4LRTA

Crystal and solution structures of the bifunctional enzyme (aldolase/aldehyde dehydrogenase) from thermomonospora curvata, reveal a cofactor-binding domain motion during nad+ and coa accommodation whithin the shared cofactor-binding site
Total Genus 136
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
136
sequence length
334
structure length
334
Chain Sequence
APRVRITDSTLRDGSHAMAHQFTEEQVRATVHALDAAGVEVIEVSHGDGLGGSSFNYGFSAVDEIDLVAAAVDEAVNAKIAVLLLPGVGTVRDLKRAHDAGASVARIATHCTEADVSCQHFAAARELGMETVGFLMLAHRIGPEELARQARIMVDAGAQCVYVVDSAGALVLSDVQARVQALVREIGHEAQVGFHGHQNLSLGVANSVLAYQNGARQIDGALCALGAGAGNSPTEILAATFERLNIETGVNVQAALAAAEEVVRPYLPRLPWADRAAIVQGYAGVYSSFLLHAERAAERYGVPAHEILQRVGEAGYVGGQEDMIIDIAVQLAEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal and solution structures of the bifunctional enzyme (Aldolase/Aldehyde dehydrogenase) from Thermomonospora curvata, reveal a cofactor-binding domain motion during NAD+ and CoA accommodation whithin the shared cofactor-binding site
rcsb
molecule keywords 4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase
molecule tags Lyase/oxidoreductase
source organism Thermomonospora curvata
total genus 136
structure length 334
sequence length 334
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 4.1.3.39: 4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase.
pdb deposition date 2013-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00682 HMGL-like HMGL-like
A PF07836 DmpG_comm DmpG-like communication domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.8.60 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Helicase, Ruva Protein; domain 3 Helicase, Ruva Protein; domain 3 4lrtA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4lrtA01
1W5NA 1DHPA 5DXYA 2I9EA 1KBJA 1TRIA 3GIYA 2V0TA 1FDYA 4RX0A 2QBYA 1FY6A 1KM4A 1OG0A 1TPUA 2FPTA 1OK6A 3TFCA 5EXPA 3S5YA 3TMLA 5D2XA 2KZHA 4JY8A 5EXXA 1FBAA 4RZ4A 5AHIA 5AC6A 2DJLA 1SW3A 4IQLA 2FIQA 2ZFAA 3UY8A 3ZWSA 4AWTA 2QKFA 1QDSA 5HJLA 5CZJA 3DHFA 3W3OA 3UXAA 3NL3A 5AHEA 1FQ0A 3CTLA 3NR0A 3G1DA 3N14A 4TMBA 2C18A 4Z1BA 4JYFA 4DBDA 1YXCA 5I3KA 3EWXA 4BI6A 2NLIA 5DCDA 4O1CA 4ZQCA 4E2BA 3FJ6A 2QJHA 3PS7A 2CE7A 3K1JA 4OU1A 4D80A 2R91A 1C29A 2Y88A 5DXXA 1IY1A 5HR7A 5G4WA 1LTDA 1P4CA 1KM5A 3MP5A 2PRLA 2GQ9A 1V5XA 1SW0A 1E32A 4D81A 4RXFA 4KODA 4TO8A 1ZAJA 3OIXA 3Q94A 1TPFA 2C6QA 1JULA 2Y7EA 1LBLA 3NQ2A 2Z0IA 2QUUA 3W7MA 4NJIA 5D09A 4O1AA 2QCDA 2JKAA 3WK3A 2HTMA 1WOAA 3PBUA 4FCVA 4RXGA 1RD5A 2I14A 1TREA 4Q4KA 1DV7A 4BI5A 1B4KA 3W85A 2DZPA 4UTIA 1GVRA 4UTWA 2ZZ6A 4J9JA 1TTQA 4FB7A 4JTLA 2YX0A 3LHTA 5F4WA 3WHKA 2CHQA 2CFFA 5EP3A 1XFBA 1CW2A 4MYXA 4LS2A 1SO5A 4B5NA 3UWQA 1R2TA 2R8WA 3B0UX 1UUOA 4NJKA 4DF2A 4DO4A 3W1AA 1IXSB 3S1VA 3GX9A 3VE9A 1BEUA 4FX6M 3DH7A 1XC4A 4DELA 3KRZA 2CZEA 2QCHA 4ZMGA 5J5DA 1JCNA 3EX4A 4EF9A 3S1WA 5G2IA 3R8RA 5D37A 3U5ZB 4W9TA 4HKPA 4U28A 4XUGA 2TYSA 2YW3A 3EXRA 2WJZA 3ABQA 1ICQA 3TAKA 1LOSA 4TU1A 5DCBA 2HCBA 1K7XA 4I7UA 4QITA 3W86A 1KFCA 1PVNA 2O7SA 3BW3A 3GXPA 4YXGA 1DBTA 1TO3A 3NQAA 1U83A 4GE8A 3CT7A 5I3HA 4WW0A 4CNOA 3UWVA 2GVLA 2X16A 4AHOA 2QCMA 4LRTA 3BG5A 3G1AA 3EEGA 2ZZ2A 1UJPA 4RKAA 2CLKA 1OYAA 3TK7A 3AJXA 1EP1A 1F76A 1R2SA 4HSOA 5D33A 5E1QA 4DF0A 2H8ZA 4QISA 2XSZA 5AHFA 3SI9A 4JTHA 4MIMA 1HUVA 3HG5A 3G8RA 5BMXA 3CC1A 1I2RA 1PL9A 3R5EA 1XWIA 3A5FA 3LLDA 1XXXA 1LRTA 4PL2A 1S3SA 4QQ3A 1UUMA 4A2SA 4MFDA 2FQIA 1K02A 3ZR4A 1LRNA 4KWWA 4QIUA 1LOLA 4LVBA 2Y7DA 1NSJA 1JRCA 4BF9A 3NQEA 2WNQA 3S6DA 3WJZA 1TJPA 2DU2A 2QAFA 4LVAA 2C14A 2WNNA 2A5HA 2ZZ4A 5AB3A 1RPXA 2B7NA 4H6KA 2QJGA 3TW7A 3WJXA 2A7NA 5D2YA 3S9YA 2G97A 3DAQA 3ZS4A 2OCZA 5HINA 2H3DA 1PHQA 3PF3A 1KFLA 1RR2A 4I7VA 2NUXA 3IIPA 4LRSA 4PEKA 2JK2A 1W5SA 3PXGA 4YMZA 3PBVA 3W6YA 5C1BA 1VLWA 4GUHA 3ABOA 3TR2A 4S1FA 1Q6QA 5F1UA 5D30A 2R65A 4ADTA 3LLFA 3HGRA 3M5VA 2WPBA 2Q3OA 4LOCA 4DF1A 2ZZ5A 4LTSA 4UFKA 5LNUA 3MHVC 2VEPA 4R53A 3I7RA 4Y8FA 1LDCA 2TMDA 4MKNA 5DN1A 5E0KA 1C8VA 4M6PA 3D0CA 3U6WA 2RH9A 1A5AA 1FWWA 3TA6A 3CIXA 3O05A 2IQTA 4GUGA 5AOUA 4NJGA 3OA3A 1QPQA 2A85A 3G0XA 1LCOA 3EWYA 4RK8A 2DHRA 3O07A 3P74A 4JTTA 3CF0A 2VEIA 1QZMA 4WY0F 1SQ7A 1I2OA 2X30A 4H3DA 4M5PA 3W7EA 1KTCA 3DFSA 4JTUA 2Y63A 3TE9A 4GJ1A 3ZWTA 4OWGA 3VKJA 3TUUA 4L4LA 3HU1A 3GXNA 2B7PA 1VYSX 5U4NA 2C98A 3AO0A 1FWNA 5HR6A 2Z4SA 2Z6IA 2J6XA 1EB3A 3LX9A 1I2NA 4O53A 4UNKA 3C2FA 1JQVA 4JNMA 2NWSA 2OJPA 4O54A 3MO7A 5C5YA 5D2VA 4Z1CA 2Q8ZA 6TIMA 4Y96A 3L9CA 2FJKA 3STCA 1QMLA 3M5XA 3SGUA 1GQNA 1M7OA 3YPIA 3B06A 3L5LA 2GJLA 4AVFA 2VELA 2XSZD 4HNTA 2D73A 3EWBX 1IN8A 3R89A 3LV5A 1G4TA 3F1QA 3NYZA 1FWRA 1AG1O 3GKAA 4K6AA 1JQJC 3NO5A 1LORA 1Q45A 4MZ8A 3WHLA 2HMCA 1TJRA 3PG8A 4LC8A 3FLUA 1UCWA 4EVZA 2H3BA 4FNQA 2E6FA 2F84A 3O6DA 1O5XA 1TB3A 3KVLA 2FB3A 5ABTA 1QR7A 3BARA 2WV8A 3KRSA 2DZNB 4UR7A 3R8FA 2E5DA 2VEKA 2NZLA 4UTUA 3LHUA 2QCNA 3G3DA 1PS9A 3LHZA 4FW9A 1H7NA 1W31A 5G4EA 5IBXC 4IJBA 2VKZG 3MHGA 4DO5A 1N55A 3HB9A 2PRMA 3LRLA 2CHGA 2YSWA 3N2MA 5DELA 5H2ZA 1W0MA 4LJ4A 2BSLA 5LSMA 1SPQA 3B9PA 1GTHA 4GWEA 2YCEA 5HWNA 1H7XA 1EA0A 1QO5A 4MZ1A 4JTFA 2JGYA 4FO4A 4OHQA 3L68A 1QWGA 2QCGA 2WKJA 1WX0A 5IBXA 1K03A 1SZEA 4BFAA 3UY7A 3N19B 3LI0A 2C1HA 3QMSA 4MLRA 4I9AA 5AYXA 3CWNA 1SZFA 4LJ7A 4IOTA 3MHUA 3N73A 1ZAIA 2V5BA 3W7LA 4BWLC 3W7GA 3W7KA 3HU3A 4NT0A 1W3TA 2GPTA 4JTKA 4K7VA 3EX3A 4LUJA 1F6KA 2ABBA 3TW6A 1ZHAA 1G4AE 1KV5A 1FDZA 4O1DA 2Q8LA 3THQA 2BTMA 1PCKA 2VFEA 3HJZA 1KM6A 4MLJA 4C1KA 1F2JA 4QJ1A 4LJAA 3JR2A 3JRKA 3RMJA 2QBYB 1AW5A 3W2LA 1W1ZA 5EP1A 2V2DA 2ZA2A 3USBA 5AYZA 4FIRA 3LCIA 4BWLA 4GBUA 4QSHA 3UPBA 2C16A 4Z0JA 4QHTA 5LHEA 2VFIA 1W5OA 2PURA 4O10A 4ZVJA 3A5VA 1K7EA 1L9WA 4FCTA 5DYGA 3U60B 3PSVA 5H91A 2V9DA 5EPDA 1EPXA 3FA5A 5FF2A 3QSTA 2E6AA 1A5BA 2W6RA 1PV8A 2NXHA 1TPC1 2QJIA 2VFGA 3W23A 4ZQRA 1GYLA 3HIJA 1RV8A 2B0MA 4HNNA 1VLIA 3LCHA 1FWTA 1JUKA 2OMAA 3GDKA 4MY8A 3T44A 5KMYA 4JTGA 3GYEA 3KAOA 5CG7A 1T0OA 4O14A 3NPWA 4K38A 5TBOA 1VS1A 2C19A 5AYYA 5T26A 2OZ0A 4K8HA 3I65A 4L15A 4OBTA 5F2GA 1OFQA 4UUIA 4KWVA 3HO8A 3P8IA 4IX2A 1L8QA 3O16A 2DWZB 1Q3NA 3OBKA 3O8AA 2A1YA 3HQ1A 3NL2A 4WUIA 3OHIA 2QEZA 3QYQA 3DFNA 1WYIA 3S8HA 4HHPA 3SYKA 2Z1BA 2EGZA 2YZRA 3F4WA 5EMUA 2ZANA 1KW1A 2YGYA 4O28A 3LCWA 3SGZA 3GXTA 4KKXA 3EKZA 2FLIA 2GQ8A 2DORA 5EP2A 3GDLA 3M0EA 3IIOA 3CWOX 1OFHA 3CIWA 3ELFA 3SECA 5KZMA 1CX9A 3PULA 1F7BA 5F4SA 3TFXA 4CCCA 4IXHA 2C15A 5EL1A 2JGQA 3W7NA 3CHVA 2Y85A 3O15A 3BO9A 3TX9A 3W2MA 2DZUA 3SIZA 1QFEA 3MYOA 1KM2A 1LLZA 5A8GA 4ML9A 3NAVA 4DQWA 2BLEA 3IGUA 3DFTA 1OFBA 2WSQA 3HGOA 5G1TA 1HQYE 1XBXA 3C2EA 2FPYA 4Y90A 1GWJA 2G5WA 3W07A 4X22A 4WXZA 3DZDA 4FWGA 4NVTA 4UTTC 1JJKA 5BNKA 3B05A 2GJNA 4Y9AA 1TQJA 1VC4A 3GLGB 3D8BA 5AFDA 1E94E 5L9FA 4XBKA 2QZ4A 2R94A 3QRHA 3PVSA 4N2YA 2VXNA 4R34A 3RK8A 3W7OA 3G1HA 3HMJG 3PVFA 4K37A 3IEBA 2R14A 2CLIA 4UTTA 2CLHA 3W7HA 3EXTA 1J4EA 4FEZA 5F2LA 3A22A 1HTIA 2DZSA 5F1VA 4ZQPA 4JICA 2Y7GA 2DJXA 4LJ6A 1TPWA 4X9SA 5LZLA 1ME9A 1N7KA 4IPJA 3G1VA 4KFPA 1SZNA 1SSDA 3O63A 2A21A 4AAJA 4L4UA 1ADOA 3ABRA 3EIHA 2ZRZA 4AB4A 5G2HA 1OX5A 3RF9A 2Z6JA 2TPSA 2A7PA 3KVJA 5IM51 4NNCA 3W83A 5AHNA 1JUBA 1IXPA 4IMCA 1FCUA 4AWSA 5HUPA 5AN7A 5FF3A 3W7RA 2AQWA 3H53A 1G4PA 3B0PA 3QW4B 4E0CA 2ZRWA 5FF0A 3PG9A 3B03A 3TSMA 3E9AA 1S3HA 1ZALA 1SUXA 1F74A 3UNDA 4ADUA 1VHNA 4LJ5A 3TSBA 4IMFA 4QHSA 1DJNA 4FWDA 1HL2A 3LXAA 4DXVA 4IGHA 1IQPA 2CU0A 3T4CA 5E93A 4O8RA 4DPPA 2BJWA 2RKOA 3TNOA 1OFOA 2RDTA 3S5NA 4UTKA 5KTLA 2P0OA 1JRBA 2ZA1A 4FX7A 3LHWA 1OHLA 4MY1A 2ISWA 1W5PA 2E5BA 1S5TA 5JI2E 4P61A 3DU0A 1YYAA 4IXXA 3TQVA 4KLNA 3FKRA 1YDNA 3NEVA 3P84A 3QQ1A 4LW7A 5EY5A 4JR5A 3VFDA 1NY6A 3W73A 2EAWA 4MYAA 1K8XA 3KVMA 1OX4B 4O13A 1VQTA 2LLEA 5DBTA 3HG4A 4O4VA 4A3VB 3RLUA 4AHQA 4UFJA 3WJSA 1IM2A 3N2XA 2O7QA 4AF0A 1X7FA 4JDYA 4JX6A 2NXIA 1GEQA 1F5ZA 4Y6GA 3H55A 3M7WA 3W75A 1QVRA 1I4NA 1H7OA 4ZQOA 4QNWA 3O6YX 5FEPA 1OF6A 1KFBA 2V30A 2QAPA 3GLGA 4UMCA 3WFAA 4ORMA 1TRDA 3MI2A 3BPWA 4N4QA 5K2ZA 2V2HA 4POCA 8TIMA 4LU0A 3LRKA 3U8GA 2NXGA 2QCFA 3LHVA 1V7YA 5AHLA 1XKYA 5KSWA 3BOSA 1OJLA 3GDMA 5CGQA 2EHHA 5EA9A 3W84A 5AC8A 2A6NA 2GVGA 4LV9A 4GUFA 3RFAA 3QQ0A 4ORIA 1IXNA 4FCWA 1M7PA 4RJEA 1LP6A 1XBZA 4NUWA 5KZDA 3G8EA 1QPOA 3EX1A 5D04C 3S1UA 4U4MA 1W5QA 4Z1DA 3P61A 4FF7A 1DQXA 3W2KA 1NJFA 3B0VC 2NWRA 5KITA 3IVUA 1LRQA 1GJPA 2C9CA 1EIXA 1OJXA 2WOQA 4C1LA 3LDVA 4FX8A 3P8JA 1PCWA 1XI3A 3UD6A 1XUZA 3PUEA 1YDVA 1YTEA 4UFHA 3STFA 2GOUA 3G3MA 1TSIA 4I4LA 4O0KA 1H5YA 4MJMA 5DBUA 1W54A 2J9XA 1BTMA 2C99A 4XKYA 5K3VA 2XFWA 4O15A 2VFFA 4LCBA 4XZ9A 3SYLA 2QPAA 3NQCA 3PM6A 2ALDA 4IMGA 4WJEA 1FCVA 2NX3A 2X1TA 4O19A 1P0KA 3LI1A 1KM3A 1P5BA 3LERA 1DO2A 1A53A 3QZEA 3EWWA 1KFKA 1J7KA 1YTDA 4HN4A 4NX5A 5FI8A 3TXZA 5CZTA 2X1SA 3G1XA 3Q37A 4O16A 3W2UA 1W37A 4RZ5A 1JCJA 3NQ7A 1OX4A 1G67A 1G4SA 3NDOA 4FWHA 5HQEA 1G7VA 3A9IA 1KV8A 1G41A 1TYGA 1DO0A 3W7IA 2DZTA 2GQAA 3KVKA 3LXBA 3M0ZA 1ZFJA 1H7RA 3W70A 1HT2E 4RLIA 2CLMA 4IWWA 4WX2A 3NZRA 1H61A 3C2RA 3MP3A 1SW7A 2YR1A 3F4NA 1ZENA 3W7QA 1DKWA 4JN6A 3TKFA 2Y6ZA 2ZTKA 3TC6A 2V5LA 1RVGA 3HBLA 1MZHA 3GKFA 5F2IA 3NQDA 4JX5A 3I7QA 3Q58A 2FB2A 1OFIA 4RV8A 3KOFA 1A5CA 3C0JA 3MHFA 4JEQA 3M43A 3M1ZA 1D9EA 2RFGA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4PZV A;  1E0V A;  4JKL A;  4GVH A;  3L12 A;  1W9U A;  3XIS A;  4U33 A;  3AMG A;  2YL8 A;  4FAL A;  5J5R A;  1DOR A;  3K13 A;  3B9E A;  3FK4 A;  3MCO A;  3LB0 A;  3PB0 A;  4L4P A;  5GPR A;  1OM0 A;  4R7W A;  3KDN A;  3K1D A;  1V3H A;  5A3H A;  5BOO A;  4HU3 A;  3UJN A;  1LRO A;  1XL9 A;  4ERG A;  3L66 A;  1VYR A;  1JXK A;  3CU2 A;  1C91 A;  1AL8 A;  2E4T A;  4LT9 A;  3V1H A;  2CZ5 A;  1TPB 1;  1REQ B;  3PUO A;  2YFO A;  2NQ8 C;  5D9O A;  2ZCG A;  1U1J A;  1Z5B A;  3B8D A;  3LOT A;  3NWR A;  2Y5E A;  3E96 A;  3C3N A;  1SJC A;  2FZM A;  1W5M A;  3FJL A;  3O3R A;  4IPI A;  3S2L A;  1H3G A;  1V77 A;  3PJW A;  2Z3X A;  4AI6 A;  3VK8 A;  2EKF A;  1KM0 A;  5F2M A;  3RU6 A;  1PYF A;  4GIT A;  1X8F A;  1R7R A;  1Q4W A;  2XU2 A;  3DIP A;  2WHK A;  2BX7 A;  4JCL A;  3QC3 A;  1ZSX A;  2C0A A;  1W2P A;  3LGE A;  3LMM A;  1FP9 A;  3K30 A;  1R47 A;  5C71 A;  3N4A A;  4RPP A;  2HS8 A;  3IWP A;  1JR3 D;  3I68 A;  2O56 A;  1XLJ A;  4ATD A;  1TV7 A;  3CS2 A;  3A4J A;  2J7H A;  3V75 A;  1AW1 A;  4QE5 A;  1D7K A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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