2W62A

Saccharomyces cerevisiae gas2p in complex with laminaripentaose
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
461
structure length
436
Chain Sequence
SFEKTPAIKIVGNKFFDSESGEQFFIKGIAYQLQRSGAFETSYIDALADPKICLRDIPFLKMLGVNTLRVYAIDPTKSHDICMEALSAEGMYVLLDLSEPDISINRENPSWDVHIFERYKSVIDAMSSFPNLLGYFAGNEVTNDHTNTFASPFVKAAIRDAKEYISHSNHRKIPVGYSTNDDAMTRDNLARYFVCGDVKADFYGINMYEWCGYSTYGTSGYRERTKEFEGYPIPVFFSEFGCNLVRPRPFTEVSALYGNKMSSVWSGGLAYMYFEEENEYGVVKINDNDGVDILPDFKNLKKEFAKADPKGITEEEYLTESVECPHIAVGVWEANEKLPETPDRSKCACLDEILPCEIVPFGKYEEYFSYLCSKVDCSDILANGKTGEYGEFSDCSVEQKLSLQLSKLYCKIGANDRHCPLNDKNVYFNLESLQPC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Saccharomyces cerevisiae
publication title Molecular Mechanisms of Yeast Cell Wall Glucan Remodeling.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLYCOLIPID-ANCHORED SURFACE PROTEIN 2
total genus 162
structure length 436
sequence length 461
ec nomenclature ec 2.4.1.-:
pdb deposition date 2008-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03198 Glyco_hydro_72 Glucanosyltransferase
A PF07983 X8 X8 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.1040 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 2w62A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2w62A01
1UD3A 3N11A 1GQLA 5M5DA 3KZSA 4F79A 3CHFA 3CHCA 3PN8A 2A3HA 3WD4A 3WDHA 1TA3A 2EXOA 1PEZA 1E0WA 3VMPA 3VDHA 4DUXA 1CECA 4MDPA 4PTVA 2OLHA 4LPCA 3PZOA 3KL0A 1KQZA 4QLKA 2V3DA 1VB9A 2GVYA 4U33A 4K68A 5I79A 4M81A 4PMYA 3MKKA 2PBGA 5AC5A 1V08A 1ZBKA 3ZMRA 3RM8A 2W66A 3W6LA 4IPLA 1VFOA 5LYRA 4GIAA 1V03A 1HL9A 4IPNB 5E0FA 2WYSA 3VIPA 2WC3A 3VIGA 1X6NA 2ZUTA 4TX6A 2G3NA 2ZIDA 4BQ2A 3N17A 1FP8A 4OIFA 4OBSA 4NI3A 1K6AA 4EANA 2D3NA 4UOQA 3GH5A 4Z2HA 2BY0A 1W2PA 1UD4A 5DF0A 3CIVA 1LF1A 1I75A 2YIHA 3PZMA 3TTYA 3AMGA 1GOIA 4GPNA 2NT0A 3GNPA 2CKRA 2ZE0A 5A6BA 3BAJA 3NSNA 3AIRA 1DWAM 3KL5A 2Y8KA 4LX4A 3RO8A 3WH6A 2A3BA 3W25A 4P7NA 1FH9A 1GORA 2WKGA 2YL5A 4EKJA 3IANA 1ISWA 2CBIA 3A6OA 4AY1A 1E6RA 5A8MA 1G0CA 5HPCA 2QPUA 4W93A 4TVUA 4PCTA 1MW0A 1GHRA 2EO7A 2ZX7A 4WF7A 3FHAA 3RJXA 2VCBA 3RMEA 2RGLA 1HJXA 4FK9A 3WN6A 2E8ZA 1ESWA 1JI2A 4A4AA 1UKOA 3AXXA 2ZUNA 3VGBA 1B3WA 2VNCA 1E6SM 1QHOA 1E1FA 5C71A 2YA1A 4D6FA 1QNOA 1KB3A 4D6JA 1Q6DA 5CPQA 3ZSTA 3WQ4A 1UWRA 2D24A 2NT1A 3I3EA 4X0VA 3W37A 3PZ9A 5E6YA 1GOQA 2XIBA 3SUSA 3E1F1 3WD1A 4E8DA 4P7LA 5EBAA 3WBEA 2GUYA 1UZ4A 4IUGA 3WFZA 3U5YA 3VPLA 3RM4A 2VQTA 5BWFA 1UH3A 3GBEA 2YA2A 1CTNA 1JZ3A 2J7FA 1VRXA 3F5KA 2E4TA 4Q7NA 3ZJ7A 3B9EA 4E4PA 2J75A 4WSJA 4PMOA 2DH3A 4JKMA 4XZBA 2CXGA 2EPNA 3PZQA 3AHVA 4QDMA 3K46A 1C93A 4U2YA 4ACZB 1BG4A 2QLYA 3PZUA 2X1IA 1GUVA 1XD0A 3WF4A 1MQPA 5IHSA 5CGMA 2JIWA 2XFFA 3CUGA 5LA2A 4AZGA 3N12A 3AICA 3W53A 3GXMA 1JAEA 1EHAA 4JHOA 1LWJA 1E6PA 3EDKA 1CXHA 1E6QM 1JD7A 2WVVB 1OM0A 3FW6A 1C8QA 1TMQA 3T2QA 1EDGA 1B3ZA 2YJQA 1FFQA 1R7OA 5JBEA 2EQDA 3HJEA 3GXIA 2XPKA 1JNDA 3QR3A 2VZTA 2E8YA 4GZIA 5A6LA 1CDGA 6CGTA 1BGGA 2DIEA 1ECEA 2DSZA 1QHPA 1JG9A 4B15A 2ZX6A 2BVDA 3BAXA 3GBDA 1HX0A 1ZS2A 2G4FA 4EK7A 1E56A 5D9OA 3VD4A 1E9LA 1GJWA 1L0PA 1QI0A 1BVZA 3AIVA 4QFUA 1TG7A 2ZWZA 4OKDA 3F4VA 3M7SA 2BHZA 2DEPA 4ZEPA 2YL9A 4XZWA 1OWQA 4MJ2A 5I78A 1CLVA 1KGUA 1BFNA 1MWOA 1VEOA 2WM0A 3WUEA 1CNVA 4ACYA 5CJ5A 2YL8A 4J3XA 5BRPA 5IDIA 4AZ6A 4A3YA 1KBKA 3RILA 1ODZA 3BMWA 3S6TA 1V02A 3BMVA 3ZJ8A 4NF7A 2WW5A 1UYQA 1EXPA 4OZOA 4U2ZA 4ATDA 1RPKA 1XHGA 4W85A 3PBGA 3WSUA 4BZYA 1LL6A 1UA7A 3CZEA 4DWSA 3CUIA 1VJZA 1ZL1A 3HN3A 4CCCA 2PWEA 1JL8A 1HJQA 1OBAA 5ABFA 2DQXA 5D8ZA 4ZE5A 1SYTA 2VJXA 4PTWA 4HMEA 1F4HA 2X2YA 3OLDA 2WHLA 2BVYA 4Q22A 1B3YA 1PIFA 2WNWA 2D23A 1K9FA 2ZXBA 4GI9A 1CBGA 4D6IA 1ITCA 2W62A 2WMIA 1NWTA 2XGBA 4MB1A 4AZIA 3A4WA 2WPGA 3AIQA 3L4ZA 4UTFA 1E43A 2DIJA 1JDCA 4UQEA 3SCNA 3RPMA 3ARVA 3AHTA 2WZHA 1G9HA 3MO4A 1HN1A 3PZGA 2J79A 1NOWA 4DWSD 2VX5A 5TD4A 7TAAA 3A4XA 4WSKA 3T08A 1Q6GA 1EA9C 4CN1A 3L4TA 2NW0A 3W4RA 1J0ZA 5D4YA 3KEHA 4AISA 1AQHA 1OGSA 3AJ7A 4UFHA 4AZ7A 5IFTA 1CENA 1FOBA 1MW1A 1E5JA 3VTRA 4PEEA 4QCEA 4RE4A 1R87A 2V3GA 1B31A 4D1IA 4TVCA 1ISXA 3N13A 4J3TA 1U30A 2WHMA 1E72M 4LYPA 1QVBA 1UD5A 5IHRA 2VRQA 3VINA 3AS1A 2J7BA 3APGA 4P7OA 1VEMA 2YLAA 4KRTA 4NRSA 3O9NA 5CQ1A 1W3JA 2OYLA 3IJ7A 1QW9A 2ZX9A 4E8CA 4ZFMA 3A4AA 3AROA 1NQ6A 3EMQA 2YLLA 3CO4A 2D0GA 3CGTA 2FH8A 1CLXA 2XM2A 4HA4A 1C7TA 3K8KA 2Z1KA 2G3JA 4H8UA 3HU7A 2DGAA 3WMSA 1JYVA 2ZUMA 3VNYA 1Q4NX 4DUVA 3WF0A 1DWJM 3SUUA 3NYDA 5A6MA 2ZUUA 3FAWA 5ABGA 2J77A 3QHMA 1WB0A 4OJYA 1NOFA 2J7CA 1QPKA 1O6IA 1JZ5A 1UR9A 3THDA 2Y8VA 3WNLA 2BS9A 3WQVA 5I0DA 4V2XA 2A3AA 2GJXB 2D22A 4JFUA 4H2CA 2BFGA 1LL4A 2X0YA 4B16A 4UQBA 2AAAA 3WNPA 4KGLA 4W89A 1LG1A 2J7DA 3NCOA 3WQWA 1W3LA 4P8WA 1EO5A 4D1JA 4S3JA 3BCDA 1C7SA 4U3CA 1QOXA 3SCWA 2G3IA 1EDTA 4PCSA 1NP2A 3VIHA 1ZU8A 1W9DM 4JAWA 1VEPA 1GPFA 1NH6A 4JFVA 1DEDA 2Y2WA 4W5UA 1D2KA 3AMDA 4TUFA 2WMKA 5BYWA 1OINA 1KGWA 3VGGA 3D3AA 5LA1A 2ZXDA 5JBDA 1UG6A 1GW1A 3CMJA 2X05A 1ZJAA 3AHXA 1JZ4A 2V5CA 4W8AA 1G01A 4HU0A 4GINA 2O9OA 1EQPA 3LMYA 2Y5EA 2HISA 2XSAA 1ZBCA 3N9KA 3WD3A 1GZJA 2YDQA 4DM2A 2WMJA 4GZEA 2PBOA 2ZOXA 2EPOA 2WLYA 2XVPA 3BLKA 5A2AA 3K8MA 1UKPA 1NWRA 3UEQA 1CXLA 2CKSA 2EBNA 2V3EA 3VMNA 1CGWA 1B30A 4AEEA 1HNYA 3G6LA 5D9MA 1DWIM 2F8QA 1JZ7A 1V0NA 1XYFA 1GOOA 1ISYA 3BAYA 2O92A 1A47A 1W9VA 4PSPA 4GO9A 1C91A 1FA2A 4QAWA 3ARWA 3VNZA 5A1AA 2ZX5A 5BXPA 3SEPA 3DHUA 1QNSA 3SCOA 4B9YA 4JFSA 3RIKA 3WH8A 1TZ7A 3SCVA 4AD5A 2DH2A 4AXNA 4D6DA 4AD2A 1GQIA 3WBAA 3OZPA 4QLLA 3KE0A 3L4VA 4B3KA 4UQCA 4MB3A 1Q6EA 3EDDA 8A3HA 1X6LA 1V6XA 4C7DA 3IJ9A 1VIWA 4BCEA 2O9PA 1J9YA 1UD2A 4QP0A 1CXIA 1UR0A 3UERA 2DT1A 1W3HA 1WO2A 3ZR5A 3PTKA 1H49A 2FH6A 4PTMA 3OG2A 2OWWA 3VD9A 4MNKA 2D3LA 3WH5A 1EOKA 2GDVA 2GK1A 3VGDA 1IV8A 2W5FA 3DYOA 2V38A 5I24A 1E0VA 4EAMA 4LYQA 5BCAA 1H11A 2F61A 5M3WA 1OIMA 4CD8A 1BVNP 1XRVA 1CZ1A 1BQCA 4D72A 2QMJA 3GDBA 3IAPA 2XYLA 1V6YA 4RE2A 1ZB5A 1E4LA 3MUAA 3VD7A 5BXTA 4P7RA 4PMZA 4PSRA 4GI6A 3OIHA 5I2UA 4E2OA 2WXDM 4KWUA 4W88A 4M56A 1E70M 3WMCA 4CVUA 3EMCA 3WDPP 1C90A 3MANA 4RL3A 2JF6A 2PWFA 2JE8A 1LJYA 1WZMA 3VMOA 3WQ8A 1TR1A 1OB0A 1CGTA 2XVNA 3BH4A 1E4MM 3A3HA 1KFWA 2W63A 3T0DA 5A8PA 3KL3A 3ARQA 1GNXA 3OB8A 3WH9A 5A94A 3CBWA 3K4DA 1UWTA 2DDXA 1LLOA 2BY2A 1JNEA 1LQ0A 1JF5A 1WDQA 3WDRA 1ODUA 4MNJA 4CU8A 2A3CA 1GQJA 1KBBA 4X0NA 1QNRA 3N18A 3W24A 1G1YA 3W6MA 1E4NA 3VDAA 1FHLA 2UY5A 2PB1A 3QHNA 3L4XA 1XC6A 2AMGA 7CGTA 4UQDA 5A8QA 2J4GA 1E3ZA 2QHAA 2G41A 2XJ7A 4M8UA 5A8NA 2VX4A 4HOXA 2JEQA 3WNMA 3AMCA 3U7BA 5ABEA 3FN9A 3S2CA 1CEOA 3UCQA 4GQQA 4CUCA 1B9ZA 5DEZA 1TFVA 1WDSA 4MPKA 3DECA 3CUJA 2AOSA 3W38A 1A3HA 4F66A 3VIKA 1OT2A 4WK9A 4X9YA 3VVGA 1PPIA 1HF6A 2VOTA 1WZAA 2CCRA 2XWDA 3VIMA 4H04A 1JAKA 5FD0A 1MYRA 1VFMA 2OSXA 4JL1A 4AZCA 3FY1A 4KMQA 2BVTA 3M46A 5CPTA 1HJUA 4WIWA 1F4AA 2PI6A 2CIPA 4W7WA 2MANA 1GHSA 1TA3B 1MFUA 3CPUA 1H1NA 4AIUA 4CN6A 1RD6A 2Y4SA 1CGUA 1H41A 1XV8A 4M82A 2YL6A 1BGAA 4J3VA 4CD4A 1UH2A 1HKMA 1NARA 1BYCA 3QGVA 2ZUVA 4AEFA 1CXKA 3EDJA 5IXEA 3NDYA 1PX8A 4HA1A 3ARSA 3BAWA 3PZTA 4XX6A 3ARUA 3I3BA 2VUYA 1E6ZA 3WEMA 3CZLA 5E9AA 5I6SA 4UFIA 2XGIA 3EYPA 3NSXA 4JZ5A 1H4PA 4PYSA 1XGZA 3MUY1 1GVYA 1IZKA 1E3XA 1J0KA 2CERA 2O9TA 3AS2A 2J25A 1IZJA 3B9DA 1OGGA 1QI5A 1XCWA 2WVUA 4OOZA 3ZM8A 1NOUA 3BCFA 3VIJA 4OUEA 2VQUA 3WFLA 1L8NA 4UZSA 3WUGA 2WHJA 3WF1A 5I5RA 4PN2A 3SCRA 3W28A 3WUFA 2C7FA 1W9BM 4TVDA 1JXJA 4JKLA 3WKZA 1C92A 2GSJA 4YN5A 1U33A 3SCTA 3TTOA 1J12A 4BQ5A 2FGLA 3VM7A 2VX6A 1UQYA 4CN4A 2CESA 4JKKA 4C7FA 2ZICA 2BHYA 1W91A 2YBUA 1HT6A 3DHPA 1TCMA 1J18A 2VI0A 3MUIA 4GI8A 4ZXLA 1EGZA 3CTTA 3MMDA 4M29A 2EPLX 3M07A 4P8VA 3QOKA 3WF3A 1GJUA 3VGFA 1XSIA 1SR0A 3CZGA 3WD0A 5I23A 2VZVA 4UOJA 3ARZA 1JFHA 1VBRA 3B8SA 1E0XA 1J0YA 5DFAA 2VL4A 3AI0A 1TVPA 2ZUWA 5CLTA 4AD4A 1M01A 1JYXA 3RJYA 1R85A 3MU7A 4WKFA 2FHCA 1E71M 1JZ6A 2YBTA 2VVSA 5E09A 1LG2A 2CPUA 2WVSA 4GKLA 1HP5A 2WBGA 4J28A 1E5NA 2PF0A 3AZTA 1TVNA 2CEQA 4JHZA 4AZBA 3AMLA 4UOZA 4IM4A 1BYBA 2C0HA 2PC8A 1VFUA 4MAZA 2J74A 1WZLA 1CGXA 2QV4A 2DPEA 3RM9A 3FNDA 4FLOA 1JZ8A 5CGTA 4Z2LA 5HNNA 3BXWA 3WELA 3JUGA 5C70A 2X0HA 3W81A 2CHNA 3FHQA 4LGXA 4FLSA 5A6SA 4JL2A 4J7RA 1W1YA 1EQCA 1K9DA 1JFXA 1QI3A 1UD8A 3VOCA 4UR9A 4ATWA 3WIJA 1I1WA 1OD8A 2PWGA 3ARXA 3PZVA 5JBFA 2B31A 2WCSA 1H2JA 2WC4A 1BYAA 1E55A 3VUPA 1OD0A 3WQ6A 4CD6A 4MDOA 2WAGA 4HP5A 3BLPX 3LPFA 1UKTA 3CUFA 1US2A 1EIBA 1R8LA 2V3FA 4BF7A 1VFFA 4R5EA 4RE3A 5JIPA 2E9BA 4TX8A 4HZ6A 5D8WA 3ZQ9A 4PBGA 4PMVA 3TTQA 2F2HA 4F9DA 3AIEA 2E9LA 1UHVA 1PX4A 1V02E 2C8NA 3ARYA 3MMWA 2OYMA 4L4OA 2WZIA 2VMFA 4U5IA 1WDPA 2QPSA 3VIOA 1QNQA 1JD9A 5A6KA 1US3A 1BF2A 7A3HA 1H3GA 2J7HA 2V5DA 1BAGA 4GZJA 3PZIA 4PMXA 2A3EA 4GXPA 5AYIA 3WQ5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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