4LRSA

Crystal and solution structures of the bifunctional enzyme (aldolase/aldehyde dehydrogenase) from thermomonospora curvata, reveal a cofactor-binding domain motion during nad+ and coa accommodation whithin the shared cofactor-binding site
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
337
structure length
337
Chain Sequence
APRVRITDSTLRDGSHAMAHQFTEEQVRATVHALDAAGVEVIEVSHGDGLGGSSFNYGFSAVDEIDLVAAAVDEAVNAKIAVLLLPGVGTVRDLKRAHDAGASVARIATHCTEADVSCQHFAAARELGMETVGFLMLAHRIGPEELARQARIMVDAGAQCVYVVDSAGALVLSDVQARVQALVREIGHEAQVGFHGHQNLSLGVANSVLAYQNGARQIDGALCALGAGAGNSPTEILAATFERLNIETGVNVQAALAAAEEVVRPYLPRLPWADRAAIVQGYAGVYSSFLLHAERAAERYGVPAHEILQRVGEAGYVGGQEDMIIDIAVQLAEERHG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal and solution structures of the bifunctional enzyme (Aldolase/Aldehyde dehydrogenase) from Thermomonospora curvata, reveal a cofactor-binding domain motion during NAD+ and CoA accommodation whithin the shared cofactor-binding site
rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Thermomonospora curvata
molecule keywords 4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase
total genus 138
structure length 337
sequence length 337
ec nomenclature ec 4.1.3.39: 4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase.
pdb deposition date 2013-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00682 HMGL-like HMGL-like
A PF07836 DmpG_comm DmpG-like communication domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.8.60 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Helicase, Ruva Protein; domain 3 Helicase, Ruva Protein; domain 3 4lrsA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4lrsA01
4Y96A 1EP1A 2YYUA 4IMDA 3PAJA 1KYIA 1WDWA 4QOSA 2Q8ZA 3G1FA 3VNDA 2QUVA 5HWNA 1LOSA 3P60A 2X1UA 1E51A 3S5OA 2V2CA 3W7QA 1FXQA 5AYYA 1LROA 1WX0A 1HUVA 4Y8FA 3W22A 2AGKA 4FCVA 3DKLA 4PTNA 1FDZA 1TB3A 1XC4A 3C2EA 1KTBA 3HPZA 1DV7A 3QMRA 3DU0A 2DU2A 4BI7A 4LJ8A 1G4PA 3RLUA 1YPFA 1SU5A 4QNMA 4MIMA 3MO7A 4O19A 3PUOA 4OHQA 5G1YA 3TH6A 3PB0A 2QCMA 4K36A 3G0XA 3GKAA 2ZAMA 2E77A 1XBXA 4MY1A 3FJLA 4MY8A 1SUXA 2Z4RA 2JKPA 4LGMA 3HB9A 2WSRA 3PUDA 3HGOA 1K02A 1VJIA 1HO4A 4LCBA 5DBTA 2VELA 1GVFA 1VR6A 5FTKA 3TR2A 4WX2A 3EWUA 1TPVA 4R53A 1R30A 4EOUA 1SR9A 1D3HA 3FLUA 2EKCA 1JULA 5T26A 5AHFA 1LLZA 4E0CA 4WQ6A 2NX1A 2P10A 5D2TA 2QCGA 3SYLA 1G4EA 4M6QA 5HNRA 5MHBA 2A21A 1GG0A 4NJHA 1IM2A 3WK3A 1KM4A 5BW6A 3AJXA 1TYGA 1HQYE 3M7WA 3PBUA 2XN1A 5C54A 4P2VA 1SZEA 1KW1A 2QCEA 3O8AA 4HT3A 4PFMA 4WXZA 1OFPA 3MP3A 3P5ZA 5CPOA 3SR7A 4HHPA 3VKJA 4YL2A 3MW7A 3EB2A 4M5PA 1PS9A 1VC4A 5EXTA 2DZVA 1K7FA 5DN1A 5LSMA 1MEWA 1G67A 3LRLA 5C2XA 3LDVA 2DWZB 3LHWA 1FCVA 2A85A 4FO4A 3S0CA 2QCLA 3M0ZA 2RDUA 2QZ4A 5G2WA 1F73A 1OYCA 1KV8A 1EUAA 3FYOA 3GR8A 5LHEA 4GJ1A 5AHIA 1KSFX 1GVRA 4FWDA 3PSWA 1QPRA 1K8ZA 2UV8G 1SO3A 1YXDA 2Y89A 1OJLA 1I45A 1ONRA 1B57A 3L0GA 1QPOA 1IXZA 1TTPA 3W7LA 5EXXA 3BGJA 2B4GA 4NVTA 4QHTA 3STCA 1XBZA 3P5YA 4ORMA 1MO0A 1R2SA 3NQEA 4JTHA 1SW0A 3NPVA 3DBPA 4ZQMA 3TROA 2WNQA 2Q8LA 3S1UA 1SFJA 2RDTA 3UK6A 1OJXA 5AOUA 2FIQA 3C52A 3C4UA 3GLFB 3N3MA 4O0KA 3R8FA 4FCTA 3HO8A 3C8FA 1G7UA 2ZAOA 1SXJB 3W75A 4Z1DA 3LRMA 3SY5A 1JR3D 4AMAA 1QO2A 2DORA 5DYGA 4O54A 1T99A 3C2RA 4UTTC 1FNNA 4HKPA 4BFAA 4GNJA 2Y61A 3PXGA 3CPRA 5DLCA 4MFEA 1BWLA 3M44A 2YDAA 3NL5A 3UD6A 4FWGA 3QYQA 1XDLA 2QUTA 3PM6A 2GQAA 3MP4A 4MLRA 3LX9A 2VFGA 3W76A 3LBCA 5K9CA 5AC8A 2PCQA 5FF2A 3QF0A 1TPFA 2NV1A 1W5TA 5CGQA 1LLWA 2CLFA 1SZNA 2V8ZA 3TX9A 2EF9A 4AF0B 5D2YA 2O7QA 3I6RA 6ALDA 1B3OA 2PC4A 2Q3RA 3FS2A 5C6MA 3N9RA 3VI2A 3SYKA 1R6BX 1DORA 2CWNA 4H4IA 1GVQA 1QO5A 3UNDA 1NSJA 2X1SA 4Z0SA 5EA9A 2F84A 1H1ZA 1O60A 2DZUA 1OYAA 5AHNA 5D2WA 3S9YA 2H3DA 1X6UA 1F74A 4PL1A 1NY5A 4FCWA 4IWWA 5TQLA 2FPTA 3W2UA 2OX1A 2VXNA 1H7PA 2CW6A 2WOQA 2TYSA 2B7OA 3NPUA 4K39A 3EWBX 3GLCA 5FI8A 3PFIA 4FNUA 1QR7A 2VENA 3NM1A 3NVTA 3R2GA 1RR2A 3CF2A 3S5YA 4IJBA 1RZMA 4KKXA 1EX5A 1KFJA 1NVMA 1SZGA 4Y90A 3AJIB 1OG0A 4KODA 3G1XA 3W2NA 1MXSA 2ZZ1A 3QQ0A 1W54A 3F03K 4PCFA 1SO5A 1FX6A 2BLEA 3L21A 3W1AA 2RFGA 3F4NA 5F1VA 1ZNNA 3SSJA 4O1BA 1LRTA 3E0IA 1W5MA 2Y70A 2CLHA 3NPXA 3T40A 1XXHB 3DI1A 4IX0A 3ZR4A 3OVQA 4ZQPA 1WA3A 5L6UA 1O5XA 1ZAHA 2DZWA 2E6AA 1TV8A 1IY1A 4LOCA 4R7JA 1B9BA 4JTJA 5KMYA 3A9IA 3C3NA 4DEFA 4O18A 4O1CA 3P84A 4IOTA 3DZDA 2C6QA 2FLIA 3BG9A 3GYEA 4E38A 4R34A 4IGHA 1SO4A 1ADOA 3CEUA 1OFIA 2ZRUA 4ICNA 3E02A 4PC8A 5FEWA 1JCYA 2GJNA 3GAYA 3B4UA 2G95A 4S2CA 3R13A 3GXNA 2GJLA 2C9CA 3L68A 5K9DA 1W5NA 2TSYA 1EPXA 3O6YX 5A8GA 2VEIA 3PB2A 2E6YA 5DY2A 2V5LA 4RLIA 1XCFA 3CWNA 3G8RA 5D2VA 3DFOA 5BNKA 3TSBA 3N19B 3LHUA 4RZ6A 3UWWA 4DQWA 3DHDA 4YMZA 1LZOA 1ZAIA 2ZRZA 3DI0A 1I2PA 3W6YA 4CLMA 3QSTA 2Y7GA 1NEYA 4JICA 4A3UA 4O17A 1R2TA 1OK4A 1ZJIA 3NQ7A 4MUZA 1ME7A 3W7RA 2CZFA 3CTLA 1KLYA 5HUPA 3TFCA 3G1DA 1RQHA 1G3IA 3LBMA 4HPXA 3GLFA 2PRMA 4KLNA 1HG3A 2WV8A 1L9WA 2HCBA 4LJ9A 3U60B 1WXJA 1DL3A 3LRKA 1SXJA 2B0MA 4WZHA 3N9SA 2A6NA 4OU1A 5KZEA 3P74A 3STFA 1LBMA 4A22A 3PG8A 2R91A 3GKFA 2WJZA 1ML1A 2DZSA 1KTCA 2EHHA 5LHFA 4RXFA 1Z41A 4L4UA 4IX2A 2CU0A 1TO3A 3L66A 3FKRA 3GDKA 3MP5A 3LCLA 1R7RA 3OA3A 3QFEA 4GFSA 1TQJA 4JYFA 4NJGA 4ZMGA 5D30A 1H61A 1ZCOA 4P61A 3HMJG 2AAMA 3NM3A 4D82A 1R46A 3UY8A 4YXGA 4AF0A 1WOAA 4CQAA 5K9XA 4X2RA 2Y7DA 2B7QA 3IGXA 1UBSA 1UM8A 1DBTA 1A50A 3FYPA 4UTWA 3NYZA 4RR4A 3BPWA 1TPEA 3NPWA 2VEMA 1BKSA 4K7YA 5HWJA 1F76A 1Q3NA 5LGXA 3CLMA 4WY0F 3M1ZA 1EWDA 4Y6GA 5LKYA 2YGYA 3B04A 3CB8A 3I65A 2I9EA 2FQIA 3W3OA 4FEZA 5F4WA 1L8QA 1UB3A 2V2DA 3P8JA 2QCDA 3KFTA 3MMTA 2ZDRA 3WJYA 2VOMA 4A2RA 1QWGA 3DFNA 3SFKA 5HULA 1WBJA 2E6DA 4OGZA 3VCRA 2A6LA 4KWWA 1C1KA 3O6DA 3B8DA 1XUUA 4GXMA 3OIXA 4HIBA 4AWTA 4BR1A 3HG5A 5AHEA 2OT0A 3DXIA 4Z0JA 3N14A 3TNOA 3UYCA 3R12A 2WQPA 1IXQA 4JN6A 2C16A 1FDYA 3GXPA 1HT1E 2E6FA 3HGRA 3MI3A 3W07A 4GUHA 1JUKA 5DCEA 3UWYA 2CLEA 3I68A 2PURA 1IN4A 1VH7A 4CNOA 2VKZG 1XXHA 3S42A 1L6YA 5D2XA 4MJZA 3PC0A 5G1TA 2OJPA 1TPUA 1DJNA 1A5AA 1W0MA 1EIXA 1RD5A 3G1YA 3GDMA 1T0OA 3KAOA 3O1NA 4LV4A 5DXXA 2NUWA 1KFKA 1TV7A 5BMXA 3QW4B 4UTJA 1P5BA 1V7YA 3LB0A 3M43A 2GPTA 3STEA 3VFLA 1QOPA 3DENA 3W7NA 2ALDA 3U2OA 4EIVA 3Q94A 1HO1A 3D0CA 1SSGA 3P67A 4H6KA 2CHGA 3TV8A 1MEIA 2H90A 4AHPA 3STGA 2ABBA 2Y7EA 3H53A 3SECA 4EIWA 3DH7A 1EUNA 1OFRA 4GWEA 3RLVA 1O94A 2JK2A 2CFFA 2P1FA 4O50A 5KSWA 1NFBA 4JEQA 3ELFA 2ZTJA 4D80A 1DVJA 4TR9A 1GWJA 1QDSA 2RKOA 1Z44A 1LM1A 2I1OA 1I8JA 5HINA 6TIMA 4A2SA 2ZA3A 3QSRA 3W1TA 4I7WA 4M6VA 1PL9A 1GOXA 1SXJE 4FNQA 4MYXA 2V9DA 1QOQA 3M0EA 4WJEA 3NAVA 3M9YA 4LVFA 4LC6A 1A53A 4NQ1A 3BG3A 4I4LA 5TBOA 4FIQA 1UASA 2JGQA 2OMAA 3TW7A 3PVFA 3PG9A 4RZ5A 1IN8A 5CPNA 4WW0A 4ZVJA 3BW3A 3NA8A 1O95A 5FF3A 5SWUA 4N9DA 4DF0A 3D8BA 3DAQA 3LM7A 4N2YA 3LXAA 4XQ6A 5D32A 2W6RA 1H60A 4UIOA 3MBDA 1OF8A 4QJ1A 4UUIA 1YLVA 4YLWA 2A2IA 1KTNA 2NWRA 2E5DA 3JS3A 2R8WA 3TMQA 1K7XA 3W1PA 1AW5A 4UNLA 4XBSA 4LRTA 2YW4A 1YTEA 3WK0A 2X1RA 2FNAA 4LNYA 4JS3A 1R47A 4FNTA 4W9TA 1UUOA 3UZ5A 1ZENA 3MHFA 2CLKA 4MZ8A 1W3NA 3TK7A 5I3GA 1ZALA 1J5TA 1A5SA 3GX9A 3KRZA 5HWMA 5I3JA 4TU1A 4RX0A 3FIGA 3L0NA 3P82A 2YR1A 2ZRWA 4PL2A 2ZANA 1IN5A 4ADUA 2DJXA 2RDWA 3THQA 3IIOA 3QZEA 4JTLA 5J5RA 1XBVA 3QEZA 3EWWA 2JGYA 1KV5A 1KA9F 3I7QA 3W7PA 1IY0A 3NEVA 3W84A 5C5YA 4UMBA 4HNVA 4JR5A 4JTTA 3TXZA 1E94E 3ABSA 4Z1BA 3B06A 4JD4A 1IXNA 4K7VA 4BF9A 1TQXA 2O7SA 5F2IA 4UMCA 1KM1A 1HTIA 1NF0A 4G1KA 3DFSA 1C29A 1M7OA 2E1DA 1AMKA 2ZZ2A 3O63A 4TMCA 1TTIA 3NR0A 3KXQA 3M16A 3Q37A 5CKSA 3JRKA 2CLMA 1GT8A 3NQ8A 1JCLA 2VIIA 5LNRA 3B9PA 4DO6A 1W3IA 3T55A 3YPIA 2VFIA 1E32A 2QP9X 2XN2A 3NO5A 2KRKA 4AB4A 3IRDA 3U6WA 3M5VA 3G8EA 1OVDA 3MJYA 3TE9A 3MI6A 5F2GA 4MKNA 1JRBA 1X1ZA 1CX9A 2Q3OA 4MJMA 3RK8A 1K8XA 4HNTA 3S1VA 4DPPA 1LCOA 4JXCA 2HTMA 3CF0A 3HPSA 1I2RA 3LGEA 3PF3A 5KINA 1TPDA 1LP6A 3HU2A 1U83A 1IN6A 3EX4A 2PE4A 1GTEA 2IQTA 4JX5A 4WD0A 3SZ8A 3OVRA 4AHOA 4NNCA 3O15A 1P4CA 1ICSA 3C2OA 4BI6A 1FCBA 2R65A 3NZ1A 3EXRA 2V6ZM 2ZZ7A 1FWNA 3CHVA 3W85A 2CEAA 3I7RA 3P8IA 4QIUA 3GLGB 1JUBA 3IEBA 2Z1BA 3MWAA 1W8SA 4IQLA 4DELA 4ZPXA 5EXPA 3IVTA 2BXVA 2QAPA 3W1QA 5HR6A 3M47A 4JTSA 4FXRA 2WNNA 3S5NA 4UTHA 1G41A 1K7EA 3BLEA 2VFDA 3CEPA 3W1XA 3W70A 5F4XA 4Z1AA 1LRQA 4MPQA 5KZDA 3RFAA 3ANYA 3G1AA 3UWVA 2CZDA 1EA0A 4A21A 3L5LA 2CLOA 3KRSA 5FF0A 2QCCA 4M7TA 5C18A 3UZJA 2ZFAA 3HPXA 3E12A 1SXJD 2Y62A 5HMSA 2ZRYA 4AAJA 4MVAA 5D33A 3EIEA 2RH9A 3WJXA 3N73A 2CE7A 2FB3A 3EIHA 2X8AA 1K3UA 1NY6A 3W1UA 3NQMA 1FCQA 3MHVC 2AQWA 2QJIA 1EWEA 1TTQA 5IBXA 1N55A 3W1NA 3N2MA 1G4TA 2QJHA 5BOOA 5D02A 4MFDA 3GR7A 3W7MA 2HS8A 1IQPA 1SW3A 2A0NA 4HNNA 3W7HA 2V82A 4LJ7A 2FPYA 1MZHA 2QJGA 4NNAA 4LY8A 5CZSA 1I2NA 3G24A 4PH6A 5LNVA 3SI9A 4JY8A 1N7KA 5KITA 1KM3A 2TMDA 5FESA 1ME9A 5I3FA 1A5CA 4FHAA 1Z48A 2NX3A 5CZ0A 1DQWA 5CG7A 3TC6A 4O57A 3HU3A 3G0UA 5DELA 3W7JA 3TMLA 4O11A 4J9JA 4ZQNA 1QPNA 3A22A 4UR7A 4CCCA 1F5ZA 3TFXA 2QCNA 3PY2A 5EP1A 4MOZA 3EWXA 1YYAA 4RJEA 5AFDA 3PULA 1W37A 2VEKA 2CHVA 4O0ZA 4FB7A 5D05A 3G1HA 1H63A 1VZWA 3E96A 4NUWA 3LHZA 4OT7A 2OCZA 4KWVA 1IXPA 2B7NA 1JCMP 1W5PA 3ZWTA 5FEPA 1W5OA 4NJIA 4NXKA 1W1ZA 2FTPA 3R89A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3TWA A;  1VP5 A;  3ARR A;  3PBV A;  1GOO A;  5ABH A;  4ZEN A;  3CUH A;  4LAM A;  1VJS A;  1AK5 A;  3HM7 A;  4MAV A;  5I78 A;  1UWT A;  2POZ A;  3OPS A;  1XIG A;  1Q6G A;  4Z2L A;  2BAS A;  2IKI A;  1VCG A;  4FP1 A;  4GRI A;  1DJQ A;  4IIE A;  4F4R A;  4H8U A;  2VQE M;  4ANR A;  3EKZ A;  3SQS A;  2G37 A;  4GUJ A;  4GIE A;  3R9X B;  1BTC A;  3TYA A;  3NJ3 A;  1WKY A;  4MWA B;  4X60 A;  4RDW A;  3N6Q A;  3N34 A;  3KBW A;  2WHJ A;  5A8M A;  1EA9 C;  4JTE A;  1IGS A;  1VIZ A;  3NZR A;  4K6A A;  3PR2 A;  2LBC A;  2OGY A;  4RKA A;  2JP7 A;  3WJW A;  4ACZ B;  3AIR A;  4IXH A;  2CZE A;  2ONE A;  2ZE3 A;  2AKZ A;  1JPH A;  1XPY A;  2QPX A;  4G8T A;  3OBK A;  4LUI A;  3E9A A;  1T96 A;  4ZFM A;  3M0X A;  1RLD A;  4RW3 A;  4AC7 C;  4JAW A;  2VCC A;  3HHZ A;  3O06 A;  4AMC A;  3BOF A;  4B91 A;  5CBI A;  1M7P A;  1ZBV A;  4AX6 A;  1AUA A;  1G6C A;  3TSD A;  4NJJ A;  3GHU A;  3LPP A;  1HNY A;  4F2U A;  1FTX A;  3VKH A;  3W2L A;  5DX7 A;  2IKG A;  4MH0 E;  4QNE A;  3HGJ A;  1N77 A;  1DJY A;  1N33 M;  3CS2 A;  2RGH A;  2XSX A;  5FJJ A;  1R3R A;  4YVX A;  4OOU A;  4HNC A;  3LNP A;  1IN7 A;  3GDR A;  4LF9 M;  2PAJ A;  4RPQ A;  4UC5 A;  9RUB A;  2DZT A;  4RNI A;  4GZE A;  1O7A A;  2WJE A;  3TC3 A;  3UWQ A;  4M81 A;  5DMN A;  4PCT A;  3N25 A;  1W6T A;  5L9F A;  1EJX C;  2FMN A;  2QDG A;  3WHK A;  4F1I A;  2Z3X A;  4DJF A;  4NRS A;  5KPZ A;  4UQD A;  1BSL A;  2KZS A;  3TIM A;  2LVA A;  4J28 A;  1VHN A;  5D9P A;  2ASH A;  3EOS A;  1TWI A;  3GLI E;  1ZBW A;  4DR1 M;  3V18 A;  3BCF A;  2PRL A;  1RQE A;  2XFW A;  1OSE A;  4JYE A;  3AZT A;  1GG1 A;  2J7N A;  4GC3 A;  4ORI A;  2J9X A;  1FH8 A;  1OFO A;  2WBG A;  4L4M A;  4YPJ A;  4UOQ A;  3NUK A;  3I6T A;  1OC7 A;  3ECQ A;  4R9O A;  4YNG A;  3SCP A;  2YCL A;  5DXY A;  3KDN A;  1FY6 A;  5FJO A;  3S4T A;  3W67 A;  2C13 A;  1MYR A;  2HVM A;  3FRH A;  1XHG A;  3VDG A;  3SCV A;  1XUZ A;  3CMG A;  3ANV A;  1V6Y A;  1S3H A;  3KL3 A;  4TO8 A;  3H55 A;  3COT A;  1K4G A;  4MSS A;  2NXI A;  2O56 A;  1UH2 A;  3K8Z A;  3IUI A;  1OX6 A;  3SGG A;  1FFQ A;  2KNZ A;  3H7R A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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