3HPZA

Crystal structure of mycobacterium tuberculosis leua complexed with bromopyruvate
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
626
structure length
571
Chain Sequence
TIVKPAGPPRVGQPSWNPQRASSMPVNRYRPFAEEVEPIRLRNRTWPDRVIDRAPLWCAVDLRDGNQALIDPMSPARKRRMFDLLVRMGYKEIEVGFPSASQTDFDFVREIIEQGAIPDDVTIQVLTQCRPELIERTFQACSGAPRAIVHFYNSTSILQRRVVFRANRAEVQAIATDGARKCVEQAAKYPGTQWRFEYSPESYTGTELEYAKQVCDAVGEVIAPTPERPIIFNLPATVEMTTPNVYADSIEWMSRNLANRESVILSLHPHNDRGTAVAAAELGFAAGADRIEGCLFGNGERTGNVCLVTLGLNLFSRGVDPQIDFSNIDEIRRTVEYCNQLPVHERHPYGGDLVYTAFSGSHQDAINKGLDAMKLDADAADCDVDDMLWQVPYLPIDPRDVGRTYEAVIGGVAYIMKTDHGLSLPRRLQIEFSQVIQKEVSPKEMWDAFAEEYLAPVRPLERIRQHVDAADDDGGTTSITATVKINGVETEISGSGNGPLAAFVHALADVGFDVAVLDYYEHAMSAGDDAQAAAYVEASVTISKTVWGVGIAPSITTASLRAVVSAVNRAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Probing the active site of M. tuberculosis LeuA
rcsb
molecule keywords 2-isopropylmalate synthase
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 190
structure length 571
sequence length 626
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.3.13: 2-isopropylmalate synthase.
pdb deposition date 2009-06-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00682 HMGL-like HMGL-like
A PF08502 LeuA_dimer LeuA allosteric (dimerisation) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3hpzA01
3.30.160.270 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Double Stranded RNA Binding Domain Double Stranded RNA Binding Domain 3hpzA02
1J5TA 1RQEA 1X8FA 4Z1DA 5BW6A 1LORA 1EWDA 4NU7A 2CLFA 1PHWA 1OK4A 4AWSA 2GJLA 2QKFA 3NG3A 4JYDA 3LXAA 3GX9A 2PE4A 3NQ6A 3BPWA 1SW7A 4MPQA 3BW4A 4RXGA 1D9EA 3TX9A 2DZWA 3SIZA 3NO5A 3FEMA 1FWNA 4FNQA 2NX1A 1D3GA 2JKPA 3P62A 2ZZ1A 5LSMA 2Z1BA 4NXKA 3TQKA 3LTYA 4UFHA 2DZTA 3CEUA 2YZRA 3LLDA 5TBOA 2Y7GA 5DCDA 1S5VA 4N9CA 5CPMA 2V2HA 3EXTA 4GRSA 3LERA 4R34A 3EXSA 3BW2A 3G1FA 1SO5A 4GUHA 4DF1A 4LS0A 3NQ7A 2ZQ0A 3AO0A 3TC6A 5D02A 3HPXA 3GNNA 5D30A 3UXAA 2ZDRA 1K3UA 1YPIA 3THQA 4OWGA 1JCJA 2ISVA 1KLZA 1X1ZA 5I3JA 4E38A 1K7FA 1OK6A 2A4AA 3O15A 3O05A 3EWXA 2VOMA 3C2VA 1PL9A 4D2JA 3UY7A 1UJPA 3HGOA 3LLFA 3TSDA 1LBFA 1QWGA 3W7CA 3N9SA 1EP1A 1W5MA 5CZ0A 3G18A 3W1QA 4NVTA 3Q58A 2QDHA 2G95A 4WOZA 3HOJA 3CT7A 1OVDA 1FCQA 4XWUA 2V2DA 1FCVA 4GUFA 4CLMA 4UFJA 3QZEA 4BI6A 3W7NA 4DPQA 1F5ZA 2JK2A 3P74A 1H7RA 4DEFA 3Q94A 4ML9A 2OT1A 1W1ZA 4QIUA 4YL2A 4LW7A 5AC6A 5F4WA 3W6YA 4E2DA 1SO3A 3W7DA 5ABTA 4XQ6A 4LVGA 1SUXA 4JS3A 3IVTA 4TX9A 5CKSA 1EPXA 2QUTA 3B0UX 1WDWA 4YCPA 1KM1A 3WJWA 1VS1A 3W72A 1MEIA 4WOQA 2PCQA 1S5TA 8TIMA 1YXDA 4WUIA 2X1SA 3TROA 1MSSA 5BRBA 4IUOA 1F6KA 3THAA 1RV8A 3N9RA 1NSJA 4DELA 1KA9F 1VJIA 4WXZA 1BKSA 4X2RA 2FB2A 2W79A 3UQNA 3S5OA 5AFDA 3CM4A 4LVBA 4RXFA 1TSIA 2D73A 1I2PA 3F4NA 2Y89A 3W7HA 4UFLA 3GYEA 3M5YA 3MP3A 1EP3A 1QOQA 3G0SA 4JDBA 3H53A 2FPTA 3NL2A 2Z6IA 2B4GA 3L0NA 2EF9A 5LNWA 4TMBA 1TCDA 4O4VA 3MHGA 2C13A 4UTWA 5HUOA 1GTHA 3B0PA 2VFEA 1G7UA 1JQVA 3NEVA 4WY0A 3M44A 3U8GA 1W3TA 1QOPA 1M5WA 2CZ5A 1WYIA 2ZYFA 1NFBA 1P0KA 1V7YA 4PC8A 5LNRA 2C1HA 1GVFA 4JD4A 5HMSA 1HUVA 1Q6QA 4O16A 1S5WA 3VNDA 1VCVA 3LV5A 4O18A 2A0NA 3ZS4A 2QCDB 4O11A 3W2JA 4CNNA 2WSQA 3CQ0A 4HNUA 3R2GA 5D05A 4PL2A 4JGDA 5AHFA 2WOQA 4R7JA 1UB3A 2GPTA 4O8RA 1DJQA 5D38A 1QDSA 3GZ3A 3DHDA 4XBSA 3S5ZA 1H51A 3A9IA 2CLKA 2VEKA 3RFAA 1OABA 1TV7A 2OCZA 1H1YA 1W56A 4UTUA 4JX6A 3CLMA 3E0IA 1G4SA 1DOSA 4WQ6A 1N8FA 4ADUA 4O54A 5DBTA 3DZ1A 3W1XA 3GXTA 2O7SA 4O10A 3BVJA 3BO9A 4AB4A 3WJYA 2NZLA 2ZRVA 3R89A 3FJ6A 2EAWA 4RKAA 2CWNA 3A5VA 1ZENA 4JX4A 1TPB1 4FNUA 2QEZA 4IX0A 4XKYB 2WSYA 4M7SA 3TU9A 3UNDA 2NUXA 2DZVA 3DHFA 2JGQA 1XCFA 3FYPA 3P60A 2WNQA 1TV8A 4FNTA 3GB6A 2VEPA 2QCEA 5K9DA 3EXRA 3O8AA 4BFAA 1AL8A 4LWWA 5L6UA 2YDAA 3LHUA 1I2NA 3S1VA 1VC4A 4RK8A 3QMSA 3YPIA 3TXZA 4CQ9A 3KVKA 3QM3A 3FJLA 3GVGA 3PR2A 1F73A 3MJYA 5D2VA 3EWUA 2EPHA 4OHQA 3ATZA 2GVGA 5LGZA 4CNOA 2CW6A 5F2IA 1LP6A 4JIPA 1GG1A 5H91A 2OJPA 1M7OA 1I45A 1JRCA 4K7YA 2HS6A 1A5BA 3MHFA 2ISWA 2WJZA 1ZCOA 4O1CA 4Z08A 1EB3A 4LUIA 4NNCA 2YYUA 3NL6A 2E5BA 2VFGA 4I7VA 3W2KA 5FF3A 1HO1A 1KFKA 4AHPA 5I3FA 4O57A 1FXPA 3UPWA 2I14A 3W7MA 1TO3A 1D3HA 3KRSA 2B0MA 3OVQA 4B5NA 3IIPA 3MBDA 4NJKA 3EKZA 4HN4A 2ATMA 1W5NA 3ABRA 2BZNA 5KZDA 3TQVA 4JTHA 1O95A 2PRHA 1FWTA 4MKNA 2DORA 5HQEA 1JCYA 1HG3A 1Q3NA 3N2XA 2VC6A 3C6CA 1TQJA 5LZLA 4AWUA 5EL1A 4DPPA 1G4EA 1R46A 3NQ2A 3B4UA 4YMZA 1H63A 1YDVA 3C2FA 1A5AA 1OF6A 4JTSA 1TTQA 4M6PA 4N6EA 5D37A 4N9BA 4O50A 1M7PA 1T0OA 5D2YA 1JUKA 2QCLA 4IXHA 4O4WA 5D09A 2QJIA 2A21A 1XBVA 5H2ZA 4UFMA 2B7OA 3C61A 3M5VA 1B3OA 3CC1A 2G5WA 4FIRA 5DY2A 3TQ0A 1Q45A 1W5QA 4UTJA 5BOOA 1TQXA 4GNJA 4NT0A 1A50A 2OX1A 2QJHA 1XXXA 3DFOA 2Y88A 3W86A 2VFIA 1SW3A 2RHGA 5KZMA 4YCOA 2WNZA 3HQ1A 4WY0F 1O94A 5J5DA 3MI3A 2ZZ2A 3UWUA 4O52A 5G5IA 3LCXA 3ELFA 3QPYA 3UD6A 1T96A 1M6JA 1QPQA 1TREA 3NZRA 1BWKA 5K9XA 1LDCA 3SGZA 2ZZ4A 2QAFA 1QAPA 2ALDA 1H7XA 3RK8A 2ZZ6A 1OFAA 3N3MA 4QITA 4RCXA 1SR9A 1QO5A 3T78A 2IQTA 4XUGA 2NXHA 3NQ8A 1GVQA 1W0MA 5AHLA 2XN2A 4IQLA 3VCRA 4OGZA 3HGSA 1ZALA 1ZAHA 2WO5A 4UTMA 4HNTA 1UUOA 1X7FA 1IIGA 3DGRA 2A5HA 2A7PA 1I2OA 3UXDA 4JY8A 3DI0A 4MLRA 2E6DA 4AH7A 3SZ8A 5D32A 1LBLA 2CZFA 4EVZA 3GR8A 2A2IA 2VENA 2GQ8A 3ABOA 5CPOA 1EEPA 1FX6A 4POCA 3OIXA 1WBJA 3QQ1A 4RZ5A 4Z1BA 1PVNA 3LHWA 1QNVA 1XM3A 5CZJA 1GTEA 3TFCA 3NQVA 2QF7A 3I68A 3UWZA 1ZAIA 5F4XA 1KFJA 2NUWA 3NM3A 5GVJA 1BEUA 1H7PA 1GEQA 1XUZA 3F03K 4IGHA 4OE7A 4I7WA 1GQNA 3A24A 3IIZA 5AYZA 4RV8A 3NYZA 3HB9A 3N14A 1KM4A 2A6NA 2X30A 1H7OA 3W3OA 5KINA 1EIXA 1H60A 1B57A 3L5MA 2DZUA 1EP2A 2E6YA 3L65A 4HPJA 4KFOA 2NV1A 2NWSA 4HNVA 3RU6A 2QCDA 1ADOA 3FIGA 4FXSA 3STFA 4O15A 3QPZA 4MYAA 4LUJA 5HUPA 2X16A 3MP4A 3T44A 1ONRA 4GUJA 3MO7A 4RZ6A 3OBKA 3R5EA 5DCEA 3FKKA 3GK0A 1L9WA 4LTSA 4M6VA 2HTMA 2YXGA 4CCEA 2H90A 4MJZA 4NZFA 1PV8A 3P80A 1TB3A 4LS2A 2Q3RA 2YR1A 5FEPA 2VFHA 2H3DA 1MEWA 3H54A 3W71A 1F74A 3W70A 2X1UA 1AG1O 4A22A 2Z0IA 1JVNA 1IF2A 1CW2A 3UZJA 2P10A 2UV8G 4XKYA 2NWRA 2A7NA 3E02A 4ICNA 3M5XA 3BGGA 1S3HA 1W3IA 3SI9A 1FWRA 1SW0A 1BWLA 1TRIA 5G2IA 3WK1A 1FCBA 3HPSA 5HJLA 4UXDA 3PS7A 1NEYA 3W84A 3LM7A 1DVJA 2WNNA 5MHBA 1EA0A 1RVGA 4E0CA 4BI5A 2X1RA 4WD0A 2A6LA 3PG9A 2YW4A 2KZHA 2FPYA 5LNSA 3CHVA 1IXQA 4OT7A 4UC5A 1VQTA 3FFSA 1DV7A 2YFNA 3ANYA 1VGAA 3W2UA 2R94A 2Y7EA 4I9AA 4Z0JA 3BW3A 1SU5A 1MEHA 2V9DA 3C52A 1KM5A 1K8XA 1H61A 1GVSA 1VH7A 2Y70A 1OFDA 3NQGA 4O17A 4JXCA 1FUYA 3USBA 3GDKA 3R8RA 4A21A 3G1XA 5D2XA 2XFWA 1LM1A 3W1AA 1YXCA 5I3GA 3PG8A 4NJJA 4UR8A 3QSRA 1Q6RA 2CLOA 3G8EA 4IOTA 3R13A 1WA3A 1YTEA 2CZDA 1X6UA 4IPJA 4O13A 2VEMA 4WXYA 3TAOA 4UUIA 5K9CA 3G24A 2E6AA 2OZ0A 2HS8A 1R30A 4IPIA 2Q8LA 3N73A 4DO4A 4UMAA 3KXQA 2A7RA 4FF7A 3GDLA 5C6MA 3LRMA 4NJGA 3TMQA 1MXSA 5D2TA 2Y63A 1ICPA 1LLZA 2RKXA 4JY9A 5FF7A 4UR7A 4KFPA 4ONVA 3W1MA 4FNSA 3F4WA 5IBXC 2H6RA 2TPSA 4PTNA 2QCNA 3S42A 5CGQA 4ZL1A 3DFSA 3M6YA 2FDSA 1VYPX 4UTHA 7TIMA 4O14A 3UWQA 5C54A 1TTJA 3M16A 1VR6A 3MI6A 1GJPA 2CLEA 4FX8A 4CNPA 3EB2A 2DJLA 4Y90A 1RQBA 1F6PA 3T7VA 1B4KA 5I3KA 2J9YA 4M6QA 4ORMA 2P0OA 5F4SA 1C8VA 1OFQA 4C1LA 3ZWTA 3L9CA 2TRSA 3B06A 3W1LA 1H1ZA 4HKPA 3TV8A 4CQAA 3M5ZA 2YW3A 3T40A 2OT0A 3IEBA 3M41A 1RD5A 1QPRA 3SJ3A 5G4EA 3LOTA 5K4ZA 2TYSA 3DFQA 4UIOA 3QMTA 3HF3A 3NA8A 2OMAA 3W75A 1ZJIA 3C2EA 4LRTA 4EOUA 2BTMA 3E9AA 2FQIA 1TMHA 1FWSA 4NJIA 5G2HA 3PVFA 3M1ZA 3LXBA 5D2WA 1LZOA 4ZVJA 1XI3A 3BG9A 1FY6A 4XTIA 2C3ZA 1G6CA 4O1AA 4OQVA 1VLWA 2C0AA 3T55A 3KFTA 3HG3A 5CSRA 2V30A 2GUUA 4IWWA 4O0ZA 5F1UA 3LCWA 1SZEA 2QAPA 3SSJA 4JDYA 1WX0A 3G0UA 2ZFAA 2C14A 3EX2A 3PBUA 3O63A 3QW4B 4DO6A 4QJ1A 3LHZA 3IIXA 3W7PA 1G7VA 3P61A 4PEKA 1QO2A 4FXRA 3UWVA 1HL2A 4QAIA 5HR7A 3HIJA 4EF9A 3S1XA 4NZJA 1AL7A 3BG3A 2I9EA 5A5WA 4Z1AA 5F2GA 4LV4A 5F1VA 3Q2DA 3FYOA 4N4PA 1LBMA 3L66A 4UTTC 2V5BA 2ZZ5A 1DHPA 3P82A 4OU1A 1GG0A 3G3DA 3GDMA 4Y6GA 5BNKA 2YSWA 3C0JA 4PFMA 1HO4A 3G22A 2V82A 3IGUA 4JTTA 3MMTA 4HSOA 4K6AA 3LHYA 1UASA 1H5YA 4X22A 4XZ9A 5K2ZA 2VXNA 1O5XA 5K7JA 1Z42A 1YDOA 1NVMA 2LLEA 2NXGA 3PAJA 4A2SA 4N9EA 3TH6A 1UUMA 3LGEA 5E0KA 1MZHA 3QEZA 3KOFA 3QYQA 5A8GA 4AF0B 1IXNA 2E68A 3B0VC 1EX5A 1LOSA 3EX3A 3KHJA 4GC4A 4MFEA 2J6XA 4JEQA 3IIVA 3LBMA 3TSBA 3W1RA 1VYSX 3TXVA 3NQEA 1I2QA 3BK0A 1OYBA 3FLUA 4R53A 1XDLA 4KWVA 4JTFA 1ZAJA 3NQDA 3K30A 1KBIA 1TPVA 4M19A 4K8HA 1TPFA 4QM1A 1TIMA 4ADSA 5K4XA 2QCFA 1GOXA 3W7QA 2J27A 3Q37A 3LCGA 4FX7A 3W7LA 1CI1A 1IXOA 3PSVA 1QPOA 4ZZ9A 4MY9A 1R2RA 2F84A 4GUGA 1SSGA 2Y7FA 4Y8FA 2JKAA 3W07A 4UTKA 3OEXA 2Q3OA 3W9ZA 3N19B 3C3NA 3G1AA 3HJZA 2W6RA 5LNUA 3GDTA 5CZSA 4GJ1A 2V5LA 3MUXA 3TA6A 1ZHAA 3M43A 1XBYA 2F7FA 1KM0A 4UCGA 4RJEA 5HNRA 1AW1A 4NNAA 1KM6A 1KTBA 2JGYA 3G1DA 3RNDA 1WXJA 4HIBA 3TFXA 4Z0SA 3S1UA 1ZY9A 3G1HA 4KFNA 1XBZA 4Z1CA 5J5RA 2EHHA 3L21A 1H7WA 3OHIA 3TCEA 4AVFA 5E93A 3WK2A 5BMXA 1VRDA 3INPA 4Q33A 4LRSA 4ZQPA 3FOKA 3WJZA 4K37A 5AN7A 3WK3A 3NQCA 2ABAA 3A21A 3HGRA 3CB8A 5G1YA 3ABQA 2G96A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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