2XJ7A

Btgh84 in complex with 6-acetamido-6-deoxy-castanospermine
Total Genus 242
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
242
sequence length
712
structure length
639
Chain Sequence
SLQPPPQQLIVQNKTIDLPAVYQLNGGEEANPHAVKVLKELLSGKQSSKKGMLISIGEKGDKSVRKYSRQIPDHKEGYYLSVNEKEIVLAGNDERGTYYALQTFAQLLKDGKLPEVEIKDYPSVRYRGVVEGFYGTPWSHQARLSQLKFYGKNKMNTYIYGPKDDPYHSAPNWRLPYPDKEAAQLQELVAVANENEVDFVWAIHPGQDIKWNKEDRDLLLAKFEKMYQLGVRSFAVFFDDISGEGTNPQKQAELLNYIDEKFAQVKPDINQLVMCPTEYNKSWSNPNGNYLTTLGDKLNPSIQIMWTGDRVISDITRDGISWINERIKRPAYIWWNFPVSDYVRDHLLLGPVYGNDTTIAKEMSGFVTNPMEHAESSKIAIYSVASYAWNPAKYDTWQTWKDAIRTILPSAAEELECFAMHNSDLGPNGHGYRREESMDIQPAAERFLKAFKEGNYDKADFETLQYTFERMKESADILLMNTENKPLIVEITPWVHQFKLTAEMGEEVLKMVERNESYFLRKYNHVKALQQQMFYIDQTSNQNPYQPGVKTATRVIKPLIDRTFATVVKFFNQKFNAHLDATTDYMPHKMPLQVKANRVLISPVEIELDAIYPGENIQILSAGLQKAPVKFVFVLTIEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Inhibition of O-Glcnacase Using a Potent and Cell-Permeable Inhibitor Does not Induce Insulin Resistance in 3T3-L1 Adipocytes.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
molecule keywords O-GLCNACASE BT_4395
total genus 242
structure length 639
sequence length 712
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2010-07-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
A PF18344 CBM32 Carbohydrate binding module family 32
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 2xj7A03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2xj7A02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 2xj7A01
3JUGA 1W9UA 4P8XA 1NOWA 1EO5A 2DQXA 1M53A 5E6YA 1C8QA 1O7AA 2VX4A 1HNYA 1XH0A 3OLGA 2Y2WA 3SIMA 4MB5A 1KGUA 4X9YA 3AMCA 4PMVA 4E2OA 1UWIA 1UWTA 3L4UA 2GK1A 3CLWA 2D0HA 4AD1A 2X0HA 3WD1A 1J11A 3VNZA 3WQ6A 2E8ZA 4HU0A 2WKGA 3ZIZA 1JZ8A 5DMYA 1XYFA 5HOSA 2QF8A 4GINA 4N0RA 5KZ6A 2WVTA 4H04A 1FH9A 5A6BD 3UG5A 5IXEA 1V0NA 1NARA 4HTYA 3BAKA 1QNRA 5A6JA 4PUEA 3OBAA 3A6OA 4MNLA 1J10A 2O9OA 4AZCB 3VVGA 4P7QA 4X0VA 1GOWA 4YPJA 1B31A 2C0HA 1TUXA 1XHGA 2WMJA 3N17A 1HKJA 3W29A 4IPLA 2E0PA 3F4VA 1HKKA 1RH9A 2QHAA 4E8CA 2CCRA 2EO7A 2BY1A 1EQPA 3WQ4A 1K9TA 3M6DA 1HX0A 2WXDM 1F4HA 1JF5A 1CZ1A 2PWDA 4AISA 4M56A 8CGTA 4AMCA 6A3HA 5CSYA 1C90A 4F8XA 2XJ7A 4DUWA 1VENA 1QHPA 2A3HA 3K4AA 1EQCA 3VGGA 1PIFA 3AMLA 3BCDA 4TUFA 4LPCA 1GJUA 4V28A 1OBAA 3CHDA 1WP6A 3NSNA 5CQ1A 3ARSA 1DWIM 1E6NA 2EXOA 2X05A 4C91A 1OT1A 4QAWA 4NSBA 1B3YA 1C7SA 2XWDA 4W89A 1CGWA 4QCFA 1DWFM 4BA0A 2WVSA 2Y8KA 2XVNA 1U33A 4H41A 2BXZA 4ACZB 1DWHM 4PMUA 1BYAA 1NOUA 2PWEA 2CBJA 1QI5A 4CCEA 4F9DA 4GI6A 2XHYA 2BNJA 3NSXA 1BF2A 2ZWYA 3NDZA 4DWSC 2JF6A 5F7UA 1HKIA 1CXEA 4PRWA 2D3NA 5GNXA 3WDRA 4AW7A 1OT2A 5LA1A 1JL8A 1WDRA 1KXQA 1UR9A 2WW5A 2DT2A 1JZ6A 4C7FA 3WMBA 4PCTA 4JL1A 2DH2A 4GO9A 4CUCA 1JDDA 1OD0A 1W2PA 1ISXA 1ISWA 8A3HA 1UH2A 3SURA 2Y8VA 4J7RA 1KB3A 1HJWA 1OIFA 4ZEPA 4H7VA 1JZ3A 2WVVA 1M01A 5D9MA 3UR8A 2WZEA 2VRJA 2MANA 3VUPA 3VM7A 3ZJKA 3QOMA 1JYVA 1J0IA 1HN1A 1NP0A 5A94A 1UWRA 1LQ0A 1QW9A 2G3IA 4OUEA 3EMCA 3ARQA 4GXPA 2IXVA 1E0VA 4C7GA 4PTMA 3SCSA 4L4OA 1VBUA 2WCGA 3OLIA 1UA3A 1HXJA 4EAMA 2WC3A 2Z1SA 4JFUA 4CD4A 1BFNA 3BLPX 3AXIA 3VDCA 3SCOA 4P7NA 1EHNA 1DHKA 3WUEA 4AZ7A 2ZICA 1WDPA 2IUZA 4GPNA 2QV4A 2FHBA 5FL0A 2J7EA 4R27A 1EGZA 1RP8A 2UY3A 3L4TA 1V3HA 1C8XA 1LL6A 4UFMA 3I3BA 1PX8A 4AIUA 1XD1A 2DT0A 1CLVA 1R87A 3CH9A 2WLZA 3WNNA 3ARRA 2C7FA 1HVXA 2DT3A 3UESA 3ARWA 3KWXA 2OYMA 1JFHA 2YLAA 3W28A 2VZUA 4AZ6A 3WDPP 1UWUA 2VZSA 4W87A 3SUVA 3WF4A 1H5VA 5I77A 1RD6A 2YL5A 1Z32X 2EPMX 1WPCA 1GVYA 3B9AA 3CUHA 4KRUA 2CKRA 3G6MA 4PUDA 3AISA 1V6UA 1XGZA 4GKLA 2W4XA 1C7TA 4Y7EA 2EBNA 5M5DA 4TVDA 2WCAA 1E4LA 1I1WA 3IJ9A 1V02A 1HKMA 2CBUA 3PHAA 1XH1A 2PI6A 5I23A 1TA3A 2PWFA 1SMAA 4RE2A 1OB0A 4XV0A 2XVPA 3WUFA 3PZVA 2YBUA 4U31A 1W9BM 1BG4A 1V0MA 1MFUA 2W5FA 3CIVA 5LYRA 4W84A 3S6TA 2WAGA 1KGWA 5KEZA 3VTRA 3VX1A 2V3DA 1H41A 3WQ5A 3W81A 1QNOA 1JZ4A 3OGRA 3AS3A 1TFVA 2D22A 4NRSA 1HJXA 1CTNA 4JZ5A 1OD8A 2FDMA 2EQDA 3WNKA 5I3DA 3FXYA 2J7FA 1H09A 3VX0A 1G5AA 4AY1A 3TA9A 3WNMA 2OYLA 2FGLA 3BXWA 3AZTA 1HP5A 4AXNA 4HMEA 5ABGA 2VCBA 1B0IA 1KXVA 1RPKA 2DPEA 4C7DA 4UNIA 2VR4A 4Z2JA 2F61A 1BQCA 1TVNA 3RMEA 1E4MM 3F5LA 3NIYA 4AD5A 4CN6A 5ABFB 3ARPA 4V27A 2WKLA 4CD5A 5A2CA 4D71A 4D6EA 1CECA 2DDXA 4MB4A 1HIZA 3AICA 3ARVA 3ALGA 2VX5A 4YHEA 4IISA 4EKJA 5DF0A 2QMJA 2PB1A 2WBKA 1E6PA 4ZXLA 4BQ5A 3OA5A 2W66A 4P8WA 1AQHA 2CNCA 3UG3A 1JF6A 4CU7A 1E70M 5CGMA 1QNPA 2VT0A 3A3HA 3MKKA 3AMKA 5EFFA 1GCYA 3O6AA 2XM1A 3VMOA 5D9OA 3BGAA 4KGJA 2YL9A 1CXKA 3MMWA 4TVCA 1HL9A 1K9FA 3O9NA 2BHUA 4UQEA 4C90A 4Q7NA 1MW3A 4W7VA 1XYZA 1X1NA 3HN3A 4BQ2A 5BXSA 3MUAA 1E6RA 2X09A 4GZJA 1J0HA 4QLLA 1V6VA 4LQ1A 3ARUA 1NWRA 2VL4A 4UZUA 2J79A 2OSYA 3FY1A 1OGSA 4W5ZA 2DSKA 3RM8A 2WMGA 1X6NA 2X2YA 1H0IA 3LPGA 2Y5EA 2GSJA 2Y24A 4UFLA 5A2BA 3W53A 1G94A 3WH9A 1VFFA 3W26A 2ZXQA 5A8PA 3BH4A 2XGBA 3BAJA 4N42A 2JIEA 3ZSTA 1G9HA 3QR3A 3WF3A 4W7UA 3L4WA 3MS8A 4H8UA 4P7RA 5JUVA 1NH6A 3TP4A 5BWFA 3HJEA 1W1TA 1G0CA 4Q22A 4AYSA 1E3ZA 3KZSA 5LA0A 3WD4A 4TVUA 2WSKA 4UR9A 2VO5A 4JKLA 3AMGA 1HJSA 1M04A 3VIMA 2DEPA 4B3LA 1ZB5A 1GONA 4TOQA 3THDA 2FHCA 1MFVA 3WFZA 3N9KA 2OWWA 3EMZA 4AZGA 2JF7A 4PBGA 3AIUA 4B15A 1MW0A 5M03A 3EDKA 3VDAA 4ATDA 2VCAA 1QBAA 2CESA 1MQQA 3WF2A 1OGBA 2XTKA 1ISYA 1QVBA 2JEQA 5GPRA 2GJPA 5ECUA 2WCSA 3OGSA 1GQIA 1VJSA 3CZJA 4F79A 4WKFA 1W2VA 3NSMA 2DGAA 2ZUNA 3M7SA 1JI1A 1LF1A 3AIQA 4GQRA 2UY5A 1ODUA 1B9ZA 1LWHA 3VMNA 2EPOA 2WSPA 1DP0A 3VKKA 1UHVA 4AD0A 1PX4A 1E72M 3WQWA 2UY4A 2J62A 1C93A 2GJXB 1E40A 4ML4A 1VFOA 2YA1A 3GBDA 2CHOA 3VIGA 5BXRA 3W25A 1VFMA 3WEZA 2ZX7A 1HL8A 1UA7A 3VIPA 1JXJA 4NRRA 2BFGA 1B1YA 3CMJA 1GORA 3VDHA 4JFTA 1ZU8A 3L4XA 1DWGM 3PTMA 5A8NA 1FP9A 1UD2A 4URIA 1XRVA 1W3JA 3BAYA 1OSEA 5EMYA 1Q6FA 2PWHA 1EDGA 4U2ZA 2BVYA 3VMPA 3AQUA 3CZKA 3O2LA 1FHDA 2G8ZA 3QOKA 3K8KA 1CNVA 1E1EA 3SCNA 2E9BA 1G1YA 3NCOA 2VJXA 1HJVA 3MSDA 5I78A 1GQJA 1QI0A 2ZX8A 1ISZA 3CHEA 1B30A 4HPHA 5IHRA 4MTVA 5IDIA 1W9XA 2J74A 3LPFA 3UEQA 1GJWA 4CKQA 4W8BA 5E0FA 2WMFA 3GXMA 1KFWA 3POHA 4Z2KA 3ZT7A 3VGFA 1PIGA 5CG0A 1O6IA 5IFPA 1TE1A 4UFIA 4DWSD 1FH7A 1JZ5A 3N15A 3MUZ1 2XYLA 1E71M 3FHAA 1TVPA 3L4ZA 4DUXA 5ABEA 1F4AA 5A6LA 2J78A 2OWXA 2VX6A 4QFUA 3OZOA 3W37A 1QW8A 2DSZA 5GQBA 2VZOA 3CZLA 1WZAA 4CGTA 2XGIA 2JALA 3KE0A 1JNDA 2VZTA 4UOZA 4HZ8A 1CYGA 3WNPA 2WLYA 2J75A 3T0AA 5GNYA 4E4PA 4XZWA 4B9ZA 1H3GA 1J9YA 2D23A 1KWKA 2V5CA 1PX3A 1V0LA 1GPFA 4FLOA 4HMDA 4MDOA 4AEEA 1NWSA 1B90A 2BXYA 3AIRA 4UQ9A 5A6SA 1BSIA 4U5IA 1M7XA 1KBKA 5DFAA 5CXPA 2WMIB 5I2UA 4HOWA 4PCSA 4RL3A 1CXFA 5EB8A 2EPNA 1P6WA 3SCPA 2VTFA 4WKAA 1PBGA 1KBBA 4M24A 4UOJA 3VD3A 3PZTA 1JIBA 2YJQA 5HBFA 3VGBA 1LWJA 2E9LA 3EMQA 4D72A 2ZXDA 2WWDA 4WKHA 4OKDA 1JI2A 4LGXA 3U57A 3IJ8A 3AHXA 1V6WA 3WNOA 3ZJ6A 3L4VA 1FA2A 3WDQA 3ZT5A 5A2AA 4MB3A 3PZGA 3OB8A 3LPOA 2XFRA 3VDBA 1UUQA 3L2MA 2XVGA 1R8LA 3ZQ9A 4WF7A 1EA9C 3D5HA 2WHJA 1HP4A 5FL1A 2VMFA 3N13A 4FMVA 4RE4A 3TTQA 4D6FA 3PTQA 1OGGA 4CD7A 4PEEA 3MMDA 4M1RA 1QI3A 3QHNA 4MADA 1QBBA 2JE8A 2J25A 1EDQA 1ZS2A 1VIWA 1R86A 3VU2A 3AMDA 1LG2A 1OWQA 5HXMA 1E4IA 1AQ0A 3TTSA 2AMGA 3WUBA 5I5RA 5BROA 1V6YA 3SEPA 1JNEA 1ZBVA 3APGA 3I3DA 3AZRA 4W93A 3DHUA 3PZQA 1B2YA 3WDIA 4AC1X 3DHPA 1JYNA 1KGXA 1XC6A 2D0GA 5CGTA 1H2JA 1E0WA 4WIWA 4TTUA 4ZE5A 4LYRA 4AZCA 4TX6A 2XVLA 5I0DA 5DT5A 4MJ2A 4FF5A 1JYWA 2PWGA 1ZBWA 1LLOA 1U2YA 3AHZA 1W91A 9CGTA 3MV01 3B9DA 1E3XA 1R85A 3AYRA 1UQZA 2ZUTA 3L2LA 4MJ4A 3BMWA 4R5EA 1KWGA 2VRQA 3PZOA 4PMNA 5M3WA 5TD4A 3WL1A 4PSRA 2FH8A 2OLHA 4IUGA 3WF0A 2ZUMA 1KCKA 4M8UA 1V03A 1W9VA 1UKTA 3OIHA 1JAKA 2VOTA 3WH5A 5EFDA 1CENA 1VJZA 4ACZA 2XIBA 4GZIA 1XH2A 1V02E 1H0GA 1BLIA 1SFSA 1L8NA 5A95A 1XV8A 2XUCA 3RM4A 5I6SA 3OLEA 5CLTA 4JCMA 3PBGA 5DEZA 4Z2LA 1A47A 3AHTA 4HMCA 2UY2A 4CD8A 2BVTA 1X6LA 3WFLA 3WH8A 1W9DM 2E8YA 4GIAA 1KQZA 2WHLA 1VEOA 3II1A 4GI9A 3QGVA 5CLWA 1IZKA 1FHLA 3PZ9A 1JD7A 4X0NA 2GUYA 1U30A 3MU7A 4JIEA 3AIVA 2ZWZA 3IK2A 4UOQA 1ZJBA 4W85A 1FFQA 4GO8A 4CU8A 2G3JA 1H11A 3M07A 3FHQA 1V3IA 1L0PA 2JFEX 2VRKA 3J7HA 3HU7A 5AYBA 1UR4A 2CERA 4DWSB 4NZCA 2ZX6A 4FK9A 4V2XA 1A3HA 2D2OA 4CN1A 4PSPA 3DC0A 3W38A 2V3EA 2CHNA 4U5KA 1HT6A 3VNYA 4Z2HA 4PMOA 5BRPA 4WK9A 1WDQA 3VINA 2WMHA 5A3HA 2CBIA 3CUFA 3UR7A 2ZE0A 3VIOA 3WH7A 5LA2A 1CGYA 7CGTA 2VUYA 2J7HA 4J3VA 1SYTA 3VIFA 1QHZA 2X1IA 4AIOA 2WMKA 1HVQA 4J3XA 2YDRA 2ZUSA 5BCAA 2WHKA 1QHOA 3SUUA 4UQBA 4D6GA 3GH7A 1AMYA 1B3ZA 4GI8A 1D7FA 1OM0A 2A3CA 5C71A 4J3WA 1S46A 3TONA 4XB3A 4Z2IA 1SMDA 3ZO9A 4K68A 3U7VA 1ISVA 4TTGA 1AQMA 5FCZA 4PTXA 2WC4A 3MMUA 2BS9A 4YHGA 3RM9A 2EEXA 1XCXA 3ARYA 1HF6A 3BC9A 5BYWA 3T0BA 1WCGA 1W9PA 1CIUA 3N11A 2QLYA 4A3HA 1MWOA 3ZOAA 4KH2A 3RDKA 3DECA 3GYCA 5A8QA 2GFTA 2E3ZA 5CPQA 2YDSA 3BLKA 1EIBA 3WL0A 2DIEA 2V38A 1B3VA 3PZNA 3AHYA 4M29A 1V3KA 4PN2A 3PZIA 3VIHA 3WBAA 4CCDA 3AXXA 4RE3A 4BQ4A 2NT0A 2J8FA 2ESCA 4LYPA 1QI4A 1QOXA 1UR2A 1E9LA 2ZXBA 1WNOA 3NDYA 4CU6A 4U2YA 2GK1B 1EH9A 1US3A 1UQYA 4QDMA 1BYCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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