3OYZA

Haloferax volcanii malate synthase pyruvate/acetyl-coa ternary complex
Total Genus 141
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
141
sequence length
428
structure length
376
Chain Sequence
RHDREFVRTFFTSPTAVEGEDDSAKMLRRAAGLRGMQAPDVWVPDNEDATAPSMRDEGAENIVEVISEQGAEFPGEIHPRMVWHRDSPETRYQGFQHMLDITDPERGAVEHIHGFVIPEVGGIDDWKKADEFFTIVEHEHGLDEGSLAMSVIIESGEAELAMGDLRDEMGKPTNNLERLFLLVDGEVDYTKDMRAMTPTGELPAWPELRHNTSRGASAAGCVAVDGPYDDIRDVEGYRERMTDNQAKGMLGIWSLTPGQVVEANTSPLPPKTGSWLLDADELREELLGLTSYVPSMDDIVDSMEEFEAAKEAGRGAIAMTQSATIEKDRMWDEATYQAAMTPISLFQDVYENRPDQHEELEERYGAGVVERAMEVG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structures of a halophilic archaeal malate synthase from Haloferax volcanii and comparisons with isoforms A and G.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
molecule keywords Malate Synthase
total genus 141
structure length 376
sequence length 428
ec nomenclature ec 2.3.3.9: Malate synthase.
pdb deposition date 2010-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03328 HpcH_HpaI HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.1560 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 3oyzA02
3.20.20.60 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Phosphoenolpyruvate-binding domains 3oyzA01
4L7ZA 3VAVA 1MUMA 1PKNA 2V5KA 2XZ7A 1VBGA 4JPGA 5JVLA 3EOOA 3ME3A 1GGOA 3IS4A 1A5UA 4L80A 1PYMA 3HQOA 1ZJHA 2XZ9A 3QV7A 2R82A 3QV6A 1PKLA 1XG3A 3OQ8A 4IMAA 3GR4A 4LSBA 2HRWA 3P0XA 1JDEA 3QV8A 3E0VA 1F61A 1A3WA 1A49A 1F8IA 1S2WA 3QV9A 4B5SA 3T07A 1DIKA 1IGWA 1DXFA 1F3WA 2VGIA 4IQEA 4TV5A 3BJFA 3OYZA 4KS0A 1VBHA 4B5UA 2E28A 5TAOA 2BG5A 3QQWA 3BJTA 3FA4A 2L5HA 3GG8A 4IQDA 2ZE3A 4L9ZA 1KC7A 1S2VA 2VWTA 3H6OA 2QIWA 2VGGA 1DQUA 2HJPA 2X0SA 1O5QA 4B2DA 3KHDA 1AQFA 4TV6A 4IP7A 4ROQA 3KTXA 3R4IA 4KCWA 2G50A 4YNGA 3U2ZA 3N25A 1M1BA 3EOLA 1IZCA 3HQPA 4B5VA 1O68A 1KBLA 4L9YA 4MF4A 1T5AA 3EZ4A 3T0TA 4B2DD 2WQDA 4YJ5A 2XDFA 3OYXA 1E0TA 1OQFA 1A3XA 4G1NA 1U5VA 1Z6KA 3MA8A 4HYVA 3SRKA 3G2GA 2KX9A 1PKYA 1XG4A 3B8IA 1O66A 2VGFA 3GQYA 4QGCA 3E5BA 2DIKA 4KRZA 2VWSA 3M0JA 1DXEA 1F3XA 1UJQA 4B5XA 4QG6A 3M0KA 3QTGA 3QLLA 1SGJA 4FXJA 1U5HA 3HQNA 3SRHA 2HWGA 3FA3A 4HYWA 4QG8A 4B5TA 3I4EA 4KCUA 3SRDA 2V5JA 2VGBA 4WJ8A 4MG4A 4FXFA 4RPPA 1ZLPA 3PP7A 3QZ6A 3SRFA 1M3UA 3EOEA 2HROA 4DRSA 1S2TA 1S2UA 3PUGA 1OY0A 3T05A 2OLSA 4B5WA 4QG9A 4KCTA 1E0UA 3LYEA 1F8MA 1PKMA 4KCVA 3LG3A 3E0WA 2DUAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QY6A 4IDQA 2IKIA 3VRBA 4MNLA 2OTDA 3BGAA 1ZP0A 1A5UA 3U5UA 4LF8T 2PS2A 1EC9A 4F40A 3Q67A 1V8EA 2RPAA 2H3BA 4TMBA 1S46A 4AW7A 3UWUA 2DVXA 4LC8A 3UZJA 3W24A 4PUDA 1ZB5A 5EA9A 2UY4A 3W1PA 5FJIA 2C0AA 1K03A 5TAOA 5HWXA 4XBKA 1HXJA 4AX7A 2UXXB 3NM3A 5HNUA 4ZO7A 3AUOA 1SFJA 1EL3A 4NJKA 4HZMA 3WQ8A 5LNWA 1VEPA 1TG7A 3JADA 1SJCA 2I57A 1SZEA 2ESCA 3MZ2A 4HN4A 1US2A 2JK2A 1CB7B 2X0LB 2ON3A 3AXXA 2Z1SA 3ONCA 5JXQA 3HV9A 1XBXA 1SQ7A 3WQOA 2RGMA 2D23A 4R27A 2X2GA 2LSJA 3RYSA 1XG4A 2LRKA 4MB1A 2VGFA 3RR4A 3R8HA 5GONE 1PXGA 3BQIA 3MCOA 3VDAA 1PZ1A 1CCWB 4LAUA 1U22A 4B5TA 2XH7A 4FI5A 2GVLA 4DEFA 5D2YA 2K9AA 4JBWF 3SIMA 2BY1A 4IIHA 1V51A 1ALDA 3VU7H 4S3AA 1UKPA 4JTHA 4HKAA 1SSGA 3BXWA 3OLEA 1JNDA 2INFA 2E09A 4DPPA 1ZJHA 4D6CA 1JYWA 4IFKB 3C98B 3R84B 2E5BA 3MT1A 4D6EA 1O94A 4F0SA 3O0FA 4MALA 2OCZA 3AIUA 1QXLA 3IGXA 2E4TA 4GMEA 3PZUA 2VL8A 5I23A 3L2LA 4TTGA 4WBNE 3STCA 3FAXA 4DJDC 3E74A 3E2RA 3WQCA 5I00A 3GZ3A 3GNOA 4IE4A 4MHCA 4QSFA 1VCTA 3OBVE 3GTIA 5FJTA 4JX5A 3A7MA 1A0EA 1VJZA 4UF0B 4YTTA 3PZMA 3AHVA 1GOIA 4ZZBA 2A3BA 2FJAA 1FDYA 5AQJB 4YLHA 2J8TA 4FIQA 4DNHA 3AS3A 2XFRA 5JH2A 5RUBA 2POTA 3BAJA 1P0BA 3WAKA 1FHVA 3MU7A 1RQEA 4WDTA 3TN4A 4LBUA 3TLUA 3MWAA 4GABA 2QPSA 3WLQA 1NAL1 5AQNB 1SFLA 4KWVA 3AYRA 4DO4A 1XP3A 3CHDA 1L2UA 2WW5A 4O28A 1QWKA 4AKIA 1UR9A 5AQOB 1BR0A 1O7AA 1PE1A 3VCNA 2BLEA 4Z0SA 5JH1A 5FEZA 2YN6A 2OEKA 4HA3A 4P0BA 4FNPA 1Q6QA 3UGRA 2PCQA 1QNOA 3ITTA 1XD1A 1OG6A 2BVLA 2DCFA 2C7FA 3W7KA 1IWPA 2BB0A 4UUIA 5DBUA 4I9TA 5KETA 1SR0A 4GXWA 3ZYZA 3SY8A 2BVDA 1YADA 5JDHA 4UB9A 1TTPA 2GPTA 1TREA 2YOEA 3EOOA 3KVBA 1IXNA 1XX1A 3LCXA 4H8HA 3FAWA 1CXEA 1NSJA 2DL1A 1UX4A 3ZWTA 1LRTA 3EDEA 3GY1A 5CKSA 3O3RA 3VKAA 4OWGA 3AA6B 1R8LA 3C0QA 4MWAD 1E4MM 3GTXA 3AC0A 1E6SM 5E0CA 4YHGA 1ICPA 1LBFA 4OFZA 1L6WA 2RGLA 4LQ1A 4PC8A 4H9ZA 3W7DA 3VDHA 1QW9A 3EXRA 3HGOA 2ZUVA 3N18A 3O05A 1DQXA 1FXPA 4HOXA 2V7IA 2WS3A 4B3TT 1POKA 4ROQA 3DDMA 5KTLA 3PDYA 3PJAJ 3ZYMA 1X39A 1MIVA 3FX4A 1E9ZB 3HGJA 4AWTA 1ZAIA 3CQIA 1ZHCA 4EANA 4HMEA 4UZSA 1ODZA 3VDBA 5CXPA 4RE3A 3OB8A 2X68A 3CK6A 1MXGA 3VIIA 4TZ4C 2J7GA 3ATZA 1T7LA 3GR7A 1VPYA 3GQYA 4FS9A 3ENLA 3DYOA 5A8PA 1EA9C 4IHJE 2HXUA 2O9TA 3QTGA 4US6A 3RO6A 3UESA 3R0DA 4HFBA 4JYAT 4WQ6A 4LS2A 4OTKA 1OJXA 3K4DA 3D6NA 3ABOA 4E7SA 1E5JA 3IAPA 3VD7A 4S2BA 1WXJA 1XLBA 2I16A 3U4FA 1VYRA 2NVDA 1R3SA 1ENUA 3G77A 5T8GA 2J66A 2XAJB 3WZ0E 1TELA 1A5KC 2J4GA 4CVUA 3UFEA 1FCQA 5DCEA 1ZFJA 3DC0A 1A5BA 7TAAA 3DI1A 4F48A 4PK5A 3CJPA 3IGHX 3FHQA 4HZ6A 2F2KA 1AL7A 5JQ9A 1DIOA 5E0KA 3K8MA 4O8AA 2BZBA 2PB1A 4K38A 3CIVA 4P8XA 4WD0A 5EMYA 3GR8A 3M0XA 1MMNA 1XW8A 3VGGA 1KKOA 5LZLA 4ERRA 3SR7A 2Q9QB 1JF6A 5I6SA 4MY8A 1XIHA 2O9PA 4EEDA 1TTJA 3UZZA 3UT0A 3CM4A 3WDRA 3QF0A 1VFUA 4PMRA 3WNPA 1MRQA 4QS5A 5AOUA 4WYVA 3TDFA 1XBYA 3TLLA 4Q8TA 3KBWA 1UB3A 5FVLA 3P84A 3S4UA 5AHIA 2GFTA 2OR2A 3W7NA 1UP2A 3MK7C 2RP4A 3KCJA 3CU2A 3NSMA 4AIOA 2WC3A 1GVQA 1JVNA 2YZRA 3PZ9A 5DMMA 4C6MA 2WBKA 3M5VA 1XBVA 1QOPA 2CESA 1R47A 4JX4A 3SADA 1WKFA 2PRHA 2E9XA 3I6RA 2QGYA 3AE5A 3EAMA 3UUNA 4UEMA 1Z42A 2BGNE 1FEWA 1JUBA 5K4ZA 1HVQA 3I9WA 2WZHA 5L3FB 4H2HA 2CCQA 4AZIA 2WVSA 1YDYA 2OJPA 2XVPA 4HK5A 2QCLA 4ORIA 3LD5A 3LG3A 3OHIA 3ZJKA 4DIAA 2BHUA 3LLFA 4GQ0A 3LBXA 2VXNA 1PZ0A 2V2CA 2VELA 3GDBA 4QISA 2OO0A 4CD7A 2EGZA 3AZSA 3NQMA 3GTFA 2QIIA 3DFPA 1BXNA 4YWSA 2XH2A 4IMGA 2ISDA 4RUBA 3LHYA 3E2SA 3MCMA 3W1RA 2BY2A 1B3OA 5J5RA 4NAEB 1UMLA 3O6YX 4QM1A 1J5SA 3SUWA 3FB2A 1WZKA 1RP9A 5CBIA 3G5EA 2RA1A 3EPMA 2X1IA 3W72A 2W2UA 3VX0A 4YSZA 1OEPA 2ZE3A 1JCJA 3TTSA 3VPLA 3HKCE 1MIYA 3EEGA 4BQ4A 1K6WA 3VDGA 4P7OA 1JF5A 1P1MA 4IDPA 4N42A 3DHUA 4DO5A 3I9YA 3NG3A 3WNMA 3PU3A 2I9EA 4O19A 2JQ9A 2OA5A 4UZUA 1FWSA 4IZGA 3KBSA 8TIMA 1GG1A 2IUBA 1OZMA 4LUSB 1JGMA 4KETA 1PZ3A 5J2UE 4HNOA 2D2OA 1GW9A 1MUCA 1HFAA 2QKFA 1SFSA 2NLYA 2BZNA 4HB7A 3AXJB 5A6TC 3RCNA 5C2GA 1MI3A 3C6CA 3HJEA 3PUDA 1M53A 2W79A 2VR5A 2VURA 3J9X1 2ZZ7A 1VCGA 3NWIA 2J7CA 4W8BA 3NQVA 2Y5JA 4UQEA 3ZR5A 5EYWA 3AIRA 3PPCA 1AJ2A 4CN1A 1XKYA 1UPPA 2BP1A 2E67A 3IAQA 3IGUA 1ONWA 2DUAA 1K4HA 2YA2A 3MO4A 4NXKA 1PKNA 2AGTA 3CGTA 1A0DA 4IXXA 1VPQA 4QH5A 3E02A 3W07A 4PMVA 3L3PA 5HPOA 2GK1B 4O0KA 4XB3A 2WXDM 4EZHA 3CHVA 3ZT6A 5C5YA 4ZXOA 1E4NA 3M0HA 3VABA 2Z7GA 2EO7A 1RVKA 4DF2A 1J2WA 1XYAA 4DUZT 5F3JA 4TNWA 3ETVA 3S9ZA 1MEWA 4O1EA 5D02A 3F4CA 3ZMRA 3GC4A 3GFXA 2FVKA 3P93A 5F7UA 1ITXA 1J96A 2YLLA 4GVFA 3WJSA 1KGWA 4O4WA 1JULA 4C7DA 4F2BA 4GISA 1LL6A 1UR4A 3TQPA 3B8TA 3EWBX 4WCJA 1LG1A 3G1AA 3CHCA 4TX9A 1LWHA 2WZEA 1WYBA 1BFNA 3FZFB 3QR1A 1MMDA 3FDGA 3VIFA 4MKNA 1OGSA 3BV4A 2O4QA 1S1RA 3IUDA 1O95A 2EHOA 1RHCA 3F7JA 2JQQA 2EHHA 1Y8BA 1BG9A 1C9WA 5CZJA 4F2TA 3HIJA 1NAFA 1TR1A 4OBSA 1FH8A 3KRZA 2E40A 5MKGB 1JZ5A 4RLIA 2Y2WA 3WK2A 3L4TA 4MKSA 2I59A 3V0SA 1PAMA 2PRMA 2N9DA 5T9BG 4AKGA 2BS9A 4JQ1A 4XKYA 2X9WA 1WO2A 1Y7VA 3I6EA 3E0IA 2W91A 3K5XA 1V0LA 1FWEC 3AMGA 1US0A 2XASB 1V79A 2O7SA 4H9VA 4TNVA 1R9ZA 2ALRA 4DBWA 4JS3A 1LCOA 2BKPA 4X64T 4HE8A 2WNQA 4ACZA 1NU5A 4BR1A 3ZMZB 4MLKA 4LUIA 3BJFA 3SCUA 1EO5A 1XXXA 3ABXA 3RX4A 2JE8A 5A5WA 3TONA 3A6OA 1BKHA 2ZFAA 2EPMX 3W23A 4ZTYA 2OOGA 2LLEA 1D8WA 3PTDA 4ZQRA 3VIMA 4TXEA 3PJWA 1UQYA 2CXLA 4YXDA 4Q22A 1H5YA 1VFTA 2X09A 2MTQA 1EJXC 3CWZB 3NPXA 1B57A 5GPRA 1MQQA 3WF0A 1ITCA 2WJFA 3UGVA 2YCKX 1U5VA 4O1CA 1FWRA 3LNMA 1YXCA 3SCNA 7REQB 1MMGA 5JR9A 2ATMA 3MANA 3NGFA 1CLXA 5D04C 2KZHA 4RXFA 2VWSA 1FHUA 2DSZA 2E5LT 3H26A 3EDUA 1ZL1A 4US5A 1EF2A 3BSHA 4C7GA 2CC0A 2VGBA 1R30A 2B7PA 1H09A 4H9XA 5JBEA 3APGA 3G1XA 4Y90A 8A3HA 2CBVA 2YYTA 1YKHB 4Q4KA 2NV9A 3ESLA 1Z9AA 2EHOD 1Q3NA 1PUDA 2FZMA 1HJXA 4J4KA 5I02A 4NPPA 1F73A 1XLEA 5FY7A 3N29A 1H49A 1XWYA 4AZBA 4H83A 3M0MA 2O4MA 1S38A 3SY5A 2GQ9A 5DABA 1REQB 3BLOA 5DLCA 1SFTA 4JQ3A 4PZVA 3P74A 2PLCA 2A79A 1JDEA 1G73A 3TAKA 3OZPA 5ADXL 5IYZE 4DXXA 4LVAA 3IJIA 1DWIM 1XLMA 3MMDA 2J1DG 1EJSC 4QS6A 3RPMA 3C56A 3C4XA 4Q4PA 4LV4A 5GQBA 1R3TA 2VASA 2EQDA 2UZ9A 4CD5A 4Q8VA 3IJQA 1TFVA 5FAGA 3VIPA 3P82A 3C52A 4TVDA 1RCQA 2YXGA 3E9AA 1OIMA 1J2BA 2QUVA 1XWMA 1DVJA 4A5XA 3WQPA 3THDA 1MNZA 4FOJA 2XAHB 4UR8A 2A21A 3KV6A 2QR6A 1AL8A 1PB0A 3B04A 3AMCA 4XKMA 3M0ZA 1UG6A 1W5PA 5IOBA 4OKDA 1DKWA 2GGJA 2I6HA 1H7OA 4X22A 1ISXA 1R3YA 5A1LA 4IP4A 1GEHA 1P0NA 2ZUUA 4MFDA 3SUUA 5A6LA 3ARTA 3CT7A 1H7PA 3M6DA 1WA3A 3CZJA 3QGKC 1Q6LA 2QQ6A 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 2UV8 G;  4U5I A;  1F6Y A;  3QC3 A;  3FA3 A;  2ZZ4 A;  3U7B A;  4PW8 A;  1XDL A;  5LGU B;  1UPM B;  3SBF A;  2NQZ A;  2CCR A;  2ZRV A;  3WK3 A;  1J1J A;  3DER A;  4PSP A;  1VR6 A;  4H2C A;  1E6R A;  4QNW A;  4YVV A;  2XPK A;  3E0W A;  3WLN A;  2A3D A;  3MKV A;  3NDZ A;  3PNZ A;  2PLJ A;  3M6Y A;  2ALD A;  2POD A;  4QFU A;  1VIW A;  2OGY A;  1XH0 A;  4R7O A;  2V9D A;  3W1A A;  2CLK A;  2WU2 A;  3RHW A;  4GUF A;  4JN6 A;  5C6M A;  2X66 A;  3QMS A;  4TX5 A;  1OFQ A;  4MTV A;  5HWN A;  4MYA A;  1P6B A;  5H6H A;  1RCO B;  5LNR A;  1B4K A;  7REQ A;  1XNQ T;  4IE5 A;  2VGI A;  4BHY A;  4ZOA A;  3THC A;  2D2H A;  4JFT A;  2A2I A;  1FWW A;  4PUM A;  3OYZ A;  5M5D A;  2YA0 A;  4UV9 B;  4XG1 A;  3VND A;  1JZ8 A;  4ZST A;  5FSE C;  2QHA A;  3GXP A;  4DEL A;  2GVG A;  1IGS A;  2BY3 A;  1V6T A;  4B2D A;  1WKD A;  3EDD A;  1XIJ A;  1VFH A;  4QE4 A;  4MBQ A;  4J3Z A;  2WKL A;  3TYE A;  5CSR A;  1TPE A;  4Z42 C;  2F8Q A;  3RLH A;  1JYN A;  1U1H A;  3Q45 A;  3APT A;  2CLL A;  4N78 D;  3LSC A;  2ACU A;  1DJZ A;  4KGL A;  4ZFC A;  3BCJ A;  1MFV A;  1REQ A;  1A5C A;  1GON A;  1G8X A;  1R9X A;  4DB7 A;  1AH4 A;  2VRJ A;  2BXY A;  3WK0 A;  3HFT A;  3UPB A;  5HMS A;  4ROP A;  3PZQ A;  1PTD A;  5G2W A;  2Z6I A;  2UXB T;  1WUE A;  1ZCC A;  4XSL A;  2ZTJ A;  4GI4 A;  4N6F A;  3A4W A;  1FH7 A;  3WO8 A;  1XIB A;  2FZ8 A;  4Q25 A;  1E56 A;  3KVL A;  1EGZ A;  4EAY A;  5BW6 A;  1LT7 A;  1IEI A;  3VIK A;  1HZY A;  1ZBC A;  2HVN A;  3TLV A;  1RSC A;  4R88 A;  3WBY A;  5C8Y E;  3U2O A;  3RR1 A;  4PGL A;  4KCT A;  3BW2 A;  2DGA A;  5EFF A;  2XIQ A;  3C2Y A;  4IE6 A;  2P76 A;  1NWR A;  1Q2R A;  3CQC B;  3SN1 A;  3PJX A;  1B3V A;  1G0C A;  1VC4 A;  1WDW A;  1E0X A;  3HQO A;  2CWY A;  4D9P A;  2G0U A;  4J35 A;  2GJX B;  2QJI A;  4ZZ9 A;  2NTY A;  3CEU A;  3WMB A;  1XGZ A;  5A6A A;  2MPK A;  2Y8D A;  3IIV A;  2CZF A;  4DYJ A;  5L6U A;  3TFX A;  3ARR A;  4UIG A;  1JPD X;  1RLC L;  2Z2A A;  2OQY A;  3EX3 A;  4GVI A;  1ZAL A;  3RKG A;  4E2D A;  4RNI A;  3P5Z A;  4ZOC A;  4PTM A;  4BQ3 A;  1BTM A;  3UG4 A;  4RNH A;  5GNY A;  4IST A;  5JMU A;  1SZR A;  3OKQ A;  5AN7 A;  1MDR A;  2PDX A;  1AZ1 A;  4UMC A;  4E7Z A;  5C7V A;  4GZJ A;  4DND A;  5BWA A;  3N19 B;  4GC3 A;  4W87 A;  4KWU A;  4B2D D;  4MJM A;  3IPW A;  4O4L E;  5HDR A;  4DV3 T;  4G2D A;  1QW7 A;  1X7F A;  4FIR A;  4DBR A;  3FXG A;  3S1W A;  4KBX A;  4PH6 A;  3W88 A;  3V5S A;  1OFR A;  2QS8 A;  1QT1 A;  5H6Q B;  1OSE A;  5HBF A;  4Y8E A;  3BUR A;  2PDW A;  4WJ8 A;  2Y7F A;  2O7Q A;  5HYA A;  1QI5 A;  4RDY A;  3TZN A;  2HRO A;  4LB3 A;  3G6L A;  3B9A A;  4AMA A;  4YIW A;  3TSB A;  5CQ1 A;  2GDQ A;  4OGZ A;  4HPH A;  3VX1 A;  3VC5 A;  4Q7N A;  4UXD A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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