2WCAA

Btgh84 in complex with n-butyl pugnac
Total Genus 225
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
225
sequence length
585
structure length
578
Chain Sequence
LQPPPQQLIVQNKTIDLPAVYQLNGGEEANPHAVKVLKELLSGMLISIGEKGDKSVRKYSRQIPDHKEGYYLSVNEKEIVLAGNDERGTYYALQTFAQLLKDGKLPEVEIKDYPSVRYRGVVEGFYGTPWSHQARLSQLKFYGKNKMNTYIYGPKDDPYHSAPNWRLPYPDKEAAQLQELVAVANENEVDFVWAIHPGQDIKWNKEDRDLLLAKFEKMYQLGVRSFAVFFDDISGEGTNPQKQAELLNYIDEKFAQVKPDINQLVMCPTEYNKSWSNPNGNYLTTLGDKLNPSIQIMWTGDRVISDITRDGISWINERIKRPAYIWWNFPVSDYVRDHLLLGPVYGNDTTIAKEMSGFVTNPMEHAESSKIAIYSVASYAWNPAKYDTWQTWKDAIRTILPSAAEELECFAMHNSDLGPNGHGYRREESMDIQPAAERFLKAFKEGKNYDKADFETLQYTFERMKESADILLMNTENKPLIVEITPWVHQFKLTAEMGEEVLKMVEGRNESYFLRKYNHVKALQQQMFYIDQTSNQNPYQPGVKTATRVIKPLIDRTFATVVKFFNQKFNAHLDATTD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Insight Into a Strategy for Attenuating Ampc- Mediated Beta-Lactam Resistance: Structural Basis for Selective Inhibition of the Glycoside Hydrolase Nagz.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
molecule keywords O-GLCNACASE BT_4395
total genus 225
structure length 578
sequence length 585
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2009-03-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
A PF18344 CBM32 Carbohydrate binding module family 32
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 2wcaA03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2wcaA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 2wcaA01
3GXDA 3VD7A 3WENA 1RD6A 2EPMX 4YHEA 1G01A 1XSKA 3VGGA 1DWHM 2V3DA 2E8ZA 3O2LA 2ZIDA 4OIFA 1ISYA 2GK1A 3BSHA 3WEZA 5A6LA 5FKYA 1ZBCA 1OT2A 2JFEX 4DUWA 2EJ1A 3WEOA 3D3AA 4H7VA 2BXZA 3VIGA 1UZ1A 1OWQA 4J3XA 4HPGA 4GI9A 4P8XA 2BXYA 5A2AA 3AMGA 3AZRA 3ARYA 5JIWA 3MUZ1 1JGIA 1HJQA 5D9OA 3W53A 5AYIA 2V3GA 3UR8A 1WPCA 1EQPA 4EK7A 4QCFA 3OBAA 2WHJA 3NDYA 3W25A 4HMCA 1NP2A 3VGEA 2BVYA 5BXPA 1NOUA 5D8ZA 9CGTA 3A4XA 4UQDA 2WLZA 2IUZA 5A6BA 1J0JA 3WQ6A 3VMOA 1V08A 3B9DA 3WH5A 4A4AA 1NWTA 2UY3A 1CWYA 2XYLA 1CGXA 4WKHA 1JFXA 1FH9A 1J0YA 2BVTA 2E0PA 2XTKA 2VURA 3VGHA 3AJ7A 2YBTA 1KCLA 3VIHA 3AS2A 5DT5A 2O9PA 1P6WA 1H09A 2XIBA 3SUTA 4OUEA 1X6LA 1K9DA 2OSYA 3WQ4A 3SCPA 2G4FA 2J7HA 1EOKA 1OIMA 5D9NA 3T09A 4W85A 3MKKA 1W9DM 5BXTA 1D7FA 2XSBA 3U5YA 4UQ9A 4MTVA 5DO8A 4PMYA 4OZOA 1KWKA 1RP9A 1BG9A 1Q6CA 2BNJA 3T0AA 5CGMA 1G9HA 4U5IA 3FAWA 4UOZA 3VGDA 4LYRA 2J75A 3SCQA 3UETA 1LWJA 3WL0A 3CPUA 4MNKA 3WNMA 1M53A 2ZOXA 1BG4A 4JZ5A 2QPSA 3AIRA 6A3HA 1UD4A 3WNOA 3AISA 5ABEA 1K9EA 1E40A 4MNJA 3KZSA 3HN3A 1J10A 2PWDA 4H8HA 5E0FA 3UG5A 4CUCA 1C8QA 4BQ2A 5ECUA 4W93A 2C7FA 1J0HA 2O9OA 4PBGA 2ZX5A 4RE4A 3CUIA 1Q6EA 2GSJA 2PBOA 4H2CA 4JKMA 2CXGA 4UFMA 4X0VA 4AISA 3VIKA 5HXMA 1W3KA 2CCRA 4PMZA 1JF6A 3CMJA 1FH7A 3N1AA 3AFBA 4ATDA 1YQ2A 4Q7NA 3THCA 4P7LA 2E9BA 1EDQA 2BHUA 2D3NA 2FGLA 7TAAA 1Q6FA 4UOJA 1U33A 2NW0A 1QOXA 2BHZA 2OWWA 5A3HA 1W2PA 4DWSB 3ARSA 1MQRA 1QNOA 1QI4A 4Z2LA 2ZWZA 4CKQA 3PN8A 1SR0A 1TCMA 2WVSA 3KWXA 4WIWA 1SMDA 3CHEA 3UEQA 3WNKA 3GM8A 4HU8A 1V6YA 2O92A 5HDRA 3U5UA 1HJSA 4MNLA 1YHTA 1VF8A 4H41A 4FLRA 2QMJA 1UD8A 3VOCA 1UA7A 1WKYA 3AOFA 3J7HA 3L4TA 1TR1A 2QV4A 3ZOAA 1TVNA 4JCMA 1QI0A 3SUWA 1EHNA 5D4YA 5FCZA 4A3YA 1MYRA 4ZEPA 6TAAA 5DFAA 4J28A 2Y8VA 4PEEA 2O9RA 3S2CA 3AIVA 1V02E 3GZAA 1KBBA 4PCTA 3TP4A 1H0GA 3K1DA 1UR2A 2ZUVA 4AZBA 4TTUA 2GFTA 2Y24A 4LPCA 4GIAA 4GZEA 4HOXA 3AXHA 4UTFA 5EB8A 1CECA 2ZUMA 4D71A 4U5KA 3WUEA 2DSUA 2VC9A 3ZJ7A 5JBEA 4UZSA 4RE3A 1VAHA 2J74A 3SUSA 3U57A 1UKQA 1UH4A 4TVUA 4XZWA 5JIPA 4TX6A 3T2PA 3SURA 4URIA 1W3HA 5M3WA 4B9ZA 1IZJA 2ZX7A 2PWFA 1QHOA 1QNRA 1MFUA 5CSYA 3TONA 4BA0A 4D6GA 3AMCA 3CMGA 4AZCB 1RH9A 1H4PA 2A3AA 4R5EA 3WDPP 5DMYA 4D6JA 3KL0A 3AROA 3ARUA 1GJWA 4HZ8A 3OLGA 3SEPA 3I3DA 2YDRA 3ZMRA 4HZ6A 3W26A 3WQWA 3BSGA 1HJVA 2EPLX 2YDSA 3EDKA 1ZJAA 3AHZA 1Q6GA 1Z32X 1CEOA 2ZUSA 3M7SA 4W7UA 2D23A 2YL6A 4AIOA 4UQEA 3WDHA 4C7GA 5A6KA 2D22A 1W9PA 3AXIA 3OLIA 1V0KA 4PMXA 3L4WA 4EAMA 4C7DA 2VZVA 2CNCA 1DWIM 3F5JA 5CQ1A 1EDGA 5E70A 1E6RA 5A6SA 1E5JA 3WDJA 1CGUA 3BH4A 5IDIA 1EH9A 3SCTA 3TTSA 2O9TA 1CXLA 1C93A 3VD9A 3D5HA 4C7FA 2VCBA 5CLWA 1HX0A 1HKKA 1TVPA 2WMFA 3N17A 4PMRA 1GJUA 4U2ZA 5A6AA 1JFHA 3EMCA 3WFLA 4M1RA 3PZUA 1M04A 1CYGA 3B9AA 2DDXA 2JF7A 1OCQA 5I6SA 2W4XA 1TUXA 3LPFA 4J3WA 4ZE4A 4PMOA 1HJUA 4ATWA 4AYSA 3CH9A 4TVDA 3IJ9A 3ARQA 4KGJA 4BQ3A 2ZE0A 2WANA 3CHDA 1C90A 2X8RA 3BAJA 3K4DA 3SUVA 3F4VA 1E73M 4Z2HA 5CLTA 2XFRA 5BCAA 2PWGA 1HKIA 1UWSA 3MV01 5AC5A 3A6OA 2V5DA 2XWDA 1B3XA 1XCXA 2AMGA 3SCOA 4ZXLA 8CGTA 5IXEA 3WELA 3A3HA 1W9VA 2J4GA 4FK9A 2W62A 1EA9C 1HJWA 2EXOA 1QW9A 2VRKA 4Z2GA 1WE5A 1CGTA 1SFSA 4XX6A 1ZL1A 5I2UA 2HVMA 4OBSA 1XSIA 4A3HA 1UH3A 2YL8A 1VFFA 1PIGA 2VCCA 2XVNA 1C7TA 4P8UA 3OG2A 3U7VA 4AZCA 2Y4SA 1K9TA 3ZT7A 1CZ1A 2VUYA 1ZBKA 1WO2A 1V0MA 3T0DA 5AYBA 1BYAA 1E71M 5A8NA 1KBKA 1NWUA 2UY2A 3NSNA 3OIHA 3RMEA 2YA1A 3NUKA 1IV8A 1OSEA 5CPSA 3GH5A 3ZT6A 4CVUA 4PTMA 1E6XM 1S46A 2J7BA 3CUHA 4AD0A 2E40A 4BCEA 5TD4A 3WKZA 2DT1A 5FOOA 1UR8A 3ZM8A 1GHSA 1V3IA 2XVGA 1HF6A 4UFLA 1VFUA 4AZ7A 1MWOA 3HU7A 5E09A 7A3HA 1BGAA 3AI0A 4U2YA 2IXVA 3WF1A 3ZIZA 3W28A 1MQQA 4W5ZA 3TTOA 1O7AA 3VIJA 3EDEA 2XWEA 4JKLA 1WDPA 4PUEA 1FFRA 5EFFA 1E4NA 3VMPA 3ZR6A 1QNSA 1XH2A 3CUJA 3APGA 3PTKA 1DWFM 2WWDA 4P7OA 2DIEA 3VD3A 1XYZA 1XCWA 2VRQA 1JZ6A 1OM0A 1QVBA 2EQDA 4WJXA 3T0BA 4PMVA 3ZJ6A 3OA5A 1HP4A 1MVYA 2FDMA 1LL6A 3N11A 4DUVA 1DWJM 2WKLA 3W27A 1OB0A 4NF7A 3N15A 3L4VA 3AMDA 2JEPA 3W0KA 2WK2A 3KEHA 4BF7A 1QI2A 3NSXA 4HZ7A 1XSJA 2J8GA 3BCDA 2CERA 1PX8A 1OGGA 3OZPA 3PZIA 1LQ0A 3OGSA 4LYQA 1UD5A 2EBNA 1JNDA 3BAKA 2PBGA 3AMKA 1NH6A 1LWHA 1X6NA 5ABFB 1CGWA 2JEQA 1CLXA 3TTQA 4OOUA 1A47A 1V0LA 2V5CA 1VBRA 5A8OA 4E4PA 4YPJA 1CLVA 3WD2A 2ZUWA 1JZ7A 2WMJA 1W1VA 3AXXA 3BLPX 1GOMA 1C8XA 2Z1KA 2CEQA 1BYBA 1QW8A 1PPIA 1OINA 2YLAA 1J0KA 5LA2A 1RPKA 1JD7A 2WBGA 3NSMA 1F4HA 1OBAA 1GOKA 5I3DA 4PN2A 3A47A 2WC3A 3SCUA 1UWTA 4JFTA 1UQYA 2DSZA 4D6CA 3MMUA 4PMNA 3EYPA 3DYOA 1JDDA 1EXPA 1E6PA 1A3HA 3AS1A 4AD3A 2X2YA 1F4AA 1E56A 3W29A 5A8MA 3FN9A 1FOBA 3K8MA 3FXYA 2WMHA 1XD0A 2WNWA 2X09A 3WBEA 4CD5A 1HKMA 3K46A 1HKJA 2CBJA 3WD0A 3S6TA 2FH6A 2WC4A 4Z2KA 4CGTA 2FGZA 4ZXOA 1Q6DA 2WM0A 1R87A 4J3SA 1SYTA 4CVWA 1NOFA 3VD5A 1VEMA 3L2LA 2VZUA 1JYNA 3TA9A 3W82A 1D2KA 2YLLA 5CG0A 1ZJBA 3QHOA 2DH2A 3CZJA 1DTUA 1DHKA 1KXTA 5CXPA 1GVYA 4D6DA 2ZX8A 3WEMA 4DUXA 1CNVA 3QHNA 2BY0A 3QOKA 2G8ZA 2VX5A 2XUCA 2VX7A 1FHLA 5C70A 4HA1A 4H8VA 3PZNA 2WCAA 2WZHA 2NT0A 3L4UA 4TVCA 1R85A 2EPKX 3LMYA 2ZXDA 1HL8A 3QOMA 5A6MA 1ISXA 3CHFA 4UQCA 1OGSA 2W5FA 2C0HA 4DM2A 1JAEA 3E1F1 1BVZA 3AHXA 3ZSTA 4WF7A 3UERA 1B3WA 1E55A 1CDGA 2UY5A 2VZTA 2GUYA 2BV9A 4M81A 1DEDA 5KZ6A 2J62A 3POCA 2XVLA 1V0NA 3GTNA 4NI3A 5AY7A 1KFWA 2AOSA 3QHMA 2PI6A 5FL1A 2XFFA 2WC7A 1CIUA 5CZKA 4LQ1A 3DHPA 1W9UA 3WH6A 4ACZB 4CD6A 2YKKA 4OOZA 4AD4A 3ARXA 4WSJA 1WP6A 2FHCA 4W8LA 1H0IA 4BZYA 4OBRA 1V6VA 1JF5A 3IAPA 2YOCA 3W37A 3WY1A 1CGVA 1XH0A 2XM1A 1CXKA 2X05A 4AD1A 1JZ8A 3ALGA 2VVSA 1XH1A 4W89A 2VVNA 4ATLA 3GXIA 4AWEA 1UKOA 4AD2A 4KH2A 3DHUA 3CO4A 4QLLA 1MXDA 1EOMA 2E3ZA 3W6LA 3WMCA 5D9PA 1J18A 1V3KA 5GNZA 1JNEA 3AS3A 5LYRA 2VL4A 2WMIB 4UOQA 2D2OA 1PZ3A 3ZSSA 3AZTA 3GBEA 1PIFA 3CZKA 4JHZA 3BMVA 1WNOA 5A8QA 3VIIA 2Y2WA 1XV8A 2DQXA 4LX4A 2G3NA 5LA0A 1VENA 1NARA 4P7QA 2PF0A 4E2OA 4MAZA 1W9XA 1FH8A 2VNCA 1CPUA 5IHRA 1QHPA 1JD9A 1JDCA 3WUBA 2IXUA 4JHOA 1UZ4A 4DWSD 5D8WA 2JIEA 4EKJA 1ODUA 4U3AA 4W7VA 2WLYA 3SIMA 1ODZA 2F8QA 1CGYA 1J01A 1BVNP 1CENA 1N82A 1PZ2A 3PZGA 1BPLB 3MU7A 2BHYA 2XVPA 3ARPA 1TFVA 4M8UA 1KGUA 5E6ZA 3EDFA 3MMWA 3F5KA 1KGXA 2DH3A 2MANA 1Q4NX 3VINA 2CHOA 3EDJA 2NT1A 2DT2A 3UR7A 1EO5A 1HT6A 4OJYA 4V28A 2V3EA 3KL5A 2VOTA 1EQCA 3VX1A 4FLOA 1L0PA 4JFSA 2XJ7A 1PJ9A 3G6MA 1J0IA 2HISA 1GOWA 3BAWA 4W88A 3FHAA 1UD6A 5BXSA 1FP9A 2UY4A 5CSUA 1W32A 3NDZA 4BQ4A 4CU7A 4AXNA 3U7BA 4TXEA 4WSKA 1V3LA 4JKKA 2W63A 5I24A 5DF0A 3AZSA 3GNRA 4MPKA 1NQ6A 4PMQA 1GW1A 4TUFA 1KB3A 2EPNA 3CGTA 1E9LA 4AD5A 2YIHA 2X0YA 2G3IA 4UFJA 3AS0A 1LG2A 4XV0A 4UQAA 5C8BB 3W4RA 1VRXA 4W8BA 5A6JA 1IT0A 1XD1A 3AQUA 2G41A 1HVQA 1K9FA 1US3A 2J7FA 5I0DA 4MADA 1V6UA 4M56A 1L8NA 3TTYA 1UD2A 1WDQA 4ACZA 1UH2A 2GVYA 4CD4A 4PCSA 7CGTA 2ZUUA 4GINA 3UCQA 3EMZA 4KMQA 5D9MA 2WSPA 1ZU8A 4WKAA 1GPFA 3HJEA 3ALFA 3IK2A 4XB3A 3CIVA 4DWSA 4W84A 1CXFA 1AQMA 2VQUA 1GQLA 3T2QA 3WSUA 1CTNA 4AEFA 4J7RA 2PB1A 1G1YA 2J7EA 1I75A 4JFWA 2PWHA 3FNDA 4HPHA 2D0GA 1CXEA 1UD3A 3WIJA 2BFGA 1EHAA 2CETA 4PUDA 4AIUA 1VJSA 3WDRA 1D3CA 2XGBA 2CESA 1LLOA 1CBGA 1E1FA 3VIFA 3VX0A 2J25A 3ZJKA 1AQHA 3DC0A 5E6YA 1US2A 4UFHA 3I3EA 1MW1A 1UR9A 2Y8KA 2CBVA 3WF2A 3TOPA 4F66A 1XGZA 4JFVA 1E4MM 3T2OA 4KRTA 1JDAA 3EMQA 3GYCA 2ESCA 1UWRA 3LPOA 4AEEA 4LYPA 4AZ6A 1E6ZA 3VIOA 2G3MA 3QGVA 4UFIA 2ZUTA 4WK9A 4N0RA 1W91A 1V02A 4L4OA 3RDKA 3WNLA 4D6HA 4GQQA 1GOOA 3BAYA 2A3CA 3VDBA 2WKGA 1KQZA 4FMVA 3WUGA 1PBGA 5I77A 1KCKA 2QMKA 4UFKA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 3GXD A;  3VD7 A;  3WEN A;  1RD6 A;  2EPM X;  4YHE A;  1G01 A;  1XSK A;  3VGG A;  1DWH M;  2V3D A;  2E8Z A;  3O2L A;  2ZID A;  4OIF A;  1ISY A;  2GK1 A;  3BSH A;  3WEZ A;  5A6L A;  5FKY A;  1ZBC A;  1OT2 A;  2JFE X;  4DUW A;  2EJ1 A;  3WEO A;  3D3A A;  4H7V A;  2BXZ A;  3VIG A;  1UZ1 A;  1OWQ A;  4J3X A;  4HPG A;  4GI9 A;  4P8X A;  2BXY A;  5A2A A;  3AMG A;  3AZR A;  3ARY A;  5JIW A;  3MUZ 1;  1JGI A;  1HJQ A;  5D9O A;  3W53 A;  5AYI A;  2V3G A;  3UR8 A;  1WPC A;  1EQP A;  4EK7 A;  4QCF A;  3OBA A;  2WHJ A;  3NDY A;  3W25 A;  4HMC A;  1NP2 A;  3VGE A;  2BVY A;  5BXP A;  1NOU A;  5D8Z A;  9CGT A;  3A4X A;  4UQD A;  2WLZ A;  2IUZ A;  5A6B A;  1J0J A;  3WQ6 A;  3VMO A;  1V08 A;  3B9D A;  3WH5 A;  4A4A A;  1NWT A;  2UY3 A;  1CWY A;  2XYL A;  1CGX A;  4WKH A;  1JFX A;  1FH9 A;  1J0Y A;  2BVT A;  2E0P A;  2XTK A;  2VUR A;  3VGH A;  3AJ7 A;  2YBT A;  1KCL A;  3VIH A;  3AS2 A;  5DT5 A;  2O9P A;  1P6W A;  1H09 A;  2XIB A;  3SUT A;  4OUE A;  1X6L A;  1K9D A;  2OSY A;  3WQ4 A;  3SCP A;  2G4F A;  2J7H A; 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