4Z2LA

Serratia marcescens chitinase b complexed with macrolide inhibitor 33
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Creation of Customized Bioactivity within a 14-Membered Macrolide Scaffold: Design, Synthesis, and Biological Evaluation Using a Family-18 Chitinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase B
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Serratia marcescens
total genus 161
structure length 498
sequence length 498
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 4z2lA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4z2lA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4z2lA01
2YA0A 1G0CA 2VCAA 2XUCA 4FF5A 2D49A 1J12A 3WF0A 1LL4A 3RJXA 3WNOA 1EQCA 1TVNA 3W6MA 2DH2A 4ATDA 3WDQA 3KEHA 4HOZA 4B3LA 2DIEA 3UG3A 1E1EA 5IHRA 1H2JA 1W91A 1V6UA 1UR2A 4CGTA 4AZ6A 3OA5A 2GDVA 1CXFA 1TVPA 1OINA 5HOSA 1GQJA 2QV4A 4Q7NA 3WQWA 2J8GA 2WVSA 3CUFA 2VZSA 1C8YA 5CZKA 2W63A 3ARUA 4AWEA 1OGBA 4URIA 3NCOA 3VKKA 1GUVA 2W66A 1MFUA 2VURA 3NDZA 3AIWA 3QHMA 1E70M 4R5EA 1VFFA 2NSXA 3N9KA 3WELA 3WMBA 4J3XA 3AMKA 4JFVA 1M01A 4X9YA 2BNJA 2ZXBA 4A3YA 1QI5A 4UFKA 2BY0A 1QI3A 3N12A 2CYGA 3CH9A 1GHRA 5EFFA 1QW8A 5DT7A 1IT0A 3GXIA 3SCTA 4PSRA 1JZ8A 1BGAA 4OOZA 4N0RA 4AW7A 3LPGA 1R8LA 3FW6A 4EAMA 3FN9A 4X0VA 2V3DA 2GJPA 2V3GA 2WKGA 4Z2KA 1CIUA 1V0MA 1HJQA 3VD9A 1OGSA 4DUVA 2CKRA 3QHOA 4DWSC 1H5VA 4AZGA 3WN6A 3RCNA 2VL4A 5BRQA 4UFJA 3ALGA 1CGVA 1J0ZA 1KGXA 3VGEA 2WHKA 2OSXA 2QPSA 2CCRA 4QCFA 3U5UA 2ZX8A 5CGTA 1G94A 1CLVA 4BQ2A 1DWHM 2WMHA 3N11A 5E6ZA 1B90A 2VRJA 4D6JA 5AY7A 2XFFA 2JE8A 3QOKA 1W3KA 3UESA 2VX4A 4C7FA 4MB3A 3APGA 1UD3A 3W28A 1NM9A 4D6CA 1OBAA 1PBGA 3VPLA 3AMLA 2ZICA 4IM4A 4W8BA 1GVIA 4HZ8A 2OWWA 6TAAA 4J7RA 5AYIA 4EK7A 4D6GA 1NOUA 4DUWA 5IXEA 3MSGA 3ZSSA 2VNCA 1QHPA 3SCWA 4QLLA 4JKMA 3POCA 3LMYA 1Q6CA 2QLYA 1UH4A 4XZWA 3S6TA 3N13A 1WB0A 3MS8A 5I24A 3PZUA 3CPUA 3MUIA 3WEMA 5CPSA 4N42A 1OGGA 1E15A 4BQ4A 4GIAA 5EMYA 2JEQA 4S3KA 1JDDA 3LPOA 4W87A 4ACZB 4PMRA 2J62A 1HKIA 3OZPA 1W32A 1CWYA 4MNJA 3T09A 3VU2A 2E40A 3ZJ8A 2J7HA 3T2PA 1W1TA 4P7LA 3VIJA 3PZTA 4BF7A 5A95A 1KQZA 1KBBA 2WBGA 3RILA 1HT6A 2XFRA 5A3HA 3WD4A 4FK9A 5E6YA 5F7UA 3DHPA 1BYCA 3SCSA 1MXDA 1VJZA 2WHLA 1TE1A 4AZBA 3GBDA 1QBBA 3GNPA 1JL8A 2VR5A 4DWSB 1EHNA 2PB1A 1GQKA 3QGVA 1W9BM 5D9OA 2WZEA 2WW5A 2C0HA 1L0PA 4HZ6A 3F5LA 2D23A 5BCAA 1JYNA 3AIRA 2V38A 3TTQA 1OT2A 4AXNA 4KWUA 5A6JA 3ZT5A 1A47A 3ZM8A 1R87A 1WDPA 1FH9A 1ECEA 2WC3A 2W4XA 1GJWA 3F5KA 4IUGA 5I2UA 1BSIA 3ALFA 1Q6GA 5A6SA 1QI4A 1QI2A 2VZTA 3IANA 1UKOA 5D9MA 4H8UA 4ACZA 4HOXA 3ZR5A 4TX8A 3B8SA 2XSBA 3WD1A 1JIBA 2YDRA 2EQDA 4MJ2A 1AIWA 4MAZA 1B0IA 3MMWA 4BCEA 1E3XA 1E56A 4AY1A 1BF2A 1UKSA 1VJSA 1GOKA 4W88A 2VC9A 1KXVA 4H7VA 1YHTA 4IISA 1HX0A 4TXEA 5CJ5A 4DWSA 3BAJA 4UQCA 5KEZA 2WSKA 3VIPA 1HNYA 3WMCA 1GHSA 1AQ0A 3WF1A 2GSJA 2FGLA 5GNXA 1SMAA 1X6LA 3L2LA 2E0PA 3MUZ1 3ZR6A 2YBTA 1V3IA 1CXEA 3OGVA 4JFWA 5TD4A 1K9TA 3VINA 4AD2A 2D3LA 1KB3A 3VGHA 4HMDA 4NZCA 3W24A 1ZBKA 4AD1A 2W62A 2V5CA 4FLRA 3PTMA 1E3ZA 1JAEA 1PIFA 4Z2GA 2VRKA 3RM9A 4WKAA 4W5ZA 1NWTA 1BYBA 1GOOA 4TVDA 3ZQ9A 3M46A 1BFNA 1GQLA 2UWFA 1US2A 2GFTA 1JZ7A 2A3HA 2WLYA 3W6LA 4B3KA 2WHJA 2WKLA 4YN5A 4MJ4A 4D6FA 1QI0A 3VVGA 5I78A 4KRUA 1P6WA 1MQRA 5I3DA 2VT0A 4EANA 4Z2IA 4UQ9A 1OIFA 3VGGA 3CHDA 5CPTA 1V6VA 3ARYA 1UUQA 2EPOA 1JXJA 4UZSA 2D22A 3N04A 1W2PA 5BROA 3AIQA 3OG2A 1ZJBA 3WF2A 2X1IA 3VM7A 2BXYA 4AD3A 4NSBA 1E0WA 1BHGA 4W7UA 4RE3A 1Y7VA 5ABHA 1G5AA 1CGTA 5A6MA 5DFAA 3WUEA 1CPUA 4ML4A 2CBJA 4F9JA 4V28A 1QNRA 4CU7A 3AMDA 8CGTA 3OGSA 1E6XM 4JL2A 4AZHA 1N82A 4GO8A 4XB3A 5AYBA 1OB0A 5A1AA 4CD6A 4AMCA 4P8UA 4Z2HA 3VDHA 3AS3A 2HISA 2WCGA 1KXHA 1UG6A 1PIGA 4J3TA 1MW2A 4WKHA 2BY1A 4P7RA 3DYPA 4OOUA 4ZXLA 4UTFA 4UFMA 1UWIA 4HU8A 5E0FA 1FHLA 1UWUA 5KZ6A 3WUGA 4GXPA 1V0KA 5EB8A 2YLLA 3WBAA 4UZUA 4GPNA 3IAQA 2NW0A 3RIKA 4RL3A 1GPFA 4F8XA 1ZU8A 5CSYA 4CU8A 4X0NA 1G1YA 3NDYA 2PWHA 4QAWA 3CUIA 2FGZA 1XGZA 3AXHA 5D9NA 4M56A 2D0GA 3CMGA 2WMKA 4UOQA 3WNNA 2WXDM 1OD8A 2D20A 2WCSA 5HPCA 2G8ZA 2J7EA 2E9BA 1ZBCA 2D24A 3OGRA 2MANA 1B3ZA 3WH5A 4M1RA 3THDA 1XHGA 2ZIDA 2WZHA 2JEPA 3CZGA 1UR1A 3WIJA 2DH3A 3BLKA 1US3A 2GJRA 2Y8KA 3U57A 4UQBA 5FD0A 2ZX6A 4J3VA 2CHNA 1JNDA 1FA2A 4MDOA 5IDIA 3FY1A 2VRQA 3WBEA 2CITA 1PPIA 2ZUWA 1BVNP 3AIBA 4W86A 3U7VA 3AJ7A 4WLCA 3OBAA 1MWOA 4MAVA 3AYRA 1UKPA 1FHDA 1O7AA 1E71M 4LGXA 3SURA 3RM4A 2X2YA 1ZS2A 4KGLA 5JH8A 1ISZA 2O9RA 3VO0A 3WH8A 4TUFA 3KWXA 1LQ0A 1UOKA 2XYLA 4DWSD 1VRXA 3AMCA 4W5UA 3DHUA 2BY2A 3AZTA 5BYWA 1WDSA 2VQTA 4D1IA 3U5YA 3HU7A 2E8YA 1GOWA 1KXTA 2EJ1A 4PEEA 2O9TA 4E2OA 5CG0A 2OYMA 1V3KA 3UR7A 3GYCA 2CEQA 4JHZA 3TA9A 4PTVA 3N17A 4PMOA 1TA3B 4NRSA 4CVUA 1ODZA 4AISA 1QNQA 3L4TA 4W85A 4MB5A 3WDJA 1XYFA 1E40A 3G6LA 2PBOA 1MYRA 3SCQA 3NYDA 2RGLA 1M03A 5BXSA 2WSPA 1EDQA 2BVYA 3BAYA 3EDEA 3U7BA 4C7DA 2WCAA 3MV01 3AIEA 4W8LA 1WPCA 2CHOA 2VZOA 2OYKA 2VVNA 1JG9A 1G9HA 2XG9A 4UQDA 1MW1A 3WDHA 2Y4SA 2EO7A 1NP0A 5DT5A 1KR0A 1I1WA 2BHYA 2ZUTA 3SIMA 3GDBA 1AQHA 4Y7EA 1E73M 1RH9A 2YDQA 1J11A 1NP2A 3OB8A 5ECUA 3WNLA 1CLXA 2YL6A 2Y24A 2DT0A 1RPKA 4PTWA 3MKKA 3NSMA 1CEOA 1EOMA 1MW0A 3IJ8A 1PX8A 3NUKA 3T0DA 4HMEA 1HJWA 1TA3A 1GOMA 1H3GA 4U2YA 3WL0A 1V0LA 5A2AA 3DECA 1GORA 5D9PA 1QPKA 3WL1A 2ESCA 1C92A 1EQPA 1H11A 1HP5A 5C70A 1H49A 1OIMA 2WMGA 1E0XA 2WM0A 2W67A 4FLSA 5I79A 4KMQA 2J7FA 2ZE0A 3GM8A 3WKZA 3BSGA 1JYVA 1IZJA 4P8VA 4OBRA 3S2CA 1M04A 3CZJA 3TTSA 3MMDA 1LG2A 1NOWA 1HJVA 3BH4A 5BWFA 3W38A 3AS2A 3ZJ7A 4BZYA 1TMQA 2J75A 4D6DA 4B15A 4UFLA 3TTOA 2F61A 4LX4A 4HTYA 2G4FA 4ZE5A 2YA1A 1SFSA 3DC0A 2OWCA 1GNXA 1XSKA 1GJUA 1HKJA 4M82A 5LYRA 4JCLA 2YKKA 3RO8A 4TOQA 4AZCB 3BAXA 3I3DA 3L4ZA 5I0DA 1H09A 1E6ZA 2VOTA 2C7FA 4CCDA 3IJ9A 1BYAA 2XM2A 3ARSA 1UD8A 2WB5A 3GBEA 4J28A 5GNZA 4GQRA 3F4VA 1QBAA 2YL8A 2ZWYA 1WDRA 2QPUA 1LLOA 2DSKA 5CLTA 3W37A 3FAXA 1JXKA 2VQUA 4CN4A 1WZLA 2J25A 4CCCA 1DWFM 4MPKA 1W9VA 5A6AA 3T0AA 5DO8A 3GNOA 2IXUA 1ZL1A 2QMJA 3UEQA 1V6WA 1W1PA 3A4AA 5LA0A 1BTCA 1JZ3A 1CZ1A 1U30A 4PTXA 5CGMA 1VAHA 3GZAA 3KL5A 2WNWA 1J10A 2XWEA 4V27A 1KWGA 1UZ4A 1ZB5A 4J3UA 1HL9A 3CBWA 2XPKA 1EDTA 9CGTA 4AD4A 4MB1A 4AZCA 1XH2A 2AMGA 2AAAA 1NWSA 5IFPA 1B31A 1LF1A 4OBSA 1I75A 4PUDA 4UFHA 4MB4A 1J9YA 4GI8A 3BGAA 1KCLA 4GKLA 1KXQA 2XVKA 3WQ6A 4MNMA 3VGDA 5LA1A 1HJSA 4P7QA 4GINA 2WAGA 2DQXA 3T08A 1W1YA 1Q6DA 3IK2A 1MXGA 3VTRA 5A8NA 3PBGA 4JFTA 2Y8VA 2OLHA 1JDCA 2CBVA 1E72M 1JNEA 2VZUA 1PX3A 1NH6A 3HMCA 2CERA 2WMFA 4GZEA 2ZX9A 1B3VA 2CETA 3VMOA 1V08A 4PCSA 3BCDA 3J7HA 3ECQA 2ZXQA 2BS9A 1BGGA 1UYQA 1H0GA 4ZFMA 5HXMA 1E5JA 4D6EA 2GVYA 1C93A 3W25A 1HKMA 3K8MA 3O2LA 3KL0A 2QHAA 5BRPA 1VBRA 2VX6A 1UQYA 4CD4A 1KQYA 1JFXA 5CPQA 4JIEA 2NT0A 3A3HA 4W8AA 2DSWA 3AXIA 4OKDA 3JUGA 1B1YA 6CGTA 4LPCA 3SCRA 2A3CA 1D7FA 2O9PA 3CGTA 1WAWA 1H41A 2E3ZA 1EH9A 1UH3A 5JUVA 3MU7A 3CLWA 3WUFA 1CNVA 4U33A 1ZBWA 2BXZA 5D4YA 2PWEA 4AC1X 1CBGA 4JAWA 1J0IA 1B9ZA 4UQEA 5GNYA 2VO5A 1GQIA 3AOFA 3ZIZA 1E4MM 5A8QA 2J79A 2VI0A 1UD2A 3EDJA 3AROA 1EXPA 4J27A 1WKYA 2V3EA 2V5DA 5ABEA 1K9FA 2DDXA 3DYMA 3WQ4A 4TVUA 1VEOA 1TCMA 3GXMA 3ARVA 2J77A 3ARXA 3KL3A 1KR1A 3ZO9A 1GOQA 3ZOAA 1V0NA 2GK1B 3VILA 4AEFA 1UWSA 4D6HA 5JIWA 4OIFA 2DSZA 1C91A 4JHOA 2EPKX 3VIGA 4K68A 4D71A 1C8XA 3ARQA 3BXWA 2XGIA 4AYSA 1XSJA 2CESA 3BCFA 2ZX5A 5A6KA 1U33A 2CIPA 2WMIB 2A3EA 1MQPA 2CKSA 4PMDA 2WWDA 4Q22A 2OSYA 7CGTA 1JAKA 2PI6A 1HJUA 5IHSA 1RP9A 3WSUA 1VFOA 4JFUA 5FL1A 5A94A 3L4VA 4FLOA 4EKJA 4HMCA 1ISWA 1NWRA 2VX7A 2BY3A 1QNSA 3EMQA 1XH1A 3EYPA 3SUVA 4L4PA 1V02A 2G3NA 3LPFA 3T2QA 3B9AA 3AHVA 1CECA 1FH8A 3IAPA 2ZWZA 4XV0A 3ZMRA 2YJQA 3WNKA 3WNPA 4W7VA 3WH7A 2HVMA 4TTUA 1CYGA 2GK1A 3TP4A 3NJ3A 4ZEPA 4JFSA 3WY1A 1JF5A 2W92A 1FP9A 3OIHA 1GOIA 4QCEA 1ESWA 3QHNA 2AOSA 5GQBA 2D0HA 2PWGA 4ZXOA 3WEOA 1J0HA 2O9OA 5E09A 1G01A 2CPUA 1B3YA 3AIUA 2WMIA 4AZ5A 2XIIA 4D1JA 2YDSA 4YHEA 2QF8A 3BMWA 3VDAA 1HL8A 3WH9A 4M80A 4AZ7A 3EBVA 3VNZA 1LWHA 2ZOXA 3DYOA 4E4PA 3MSDA 4PRWA 4C7GA 4CN1A 2WVTA 1UA7A 4M29A 2BHZA 1UWTA 1E6NA 4CD8A 2VMFA 3VD4A 4CD7A 1IZKA 2JF7A 2X0YA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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