2W67A

Btgh84 in complex with fma34
Total Genus 243
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
243
sequence length
711
structure length
642
Chain Sequence
LQPPPQQLIVQNKTIDLPAVYQLNGGEEANPHAVKVLKELLSGKQSKGMLISIGEKGDKSVRKYSRQIPDHKEGYYLSVNEKEIVLAGNDERGTYYALQTFAQLLKDGKLPEVEIKDYPSVRYRGVVEGFYGTPWSHQARLSQLKFYGKNKMNTYIYGPKDDPYHSAPNWRLPYPDKEAAQLQELVAVANENEVDFVWAIHPGQDIKWNKEDRDLLLAKFEKMYQLGVRSFAVFFDDISGEGTNPQKQAELLNYIDEKFAQVKPDINQLVMCPTEYNKSWSNPNGNYLTTLGDKLNPSIQIMWTGDRVISDITRDGISWINERIKRPAYIWWNFPVSDYVRDHLLLGPVYGNDTTIAKEMSGFVTNPMEHAESSKIAIYSVASYAWNPAKYDTWQTWKDAIRTILPSAAEELECFAMHNSDLGPNGHGYRREESMDIQPAAERFLKAFKEGKNYDKADFETLQYTFERMKESADILLMNTENKPLIVEITPWVHQFKLTAEMGEEVLKMVEGRNESYFLRKYNHVKALQQQMFYIDQTSNQNPYQPGVKTATRVIKPLIDRTFATVVKFFNQKFNAHLDATTDYMPHKMNLPLQVKANRVLISPVEIELDAIYPGENIQINFGLQKAPVKFVRFQFVLTIEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Molecular Basis for Inhibition of Gh84 Glycoside Hydrolases by Substituted Azepanes: Conformational Flexibility Enables Probing of Substrate Distortion.
pubmed doi rcsb
molecule keywords O-GLCNACASE BT_4395
molecule tags Hydrolase
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
total genus 243
structure length 642
sequence length 711
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2008-12-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
A PF18344 CBM32 Carbohydrate binding module family 32
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 2w67A03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2w67A02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 2w67A01
4AIOA 4ATLA 3TTYA 3W27A 3WNPA 3O2LA 4ACYA 1AQHA 4DUXA 1LL6A 2VZVA 4W88A 3ZSTA 1GOIA 5GQBA 4UFIA 3GM8A 4D6HA 4EK7A 1KR0A 2CBUA 4WK9A 2DSVA 2D23A 2ZX8A 1FH7A 5A6BA 9CGTA 4CVWA 3W24A 2PI6A 3AMGA 3WNLA 4FLRA 4ZXLA 3OLDA 3N17A 2D3NA 1CXEA 1HKIA 4AD2A 3VIPA 1TVPA 1ITXA 2E8YA 1KGXA 3FAXA 5DEZA 1Y7VA 2GSJA 3BSGA 4E8DA 4CD6A 3LPGA 4CCDA 1X6LA 2Y5EA 1TE1A 4UNIA 5CLTA 3CZJA 1JZ4A 3AXIA 3HU7A 3ZOAA 4UTFA 2DQXA 3WNOA 1V08A 1V3JA 3BMWA 1ZS2A 1GVYA 1V6YA 4CCCA 1NWRA 1WAWA 2DT2A 3WQWA 2HVMA 3D3AA 1J0ZA 3PZ9A 4BA0A 1GOKA 1VEPA 4TX8A 3VX1A 4QDMA 4H8VA 4KGJA 4Q22A 1UG6A 3W0KA 4UCFA 3IJ9A 3WKZA 4UQEA 4AZ6A 4LPCA 4D6IA 4FF5A 4Z2IA 4PUDA 2XFRA 4UQBA 3CZ8A 4YN5A 5AYIA 2BXZA 3PZMA 2NW0A 5FD0A 2X0HA 4ZEPA 4DWSB 1OT1A 3F5KA 1V0LA 3A4XA 4JKLA 3ZMRA 5AC4A 3GZAA 4MADA 3AHYA 2CERA 3U5YA 2PF0A 1OIMA 3CHEA 4UFKA 5A6JA 3IAQA 2G3IA 5CXPA 3WIJA 1W1TA 4P7OA 1W9XA 2BVTA 1LG1A 1QHZA 5CPTA 4M56A 1JI1A 1KWKA 4P7LA 3VMPA 4QAWA 1CIUA 2XSBA 4YHEA 1OSEA 1V3IA 3K8KA 3WDHA 6CGTA 2XGBA 1WDPA 1JAKA 3WD3A 3CBWA 1WB0A 1J0KA 3WN6A 4H2CA 4YPJA 3EMQA 3ZQ9A 1HVXA 2W67A 1JYWA 1TR1A 1GQLA 4CD4A 1UH2A 4DUWA 4Z2HA 2GK1B 1CXLA 3VKKA 1EOKA 2WCSA 4FLOA 4AW7A 2Y2WA 3L4WA 2BHYA 2ZOXA 1DTUA 3ZIZA 1UQYA 1UZ4A 3M7SA 1HJSA 2DGAA 3AXHA 5TD4A 2J75A 2WAGA 1UWUA 3NSNA 1MXDA 1MFVA 2WVVA 3T0DA 2ZUSA 1C90A 2PWEA 1E5JA 3N9KA 4IPNB 4R27A 1DWGM 1HIZA 1E3XA 3WH5A 2WZHA 3TA9A 3K8LA 1CXFA 1JZ2A 3MV01 5A1AA 3DECA 3AHVA 1JDCA 2CKSA 4KGLA 5E70A 1R7AA 4HU0A 1D3CA 3W81A 1HKMA 2DH3A 2JF7A 3VILA 1E4MM 2OSYA 2ZX5A 3POCA 2VZOA 3WL1A 3WDJA 1J9YA 2XM1A 4D6DA 3VGBA 2GJXB 1VRXA 1UR1A 2YLAA 2VNCA 2PWDA 1M53A 2WYSA 2J7DA 3SUSA 4PYSA 4NRSA 4W7WA 1KBBA 5I2UA 3VD4A 4BQ5A 4D71A 1VFOA 4MTVA 4QP0A 2V3EA 3AMKA 2WWCA 1EOMA 3EDEA 3HMCA 3AS0A 1XD0A 3WL0A 4U33A 3DYMA 1I1WA 2J78A 3GXIA 3W29A 3SUWA 3MV11 3PZGA 4PSRA 4J28A 4PUEA 1WDSA 2QF8A 2VX5A 2WLYA 2DSZA 2XWDA 4MDPA 1CGVA 1W9PA 1C93A 3NJ3A 1HL8A 4LYRA 2YKKA 1GORA 3N1AA 5D4YA 4AIEA 5BXRA 4GXPA 1QI5A 2YL5A 3WUGA 1TA3A 1XH0A 1KFWA 4GKLA 1H3GA 2O9PA 3UR7A 2WKGA 2WLZA 4OBSA 1HT6A 1HX0A 1V3HA 1JFHA 1JZ6A 1C92A 1UD4A 4WSJA 1PAMA 1C7SA 2OSWA 3ZR5A 2OWWA 5FOOA 1XSIA 5EB8A 1QBAA 5IXEA 3MANA 3NDZA 1CGWA 1GVIA 3AXXA 1GW1A 5BXTA 1QVBA 3VVGA 2DSUA 2BY1A 3QHNA 4ACZA 5I78A 4C91A 3ARZA 5D8WA 1B3VA 5HPOA 3RILA 2D3LA 1J11A 3CIVA 4PRWA 4EAMA 1E6NA 5CGTA 2VX6A 4WSKA 1TZ7A 3NIYA 4MB4A 1LWHA 5M03A 4P7QA 4W5ZA 1JGIA 2WC4A 3EDFA 4A3YA 2OYLA 3ZM8A 1XYFA 1L0PA 2WC3A 3E1F1 3WF3A 1BYDA 2WMIA 2D1ZA 2CITA 1B30A 1RH9A 3FY1A 3AQUA 1EDGA 2WMFA 1PZ3A 2CIPA 1YHTA 5IFTA 4JHZA 1J0IA 2X8RA 3AOFA 3FHQA 1XHGA 3WH6A 2VI0A 2RGMA 1UD2A 2VZUA 1VBRA 1XV8A 3K4DA 3W6LA 3WBAA 2ZXBA 4HZ7A 2ZUWA 3WF2A 1UQZA 3IJ8A 4AEEA 5FKYA 3L4YA 3VM5A 1BYBA 4LYPA 4X0NA 3WEZA 2OWXA 4W7VA 1R7OA 3I3BA 4FMVA 2G3MA 4CUCA 3PZUA 2V5DA 4HPGA 3MUIA 3CMJA 4AZBA 4ZXOA 1B31A 1U2YA 3WF0A 1BG4A 2TAAA 3SUTA 2NSXA 4QLKA 4H04A 3OGVA 1U30A 3KZSA 3ZJ8A 2EQDA 1MQQA 4WIWA 3FXYA 2X0YA 5HBFA 3UG3A 3KWXA 3UR8A 1UWTA 5CG0A 3VMOA 3ZR6A 5JIPA 4TTGA 7A3HA 2PC8A 2G3JA 2YLLA 3FAWA 3T0AA 3SIMA 1HJVA 2ZXAA 5BXSA 1K9EA 3HN3A 2DSKA 5D9MA 3GYCA 1FH9A 4UFHA 4U2YA 3ARQA 3OGRA 3OZPA 1KB3A 1EO5A 1XCXA 4V27A 2EJ1A 5GNXA 1GQIA 3BLKA 1DWJM 2WHMA 4LYQA 3CHFA 1MYRA 2PBGA 3AIBA 2YIHA 1VBUA 2XGIA 3DHPA 5AC5A 2XVPA 1UD3A 3WMCA 3ZJ6A 3EBVA 2A3EA 5CSUA 4Z2JA 3MKKA 3RJYA 4HZ8A 3K46A 3WFLA 1CYGA 4DWSC 1MXGA 3PZVA 4GO8A 4UOQA 1Z32X 4S3JA 3UG4A 4W84A 2WXDM 1JFXA 3GXDA 1PIGA 3WNMA 2ZXQA 4PEEA 4WKAA 1K6AA 2W61A 5BXPA 5D9PA 2XVLA 4MB1A 4D1IA 3JUGA 1KQYA 1QOXA 1CDGA 1W3KA 2NT0A 4X9YA 1JAEA 4AIUA 1E9LA 4PMZA 4W85A 4PN2A 3TTSA 2XWEA 3BAXA 4AD5A 2A3HA 4CD5A 1BF2A 4AZCB 2CETA 1UWQA 4AXNA 4Z2GA 3WY1A 4PMRA 1ESWA 3VGDA 2J47A 3POHA 3N04A 2D0GA 2DDXA 1UWIA 5JBDA 2BY2A 1KCLA 3GBEA 4M8UA 4UOZA 1XRVA 1GNXA 3KL0A 4ZE5A 1PX3A 3THDA 3W82A 4V28A 5ABFB 2WWDA 2O9RA 2A3AA 5A3HA 1ODUA 3T2PA 1KCKA 1QNPA 4W86A 1E6ZA 1DWIM 1TCMA 2MANA 3VGFA 4J3VA 5ECUA 3PHAA 1KGUA 3WMBA 2WMHA 2F8QA 4KRTA 1KGWA 3ARUA 4A3HA 3IANA 2WCGA 2ZXDA 3PTMA 2W4XA 4PMDA 4DWSD 1Q6CA 3CUJA 4BQ2A 1EH9A 4WKFA 1FA2A 2J7EA 1CLVA 3MUZ1 1TMQA 4UQAA 3WBEA 4GI6A 3AMCA 3NCOA 1OINA 1V03A 2Z1KA 5M5DA 1EO7A 1SMDA 3ZO9A 1PZ2A 3BC9A 1W3JA 1UWSA 3IJ7A 1XGZA 2WM0A 3VD5A 2UWFA 3VDCA 1G01A 1O7AA 3RM9A 2GJRA 1J18A 2Y24A 2XHYA 5IDIA 4AZ7A 4TOQA 4PMVA 4W89A 2J7HA 4HA3A 4UR9A 1C8YA 4KRUA 1SYTA 3OLIA 2HISA 3T2OA 2QMKA 5I3DA 1JF6A 3W4RA 3L4ZA 1L8NA 3ALFA 4F66A 3WH8A 1TG7A 2C7FA 1CGUA 1U33A 3WMSA 3ZJ7A 2XIIA 2J7FA 1J0YA 4GQRA 4AZ5A 2YBUA 4J3SA 2YDRA 4OOUA 4AEFA 3W53A 3QOMA 3EDKA 3A6OA 1H1NA 1G5AA 2DH2A 3AMDA 1QNQA 1JNEA 1ZU8A 3WNNA 2FH6A 3OA5A 3M46A 4U5KA 1K9FA 1LLOA 3W28A 1E71M 2J7CA 1GOQA 4W87A 1QI4A 1E1FA 4JCLA 2J7BA 1GUVA 1WO2A 1VB9A 1E4LA 3ARYA 2BFGA 5E0CA 1KQZA 2XSAA 1NWUA 3VO0A 2F61A 2DSWA 4AWEA 5FL1A 1ZBWA 1E0XA 3CZEA 5JBEA 1RP9A 4WLCA 2J62A 1QI2A 1IT0A 3CHDA 5HDRA 4R5EA 1J0JA 2QLYA 3N18A 1SR0A 5HPCA 4E8CA 3MO4A 4S3KA 3AHXA 1VJSA 1E0VA 2VJXA 4CN6A 3QGVA 2VL4A 4BQ3A 4MAZA 1M7XA 1GJUA 4IPLA 1UH3A 4NSBA 5JUVA 3SEPA 2WANA 2FHCA 1E40A 2VT0A 4MNMA 4U2ZA 3MS8A 1FFQA 3I3EA 1CECA 1VAHA 1W1VA 2B31A 2ZUMA 2XTKA 4JFTA 2D0FA 3HJEA 1WE5A 4UZUA 3VMNA 2CBVA 1MFUA 1VF8A 2WVUA 3ZSSA 2EBNA 1G9HA 1GHRA 1PIFA 1O6IA 3A47A 1V3LA 3TONA 4C90A 5I77A 6TAAA 4AC1X 5E6ZA 2BY3A 3VTRA 4QCEA 3T0BA 1E1EA 2E9MA 1EQCA 3BAJA 3VX0A 3LPFA 1WZAA 2V38A 1E70M 2OLHA 1H11A 3GDBA 1V6VA 3KEHA 1MW3A 4HTYA 4DWSA 4MJ2A 2X05A 1BYAA 4J27A 5EBAA 2YBTA 2JE8A 4XZBA 1NH6A 2V5CA 5A8MA 4U3CA 2CXGA 1BPLB 2E9BA 3TP4A 1EDTA 3VNZA 2PBOA 1BFNA 4YHGA 4P7RA 4TVUA 3TTOA 2PB1A 4ACZB 4WKHA 3N15A 2WVSA 3B9EA 2OWCA 1NOFA 3FNDA 3AS2A 1B3WA 2C0HA 5A8QA 3AZSA 3CO4A 3U5UA 1M01A 1QHOA 2AOSA 4PMOA 2BVDA 4TTUA 1B0IA 2W66A 1GONA 1NOWA 4GPNA 4D6CA 2ZWYA 5AYBA 1JDDA 4HA1A 5CSYA 2JEPA 4EKJA 3WD2A 5I24A 5IFPA 1QBBA 1OBAA 2VOTA 4H8UA 5A8NA 1IZKA 2ZX6A 4U3AA 1R85A 1VEMA 4IUGA 4M1RA 4MJ4A 3WDRA 1V02A 3N12A 5GNYA 3CPUA 1CENA 2WMJA 4JKMA 2V3DA 5DT5A 2BHUA 1A3HA 1QNSA 5E6YA 2DPEA 3CHCA 5BCAA 1P6WA 4PMXA 2VX7A 1GQKA 3RO8A 2WMGA 2CHOA 1BGGA 4F8XA 3CTTA 4H8HA 3VIKA 3PZNA 4B3LA 3SCTA 2YOCA 1V6XA 2XG9A 1UR0A 1OT2A 3FW6A 2VR4A 1OIFA 1DWHM 2VUYA 3AIEA 3WQ4A 2ZUVA 5EFDA 2GJXA 4AYSA 4BF7A 3WUEA 4HMCA 3U7VA 2E9LA 2CKRA 1E6PA 1W32A 1ZJBA 3AIVA 4L4PA 3RM8A 1WZKA 3WFZA 2VZTA 1VJZA 1K9TA 3ZT6A 3F4VA 5A94A 5A6LA 1UD5A 2WK2A 2F2HA 1R87A 3AHZA 2VCAA 2WPGA 2G4FA 3VGHA 4CCEA 1JZ7A 3F5JA 4HOWA 3BXWA 4HA4A 1EHAA 5FCZA 1KXVA 4B3KA 2A3BA 4PMNA 5ABGA 4J7RA 1VENA 5I79A 4DUVA 1WKYA 4ZENA 2WSPA 4PMYA 3GNPA 5GNZA 4PSPA 2G41A 3SCPA 3F5LA 3VU2A 3WDPP 1DEDA 1JDAA 4NI3A 3W38A 1C8XA 2NT1A 3UCQA 2CHNA 1ISXA 2ZUUA 1QW9A 1RPKA 1NWTA 1H09A 3BCFA 5GPRA 4C7DA 3QOKA 1X6NA 2UY4A 2XM2A 3AFBA 3WEOA 1B3XA 1BYCA 1MW1A 2G3NA 1HJWA 1UR2A 2W91A 1UKTA 1J01A 3L4XA 1E0WA 2WCAA 3PTKA 4URIA 4V2XA 4F9JA 3IK2A 3PZTA 3T2QA 1JZ5A 5HXMA 1QI3A 4AZIA 5CPQA 2UY5A 1HJUA 1E4NA 1QW8A 4MNKA 2WMKA 4P8VA 1UD8A 4F79A 3WNKA 2JEQA 2YA2A 2G8ZA 3CLWA 4JAWA 2J25A 3ARRA 3WDQA 2VCBA 3SURA 3VIHA 3UESA 1J12A 4JFVA 4XB3A 3MUAA 4UQ9A 1E6XM 4PCSA 4GI8A 1YQ2A 2ZWZA 4RE3A 2X09A 2CPUA 1B3YA 1DWFM 5I5RA 4MAVA 5ABEA 3OBAA 3UERA 4EE9A 1W9VA 3ARWA 3N13A 4J3TA 2YL9A 1CWYA 2FH8A 3ARSA 4PBGA 1NARA 2PWHA 2QPUA 3SCOA 3GBDA 3AIQA 2FGLA 1V3KA 2C8NA 3BH4A 2BY0A 1JD7A 1WDQA 5IHSA 1NP0A 3VDBA 5C71A 1D2KA 1B2YA 3U7BA 1NOUA 1UD6A 1W1YA 1WDRA 4MDOA 3WQ5A 1US2A 1D7FA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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