2WCAA

Btgh84 in complex with n-butyl pugnac
Total Genus 225
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
225
sequence length
585
structure length
578
Chain Sequence
LQPPPQQLIVQNKTIDLPAVYQLNGGEEANPHAVKVLKELLSGMLISIGEKGDKSVRKYSRQIPDHKEGYYLSVNEKEIVLAGNDERGTYYALQTFAQLLKDGKLPEVEIKDYPSVRYRGVVEGFYGTPWSHQARLSQLKFYGKNKMNTYIYGPKDDPYHSAPNWRLPYPDKEAAQLQELVAVANENEVDFVWAIHPGQDIKWNKEDRDLLLAKFEKMYQLGVRSFAVFFDDISGEGTNPQKQAELLNYIDEKFAQVKPDINQLVMCPTEYNKSWSNPNGNYLTTLGDKLNPSIQIMWTGDRVISDITRDGISWINERIKRPAYIWWNFPVSDYVRDHLLLGPVYGNDTTIAKEMSGFVTNPMEHAESSKIAIYSVASYAWNPAKYDTWQTWKDAIRTILPSAAEELECFAMHNSDLGPNGHGYRREESMDIQPAAERFLKAFKEGKNYDKADFETLQYTFERMKESADILLMNTENKPLIVEITPWVHQFKLTAEMGEEVLKMVEGRNESYFLRKYNHVKALQQQMFYIDQTSNQNPYQPGVKTATRVIKPLIDRTFATVVKFFNQKFNAHLDATTD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Insight Into a Strategy for Attenuating Ampc- Mediated Beta-Lactam Resistance: Structural Basis for Selective Inhibition of the Glycoside Hydrolase Nagz.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
molecule keywords O-GLCNACASE BT_4395
total genus 225
structure length 578
sequence length 585
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2009-03-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
A PF18344 CBM32 Carbohydrate binding module family 32
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 2wcaA03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2wcaA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 2wcaA01
1P6WA 3IAQA 1IV8A 1NP0A 4WKAA 1J01A 1GJUA 2AAAA 4UQ9A 1H3GA 2A3BA 1OGGA 1HNYA 5BYWA 2XWDA 2ZXAA 5DT7A 2VX4A 3BAYA 3NSXA 4W7VA 1LL6A 3WH6A 3WNOA 1GOOA 4UQAA 4AD5A 1PX8A 4JL2A 1UQZA 1JAKA 2WC4A 2DQXA 3GNPA 1KQZA 1FHDA 2WB5A 3CMJA 2UY3A 2WVVB 5HDRA 1GZJA 4D6FA 5LA0A 3A47A 4Z2GA 2VT0A 1HJQA 2WSPA 4M81A 3WQ4A 2W4XA 1AMYA 4YHEA 4B3KA 4F9DA 3N04A 2DT2A 4EANA 1H1NA 1KXVA 1QHOA 4UFMA 1E72M 1W2PA 3AIQA 4UFHA 4MTVA 3MKKA 3WD4A 1NWUA 4JL1A 4AC1X 1EQPA 3GXFA 1W9DM 2XSAA 3W6MA 2E9MA 4GZIA 5A6AA 1F4AA 2EPKX 5CG0A 3WDQA 1W91A 4E8CA 4OUEA 1J11A 2ZIDA 4TVCA 5M17A 1E73M 2JE8A 1GORA 2UY5A 3CZ8A 4N42A 5IXEA 1EDTA 1QNRA 2O9PA 1JF5A 2ZUSA 3O6AA 2OSWA 2NT1A 1US3A 1GOKA 4WIWA 4JCLA 2VRQA 2PBOA 3PZVA 2OWXA 3EYPA 4HU0A 2XSBA 3UG3A 1CZ1A 1UD8A 1GOIA 7A3HA 1E6SM 2BY3A 5FIPA 3WDJA 5A6SA 3GBEA 4QCFA 3SCRA 2YIHA 4PMNA 4MNJA 2GJRA 4DWSC 4FLSA 4KWUA 5CPQA 3CUFA 4BCEA 1JI1A 7TAAA 5A94A 4S3KA 2Y8VA 1FHLA 4D71A 1PAMA 2Y4SA 3W27A 3VIFA 3I3DA 1ISZA 1NWSA 2DIEA 3AHVA 1HL9A 1E0XA 2EBNA 4Z2LA 4DWSD 3M46A 1V6UA 4CN4A 1QI5A 1J10A 3ZM8A 3CZGA 4P8XA 5DT5A 2JEQA 3AIBA 4EE9A 4AZ7A 4BS0A 3CIVA 1W3KA 4D1JA 3IJ8A 1A47A 3VDBA 2PF0A 5A6LA 3FN9A 4FLQA 3I3BA 1W3HA 1JYVA 3EDDA 3CHEA 4A3HA 3WDHA 1J0KA 1WPCA 1HJUA 1ESWA 2BY1A 2J7EA 4C7DA 5CZKA 3BLKA 3WH7A 3PBGA 2VO5A 2EPOA 4UFIA 1V3MA 3EDKA 3N13A 1JFHA 5JBFA 5A8PA 2ESCA 1MQRA 1UA3A 3ARQA 2YKKA 4V2XA 1E6NA 3MSGA 1LLOA 5I77A 4FMVA 3CBWA 1MVYA 3N11A 1C93A 3VGDA 1E4MM 2JIEA 4JAWA 5CSYA 3WENA 2G41A 1GOMA 2DH2A 1UD6A 4AMCA 4D6EA 1WE5A 5E0FA 3FW6A 4UNIA 5GNZA 5CSUA 3EMCA 4UR9A 1LF1A 2J7HA 3PZOA 3AZTA 1ODZA 2VTFA 2QV4A 1XSKA 1W3LA 3VGFA 5CQ1A 1JD9A 3WNKA 3GBDA 3WUBA 4ML4A 1AQ0A 3ZJKA 3AFBA 1JZ8A 3ARTA 4HMCA 2E8ZA 3L2LA 3DC0A 4P7RA 1V6VA 4J3XA 4CU7A 5I24A 1VB9A 2DSKA 3LMYA 3WDPP 1EOKA 2YDRA 4LX4A 3GNOA 3ALGA 4CD8A 1JZ3A 3BMVA 1E6PA 3SCPA 2UY4A 1CGTA 4HPHA 2QLYA 3T08A 3OZPA 4UQBA 4JFWA 1BLIA 4PN2A 2C7FA 1TFVA 4UCFA 1UWTA 4CD6A 3W53A 1M7XA 1H4PA 2VQTA 4AZIA 1HIZA 1ZJAA 4D6CA 4DM1A 1BYBA 5FL1A 3NCOA 4U31A 1RD6A 2XIIA 1XV8A 2FHFA 3ZR5A 1N82A 3WMSA 5BROA 3UR8A 4KMQA 3WQVA 4W85A 5EBAA 1GUVA 4FLOA 1L0PA 1UR0A 2YL9A 1V3IA 4B3LA 3WH8A 1SFSA 2ZX9A 1U33A 3L4ZA 3CH9A 5EMYA 5E0CA 3WNLA 1FH7A 4H7VA 2VCBA 4MAZA 1GQJA 1ZBCA 1H11A 2W67A 1B3VA 2OWWA 2V3EA 3WQ8A 2X8RA 3T2QA 3POHA 2D2OA 4FF5A 2XVKA 1XSJA 3A4XA 3GH4A 3OBAA 3FHQA 1B2YA 3M6DA 1V3HA 1I1XA 1UH2A 2PBGA 5KEZA 6A3HA 2J7FA 2CERA 1UG6A 2DGAA 2J8FA 3VIOA 4M8UA 3GTNA 1UR2A 4PMVA 5FOOA 4OOZA 1VF8A 1PZ3A 1RPKA 3F5KA 1R87A 2WVSA 3MUZ1 2XM2A 2NT0A 1UWUA 5GNXA 1VFMA 3ZR6A 1OM0A 4F9JA 2EPMX 1H0IA 4UFJA 3VD4A 3O2LA 1FFQA 1E15A 1WAWA 1GJWA 1K9DA 2DSWA 4D6HA 1B9ZA 1WNOA 3ARZA 5HXMA 1H49A 1W9UA 3RM4A 3WN6A 5E09A 1JF6A 4D6IA 2VZSA 3WMCA 1H5VA 3RPMA 2XVPA 4BA0A 2WAGA 1CXHA 2IUZA 5CJ5A 5AYIA 1AQHA 1BYCA 3BCDA 2ZXQA 2VUYA 1JDDA 1W1TA 4P7QA 3ARPA 3W24A 4AD3A 5ABFA 4HU8A 3AROA 1QBAA 2QHAA 4FLRA 2A3EA 1O6IA 3VIPA 1CGXA 1R7AA 2WZHA 5AYBA 5IHRA 3CLWA 4ZEPA 4B16A 3E1F1 4GI8A 4DM2A 3ZIZA 1DEDA 3HJEA 1KB3A 3WEOA 3F4VA 1UKQA 3MSDA 1ZBVA 2J7DA 5D9OA 2ZICA 4GPNA 5A95A 1C7SA 3ALFA 4QLJA 3ECQA 1E4LA 2ZX8A 4R27A 1FOBA 4W7UA 1EHNA 2ZE0A 3JUGA 1BQCA 2XYLA 2Y2WA 1ISYA 3BAWA 3B9DA 1J0YA 1B3XA 1DWGM 2VJXA 3ZJ6A 1GPFA 4KGLA 4LGXA 3T09A 1Q4NX 1WDPA 1VBRA 3WH9A 3DYMA 1C7TA 1OCQA 4U3CA 1UYQA 4UOQA 5A2BA 2G8ZA 1KQYA 1G0CA 1V02E 5GPRA 1XD0A 4PYSA 5D9PA 2J25A 3KWXA 4PSRA 3RIKA 4B15A 1ZBWA 1WB0A 1H2JA 2WVTA 5I78A 3ZT5A 3ZSSA 2VRJA 1UA7A 5BRPA 5AC5A 3WMBA 1QI4A 1E3ZA 4PCSA 4J27A 3WBEA 2G3JA 1UR4A 9CGTA 4HOWA 2WKGA 1HJWA 3AQUA 3VX1A 3WF1A 1GVIA 2CBIA 7CGTA 1HF6A 1JIBA 2Q8XA 1VENA 2ZWYA 4H04A 3FAXA 1LJYA 1CGWA 4UQEA 3VGGA 1ZBKA 4MB5A 1G5AA 1JYXA 1QOXA 1PBGA 1W3JA 4AWEA 2W63A 1IZKA 2CKRA 1PIGA 3W0KA 6CGTA 2V3GA 4QLLA 1MQQA 2GK1A 5A8MA 1DTUA 1E0VA 1V0KA 2ZWZA 2WPGA 1QNQA 3DHPA 1R86A 4IUGA 2E9BA 3ZJ7A 1W9XA 2CXGA 1OT2A 1HP5A 3RDKA 1U2YA 2XPKA 1QBBA 2OLHA 2BFGA 4LYPA 3PTQA 1XD1A 1UKOA 3VIMA 4Q22A 4J3VA 3T2PA 3OLEA 3AMGA 4H41A 3SUWA 2ZX5A 1EO7A 1BFNA 4B9ZA 3RJYA 4TVDA 3THCA 2WZIA 3KL3A 3UERA 5BXRA 1X1NA 3ZJ8A 5A2CA 5HOSA 2TAAA 4U33A 2BY0A 2WHKA 3MUIA 4CD7A 1DP0A 2QF8A 2UY2A 3WL1A 2WCAA 3VUPA 1VJZA 2YA2A 1C92A 5KZ6A 4MNLA 4QDMA 4CCCA 1K6AA 2X05A 4AXNA 1UH3A 3OB8A 3QOMA 3WF2A 4L4OA 2G3NA 1JNDA 1MXGA 1QVBA 3A6OA 1GVYA 3J7HA 1XHGA 3AIUA 4M80A 1KCKA 4OKDA 4P7LA 5ABFB 3VIIA 2NSXA 1I1WA 1XYZA 1B3YA 5HNNA 3AS1A 4AZGA 1ZU8A 1BTCA 4UFKA 2X2YA 1MQPA 1TMQA 1WCGA 4UFLA 4LXFA 2DT0A 3WBAA 4ACZA 3ZMRA 3BAXA 4AD2A 1UZ1A 3GXMA 5GNYA 4D72A 2VCAA 3VMNA 5CGMA 3ZT7A 1KBKA 3CUGA 4JFUA 2BNJA 2YDQA 1NM9A 2WMKA 1MFUA 1WZMA 1OINA 2BHUA 3MUAA 1QPKA 1CWYA 1J0JA 3OLGA 4AIUA 4H8VA 1KGUA 1VFUA 4Z2JA 2VNCA 2PWGA 3GXIA 3SEPA 1BF2A 3VILA 1CXFA 3WD2A 3AIEA 5D9MA 1S46A 2UWFA 4YPJA 1D3CA 1HVQA 3AHTA 4GKLA 4D6DA 5I0DA 4NSBA 1MW3A 2Y5EA 3WL0A 3W38A 3RO8A 1CPUA 2DSVA 1YQ2A 3OA5A 2EO7A 4XZWA 1H0GA 1G01A 1GONA 3QOKA 4URIA 2CCRA 5FKYA 3PZNA 1DWHM 3KL0A 1UWQA 2WCSA 3BLPX 5CXPA 4CCEA 4IPNB 3VINA 4JKLA 1E6ZA 4J3WA 1NOFA 5FL0A 1V0LA 3CZKA 3BXWA 2E3ZA 3N18A 3APGA 3VVGA 4CN1A 4AZBA 1E5JA 3K1DA 3WFLA 4EK7A 3ARSA 3B9EA 5A6BA 3SCWA 1VIWA 2WBGA 1LG1A 2JIWA 2BVYA 4IM4A 3VIHA 3EDEA 1E4NA 4P8VA 1OGSA 3W81A 4P8UA 1BYAA 2W91A 3M07A 2GJXA 3CHCA 1Q6FA 2GK1B 2J8GA 1FH9A 1UKSA 3T0BA 4MADA 1HJXA 1QHZA 3ARRA 3ZQ9A 1O7AA 1MYRA 3IANA 3QGVA 3SUTA 2O9OA 2YA1A 3K8KA 1JNEA 5CPTA 3TTQA 2BHZA 4GZEA 2WC3A 2VC9A 3LPFA 4CCDA 3FXYA 3AIRA 4ZE5A 1VEOA 1JZ5A 5A8NA 1V6XA 3AXXA 2PB1A 4XX6A 1KR0A 1V6WA 3VTRA 3AZSA 8A3HA 1DWAM 3VM5A 2YDSA 1UQYA 4UZUA 3ZT6A 3VDAA 1UR9A 1JAEA 3D3AA 2QPSA 3WY1A 4OZOA 1FP8A 1E1EA 3AMKA 1ITXA 3WF0A 3TP4A 1Q6GA 4JFSA 3SUUA 3IJ7A 2XJ7A 5DEZA 4HA1A 3IJ9A 1J12A 4XB3A 1M53A 4UOZA 4M82A 3S6TA 3WNNA 1M04A 5BCAA 4AYSA 2J4GA 4FK9A 4UQDA 2HVMA 2E9LA 5DFAA 2XTKA 3PN8A 1ODUA 1B3ZA 1JL8A 1ZJBA 4NRRA 3L4UA 4PTWA 4J3TA 1XH2A 1JGIA 4LQ1A 1WO2A 2G3MA 1OWQA 5A69A 3AIVA 1OGBA 1W1PA 4AIOA 4AZHA 4MPKA 3FY1A 5FCZA 1LG2A 1UD4A 2AMGA 5I23A 3A3HA 3QHMA 2D20A 2CPUA 2WMJA 1E6XM 1E3XA 2VQUA 1MW0A 2VOTA 1J18A 3AHZA 4ACZB 4RE2A 1WZLA 4E2OA 6TAAA 1AVAA 1GHRA 4WSKA 1JFXA 3VKKA 4PSPA 3N17A 3T0AA 1KBBA 3WD0A 1QW8A 2WLYA 4J28A 4PTXA 1CIUA 5LYRA 3OGSA 2VZUA 3RILA 3WNMA 1JZ2A 1UOKA 3NSMA 2WMHA 3PZUA 2WCGA 2XGBA 2WWDA 2VZOA 3DHUA 1TA3A 2ZUTA 4NRSA 1XGZA 1LQ0A 1E9LA 2OYKA 4TX8A 1QW9A 2ZOXA 1PZ2A 3NSNA 1KWKA 4W5UA 3WD1A 2YL8A 5IHSA 4PUEA 2GUYA 1V02A 2XM1A 5DO8A 3MMWA 3MANA 1JZ4A 5I2UA 5BXPA 4OBRA 3GYCA 1BGAA 2PWHA 5DMYA 3SCVA 3L4VA 1CENA 1VBUA 4A3YA 1UUQA 3EBVA 2OYMA 3OG2A 4LYQA 1HVXA 3D5HA 4W93A 2BXYA 4ATDA 5TD4A 1Q6CA 1JI2A 2YLAA 1C90A 4Z2KA 4QFUA 1J0HA 2YJQA 4HZ6A 1E1FA 2G4FA 3U5UA 3WNPA 1JDCA 4JFVA 3VD9A 1CYGA 1UH4A 2CIPA 4HZ7A 3ARWA 3GZAA 3WQWA 3N1AA 5A6JA 4P8WA 2O9RA 5C70A 3LPGA 4TOQA 1K9EA 5CLTA 1V0NA 2Y8KA 2PC8A 3A4AA 3LPOA 1XCWA 2J75A 5CGTA 1KFWA 2AOSA 1JZ7A 2XWEA 4EKJA 2XVGA 3TONA 3U7BA 2VZTA 1MFVA 4MDPA 2GJXB 4AD1A 1HT6A 1EOMA 1NWRA 2BHYA 3PTKA 2DEPA 3WFZA 1EGZA 4QCEA 1DWIM 1M01A 2W92A 4AZCA 1G94A 4JKKA 3F5JA 5DF0A 2WHMA 3FAWA 4DUVA 3K8LA 1VEPA 2CHOA 3W28A 3ARXA 2X1IA 2F61A 1HKMA 1V08A 2JALA 4D6JA 2F2HA 4AZ5A 1GHSA 3NUKA 1CXEA 3ZOAA 3A4WA 4WJXA 2X0YA 2YOCA 3EMQA 2J47A 4XV0A 1EHAA 4KRUA 4PMDA 2WVVA 1BVZA 3MU7A 1HKJA 4AEFA 5ABHA 2D22A 1JXJA 2CHNA 3BC9A 3AS3A 3VDCA 5I79A 1GCYA 1ECEA 2FHCA 2ZXDA 2VX7A 3L4WA 5ABGA 1H09A 5D9NA 1J0ZA 4H8UA 1HN1A 2WM0A 2Z1KA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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