2W61A

Saccharomyces cerevisiae gas2p apostructure (e176q mutant)
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
480
structure length
470
Chain Sequence
GVSFEKTPAIKIVGNKFFDSESGEQFFIKGIAYQLQRSANGAFETSYIDALADPKICLRDIPFLKMLGVNTLRVYAIDPTKSHDICMEALSAEGMYVLLDLSEPDISINRENPSWDVHIFERYKSVIDAMSSFPNLLGYFAGNQVTNDHTNTFASPFVKAAIRDAKEYISHSNHRKIPVGYSTNDDAMTRDNLARYFVCGDVKADFYGINMYEWCGYSTYGTSGYRERTKEFEGYPIPVFFSEFGCNLVRPRPFTEVSALYGNKMSSVWSGGLAYMYFEEENEYGVVKINDNDGVDILPDFKNLKKEFAKADPKGITEEEYLTAKEPSVECPHIAVGVWEANEKLPETPDRSKCACLDEILPCEIVPFGAESGKYEEYFSYLCSKVDCSDILANGKTGEYGEFSDCSVEQKLSLQLSKLYCKIGANDRHCPLNDKNVYFNLESLQPLTSESICKNVFDSIRNITYNHGDY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Molecular Mechanisms of Yeast Cell Wall Glucan Remodeling.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLYCOLIPID-ANCHORED SURFACE PROTEIN 2
molecule tags Glycoprotein
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 164
structure length 470
sequence length 480
ec nomenclature ec 2.4.1.-:
pdb deposition date 2008-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03198 Glyco_hydro_72 Glucanosyltransferase
A PF07983 X8 X8 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.1040 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 2w61A03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2w61A01
3RJYA 3O9NA 2ZX6A 1HJVA 4EAMA 3AFBA 5IHRA 4MB5A 1CECA 3S2CA 2VURA 4W87A 5E0FA 3WMBA 1VFMA 3WQ4A 5D4YA 1KB3A 2XJ7A 3W28A 1OGSA 4L4OA 4AD0A 1CGXA 4HMCA 1ZJAA 3NSNA 5BRPA 4W7VA 1GJWA 3VDAA 2ZXQA 3MUY1 3QR3A 3W29A 3ZR5A 4GZIA 1XHGA 3M7SA 1CXHA 5A6KA 2RGLA 2G3MA 4HOXA 5I5RA 2CHOA 3BCDA 2UY3A 2GFTA 1E15A 2WC7A 1KCLA 1UWSA 1W9BM 3SIMA 3MANA 4PTVA 2X0YA 2VTFA 4QLJA 2VR4A 2ZX8A 3RCNA 3WDHA 3PTMA 2XG9A 3OB8A 1PX4A 3L4UA 1EQCA 1UKQA 2DEPA 4AZBA 1JAKA 3U5UA 2Y8KA 1BTCA 2BV9A 1BYAA 2DH3A 1GORA 2D0FA 9CGTA 4P8XA 4BS0A 3WL1A 3QOKA 4C7GA 4IM4A 2J4GA 5HDRA 1VEMA 4FLQA 4D6GA 1EOKA 2WMGA 1XD1A 4LYRA 3WENA 3PZNA 2E9LA 3WQWA 1LQ0A 1XCXA 1UWRA 5A8QA 3GH7A 3L4YA 4DM2A 4N0RA 3AQUA 1GQLA 4JZ5A 3VD3A 1QBBA 1DWFM 2CBVA 2EPKX 3PZMA 1ZBKA 1TE1A 3SUVA 1TFVA 1EGZA 3EDKA 4MJ4A 3ZT6A 3RILA 3OGSA 1XYFA 1BG4A 1FA2A 2WCAA 2JE8A 3VIOA 1GQJA 1HKMA 1M03A 3MMWA 5BCAA 1W9XA 1GCYA 2E4TA 3NSMA 3WDRA 3F4VA 1W3JA 2J7GA 5ABEA 5CJ5A 2BNJA 4CUCA 3N15A 4TTGA 3W0KA 4LPCA 3VD5A 4F79A 1PIFA 4QCFA 3AISA 4JFWA 1RP8A 3GBEA 1LL4A 1YHTA 4QCEA 4AC1X 5BYWA 1JDDA 3TP4A 2EPMX 3WD0A 1CGWA 3VPLA 2C7FA 3KZSA 1XSIA 2DGAA 1EO5A 1GOKA 3UG4A 2XUCA 3GYCA 3SCSA 1J0JA 1EQPA 2XWEA 2G4FA 1H1NA 1XH2A 2YDQA 3AXHA 3GH5A 5GQBA 1HN1A 5CSYA 1XRVA 4K68A 4D72A 1DEDA 5JBEA 1PAMA 3IK2A 5ECUA 5BXRA 2VC9A 1C8XA 4Z2HA 2EEXA 4LX4A 4NF7A 2ZUMA 4PMVA 2WBKA 3PTQA 1AQ0A 3IJ8A 3UG5A 4GZJA 1GVYA 3WNKA 4EK7A 1CPUA 1CTNA 4UR9A 4Z2JA 4W89A 2BY3A 4AIUA 4PCSA 2BVTA 4F9DA 1BGGA 1HKKA 2FDMA 2WPGA 3VGGA 1NH6A 5FOOA 1Y7VA 2V5DA 5LYRA 1J0KA 3VM7A 1CGUA 4LQ1A 3U5YA 3VVGA 5A2CA 1XCWA 1E4NA 3AIRA 5IFTA 3BSHA 1TCMA 1QHPA 2J77A 1K9DA 3AHXA 1JZ6A 1G1YA 4R27A 4F8XA 3NIYA 4URIA 5I3DA 3SCTA 1WZMA 1UD4A 1JXJA 2YDSA 3A4XA 4QP0A 2WVTA 1OM0A 5DEZA 1CIUA 5LA1A 2Q8XA 3UR8A 3QOMA 3IJ9A 1M53A 4H2CA 3UR7A 1QNQA 4E4PA 2E9BA 3OZOA 5E9AA 1GOWA 1CYGA 3UETA 1OCQA 1JYXA 3AIBA 2FHCA 4IUGA 1U33A 2ZIDA 1HT6A 1H0GA 3CZLA 2ZUWA 3KL3A 4F66A 2QHAA 3OA5A 1UD2A 1ZU8A 5FIPA 1UD8A 1JFHA 4PTMA 1VJSA 1HL9A 4JKLA 1E1FA 3WUGA 3CHDA 3CMGA 1UWQA 2XM1A 4CCEA 4U2ZA 3UEQA 1WZAA 5E6YA 4WIWA 3VMOA 1HF6A 1CLVA 3WIJA 2YDRA 2DQXA 2UY4A 1UUQA 2X05A 1BYDA 1HNYA 3CZEA 3B8SA 3K1DA 5DT7A 1S46A 2ZUVA 1JF6A 3BCFA 2E9MA 3MV01 2J74A 3WDJA 4AD5A 3F5JA 4CU8A 2JEQA 2FGLA 3WKZA 4E8DA 3BMWA 3L4TA 1IV8A 1RP9A 1PJ9A 1QW8A 1W1PA 1WPCA 3K4DA 4H7VA 4UZUA 3QGVA 3QHNA 2WHMA 2VRQA 3WH9A 1G9HA 1K9EA 3TOPA 3ARYA 4BQ3A 2FHBA 3ARZA 1FH7A 4W7WA 4U31A 4W8BA 2GSJA 1HP4A 1VEPA 2DDXA 4HA4A 2CESA 1BFNA 3AXIA 3TTQA 4WKHA 3ZMRA 1V03A 3BAYA 3AIEA 2DSKA 5AC4A 3L4XA 4PMZA 2B31A 1JNDA 1QI4A 3N04A 3CMJA 4JCLA 3I3DA 4N42A 3NDYA 3WNMA 1W3LA 3GNOA 1V02A 4GIAA 5D9NA 4IPNB 4GQRA 4P8VA 4BA0A 5F7UA 3RO8A 4JHZA 2G3JA 1BSIA 4D6EA 3CZKA 3SEPA 4WSKA 1NARA 2D24A 1C92A 3W81A 2YL9A 2UY5A 4AW7A 3SCUA 3F5KA 1KR1A 3AS3A 3AHZA 2WBGA 3PZOA 1C3FA 3AOFA 5HPCA 2IXVA 5LA2A 4M80A 2A3BA 3D3AA 3VM5A 2F61A 4Y7EA 5TD4A 3K4AA 1HVXA 2WSPA 4HP5A 1BYCA 2BY1A 2VQUA 3PTKA 4GO9A 3GTNA 2VVNA 3O2LA 2BY2A 2XVPA 3WELA 2ZXDA 3FN9A 1UWIA 4MADA 5M3WA 5FL1A 7CGTA 1C91A 4P7OA 1UWUA 5A6MA 3AZSA 3GDBA 2VJXA 3GNRA 4CN6A 1KGXA 1R86A 1ESWA 3ARRA 2YBTA 2J47A 1HJQA 4HZ8A 5ABFB 2VL4A 2DSVA 1V3MA 2J7HA 4XX6A 1XYZA 4AZ6A 4AIOA 4HA1A 4D6FA 1GHRA 1TA3A 2Y8VA 5CLTA 2WC3A 1EHNA 3OG2A 5A1AA 1M04A 3VDCA 4UOJA 1TMQA 1HIZA 4QDMA 1QNPA 4A4AA 3W24A 1VIWA 3GZAA 2W66A 4WJXA 1QI0A 2ZOXA 5D9PA 1ITCA 2ESCA 3WY1A 1H11A 4IPLA 1H2JA 4W85A 3HU7A 3CH9A 1W9DM 2WSKA 4AIEA 4UOZA 1JZ8A 1CEOA 3ZJ6A 1LF1A 4P8WA 1ZBCA 2CPUA 5EMYA 1ZB5A 4KMQA 3AHVA 4YHGA 2BS9A 2WZIA 4CVWA 4MTVA 3ZSTA 2VZOA 1PBGA 1NM9A 3CZGA 4UNIA 1GHSA 2Z1SA 2BHZA 3DECA 1B3YA 4PUEA 4CU7A 4JFSA 1LWHA 5EFDA 1MFVA 1E6ZA 1J0HA 1EHAA 1E0XA 3OLEA 3VGBA 1GOQA 1US2A 5CLWA 3BAIA 3EDEA 3MO4A 2CBJA 5A6SA 5I78A 1ODZA 4JAWA 2XFFA 4YPJA 3M07A 4XZBA 3K8MA 4WKFA 4WSJA 3VIIA 3HN3A 1VBRA 3GBDA 5DO8A 1BVNP 1DWHM 1J18A 5KEZA 2IUZA 3EDDA 3G6MA 4UOQA 5EBAA 4TXEA 1C7SA 4EE9A 1WNOA 2J79A 5BXTA 2XYLA 3N18A 3EDJA 1VJZA 4NZCA 4KGLA 1ECEA 1R87A 1U30A 4HA3A 3KWXA 5GPRA 3W6LA 1FFQA 1C8QA 2DSUA 2OYMA 1OT1A 4TTUA 1EA9C 1E71M 1BG9A 3AMLA 4PBGA 4AYSA 4QFUA 1E0WA 1W2VA 4CCCA 3WH8A 3WQ6A 3RM9A 3A6OA 3AMCA 2WMKA 5EB8A 4W7UA 3WNNA 1H09A 3PN8A 1BHGA 3PZQA 2XSAA 3VX0A 1E43A 1CZ1A 3ARXA 4JL1A 1JZ3A 2PC8A 1EOMA 2GDVA 5D8ZA 3VNYA 4Z2KA 1FH9A 2QMJA 4CN1A 1TZ7A 1SFSA 1I75A 1QNSA 2V38A 1UA3A 1UOKA 1JD7A 4D6HA 3UCQA 1CLXA 1MW1A 4U5IA 3ZJKA 2YL5A 6CGTA 4RE3A 3ZSSA 3BGAA 1W3HA 3ARQA 3PZIA 3VD7A 3AYSA 2VI0A 1W91A 3HJEA 2DT2A 2IXUA 1JG9A 4A3HA 4E8CA 1ITXA 3POHA 4CKQA 1UQYA 3LPOA 4CN4A 2WW5A 4TVCA 3GM8A 4AD4A 3WF4A 1E55A 2YJQA 3VIKA 3AXXA 2UY2A 1V3HA 4D6CA 3WEMA 4KWUA 4C7FA 4FMVA 3W26A 5EFFA 1W2PA 4B16A 4DWSD 2XGBA 4W5UA 3CZJA 3WDQA 2J7EA 4W8AA 4DUVA 1KGWA 2WCGA 3QHMA 1R85A 3AHTA 3THCA 5FKYA 2XWDA 2VOTA 3BAJA 1RH9A 3W25A 1OINA 3AI0A 2ZXBA 3T0DA 3VTRA 1UQZA 3HMCA 1QNOA 1KGUA 1V0NA 1TR1A 2D0GA 4KH2A 2MANA 5JIWA 3SUTA 5I2UA 4M81A 4X9YA 5ABHA 2NSXA 3VMPA 1JYVA 4LGXA 1IZKA 3AZTA 1KXQA 1UR8A 1V3JA 2NT0A 1WDPA 1JXKA 1V6VA 3UESA 2JF6A 1B3ZA 3GXMA 1CGVA 1WKYA 1TA3B 2HVMA 3CHEA 1VAHA 1CENA 4MDPA 1UH4A 2UWFA 1KFWA 5GNZA 4JL2A 1PPIA 2VX4A 2PBGA 5A8PA 3PZGA 1JD9A 2FGZA 2DIEA 4UFJA 4M56A 3NSXA 3A4WA 1L0PA 3N9KA 1PX3A 4MAVA 2E3ZA 2FHFA 1NWRA 3BLKA 5A8NA 4FLSA 2D20A 1JYWA 2XIBA 1OSEA 1XH0A 2Y24A 4OIFA 2BY0A 2ZUSA 3W82A 4R5EA 2DT1A 3AIWA 3FNDA 1UD3A 2ZICA 5IDIA 1ZBWA 1WAWA 3LMYA 1PX8A 2VUYA 1HJXA 5A8OA 2YOCA 1MQQA 3GXIA 4PMUA 3MV11 1D3CA 5ABFA 2GJXA 2WZHA 3IAPA 3VD9A 2WHLA 1GOMA 3MMUA 3T08A 3WEZA 2CCRA 4PMQA 3PBGA 4EKJA 3PZTA 2JALA 4W88A 1Q6EA 1JIBA 2VZTA 4CD7A 4BZYA 4AISA 4AZHA 1BAGA 2DSWA 2EQDA 4J28A 2CYGA 1R7OA 4QAWA 5JBDA 1UKOA 3DHUA 2O9OA 3AJ7A 1MWOA 1UKTA 1KR0A 2W91A 2D3NA 3DYOA 4DWSA 3FHAA 2GJRA 2WMHA 3E1F1 2JFEX 1L8NA 5D9OA 4DWSC 3SUSA 4TOQA 2J78A 3RM4A 3U57A 4JFTA 1LWJA 5BROA 3B9EA 3I3EA 1E4MM 2WYSA 1B2YA 2E0PA 2G8ZA 2Y4SA 1EH9A 3CHFA 4TVUA 4PRWA 4ACZA 3ZOAA 1MVYA 4U3CA 3GXDA 5C8BB 3WD4A 1XSKA 3OLDA 4J3TA 5CG0A 7TAAA 3BAWA 2CKRA 1AMYA 4WF7A 2VCBA 5IXEA 2XSBA 3J7HA 2AAAA 4AXNA 5A8MA 5CSUA 1CXIA 1MFUA 4WLCA 2WANA 2CBUA 3WDIA 1DWGM 4U33A 3VD4A 4PMXA 5CZKA 4TVDA 5HPOA 5A95A 1Q6GA 1E0VA 1H5VA 2JEPA 1WB0A 5I24A 4V28A 1NWSA 3N11A 1E70M 1KXHA 4PN2A 2J7CA 3LPPA 1OD8A 4GI9A 4AMCA 2EPOA 4B9YA 5ABGA 4X0NA 4PEEA 1JI1A 1E6QM 1CDGA 1NP2A 2QPUA 4HOZA 3ARWA 5AY7A 1CXKA 2XFYA 3KL5A 4AZ7A 2AOSA 2QF8A 5E0CA 1RD6A 3ZQ9A 2OWXA 1CNVA 1E72M 3L4WA 1V0KA 1HX0A 4ZXOA 1WDQA 4HPHA 1FP9A 4J3XA 3KEHA 2WVUA 5HOSA 4M1RA 2TAAA 2J62A 2GJPA 4NSBA 1DWAM 2X09A 1JZ4A 1KBBA 1W1TA 3L4ZA 1OIFA 1B30A 1R8LA 3MSGA 3APGA 4AZCA 3T0AA 1K9TA 1JGIA 5IFPA 3W37A 3OZPA 3SUWA 1VENA 4MNKA 4P7NA 3L2MA 2AMGA 3CUJA 1FHLA 1J10A 3EMZA 4Z2LA 1DHKA 2CITA 3UG3A 2OWWA 4J7RA 2XVGA 4JHOA 4UQBA 1J0IA 3VDHA 3VU2A 3WUFA 1SR0A 1W1VA 2JIEA 3DYMA 1UYQA 2ZWYA 2ZX7A 3KE0A 4PMRA 3LPGA 2PWGA 4AZ5A 2XIIA 2J7BA 2XPKA 3K8KA 3ARTA 1I1WA 2XTKA 4UQEA 3NDZA 1GOOA 2W62A 3B9AA 4S3KA 4HMEA 1ZS2A 5HBFA 4PYSA 2NW0A 4GI6A 3CUGA 4H04A 3CIVA 3WQVA 3SURA 2PWFA 3KL0A 1EXPA 1D7FA 4LYQA 4CD8A 2GUYA 3WD3A 2CETA 1W9VA 5BXPA 1FHDA 3WFZA 2GK1A 1V08A 4PMYA 1KWKA 4V2XA 1JL8A 1XC6A 1CBGA 5I79A 3WH7A 1PEZA 5AYIA 1VBUA 4J3SA 1V3KA 1UR9A 1KXVA 1JF5A 5IHSA 4UZSA 3MMDA 3RJXA 1XGZA 2WHKA 4HZ7A 4M82A 3VIPA 1NOUA 1NWTA 4YN5A 2J8GA 4FK9A 2XVNA 4AWEA 1SYTA 2GJXB 1KQZA 3VGDA 5JIPA 2FH6A 5JBFA 2E8YA 3AS1A 3BLPX 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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