2W66A

Btgh84 in complex with hq602
Total Genus 244
100200300400500600050100150200250
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
244
sequence length
712
structure length
647
Chain Sequence
SLQPPPQQLIVQNKTIDLPAVYQLNGGEEANPHAVKVLKELLSGKQSSKKGMLISIGEKGDKSVRKYSRQIPDHKEGYYLSVNEKEIVLAGNDERGTYYALQTFAQLLKDGKLPEVEIKDYPSVRYRGVVEGFYGTPWSHQARLSQLKFYGKNKMNTYIYGPKDDPYHSAPNWRLPYPDKEAAQLQELVAVANENEVDFVWAIHPGQDIKWNKEDRDLLLAKFEKMYQLGVRSFAVFFDDISGEGTNPQKQAELLNYIDEKFAQVKPDINQLVMCPTEYNKSWSNPNGNYLTTLGDKLNPSIQIMWTGDRVISDITRDGISWINERIKRPAYIWWNFPVSDYVRDHLLLGPVYGNDTTIAKEMSGFVTNPMEHAESSKIAIYSVASYAWNPAKYDTWQTWKDAIRTILPSAAEELECFAMHNSDLGPNGHGYRREESMDIQPAAERFLKAFKEGKNYDKADFETLQYTFERMKESADILLMNTENKPLIVEITPWVHQFKLTAEMGEEVLKMVEGRNESYFLRKYNHVKALQQQMFYIDQTSNQNPYQPGVKTATRVIKPLIDRTFATVVKFFNQKFNAHLDATTDYMPHKMLPLQVKANRVLISPVEIELDAIYPGENIQINFRLSAGLQKAPVKFVRFFVLTIEK
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
publication title Molecular Basis for Inhibition of Gh84 Glycoside Hydrolases by Substituted Azepanes: Conformational Flexibility Enables Probing of Substrate Distortion.
pubmed doi rcsb
molecule keywords O-GLCNACASE BT_4395
total genus 244
structure length 647
sequence length 712
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2008-12-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
A PF18344 CBM32 Carbohydrate binding module family 32
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 2w66A03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2w66A02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 2w66A01
1W3HA 1NOUA 3SUWA 1NWRA 3A4WA 2BXYA 3BCFA 1ECEA 3OGSA 1V6UA 4M29A 4FLRA 3WIJA 3U57A 4RE3A 1NARA 1PZ2A 3RCNA 5JIPA 3BAIA 4PMRA 3M07A 3ZSTA 3WDQA 2QV4A 2V5DA 2JIWA 5DT5A 5E6YA 5F7UA 2XGBA 3TOPA 3ZT6A 1E5JA 3HN3A 3QHNA 3K4DA 5CXPA 2DT0A 3VDHA 1EOKA 5A6LA 1KWKA 2BV9A 3MMWA 4TVCA 2CEQA 2B31A 1OCQA 1W3KA 3WQWA 1I1WA 1ISVA 2QLYA 4GIAA 2VX7A 4RE4A 4MB3A 1SR0A 1JFXA 2D24A 3I3BA 3WBAA 1B3ZA 1VFUA 2XIIA 3FY1A 2YL6A 2A3EA 2HVMA 4JCLA 3VIOA 4HOZA 5BXSA 1XSJA 1E0VA 3W6LA 3QHOA 1DWHM 1MVYA 1UKOA 2VX4A 1HXJA 1V0KA 2ESCA 1IZJA 2XFRA 1EH9A 1HJWA 2DT2A 2ZX7A 3ZO9A 4AD1A 1KXTA 2EPKX 1JL8A 1GOMA 1UA7A 2WPGA 1Q6GA 3WQVA 4AD4A 3NUKA 1LWJA 4KGLA 4QLJA 1WKYA 2ZIDA 1W1TA 1B0IA 4E4PA 2Z1SA 1X6LA 3VGHA 1QHPA 1UKTA 3GM8A 4OZOA 3WFZA 2WC4A 2VZTA 3D5HA 3WD0A 1XH0A 4X0NA 2W92A 3M6DA 1CYGA 1VIWA 3FHQA 3VIIA 3WH5A 5M5DA 5A2CA 2AOSA 4W87A 5I2UA 4U3AA 3UG5A 2XTKA 2VRKA 3IJ8A 2D0FA 4LQ1A 1NOFA 5D8ZA 1K9EA 1GHSA 1OT2A 2BY1A 5GNYA 1EXPA 3AHTA 3VIHA 1VEPA 2JE8A 3PBGA 4QLKA 1W9VA 2CYGA 3VNZA 3CHCA 1D3CA 1KXVA 4MNMA 3POCA 3A4XA 3VDAA 1DP0A 1XD1A 3DC0A 1TE1A 2J7GA 2WMIB 4Z2GA 3WSUA 1HL8A 4PCSA 3ZMRA 3II1A 2Y4SA 5ABHA 1DWJM 4MPKA 2OWXA 2ZUMA 4J3TA 5A8MA 3VGBA 3SCQA 4E8CA 1ITXA 1UH2A 4WLCA 4C7DA 4EKJA 4CD7A 1C8QA 3BAXA 1H5VA 2V38A 2DDXA 2PBOA 5D8WA 5IFTA 4MADA 3ZSSA 4TX6A 3EYPA 4YN5A 1E4NA 2WSKA 2CBJA 1JDAA 1V3KA 1QI4A 1KFWA 3CUJA 3WF0A 5BXPA 2XM1A 2V3DA 4RE2A 3WD1A 4QFUA 4D6DA 1G01A 1PPIA 3W27A 4AZ5A 2ZICA 2YL8A 3VIMA 1VJSA 1DWGM 1B30A 3BAWA 3VILA 3MV01 2ZUNA 1ODZA 4AIEA 2DH3A 3GBDA 1C93A 3GBEA 1R87A 4MDPA 4JFTA 7CGTA 3A4AA 5CPTA 2GK1A 2E8ZA 1SMAA 4NZCA 1MFVA 4P8UA 5DT7A 3CUIA 4ML4A 1UHVA 1ZL1A 3PZOA 1JYXA 3VX0A 2YIHA 1QI0A 4OOZA 1XSKA 4HA3A 1JF6A 3F5LA 2DEPA 3FN9A 1HN1A 3OGVA 1HJQA 4HZ6A 1E0XA 2VZUA 2JEPA 1HVXA 5CLWA 1KBKA 2WVVB 3QR3A 3O2LA 1LLOA 2CITA 1BFNA 1CLVA 1FH7A 3DYMA 3NJ3A 4CGTA 2OYMA 1VRXA 1GHRA 3L2LA 3PZTA 4LYQA 4S3KA 4XUYA 3PTQA 4PTWA 4CN1A 1E3XA 2CETA 1Y7VA 3L4UA 1EO7A 3SCSA 4CU6A 1BPLB 5GNZA 2WMKA 2VCCA 4D72A 3K8MA 2RGMA 5ABFA 3B9EA 1NWTA 4UCFA 1CXIA 2DIEA 5I6SA 1KGUA 2DT1A 2XYLA 3OZOA 4U3CA 5A95A 4ACZA 2J25A 1MQPA 4HP5A 3A47A 2DSVA 2DQXA 2CBVA 3NSMA 1VAHA 3CHDA 3AHYA 1S46A 1KGWA 2VRQA 3VGDA 2CPUA 3U5UA 4GZEA 1BVNP 1TA3B 4LYPA 4Z2HA 3VU2A 1PX8A 3RJXA 4LXFA 1UUQA 3SIMA 1GW1A 4A3HA 1V0LA 1CGXA 1BF2A 1NH6A 2G3MA 1CDGA 1E73M 1E1EA 1GORA 4LPCA 1V3MA 3WH7A 4PUEA 2X0YA 1IT0A 1R86A 3G6LA 3VPLA 2OSXA 2PB1A 2QF8A 4UQ9A 5CGMA 4D1JA 1VBRA 2PWGA 1UKSA 1HKJA 1QNQA 2CKRA 4HZ7A 4AD3A 1UR9A 1VFOA 3AROA 3PN8A 4JHZA 1QNRA 1V3JA 3ALFA 4WJXA 3O6AA 5CJ5A 4GZIA 4W89A 3OLGA 1C92A 2GJXA 1TUXA 3ECQA 1GPFA 5A8PA 4PMOA 2XG9A 1OIFA 1R7AA 4DWSD 1OB0A 2ZX6A 1CECA 3ARTA 4AZ6A 1OIMA 2FH6A 1W1YA 3ARPA 5DFAA 4TXEA 3CHFA 3GNOA 4DUWA 4U31A 2VUYA 3SCRA 4UOZA 4FLSA 3SCUA 5IXEA 3VGGA 3GYCA 3BAKA 1QHOA 4PMYA 1GOKA 5I0DA 1X6NA 3VTRA 3SUUA 2WSPA 1XC6A 5BCAA 1ZJBA 1M7XA 1E4LA 3L4YA 1GOOA 2WNWA 1N82A 4P7QA 1H2JA 1CGVA 2J74A 2ZUUA 4W8BA 4FLOA 5I5RA 4YHGA 1M53A 1JZ3A 3WF3A 5E70A 1J0IA 1V02E 2J78A 3EDJA 1JI2A 3IK2A 2EO7A 3OLDA 1JI1A 1ZB5A 3T0DA 1W9XA 2WCSA 2ZXBA 2PWFA 4PTMA 1H11A 1LF1A 4JIEA 4J28A 4JAWA 1LWHA 2FHCA 3AIVA 1UWSA 3SURA 2BVTA 1QBBA 3W29A 1FP9A 2ZX9A 1SYTA 1KCKA 4DWSA 2QMJA 2JF6A 3AYSA 4PSRA 3WENA 3CUHA 3VDBA 1GOQA 5LYRA 2XVNA 1UWUA 3BC9A 1L0PA 1W2VA 2WYSA 4PEEA 2V3FA 3T2QA 4D6FA 2GDVA 3N1AA 3GZAA 5DEZA 1IV8A 2VX5A 2J4GA 3RM4A 4HTYA 3KL5A 3VO0A 2FGLA 3BSHA 3K4AA 2OSYA 5JUVA 1OD8A 2Y8VA 2OLHA 4DUXA 1V6YA 2G4FA 4WSJA 2ZWZA 2WZHA 1KWGA 1FP8A 4W86A 4ZE5A 2BS9A 5GPRA 3MUIA 1NWSA 1H3GA 4CCEA 3ZR5A 2CERA 4N0RA 1JG9A 2EXOA 3ARSA 2XJ7A 3MUZ1 4JZ5A 3ZJ6A 4OJYA 5HDRA 1V08A 2J7FA 2YDQA 1UD4A 5AC5A 5EB8A 1CXFA 3WDIA 3TTQA 3AIWA 1C8XA 4UR9A 1BYDA 3OLIA 5KZ6A 1XCWA 4QLLA 1OGSA 1U30A 2ZX8A 4H2CA 1FH8A 3VD3A 3ZR6A 1A47A 3KL0A 3U7BA 3WMBA 3ARUA 1CXLA 3WNNA 1RH9A 4M80A 1UZ1A 2WMJA 3BAYA 2D0GA 4W8AA 4B3LA 2W4XA 1EA9C 1WP6A 4BQ2A 3MU7A 3WNMA 3N11A 3GXFA 4U5IA 3N15A 2WW5A 4UFMA 2JFEX 5E0CA 2WMFA 4AD5A 4JL2A 3ZT7A 1BLIA 3TTSA 1V3IA 3VM5A 2ZE0A 4DM1A 2YL5A 5JBFA 4CD8A 2X05A 5IFPA 4EK7A 2VI0A 1JGIA 3VMPA 4AMCA 4GI8A 4WF7A 1QNPA 2PWDA 4AIUA 1DWFM 1ESWA 1WDPA 1J0JA 4AZCA 4W7WA 1RP8A 3AMLA 5C71A 1GQLA 3AMGA 2ZUVA 5C70A 4IPLA 4TX8A 3VMOA 1UR2A 3FAWA 5D9NA 3SCWA 5EMYA 2PC8A 2QPUA 4WKFA 1GOWA 2WBKA 2UY5A 5EBAA 4HU0A 4QCEA 4AZBA 1HJUA 4W8LA 1QNOA 5AYIA 5D9PA 4XZWA 3UR8A 3DHPA 2G3NA 3U5YA 1WZAA 2C8NA 1WDQA 2XVPA 5HBFA 4OUEA 2Z1KA 4D6GA 1GOIA 3ZM8A 2FHBA 4UQEA 3MSDA 3MS8A 4MAZA 4F66A 4J3VA 1M01A 3BCDA 3VGFA 1XH1A 5E6ZA 1UWIA 3J7HA 4UFJA 1C90A 3FW6A 2IXVA 2GSJA 4TTGA 1TR1A 1UKPA 3WUFA 4QCFA 1K9TA 1BVZA 3VNYA 1E6NA 3RJYA 2YBUA 2BY0A 4M24A 1LL4A 3LPOA 3WN6A 1EQCA 5IDIA 3SCTA 4BQ5A 4CN6A 4CU7A 1QPKA 4ACYA 1K6AA 1UQYA 2BY3A 3MKKA 1QW8A 1WE5A 1QI3A 2WWCA 3W6MA 4LYRA 4TVDA 3GTNA 2DPEA 1PX4A 3ZT5A 2XHYA 4WKAA 5TD4A 8A3HA 2WB5A 3RM9A 3NIYA 2EPMX 5ECUA 1KXQA 3AFBA 3OIHA 3ALGA 2Y2WA 2J62A 1KR1A 3EDDA 3PZQA 2VZOA 2E4TA 2WK2A 4URIA 5CSYA 2CIPA 1H1NA 4V2XA 3AXIA 5KEZA 3B9DA 2Q8XA 2EEXA 2JF7A 3TONA 1CBGA 5M3WA 5M03A 2WKLA 3A6OA 3N18A 3T09A 1EHAA 5BYWA 1FFRA 4ATDA 3GDBA 1MQQA 5D9OA 2ZOXA 1PIGA 4W7VA 4BA0A 3AZSA 1GJUA 3AS0A 2TAAA 3AJ7A 5FOOA 1ZBCA 2VR4A 1GQIA 1QNSA 4QAWA 4BCEA 1W9UA 1XH2A 3NSNA 3RILA 5JBDA 3AS2A 1JZ4A 4AD0A 3WDJA 2WMGA 1JF5A 3KEHA 1TZ7A 2D20A 3THCA 4NRRA 3WDHA 2EPLX 1CEOA 4B9ZA 3L2MA 4IM4A 4GKLA 1FOBA 5FIPA 1GJWA 2W67A 4F8XA 2BY2A 4HU8A 1C7SA 1UWQA 9CGTA 2ZXAA 2MANA 4PMDA 1TMQA 4AW7A 1KXHA 3PZUA 2J8GA 1LL7A 4UOJA 4IUGA 1E15A 5EFFA 2BXZA 2A3HA 4PMXA 4P7OA 5CZKA 2XWDA 1J12A 3BSGA 3PZMA 4OOUA 4H8HA 2ZUSA 1O7AA 2YOCA 2FH8A 4DWSC 1JYWA 5I77A 3ARVA 3K1DA 5HPOA 3GXMA 2J47A 3CPUA 1UOKA 5A6JA 3WQ8A 3VMNA 4H8VA 1V3LA 2V3EA 2J7BA 1VB9A 3SCOA 2JEQA 4PSPA 3ZJKA 3L4ZA 1JNDA 1JD9A 3WH8A 4UOQA 4EANA 4HMDA 4M8UA 1ISXA 2E9BA 1MYRA 3VIPA 4U2YA 1HF6A 3AZTA 4R5EA 1HJVA 3OBAA 1TCMA 5IHSA 1UH3A 3FAXA 2VO5A 1RD6A 2CESA 4PMNA 2Y5EA 4MB1A 3WL0A 2PWHA 3TTOA 2VCBA 6TAAA 1W1VA 2WCGA 3TA9A 3NDZA 2CHNA 1BG9A 3VKKA 1XGZA 2BHUA 4V27A 3VINA 5CSUA 1B31A 4D6HA 4BF7A 2J8FA 3OB8A 1BG4A 4YHEA 1CGTA 4KMQA 4AD2A 1JDCA 1LG1A 1B9ZA 2J7EA 4M56A 3VUPA 1G0CA 1WCGA 1E1FA 1NWUA 3AICA 2W61A 4ZE4A 2W62A 4EAMA 2PWEA 4KRUA 1G5AA 2X8RA 2Y8KA 3S6TA 3W82A 3VIJA 1UQZA 4KH2A 4MB4A 2A3CA 5LA1A 3CZEA 1XRVA 3VDCA 2JIEA 1ITCA 1W9DM 5FD0A 1QW9A 2WKGA 2ZUWA 1A3HA 3CTTA 5A69A 4HMCA 4PCTA 2IXUA 2BHZA 3DYPA 4HOWA 3LMYA 2VCAA 1UA3A 5A6AA 2DSWA 4PMZA 4UQDA 4J3SA 1W91A 2G41A 2VVSA 1CPUA 2WVTA 3WDRA 1CGUA 2EJ1A 2O92A 1CTNA 4TOQA 2EBNA 1CZ1A 2WVUA 4BQ3A 1WNOA 4PMVA 3W4RA 3WL1A 1B3XA 2F61A 2XIBA 2WAGA 3QHMA 4W85A 3GXDA 1HJSA 4L4PA 4PUDA 4B16A 4U2ZA 1ODUA 3BMVA 3OZPA 3WD2A 3MMDA 3NSXA 4CN4A 1TVPA 2PBGA 2DH2A 4JKKA 5A2BA 1L8NA 2YA1A 3RM8A 5A6SA 4J27A 5DO8A 3WUGA 4H04A 3VIGA 3W28A 3EMZA 3KWXA 2E9LA 2XUCA 1B3WA 3UCQA 2QPSA 1UYQA 4ZXLA 1HKIA 5DF0A 1UD8A 4F79A 1CNVA 3CMGA 3WNLA 2XM2A 4HA1A 3AS3A 3GH7A 3AS1A 2WVSA 2YBTA 1H09A 2ZUTA 4XX6A 4AISA 2UY4A 1ZBVA 1J01A 1GUVA 1DEDA 1HL9A 4D1IA 1HP4A 3F5KA 5CG0A 1V0NA 1GZJA 2VTFA 3FHAA 1WZLA 3AIBA 1QOXA 2J7CA 2WMIA 1OBAA 3POHA 2CBUA 1BYAA 3WD3A 2WC3A 4C7GA 1EDQA 1BYCA 3WEMA 4FK9A 3WKZA 1JYNA 1AQMA 2XFYA 3AHXA 1UWRA 1KGXA 4P8XA 1BGAA 4ATLA 2NT0A 2WLYA 1JDDA 3VIKA 1PJ9A 4PMUA 1AQHA 4UZSA 3ARXA 5E0FA 1QVBA 3AXXA 2VVNA 4Q22A 4JFWA 3T0BA 1GQKA 4CD6A 3N04A 1C7TA 1CLXA 3WH9A 4X0VA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1W3H A;  1NOU A;  3SUW A;  1NWR A;  3A4W A;  2BXY A;  3BCF A;  1ECE A;  3OGS A;  1V6U A;  4M29 A;  4FLR A;  3WIJ A;  3U57 A;  4RE3 A;  1NAR A;  1PZ2 A;  3RCN A;  5JIP A;  3BAI A;  4PMR A;  3M07 A;  3ZST A;  3WDQ A;  2QV4 A;  2V5D A;  2JIW A;  5DT5 A;  5E6Y A;  5F7U A;  2XGB A;  3TOP A;  3ZT6 A;  1E5J A;  3HN3 A;  3QHN A;  3K4D A;  5CXP A;  2DT0 A;  3VDH A;  1EOK A;  5A6L A;  1KWK A;  2BV9 A;  3MMW A;  4TVC A;  2CEQ A;  2B31 A;  1OCQ A;  1W3K A;  3WQW A;  1I1W A;  1ISV A;  2QLY A;  4GIA A;  2VX7 A;  4RE4 A;  4MB3 A;  1SR0 A;  1JFX A;  2D24 A;  3I3B A;  3WBA A;  1B3Z A;  1VFU A;  2XII A;  3FY1 A;  2YL6 A;  2A3E A;  2HVM A;  4JCL A;  3VIO A;  4HOZ A;  5BXS A;  1XSJ A;  1E0V A;  3W6L A;  3QHO A;  1DWH M;  1MVY A;  1UKO A;  2VX4 A;  1HXJ A;  1V0K A;  2ESC A;  1IZJ A;  2XFR A;  1EH9 A;  1HJW A;  2DT2 A;  2ZX7 A;  3ZO9 A;  4AD1 A;  1KXT A;  2EPK X;  1JL8 A;  1GOM A;  1UA7 A;  2WPG A;  1Q6G A;  3WQV A;  4AD4 A;  3NUK A;  1LWJ A;  4KGL A;  4QLJ A;  1WKY A;  2ZID A;  1W1T A;  1B0I A;  4E4P A;  2Z1S A; 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