2XJ7A

Btgh84 in complex with 6-acetamido-6-deoxy-castanospermine
Total Genus 242
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
242
sequence length
712
structure length
639
Chain Sequence
SLQPPPQQLIVQNKTIDLPAVYQLNGGEEANPHAVKVLKELLSGKQSSKKGMLISIGEKGDKSVRKYSRQIPDHKEGYYLSVNEKEIVLAGNDERGTYYALQTFAQLLKDGKLPEVEIKDYPSVRYRGVVEGFYGTPWSHQARLSQLKFYGKNKMNTYIYGPKDDPYHSAPNWRLPYPDKEAAQLQELVAVANENEVDFVWAIHPGQDIKWNKEDRDLLLAKFEKMYQLGVRSFAVFFDDISGEGTNPQKQAELLNYIDEKFAQVKPDINQLVMCPTEYNKSWSNPNGNYLTTLGDKLNPSIQIMWTGDRVISDITRDGISWINERIKRPAYIWWNFPVSDYVRDHLLLGPVYGNDTTIAKEMSGFVTNPMEHAESSKIAIYSVASYAWNPAKYDTWQTWKDAIRTILPSAAEELECFAMHNSDLGPNGHGYRREESMDIQPAAERFLKAFKEGNYDKADFETLQYTFERMKESADILLMNTENKPLIVEITPWVHQFKLTAEMGEEVLKMVERNESYFLRKYNHVKALQQQMFYIDQTSNQNPYQPGVKTATRVIKPLIDRTFATVVKFFNQKFNAHLDATTDYMPHKMPLQVKANRVLISPVEIELDAIYPGENIQILSAGLQKAPVKFVFVLTIEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Inhibition of O-Glcnacase Using a Potent and Cell-Permeable Inhibitor Does not Induce Insulin Resistance in 3T3-L1 Adipocytes.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
molecule keywords O-GLCNACASE BT_4395
total genus 242
structure length 639
sequence length 712
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2010-07-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
A PF18344 CBM32 Carbohydrate binding module family 32
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 2xj7A03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2xj7A02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 2xj7A01
4MDPA 5FKYA 2ZXBA 3CUGA 3ZJ8A 2XUCA 1SFSA 2G3IA 2WZEA 2Y5EA 1CTNA 2YL9A 3N11A 4MB4A 2YL8A 1IZKA 4D1JA 1GOKA 3O6AA 5EMYA 1QNOA 5E09A 1VFMA 4PMQA 2V3EA 4XUYA 4PYSA 4M82A 6CGTA 3WN6A 4ACZA 1FFRA 1FP9A 3CMJA 4S3JA 4TUFA 3WF4A 2ZE0A 2YA2A 5C8BB 4TOQA 1G01A 1Q6CA 3LPFA 3OGSA 4ATDA 3KL5A 1C7SA 2DSWA 1M03A 3WUEA 4HP5A 1W9UA 2ZWZA 2VTFA 3ZT7A 3MUZ1 1KB3A 1OIFA 1H4PA 4ZE4A 2ZIDA 3FAXA 1E6XM 1QNPA 1W1TA 2PWGA 3DC0A 3WDQA 2D22A 3NYDA 1ISWA 1E5JA 4PMNA 3WNPA 1JYVA 4HOXA 4J3VA 5BXPA 1UD4A 2A3EA 3MU7A 1LL6A 1GOQA 1I1XA 1W3JA 1PEZA 2QLYA 3GNRA 4QDMA 1MQQA 1K9EA 1UOKA 4LPCA 1C7TA 4ZE5A 4C91A 1V3IA 4CUCA 5BXSA 3FHAA 3ARTA 4LX4A 2GK1B 3PZIA 3L4WA 1ZL1A 5A3HA 1JZ3A 5DT7A 1V03A 4WKFA 4R27A 3K8LA 1QPKA 2OSXA 3VDCA 1TA3A 4BQ4A 5A6BA 4B3LA 5BRPA 3SIMA 5ABEA 3UG4A 1UR4A 2XM2A 2WBKA 1BSIA 3PZGA 4GO9A 1CEOA 4P7OA 4D6HA 4W8AA 4F9JA 3VUPA 2WMGA 1JDDA 4J3TA 1E73M 1LJYA 1UD5A 4C7FA 4XV0A 3WQ5A 3WQ6A 1VENA 5ECUA 4JHOA 4QCEA 3GXIA 3PZQA 2J7EA 2WCSA 1V08A 5KZ6A 4NF7A 4CN6A 2AOSA 3PZ9A 3WEMA 1UD6A 4MB1A 3W28A 1BYDA 2XVNA 4JKLA 1Q4NX 2E8ZA 3I3DA 1ZS2A 3SCTA 3VD9A 1KCKA 2X09A 4ZXOA 3OLGA 1GQIA 2D24A 1M7XA 4UOZA 1QI0A 1W91A 5A69A 3PZUA 3ZT6A 3HN3A 2V3FA 4TX8A 4C7DA 2GUYA 1US3A 2NSXA 1LLOA 1E70M 2BV9A 4CD7A 3GXDA 1E0VA 3WQ4A 5IDIA 2CESA 2DT1A 3I3EA 3L4VA 3RM4A 3T09A 1I75A 1VAHA 3T0BA 3PTQA 4J27A 2CEQA 4PMXA 2YLLA 4UR9A 4D6CA 2C8NA 1B90A 3FXYA 2DH2A 4WKAA 4NSBA 2YJQA 1XSIA 2ZUNA 1UD2A 4S3KA 3CH9A 1WP6A 2X05A 1KFWA 3OBAA 4GQQA 2VRJA 5HOSA 4M80A 1H09A 1H5VA 1CGUA 4LQ1A 1GJUA 2WVUA 4Z2GA 2WKGA 2WYSA 4N42A 3ALGA 4TVUA 1CGTA 3AIEA 1IT0A 1CWYA 2XVLA 2MANA 1QNQA 3ARWA 2W61A 3N04A 1ZJAA 1LQ0A 2XHYA 2VOTA 2WC7A 4QP0A 1XCWA 4AZ6A 5BXTA 1XSJA 4XX6A 4JIEA 3W81A 7CGTA 1NP0A 3CUFA 1OD0A 1UG6A 4OIFA 3HU7A 1L8NA 5DFAA 1NQ6A 4DM1A 2Y24A 3WF3A 1V6WA 4PUEA 4PTVA 1E4MM 5F7UA 1R7OA 5A1AA 1TG7A 3WF1A 1V6XA 1QHZA 5EFDA 1NP2A 1VFUA 1WE5A 2VQTA 3NCOA 1H11A 3N9KA 4W85A 1PX8A 3SCQA 4EE9A 2BY2A 5GPRA 3WNNA 3TTQA 3WBAA 1B30A 2QPUA 3ZJ7A 4XZBA 3UEQA 3EMCA 2J47A 4OJYA 2V5DA 3CHEA 4L4PA 1JFXA 2BY0A 3OLDA 3T2OA 5CGMA 4V28A 3AMGA 5A95A 1FOBA 5JIPA 4MB5A 3VD5A 3F4VA 3FW6A 2AAAA 1JZ7A 3AZRA 3OB8A 1W3LA 3E1F1 5GQBA 3SCNA 1KXQA 4J7RA 4NRRA 4DWSD 2DT3A 3WQ8A 3B8SA 3W53A 4AXNA 2J77A 5M03A 2GK1A 3CZKA 4AISA 4HPGA 1R7AA 1JZ8A 1BYBA 5M5DA 2XVKA 4M1RA 4OUEA 3MV11 5A6KA 4AD1A 3PTKA 4WIWA 1OT1A 3WFLA 3GBEA 3GTNA 5IXEA 7TAAA 2DQXA 2Y8VA 3QHMA 4GZJA 1EDTA 1WO2A 3VGHA 1W1VA 3AMCA 1LWJA 1CGYA 2JF6A 5I2UA 5DF0A 4PBGA 5BCAA 1KBBA 1GVYA 1JI1A 1VIWA 2B31A 3ZSSA 4AD0A 4CGTA 2VJXA 2WLYA 1SYTA 4NZCA 5LA0A 2CHOA 3NSNA 1LG1A 1UR2A 2VR5A 4LYQA 2E8YA 1EXPA 4QLJA 5CZKA 4PMRA 1VEMA 4AY1A 3WIJA 3LMYA 1WZMA 3IJ8A 3MUAA 3ZOAA 1CXFA 3CUIA 1BGGA 1JI2A 1MQRA 2OYMA 4GI9A 2V3DA 4U3AA 3VINA 3VD4A 1TVNA 2BY3A 2CXGA 3D3AA 4PSRA 2WVVB 3B9AA 4B3KA 2ZWYA 2JEPA 2DIEA 3HJEA 1JF5A 3WBEA 2XWDA 2G3NA 4GI8A 1KBKA 1DWGM 2XTKA 5M17A 4CD5A 1NOFA 1E9LA 3G6LA 5LYRA 4YHEA 4Q22A 5JBDA 2DDXA 3CZGA 1XD0A 1BAGA 5CSUA 2QF8A 5CG0A 1MWOA 1DWFM 3OG2A 4HA3A 4JL1A 1NWRA 2BFGA 1N82A 1VJZA 1UR9A 1KXHA 2FHCA 3W29A 2D2OA 1EGZA 1QW9A 2CKSA 3CLWA 4MDOA 4BF7A 1JL8A 1O6IA 1M53A 4H41A 3AXIA 5A8NA 1XC6A 2XIBA 2XSBA 3WD3A 1HVXA 4CKQA 4ML4A 3AIBA 2CYGA 1CXKA 1V6UA 3EDJA 2VR4A 2PWEA 1W2VA 2VRKA 4RE2A 5E6YA 4U2ZA 2A3HA 1GPFA 3AHZA 3VIMA 1J01A 3G6MA 1EHAA 5E0FA 2D1ZA 1HX0A 5I24A 2WKLA 2PI6A 2ZX7A 4UQCA 4W87A 3RJXA 5ABFB 5D9NA 4DWSC 3D5HA 3N1AA 1LG2A 3GH5A 4UCFA 1E5NA 4U5KA 2D3NA 1HJQA 1EDQA 4HA4A 3ZQ9A 1E15A 5FD0A 1PX4A 2W63A 1KR1A 3WDIA 2ZUSA 1DWJM 3GXMA 2CKRA 3SUSA 1WZKA 4PMZA 3PHAA 5A6BD 2VQUA 4ZEPA 1U2YA 4MJ2A 5CPSA 2G41A 2WMKA 3KE0A 2VL4A 3L4YA 5D8ZA 2VZVA 1ZBKA 1C3FA 3K8MA 2PF0A 3AISA 1M01A 3MS8A 3AS1A 3U7VA 3BLKA 3AIVA 3WNLA 1BVNP 1J10A 2EPKX 2WZIA 4BQ3A 3RMEA 2QV4A 1E6QM 3W6MA 3K1DA 3VIGA 4GXPA 2YLAA 4Y7EA 1UKSA 1QNRA 3KWXA 1BVZA 4C90A 4HTYA 1H1NA 3UG3A 1ZB5A 2WPGA 3RIKA 2OSWA 1CXLA 1QBAA 1P6WA 3GH4A 3AIWA 3AOFA 2ZX6A 1E56A 3WUFA 1E6NA 3M46A 4D6DA 2XWEA 5AYIA 2VNCA 1NOWA 3O9NA 3POHA 1HJXA 4BCEA 1VFOA 5DT5A 1QI4A 4W5ZA 1XYFA 3UR8A 1NWSA 1K9TA 1V0LA 1WDQA 1JZ2A 2V38A 4JFUA 4JL2A 3SUVA 4J3UA 2GJRA 4M29A 2XJ7A 3THDA 4GINA 2JALA 4HZ6A 4OBRA 3RJYA 4WSJA 1OIMA 1V02A 1A3HA 1CXHA 1V3JA 1QNSA 3CZJA 2PWDA 1JNDA 4JKKA 3VGFA 4YHGA 2PBGA 1G94A 2XGBA 4D6FA 4D72A 5BWFA 4P8VA 3EMZA 1UWUA 2Y2WA 1WAWA 4W7VA 1LWHA 2VCAA 2QMKA 4HU0A 4AIUA 4DM2A 2RGLA 3VGDA 3WMBA 3B9DA 3BAYA 1GNXA 4W86A 4KGLA 4D6IA 1HKKA 3N12A 1E72M 3O2LA 1UKTA 2WVSA 4AZ5A 5HDRA 1PZ3A 3K4AA 1HL8A 2BS9A 1B3VA 4MPKA 2J8GA 2WK2A 3BMVA 4Q7NA 2NW0A 3WQVA 2UY3A 1UR1A 2ZUWA 5CSYA 4IISA 2PC8A 2BXZA 3EDDA 1CECA 5HXMA 1LL4A 1GJWA 1PX3A 2DSZA 1CENA 2CERA 3MUIA 2PWHA 4A4AA 5CJ5A 1I1WA 2WMIB 3AYSA 1W9PA 1UA3A 5A2CA 2JF7A 4W93A 2W91A 3AQUA 4A3YA 1UZ4A 2GFTA 4HMEA 2GDVA 3FY1A 3WEZA 3PZTA 4U2YA 1TE1A 2TAAA 2YA0A 5A2BA 3AHTA 2D20A 2NT0A 5FIPA 3OGVA 1RPKA 3AICA 4MNLA 1TCMA 5I5RA 1CLXA 1JGIA 2BVDA 3WENA 1R87A 2HISA 2ZXQA 3WUGA 1OWQA 4HZ7A 3N17A 1IV8A 2VMFA 4PEEA 5ABFA 1E4IA 3WUBA 3MMWA 4M8UA 4PTWA 3ZO9A 2F2HA 3VTRA 3SURA 1MVYA 5A8OA 3WD1A 1Q6EA 2V3GA 4FLQA 1VEPA 4HA1A 4E2OA 1RP9A 3UERA 3S6TA 2C7FA 1XH1A 4DUXA 4MNMA 2WZHA 4HMDA 1CZ1A 3U57A 2OYLA 1TUXA 1ISXA 3QGVA 1KQYA 2CCRA 2EO7A 1UH3A 4TTUA 1JF6A 4A3HA 4X0VA 3TOPA 1XCXA 1JAKA 3UCQA 5HPOA 2Y4SA 1KWKA 4ACYA 3ALFA 3UR7A 3L4ZA 2ZXDA 1WDSA 2GDUA 3WNOA 1C92A 4AZCB 2D0GA 1DWIM 5BRQA 1QI2A 2YA1A 1B3WA 4P7QA 2XGIA 4AYSA 5I23A 2YL5A 3L2LA 3A47A 1W1YA 1W9VA 3UESA 1GUVA 4Z2HA 4J3SA 5C70A 3SCOA 2J7FA 4AW7A 1G9HA 1DEDA 1V02E 2YDSA 2WHLA 1JDCA 5LA2A 1FHLA 1PPIA 3MV01 2XYLA 2X2YA 2G3JA 3TTOA 2DPEA 1NWUA 3PZVA 5I79A 1V3HA 1VF8A 3EYPA 1C8QA 4AC1X 3BSGA 1US2A 1HN1A 2DT0A 2J7BA 1PZ2A 2BNJA 2EPOA 1B1YA 2BXYA 1H0GA 1V3MA 2VUYA 1UKOA 2YKKA 1XRVA 2XFFA 3WL0A 4EK7A 2JFEX 4B9YA 2VX4A 3ZR6A 3AZSA 3B9EA 1C8YA 2WMJA 1GHSA 5E0CA 1GZJA 1DHKA 1UR8A 3VPLA 2DGAA 3EMQA 1FH9A 3CUJA 2WM0A 1MXDA 2Y8KA 3BSHA 1PIFA 2DSVA 1G0CA 4CCCA 3DHUA 2OSYA 4PN2A 4PMDA 3VIKA 3WKZA 2CBVA 1B3XA 4URIA 2OWWA 2VRQA 3M07A 3K8KA 4P8UA 1J0KA 1R86A 2CBUA 4NI3A 3ZJKA 2WAGA 1KGXA 5A2AA 3SUTA 2G3MA 3WDRA 4JZ5A 3VGEA 1SR0A 3ARYA 4DWSB 1UZ1A 3QOMA 4UFJA 3U5YA 2X0HA 1QW8A 4JHZA 3CZ8A 4EANA 1FH7A 2WMIA 1B31A 2VO5A 2ZUMA 4J3XA 4UQ9A 2NT1A 1CYGA 3LPGA 3MO4A 1HKMA 1JD7A 2Z1SA 3W37A 2J7DA 2W5FA 4BQ2A 1BPLB 2F8QA 4D1IA 1J0JA 2J7HA 5A94A 3A4AA 3OGRA 2CITA 5E70A 1UWRA 4PMOA 2DSKA 1HL9A 2QMJA 2WMHA 2WANA 3APGA 3F5JA 1V0NA 5A8QA 3MMUA 1EIBA 4D6GA 3VMOA 2WMFA 3SUWA 1E6ZA 1V3KA 3POCA 4FLOA 1EHNA 4CVUA 4IPNB 3MUY1 1AVAA 1EOMA 2EPNA 2J75A 3ARVA 4XZWA 3VM5A 5FL0A 3AMLA 3AROA 4N0RA 1A47A 3UG5A 1KXTA 4FF5A 2D3LA 3BGAA 1D3CA 4U33A 1UKPA 1QHPA 4W89A 3BH4A 1EDGA 2WW5A 1JNEA 2E4TA 1Y7VA 1X6LA 2WHMA 4AD2A 3VDAA 2ZX8A 1GHRA 3II1A 3WQWA 4WLCA 1KGWA 4Z2JA 1UH4A 2J25A 3FNDA 3WSUA 1UWSA 1BGAA 3WY1A 1ODZA 3AS0A 3DECA 5A8PA 4HMCA 1HKIA 2WXDM 1J11A 4MAZA 4B15A 4AZCA 1HIZA 2BHYA 1XGZA 3W27A 4AZBA 3W26A 1J0HA 4UQBA 3VM7A 4MNKA 3VVGA 4UTFA 1Z32X 1GW1A 1XH0A 1SMAA 4WSKA 2QHAA 4TVCA 1JIBA 4UFHA 1BFNA 3WD4A 1L0PA 3BXWA 4TXEA 1OT2A 1GQJA 1EQPA 3SEPA 3AXXA 3GBDA 4HOWA 3MANA 3BCDA 4AD4A 4WK9A 1JYXA 4PRWA 3NSXA 4W7WA 3ZMRA 1UQYA 1CLVA 1FA2A 1CBGA 2VC9A 1E4LA 3AYRA 3AHYA 5ABGA 1PBGA 3IANA 3IJ9A 2UY2A 3QHNA 2VX5A 1VBUA 1H3GA 2WSKA 5HBFA 2DEPA 1BQCA 2QPSA 3TA9A 4QLLA 1PJ9A 1H49A 1FHDA 4PMUA 1U33A 2W66A 2JEQA 1B9ZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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