;  3F4N A;  3WSU A;  3N14 A;  3VNJ A;  4UFK A;  3R4I A;  2WQP A;  4LYR A;  5HDR A;  3FS2 A;  3VUS A;  3LD5 A;  2GYI A;  3IKD A;  2CLH A;  3EKZ A;  2PN0 A;  1UCW A;  1HFB A;  1FKB A;  2CHO A;  2NQL A;  4OZO A;  2CC0 A;  2X0S A;  4MJM A;  1WDQ A;  2FJU B;  1IGW A;  2E3Z A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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