2WB5A

Glcnacstatins are nanomolar inhibitors of human o-glcnacase inducing cellular hyper-o-glcnacylation
Total Genus 227
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
227
sequence length
585
structure length
584
Chain Sequence
QVLVPNLNPTPENLEVVGDGFKITSSINLVGEEEADENAVNALREFLTANNIEINSENDPNSTTLIIGEVDDDIPELDEALNGTTAENLKEEGYALVSNDGKIAIEGKDGDGTFYGVQTFKQLVKESNIPEVNITDYPTVSARGIVEGFYGTPWTHQDRLDQIKFYGENKLNTYIYAPKDDPYHREKWREPYPESEMQRMQELINASAENKVDFVFGISPGIDIRFDGDAGEEDFNHLITKAESLYDMGVRSFAIYWDDIQDKSAAKHAQVLNRFNEEFVKAKGDVKPLITVPTEYDTGAMVSNGQPRAYTRIFAETVDPSIEVMWTGPGVVTNEIPLSDAQLISGIYDRNMAVWWNYPVTDYFKGKLALGPMHGLDKGLNQYVDFFTVNPMEHAELSKISIHTAADYSWNMDNYDYDKAWNRAIDMLYGDLAEDMKVFANHSTRMDNKTWAKSGREDAPELRAKMDELWNKLSSKEDASALIEELYGEFARMEEACNNLKANLPEVALEECSRQLDELITLAQGDKASLDMIVALNEDTEAYESAKEIAQNKLNTALSSFAVISEKVAQSFIQEALSFDLTLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Glcnacstatins are Nanomolar Inhibitors of Human O-Glcnacase Inducing Cellular Hyper-O-Glcnacylation
pubmed doi rcsb
molecule keywords O-GLCNACASE NAGJ
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium perfringens
total genus 227
structure length 584
sequence length 585
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2009-02-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 2wb5A03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2wb5A02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 2wb5A01
1ZJBA 4U2ZA 5E6YA 1HVQA 4AZ5A 4UFLA 1GQLA 4C91A 3PN8A 5BRPA 2J4GA 2XGBA 2WHJA 4M56A 6TAAA 1EIBA 2EPKX 1HIZA 4KGLA 2IXVA 4FF5A 2D23A 2O92A 3SUSA 4N42A 3TA9A 1VRXA 1HJWA 4RE3A 4BZYA 5AC5A 1QHPA 4Y7EA 2XHYA 3PTQA 5I23A 3WDPP 3OBAA 4HOXA 1R86A 3AICA 4P7OA 5M3WA 1E6NA 5CLWA 2W66A 1GONA 3AMKA 1BG4A 7CGTA 4GKLA 1D3CA 2J7DA 1V02A 3AOFA 4ACZB 2YL6A 3MSGA 4PBGA 1J10A 4KRTA 4AY1A 2VVSA 3E1F1 2WANA 1HJQA 1XC6A 1GW1A 2E9MA 1VFUA 3IAQA 3AIWA 4DWSD 1UH4A 5BXRA 1V6XA 3NYDA 2W63A 3T2QA 3SIMA 4V28A 2VX5A 1ZBKA 5LA2A 4E8DA 3CHFA 4HA3A 4HOZA 3AS0A 3POHA 3HMCA 5DFAA 3VM7A 1J0KA 4X0VA 2WVVB 2WC7A 3AIUA 5I24A 4J3XA 2CHOA 1IZJA 4B9YA 1F4HA 4LQ1A 3RM9A 2YBUA 4D6IA 2V5CA 1UD8A 2VR4A 1HKIA 1KB3A 1PZ3A 2BHUA 3AIEA 4AZHA 1JNEA 3HU7A 3BLKA 1U33A 3VX0A 8A3HA 1B3ZA 2YDQA 1N82A 4JL2A 2CEQA 3MV11 4BF7A 1UA7A 4TTUA 2XFYA 2WMHA 3AMDA 4CD8A 2ZUVA 4NZCA 1UKQA 3K4DA 3KL0A 5CSYA 3W0KA 3ZSSA 1W3KA 3ARYA 2X05A 2W92A 2EBNA 3FW6A 3AMGA 2X8RA 1PX8A 1Z32X 3CZGA 1V3MA 4CN1A 1FHLA 3CMJA 4B3LA 4E4PA 3L4WA 2WHLA 1B3WA 3N13A 4LX4A 4F9DA 1H4PA 3CUJA 3ARVA 3RM4A 1QW9A 1BVNP 2EQDA 2J7BA 4MAVA 1ISWA 5A95A 4HZ7A 1O7AA 1OB0A 2GJXA 2OYLA 5A2CA 1E4MM 4AD2A 1JZ2A 3S6TA 3WH9A 1J18A 2E8ZA 2G3NA 1KCKA 2WPGA 2WVTA 1TA3A 3ZT5A 2WC4A 1JZ3A 1JZ4A 4AIEA 3WF1A 4M1RA 4CKQA 2EPOA 1JIBA 3L4UA 1WO2A 3KZSA 4EANA 4YN5A 4PSRA 4A3YA 1JG9A 3B9AA 4ZXOA 1V6YA 4W8AA 1VEPA 2WMFA 1W9UA 1EA9C 2ZUTA 3WF3A 4J3UA 2XVLA 3GXDA 3OB8A 3ZT7A 2ZWYA 1B31A 1GUVA 1NWSA 3VIGA 1B2YA 1WZAA 4OUEA 2VZOA 2J7CA 4AIUA 3WNOA 1C3FA 1JL8A 1LWHA 4H8VA 5CGTA 4OIFA 5JUVA 1PZ2A 4W86A 5EBAA 3ARWA 3WMCA 3GTNA 2BVDA 4UOQA 1EGZA 1W3JA 5HNNA 4PTXA 5GNYA 1BYBA 3QHOA 3WDQA 1UD5A 5CJ5A 3CLWA 3I3EA 3WUGA 3SCOA 3NIYA 1M7XA 4PMOA 3UG5A 2W4XA 4IISA 2CBUA 3KL3A 4HMCA 1UYQA 3EDDA 5JBFA 1MXGA 4MPKA 3EDFA 4W8BA 3BCDA 1F4AA 1LLOA 5HPCA 3TTYA 4LXFA 3RDKA 2XIIA 5D9PA 1B3VA 4J27A 4OOUA 5HBFA 1KCLA 4W85A 4JKMA 4PMYA 2DH3A 5ABFB 1KXQA 3GBDA 5M03A 1TMQA 3VGDA 4U3AA 4W7VA 3WQWA 5BWFA 2VRJA 3VGGA 1KQYA 2J75A 2G4FA 1LL4A 5CPQA 1JZ7A 2GJPA 3RJXA 2WLYA 4ATDA 3VD5A 5BRQA 3SCPA 3VGFA 2BHZA 1JI2A 3A6OA 3AFBA 4S3JA 2ZE0A 1GNXA 1ZL1A 2FHCA 3TTOA 4GZIA 4PYSA 3F5JA 3BGAA 2E4TA 4W7WA 2AMGA 4PCTA 1UR2A 4OOZA 3M6DA 2CCRA 3N9KA 1MQPA 2GDUA 1DP0A 2DT0A 1GOKA 2BHYA 2JIEA 4H2CA 2VX4A 3CUIA 1X6LA 3WQ6A 4ACYA 4CD5A 3A47A 3FHAA 2CERA 4AD5A 4J3SA 2YL5A 3BSGA 2NSXA 3NDZA 1Q6FA 4AMCA 3TOPA 3WF0A 2YDRA 4U33A 2ZUSA 3VMNA 1VBUA 1TVPA 3W28A 5AYIA 1ZS2A 1ZU8A 2VTFA 1CPUA 1J01A 1QNPA 3RJYA 1G0CA 2PWGA 4CCCA 1E40A 4PMUA 1KGUA 4Z2JA 2J79A 4GI9A 4QCEA 3VVGA 3VIFA 2CBVA 4J3TA 1CGXA 3PZMA 1W2VA 2RGLA 1R7OA 1XYZA 4J7RA 3NSMA 4HU8A 3NDYA 1O6IA 4ML4A 1JZ8A 4W87A 2VQTA 3VIJA 4AXNA 4AZGA 1PEZA 3ARTA 1VF8A 4PMVA 5KEZA 4W8LA 4KGJA 2EPMX 1E0XA 3CHDA 2DSWA 1FA2A 2G3MA 1QBBA 4IM4A 1AQMA 5C71A 1GJUA 3AZRA 1MXDA 1UWSA 4UFJA 3WF2A 4N0RA 3SUTA 2A3EA 1XH2A 5IFTA 2XM1A 3AXHA 4MNKA 1TR1A 1TFVA 3AHTA 2VCAA 2DSZA 2WNWA 4UQDA 3VGEA 4ATWA 4CU7A 3OA5A 1GQKA 2OSXA 1GOWA 4J28A 2XFRA 1V3LA 2WW5A 4JL1A 5AY7A 1TCMA 2GFTA 1ISVA 5GPRA 5LA1A 3O6AA 3A4WA 3T0AA 2OWCA 4JFSA 2NW0A 1M03A 1R87A 1KR1A 1UWQA 3CZLA 3TP4A 4ATLA 2CKSA 2GJXB 2ZXQA 3CUFA 4JCMA 3AQUA 4OBRA 4OZOA 2WYSA 4JAWA 1E73M 2DSUA 3LPFA 2Z1SA 4M24A 3WBEA 1AQ0A 2CBIA 1UD2A 3CUHA 1JZ5A 5E09A 1K6AA 3PZQA 1UUQA 4C7DA 1XGZA 1UA3A 4JCLA 2VZTA 4QAWA 2EJ1A 3CZKA 2ZXDA 3PHAA 3VIMA 3WEOA 2PBOA 4GI6A 4P8XA 3BMWA 1DWIM 1OCQA 5CSUA 3J7HA 5C8BB 2DSVA 3CGTA 1G94A 2JEPA 2ZUUA 3BAYA 4X0NA 1GOIA 1GZJA 1G1YA 1XH1A 4PTWA 5A3HA 5CQ1A 1G5AA 2WMIB 3T0BA 3VIIA 3VD3A 4B16A 4HA1A 3WQ5A 1E43A 3DYOA 5BROA 4RL3A 5FL1A 1E6PA 3VIHA 1AVAA 1HNYA 4NSBA 4B15A 1PX4A 3BSHA 5E9AA 4OKDA 1E55A 1SMAA 2QHAA 1VBRA 1IZKA 1M04A 2HVMA 5A69A 3ZIZA 1GOQA 1ZB5A 1C8YA 3RILA 3W81A 1HX0A 2C8NA 1C7TA 1CGUA 3SEPA 1QOXA 3GDBA 3K1DA 1TVNA 3WDJA 2X09A 4BCEA 1UZ4A 5A1AA 5BXTA 3ARUA 3L4YA 3K4AA 2OWWA 4W93A 2D0FA 2AOSA 3DYPA 4AZIA 4ZFMA 4P7QA 3CZ8A 1DTUA 3ZMRA 2VI0A 3VD4A 1JYWA 2QV4A 1IV8A 1VB9A 1UR1A 1OGSA 1D7FA 4DUWA 2X0HA 5KZ6A 1PJ9A 5A6SA 3N17A 2Y2WA 4PUEA 3WELA 2PBGA 2PB1A 5ECUA 1X1NA 1E6QM 4AZBA 3N15A 1W1PA 3T08A 3PZIA 4MB1A 4FLOA 4ZENA 2XVPA 3W26A 2WB5A 1UKTA 4UFHA 3WEZA 4LYRA 3I3BA 4PMNA 1JAKA 3QHMA 1E3ZA 1V02E 4NF7A 1GQJA 1XSIA 2XVGA 5A6BA 1ZBVA 3B8SA 1QVBA 1B9ZA 1ESWA 1W3HA 1KBKA 1RP9A 1B1YA 4P7RA 1LWJA 2WSKA 2Q8XA 1K9EA 1V3KA 1E1EA 4MNMA 1GQIA 3AROA 4Z2HA 1KR0A 2EEXA 3AXIA 2BS9A 1QHOA 1M53A 4JKKA 1UOKA 1J9YA 3AZTA 4HMDA 2W62A 4AD1A 2E9BA 3AIRA 4GPNA 4D72A 2UY2A 3EDJA 1B3XA 4GXPA 1KGXA 5JIPA 1OBAA 4MNLA 2ZWZA 4AZCB 1BLIA 3W29A 4HA4A 3AMCA 2QMJA 4M29A 4D71A 2VUYA 4E8CA 1Q4NX 2FH8A 1NOFA 4NI3A 3RM8A 3TONA 2VRKA 1HKJA 2OYMA 5DT7A 1QI0A 1NWTA 1J12A 1CLVA 1UH3A 2BVTA 3W6MA 1EQPA 3CIVA 3VDAA 1K9TA 1BGAA 3OZPA 4FK9A 1MVYA 3BAWA 3VU2A 4UOJA 1H41A 4FMVA 1JDAA 1VJZA 4IPLA 5E0FA 5I77A 3PBGA 4AW7A 3AMLA 1V0LA 4M80A 1UR4A 4D1IA 2WSPA 4Z2GA 3VNYA 2ZX8A 5HPOA 1EOKA 3AS1A 4RE2A 1US2A 1HJXA 1HL9A 4PCSA 4H8UA 4MDPA 5E6ZA 5A6AA 4OJYA 1V3IA 3PZOA 3DHPA 1R7AA 1KQZA 4D6JA 5JBDA 2VVNA 2AAAA 3ZJKA 4NRRA 1W1TA 3WBAA 4JIEA 3ECQA 3M46A 1EDTA 1XSKA 5DEZA 3BAJA 4CVUA 3POCA 2EXOA 4XZWA 3TTSA 3D5HA 3L4ZA 4WIWA 3MUIA 1VIWA 1G01A 3AIBA 3CUGA 2BY3A 2FGZA 2W91A 1XHGA 3NSNA 4YPJA 1GPFA 1U2YA 2J8FA 3SCVA 3ZT6A 3GNOA 4FLSA 1UWRA 1BVZA 3U7VA 2ZUNA 2JEQA 2WCAA 1CGVA 3DYMA 1Q6CA 2O9OA 1HKKA 4CCDA 2VX7A 1WAWA 3W82A 3AI0A 4CN6A 1XV8A 3GBEA 3ARPA 3SCUA 3L4TA 1EQCA 4A3HA 1V03A 4CD6A 4CD7A 1ODZA 1D2KA 3WMBA 3ZJ7A 3BMVA 2WXDM 1QI4A 1OIFA 5BYWA 1WNOA 3U5YA 3QOMA 4M82A 2DSKA 3SUUA 3VO0A 1CGYA 2WHKA 2WZIA 1E9LA 4XB3A 3IJ9A 3W6LA 4AZ7A 2WAGA 2F8QA 3KE0A 3CTTA 2NT1A 4D6GA 1HN1A 2CKRA 2XVKA 3DC0A 2GK1A 2ZX7A 3G6LA 2J47A 5M17A 1IT0A 3IJ7A 4DUVA 1J0YA 4E2OA 2UY4A 3SCTA 1BYAA 1MW2A 1W1VA 1OGGA 1FP8A 3OGVA 1QNSA 2A3AA 2WM0A 2ESCA 1OD0A 1E56A 3WUBA 4D6CA 3WH8A 3VILA 1QI3A 1ECEA 2V3DA 4DWSA 5A6JA 4NRSA 4QLJA 3VMPA 1CBGA 3CZJA 1JAEA 3U5UA 2DT2A 1EDGA 1J0IA 4CU6A 2J7FA 4JHOA 1Q6GA 1W2PA 2E3ZA 1MFVA 4GINA 2V3EA 1HP4A 4PMDA 3RPMA 1R85A 1LG2A 1JFHA 2ZXBA 3GXIA 3IAPA 2TAAA 2JALA 2VOTA 1TZ7A 4MJ2A 2BY2A 3WDRA 2DT1A 2DDXA 4JZ5A 4ZXLA 1MQQA 2WK2A 3W37A 3AHZA 2XUCA 3AS3A 1UKOA 3W27A 4HP5A 4PRWA 4P8UA 3FN9A 3T09A 3LMYA 3N04A 2ZUMA 2WMGA 3PZGA 4GZJA 1BAGA 3OGRA 4TVUA 3THCA 1UKSA 1US3A 2GVYA 1TUXA 2WZHA 4M8UA 5CLTA 2W67A 2IXUA 4C7GA 5ABEA 8CGTA 1KXHA 2NT0A 1CTNA 3U7BA 4CU8A 4AD0A 3AIVA 1BQCA 1HXJA 3LPGA 5A8MA 1GCYA 4UZSA 3WNPA 2QPUA 1CWYA 3WEMA 4P8WA 3SUVA 2E8YA 3M07A 1VAHA 3B9DA 3F4VA 1A47A 3PZ9A 3GH7A 1ISZA 2E0PA 4L4PA 1C92A 3ARQA 4HTYA 1RH9A 3U57A 6CGTA 1PPIA 3BAKA 4KMQA 3SCNA 3DHUA 3L4XA 4F66A 1VENA 2YJQA 2WVVA 3W25A 2D20A 5GQBA 5I0DA 1JF5A 5C70A 3OLIA 4XZBA 2D3NA 1E0VA 1DEDA 4QDMA 2YL9A 4GZEA 4HPGA 3N12A 1DWFM 1LL7A 1VJSA 1GOOA 2OLHA 2XSBA 1WDSA 1SYTA 1E6RA 1QBAA 5D9OA 1V6UA 3GNRA 3OLEA 1DWGM 1FH7A 1XCXA 4AZ6A 3NCOA 3ARRA 3WD0A 2X1IA 1VEOA 4UQCA 2YKKA 3CH9A 1VFOA 2D1ZA 3AYRA 3UR7A 2V3FA 4MNJA 4OBSA 1PIFA 2VT0A 1EH9A 2DEPA 4UQEA 1ZBCA 4K68A 3VGBA 3ZO9A 3M7SA 4GO9A 3VDBA 1C93A 3II1A 1OSEA 4EK7A 1V08A 1HL8A 5CZKA 4D6FA 3AJ7A 2WKLA 3ZR5A 1FH8A 3WMSA 3BLPX 1W9BM 4TUFA 3LPOA 1GVIA 1UD4A 3SCRA 2Y4SA 1EO5A 3A3HA 5A8NA 4ZEPA 1I1XA 5CXPA 1OT1A 1P6WA 1I1WA 3OLGA 2G8ZA 4LGXA 1HJSA 3APGA 3L2LA 3VNZA 3IANA 4H8HA 4BQ5A 2WKGA 2ZIDA 2XFFA 4M81A 4HZ6A 4W5UA 4AEEA 4KH2A 3KWXA 5I3DA 3ALFA 3K8MA 1H0GA 5I6SA 4P7LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1ZJB A;  4U2Z A;  5E6Y A;  1HVQ A;  4AZ5 A;  4UFL A;  1GQL A;  4C91 A;  3PN8 A;  5BRP A;  2J4G A;  2XGB A;  2WHJ A;  4M56 A;  6TAA A;  1EIB A;  2EPK X;  1HIZ A;  4KGL A;  2IXV A;  4FF5 A;  2D23 A;  2O92 A;  3SUS A;  4N42 A;  3TA9 A;  1VRX A;  1HJW A;  4RE3 A;  4BZY A;  5AC5 A;  1QHP A;  4Y7E A;  2XHY A;  3PTQ A;  5I23 A;  3WDP P;  3OBA A;  4HOX A;  1R86 A;  3AIC A;  4P7O A;  5M3W A;  1E6N A;  5CLW A;  2W66 A;  1GON A;  3AMK A;  1BG4 A;  7CGT A;  4GKL A;  1D3C A;  2J7D A;  1V02 A;  3AOF A;  4ACZ B;  2YL6 A;  3MSG A;  4PBG A;  1J10 A;  4KRT A;  4AY1 A;  2VVS A;  3E1F 1;  2WAN A;  1HJQ A;  1XC6 A;  1GW1 A;  2E9M A;  1VFU A;  3IAQ A;  3AIW A;  4DWS D;  1UH4 A;  5BXR A;  1V6X A;  3NYD A;  2W63 A;  3T2Q A;  3SIM A;  4V28 A;  2VX5 A;  1ZBK A;  5LA2 A;  4E8D A;  3CHF A;  4HA3 A;  4HOZ A;  3AS0 A;  3POH A;  3HMC A;  5DFA A;  3VM7 A;  1J0K A;  4X0V A;  2WVV B;  2WC7 A;  3AIU A;  5I24 A;  4J3X A;  2CHO A;  1IZJ A;  4B9Y A;  1F4H A;  4LQ1 A;  3RM9 A;  2YBU A;  4D6I A;  2V5C A;  1UD8 A;  2VR4 A;  1HKI A;  1KB3 A;  1PZ3 A;  2BHU A;  3AIE A;  4AZH A;  1JNE A;  3HU7 A;  3BLK A;  1U33 A;  3VX0 A;  8A3H A;  1B3Z A;  2YDQ A;  1N82 A;  4JL2 A;  2CEQ A;  3MV1 1;  4BF7 A;  1UA7 A;  4TTU A;  2XFY A;  2WMH A;  3AMD A;  4CD8 A;  2ZUV A;  4NZC A;  1UKQ A;  3K4D A;  3KL0 A;  5CSY A;  3W0K A;  3ZSS A;  1W3K A;  3ARY A;  2X05 A;  2W92 A;  2EBN A;  3FW6 A;  3AMG A;  2X8R A;  1PX8 A;  1Z32 X;  3CZG A;  1V3M A;  4CN1 A;  1FHL A;  3CMJ A;  4B3L A;  4E4P A;  3L4W A;  2WHL A;  1B3W A;  3N13 A;  4LX4 A;  4F9D A;  1H4P A;  3CUJ A;  3ARV A;  3RM4 A;  1QW9 A;  1BVN P;  2EQD A;  2J7B A;  4MAV A;  1ISW A;  5A95 A;  4HZ7 A;  1O7A A;  1OB0 A;  2GJX A;  2OYL A;  5A2C A;  1E4M M;  4AD2 A;  1JZ2 A;  3S6T A;  3WH9 A;  1J18 A;  2E8Z A;  2G3N A;  1KCK A;  2WPG A;  2WVT A;  1TA3 A;  3ZT5 A;  2WC4 A;  1JZ3 A;  1JZ4 A;  4AIE A;  3WF1 A;  4M1R A;  4CKQ A;  2EPO A;  1JIB A;  3L4U A;  1WO2 A;  3KZS A;  4EAN A;  4YN5 A;  4PSR A;  4A3Y A;  1JG9 A;  3B9A A;  4ZXO A;  1V6Y A;  4W8A A;  1VEP A;  2WMF A;  1W9U A;  1EA9 C;  2ZUT A;  3WF3 A; 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