3OYZA

Haloferax volcanii malate synthase pyruvate/acetyl-coa ternary complex
Total Genus 141
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
141
sequence length
428
structure length
376
Chain Sequence
RHDREFVRTFFTSPTAVEGEDDSAKMLRRAAGLRGMQAPDVWVPDNEDATAPSMRDEGAENIVEVISEQGAEFPGEIHPRMVWHRDSPETRYQGFQHMLDITDPERGAVEHIHGFVIPEVGGIDDWKKADEFFTIVEHEHGLDEGSLAMSVIIESGEAELAMGDLRDEMGKPTNNLERLFLLVDGEVDYTKDMRAMTPTGELPAWPELRHNTSRGASAAGCVAVDGPYDDIRDVEGYRERMTDNQAKGMLGIWSLTPGQVVEANTSPLPPKTGSWLLDADELREELLGLTSYVPSMDDIVDSMEEFEAAKEAGRGAIAMTQSATIEKDRMWDEATYQAAMTPISLFQDVYENRPDQHEELEERYGAGVVERAMEVG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of a halophilic archaeal malate synthase from Haloferax volcanii and comparisons with isoforms A and G.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Malate Synthase
molecule tags Transferase
total genus 141
structure length 376
sequence length 428
ec nomenclature ec 2.3.3.9: Malate synthase.
pdb deposition date 2010-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03328 HpcH_HpaI HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.1560 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 3oyzA02
3.20.20.60 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Phosphoenolpyruvate-binding domains 3oyzA01
4LSBA 3FA4A 2HWGA 1XG4A 3E0WA 1DQUA 4JPGA 3T0TA 1GGOA 1MUMA 1S2UA 4QGCA 4IP7A 3QLLA 3HQNA 4QG9A 1JDEA 1F8MA 1Z6KA 3SRKA 2E28A 4L9YA 3E0VA 3M0JA 4IQEA 2V5KA 1A5UA 3QTGA 2DIKA 2R82A 2DUAA 4IQDA 3QV6A 1S2VA 3QV9A 4KCWA 4MG4A 2KX9A 1O68A 3EOOA 3GG8A 1PKLA 2VGBA 2VWTA 3E5BA 3HQPA 4FXJA 1SGJA 1VBGA 1S2WA 3QV8A 4HYWA 3GR4A 3ME3A 3SRDA 4L80A 4KCVA 2OLSA 4YNGA 3R4IA 4QG8A 1ZJHA 4QG6A 3OYXA 4G1NA 2ZE3A 1F8IA 2VGGA 4B5UA 3B8IA 1M1BA 3IS4A 4KS0A 4B5VA 4B5WA 1S2TA 2VGIA 1U5VA 1E0TA 1F3WA 4ROQA 1F61A 4FXFA 4YJ5A 5TAOA 3HQOA 4TV5A 3T07A 3I4EA 3QZ6A 1DXFA 4KRZA 3G2GA 2VWSA 3U2ZA 4HYVA 3PP7A 2XDFA 1PKYA 2HJPA 2QIWA 3OYZA 4WJ8A 2L5HA 3EOLA 1OQFA 3SRFA 3QV7A 2HROA 3FA3A 4L9ZA 5JVLA 4B5TA 3KTXA 2XZ7A 3VAVA 3PUGA 3LG3A 1KC7A 3MA8A 4TV6A 1PKMA 4IMAA 3OQ8A 4RPPA 4B2DA 1A49A 3GQYA 1U5HA 1PKNA 1VBHA 3BJTA 4MF4A 4KCUA 1UJQA 3M0KA 1DIKA 1PYMA 2BG5A 1F3XA 3BJFA 3LYEA 3QQWA 2X0SA 1A3WA 4B2DD 1O5QA 1DXEA 4B5XA 1M3UA 3P0XA 1E0UA 1AQFA 1IGWA 1XG3A 2HRWA 2WQDA 3T05A 4L7ZA 3N25A 2G50A 2V5JA 2VGFA 1OY0A 3H6OA 3KHDA 1O66A 3EOEA 4KCTA 4DRSA 2XZ9A 3EZ4A 3SRHA 1ZLPA 1T5AA 4B5SA 1IZCA 1KBLA 1A3XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MY9A 2OWXA 5K3VA 1VCSA 3SSZA 3ZYZA 3BW4A 2VELA 3BUVA 1KLZA 3C64A 3NWRA 4Y9NA 2IPGA 4B15A 3DENA 4F0MA 4G63A 4XV0A 3WZ0E 2VKDA 1DTUA 4GHRA 3EOOA 1X7FA 4F6RC 3CBWA 1D2KA 1S2WA 2WMJA 4JN8A 3IAPA 3QZAA 3ZN1B 4MNKA 1U83A 1B4KA 2V7KA 1JPMA 4KS0A 4GNVA 2DT3A 4OOUA 4Q8PA 1IXQA 4XD5A 3DAQA 4CNNA 2W2UA 3P50A 3SUTA 3MKDA 4KX6A 1D1CA 3UG3A 4AFYA 3SY8A 1GZ1A 2X30A 5EZYE 3TLQA 1TIMA 1DQXA 1MUCA 1LM1A 2CCRA 3H23A 4UFKA 2FYMA 1U5JA 3NL3A 4N9CA 3F5LA 3LG7A 3F4VA 3CH0A 1P43A 2AOSA 2IXUA 4ZS3A 5IBXC 3R8HA 1U5HA 3E08A 3E1F1 3QR0A 1UW9A 1XGEA 3RC3A 1ZTVA 1ZZMA 2PURA 4HTYA 2F9RA 3ZMSB 1P6WA 3PWAA 3RCMA 1V77A 2W79A 3UR2A 1XBVA 1WDSA 1UZ4A 1ZP3A 4NG3A 1XINA 2UXDT 1JNEA 1GJUA 2VGFA 1EDTA 3KHDA 3UFEA 2PLKA 4QH5A 1UUQA 1WOAA 5E09A 2AAAA 5ABFA 5HJLA 1VFTA 3TVAA 4Q22A 3WNMA 3TU9A 2CBVA 5AVHA 3N2TA 1F8MA 2E5VA 1VLWA 3CIVA 4S39A 3UJFA 5I03A 2A1YA 1CXHA 3OZOA 3WMSA 2BLEA 3VGBA 4A98A 4FX6M 3VNYA 3FXEB 1H0IA 1KD0A 4HHMA 2AL2B 3V0TA 1OADA 4H01A 3ZJ1A 1AODA 1B90A 1JEZA 2ZZ1A 3NO3A 3R8RA 2OEJA 2V30A 2JQXA 3H8AA 3HA1A 1J0JA 3LBXA 3BOLA 3CAVA 3RUBL 3BDKA 4Q8WA 4FOJA 2C0SA 4GE8A 4AB4A 2EKCA 4NSBA 1SZGA 2EO7A 4GFIA 4DNMA 1MQRA 5C8YE 2OGJA 4QSFA 5FSEC 2F7FA 4Q7BA 3EPOA 4UXNB 3ZT5A 4US6A 3SCSA 3RQWA 4XO6A 3AMDA 1AK5A 2E1DA 1XISA 1A5MC 4L56A 1QOXA 3HPFA 1A80A 2FDSA 1XYLA 2Y62A 2IQ0A 4M29A 4POCA 2WMGA 3W00A 4MLRA 4Q4MA 5A3HA 3HGRA 2PTFA 4JIHA 3QY7A 5HXMA 1MMGA 2DGAA 1ZUAX 4RKAA 4AXNA 2NQZA 3JZUA 2P3ZA 4ZB0A 1FHDA 2WHKA 2NWSA 3BMVA 2KWHA 4J27A 2JIWA 4M6UA 2Y6ZA 3L3PA 1KNZA 3AWOA 4BJNA 1UA3A 1B4EA 3W1PA 3WLHA 2OPJA 2NT0A 5F2GA 3HMCA 1JCJA 3TCEA 3R0DA 2O9PA 1V3LA 3WLIA 3RLHA 2W67A 1NH6A 2I5IA 2AXDS 1TPVA 3UR7A 3R5EA 3KCLA 4HNNA 2CEAA 1R3WA 3K3NA 1TJ0A 1FA2A 2WVTA 4I5XA 2Y48B 3EWXA 2OKTA 5PTDA 4KEZA 4GY7A 4UNKA 1RALA 3G2GA 3LCIA 1KM1A 5HEJA 4FEZA 4AYSA 4MWAA 6PTDA 1KCXA 3NQ6A 2C1GA 1T8QA 4FIQA 4O4WA 5D09A 1BAGA 1I2PA 4JYFA 4EVZA 3WQCA 3VNJA 2NOXA 3O6CA 3STFA 3TNOA 1KTCA 2NQHA 3PNUA 4B2DA 3FZHB 4GIWA 3IGHX 5AQVB 3GWQA 2D2OA 5I6SA 1NWUA 1YPIA 3QW3A 2LOSA 1QSDA 4K36A 4N4QA 3ZR6A 3LGDA 1TRIA 2NWRA 2DZUA 3SBFA 3B8DA 2L9QA 2VEMA 4V15A 4BK9A 3AXHA 3EVYA 4HKAA 2J78A 4I8YA 3SDOA 4XG1A 3BE7A 4M6VA 2J8FA 4KFOA 1JQVA 3D46A 3EBVA 3WJWA 4Q8QA 4D6GA 4JGDA 4R7JA 3MMDA 2EQDA 4FMVA 1CIUA 2E5LT 3BLIA 3KS5A 2JRKA 2VL8A 1EHAA 1OGGA 1QRQA 1RA5A 3NEVA 4MFEA 5DY3A 1AQMA 1S46A 2WS3A 2XQ4A 2D3NA 3MV11 3H7UA 1G0CA 4KI0F 3ABXA 5AQNB 2ZICA 1XRVA 2YINA 4IMEA 4FI4A 2ALDA 4HWFA 4LF1A 3SO7A 3VGHA 4O4IE 3UGRA 1M62A 2IC9A 3GTHA 4OYKA 4D6EA 2VKJA 1V5XA 5LNWA 3K3OA 4DZHA 3LUTA 4PJNA 1HKJA 3QTPA 5HXSA 4DIAA 2AE9A 2CITA 4J2MA 1EJSC 4HWCA 4YWSA 3N9NA 4XBKA 2DUXA 4AWTA 3RX6A 4J3WA 4UFMA 1JG9A 3N11A 1GW9A 3VMOA 4PUEA 3UQNA 3LBXB 2OT0A 5CPSA 1ZALA 1CXFA 1R8IA 4F0RA 3NXLA 2WY2A 3QJAA 1HQTA 1J93A 3GDKA 1N2VA 4H4IA 2G4JA 2GWGA 4HTEA 5D38A 5FF4A 5FYMA 2FFCA 6CGTA 5CC6A 4L5ZA 3LBMA 4IGSA 1LP6A 3RC8A 2WMNA 4ZI7E 1P4CA 1Q6FA 2OOFA 2ZZ6A 3EMQA 4NL1A 4RK8A 1F76A 2X05A 4ZZ9A 1UP2A 3L5AA 4GKKT 3R25A 1EKOA 4HOZA 2PU1A 5HWYA 4V1XA 5D2WA 5ABHA 5HJXA 3WBXA 5XIMA 3DKJA 3TLVA 1J01A 1ZHCA 4RNJA 3TYEA 3M6DA 1DQUA 5H6QB 4OV9A 3TKLB 1VGAA 3WQ8A 2Y5JA 5LBQB 2QIIA 3GU9A 4LBUA 2VEIA 4Z1DA 3RRCA 1RD6A 3N1AA 2X1SA 4B3MT 1UD2A 1FXPA 3EA3A 2CLMA 4Z8XA 1ZV4X 3EA2A 3HQPA 5LSMA 3V16A 3R84B 3BK0A 4J5NA 3L7RA 5BROA 2Q09A 1S5TA 1W1ZA 4H9UA 4UMBA 1W17A 2JF6A 3JAEA 4JHOA 4G1NA 3KM8A 3G0UA 4X65T 2BXVA 4CQBA 3W3OA 2V8SV 1S2TA 2PWFA 3BLEA 4Z2IA 4AD2A 4AWSA 1A5SA 2OU4A 4HU8A 1EEXA 2MYSA 3XINA 3HQOA 3UNDA 2YW4A 2TSYA 2BS4A 2VI0A 3W15B 1EDQA 1E40A 4A3HA 1ADDA 1U4QA 5AQGB 4BS0A 3TAOA 3B57A 1XSKA 3M65A 4HNOA 4M1RA 4PB4A 4PB5A 3ARTA 4IJBA 1ISXA 3KVAA 3CTTA 4TV6A 1QI4A 2DZTA 2WVVB 1MEIA 4GXWA 4GYPC 4UELA 2YU1A 3ETUA 3OQEA 3WG6A 2QGSA 5KITA 3F7JA 4MWAB 1SO6A 2REQA 3S5SA 1CXIA 4TOQA 3G22A 4KKXA 4G8TA 2IKHA 1CPUA 1C8VA 2DH3A 3UUMA 1UWIA 3E5PA 4JX4A 2WNQA 1FWCC 3WD2A 4A22A 3UWVA 1LUCB 4E5TA 3CIWA 1QWKA 1W3LA 3TWAA 3U2OA 1SR9A 3S9YA 5AQMB 3RPDA 4Q4OA 3TCSA 4DJEA 1VYSX 1E51A 1QNRA 4Y9OA 4C6CA 3ICJA 5AECA 1S39A 2O9TA 3L39A 2P8CA 3PPGA 4IGHA 3LY0A 3PAOA 3QOMA 1C9WA 2Q3OA 4W5UA 4ISTA 1A0DA 4REQA 3H2FA 4DR3T 2BXZA 1A0CA 3WUFA 2ACQA 5FJOA 3MBDA 4MYXA 2ZZ4A 3LQLA 2JIEA 1GK8A 2V2DA 3GDMA 1HNXT 4XZIA 3WY1A 4LFCT 2PBGA 5F3JA 3W4RA 1AJ3A 5CCZA 1F61A 3CUFA 4EX4A 3T08A 3OODA 4WZHA 2YXOA 3V36A 1DXFA 1WDQA 5D03A 3CV2A 1WZKA 4HIBA 1VAHA 2HDJA 4W86A 2GVEA 1DJWA 3REQA 5HNUA 4L61A 1ZRQA 2VEKA 3GXMA 3LHTA 4LOCA 1LL4A 2PD9A 1XLHA 5BW6A 1E9LA 1H51A 1FWEC 5LGXA 3EEGA 5FJTA 4DBWA 2BZNA 1A49A 2F6UA 4FA3A 1G4TA 3KFTA 4QDWA 5F2MA 2E6YA 3MKKA 2QUUA 1IIGA 3A64A 3FW6A 2ZUTA 1ITQA 4X66T 3PY2A 4LC8A 5FY0A 2VX6A 5FF0A 2OQYA 5LBMA 1SZFA 3TROA 3CL8A 1OGBA 3P6LA 3V3WA 1H7NA 3H53A 3MK7C 1UR8A 4AQFC 1VPQA 4RXFA 1E0XA 3PBMA 4S3AA 2X1TA 1GVRA 1CNVA 3TSDA 3A9IA 3T0AA 1OZMA 3TQ0A 2PDWA 3K5XA 3KVKA 2PWGA 4O13A 5BMWA 1CENA 3QZEA 2R9RA 1SO4A 1E55A 1CECA 3VD3A 3MC5A 1HO1A 3OZMA 4B92A 2BWGA 1KFWA 4JTJA 3UVIA 1NEKA 5M3WA 1ZAIA 1NEYA 5FKYA 1R87A 4AQLA 3RPTA 5CJMA 4H8VA 5BOEA 3ZLHA 4DUZT 2V38A 2VZUA 2XHYA 4UFLA 1JFXA 4NIQA 1W9UA 4WSHA 3GA8A 4GRSA 1U30A 1ISZA 4LW7A 1FWSA 3T0BA 4DV1T 1ENUA 2VGGA 4GUFA 1M1BA 3KV6A 2E6AA 1BYBA 1KW1A 4HA1A 1PAMA 1UJPA 1VCGA 3B40A 1ZP0A 3FEQA 1ISYA 3KBSA 4HYVA 4L64A 3UUBA 2KXPB 4HMDA 4ILAA 1HP4A 1KBIA 2HH7A 1W0BA 4LYKA 4YTRA 5G2HA 4QLLA 1LJYA 2W62A 3WH7A 3H54A 4ES4A 4EZHA 1XLIA 3OW1A 1R38A 3UT5E 2GSEA 1BG4A 2YDQA 3FYPA 1A3HA 3VR8A 3MS8A 1DJGA 2EHOA 4IE7A 4GCXA 3A47A 3RCYA 4DLFA 5FMNA 3W71A 1UC4A 1CB7B 1J0YA 3PFRA 3GNNA 3M4HA 3GVVA 3B9DA 2PJQA 3N9QA 3TE9A 3URBA 4PUKA 1FHUA 1WR0A 4NZFA 4QEEA 5HQEA 3W25A 4GH1A 1B3ZA 2JJ9A 3USZA 5LGZA 5C6MA 2Z7KA 4UF0B 3DEQA 4AMAA 3ANUA 3KZSA 2HVNA 3L4ZA 4PJLA 2E77A 3RYFE 4QG9A 4UNLA 4F0LA 1F73A 4YHGA 4ZI3C 3H2EA 3TN3A 5F7UA 4BQ3A 3NL5A 2VMFA 3VMPA 5DBUA 3DXIA 3TW7A 2WSSV 1N55A 5CAHA 1LOLA 4BA9A 3NL2A 1ELSA 3KHJA 2Z2AA 1OFQA 4KP3C 5DEZA 2ZXBA 4OECA 2BG9A 1WXZA 5A8PA 4YPJA 3I4EA 4V1YA 1K9DA 4REQB 2Y63A 2DJXA 2ZRYA 3VNLA 2ON3A 1HX0A 4PMYA 3KXQA 1FWJC 1TCMA 2G95A 2LKHA 5AQHB 1Y8BA 1BQCA 4ZI3D 1N33T 5CPMA 3T0CA 2X9YA 1S3HA 3GFYA 4BCEA 4Q8TA 1OEDE 1XDPA 3STPA 3V35A 1E4NA 3WQ4A 3STCA 2IW0A 3S0CA 1AW5A 3NEHA 4Q4SA 1H1NA 3KE0A 8XIAA 2Q01A 3L23A 2YXXA 3IJDA 2FZDA 2PRLA 4DMVA 3REQB 3VUSA 3OVQA 1M3UA 4YTSA 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 1EFZ A;  1RY0 A;  4I9A A;  1ITU A;  4B3Z A;  4UVA B;  3W7K A;  1VJS A;  5D37 A;  4H9P C;  4ZOE A;  3WLM A;  5KX5 E;  3DGB A;  4NNC A;  3P4S A;  1JDC A;  1UQZ A;  3NFU A;  1H4P A;  4ICC X;  4LFA T;  4BF5 A;  3UXI A;  1KQY A;  3BCF A;  3RLU A;  4XWU A;  1XDJ A;  1LWH A;  2DWK A;  2DJL A;  1RJQ A;  1YKH B;  1V51 A;  3OQ8 A;  5AC5 A;  2V3E A;  4ATD A;  2QVH A;  1FFQ A;  2RDW A;  5L9F A;  5LGT B;  1KEY A;  1GKP A;  1V6Y A;  3EMC A;  3AA6 B;  2WHM A;  4AHP A;  2FZB A;  1O60 A;  1LRO A;  3MB9 A;  3VDC A;  4JFW A;  3RM8 A;  5HQL A;  4MOZ A;  3C98 B;  3UU8 A;  3KBW A;  2E9M A;  1VR6 A;  3D3F A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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