3FIGA

Crystal structure of leucine-bound leua from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 183
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
183
sequence length
626
structure length
574
Chain Sequence
TIVKPAGPPRVGQPSWNPQRASSMPVNRYRPFAEEVEPIRLRNRTWPDRVIDRAPLWCAVDLRDGNQALIDPMSPARKRRMFDLLVRMGYKEIEVGFPSASQTDFDFVREIIEQGAIPDDVTIQVLTQCRPELIERTFQACSGAPRAIVHFYNSTSILQRRVVFRANRAEVQAIATDGARKCVEQAAKYPGTQWRFEYSPESYTGTELEYAKQVCDAVGEVIAPTPERPIIFNLPATVEMTTPNVYADSIEWMSRNLANRESVILSLHPHNDRGTAVAAAELGFAAGADRIEGCLFGNGERTGNVCLVTLGLNLFSRGVDPQIDFSNIDEIRRTVEYCNQLPVHERHPYGGDLVYTAFSGSHQDAINKGLDAMKLDADAADCDVDDMLWQVPYLPIDPRDVGRTYEAVIKGGVAYIMKTDHGLSLPRRLQIEFSQVIQKIEVSPKEMWDAFAEEYLAPVRPLERIRQHVDAADDDGGTTSITATVKINGVETEISGSGNGPLAAFVHALADVGFDVAVLDYYEHAMSAGDDAQAAAYVEASVTIASKTVWGVGIAPSITTASLRAVVSAVNRAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of LeuA from Mycobacterium tuberculosis, a key enzyme in leucine biosynthesis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-isopropylmalate synthase
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 183
structure length 574
sequence length 626
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.3.13: 2-isopropylmalate synthase.
pdb deposition date 2008-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00682 HMGL-like HMGL-like
A PF08502 LeuA_dimer LeuA allosteric (dimerisation) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3figA01
3.30.160.270 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Double Stranded RNA Binding Domain Double Stranded RNA Binding Domain 3figA02
1MEWA 3GX9A 2NWRA 3DFOA 4IQLA 2I14A 3R8RA 2FJKA 3BGGA 1BEUA 2DZWA 1QR7A 3VCRA 2X2GA 1PCKA 4XUGA 2Z1BA 2YGYA 4H6KA 2AGKA 1GQNA 1TPC1 1VHNA 2Y7DA 4WY0A 3TMQA 3C2FA 3I7RA 5I3KA 2WNQA 3ELFA 3KRUA 1W54A 1OG0A 2R8WA 3V1PA 4LRSA 3MHGA 5F2GA 4HNUA 2E6FA 2A1YA 3W71A 3M5XA 3D0CA 3TW7A 1BKSA 4KFPA 3G1DA 5CPMA 3Q37A 1T96A 3NOEA 3CT7A 4NX5A 5IBXC 4HT3A 1TJPA 1RPXA 3DFSA 5KZMA 1MEHA 4JTFA 2Y89A 1PHWA 2E6DA 3UXAA 3MP3A 5HULA 1TPUA 1KFLA 1P1XA 4IXHA 1TTIA 3OG3A 5TBOA 3G18A 3KVKA 4MZ1A 7TIMA 3NQDA 5EA9A 3IEBA 1M7OA 3GAYA 3RMJA 1MO0A 4AF0B 1KLYA 1U5JA 5HUPA 2DZUA 5DBTA 4YXGA 4Z1AA 3OHIA 3W2NA 1Q6LA 2BX7A 3W7IA 3C2OA 1P0KA 1ZENA 4FXSA 4BI5A 2A85A 4BWLC 4RLIA 2Z6IA 1VR6A 3KVJA 3TFCA 1I8JA 2CLHA 3DKJA 1H7RA 4CQAA 3G0XA 3HMJG 4PH6A 4OBTA 2G97A 3TQVA 3CPRA 4S1FA 3S5OA 2H90A 4HNVA 4QITA 3EX3A 2PE4A 1DL3A 3N9SA 5AHLA 1MEIA 4O28A 4UMCA 3KXQA 1FWWA 3TSMA 3LLDA 1FDYA 2CLLA 2W79A 3IVSA 5F2LA 5LGZA 3LTYA 4JTSA 2VENA 3MP5A 2GOUA 5F4SA 3USBA 2OX1A 3PM6A 1ZNNA 1F7BA 1H61A 3CEPA 4HHPA 4ADTA 1QPQA 5LKYA 3TV8A 2GQ9A 4M7TA 3LCFA 3M9YA 4PCFA 1N55A 2C16A 3MJYA 4Y96A 4A21A 4LV4A 3KAOA 2BXVA 4LUIA 3S5NA 3GDLA 2ZRXA 3M5ZA 2OCZA 2DZSA 2WSYA 1TV7A 1QPOA 2ZZ2A 3P80A 5AB3A 2QF7A 3R2GA 3G1SA 2RFGA 1W8SA 1FDZA 1ZAIA 5CPNA 5IM51 3SI9A 1EPXA 2FIQA 1JULA 1OX4B 3TQ0A 2NX9A 2GVLA 3LI1A 4UTKA 1K7EA 5AC7A 2Y85A 3OEXA 2HS6A 4O19A 3UWQA 4O0KA 2A6NA 2YFNA 1IF2A 3ATYA 4DO4A 2A21A 4FNSA 3SR7A 3KVMA 5FF0A 4OWGA 3W2KA 2H8ZA 1VYSX 2TYSA 1ME7A 2TPSA 5EY5A 3GR7A 4NZFA 1P5BA 3TC7A 5DELA 3LRKA 3KRZA 2QDGA 3EX4A 3LCXA 1TB3A 2G96A 5CPLA 2JKAA 3FFSA 2GJLA 3U8GA 1OYAA 3A5FA 4HIBA 1I2OA 3UPWA 4NNCA 2ISVA 1IGSA 4ONVA 3CC1A 1SO5A 1F6PA 1CW2A 3LV5A 1R2TA 4WOQA 1L6WA 5I3GA 3TC6A 1BTMA 1EUNA 4TR9A 2DJXA 2F84A 2WNNA 3W83A 3NG3A 4HSNA 1SZFA 1E51A 5D38A 5BNKA 4LVFA 1H62A 1XL9A 1ME9A 4IX2A 4OE7A 1YADA 3THQA 4AH7A 4KFOA 1AG1O 4LT9A 1AMKA 2QCMA 4R33A 1IXNA 5AC8A 1SSDA 3OA3A 5D2VA 5BOOA 4OT7A 5LNWA 4NUWA 3M0ZA 3PBUA 2WO5A 2ZZ5A 1M7PA 2YSWA 3W7CA 1SUXA 2G95A 3BG5A 3IGUA 3NO5A 1LTDA 2Z0IA 3I65A 3GIYA 4JY8A 4O54A 4JNMA 1ONRA 1OF6A 1TRDA 3P67A 1I2RA 3FS2A 5K4ZA 4FHAA 3NQGA 3L66A 5EKYA 1S5WA 2HTMA 4K7YA 3TSBA 1LBLA 4ZQOA 5I3HA 3PB2A 4D2JA 2FTPA 3QYQA 3NQAA 2DP3A 4MLJA 2V5BA 5D2WA 5EYWA 4ZVJA 5CPOA 4FIRA 2X30A 2NWSA 3QQ0A 1TTPA 1H50A 1OX5A 2FFCA 3F4NA 5TIMA 4XZ9A 3UNDA 2D73A 3PG9A 1Z48A 3GXNA 3TCEA 2C3ZA 3QEZA 4GNJA 5DLCA 3E02A 3W3OA 3G3DA 4UTHA 4LVAA 4GBUA 1W5QA 4ADSA 2OJPA 1QAPA 1OYBA 3NQMA 5D33A 4LS1A 4TO8A 2QCLA 3TXZA 4EF8A 3P74A 3W7DA 1W5PA 1DQXA 4WOZA 2YYUA 3SGZA 2C14A 1H1ZA 3W7NA 3DHFA 4X3ZA 4O4WA 4FNTA 1JCNA 2VFDA 3W7KA 3HG4A 2QUVA 4GUJA 3LCIA 3S5ZA 1UUMA 1YDNA 1OFBA 4MJMA 3GZ3A 1BWLA 1NSJA 1LP6A 1AL8A 4QM1A 5EBUA 3VE7A 2E5CA 2VOMA 3BLFA 3CTLA 1KV8A 3GDTA 4X2RA 4CNPA 4IMDA 2ZQ0A 4UFKA 5D03A 3W22A 4TMBA 5HUOA 3DENA 3S6DA 1Q6RA 3NYZA 1UCWA 4GXMA 4FEZA 5DXYA 3L65A 2A7NA 2GQAA 4AHOA 3C8FA 1H51A 4FNRA 3DAQA 1THFD 4CCCA 3QF0A 1GZGA 1WQ5A 1FWNA 4DF1A 5LNUA 2TSYA 3L67A 4LVBA 2FPVA 3N14A 3S0CA 4LV9A 3LHYA 3IRDA 1JUEA 1L9WA 3WJZA 3PUEA 4I7VA 1X6UA 4XBSA 5AOUA 1LRTA 1YTEA 3CWOX 3C56A 2JKEA 3VKJA 2CLKA 4LRTA 1Z41A 3QMRA 2X1TA 2ZDRA 1QFEA 2P1FA 3UWVA 1WX0A 2Y7EA 1WV2A 2PRMA 3EX1A 3LERA 1VZWA 1KM5A 1QPRA 5DY3A 1LCOA 3QQ1A 4NJHA 5AFDA 3QRHA 3E49A 2X16A 4LNYA 1ICQA 2C1HA 2QUUA 2EF9A 1WYIA 1TSIA 4M6VA 1I4NA 1Q3NA 3LHTA 2EKCA 3C6CA 4GUHA 1EUAA 4JXCA 1KLZA 1OX4A 1GTHA 2CLFA 4E38A 4O10A 1SZGA 3W88A 1VPXA 3M5YA 3WK1A 3G3MA 4S2BA 1TIMA 3BW2A 1XC4A 3E9AA 3Q2DA 4X22A 2ZRZA 1G6CA 1ZJIA 3BG3A 3HF3A 3VFLA 1KFEA 2JGQA 3W7GA 4UFLA 3NPUA 5J5RA 3W1TA 4RZ5A 4RZ6A 3RU6A 1A50A 1RVGA 4UR8A 2IQTA 2G5WA 3PSVA 1ADOA 3SZ8A 3TIMA 1C29A 1K03A 3OVRA 4KFNA 1WOBA 4LS2A 2BWGA 1SSGA 3DH7A 3NNTA 1PL9A 2CZEA 4J9JA 3TE9A 2GVJA 5FF7A 1GG1A 2E09A 2QJIA 3C2VA 2UV8G 2NXGA 4UFIA 5G2WA 1VCFA 3LX9A 5DXXA 5F2IA 2B0MA 1JQVA 3QPZA 1GVQA 2V81A 2J6XA 3O07A 2C13A 3M41A 4LVGA 2B7NA 3W23A 1Q6QA 3L0NA 3W1NA 1OFEA 5K9XA 1TQXA 3EWYA 2Y61A 2A0NA 3V75A 3E12A 1JCMP 2YDAA 2CFFA 1HL2A 1ZALA 4JYDA 3ZS4A 3FJ6A 3W7OA 1B4EA 1QOPA 2CWNA 1F2JA 3G1XA 3G22A 2LLEA 4UUIA 2C6QA 4XKYB 4IX0A 4Z1CA 4A22A 4DPPA 1KTCA 3F03K 2NXHA 1KM4A 3CWNA 3SFKA 4B5NA 5L6UA 3T7VA 1VCGA 5AHIA 3P8JA 3W2JA 3T4CA 2XN1A 4S2CA 1KA9F 1UJPA 6TIMA 1AW2A 4DF2A 5AN7A 3HGOA 3UWYA 2RDUA 2VEMA 4TIMA 4BFAA 3PC0A 4ZQMA 1K8YA 5D2YA 2QCHA 5G1YA 3FIGA 3B06A 4O1BA 5FEXA 3HBLA 1TPFA 2ZCGA 4FNQA 3OVQA 3LHWA 3CLMA 1CI1A 2CLIA 2YYTA 2X1RA 1WA3A 3LHUA 3OIXA 3G1VA 3MBDA 1FUYA 3B0PA 5DCEA 4AWSA 5D30A 3ATZA 3S9YA 1NVMA 4JDBA 3TX9A 4UTWC 1NEYA 3NQEA 4AAJA 3BO9A 1G7UA 2B7OA 3NR0A 4NXKA 2NLIA 1RQEA 3MW7A 4OQVA 1FX6A 1VHCA 3MUXA 3EX2A 1XM3A 2ATMA 5A5WA 4GC4A 4JYEA 5G2HA 1GOXA 4JTLA 4K7VA 3HPSA 4ALDA 3STCA 3W1RA 4JTEA 2ZRYA 4ZQRA 3KHJA 4CQ8A 1S3HA 1YYAA 1J2WA 3EB2A 3MI2A 5F2MA 3L68A 1T8XA 3A22A 1XBYA 2FDSA 1RR2A 4O0ZA 2QCNA 4HPJA 5T26A 4MZYA 1N7KA 5SWUA 1ZFJA 2F7FA 1PHQA 5FF4A 4HKPA 3QM3A 4NU7A 3E96A 1OVDA 3IGSA 5C2XA 4O1CA 3QSTA 1SW3A 1GYNA 1KM0A 1SZEA 4DQWA 2WNZA 5FEZA 3TUUA 3PUDA 4XBKA 1KFJA 3FYOA 1HO4A 1FCQA 1QNVA 3AO0A 1FWSA 3T44A 1UUOA 3C61A 3O05A 3W70A 4AHPA 1PV8A 1AK5A 3M5VA 3I7SA 4RXFA 4XWUA 4HNTA 5U4NA 3GDKA 3DU0A 4I7WA 3WK2A 2C0AA 3LI0A 2BZNA 3GK0A 5LSMA 1GWJA 3MYPA 1DBTA 4H3DA 4JTJA 2JK2A 3DFNA 3N34A 1EWEA 1IIHA 1T99A 4PC8A 4UTMA 1CX9A 1JCYA 3N2MA 2QJGA 1I45A 1W5NA 3N19B 2AQWA 1K8XA 1L6YA 1TPEA 4OGZA 4UTIA 2ZFAA 1KBIA 2XN0A 1JQXA 1W3NA 3LCWA 4O52A 1GVOA 1SO3A 4JTHA 3QC3A 4EVZA 2GJNA 4JX5A 5F1UA 1ICPA 1D9EA 2ZYFA 2VC6A 4CNOA 1OYCA 3GXPA 1QCWA 1XDLA 3GYEA 4DO5A 3NXFA 1KBJA 2O7SA 4O18A 5KSWA 2VKZG 2YZRA 3RFAA 2GUUA 4WXZA 4GJ1A 4UTTA 3TKFA 1UBSA 1PS9A 4NQ1A 4WY0F 3EXSA 1B9BA 5D2XA 5DCDA 4AB4A 4JGDA 2YR1A 2X1UA 3L0GA 2FPTA 4POCA 2CW6A 3KOFA 1OF8A 3M7WA 2ZRUA 4IPJA 3PULA 3DHDA 1B3OA 3H54A 4JX6A 5F4WA 4DO6A 1EP2A 3QH2A 4GUFA 4MZ8A 4DEFA 1JCLA 3O63A 3QMSA 1VLWA 2YXGA 4UMBA 3TSDA 3W87A 1VJIA 4UC5A 1XFBA 3W1UA 1VGAA 1XBVA 4P61A 3NQCA 3TAKA 4PL1A 1GPWA 3A23A 3UD6A 4NZJA 2ZTJA 5K7JA 3UZJA 3VNDA 2QCEA 3MO7A 2CZDA 4IOTA 4LU0A 2FQIA 3C2RA 3LHVA 1EWDA 4O57A 2E5BA 5BRBA 3CB8A 3RF9A 2NUYA 3PY2A 3M16A 3NL3A 1K3UA 4LOCA 4UTTC 1OK4A 3MI3A 4A2RA 2VXNA 1O5KA 1EEPA 4EWND 5K4XA 4OU1A 3RLVA 2QCDB 2DZVA 5CSSA 3PBVA 4Z0JA 4N6FA 4Z0SA 3O6YX 4HN4A 3S1XA 5I3IA 3L5LA 1SFLA 4UR7A 3GKAA 1SQ7A 1H7WA 3DGRA 5ABTA 1Z44A 3LTPA 3IVTA 3EWWA 4M6PA 2YFOA 4M7SA 4IGHA 1J5TA 3HG2A 4GE8A 3FYPA 3Q94A 1YTDA 1JR1A 4EIVA 5F4XA 3STFA 4TMCA 1JVNA 1ZAJA 3NQ2A 4W9TA 3HIJA 2J9XA 5CZJA 1S5TA 2WV8A 5AHNA 4QQ3A 1KTBA 4JICA 4KWVA 4HNNA 1VRDA 5CG7A 4PODA 4E2BA 1G4SA 2R91A 1DORA 4MKNA 4JTTA 4RKAA 5CZSA 3G1YA 3G0UA 3P7YA 4JD4A 3W7LA 3EXTA 1TQJA 2Y6ZA 1GVRA 1X1ZA 4UMAA 3O16A 3IVUA 4Y9AA 1V7YA 3PS7A 3O06A 4LWWA 4A2SA 4AWUA 1FWRA 5AYYA 1T0OA 3BARA 5A8GA 1W1ZA 2OT1A 5KINA 3TJLA 3UWUA 2QEZA 1OJXA 4O15A 1JUKA 2V2HA 3PBWA 2XN2A 2V9DA 1BWKA 5HWMA 2GQ8A 1I2PA 4DF0A 3TJXA 4AXKA 1W5MA 3P62A 1TYGA 3CQ0A 2DJLA 3BPWA 3M1ZA 3GDRA 3S1UA 3INPA 3CHVA 5LHEA 1YDVA 2Q3OA 1V5XA 3L5AA 2R94A 3HPZA 1WDWA 3TNOA 2EGZA 1B4KA 2TMDA 2XFWA 5HMSA 4JIPA 4MVAA 2NV1A 2WPBA 3P84A 1FCUA 3NQ6A 4M19A 1A5SA 3GVGA 4ZQPA 5LGXA 1D3HA 4AF0A 2ATSA 4RZ4A 1A5BA 3PUOA 5FF3A 5J5DA 5LNSA 1LDCA 1TV8A 4MOZA 4C1LA 5C6MA 4UTLA 3NDOA 2A6LA 2Y62A 3SGUA 2ZZ4A 1NF7A 1L2UA 1Q6OA 5EMUA 3LLFA 3TR2A 3HQ1A 2Y70A 1TTQA 3WK0A 3B03A 4YL2A 3B4UA 5U7SA 3C0JA 4JIQA 3N9RA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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