2WB5A

Glcnacstatins are nanomolar inhibitors of human o-glcnacase inducing cellular hyper-o-glcnacylation
Total Genus 227
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
227
sequence length
585
structure length
584
Chain Sequence
QVLVPNLNPTPENLEVVGDGFKITSSINLVGEEEADENAVNALREFLTANNIEINSENDPNSTTLIIGEVDDDIPELDEALNGTTAENLKEEGYALVSNDGKIAIEGKDGDGTFYGVQTFKQLVKESNIPEVNITDYPTVSARGIVEGFYGTPWTHQDRLDQIKFYGENKLNTYIYAPKDDPYHREKWREPYPESEMQRMQELINASAENKVDFVFGISPGIDIRFDGDAGEEDFNHLITKAESLYDMGVRSFAIYWDDIQDKSAAKHAQVLNRFNEEFVKAKGDVKPLITVPTEYDTGAMVSNGQPRAYTRIFAETVDPSIEVMWTGPGVVTNEIPLSDAQLISGIYDRNMAVWWNYPVTDYFKGKLALGPMHGLDKGLNQYVDFFTVNPMEHAELSKISIHTAADYSWNMDNYDYDKAWNRAIDMLYGDLAEDMKVFANHSTRMDNKTWAKSGREDAPELRAKMDELWNKLSSKEDASALIEELYGEFARMEEACNNLKANLPEVALEECSRQLDELITLAQGDKASLDMIVALNEDTEAYESAKEIAQNKLNTALSSFAVISEKVAQSFIQEALSFDLTLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Glcnacstatins are Nanomolar Inhibitors of Human O-Glcnacase Inducing Cellular Hyper-O-Glcnacylation
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium perfringens
molecule keywords O-GLCNACASE NAGJ
total genus 227
structure length 584
sequence length 585
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2009-02-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 2wb5A03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2wb5A02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 2wb5A01
1PX8A 4C7FA 3PTMA 2ZWZA 1GZJA 3GBEA 2WMHA 1W1YA 1VAHA 3JUGA 3SCWA 2QHAA 1EH9A 4AW7A 2ZUVA 3ARWA 3VD7A 4QCEA 3MS8A 3VMOA 3WNPA 3WMCA 7A3HA 2V3DA 4ZXLA 3WNKA 1PEZA 2ZUUA 4PMRA 1HF6A 1ISVA 3VIKA 4JL2A 4L4PA 2F8QA 3CGTA 4JFUA 1ZBWA 3UETA 2JIEA 1WCGA 4AD5A 5C8BB 4A3HA 1V3KA 1LG1A 3MKKA 4IISA 1E6NA 2QV4A 2UY3A 1XH1A 4D6GA 4UQBA 1MYRA 4DUVA 2BY2A 2GDVA 3U7BA 2WC3A 1HJWA 5A6SA 4QDMA 2BHUA 1BVZA 1H1NA 1U2YA 1CXKA 1E1FA 3WH5A 2NT1A 5DF0A 4Z2HA 2OLHA 1B1YA 4AEEA 4UQDA 1UKQA 1BF2A 3AOFA 1F4AA 2VR5A 2XIIA 1WPCA 4XX6A 4RE2A 4E8DA 1V6UA 1XV8A 3VINA 4WSJA 1B3ZA 1SYTA 2DSVA 2AMGA 3ARSA 2FHFA 3VDCA 1JDCA 4E8CA 2A3BA 2JF6A 1GOOA 4GI6A 3UG3A 2ZXAA 3N12A 1HKIA 2J75A 2V3GA 2JE8A 4B16A 4JAWA 4ATDA 1KB3A 4XZBA 3OLDA 1NWRA 1VFFA 3VIHA 3ZSTA 5BWFA 3RDKA 1QPKA 5D9OA 1E0XA 3VUPA 1P6WA 1RP8A 2BS9A 4OOUA 5DMYA 5AY7A 2J7BA 2UY5A 1MQRA 5GPRA 1HL9A 1HXJA 1E55A 4AD0A 5I77A 1CGWA 2VC9A 1UH4A 3NDYA 4J3UA 3MMDA 1XYFA 3VGFA 4MB4A 4V27A 4JKLA 4XZWA 3S6TA 1BTCA 3MU7A 2WM0A 1TUXA 1NOWA 3N04A 1M01A 4GI8A 4URIA 3UR7A 1ISZA 4F9JA 4F66A 3MUZ1 2WMIA 3GZAA 5GNXA 1UKPA 5CSUA 4C7DA 1E4LA 3L4XA 3ZR6A 3A3HA 1PZ3A 1UH3A 4GQQA 3THDA 3A4AA 2WMIB 3PZIA 3AMGA 4HP5A 4AIOA 3CZLA 2CITA 3WF2A 1TG7A 4IPLA 4QCFA 3F4VA 4M82A 5A6JA 1JI2A 1VBRA 4W7WA 4U5IA 1E4MM 4NSBA 1J10A 1ODZA 5CJ5A 1HT6A 2VX6A 2WK2A 3OZOA 3FHAA 3W38A 3T0DA 1LG2A 1VB9A 1J0ZA 4UOQA 3SUSA 4KRUA 1E0WA 1BQCA 5E0FA 3SUWA 3PZMA 4CD7A 1EXPA 2XSAA 3CIVA 4GZIA 2VT0A 2YJQA 1ZJBA 4KGLA 2XPKA 3DYOA 2WSKA 2WYSA 3SCQA 3SCOA 3TA9A 4PRWA 2CBUA 4PCSA 4JKMA 1JFHA 2E9MA 2WVSA 4QLJA 3F5KA 2BY3A 5IXEA 5JUVA 2EO7A 3GXDA 4CU7A 1J01A 1MXGA 1BPLB 1B3WA 2C8NA 1GHRA 2WLYA 2PWGA 1W32A 3WF4A 3OGRA 3WUGA 4X0NA 1B2YA 1W9UA 5E6ZA 4JL1A 3ARTA 4KWUA 5DT5A 1HP4A 2DPEA 3BGAA 4FLQA 4PMNA 1KR1A 2G3MA 3LMYA 1AQ0A 2NT0A 1VEPA 5A6BD 1US3A 3AS2A 3K4DA 2CKRA 3VIGA 4HU0A 4UCFA 3RJXA 3THCA 1CECA 1JNEA 3K8MA 3WNNA 2FH6A 3ZOAA 4BQ2A 1E6XM 4ATWA 4R27A 2UWFA 1QNRA 3N17A 2W92A 2XFFA 4V2XA 1KBBA 1W1PA 1CXFA 1L8NA 3GXIA 3CMJA 1E9LA 2BV9A 3VDHA 3GTNA 2YLAA 5ABHA 1IV8A 4N0RA 1ZU8A 1V03A 1Q4NX 3NUKA 3CUHA 2QMKA 3CMGA 5CPSA 4DWSA 3MANA 1JDAA 4UFMA 2GJPA 5IHRA 2ZXQA 2XVPA 3E1F1 2J77A 1UA7A 3BCFA 4WKFA 2XM2A 1V6XA 3G6MA 2WLZA 4C91A 1W9VA 1TE1A 4DWSB 3WUBA 5JBEA 2AOSA 3VIJA 1XGZA 2ZXDA 1WZMA 3AIEA 2OYKA 3CH9A 4FF5A 1E72M 1B3VA 3WL1A 1UQZA 2G8ZA 2XTKA 2Y8VA 2Z1KA 5DFAA 4H7VA 1NOFA 1JYVA 5EB8A 1MFUA 2BY1A 2HISA 4PSRA 1GJUA 3VD3A 4PTVA 5AYBA 4HOZA 4H04A 1HVQA 3CZJA 1E6SM 2YIHA 7TAAA 3VM7A 1FP9A 2D24A 2B31A 4FLRA 1E6PA 3EMZA 2Y24A 2JIWA 3AMKA 1VEMA 5JIWA 1VENA 4J3XA 3DECA 3W82A 1V0MA 5CSYA 1DWGM 1AMYA 1WZKA 1CZ1A 1HL8A 2FHBA 1NM9A 1UHVA 1HVXA 3DHUA 4HZ8A 1V0LA 5M17A 1JD9A 3AHXA 1NARA 4M1RA 3MO4A 3AI0A 2BVDA 2DT1A 3RCNA 2C0HA 1HX0A 2C7FA 4F9DA 1JYXA 4BQ5A 3A47A 4IPNB 3W0KA 1FHDA 4HA3A 4XV0A 3ECQA 2DDXA 4J3VA 1CWYA 1UR0A 4EANA 5AYIA 2XYLA 1OT2A 3VD9A 2WB5A 3WNLA 5ECUA 1CPUA 3MUAA 1W9BM 1WDQA 3RPMA 2VZOA 3L4TA 1E6ZA 3AYRA 3KE0A 4UZUA 2XVGA 1XH0A 2FHCA 2VVSA 2RGMA 1HKMA 4TTGA 3QHMA 1WNOA 2IUZA 1AQMA 1E56A 2DSUA 1W3KA 4OJYA 2YOCA 2WC4A 4WK9A 4A4AA 4MB1A 1ZJAA 1QI5A 4JCMA 2XWDA 5A8QA 3KZSA 3VM5A 3OLEA 1KXVA 4AYSA 3DYPA 3DHPA 4P7NA 1V3HA 3U57A 2A3EA 8A3HA 1QNPA 2BVTA 3B9AA 1W3JA 2CETA 1C91A 4W85A 1VFMA 5I24A 3AXHA 2BNJA 5LA0A 1WZAA 1FP8A 3BLKA 4M56A 3TTYA 4M29A 5LYRA 1HJVA 5FIPA 1IZKA 2YBTA 3KL5A 1QI4A 2WBGA 2RGLA 3AS0A 3OZPA 2VQUA 3RM9A 2GJRA 1K9TA 4NI3A 4UQCA 4MJ2A 1VIWA 2OYLA 1GW1A 1B90A 4WKAA 2D0FA 1SMAA 3K4AA 2DT2A 2VRQA 4U5KA 3W24A 4W93A 1GVIA 2J8FA 1SMDA 3SCTA 2EQDA 3QOKA 3BSHA 3CUFA 3O6AA 3ZQ9A 4ZE4A 3ZT5A 1KGUA 3ARYA 5BXPA 1ECEA 4WSKA 4GO9A 2WKGA 1JZ6A 3MUY1 1E3ZA 1W9XA 1H49A 2E3ZA 1GOIA 2A3CA 3T0BA 2G3JA 4OBSA 1UZ4A 1ISWA 1DWHM 4MDPA 3AZSA 1V3MA 5JBFA 1GQJA 1CXIA 2W66A 2X0YA 3BSGA 1G94A 1H11A 1E6RA 2CHOA 2WHJA 1J0KA 5I79A 1WE5A 5CLWA 1DWIM 2E40A 4D1JA 2JF7A 2W5FA 1VF8A 1W3LA 2JALA 4P8WA 3T0AA 5A1AA 2W61A 2V5CA 1M7XA 1JXKA 3LPFA 2DEPA 4D71A 1KBKA 1WDSA 2YDRA 2GK1A 4CD4A 1B31A 1B3YA 4B3KA 3NSNA 3UR8A 1Z32X 3AMDA 4TVDA 1D7FA 1JDDA 4ZE5A 4PSPA 2GK1B 1C92A 1WP6A 5A6KA 4LYRA 1R7OA 3VDBA 2E0PA 1OM0A 1CLVA 3FHQA 3LPGA 4JFWA 1JZ3A 3RMEA 1QI0A 4UZSA 1UOKA 4P8UA 1HKKA 3GBDA 1R86A 3M07A 1KWGA 4PTMA 3AS3A 5BROA 3ZJKA 2V3EA 2DT0A 3TOPA 1S46A 3WH8A 1R7AA 1V08A 3GNOA 4AD4A 4PCTA 3AYSA 3MV11 2Y2WA 3WH6A 2TAAA 2NW0A 4D6JA 6TAAA 1ISXA 5A6MA 3AHZA 2ZICA 4BA0A 3WQVA 1UKTA 4BCEA 5FD0A 1GPFA 4GI9A 4IM4A 4QAWA 1MW1A 4XB3A 4D6IA 4U31A 3SEPA 1C93A 3II1A 1CENA 1UD6A 4AD3A 3VKKA 3BMVA 3WEMA 5I2UA 3TTSA 2PWFA 3CUJA 3RM8A 1QHOA 4DM2A 1EO5A 1HJUA 1E4IA 1FH9A 3U5YA 3J7HA 2EPNA 4U2YA 2F2HA 3I3EA 5CXPA 1BVNP 4BQ4A 3HN3A 5DO8A 1V6WA 2W4XA 5HPOA 5HDRA 1K9FA 2VO5A 3ARVA 4H8VA 3VMPA 3GH4A 4DUXA 2WWCA 4ACYA 1JZ4A 3ALGA 4AD2A 3WD1A 1Q6FA 1EDQA 3SUTA 4C90A 3WSUA 1IT0A 1GHSA 1PIGA 2OWCA 1TA3A 4OOZA 4HOXA 2PF0A 1BGAA 1I1XA 1UWUA 2XSBA 1XSJA 5IFTA 3TP4A 3VILA 1EOKA 1JI1A 1C90A 4S3KA 4UQEA 3CZGA 1NWSA 4GKLA 3ZJ6A 1J12A 4E2OA 1UR8A 1UWRA 2X1IA 1EOMA 4W8AA 3VOCA 1ZB5A 3WF1A 4WLCA 4ACZA 5A94A 4LQ1A 3OGSA 1TA3B 4MTVA 3AIBA 1E43A 3I3DA 1UYQA 4EE9A 4UFJA 4MNLA 1CXHA 4H8UA 2DIJA 1JFXA 4ACZB 5A6AA 1D2KA 8CGTA 2J25A 2FGZA 3ZM8A 5E09A 3ARZA 4TVCA 1KXHA 2D23A 2WANA 4NZCA 1J0YA 3DC0A 4AZ5A 3RM4A 3WDRA 2VTFA 1FFRA 3A4WA 4YPJA 5KZ6A 2ZXBA 2WNWA 2WVUA 3EDDA 5BRPA 1TFVA 1OBAA 3RJYA 3AHTA 4W5ZA 1E40A 1RH9A 2PC8A 3CHDA 2CKSA 5I6SA 5A6BA 5KEZA 4B15A 5BXSA 1CGXA 1BYAA 1JZ5A 3WKZA 3VX1A 4GO8A 1XC6A 1M04A 3ARRA 2VZVA 3K8KA 1OINA 3NYDA 4W5UA 3WEZA 4AZIA 1OWQA 5IHSA 3VIPA 1E3XA 1CDGA 1UR1A 1BG9A 3G6LA 1QHZA 3FAWA 3BXWA 3L2MA 4QP0A 3GNRA 3PZNA 3POCA 5GNYA 1J11A 4P8VA 4MDOA 4CGTA 2XIBA 1I75A 2YA1A 4UQ9A 2UY2A 3PBGA 2J47A 4ZFMA 2G41A 3BAXA 3FY1A 3IJ9A 5D4YA 5JBDA 4TVUA 1HP5A 5EFFA 3EDJA 3U7VA 5I78A 1W2VA 3GH5A 2J62A 3PHAA 4DWSC 1GUVA 1KFWA 1PBGA 1TR1A 4R5EA 1O7AA 1JZ8A 1DP0A 1KWKA 1UD3A 1WAWA 1UWTA 2O9TA 2XFRA 2ZE0A 3BCDA 4PBGA 1QOXA 3N1AA 4U3CA 4W7UA 5D8WA 3WFZA 1OIMA 5A2CA 3K46A 2WBKA 3BAKA 1YHTA 2IXUA 4UFIA 5I23A 2D1ZA 1MWOA 1BAGA 4PTXA 1X6NA 3VIIA 4NF7A 1EQCA 3CLWA 2WZEA 4D6FA 3EBVA 4Z2JA 2UY4A 3BAIA 4FK9A 5HNNA 3HJEA 2WCSA 1V6VA 1NQ6A 2YLLA 2FDMA 2VMFA 2WVTA 7CGTA 6CGTA 4AISA 2CBIA 4AD1A 2CHNA 4MNJA 1ITCA 3T09A 3SCVA 1EQPA 5HPCA 4M8UA 4LPCA 3IANA 3N15A 1OIFA 4ZENA 3ZJ7A 4NRRA 5ABGA 2Y8KA 1H0IA 1H09A 2XHYA 1H5VA 2V38A 2GFTA 1G1YA 2ZUMA 1A3HA 2W62A 4D6HA 3WDQA 3W81A 1K9EA 3GM8A 1LWJA 4UFLA 1MQPA 3SCUA 4W87A 5D9NA 1DEDA 3WUEA 2ZX8A 1JL8A 2EPOA 2D3LA 4F79A 3UERA 3I3BA 2PBGA 3RIKA 2DSKA 3PZUA 4K68A 1H0GA 1YQ2A 4JFSA 3OA5A 4UQAA 3WENA 1B30A 4BF7A 5A8PA 5FL0A 3AZTA 4YHGA 3AIUA 4JFTA 4P8XA 1GOMA 3WQ6A 1C8QA 3AICA 1W9DM 4JHOA 5A95A 3W25A 4D1IA 2WXDM 3AMLA 4V28A 4KRTA 1OGBA 4AZ7A 1ZBCA 1EA9C 4CU6A 2J7GA 1PX4A 3T2QA 3GNPA 4X0VA 3QR3A 2EPMX 1LL4A 3W6MA 3KWXA 1KCKA 3WEOA 4WIWA 4AZHA 3OLGA 4CD8A 4DM1A 1BYDA 4UR9A 2VCCA 2BHZA 1XHGA 2D0HA 4AZBA 4EK7A 1LL7A 1PPIA 4Z2IA 1AVAA 3U5UA 1HNYA 5CZKA 1Y7VA 3VGBA 4TX6A 1L0PA 2CPUA 3VVGA 4TUFA 4PEEA 1HN1A 2IXVA 1CNVA 2J7CA 1E1EA 3WH7A 2VJXA 4M24A 4QFUA 2AAAA 5GQBA 1EGZA 3CTTA 4P7LA 1JZ2A 2J7HA 4J7RA 1CXEA 4ZEPA 1BLIA 3AMCA 3OG2A 1E15A 1RP9A 1R87A 5IFPA 2EBNA 1H41A 5HOSA 3OGVA 2WHKA 4X9YA 1UWSA 2PWHA 3M6DA 2WVVA 4AZ6A 4RL3A 2CBJA 2X8RA 3W37A 4OIFA 3TONA 4DUWA 5JIPA 3WD4A 1JF5A 3WQ5A 1WB0A 1MW0A 1V02E 1WO2A 2WVVB 3B9DA 4PUEA 2YDSA 3WD2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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