4Z2LA

Serratia marcescens chitinase b complexed with macrolide inhibitor 33
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Chitinase B
publication title Creation of Customized Bioactivity within a 14-Membered Macrolide Scaffold: Design, Synthesis, and Biological Evaluation Using a Family-18 Chitinase
pubmed doi rcsb
source organism Serratia marcescens
total genus 161
structure length 498
sequence length 498
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 4z2lA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4z2lA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4z2lA01
3RJXA 3WF1A 5GNYA 5IHRA 4S3JA 2WMIB 3WQ6A 4JFTA 4CD8A 1LG1A 5CPQA 4HP5A 3W29A 1E6ZA 2J47A 1BGGA 3W0KA 3IAPA 3AZSA 3B9EA 4NF7A 3VDHA 2FDMA 2D3NA 2VQTA 3RILA 1G9HA 3BSGA 1RP9A 2WMKA 2J79A 3WNPA 3CTTA 4CCEA 3PZTA 2XGBA 4AISA 2EO7A 3CBWA 1HT6A 2CBUA 4V28A 1CGWA 1I1WA 4HU0A 5HPOA 4NRRA 3AYRA 4U3AA 5A2BA 3MU7A 3UESA 5GQBA 1J0KA 3PZGA 3L4TA 3VD3A 5DEZA 2VZSA 1CBGA 1UH3A 2BS9A 3ZQ9A 1OINA 4CU7A 3FW6A 3PZMA 1FFQA 1GONA 2FH8A 3VX0A 1TFVA 2YL9A 4UZSA 3K1DA 4UCFA 4JL2A 3IJ8A 4J7RA 1TZ7A 2F2HA 3THCA 1ISVA 3WFZA 1H09A 5EBAA 1AIWA 4UR9A 1OD8A 4AMCA 2GUYA 3WSUA 2JALA 4GXPA 5FIPA 1GZJA 7A3HA 2O9OA 4Z2GA 2D22A 3WNLA 1G94A 4TVCA 4DWSD 3VVGA 1C8QA 1CPUA 4LQ1A 2YL6A 2W66A 1JZ7A 3WF3A 4W85A 1B3ZA 1W3KA 3ZJKA 4P8UA 1E1EA 4CD7A 1TR1A 2X09A 1GCYA 3S2CA 3CZJA 1UUQA 2D49A 1V3IA 4D6CA 4PYSA 3CUJA 4W5UA 1JZ6A 2ZE0A 4P7NA 1V3KA 1ISYA 2QPUA 2YJQA 3FNDA 4HU8A 1Q6FA 2BVDA 4WKHA 1QNPA 4HMCA 1EQPA 1TUXA 3BAXA 1FH9A 5DT5A 2JF7A 1KQZA 4URIA 4UFHA 1XD1A 4D6JA 1GORA 1C7TA 2VZOA 1OSEA 3U57A 3WEZA 5GPRA 1G01A 4H2CA 3ZM8A 1NOWA 2NT0A 3T0BA 1GOIA 2J7GA 1Q6GA 2JF6A 2VCCA 1H5VA 3WDJA 1VB9A 1HVXA 4ZFMA 1E6PA 1E3ZA 4QLJA 2X2YA 2NW0A 3CMGA 3BMVA 1XD0A 3SCOA 4JL1A 2WWDA 1ZB5A 1CXHA 4GIAA 3UG3A 5ABGA 2PWGA 2G3NA 4LYRA 5I77A 2BV9A 5D4YA 2WM0A 4MNJA 4JKKA 2W67A 3WDRA 3WMBA 2XIIA 4XZBA 4LYQA 1ISXA 2VX7A 4F79A 3K8KA 1KGWA 2BY0A 4M24A 2OSWA 3KEHA 4PSRA 2VURA 5AC4A 4QCFA 1XV8A 4PMYA 2XTKA 2WKGA 5EFFA 4JKLA 1EDTA 4HOXA 1MW2A 1JI1A 1E1FA 1HL9A 2E9BA 1PX8A 1C90A 2W63A 2DH2A 1WDRA 2FHCA 1H0IA 4L4PA 5M17A 5I2UA 2VI0A 7CGTA 4GZEA 3VIGA 1W2VA 2E3ZA 4HPHA 2QF8A 1MFVA 3E1F1 2WSPA 1RD6A 3PTKA 1DTUA 2XM1A 3N12A 1BHGA 3M46A 3TTQA 4R5EA 2HVMA 1M03A 1GJWA 1M53A 5JIWA 2Y5EA 2E9LA 1XCXA 5CGTA 1OT1A 4Q22A 3A4WA 4IM4A 1ZU8A 1JYVA 2Z1SA 1JGIA 5BXSA 2CERA 2UWFA 1UH2A 4C7DA 2ZX7A 3BLPX 2XG9A 3KE0A 5FKYA 3AOFA 1LG2A 1R7AA 1MXDA 1JD7A 1RPKA 3D3AA 1IV8A 2QPSA 4TTUA 1V3HA 3W82A 4DUXA 1KGXA 1XH1A 1BYAA 1LLOA 3SCSA 2E40A 3AXXA 1EDGA 3WNOA 1RP8A 2WYSA 1GHRA 1WKYA 3MANA 3TOPA 2YBUA 1CGYA 4LYPA 3SCNA 1C8YA 3VINA 2ZUTA 4PBGA 1MXGA 4UQCA 3MO4A 1E15A 5ECUA 3I3BA 1QBBA 5KZ6A 1Y7VA 2CYGA 1H11A 7TAAA 1UHVA 1SMDA 4GO8A 2J62A 4JFVA 1NOUA 2G4FA 4D71A 3L4ZA 3U7VA 3WENA 3WH8A 4JIEA 2J7DA 2VT0A 2O9TA 2X05A 1CDGA 3OGSA 3CZLA 1X6NA 1DWFM 1JFXA 3SUSA 1H49A 1E0XA 1FA2A 1WCGA 1CZ1A 1VJZA 1KQYA 1HJUA 4AEEA 2A3BA 1V6UA 2E0PA 4ZXOA 3SUUA 4V2XA 2VC9A 3OG2A 2J7HA 2WLYA 1AVAA 6TAAA 1QNRA 1VEPA 1VFUA 3DHPA 5IHSA 3BXWA 5DMYA 3POHA 3WQWA 2EPMX 3WD1A 2WNWA 2JIWA 4PUDA 1GPFA 5CXPA 1CECA 4UQDA 2XSBA 1WNOA 4J3XA 1BGAA 4D6HA 1FHLA 2J7FA 3VIIA 3VX1A 1H4PA 1OD0A 1QI2A 3W37A 4P8WA 3LPGA 3ARTA 1G1YA 4AD3A 3UCQA 2O92A 4RE3A 3GH7A 3QHMA 1ECEA 2ZUNA 1OIFA 4CD4A 1W3JA 2EPNA 2WANA 1J11A 3MV01 3PBGA 2ZIDA 1JL8A 1QW9A 5CPTA 2XVGA 4MJ4A 5AYBA 1XRVA 3BC9A 1VFMA 3VMOA 1W9XA 1B3WA 2MANA 1OGGA 2JE8A 1OGBA 1ZBKA 3OGRA 3DECA 4UQAA 4AZIA 1GQIA 1B3XA 1JZ5A 5ABFA 2VZTA 3POCA 3T09A 3IJ9A 3WMSA 1J10A 4A3HA 4HA4A 4HMEA 2ZX6A 3AS0A 4P7QA 1I75A 1UWUA 1W91A 5M03A 1JG9A 1UWRA 5A8PA 3ZIZA 1HJSA 1BYDA 4OOUA 4RE2A 4BA0A 6A3HA 2VOTA 1SYTA 1B9ZA 3FN9A 5JBDA 3VDAA 1LL4A 3IAQA 3K8LA 1C8XA 3WKZA 3WEMA 1JF6A 2J25A 1LJYA 3AS1A 2WPGA 1HJVA 5FCZA 1PX4A 3OB8A 4CN6A 4HPGA 1QVBA 3AMKA 2XVLA 2OWXA 3VPLA 4AZCB 1NP2A 2GJXB 1XSKA 1UD3A 2XPKA 1QHOA 3WQ5A 2VZVA 3SCWA 1UKPA 4WJXA 1JAKA 3VD4A 3CPUA 1V6VA 5CLWA 1V02A 3AMLA 5A6BD 4UFLA 1OWQA 3AS2A 3EDDA 2CIPA 2ZX8A 3QHOA 5LYRA 3SCQA 1DEDA 2YA0A 2A3CA 1GOMA 1WB0A 3L2MA 3VIPA 1H41A 1HN1A 3WN6A 3KL0A 1VBUA 4HTYA 5CLTA 5E0CA 1NARA 3VIFA 2Y4SA 1A47A 1KXVA 2VTFA 2XGIA 2WMJA 3K8MA 1MW1A 2PB1A 1E4LA 4AY1A 4PTXA 4MB1A 5FOOA 2EJ1A 4BS0A 3SUWA 3MS8A 1JYXA 4PRWA 5IFPA 1SR0A 2D24A 1QNSA 2VX4A 3KL3A 2D20A 3WNNA 5JUVA 1KWGA 2IXUA 4D72A 1BAGA 3BAKA 3DC0A 4MNMA 1VFFA 2VX5A 2DSWA 2DGAA 4ACYA 4WLCA 1J0JA 1Q6CA 5C8BB 4CGTA 2WVUA 4CU8A 4WSKA 1W9BM 2BHZA 3FAXA 5A6AA 4UQEA 3RM8A 2VZUA 5A6KA 1E70M 1UQZA 3NJ3A 4AIEA 3AROA 1UG6A 2CNCA 4KGLA 4ML4A 4D6EA 3QGVA 4QAWA 3AISA 4AZ7A 4JFWA 4KWUA 2Y8VA 1FP9A 2VMFA 1BG4A 5LA0A 1JXJA 1E4MM 5LA1A 1VENA 2VL4A 5FL0A 4A3YA 4LPCA 1E71M 4U31A 2FGLA 3WDQA 4CCCA 2VQUA 5ABEA 3VGHA 2WMIA 4P7LA 1HJQA 1LF1A 4QLLA 2YL5A 1M7XA 1WZMA 3CZKA 3ZJ6A 3EMZA 2CITA 5A95A 1PIFA 1KFWA 4QCEA 1JXKA 1HP5A 1XGZA 1DWJM 1WE5A 1XSIA 1W32A 2ZWYA 2OLHA 1EGZA 1E4NA 5A1AA 1WO2A 2Y2WA 1VJSA 1P6WA 4HZ8A 1Q6DA 1MFUA 1HJXA 3WD2A 3VILA 5BRPA 2A3AA 3ARZA 2PWEA 3WBAA 3N17A 2W62A 3GXMA 1MWOA 2QMJA 2VVSA 2BHUA 4JCMA 5I5RA 3N1AA 4H41A 1H0GA 2Y8KA 4J3SA 3AQUA 3ARPA 3OZPA 3VO0A 1UD5A 4MPKA 4X0VA 4ZEPA 1UR0A 1DWHM 3GDBA 1BTCA 2WSKA 4FLSA 4FF5A 4IUGA 1JZ8A 3AZTA 2ZXDA 8A3HA 1KCKA 3WD3A 4GINA 5FL1A 5D9MA 1V0KA 4Z2IA 4MNLA 2O9PA 5EB8A 4WF7A 1UR4A 3F4VA 1Z32X 2WHLA 2AMGA 1TE1A 4BQ5A 3GH4A 1PBGA 4W89A 5E70A 3GNPA 1WPCA 1LQ0A 4CD5A 1WZAA 2XWEA 3OLIA 3WUEA 3VD9A 4P7OA 3AIBA 4H04A 2PWHA 2J8FA 4E8CA 4B3KA 1KXQA 3ALFA 4KH2A 1TVNA 2DT1A 4X9YA 2V38A 1K6AA 4W88A 4RL3A 4IISA 1E5JA 3EDKA 1PPIA 2ZICA 3RJYA 4MJ2A 3WH9A 2C7FA 3VD5A 1V08A 2WCAA 3PTQA 4M80A 1QI3A 2YKKA 4M82A 3OZOA 4UOQA 3GBEA 4HZ6A 2NT1A 4K68A 2AAAA 2WKLA 5E09A 2DEPA 1CLVA 1CEOA 2OWCA 1UQYA 1GVIA 1NQ6A 1WDQA 4XB3A 3A6OA 5A6LA 1LWJA 4A4AA 3QOMA 4BCEA 1MW0A 4J3VA 3SCRA 1MYRA 1G5AA 1UWTA 3GXDA 2J75A 1PJ9A 3PZNA 3WQVA 2ZXQA 1OGSA 2W61A 4DUVA 3THDA 2XWDA 1TVPA 4W93A 1OB0A 1E9LA 1LL7A 1VAHA 3AYSA 4UZUA 4UFMA 4W5ZA 5D8ZA 5HNNA 4WK9A 4AD1A 2TAAA 2WHMA 1VRXA 4RE4A 3VGDA 3BAWA 4W8BA 3AIUA 3AIEA 2UY4A 3CHEA 1ISWA 1GQKA 1B0IA 2J7EA 3B9DA 3WBEA 3WNMA 3EBVA 2DSVA 3CHFA 1HKIA 1C7SA 1BSIA 4M1RA 1GOKA 5IXEA 1R8LA 1QI5A 1QNQA 3VNZA 4F66A 2BY1A 3OLDA 4JFUA 5F7UA 3J7HA 3BGAA 3BAJA 1UYQA 3L4VA 9CGTA 4D1JA 5BYWA 1D3CA 4AZHA 1VFOA 1DWGM 1R85A 2WHJA 1W1TA 4DUWA 1BF2A 1EO5A 4TUFA 1QHPA 4MB5A 4U2ZA 4B9ZA 5CJ5A 3EMCA 4BQ3A 1UD4A 2VJXA 4NI3A 2CHOA 4PN2A 1C92A 2WHKA 4Z2KA 4MAVA 2PI6A 4ZXLA 3F5KA 3PTMA 2WCSA 3AHZA 4V27A 4AWEA 2F61A 4D6DA 4W84A 4AYSA 3PZUA 3GXIA 2W5FA 3QR3A 1NWTA 4F9JA 1G0CA 1TCMA 3UEQA 3ARVA 2B31A 4BQ2A 1HKMA 2E8ZA 1PEZA 4BQ4A 1ITCA 1XC6A 3CUGA 2YA1A 4GKLA 1UR2A 5C70A 4W86A 1FHDA 3KL5A 3B8SA 1EHNA 1XCWA 5E6ZA 3WDHA 1AQHA 1H3GA 1NP0A 1CXKA 3PZOA 3FHAA 1BG9A 3AI0A 1UZ1A 3VIMA 4HZ7A 1DWIM 1JZ2A 2FGZA 4OBRA 4E4PA 4CVUA 1GNXA 4MNKA 1KXTA 3MMWA 3MUAA 3O2LA 4GQRA 3VDCA 1CYGA 5I3DA 2WC7A 1XH2A 5BXRA 1W9DM 1O7AA 4KMQA 1FH7A 4D1IA 4GI6A 1XYZA 5IDIA 2GDVA 1ISZA 1HL8A 4F8XA 1E0VA 2BXYA 1B31A 3VGFA 2IXVA 2XUCA 2ZUMA 4OKDA 1WP6A 4PCSA 4CUCA 4CN1A 3AIWA 4CCDA 1VEOA 2WVVA 4FLRA 1J0ZA 3GTNA 4AZBA 3VGGA 1KBBA 3N11A 4M56A 1J01A 2BNJA 4BZYA 5CQ1A 1HKKA 4QDMA 2JFEX 1K9FA 2GJRA 3N15A 3K46A 4OUEA 3ZR6A 1JYNA 2PC8A 1E72M 2UY2A 2O9RA 2DSZA 3UETA 1H1NA 3PZVA 2DSKA 3VM7A 1BVNP 1HF6A 4JHZA 1K9EA 4DWSA 4WSJA 5I79A 3SCPA 4HMDA 4PMOA 3CMJA 3K4AA 4EAMA 2YDQA 3SCTA 3BMWA 2WBGA 2WCGA 3NSNA 1GOWA 3GXFA 4ACZB 4W8AA 2IUZA 1CTNA 4GI9A 4H7VA 3MSGA 1ZJAA 3MUY1 3I3DA 1ZBCA 4PMRA 1QOXA 3TTSA 4E2OA 4Z2JA 2XFYA 5BXPA 3PZQA 2OWWA 3OBAA 2BY2A 3BSHA 2VCBA 4PMUA 4YPJA 3CO4A 1E5NA 3ZO9A 4TVUA 2BFGA 1PZ3A 1LL6A 3D5HA 2E4TA 1CXFA 5BRQA 1D7FA 2VRJA 4AIOA 3FY1A 4B16A 2EXOA 2OYLA 3WMCA 2X1IA 3BLKA 5CSUA 4UQBA 4KRTA 5ABFB 3SCVA 3SIMA 1V6XA 2VNCA 4F9DA 3AXIA 1EOMA 3UR8A 1F4AA 1QW8A 3AFBA 1UWSA 1TA3A 3SCUA 1VBRA 2CBVA 2XFFA 3TA9A 1UH4A 3IANA 2JEQA 1KBKA 5A6JA 1W1VA 2E9MA 3VIKA 5HXMA 3AICA 3BAIA 3WELA 3TP4A 2GJXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2OKT A;  1EGV A;  4XQ6 A;  1GHS A;  1S1R A;  5FI8 A;  1AW5 A;  1NJJ A;  2E28 A;  4QJ1 A;  2V82 A;  5H6H A;  2YXO A;  2G0W A;  3KOF A;  1KM0 A;  2IF4 A;  1H60 A;  4UTM A;  1EHA A;  2XYL A;  1NU5 A;  3Q67 A;  4HCD A;  1BRL A;  1YE6 A;  3WFL A;  2OQL A;  4O54 A;  1QWK A;  3NG3 A;  3O6A A;  2H9A A;  4UFJ A;  2G3I A;  3TK7 A;  4AXN A;  2VEN A;  4HPN A;  1YXD A;  4AD4 A;  5DIT A;  2D0G A;  1JCJ A;  1M01 A;  1SZG A;  5G4W A;  1S2U A;  5FEZ A;  2P1F A;  1KB3 A;  2PDG A;  3F4D A;  3GDM A;  2OTD A;  1O60 A;  1EH9 A;  3P3B A;  2ZUW A;  4MSP A;  4X2R A;  3V0T A;  3NQE A;  2Y7D A;  1NWS A;  3ZSS A;  3DYP A;  3G0S A;  4H9M A;  5I6S A;  4JHO A;  4CEU C;  4NKC A;  1VYS X;  2D0F A;  3AHT A;  4J1O A;  2INF A;  2VYO A;  2RDX A;  1XS2 A;  3AJ7 A;  1G67 A;  5J5D A;  2OJP A;  3VIO A;  4HCH A;  1UKS A;  2OZ8 A;  2VRK A;  1JUL A;  3EDJ A;  4E2D A;  4Q4O A;  5FAJ A;  4QDP A;  2GK1 B;  1TE6 A;  4JKM A;  1XDL A;  2ZDS A;  4WX2 A;  4LBS A;  1OFQ A;  4I8D A;  1EQ3 A;  2DT2 A;  2QLY A;  4IQJ A;  3ANY A;  5I0D A;  2BXZ A;  1UKT A;  2Z6J A;  3C8F A;  8CGT A;  4Q8W A;  5D33 A;  4C6I A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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