2W62A

Saccharomyces cerevisiae gas2p in complex with laminaripentaose
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
461
structure length
436
Chain Sequence
SFEKTPAIKIVGNKFFDSESGEQFFIKGIAYQLQRSGAFETSYIDALADPKICLRDIPFLKMLGVNTLRVYAIDPTKSHDICMEALSAEGMYVLLDLSEPDISINRENPSWDVHIFERYKSVIDAMSSFPNLLGYFAGNEVTNDHTNTFASPFVKAAIRDAKEYISHSNHRKIPVGYSTNDDAMTRDNLARYFVCGDVKADFYGINMYEWCGYSTYGTSGYRERTKEFEGYPIPVFFSEFGCNLVRPRPFTEVSALYGNKMSSVWSGGLAYMYFEEENEYGVVKINDNDGVDILPDFKNLKKEFAKADPKGITEEEYLTESVECPHIAVGVWEANEKLPETPDRSKCACLDEILPCEIVPFGKYEEYFSYLCSKVDCSDILANGKTGEYGEFSDCSVEQKLSLQLSKLYCKIGANDRHCPLNDKNVYFNLESLQPC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Molecular Mechanisms of Yeast Cell Wall Glucan Remodeling.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule keywords GLYCOLIPID-ANCHORED SURFACE PROTEIN 2
total genus 162
structure length 436
sequence length 461
ec nomenclature ec 2.4.1.-:
pdb deposition date 2008-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03198 Glyco_hydro_72 Glucanosyltransferase
A PF07983 X8 X8 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.1040 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 2w62A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2w62A01
1KCKA 1UWSA 2V38A 1LG2A 1ZJBA 1QI3A 4OJYA 2ZXQA 1OSEA 3PZNA 3VDHA 2WBGA 1JI1A 4WK9A 4J3TA 3WH6A 1E6QM 1QI5A 1W2VA 3AIWA 3EBVA 5DF0A 3CHFA 2VQUA 3W6MA 4MJ4A 1W2PA 2G41A 4MAZA 3VNZA 3HMCA 3GXMA 1SR0A 1JZ8A 4P8VA 2VRKA 1KGUA 5A3HA 1VEPA 1WCGA 3W28A 2D3LA 1F4AA 3BMWA 4GXPA 2A3CA 2PBOA 4AD5A 5HPOA 1K9DA 1IT0A 2X09A 1ESWA 2XG9A 4HPHA 2HISA 5I78A 7CGTA 3AMDA 3BGAA 3CGTA 1HJXA 4D6FA 1M53A 1HF6A 3BLKA 3ZSSA 1C3FA 1U30A 3FAXA 1GQJA 4RE2A 2J7EA 4JKMA 3OG2A 4H7VA 2WCAA 4U31A 2O9PA 2E9LA 1VIWA 4F9JA 4UOJA 1CLXA 1GONA 2CBUA 2OWXA 1CGTA 4TVUA 1CZ1A 1MYRA 3KEHA 1ZBVA 4M1RA 5CJ5A 2XSBA 1PPIA 5FL1A 1E43A 4B15A 1CGUA 5A95A 5D8WA 1ODUA 1Q4NX 3ZMRA 1L8NA 5HOSA 2X0HA 1BYDA 4LX4A 1NH6A 4UFIA 5IHRA 1VENA 2V3GA 1WZMA 3CLWA 4V27A 1TCMA 3N9KA 4ZEPA 1WPCA 1BG4A 2NW0A 4AIEA 4D6GA 5JBDA 1E3XA 1MW0A 1QPKA 1TE1A 2VOTA 3MU7A 3KL3A 3RMEA 1VEMA 1WZLA 3WENA 3WQ4A 2WVUA 1JZ2A 1CXEA 1UD5A 3BSGA 4WIWA 3WF1A 1AQMA 3U7BA 4GI9A 3ZT6A 1QHPA 3B9AA 1FFQA 1TG7A 2QLYA 3WBAA 1W1YA 2WVVA 3JUGA 2XSAA 5HPCA 2QPUA 2WW5A 3RO8A 2ZUUA 4PUEA 3BAXA 1XH1A 1Q6CA 2DSZA 2W5FA 1TFVA 1HJQA 3BXWA 2D24A 1E6RA 4MNMA 3PZOA 3CTTA 1W32A 1KFWA 2D2OA 5FKYA 3VD4A 2WC7A 4JL1A 2QF8A 3RJXA 3L4ZA 1ZBCA 2YOCA 4CD5A 5M17A 5D9PA 4W88A 3EDKA 3DC0A 5BRQA 3W38A 4U3AA 3WKZA 3OZOA 1FP8A 4BS0A 3F5JA 4JIEA 1KXHA 1VF8A 4V2XA 1JDDA 3N04A 2XPKA 1ISVA 1QNSA 1OBAA 2DGAA 4HMCA 5CQ1A 3WFZA 1V0LA 3A47A 3IK2A 4H04A 3BCFA 1E4LA 1HIZA 1W91A 4AXNA 3UG4A 3IAQA 4NI3A 2EEXA 2WYSA 3AZSA 1W1VA 2X8RA 2BY3A 2GJXB 3N18A 4S3KA 5DO8A 2GDUA 1C8YA 4OKDA 4AMCA 4CU6A 3NSNA 3VUPA 5JIPA 5DT5A 2FHFA 1WNOA 5E70A 4MAVA 1P6WA 1EDTA 3VIMA 1J0ZA 1E0VA 1XH0A 1HKKA 3SCPA 4IPLA 1U33A 2J7GA 3WDPP 4M24A 2WMFA 2VZOA 3DYOA 4TOQA 5A6AA 4HZ7A 1UKTA 5ECUA 3G6LA 3VD9A 2DSKA 1GOQA 2RGMA 1EO5A 5FCZA 1AQ0A 2CESA 3W53A 3II1A 2JFEX 1V3HA 1GW1A 2ZX5A 1JAKA 5A8QA 1HL9A 3K46A 1RD6A 1GQLA 1V03A 1R7OA 4M8UA 4PMDA 2GJPA 5IDIA 4GZJA 1UH4A 1NOUA 1ISWA 3VGDA 1MVYA 4S3JA 3OLIA 2ZXAA 1HT6A 2FH8A 2QV4A 4AEEA 3KE0A 3BC9A 3BAIA 1LQ0A 2OYLA 5GNXA 3VDCA 3WD1A 5M03A 3TA9A 2VNCA 4JHZA 4E8CA 4C7GA 1W9PA 1G5AA 5EB8A 4H41A 1OGGA 5A2BA 4AZHA 3EDDA 1E5JA 3W4RA 3MV11 4D6EA 2GJRA 2BNJA 4LPCA 3EYPA 1M01A 1G94A 2D1ZA 4AIOA 3VGFA 2Y4SA 4EAMA 3OZPA 3U7VA 3LPGA 1E3ZA 1JXJA 4WLCA 4ZXLA 2DSVA 4M81A 4CKQA 5EFDA 1E73M 3ZJ8A 2XVGA 5A69A 5A6SA 2VR5A 2G3JA 2DH2A 1DWIM 2VRJA 1XRVA 4ZE4A 1OWQA 1QNRA 2BHUA 2CBJA 2O9OA 1EHAA 3T08A 4P7RA 3T09A 1KWKA 4QDMA 3AHVA 1B3YA 2VVNA 1B3XA 1MW3A 4PCTA 5I79A 3AYRA 2VJXA 1VBRA 3AIQA 1UKSA 2ESCA 2UWFA 1LLOA 3OGSA 1YHTA 2UY5A 3WNMA 4AYSA 5ABEA 1DWHM 1UWQA 3ZQ9A 3WQ5A 4QLJA 1QW9A 3WN6A 2YL8A 2WCSA 3RPMA 1V3JA 3D3AA 4ACZB 1XGZA 2PC8A 2YBUA 2Y5EA 3M07A 3VVGA 2VZSA 1DWGM 4KRTA 3SIMA 2PB1A 4W84A 2CKSA 3K8LA 2V5CA 4KGLA 4TUFA 2WHLA 4ATDA 3LPFA 1CGWA 8A3HA 2CNCA 4RE4A 1C93A 2BY1A 1ZBWA 4Y7EA 1H5VA 1OD8A 5DT7A 3AS1A 4CN6A 2FGZA 3WUBA 5A6JA 3KWXA 2BY2A 4ATLA 1CLVA 3AHZA 1VRXA 2W63A 3LPPA 2RGLA 4B9ZA 4YPJA 3WQWA 1SYTA 1A3HA 4ZXOA 1H0GA 3MUY1 1PIFA 1WO2A 1EO7A 5GPRA 1LJYA 1NWUA 4PMYA 3OGVA 1I1WA 4D72A 3AHYA 4AZ5A 2NT0A 2GK1A 1J12A 1HP5A 1NWTA 4W7UA 3VIOA 5A2AA 1VJSA 4HOZA 1PAMA 2XIBA 5DEZA 3TONA 4LQ1A 3PZ9A 3VU2A 3AS0A 3QOKA 1BGGA 2ZE0A 4Z2HA 5HXMA 3THDA 2WSPA 3UESA 3T2QA 3WNKA 1V6XA 3HN3A 1E6XM 4BQ5A 4W8LA 3L4WA 1GOIA 3MMWA 4TTGA 3FY1A 1KCLA 2AAAA 1OGBA 2D3NA 2WK2A 1OIMA 7TAAA 5CGTA 3WEZA 1UR2A 1JD7A 4GO9A 1KR1A 3WELA 2XGIA 3WMCA 1WKYA 1XSIA 2YLLA 3UERA 3VOCA 3NJ3A 4TXEA 1H11A 1JYWA 4RL3A 2W67A 1OGSA 3A4XA 4QP0A 4HZ6A 1W9BM 1V02A 4NRSA 1OT2A 2A3HA 1LL7A 1B2YA 2VO5A 2G8ZA 1V0NA 4FF5A 2WMGA 2X1IA 4UQCA 3A4WA 5ABHA 3VPLA 3AOFA 3AJ7A 4U2YA 4UQEA 2UY2A 4NZCA 3OLEA 4QLKA 1UD8A 3KL5A 6CGTA 4DWSD 7A3HA 2QPSA 2GFTA 1XYFA 4P8UA 1XD0A 2TAAA 3UCQA 1LF1A 4ACYA 2W61A 3DHPA 1BGAA 2J7HA 1TR1A 1RP9A 1CGYA 1H41A 3CUJA 1UWIA 4FLQA 2O9RA 3PTQA 1OD0A 5BXSA 3MV01 2VX5A 1XHGA 1KXTA 1BYBA 2CXGA 3VIJA 5CSYA 3ECQA 4HPGA 4FLRA 4OOUA 4U2ZA 2OWWA 3WUEA 3CZJA 1R8LA 1WDQA 2E40A 1TZ7A 4WKHA 1X6NA 2YJQA 2EPKX 2ZUTA 1HVXA 1FFRA 1JGIA 3CHEA 5KZ6A 1QI0A 2GSJA 3MUIA 1AQHA 5D9NA 2YA2A 4KMQA 1B30A 4J28A 3GH4A 4D6JA 3GTNA 1FHLA 1J11A 1W9UA 2CERA 2ZXDA 1H09A 5D9MA 4CCEA 5CGMA 1C90A 1EDGA 4W7WA 4AW7A 1FA2A 2WVVB 1V6YA 3QHMA 4X0VA 3RM4A 4DUVA 4J3WA 5E09A 2WKLA 1VBUA 1DTUA 3AROA 1J01A 2XM1A 3RJYA 2XFRA 4LYQA 2YDSA 4GQQA 1K9EA 3GBDA 1E40A 1WB0A 2WMKA 4D1IA 3PTMA 2A3BA 4W5ZA 1UR9A 1QNQA 4M80A 4MNKA 5ABFA 4XX6A 4GQRA 5A8PA 3AIUA 4X0NA 2XVLA 2QMJA 1JZ7A 1C7SA 2NT1A 2DT2A 2DT0A 2ZUMA 1V6UA 3CBWA 3ZT5A 4F79A 3GZAA 5GNYA 4KH2A 1V3MA 2O9TA 1E6ZA 1UOKA 5FL0A 1HVQA 3PZUA 1EQCA 1EH9A 1GPFA 2D0GA 1DP0A 3WMSA 1G0CA 2Y2WA 3J7HA 4TX8A 3VX1A 1EOKA 2J77A 4XUYA 4MPKA 4PMXA 1GZJA 5JIWA 2EPMX 1H0IA 4JZ5A 4KGJA 2X05A 1C8QA 3W81A 1G1YA 1SMAA 1XSJA 2E0PA 2E8ZA 1O6IA 3D5HA 4V28A 4OBSA 2XVNA 2C7FA 3PZIA 4GZEA 3IAPA 4AD1A 3PZGA 4H8UA 3S2CA 3PZVA 1TA3A 1UKOA 2PF0A 1J0JA 3ZR6A 1G9HA 5A8NA 2J78A 4U5KA 1SFSA 3CMGA 2VX7A 2Y8VA 4JKLA 1W9XA 4UZSA 3ARYA 3WUFA 1OCQA 1HL8A 1E70M 2WCGA 2WZEA 2Z1SA 2WM0A 3L4YA 5AC4A 1M7XA 3CO4A 1CXLA 3VIHA 4J3XA 5A1AA 2PWDA 1GOMA 2WMIA 1CNVA 1XV8A 3U5YA 3K4AA 4OUEA 5F7UA 1JDCA 3WD2A 2YBTA 4URIA 4EE9A 4UTFA 1FOBA 3NDYA 1UA7A 2A3AA 1YQ2A 2WMJA 2ZUSA 1JYNA 4AZ7A 3SCOA 4F9DA 1CXKA 4F8XA 4JFUA 2BVDA 2WAGA 1Q6EA 2VQTA 1KGWA 3FNDA 3AIVA 2MANA 1JFXA 3N1AA 4W86A 3B9EA 1TUXA 3E1F1 1BF2A 4CD8A 3GH5A 4E8DA 3SUUA 3WEOA 1IV8A 4PUDA 1L0PA 4DWSB 1JI2A 4AZIA 4AEFA 3FN9A 4FLOA 5A2CA 2VCCA 1JYVA 4BA0A 3W37A 2V3FA 4PMRA 1FH8A 1E72M 3EMCA 4MB1A 2JIEA 1NQ6A 3GM8A 3PZTA 4WF7A 5LA1A 1DWFM 4AZGA 5KEZA 1H1NA 1UH2A 2WVTA 3VKKA 1BHGA 3BH4A 2IXUA 3WBEA 2XJ7A 1ISZA 4GZIA 4R27A 1CDGA 2J74A 4C7FA 1XD1A 2D20A 1OM0A 3SCUA 4IISA 5FD0A 3AHTA 2DPEA 4HMDA 1UKPA 1UD6A 3EMZA 2CETA 4PYSA 3BCDA 1UQYA 1EQPA 3AMGA 1ECEA 3NSMA 1BVNP 4DM1A 1HJWA 3WQVA 3GNOA 3M6DA 4HOWA 1R87A 4N42A 1MW1A 2G3NA 2YA0A 4UQBA 3PZQA 4RE3A 3VMNA 4JAWA 3RILA 3KL0A 1J0HA 1UQZA 1QHZA 1XC6A 3WL1A 3L4UA 1MXGA 4MB5A 1B31A 1DHKA 1K6AA 3ALGA 3L4VA 2OSWA 1NWSA 4CU8A 1E15A 2VX6A 3F5KA 9CGTA 2YL6A 3FAWA 3APGA 3GNRA 1PIGA 5A6KA 1LWHA 1VFFA 5ABGA 3ZM8A 2J7DA 4PTVA 1ZU8A 4XZBA 1WE5A 3CIVA 1CEOA 2GK1B 1J18A 3SUTA 1WZAA 2J7FA 4TVDA 2FDMA 2W66A 3U5UA 2W91A 2Y8KA 4HMEA 3CUGA 2WC4A 1ITXA 3AMCA 1GOKA 4R5EA 1HX0A 5FOOA 4H2CA 1J0YA 2XHYA 4EKJA 5CPQA 3F5LA 1K9FA 3LMYA 1HJSA 2PWFA 2EO7A 1JG9A 2WBKA 1KB3A 1PX8A 1MQRA 4HZ8A 1BFNA 2BVTA 5CZKA 1ITCA 2XWEA 3K4DA 3VD7A 2VR4A 1N82A 2Y24A 3F4VA 3TOPA 1UG6A 3VMPA 4U3CA 1U2YA 1UWRA 4PCSA 3WNLA 4DM2A 1KR0A 1RPKA 4JFVA 4J3SA 1E6PA 1PEZA 3CZLA 4Z2LA 5IFPA 3AQUA 4W5UA 1JZ4A 1PBGA 1PX4A 4CVWA 3CZGA 3GYCA 1J0KA 3GXFA 1HKMA 4AD0A 1VEOA 1H3GA 1VFOA 4CVUA 3ARWA 1JL8A 1ISXA 3KZSA 5LA2A 2WHJA 5E0CA 2WWCA 2BHYA 1KXQA 2VURA 3VMOA 4TX6A 1EGZA 1PJ9A 3QR3A 2ZWYA 4UNIA 3EDEA 4EANA 5CG0A 4AY1A 5CPSA 3NIYA 4W89A 3QHNA 3HJEA 2BV9A 4W87A 4W93A 2ZX6A 2VC9A 5E6ZA 3S6TA 3AIRA 5A6MA 3L2LA 1W1TA 4AD4A 1JDAA 4HTYA 3AFBA 1KXVA 3EMQA 1GHRA 4LGXA 3O9NA 1BYCA 1F4HA 1R7AA 1QI2A 3CZ8A 4UFLA 1HJUA 5A8OA 4P7QA 2EJ1A 3CHDA 2VMFA 2J47A 2ZX8A 4PMUA 1EA9C 1KBBA 1GNXA 3ARQA 3WDHA 3DHUA 1XSKA 4IUGA 5LA0A 4P8XA 1M03A 4UOZA 4W7VA 2GJXA 4B3KA 2WLZA 1B90A 3WD0A 1EHNA 3FHQA 3DECA 1GJWA 1OIFA 1G01A 5CPTA 1XCWA 5BXRA 4D6HA 3T0BA 3DYMA 2WZHA 3ZJKA 3AMLA 4ZFMA 5HBFA 3WF0A 1TVPA 4PTXA 1LL6A 1GUVA 4AZBA 2BHZA 4CCCA 2FHCA 1MFUA 2EPLX 5BCAA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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