The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
72
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sequence length |
239
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structure length |
235
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Chain Sequence |
ESQPDPTPDELHKSSEFTGTMGNMKYLYDDHYVSATKVMSVDKFLAHDLIYNISDKKLKNYDKVKTELLNEDLAKKYKDEVVDVYGSNYYVNCYFSSKDNTGGKTCMYGGITKHEGNHFDNGNLQNVLIRVYENKRNTISFEVQTDKKSVTAQELDIKARNFLINKKNLYEFNSSPYETGYIKFIENNGNTFWYDMMPAPGDKFDQSKYLMMYNDNKTVDSKSVKIEVHLTTKNG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
publication title |
Structure of staphylococcal enterotoxin C2 at various pH levels.
pubmed doi rcsb |
molecule tags |
Toxin
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molecule keywords |
ENTEROTOXIN TYPE C-2
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total genus |
72
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structure length |
235
|
sequence length |
239
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ec nomenclature | |
pdb deposition date | 2001-02-23 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
A | PF01123 | Stap_Strp_toxin | Staphylococcal/Streptococcal toxin, OB-fold domain |
A | PF02876 | Stap_Strp_tox_C | Staphylococcal/Streptococcal toxin, beta-grasp domain |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Mainly Beta | Beta Barrel | OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) | OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) | ||
Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4DXF A; 4RFB A; 3W2D A; 1XXG A; 5ELC A; 1LT4 D; 1PTO F; 4C56 C; 1CHP D; 1D5Z C; 3R2T A; 3R2I A; 5ELD A; 1KTK A; 1SJH D; 5D3I B; 2CHB D; 1ENF A; 1PTO H; 3CHB D; 1LTS D; 1B1Z A; 3KLS X; 1CQV A; 1JWS D; 1GOZ A; 1AN8 A; 2ICI A; 1PZI D; 2Z8L A; 2XRS D; 1FNW A; 1LT5 D; 2QIL A; 1PTO C; 1RD9 D; 1FNU A; 1SBB B; 1D5X C; 1BXT A; 4RH6 A; 1JQY D; 4L63 B; 1RF2 D; 4RHS A; 1I4Q A; 1LTT D; 1PRT B; 1EFI D; 3EA6 A; 1SE2 A; 1DJR D; 3DWQ A; 4RCO A; 3V05 A; 1S5D D; 1PTO D; 1LTA D; 2NTT A; 1CT1 D; 1V1P B; 1EU3 A; 3URY A; 1SEB D; 1TS2 A; 3DWP A; 1RDP D; 1S5C D; 4K6L A; 1LTB D; 2J4X A; 1BCP B; 2RDG A; 3TSS A; 3O13 A; 1BCP F; 1BCP D; 1DYQ A; 4RGN A; 3BVG A; 3BZD B; 1XTC D; 1LT6 D; 2AQ1 B; 3GP7 A; 1I4P A; 5TSS A; 1SE3 A; 1TS4 A; 1F77 A; 1JR0 D; 1YN3 A; 1B44 D; 1PTO B; 1LTG D; 3MC0 B; 1PYW D; 1V1P A; 2R61 A; 4L6T B; 4RGO S; 1FNV A; 1RCV D; 1LLR D; 1S5B D; 3BYT B; 1SXT A; 1SE4 A; 1BCP C; 1HQR D; 1PRT F; 1SJE D; 5FK9 C; 1PRT D; 4DXG A; 1M4V A; 1LTR D; 3MFG A; 1LO5 D; 1JWU D; 4OHJ A; 5I4D A; 1KLU D; 1CHQ D; 1MD2 D; 1PZK D; 1TY2 A; 1TY0 A; 2XRQ D; 5ELE A; 5ELF A; 1HXY D; 1YN4 A; 1L0Y B; 1T5X D; 4NZL B; 1EWC A; 1HA5 A; 2QEJ C; 1UUP A; 2SEB D; 1ET9 A; 1TS5 A; 1LT3 D; 3DWA A; 1AW7 A; 1I4H A; 1STE A; 4O1N A; 5FKA C; 2G9H D; 1LTI D; 2AQ2 B; 1PRT C; 1EEF D; 1V1O A; 1G8Z D; 1L0X B; 1JCK B; 3EFX D; 1FD7 D; 1CK1 A; 4BWG B; 2IPK D; 2TSS A; 1TS3 A; 3OWE B; 4RHR A; 4RGM A; 5ELB A; 1EU4 A; 2IJ0 A; 1S5E D; 4UDU C; 1I4X A; 1PZJ D; 4ZYS A; 3BVM A; 1ESF A; 1EEI D; 1JWM D; 1S5F D; 2WV6 D; 2XN9 C; 1D6E C; 2RDH A; 1QIL A; 1YN5 A; 1UNS A; 5D3D A; 4Z9C B; 1KLG D; 3BYY B; 2O2L D; 4TSS A; 1ET6 A; 3BVZ A; 2NTS A; 1HTL D; 4RGT A; 3R8B A; 1D5M C; 1FGB D; 1I4G A; 2AQ3 B; 3SEB A; 2XNA C; 1I4R A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2Y0S B; 4RFB A; 3TP7 A; 3MJ5 A; 1S4Z A; 2K4K A; 2H1E A; 4FXK C; 1Q86 C; 1Q8I A; 2A4Z A; 4YTM B; 1STG A; 3TP6 A; 3EFU A; 4W9C A; 2NVX B; 3GB1 A; 3NWS A; 1ENF A; 3CHB D; 2Z59 B; 3GTL B; 4B0M A; 1P7F A; 5JH5 C; 1YEZ A; 3VXW A; 2WU2 B; 3Q3J A; 4I7A A; 3NY5 A; 4XWT A; 2WQY B; 1I3Q H; 1V43 A; 1TWC H; 4OVZ A; 1C48 A; 5LMU L; 2DZK A; 2FIF A; 2HTM E; 5M3F B; 1FNU A; 3J81 j; 3CCM A; 4DV1 Q; 1C4A A; 4DK5 A; 2UXB L; 4HJ5 A; 3TP5 A; 1LM0 A; 4LW1 A; 4A3F G; 3BU2 A; 2MQH A; 1VQJ A; 3E0E A; 4QJF A; 2JZ3 B; 2KN5 A; 2W3R A; 4ZHP A; 4MTN A; 4B3R L; 4DK0 A; 4L5S A; 3K9P B; 1PFS A; 4LNK A; 2BYT A; 5JOB A; 2WP8 J; 3VDY A; 4MSM B; 2B2W C; 1IZ6 A; 1S3O A; 2UUA Q; 3M4P A; 1S5D D; 2IHF A; 4BXX H; 1UE7 A; 1D7Q A; 4GB9 A; 3QG1 A; 3VR4 A; 4HPL B; 3ZVV A; 3HP3 A; 4N8F A; 2E2I H; 4MHE A; 1TS2 A; 2JWU A; 3A5Z B; 4XQN A; 2PZU A; 2ONQ A; 3GOE A; 3R7Q A; 2EMS A; 4BBN F; 1Q46 A; 4GLV B; 3RNU A; 4P16 A; 2ZVO A; 4JIO U; 1X3P A; 3GS2 A; 3CC2 A; 3GTL H; 1K8G A; 3TRZ A; 5TSS A; 4G7H C; 4DR5 L; 4DWF A; 1N36 L; 3B2G A; 1DGS A; 4DPG A; 4XZ4 A; 3BZK A; 3IBE A; 1RFK A; 1VLB A; 4WJP A; 2UWQ A; 2ENB A; 2ZPY A; 1FIQ A; 1SNP A; 1U4R A; 2JP1 A; 4OIK A; 4GXB A; 1PV4 A; 4DNI A; 1SSN A; 1KC8 C; 4J6H A; 3LYY A; 4A55 A; 1BO0 A; 1LTR D; 1JWU D; 2FFK B; 4A3D H; 3RUL A; 4XDC A; 3HM3 A; 4UPA A; 1EWC A; 4FXG C; 5LMU Q; 1VQD A; 2E5L L; 1GG3 A; 1N63 A; 1TS5 A; 1WH3 A; 2MBB B; 4QAY A; 2AWT A; 2UXB Q; 2R7Z B; 1R4N B; 1B9M A; 4OWT B; 4LDT B; 1PGX A; 3TEZ A; 4ARI A; 3H0G B; 3M4Q A; 1C7Y A; 1IBM L; 3VR2 A; 4B3R Q; 1JC7 A; 2E8G A; 2KYW A; 4DFA A; 1A63 A; 4X57 B; 4RGM A; 5CBE E; 1WTW A; 3NS8 A; 2KNB A; 5FLM G; 4A3G B; 1FRD A; 1LAC A; 2GN5 A; 4FF2 A; 3AM9 A; 2L32 A; 4UDU C; 3S2D B; 3VFK A; 3K80 C; 1YNJ D; 2FUH B; 1ESF A; 2D3A A; 5GXG B; 4IKG A; 3RUZ A; 2Q8I B; 4PG3 A; 1EY4 A; 2NVT B; 1STH A; 4K2L A; 4KN4 C; 5CR3 A; 3Q6S A; 3VTV A; 1PFN A; 2K7V A; 3K8A A; 1YIJ A; 3T9L A; 1PFB A; 3OW2 A; 1WWT A; 2O2L D; 1K9M C; 2B8F A; 5C0X J; 4DV0 L; 1UH6 A; 1N36 Q; 4FYD A; 1E8X A; 3PUX A; 1HUM A; 2SDF A; 2B2V A; 3RD4 A; 3VUX A; 3EN2 A; 3MHS D; 3FKI H; 2JSV X; 1OXX K; 3CWI A; 1F0Z A; 3P1H A; 1WFY A; 4FO2 A; 1WTV A; 4A3P A; 1SYC A; 2NN6 G; 2A68 D; 3EVQ A; 2K22 A; 2CWP A; 4C1N I; 2QHO A; 3FRP B; 4KV6 A; 1QWY A; 5ELC A; 5IGD A; 2R7Z H; 4MM3 A; 1FJG L; 4A93 G; 1E1O A; 1CHP D; 3ERO A; 2ZTD A; 1TYG B; 1KLV A; 5D3I B; 2WXP A; 4ILW A; 4F7Z A; 3GDE A; 3S2H B; 1LTS D; 3CCS A; 1JRO A; 4HN7 A; 3L08 A; 1XTD A; 4FXD A; 4JVZ A; 2E5L Q; 4A3G H; 3NZS A; 1N5X A; 1WGH A; 3S2D H; 5CV8 A; 1IBM Q; 2IW3 A; 2VQF L; 5BR8 L; 4CJ0 B; 2BOS A; 3T8M A; 2NVT H; 2MP2 A; 2B2T C; 4GDK B; 2KAJ A; 3K9O B; 1HFG A; 4NXN L; 3RD2 A; 1RHP A; 4GOP A; 3RZD B; 5BMI A; 4RHS A; 2F0G A; 1PH1 A; 3CC4 A; 3NJT A; 3VTU A; 5L83 A; 3I91 A; 5IP7 G; 4A3M H; 2K52 A; 5FLX L; 1EM7 A; 4IFD H; 4MH8 A; 2DYB A; 1KAB A; 2LI5 A; 4A3I G; 4LF5 Q; 1ZUD 2; 1QF6 A; 5CGK A; 1N8R C; 3KW5 B; 2FIN B; 1D1K A; 4K5X A; 5JEA G; 2ZVN A; 3C0R B; 4NMZ A; 3HOU B; 1G2T A; 4MH0 E; 1UBQ A; 3F2U A; 4DV0 Q; 1VQE A; 1P0R A; 4GN3 B; 5IOI A; 2JA7 G; 1WE7 A; 2KC2 A; 1HZ5 A; 4C1N K; 3U58 A; 4A3C G; 2MBH A; 3RZW C; 2QCZ A; 3QJZ A; 4ZCK A; 4A6Q A; 1ISN A; 1EY7 A; 3KOJ A; 2KAC A; 2WXI A; 3Q69 A; 3MC0 B; 2YTX A; 1X1M A; 4IWO A; 1V2Y A; 2QW7 A; 1NY4 A; 4NAW B; 5JHB A; 1GB4 A; 3IT4 B; 1HH2 P; 3C19 A; 1PH2 A; 5JJK A; 1MG8 A; 5DCN A; 4EFO A; 1L2N A; 1TWA B; 1VQK A; 1B3Q A; 4C3J H; 4G11 A; 2ZZP B; 1SFO H; 1WZ0 A; 2VNU D; 3RZD H; 2F0D A; 4M8A A; 1QT9 A; 2NVQ B; 1A2U A; 1UUP A; 2ZTE A; 2DWQ A; 2B3A A; 4P2C B; 5BR8 Q; 1ZOY B; 1STE A; 2DZJ A; 3PO0 A; 4RA8 A; 5DPT A; 1C0A A; 4O0A A; 1LM8 B; 3TBL D; 5COY A; 4X64 L; 3CSF A; 1G51 A; 1E2W A; 3ND8 A; 2EZV A; 5KGU A; 1VQN A; 1Y8N B; 1EZ8 A; 3V60 A; 4LFC L; 5BO4 B; 2ZT9 C; 3DM3 A; 4TQU S; 4DNT B; 1L0V B; 4RHR A; 1UE6 A; 2IDY A; 2FAZ A; 4GDL A; 4CDF C; 1KXL A; 2L7R A; 3E3X A; 2IJ0 A; 5KNB A; 1HNW L; 3ECI A; 1WXS A; 2MX2 A; 4D2K A; 4IWP A; 1Q3L A; 4R4Q A; 4II3 B; 4IDI A; 1YI2 A; 5IGG A; 1TKW B; 2CH4 A; 3D0F A; 3TRE A; 4BXX G; 5IT9 c; 2E2J B; 3PPA A; 1L1O A; 3A0J A; 4DV3 L; 2A5U A; 2IT1 A; 1E24 A; 2VB2 X; 4JLC A; 1H8C A; 1VMP A; 4BBS H; 2N78 A; 2WB1 G; 2N55 A; 1PQS A; 4WRD A; 2K1B A; 1WZ3 A; 3HEJ A; 4RGT A; 1ROE A; 2YU9 B; 4YL8 A; 1FGB D; 3Q3F A; 4ANX A; 4ICU A; 5AJ3 L; 2QDL A; 3TJP A; 4PYZ A; 1A8V A; 4J8Q A; 2ZCB A; 5IYB H; 1O78 A; 2F4V L; 2R6G A; 2WAQ B; 2YTV A; 4URK A; 1IP9 A; 3H6M A; 5HUR A; 1WXQ A; 3J7A 5; 2OJR A; 2KVM A; 4OX9 L; 3H9D A; 3R2I A; 1Q81 C; 3PVL A; 4ZKC B; 3D4W A; 4G7O C; 2L3Z A; 2ATW A; 4ODG A; 3H7P B; 5E3F A; 1FL0 A; 1OQQ A; 3J7A F; 3UI3 A; 1TZO A; 3BWU D; 5H8Y E; 1AN8 A; 2VW9 A; 1V49 A; 3B08 A; 1WGG A; 4YHH L; 3V96 A; 2WDR B; 3UGB B; 5M5X B; 4X64 Q; 4IJL A; 4B08 A; 2XRS D; 1NBF C; 4A3D G; 2K5N A; 2CS4 A; 2WXO A; 3PLV A; 4X65 Q; 3WIM A; 3ZRC A; 1RD9 D; 1JW9 D; 4P75 A; 4HCS A; 2G3Q B; 4KHV A; 2E2J H; 2CJO A; 3RMH A; 1HNW Q; 3EJI A; 2K14 A; 3L2P A; 3NVW A; 1C4Q A; 3CAM A; 3TCA A; 2W9N A; 4ZRI A; 2YU9 H; 1WX9 A; 1E7Z A; 3HOV B; 3FVQ A; 2E2H B; 3NVV A; 4TQ1 A; 1V1P B; 2D0P A; 4IUN A; 2EYP A; 2F1M A; 1FRR A; 1TKE A; 2D2Q A; 5E6J A; 2K5Q A; 3OMG A; 4DV3 Q; 1GO3 E; 5LHY 1; 4HIM A; 1EWY C; 1CZW A; 1WMH A; 2J4X A; 2B29 A; 3RLN A; 1WD1 A; 3H3V H; 1WXA A; 2D3C A; 3HZX A; 1VCI A; 2EYH A; 3BZD B; 1N61 A; 2G45 B; 5HFY A; 4HJA A; 3L3O C; 5T1I A; 2SAK A; 5AJ3 Q; 4XE0 A; 4NXM Q; 1MSH A; 5EPK A; 2R7F A; 1YN3 A; 4HEA 1; 2KLG A; 1ML0 D; 1PYW D; 5M5X H; 2RDF A; 5M3M H; 1RCV D; 1B9R A; 1KD1 C; 5FO7 B; 2DY7 A; 1AWD A; 1SE4 A; 2RF4 A; 3VYR A; 4LNI A; 4DDI D; 2QMT A; 5BYS A; 2AUJ D; 1ZXT A; 3NEN A; 3ZW3 A; 1MD2 D; 4GIV A; 1E0Z A; 2HD5 B; 1SNQ A; 4YHH Q; 1VQI A; 2JA5 G; 2BKR B; 3I3T B; 3M7N A; 2JE6 I; 5EE9 A; 2SEB D; 2QEJ C; 3ERS X; 5IGF A; 1I42 A; 3OTO L; 2M9V A; 1VQG A; 4A75 A; 1PH8 A; 3HOV H; 4IN3 A; 5FKA C; 3UI2 A; 1DZ1 A; 2HQL A; 4CDE C; 2B63 G; 4JI5 L; 1IYV A; 2INC C; 1RYJ A; 4MGZ E; 4ZOH C; 3GZN B; 2MO1 A; 3I4N B; 1VQH A; 2F0H A; 1W3S A; 2Q2I A; 1JMC A; 1DXM A; 4CKB A; 3VA7 A; 3B2F A; 2BE5 C; 2Q2H A; 2I1J A; 4MEL A; 1QVG A; 4PV1 C; 1ILQ A; 1P98 A; 5JHA A; 4B3M L; 1YJI A; 3HOW H; 2DX5 B; 4JI7 Q; 3HHM A; 2JEA I; 2WX1 A; 3VQI A; 5C3E B; 4A3K B; 2LS0 1; 4CQN A; 5CV9 A; 1F2Z A; 3A55 A; 4G57 A; 1OEY A; 1WR1 A; 4IFD G; 5C4J B; 3Q8F A; 3O65 B; 1TJE A; 2KK8 A; 2HJ8 A; 5C3X A; 3C46 A; 5EBD A; 2V3N A; 2D0O A; 2GB1 A; 3OAW A; 3S24 A; 1TWG H; 2KVZ A; 3TS0 A; 4LNO A; 2BW2 A; 3NTH A; 2WP9 B; 4C7Y A; 4XYQ A; 2JJQ A; 1MHH E; 2NVU I; 4K3B A; 3CCL A; 2J7Z A; 2KED A; 1QNU A; 4BOS C; 3V2T A; 4M8N A; 3RI7 C; 3UF8 A; 1MJC A; 3HKZ G; 4AS1 A; 2B2U A; 2WU5 B; 2WKC A; 3I4N H; 1D5Z C; 4IOC A; 3K6O A; 3I4L A; 1EUV B; 1A3U A; 2DJG C; 4WJQ A; 3PHX B; 4AUQ C; 3J80 i; 3A74 A; 5E6N A; 5CX3 A; 1KRT A; 2K1F A; 5CHV C; 2UU7 A; 3OTO Q; 2K32 A; 4C3J G; 4NAM A; 2UXD L; 1HE8 A; 3PIO 3; 5CTR C; 4JI5 Q; 4JGH B; 1P16 A; 1JJ2 A; 3U4E G; 5C0X I; 1F2R I; 2G9D A; 5C3E H; 1XPO A; 1HEZ E; 1YNN C; 2JYT A; 3VR9 B; 1WF9 A; 1YOV B; 1UEL A; 3AEE B; 4ZKB B; 2UXC L; 1PH5 A; 1FXT B; 1J7C A; 1AZQ A; 3AYH B; 2HHH L; 3SR1 A; 4A4I A; 3RT3 B; 1KOT A; 5K36 G; 3L0O A; 4HSP A; 4B3M Q; 2OF1 A; 3EA6 A; 2VQE L; 5G5H A; 1QOA A; 2H89 B; 1EY5 A; 1HR0 W; 1JRU A; 1CJE A; 2C35 B; 1PH3 A; 3L9A X; 1STA A; 4A3J B; 2A19 A; 1JE4 A; 5DM7 3; 2KVR A; 5LL6 S; 2L0F A; 2UU9 L; 4DHJ B; 1QNK A; 2IX3 A; 2K25 A; 2JY6 A; 3A9J A; 4IZ8 A; 4C3I G; 1OTR B; 2H88 B; 4X6A H; 4PMB A; 1WGK A; 4LAA A; 1C9O A; 2E75 C; 3AMU A; 1S1Q B; 4FP5 D; 1WM2 A; 3ZNI D; 3ZJT A; 3PV0 A; 3MC9 A; 3AEB B; 3HOX G; 3NG0 A; 2WWZ A; 2GBJ A; 3ZGZ A; 1E90 A; 4PZ8 A; 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