2XJ7A

Btgh84 in complex with 6-acetamido-6-deoxy-castanospermine
Total Genus 242
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
242
sequence length
712
structure length
639
Chain Sequence
SLQPPPQQLIVQNKTIDLPAVYQLNGGEEANPHAVKVLKELLSGKQSSKKGMLISIGEKGDKSVRKYSRQIPDHKEGYYLSVNEKEIVLAGNDERGTYYALQTFAQLLKDGKLPEVEIKDYPSVRYRGVVEGFYGTPWSHQARLSQLKFYGKNKMNTYIYGPKDDPYHSAPNWRLPYPDKEAAQLQELVAVANENEVDFVWAIHPGQDIKWNKEDRDLLLAKFEKMYQLGVRSFAVFFDDISGEGTNPQKQAELLNYIDEKFAQVKPDINQLVMCPTEYNKSWSNPNGNYLTTLGDKLNPSIQIMWTGDRVISDITRDGISWINERIKRPAYIWWNFPVSDYVRDHLLLGPVYGNDTTIAKEMSGFVTNPMEHAESSKIAIYSVASYAWNPAKYDTWQTWKDAIRTILPSAAEELECFAMHNSDLGPNGHGYRREESMDIQPAAERFLKAFKEGNYDKADFETLQYTFERMKESADILLMNTENKPLIVEITPWVHQFKLTAEMGEEVLKMVERNESYFLRKYNHVKALQQQMFYIDQTSNQNPYQPGVKTATRVIKPLIDRTFATVVKFFNQKFNAHLDATTDYMPHKMPLQVKANRVLISPVEIELDAIYPGENIQILSAGLQKAPVKFVFVLTIEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Inhibition of O-Glcnacase Using a Potent and Cell-Permeable Inhibitor Does not Induce Insulin Resistance in 3T3-L1 Adipocytes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords O-GLCNACASE BT_4395
molecule tags Hydrolase
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
total genus 242
structure length 639
sequence length 712
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2010-07-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
A PF18344 CBM32 Carbohydrate binding module family 32
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 2xj7A03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2xj7A02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 2xj7A01
5CLTA 5EFFA 5CZKA 4UFLA 3ZMRA 2W4XA 4QFUA 1H0IA 2WCAA 4W85A 5CSUA 4Q22A 2DH2A 3MS8A 3M6DA 1EDGA 2J7BA 4HA4A 3M46A 3PTKA 4D6HA 1WAWA 1EXPA 1W3JA 1JF6A 1H41A 3LPFA 4TVDA 4D6FA 5TD4A 3MV01 1GZJA 4ZE5A 1V02E 5I23A 3NIYA 1VEPA 2QV4A 4AY1A 3WN6A 1B31A 2Y24A 2WMIB 4PYSA 2VVNA 1B0IA 3L4TA 4BS0A 2F8QA 4J7RA 3T2QA 3NDYA 2EPLX 4OIFA 1W32A 2PF0A 4W5UA 1TR1A 1GHSA 1SR0A 3WMBA 4CU6A 3WKZA 1QI2A 1UG6A 2WVUA 1OINA 2WNWA 1VB9A 3AIBA 2D3LA 1R85A 3W6MA 4P8XA 1ESWA 1CXEA 1B3ZA 1JZ2A 5FL1A 1PIGA 1UR4A 3CO4A 1XHGA 3EDFA 4HA1A 5M5DA 3AS1A 3O2LA 2WMJA 3SCRA 2QMJA 4J3UA 3WBEA 1PZ2A 3NYDA 3T2PA 3K8KA 1DWAM 1EO7A 4MB4A 3GXMA 3AIQA 1QW9A 2CBUA 2DT3A 4W88A 2WXDM 6CGTA 1UUQA 2CBVA 1IZKA 1Q6CA 5FL0A 4W87A 3AXIA 3RIKA 4WSJA 1E6RA 3W24A 4Z2LA 3CHDA 5A2CA 4F9DA 3GTNA 3RO8A 4CN4A 1BLIA 1HKJA 3K46A 1JL8A 2QF8A 3BAKA 5A8PA 4GINA 2X0HA 3VGGA 1E6XM 1OIFA 2O92A 1LJYA 1JZ4A 2VX6A 2O9PA 5JUVA 2WHJA 4DUVA 1LLOA 2VRJA 3GH7A 4KWUA 3ARZA 4U3AA 1GORA 1HJUA 3SUVA 4CD8A 4GI9A 3FHAA 4LYQA 2BY3A 5EMYA 3BAXA 3VINA 1IT0A 5EFDA 4LX4A 1MW0A 5A6SA 3L4YA 2WZHA 1J11A 3AMGA 1QNOA 3T09A 3WQ6A 2EPNA 2DGAA 3FXYA 1JNEA 3U7VA 1QI4A 3AMCA 1BYBA 4JL1A 4Z2GA 3BCDA 1QI5A 4D1IA 1I1XA 3VMPA 1FP9A 1MQRA 1D2KA 4D6JA 5I6SA 1E6SM 1EA9C 2ESCA 2A3AA 1UKQA 3QOKA 2EPMX 3QGVA 4NF7A 1UWQA 2ZX6A 4N42A 2TAAA 1V03A 3SUWA 4JFVA 3PBGA 2ZXDA 2CYGA 3A3HA 4BQ3A 5GNXA 2YJQA 1H1NA 3WQ8A 4AD1A 4MNMA 3TTOA 1ODZA 1JZ6A 4WF7A 4B16A 1IZJA 3WF4A 1U33A 1JZ7A 4P8UA 3RCNA 5BXSA 2VOTA 2J7CA 2O9OA 2QMKA 2YIHA 4MB5A 3VGEA 4W8LA 3MUZ1 2WLYA 1WDQA 3K4AA 1VAHA 2QLYA 3AS3A 2BNJA 2Y8VA 5IFTA 5E9AA 3MV11 4GZIA 1Q4NX 4F9JA 1M53A 2YL8A 3EYPA 1J18A 1UR1A 1EQPA 2DH3A 3QHOA 4OJYA 1HVQA 1E40A 3KZSA 2MANA 4Q7NA 2WCSA 3ALGA 3NSMA 1V6UA 3VDHA 1J9YA 1R86A 2CNCA 4UQ9A 1V0LA 1XH2A 1CZ1A 4AW7A 4PMYA 1KXVA 3M07A 4M56A 5CJ5A 1GOKA 2J47A 1X1NA 2VX5A 5JBEA 1GPFA 1CGXA 2GUYA 1D3CA 4ACZA 3VDCA 1OCQA 4A3HA 3I3EA 3WENA 2CKRA 4C7GA 2VL4A 1G1YA 4W7VA 3AI0A 1DHKA 1RP8A 3I3BA 4AD0A 1TVPA 4HZ6A 2ZXQA 3MMWA 2V3FA 3QR3A 2WLZA 3BAJA 4NI3A 3AIRA 1E3ZA 1E4MM 1W9DM 3WH8A 2E9BA 2WW5A 1TG7A 3ARXA 4ZXLA 3SIMA 2CETA 1J10A 3G6LA 2J8GA 1W3KA 2DT0A 1TFVA 4UQCA 3ARUA 5D9PA 1CGVA 3W81A 3T0BA 4Z2IA 3L4ZA 2X8RA 1HF6A 2O9RA 2AOSA 3ZJ8A 3PN8A 2RGMA 3APGA 5I2UA 1E71M 1RD6A 4KRTA 3VO0A 2DT2A 3IAPA 4AMCA 3SCQA 3LMYA 4CN1A 3SCSA 5ABEA 1OGBA 5AC5A 1JDDA 4W84A 3IK2A 1UD6A 1UQYA 3AICA 5D4YA 1EHAA 1FHDA 1PEZA 2FH6A 5F7UA 3WQ4A 1JYWA 5A2AA 1UR8A 5DEZA 4M80A 3BXWA 4CUCA 1LF1A 3A4AA 1XCWA 4HU8A 1C3FA 2PBOA 2Z1KA 2X1IA 1NOFA 3AYSA 1PJ9A 4P7OA 3VIFA 1SFSA 5FKYA 2GDUA 1UH4A 1V6XA 3BAWA 1MXGA 4D6GA 2BV9A 3WNMA 3RJXA 4OKDA 1GW1A 3PZNA 3W27A 4AZ5A 3AXXA 1VEOA 5ABGA 3CZGA 4FLOA 3TTSA 3CZKA 4P8WA 1LL7A 4W8BA 3UESA 1UHVA 4MB3A 2D23A 2VC9A 4QDMA 4AZBA 3AMDA 2B31A 5A6LA 5A6JA 4H7VA 2WMKA 4WK9A 1IV8A 1SMDA 3L4WA 3RILA 3OZPA 4LQ1A 1K9EA 2VX4A 2C0HA 2WHLA 4U2YA 1RP9A 1AQHA 4LGXA 4Z2HA 4PTVA 4CU8A 2XVGA 3RM8A 1US2A 1OGGA 1HT6A 4IUGA 2YA2A 1V0MA 2RGLA 2WVSA 4GPNA 4YHGA 3SCTA 4U5KA 1W9BM 4LPCA 3WDIA 3AQUA 3THDA 2ZUMA 1KQYA 3PZTA 1QNSA 2WWDA 1HJSA 1QVBA 1OT2A 2VR5A 2D0HA 2G3MA 2YBTA 3AJ7A 3BMVA 3D5HA 1JD7A 2ZUWA 3VMNA 4WSKA 5LYRA 1M01A 4AIUA 2VX7A 1QHOA 3OB8A 3CGTA 5CLWA 4ACZB 3ZIZA 2OYMA 2PBGA 3CUJA 1Q6FA 3SCNA 3VGDA 1V3KA 4BQ5A 4ZEPA 1G01A 2WHMA 4J3WA 1KGUA 3PTQA 1VBRA 4CD6A 1XYZA 5I24A 3NUKA 1VRXA 1W1PA 4HMDA 5CGTA 3SCVA 4AWEA 2WHKA 5CGMA 3N13A 1C7TA 4UFMA 1HX0A 2FHCA 5CXPA 3SURA 5FCZA 4TX6A 4FMVA 3PZQA 3W28A 4H8VA 1HKMA 4EE9A 3U5YA 1LWHA 2WC4A 3GH5A 3PZUA 2OLHA 2C7FA 3GNOA 4J27A 4U2ZA 3WL1A 2J7GA 4AZ7A 3AS2A 1D7FA 2WCGA 4F79A 3NSXA 3K8MA 4D6EA 2DQXA 3T08A 2G3IA 3WUEA 4U31A 2YA0A 2NW0A 1V6YA 1HJVA 3SEPA 2XVKA 4P7NA 5IHSA 1WZKA 3OGRA 2WZIA 4AC1X 5BXTA 2VRKA 4ZFMA 3MMDA 1QHZA 4CD4A 3VIJA 3CBWA 5IDIA 2DDXA 4DM1A 1ZBWA 4GI6A 2YDSA 4XX6A 2OYKA 1EOMA 2XHYA 2DSZA 1BGAA 3CIVA 3FAWA 3II1A 5A8QA 1WZAA 1E1EA 2YL9A 3HMCA 4AIOA 4H8UA 4JHZA 1M03A 1DTUA 4TXEA 1HJQA 3UG3A 1C8YA 1ZU8A 2XGIA 4TUFA 3VIMA 4RE4A 2W62A 1CIUA 5HBFA 4UQAA 2DEPA 1GOMA 1E6ZA 4PMQA 3SCOA 1MFVA 2ZXBA 5A95A 1RPKA 1V3LA 2XIIA 3K1DA 3WY1A 1W91A 5DFAA 4MJ4A 4M81A 1MQPA 1MVYA 3B9AA 3A6OA 1GVYA 1R7OA 4L4OA 2WSPA 3IANA 4EK7A 1WZMA 5A6BD 3MANA 4AEEA 4A4AA 2G4FA 1KB3A 2BHUA 2DIEA 1C90A 1TA3B 4PBGA 1K6AA 3EDJA 3MUY1 4PMZA 3WDPP 4WKFA 3ZJKA 4EKJA 3BGAA 4QLKA 3HU7A 1GOQA 2X2YA 1DEDA 4LXFA 1J0ZA 2XGBA 2OSYA 3BLKA 2VCAA 5JIWA 1OD8A 3PZIA 5ECUA 1OM0A 1OIMA 4PMRA 1OT1A 5GNYA 1BSIA 1EH9A 1Y7VA 1HJXA 3W37A 1UD3A 1C8QA 2V3EA 2XG9A 3U5UA 1UWRA 4DUXA 1JI2A 2JIEA 3ZM8A 1U30A 2ZWZA 4H04A 1HL9A 3A4WA 4CVWA 3T0DA 1E56A 2Y4SA 5JIPA 2EJ1A 4URIA 2GSJA 2W5FA 4BZYA 1I75A 1OD0A 2BS9A 1CDGA 3CHEA 1JIBA 3BAYA 3WDJA 4TVCA 3WQVA 4HMEA 3WF0A 3CPUA 2FGZA 4W7UA 1H4PA 1US3A 2E3ZA 3WBAA 3VMOA 5DO8A 1E5JA 1BVZA 4AD4A 3GXFA 3VKKA 4F8XA 4B9ZA 1MFUA 1X6NA 3WEMA 1CGTA 3WMSA 2XFYA 1UA3A 5HOSA 4M8UA 4NSBA 1CLXA 2PWDA 1XYFA 4DWSC 2EO7A 1VJSA 4KMQA 1CEOA 5CPQA 2FHFA 4D6CA 3WQWA 1HN1A 1CXHA 1WDSA 4BCEA 3S6TA 3MKKA 5CQ1A 4E2OA 1CNVA 2JALA 4Z2JA 3VD7A 4GI8A 1HNYA 3PZMA 4E8DA 5E6YA 1A47A 1F4AA 1JYVA 3UERA 1W9PA 2IUZA 5E70A 1V3IA 2Z1SA 3AROA 2VZSA 4BQ4A 1KWKA 7CGTA 4AD5A 3PZOA 2JIWA 3GNRA 3F5LA 2J62A 1CGUA 1GOIA 2ZOXA 2XJ7A 1UOKA 2NSXA 3U57A 2ZUSA 2W66A 3TOPA 3L4VA 3W53A 1WNOA 5IXEA 1JDAA 2J7EA 3ZT5A 1JAEA 4MTVA 4XZBA 3TTYA 3EMCA 3VIHA 3AMKA 4J3XA 2BHZA 1PX4A 1B3YA 1KGXA 3B8SA 1NM9A 4PMVA 4K68A 3UCQA 1UR2A 5BWFA 3WD1A 2A3HA 2XSBA 4ATWA 4QAWA 5LA1A 3W6LA 3ZR5A 4JZ5A 1FP8A 3N15A 4MNJA 1NARA 1G94A 2JE8A 3WUBA 2V3DA 3A47A 2BY0A 2YDQA 1TZ7A 3DYPA 1DWGM 4MDPA 4DWSA 3SUUA 3WNNA 2UY5A 3W38A 1BG9A 3EDDA 4ACYA 2EBNA 3OGSA 1GOOA 1GNXA 3VPLA 4A3YA 5A8MA 1MW3A 4ATLA 2IXVA 3QHMA 3LPPA 2CERA 4UFJA 4OOZA 4TVUA 5AY7A 4GO9A 3VDBA 3CTTA 4PEEA 4UNIA 1C92A 3A4XA 5D9MA 5CPTA 5D8ZA 4IM4A 2WMFA 1NWTA 2DIJA 4RE3A 2WM0A 1JD9A 2W63A 4GZJA 5FIPA 1JYNA 4UCFA 5I79A 1PAMA 2ZUNA 2HISA 1E0WA 3BLPX 1QI0A 2OYLA 2XFFA 3OG2A 4N0RA 1BFNA 3AIVA 3OZOA 2GJRA 2Y5EA 3RJYA 5KEZA 1PBGA 1HP4A 4D72A 3QHNA 3ZJ7A 5C70A 1BAGA 3WIJA 4QCEA 1ECEA 2WC7A 1B3VA 1XSKA 3GXIA 1CLVA 2ZUVA 2FGLA 1UYQA 1SMAA 1VJZA 2CBJA 1LL6A 2YOCA 1ITCA 1J0JA 4FF5A 3PHAA 1KXTA 3WH9A 5A3HA 3N9KA 4MADA 1UR0A 1GVIA 3CUFA 3L4UA 3VU2A 2D22A 3PZ9A 4M1RA 4WKHA 1UZ4A 3GM8A 2V5DA 1E43A 4OBSA 4V2XA 3VGHA 3ZSTA 1G9HA 1E55A 2QPUA 5D8WA 3WH5A 1EGZA 8A3HA 3ZOAA 1H2JA 1KCKA 1XH0A 5E6ZA 2JEPA 3T2OA 1CYGA 3CUGA 4CU7A 5BRPA 5FOOA 4HPGA 3GBDA 2G41A 2FH8A 4PMNA 4YPJA 4W86A 3GNPA 1HL8A 5I77A 1CBGA 2VRQA 2WWCA 5ABHA 2F61A 3WSUA 3ARSA 3AZRA 1XH1A 1JGIA 1R8LA 2D0GA 1JI1A 1Q6DA 1OWQA 2VNCA 4ZXOA 1V0KA 1E6NA 2ZWYA 3ZO9A 1E5NA 5I3DA 1VEMA 3AXHA 3W4RA 2D0FA 3IJ9A 1JYXA 4GQRA 3FHQA 1W2VA 3WUGA 3MUIA 6TAAA 1W1VA 3SUSA 3KE0A 2ZICA 3KWXA 3EMQA 1MWOA 3OLEA 4HOWA 1AMYA 1JF5A 3AHXA 2JEQA 2WYSA 4CCEA 3VGFA 5BRQA 3WFLA 4AZHA 3L2MA 4DWSB 4FLRA 4FLQA 2YDRA 4P7RA 1MYRA 3BAIA 2A3CA 1E6PA 2V3GA 3WFZA 1FA2A 1BPLB 5HXMA 3W0KA 4R5EA 1ISYA 2CHNA 1HP5A 3T0AA 4L4PA 1TA3A 3W29A 4UOZA 3MSGA 4PN2A 2OWWA 4D1JA 3WH6A 4HZ8A 1K9FA 3OA5A 4C90A 1VBUA 4UR9A 1Q6GA 1F4HA 1E72M 1LQ0A 3CZJA 3MSDA 1LG1A 2DSVA 3WDRA 1AQMA 3K8LA 2WK2A 1OSEA 4AYSA 1ISWA 2WKGA 3JUGA 2VMFA 1PX3A 3OLDA 1UD4A 4JL2A 3UEQA 2DSWA 1TCMA 3EDEA 3TONA 1V3MA 5CG0A 5FD0A 4W89A 4MDOA 1B2YA 1O6IA 4UQBA 3HN3A 1XD0A 1KFWA 1W2PA 2XVLA 5A94A 1P6WA 1UWUA 2XVNA 1I1WA 1KXHA 3AOFA 1L0PA 5GQBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 5CLT A;  5EFF A;  5CZK A;  4UFL A;  3ZMR A;  2W4X A;  4QFU A;  1H0I A;  2WCA A;  4W85 A;  5CSU A;  4Q22 A;  2DH2 A;  3MS8 A;  3M6D A;  1EDG A;  2J7B A;  4HA4 A;  3M46 A;  3PTK A;  4D6H A;  1WAW A;  1EXP A;  1W3J A;  1JF6 A;  1H41 A;  3LPF A;  4TVD A;  4D6F A;  5TD4 A;  3MV0 1;  1GZJ A;  4ZE5 A;  1V02 E;  5I23 A;  3NIY A;  1VEP A;  2QV4 A;  4AY1 A;  3WN6 A;  1B31 A;  2Y24 A;  2WMI B;  4PYS A;  2VVN A;  1B0I A;  3L4T A;  4BS0 A;  2F8Q A;  4J7R A;  3T2Q A;  3NDY A;  2EPL X;  4OIF A;  1W32 A;  2PF0 A;  4W5U A;  1TR1 A;  1GHS A;  1SR0 A;  3WMB A;  4CU6 A;  3WKZ A;  1QI2 A;  1UG6 A;  2WVU A;  1OIN A;  2WNW A;  1VB9 A;  3AIB A;  2D3L A;  1R85 A;  3W6M A;  4P8X A;  1ESW A;  1CXE A;  1B3Z A;  1JZ2 A;  5FL1 A;  1PIG A;  1UR4 A;  3CO4 A;  1XHG A;  3EDF A;  4HA1 A;  5M5D A;  3AS1 A;  3O2L A;  2WMJ A;  3SCR A;  2QMJ A;  4J3U A;  3WBE A;  1PZ2 A;  3NYD A;  3T2P A;  3K8K A;  1DWA M;  1EO7 A;  4MB4 A;  3GXM A;  3AIQ A;  1QW9 A;  2CBU A;  2DT3 A;  4W88 A;  2WXD M;  6CGT A;  1UUQ A;  2CBV A;  1IZK A;  1Q6C A; 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