2VVSA

Btgh84 structure in complex with pugnac
Total Genus 236
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
236
sequence length
588
structure length
580
Chain Sequence
LQPPPQQLIVQNKTIDLPAVYQLNGGEEANPHAVKVLKELLGMLISIGEKGDKSVRKYSRQIPDHKEGYYLSVNEKEIVLAGNDERGTYYALQTFAQLLKDGKLPEVEIKDYPSVRYRGVVEGFYGTPWSHQARLSQLKFYGKNKMNTYIYGPKDDPYHSAPNWRLPYPDKEAAQLQELVAVANENEVDFVWAIHPGQDIKWNKEDRDLLLAKFEKMYQLGVRSFAVFFDDISGEGTNPQKQAELLNYIDEKFAQVKPDINQLVMCPTEYNKSWSNPNGNYLTTLGDKLNPSIQIMWTGDRVISDITRDGISWINERIKRPAYIWWNFPVSDYVRDHLLLGPVYGNDTTIAKEMSGFVTNPMEHAESSKIAIYSVASYAWNPAKYDTWQTWKDAIRTILPSAAEELECFAMHNSDLGPNGHGYRREESMDIQPAAERFLKAFKEGKNYDKADFETLQYTFERMKESADILLMNTENKPLIVEITPWVHQFKLTAEMGEEVLKMVEGRNESYFLRKYNHVKALQQQMFYIDQTSNQNPYQPGVKTATRVIKPLIDRTFATVVKFFNQKFNAHLDATTDYMP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Elevation of Global O-Glcnac Levels in 3T3-L1 Adipocytes by Selective Inhibition of O-Glcnacase Does not Induce Insulin Resistance
pubmed doi rcsb
molecule keywords O-GLCNACASE BT_4395
molecule tags Hydrolase
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
total genus 236
structure length 580
sequence length 588
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2008-06-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
A PF18344 CBM32 Carbohydrate binding module family 32
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 2vvsA03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2vvsA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 2vvsA01
2BY0A 2VX5A 5FL0A 4TX8A 2CESA 2CKSA 3OZPA 1GNXA 4AXNA 2ZX9A 4PTMA 2ZOXA 2DIEA 3WD4A 4W8BA 4IISA 4CVWA 4PMNA 4H2CA 4TVCA 1E1EA 1CIUA 4MB4A 3KWXA 4AZCB 2G3MA 1TFVA 4AZ6A 1C90A 2VRJA 3ZJ8A 2UY4A 2E9BA 3BLPX 3HMCA 3AJ7A 2BFGA 1CLXA 4ZFMA 3WNMA 3NIYA 2DPEA 4AZGA 2DH2A 1PAMA 2NT1A 2FHCA 3VGEA 3MSDA 3WY1A 5HPCA 1J9YA 1QBBA 3BSGA 4A3HA 4W5UA 2PWFA 2WNWA 4ACZB 5M3WA 5C8BB 4CD5A 3ZOAA 2WVTA 1D3CA 1UR2A 1VRXA 1GUVA 1KXTA 1I1WA 2FHBA 3U5UA 1WKYA 2Y8KA 1PJ9A 2O9PA 5I23A 1UD8A 1WDSA 4D6CA 5TD4A 4UFMA 2WZIA 1J0JA 2OYMA 1V3KA 1NWUA 2J62A 4ML4A 2EBNA 1IV8A 3PTKA 1UKPA 2WWDA 3L2MA 4Q22A 1H41A 2GK1B 4QLLA 2QHAA 4KWUA 4BF7A 2D2OA 5D9OA 1CXKA 2YA2A 1BYAA 3AZSA 1U2YA 3I3DA 2G3NA 4ATWA 1AQ0A 2JEQA 5A8NA 3VDBA 3L4VA 2UY3A 4F79A 3WL1A 1E0VA 1EGZA 1CDGA 3CH9A 4F9DA 1ZU8A 4PMZA 3WD3A 2PC8A 5FIPA 1WPCA 3L4TA 1VFOA 4AD4A 2CBVA 1J0KA 5E09A 1FH7A 4P8WA 3THCA 3WIJA 5ABFA 3M07A 1WB0A 4DUWA 1MW3A 3AROA 1KCLA 1QOXA 1GOMA 2PWDA 3VGGA 3L4ZA 3PZOA 1QI4A 1WDRA 5JIPA 1ESWA 4QP0A 4WKAA 2J74A 2WSKA 1AMYA 3SCSA 1US3A 3PZTA 3VDAA 2E4TA 3N18A 3PZIA 4D6HA 3AHTA 2VT0A 3GXFA 3WD0A 2WLZA 1JAKA 2ESCA 2ZUMA 2V5CA 1CXFA 1E40A 3SCQA 4LXFA 1S46A 2J7EA 1DWFM 1X1NA 2EPNA 2A3AA 1LWJA 4Z2HA 4MNMA 3LPFA 3FHQA 1C91A 3L4WA 5HNNA 1KR1A 2F2HA 1KFWA 1ITXA 2YBTA 1DHKA 4U33A 5M03A 1XCWA 2BVTA 4JKKA 4AEFA 4X9YA 1TVPA 1MW1A 3QR3A 1UQZA 2J78A 2YLLA 3L4XA 4HTYA 1H4PA 1ZJAA 1BYDA 3KL5A 4WIWA 3ZJKA 4NRSA 2J7GA 3POHA 1B1YA 4PEEA 4MADA 1J0YA 4WSJA 3SCWA 5LYRA 4CU8A 5CZKA 5A1AA 4TTUA 3W25A 3WMBA 4AD3A 2VNCA 1V3LA 2QMKA 2V3DA 4AISA 3SEPA 3UG5A 4D71A 3RCNA 4GZIA 2MANA 2ZWYA 2VI0A 3O9NA 1E3ZA 1HNYA 4NRRA 4D1JA 3WF2A 4PUEA 4W86A 3MUZ1 3FHAA 2XJ7A 1UYQA 3BLKA 2J79A 1CECA 1EHNA 3ARTA 1QW8A 2J77A 2CXGA 1OM0A 3BMVA 4HZ8A 5A6BA 2WXDM 5A2BA 3L4YA 4W87A 3TOPA 1E6QM 1V03A 1GHSA 1J0IA 1V08A 4J3UA 2D3LA 3UERA 4XV0A 4KRTA 3MMUA 2DSUA 1DWIM 4KRUA 3VILA 4M24A 3B9EA 4BQ5A 3ZR6A 1MQRA 1KR0A 5A3HA 1MYRA 4MDOA 1QHZA 1J0ZA 1HJXA 5F7UA 2CERA 4JL2A 1NWTA 4N0RA 2QV4A 2RGMA 4HU0A 4HMDA 2VZSA 4MJ2A 1GVIA 4CCDA 4CN1A 2OSXA 5I77A 2AOSA 3SCTA 4QDMA 3VDCA 3ZSSA 1C3FA 5FKYA 3T2QA 4JZ5A 1GW1A 1QPKA 3A4WA 3EDEA 4W8AA 4LYQA 1E5NA 1JZ6A 1UG6A 3NSXA 1D2KA 2XUCA 5I0DA 1UKTA 2GJXA 1E9LA 2VZVA 5M5DA 1OGSA 1G0CA 2CBIA 1VJSA 3EMQA 1TR1A 1JL8A 3AHVA 3WH9A 3TTYA 3RPMA 3UG3A 2ZWZA 3W38A 3T0DA 3G6LA 4H8HA 2WLYA 3BXWA 1SFSA 3MUIA 1W1TA 3GYCA 3EDKA 4LYPA 4DWSA 2XIIA 4F66A 3A4XA 2WWCA 2G41A 4B3KA 4TTGA 3W81A 3QHOA 1BG4A 2PI6A 5IHSA 4H41A 2WBKA 2JIWA 1DWJM 3N13A 2NSXA 2OWWA 2W67A 2DSZA 1BLIA 4B16A 4HU8A 3VIGA 2ZUTA 5DT5A 4GXPA 1GZJA 1AQHA 3AHYA 4PMYA 4M1RA 2XGIA 3MKKA 4TXEA 3T2OA 1WZLA 2X2YA 2J7DA 2OYLA 1ITCA 4UQ9A 4JCMA 1YHTA 2WCSA 5KEZA 5AYBA 3WQ8A 3CUJA 2DDXA 3GNOA 4AYSA 4CVUA 3RIKA 4PTWA 5E9AA 4U3CA 6A3HA 3ARPA 2GSJA 2X05A 1RPKA 4W89A 1MXDA 1H3GA 3PBGA 1E6SM 2JE8A 2CCRA 4XZWA 4JFTA 1UWIA 2WW5A 3ZJ6A 1UUQA 2XVLA 1WZMA 2Y5EA 3W28A 5LA1A 3W24A 4AZCA 1WCGA 3EMCA 1JYNA 1Y7VA 5BCAA 1CGWA 5I79A 3VM5A 1B3XA 1ZS2A 3CBWA 3IAPA 3VIKA 1B31A 3K8KA 1SR0A 3W27A 2O9TA 4QLKA 3F4VA 2XVPA 3VIIA 4AD5A 1CBGA 4BQ3A 4AZIA 1CGVA 3N9KA 2E8YA 4HA3A 4OJYA 4ACZA 3S2CA 2G3JA 3AOFA 3CO4A 4CN6A 3UG4A 4HA4A 4P8UA 5DT7A 5A6KA 3LPOA 5JBEA 4MDPA 2W61A 1DWHM 5FOOA 4UZUA 5BXRA 3FY1A 2WMKA 1BF2A 1CWYA 1OT2A 1JDAA 2CEQA 2XFRA 2WCAA 1E72M 1FFQA 2QPUA 3VNYA 4U31A 1JD9A 3WDIA 3CUGA 3BAJA 3SCUA 4A4AA 2GK1A 5AY7A 1B3WA 2Y4SA 4J3VA 3PHAA 3BAYA 2Y24A 1Q6FA 4PBGA 1J11A 1G01A 1RH9A 1GQJA 3LPGA 1KGXA 2VVNA 5D8WA 1XYFA 4M56A 3N15A 3CLWA 4ZE5A 2ZUWA 1CGYA 3CHDA 1UR8A 1UR1A 3AIQA 4PUDA 4EE9A 2WHLA 4FF5A 4CKQA 1EHAA 2XFYA 2YOCA 4LYRA 2CPUA 4CCEA 3MV11 1W32A 2WC3A 2WSPA 3NJ3A 3RILA 2YDRA 3ARWA 3T09A 3VD3A 1CXHA 3F5JA 1HIZA 3E1F1 3I3BA 4UOQA 1VIWA 1E55A 2V3EA 2Z1SA 1BFNA 1GQLA 2X09A 2OSYA 3RMEA 3O6AA 1UQYA 5I24A 1E73M 5DO8A 4M81A 4P7QA 1KBBA 4D1IA 4GIAA 3SUUA 5EFFA 1KWKA 3GZAA 1NQ6A 2OWXA 3VDHA 1DP0A 2E9MA 1R87A 4Z2GA 5IFPA 1UH3A 1BYBA 1XHGA 2ZX6A 3VGFA 5JUVA 4EANA 3CUFA 1E3XA 3ZQ9A 1OIMA 3N12A 4J3TA 2VTFA 1R85A 7TAAA 3U7BA 2XPKA 1H2JA 5GPRA 3PZNA 4MAZA 4KH2A 4FLSA 3NYDA 2OYKA 4AY1A 4DM2A 5IHRA 1CZ1A 2ZUUA 3VOCA 2PBOA 3WF4A 3OLEA 4C90A 4RL3A 1ISWA 4JHZA 4W8LA 1GJUA 4CD6A 3UEQA 1XRVA 2Y2WA 5A6MA 1BVNP 2WK2A 4GO9A 3WMCA 4U2ZA 1VF8A 3ARYA 1VBUA 2CBUA 1UWTA 2WKLA 1HL9A 3TA9A 1WP6A 4FK9A 2QLYA 2XVKA 1F4HA 4UQBA 3GBDA 3DHPA 5HPOA 3RM8A 2X0YA 4X0VA 2ZUNA 4C7GA 2DSKA 2WB5A 1IZJA 1PEZA 2XSAA 5FD0A 1WDQA 2D22A 6TAAA 1XD1A 3IJ7A 3KL3A 1MQPA 4GO8A 5CXPA 1EQPA 3VM7A 1G5AA 3ARUA 3WF3A 1E6PA 1D7FA 3DHUA 2WCGA 2WVVA 5HBFA 5A6AA 2VRQA 5A8MA 4PYSA 1LWHA 2XYLA 3OG2A 3WH6A 5A8OA 6CGTA 2D0GA 4H8VA 1HKJA 1HP5A 2YL8A 5LA0A 1TZ7A 2XVGA 3F5KA 2XVNA 1GOOA 1VAHA 3WFLA 1UZ1A 1WNOA 2HVMA 4MB3A 2D1ZA 3CZGA 2GVYA 4W93A 3S6TA 1W2PA 3VIMA 1GOKA 2YL6A 4CUCA 1KCKA 4PN2A 4Q7NA 3A47A 3AMGA 2XGBA 1MW0A 2VMFA 3MANA 2VVSA 1QBAA 2WBGA 1MQQA 5E70A 1Q6CA 1Q6EA 2ZUSA 4TX6A 5E0CA 4L4PA 3OB8A 4Z2LA 3CZKA 1XV8A 2QF8A 1F4AA 4GI6A 4HMEA 1ZBCA 2ZICA 4K68A 2X1IA 2D23A 3OA5A 4ZENA 3IK2A 5E0FA 4Y7EA 1CGXA 2EJ1A 1B3VA 2HISA 4GPNA 3ECQA 1OB0A 3UR8A 4HZ7A 2J7CA 2VJXA 1E6NA 1TUXA 1GQKA 2PWHA 3AIVA 2DT1A 1LL4A 2W4XA 1OGGA 5BXSA 2A3HA 1QI3A 4UOZA 1ZJBA 4Z2KA 3WKZA 1BPLB 5GQBA 4HMCA 1EDQA 4KMQA 4P8XA 1QNRA 1GOQA 3MU7A 2WHKA 1UA7A 1UKOA 2EO7A 3MSGA 4H04A 4C7DA 1KQYA 4PSRA 4URIA 4MB1A 1E4LA 2ZX7A 2ZE0A 1M01A 5A6LA 2XSBA 3GTNA 4R27A 1A47A 4PMRA 1CXEA 2WMFA 2XHYA 3K8MA 1EOKA 3NSNA 4CD8A 1QNQA 2BV9A 1GORA 1HJVA 4UQEA 2FH6A 4PRWA 1GOIA 3POCA 1AVAA 2WMIA 3A4AA 3WDHA 4QCFA 1VB9A 1LL7A 1W3JA 1UD6A 4P7RA 3TP4A 3MO4A 1L8NA 2J7FA 4WJXA 1UKQA 3ZSTA 1FH8A 4OIFA 1JZ4A 4TUFA 1VJZA 4WK9A 1E56A 1XYZA 1C8QA 2XM2A 4ATLA 3OGRA 2VCBA 4J28A 1VFUA 4HPGA 5DEZA 3N11A 3NSMA 4OOUA 2E9LA 3FXYA 5JBFA 1W3LA 5CPSA 2BXZA 3KEHA 4GZJA 2DT2A 2V3FA 3VD4A 4UR9A 1HJSA 1C7TA 3VIPA 2VX4A 5CLTA 3K8LA 7CGTA 3QHNA 1FP8A 4CGTA 3SCVA 3WD2A 1JI1A 2V5DA 1SYTA 3SIMA 3ZMRA 1XH1A 1TG7A 1TA3B 4MB5A 2CITA 1HVXA 3AMLA 4GI8A 4W7WA 2X8RA 4C7FA 2XWEA 3PTMA 1BTCA 1ISXA 5HDRA 3GNRA 1NP2A 4D6EA 1IT0A 2O9OA 4LGXA 1PIGA 1O7AA 1GCYA 3N1AA 1XSKA 3W82A 3U5YA 2EQDA 3T0BA 3D5HA 3PTQA 1E4NA 1UD4A 1B30A 1FH9A 3AS0A 1JI2A 2BY1A 2D24A 4JCLA 2DGAA 3RDKA 2BY3A 1C92A 1HJQA 1R86A 1DWAM 3CPUA 2VX7A 3IANA 2ZXBA 2DIJA 1M03A 3VIOA 1UD5A 5ABFB 1V6YA 1XH2A 3M6DA 4XB3A 1OBAA 3SUSA 1W9BM 2VURA 2BVDA 4NSBA 1E1FA 1HX0A 2QPSA 1RP8A 3UCQA 2VUYA 4QFUA 4R5EA 1HT6A 2PWGA 4J3WA 2BY2A 2V3GA 3WDRA 3WUGA 2TAAA 5AYIA 3WUFA 2YIHA 3ZIZA 4AEEA 1CEOA 3BAWA 3WSUA 2JIEA 2PWEA 3QOMA 4PTXA 2EXOA 4AW7A 2EPLX 4P7OA 3F5LA 4F9JA 1JFHA 3AYSA 3CGTA 2F61A 3L4UA 3UESA 5A8PA 2BVYA 3AZTA 2AAAA 1UWQA 3RO8A 1HL8A 1CENA 1OGBA 3VINA 3W0KA 3DYMA 3NUKA 2Y8VA 1N82A 1E70M 4HP5A 2W91A 4FLQA 2VL4A 1WAWA 1WDPA 3AS2A 4UZSA 1QNOA 2D20A 1ODZA 3WBAA 1HF6A 1QW9A 1JZ8A 1H1NA 4U5IA 4J3SA 2E8ZA 1K9EA 4BA0A 5IFTA 1PZ3A 4AZHA 5KZ6A 2O92A 3AQUA 2XWDA 4MNJA 3TTOA 2Q8XA 3SCOA 5GNZA 3WQWA 2O9RA 2VCAA 1H0GA 1KB3A 3BCFA 4DUXA 1X6NA 1R7AA 3ARRA 2XFFA 2OSWA 1XSIA 4E4PA 2J25A 5CSYA 1GVYA 4UTFA 3AXIA 4AD1A 1E0XA 1EO5A 4P7NA 2AMGA 1Q6GA 3AMCA 3IAQA 5A6BD 5EFDA 5I78A 3ZT6A 4PMVA 4BCEA 4IUGA 1XC6A 3T2PA 2DSWA 1U30A 1JFXA 1FP9A 4UQDA 1CXLA 4B9YA 3WH8A 1UA3A 1PX8A 1ZBVA 1W9UA 1SMDA 4UFIA 3W4RA 3JUGA 2XG9A 1OD8A 1W1YA 3WEZA 3BH4A 4DUVA 1NH6A 1Q6DA 3I3EA 1E0WA 3VUPA 4MJ4A 1JXKA 4ZXLA 1Q4NX 4AIEA 2NW0A 1EH9A 1YQ2A 3CZ8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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