4Z2JA

Serratia marcescens chitinase b complexed with macrolide inhibitor 31
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Chitinase B
publication title Creation of Customized Bioactivity within a 14-Membered Macrolide Scaffold: Design, Synthesis, and Biological Evaluation Using a Family-18 Chitinase
pubmed doi rcsb
source organism Serratia marcescens
total genus 161
structure length 498
sequence length 498
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 4z2jA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4z2jA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4z2jA01
4JFUA 3F5LA 1HP5A 2WC3A 1E15A 3UG5A 3GH4A 2G3MA 2XJ7A 2E9LA 3VNZA 1J0YA 5CQ1A 3N18A 2CBUA 3BLKA 4U2ZA 3THCA 3WNPA 4D1IA 3ZJ8A 2ZUNA 1B9ZA 1XC6A 3WF3A 3OGSA 4C7GA 1FP8A 1UKQA 3SUUA 4CCCA 1LL4A 2XGIA 4R27A 3W6LA 1GJUA 2ZXDA 3SIMA 4AWEA 1W2VA 3B9DA 4C7FA 1HJUA 1CZ1A 2ZIDA 4ACZA 1QNPA 2E0PA 4TVUA 1JYNA 1E40A 2XSBA 1UWUA 1UR9A 5CLTA 4W8LA 1NWTA 3ARSA 3M46A 4WSJA 2YBUA 3QHMA 3WEMA 5LYRA 1B3VA 2J47A 5BROA 1JZ4A 5HPOA 2YA0A 5HBFA 3EDDA 3L4TA 1H0GA 4KGJA 1TMQA 1XRVA 1CGWA 5A69A 1AIWA 2F61A 3A4XA 3SCRA 1CYGA 3TA9A 1NP0A 3CZEA 3CTTA 2CBVA 2O9OA 3N17A 3NCOA 2WHLA 1EIBA 4D6EA 3N15A 5M5DA 4HOZA 1HL9A 5IFPA 5D9OA 3UESA 2PBOA 4PBGA 2XVPA 3WQ8A 4GO9A 4GPNA 3HN3A 1CECA 4W5ZA 4H7VA 2E8YA 2X8RA 2V3EA 3PZIA 5BWFA 4ATLA 2DT0A 4KRUA 4CVUA 4TUFA 2EXOA 4PRWA 1MQQA 3II1A 4PMOA 3BLPX 1ZS2A 1WDRA 1KXTA 3G6MA 1E6NA 2CXGA 5CSYA 2WC4A 4GI8A 5D9MA 4Z2KA 3T2QA 5GNYA 1UA3A 3TP4A 3DC0A 4WK9A 3K4DA 4PMXA 5BRPA 4HTYA 1IZKA 5A2CA 4E8DA 3BSHA 5KEZA 4YPJA 3MANA 4UQ9A 4GI9A 2PWFA 3SCSA 1QNRA 3VMNA 4UFHA 1UQYA 4PUDA 4UR9A 1S46A 4W7UA 1HVQA 1CEOA 2VX5A 5BXTA 1ZBKA 3AMGA 2W92A 4QLKA 3PZQA 3BAIA 1TCMA 2PWDA 4DM2A 2J74A 2QMKA 2DT2A 2J7DA 1KR1A 1FH9A 1R7OA 4PCSA 3WDRA 1K9FA 3PZNA 1V3LA 1XYFA 1QPKA 1HL8A 3WQ5A 2ZWYA 5A95A 3VDBA 1EQPA 1J0ZA 2XVNA 5DF0A 1TUXA 2VCAA 5E6ZA 3AIRA 3WDQA 2DSKA 1LJYA 2CBJA 4UTFA 5E09A 3ZR5A 2NT1A 2NSXA 1MQPA 1V0MA 3POCA 1JAKA 5FL0A 3SUSA 3CUHA 1LWHA 1QVBA 4U33A 5I24A 4W85A 2GVYA 2C7FA 3EDJA 4D6FA 3L4VA 3GBDA 2J4GA 3WQWA 3MUIA 2VURA 1B3XA 3CMGA 4D72A 4M81A 1XD0A 2EPNA 4ZE5A 3WF0A 3WNNA 4DWSB 3L2MA 3BCDA 4UFMA 2XGBA 5A1AA 4Z2IA 2TAAA 1XSIA 3K46A 2V5DA 3W0KA 1W9DM 3OA5A 3UERA 2DT1A 1MXGA 1GZJA 2WMJA 2E4TA 5A6KA 3DYOA 1XD1A 1KWGA 1ITCA 2FGLA 1G9HA 2WKLA 4H8VA 1JIBA 5EFFA 1CLXA 4MB5A 3WL0A 1Q4NX 1EA9C 1E6RA 1DEDA 4GZEA 2XIBA 4PMUA 3UEQA 3PZ9A 1UQZA 1BYDA 5D4YA 4F9DA 3CZ8A 1XCXA 3LMYA 2DIEA 3PZGA 3VNYA 4AD0A 1VIWA 4XZWA 1V6WA 1SR0A 2JIEA 2V5CA 2XWDA 4MNLA 3AIUA 3WSUA 1MW2A 3UG3A 2EO7A 5AYIA 1JNDA 2YOCA 1BQCA 4AZIA 1GONA 5IDIA 2DH2A 1W9BM 1H49A 4TTUA 4QP0A 1QI5A 2GJXB 1EOKA 1ZJAA 2J7HA 1H5VA 4DWSA 3AIVA 2YA1A 5LA0A 1WZLA 2E9BA 4HA1A 2ZX7A 4HPHA 1JD7A 4U5KA 2XYLA 1V0LA 1E43A 2HISA 3LPPA 1HJWA 1CGXA 2G3NA 2XVGA 1ESWA 1SMDA 3T08A 4MPKA 4JL2A 1E0VA 5C70A 1SYTA 4NRSA 1JFXA 4AD2A 1C90A 1OD8A 3AICA 3W6MA 4ZEPA 4AZBA 1E9LA 2Y24A 1KCKA 1GOKA 1TA3B 3QGVA 4PMDA 2O9TA 2CKSA 2VO5A 1JAEA 4BS0A 1V6XA 2EQDA 2PB1A 2ZX8A 3FN9A 3VILA 1JDAA 5IHSA 2O9RA 5D9NA 2Z1SA 3BCFA 1FP9A 3VO0A 5A6BA 2VCBA 4CVWA 3VIOA 4S3JA 2Y8VA 1U30A 4ZFMA 2WLYA 2AMGA 2WHJA 2GJXA 3W25A 4L4PA 3A6OA 1ZBCA 3NUKA 1CGUA 4D6HA 1MVYA 1X6LA 7A3HA 3AHZA 5BYWA 1VEOA 2WKGA 3AZTA 1NWSA 2WNWA 2HVMA 1NM9A 1CNVA 3WH8A 1BHGA 1MXDA 2C0HA 5BXRA 3SURA 2B31A 2VZSA 2WHKA 1MWOA 2BHUA 2J79A 1QI2A 2ZUMA 2G8ZA 2WVVB 3U57A 1NWRA 2J62A 4HP5A 3G6LA 5AC5A 4MDPA 4JHOA 5E6YA 3S6TA 2VI0A 3L2LA 1MW1A 1TA3A 1VEPA 2DH3A 4TXEA 1U2YA 4HMDA 4PSRA 1WDQA 3MV01 3LPFA 4BQ4A 1VJSA 2WMHA 2VUYA 1B1YA 2BY1A 2DDXA 1SFSA 4HOWA 2VCCA 4GINA 1NP2A 3WUEA 3GM8A 3S2CA 2F2HA 3CHFA 5CZKA 2VNCA 2WSPA 1QHOA 3CHEA 3GXMA 2CPUA 3K4AA 5JUVA 1CTNA 2W91A 3CUJA 4HMCA 3PTQA 1D7FA 2J7BA 5C8BB 1BG4A 1UWQA 5FOOA 2WMIB 5DO8A 1XGZA 3HJEA 4YN5A 2AOSA 1H1NA 1G01A 3W38A 4WIWA 1BVNP 3SCPA 1JD9A 2VVNA 3BMWA 3QOMA 1E71M 4CGTA 1QW8A 3THDA 2DSVA 2WVVA 4AZHA 4CD6A 5DT7A 1NOWA 3O6AA 3IJ9A 1CXHA 4AISA 1B2YA 2WANA 1BYAA 1IV8A 2VZVA 3PBGA 1W1YA 4UQAA 2BXZA 4X0VA 3T09A 1BF2A 1V3JA 3RM4A 2J8FA 5D9PA 1AQMA 1VAHA 5A6SA 5BRQA 1J01A 1IZJA 3ZOAA 4A3YA 4JFSA 4J3WA 2VX6A 3AHTA 3BAJA 3SCUA 3CUFA 1EOMA 3RDKA 5EMYA 2XWEA 1PX3A 3VINA 2VTFA 1WPCA 1UUQA 1GORA 4EAMA 2VX7A 4DUWA 2E8ZA 3CGTA 3AQUA 5EFDA 3WUFA 1Q6GA 3CMJA 4NI3A 1MW0A 1C7TA 1UR8A 2DQXA 1XCWA 3MUY1 1G5AA 2WMIA 4PUEA 5FIPA 3AXHA 5CGTA 1UHVA 5LA1A 1OGSA 3AIEA 2ESCA 2XG9A 1JF5A 4OJYA 1RPKA 5CJ5A 3L4ZA 1B3WA 1TVPA 4GIAA 1PZ3A 3GBEA 2GJPA 3VIFA 1E56A 1EO7A 1HJXA 5A6MA 4MNKA 4R5EA 1LQ0A 4AD4A 4GO8A 5A8PA 5ABGA 4PTWA 3PZUA 2A3BA 2CHNA 3VUPA 3CUGA 1LG2A 4M80A 1PJ9A 3RM9A 2ZX9A 3KWXA 1E72M 2ZXBA 1E5JA 1WZKA 1CXFA 3MMWA 4TOQA 4W86A 1UOKA 1TFVA 4OZOA 3K1DA 4UFLA 4URIA 3EDEA 4GXPA 1WCGA 2VZTA 2PI6A 1Y7VA 2AAAA 4X9YA 3FW6A 1EQCA 4XV0A 5HXMA 4Q7NA 1E1FA 3WN6A 1I1WA 2YL6A 4EKJA 1JZ2A 2QF8A 4EE9A 1KB3A 1BGAA 2GFTA 2X2YA 1VB9A 2WM0A 2JFEX 4OKDA 1R86A 3SUTA 1N82A 5EBAA 2G3IA 4AC1X 4JFWA 2JEPA 1FFQA 2D0FA 4AIUA 1WP6A 1OD0A 4W5UA 4CD7A 4N42A 3WD4A 5JIPA 1E6PA 4FK9A 3BH4A 1PPIA 2J8GA 3WH7A 3ECQA 1SMAA 4ZXOA 3UR8A 3SCTA 1BTCA 1OSEA 4WKHA 2W62A 1DWHM 1J0KA 1KGWA 3SCWA 2YJQA 3AHXA 5ABFB 1PZ2A 1G0CA 2JALA 4P8VA 1HT6A 1US2A 3IAQA 1JDDA 3WBEA 2FDMA 4FLSA 4B16A 5FL1A 2D23A 1J0HA 4AZGA 2OWWA 1JDCA 2XM1A 4BF7A 1V0NA 2WMFA 3ARTA 3AIWA 1VFOA 4U3AA 4FLRA 1RD6A 3W53A 1V08A 5C71A 1CXEA 1ISVA 4W7VA 1JZ5A 3EMZA 5A2AA 2OSWA 2WVUA 4W8AA 3U7BA 3KEHA 1ODZA 1JYWA 4CD4A 2J77A 1HKKA 4GZIA 5A3HA 4UCFA 3WH9A 2EEXA 3AZRA 1E6SM 2W61A 4OBSA 1E6XM 4P7LA 3NYDA 1B3YA 3ZJ7A 4WKAA 1OM0A 2WBKA 3AMDA 1ED7A 4OOZA 4XUYA 4P7OA 3SCQA 4PSPA 1W1TA 4D6DA 2GDVA 4UNIA 1VFUA 1EGZA 2Y4SA 3MU7A 1V3HA 1M01A 3EYPA 4M24A 4U31A 2RGLA 5A8OA 3CZKA 3EDKA 3WY1A 5ABFA 1DTUA 2IXUA 3LPOA 4H2CA 4RE2A 3FY1A 4BQ2A 4UFJA 4CCEA 1B3ZA 4A3HA 1W9VA 1E4NA 3EMQA 3MMUA 2V3GA 2BHZA 2BXYA 3WKZA 2Y8KA 2XPKA 4PMNA 3WQ4A 2FH8A 1W91A 2J75A 4UOJA 1KXQA 2WHMA 3GZAA 3HU7A 4JCMA 1C92A 2OSXA 1JI2A 1KQYA 1JZ6A 4HOXA 3WD2A 2Q8XA 4MB1A 3W4RA 2FH6A 4AZ5A 1PAMA 4IM4A 2V3FA 2E40A 3CUIA 1CLVA 1ECEA 2QHAA 4W88A 3ARXA 4FMVA 2UY5A 4CN6A 4QDMA 1H3GA 1Q6EA 4X0NA 4WLCA 3GXDA 1KXHA 4MNMA 4AIEA 4IPNB 3MS8A 1RH9A 3KL5A 2D3NA 4M8UA 1MW3A 3VD4A 1C7SA 3I3DA 1MFVA 4LXFA 4KH2A 5CPQA 4HZ8A 3F4VA 1Q6DA 1WZMA 3N04A 4CU8A 2EPKX 1E4IA 4YHGA 1OWQA 4TVDA 2ZX6A 1HVXA 3WL1A 1U33A 1KGUA 1GVIA 2XFFA 5I3DA 1CGYA 2CHOA 4FLQA 4MADA 3ZM8A 4GKLA 1C8QA 2QMJA 2X1IA 1QOXA 2UY4A 5BXSA 1UG6A 1WO2A 1J9YA 3W82A 1CWYA 2NW0A 5I2UA 5I77A 1QI3A 2UWFA 1F4AA 4WJXA 4XB3A 4B9YA 2EPLX 4XZBA 1BPLB 4HA4A 5HOSA 3AMKA 2DT3A 1OCQA 3T2PA 1QHPA 3WF4A 4UFIA 4J28A 4TTGA 1VRXA 3NIYA 4AZ7A 1OGGA 3PZVA 3NSNA 3ALGA 3WELA 2BNJA 4ZE4A 2ZXQA 3T0AA 1HKIA 3OLDA 5E0CA 9CGTA 1GUVA 1AMYA 1V0KA 3WIJA 3L4XA 4AY1A 5M03A 1PX4A 1TR1A 4UQDA 1FH8A 1XV8A 1XSJA 3O2LA 1V3IA 1LLOA 1UKPA 4PTMA 2WBGA 2XVLA 3U7VA 2VRJA 1EXPA 2D24A 3WF1A 1UH3A 1LL7A 1GQLA 1TZ7A 2ZWZA 2E3ZA 2OYMA 3VDAA 1QW9A 4CN4A 1RP8A 3SCOA 5CXPA 1CXKA 1GQIA 3VD5A 3IJ8A 2PWGA 1E3ZA 2GJRA 2X0YA 3VIKA 1LF1A 3VGEA 1J0IA 4W89A 2JF6A 2EPOA 4UQBA 3RM8A 3I3BA 1W1PA 3FAXA 2YDSA 1H09A 1E5NA 3ZJKA 4HPGA 1VBRA 1ZU8A 2Z1KA 3TONA 1HJQA 1JXJA 2UY2A 3CZJA 2FHBA 5BCAA 2ZUVA 2VR5A 4Z2JA 2J78A 3APGA 4P7RA 3GNOA 2YL9A 2FHFA 5CLWA 1H2JA 3PZOA 3EMCA 3MO4A 4UOZA 3WMSA 1P6WA 2Y5EA 2BY0A 3TTQA 3ZR6A 1HN1A 2QV4A 4JAWA 1UKOA 4UQEA 3W29A 1XHGA 3SEPA 2DIJA 1QI4A 3W28A 1TE1A 3VDCA 2XM2A 3O9NA 3SUWA 1VFFA 2WXDM 1ITXA 2D0HA 2VC9A 2WB5A 4PMYA 4CN1A 3PTKA 2XVKA 1ZJBA 2WPGA 5I5RA 3WFZA 1JZ8A 3WNMA 1QI0A 2O9PA 3N13A 4B3LA 4HA3A 5ABHA 1JF6A 3CZLA 3VM7A 2CIPA 3MV11 4UZUA 3GXFA 5FKYA 2VQTA 2WVTA 5HDRA 5E0FA 5CGMA 5CSUA 2DSZA 4PTVA 2PF0A 4B15A 3OG2A 1K9EA 4KWUA 3ZSSA 4WKFA 1VFMA 1MFUA 4QLLA 3WUGA 3VKKA 1BYCA 2WC7A 3TOPA 1NARA 3WF2A 2JEQA 1K9TA 3ARRA 3W81A 2XSAA 3A4WA 1BLIA 1IT0A 4NZCA 1QHZA 4JZ5A 4P8UA 1E6ZA 5IXEA 3MKKA 1RP9A 1WZAA 1CBGA 2D49A 2W66A 3PZMA 1UD5A 1F4HA 2VJXA 3N12A 4GI6A 4MTVA 1UH4A 2CYGA 5KZ6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2W4X A;  2IXV A;  4OUE A;  1ODU A;  5E70 A;  1UKS A;  3BAX A;  3U5U A;  1GW1 A;  3ZO9 A;  1QBA A;  2YL8 A;  3EBV A;  1B30 A;  1JGI A;  1QNS A;  3DYM A;  5GNZ A;  2E9M A;  6A3H A;  1WDS A;  1A47 A;  4EK7 A;  3AZS A;  3I3E A;  3CZG A;  2W67 A;  2VRQ A;  1GQJ A;  4UOQ A;  3WQ6 A;  5A8N A;  5I23 A;  2WCS A;  2RGM A;  1V03 A;  3SUV A;  3MSG A;  1D3C A;  1EDG A;  1X1N A;  5LA2 A;  2ZOX A;  3DHU A;  1GNX A;  4V28 A;  2D0G A;  1W3K A;  3KE0 A;  5HNN A;  4AIO A;  4NRR A;  3W24 A;  2A3C A;  1V3M A;  5A2B A;  1V02 A;  4DUX A;  3K8M A;  4N0R A;  2OWX A;  1L8N A;  1E1E A;  1QBB A;  5ABE A;  1H4P A;  4ATD A;  8CGT A;  4J3T A;  4HME A;  5GPR A;  2J7E A;  3VD7 A;  1DHK A;  3ARP A;  2WMG A;  4W93 A;  2VT0 A;  1EDQ A;  1MYR A;  3BC9 A;  1JZ7 A;  2WWC A;  2WSK A;  6CGT A;  4P7Q A;  3WFL A;  1VEN A;  3OGV A;  1HJS A;  1FH7 A;  3K8L A;  4Q22 A;  4V27 A;  4DUV A;  4AD3 A;  2OYK A;  1JZ3 A;  4H41 A;  4OBR A;  3AOF A;  3VII A;  1PEZ A;  4U3C A;  1UWR A;  1EHA A;  2CCR A;  3UG4 A;  2WCA A;  2F8Q A;  4LX4 A;  1XH2 A;  1O6I A;  4KGL A;  4A4A A;  1V6V A;  1H0I A;  5A8M A;  2XUC A;  1V02 E;  1E4M M;  3AXI A;  3A3H A;  1EHN A;  3CIV A;  2IUZ A;  2BFG A;  1UD8 A;  2YL5 A;  1W1V A;  2QPS A;  3FHA A;  1J10 A;  2FHC A;  3RJX A;  6TAA A;  4S3K A;  3CO4 A;  4QCF A;  1NQ6 A;  3ALF A;  1KXV A;  1UR2 A;  4ACZ B;  4C7D A;  3L4Y A;  1AVA A;  5FD0 A;  3AML A;  4E8C A;  1ISX A;  3VIM A;  1E6Q M;  1K6A A;  3DEC A;  3OLE A;  2CBI A;  3WQV A;  2D22 A;  3WBA A;  1GHS A;  3AHY A;  3KL0 A;  2A3H A;  4E4P A;  1I75 A;  4B9Z A;  4MB3 A;  5IHR A;  5A8Q A;  2VX4 A;  3E1F 1;  4FF5 A;  2ZIC A;  3WEO A;  2ZUW A;  1BAG A;  3WD0 A;  3AS3 A;  4PMR A;  2G41 A;  2X0H A;  3MUA A;  2X09 A;  3VGF A;  1M03 A;  1UD2 A;  4WSK A;  1JYV A;  1HX0 A;  1BSI A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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