4AISA

A complex structure of btgh84
Total Genus 243
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
243
sequence length
712
structure length
637
Chain Sequence
SLQPPPQQLIVQNKTIDLPAVYQLNGGEEANPHAVKVLKELLSGKGMLISIGEKGDKSVRKYSRQIPDHKEGYYLSVNEKEIVLAGNDERGTYYALQTFAQLLKDGKLPEVEIKDYPSVRYRGVVEGFYGTPWSHQARLSQLKFYGKNKMNTYIYGPKDDPYHSAPNWRLPYPDKEAAQLQELVAVANENEVDFVWAIHPGQDIKWNKEDRDLLLAKFEKMYQLGVRSFAVFFDDISGEGTNPQKQAELLNYIDEKFAQVKPDINQLVMCPTEYNKSWSNPNGNYLTTLGDKLNPSIQIMWTGDRVISDITRDGISWINERIKRPAYIWWNFPVSDYVRDHLLLGPVYGNDTTIAKEMSGFVTNPMEHAESSKIAIYSVASYAWNPAKYDTWQTWKDAIRTILPSAAEELECFAMHNSDLGPNGHGYRREESMDIQPAAERFLKAFKEGKNYDKADFETLQYTFERMKESADILLMNTENKPLIVEITPWVHQFKLTAEMGEEVLKMVEGRNESYFLRKYNHVKALQQQMFYIDQTSNQNPYQPGVKTATRVIKPLIDRTFATVVKFFNQKFNAHLDATTDYMPHKMPLQVKANRVLISPVEIELDAIYPGENIQINAGLQKAPVKFVRQFVLTIEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
publication title Metabolism of Vertebrate Amino Sugars with N-Glycolyl Groups: Intracellular Beta-O-Linked N-Glycolylglucosamine (Glcngc), Udp-Glcngc, and the Biochemical and Structural Rationale for the Substrate Tolerance of Beta-O-Linked Beta-N-Acetylglucosaminidase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords O-GLCNACASE BT_4395
total genus 243
structure length 637
sequence length 712
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2012-02-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
A PF18344 CBM32 Carbohydrate binding module family 32
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 4aisA03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4aisA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 4aisA01
4D6EA 2EPOA 4Y7EA 2DT2A 5EB8A 2E8YA 3VIPA 1VF8A 3NCOA 3VNYA 2FHBA 3A6OA 4DWSC 3ARTA 1E0VA 2BHZA 5A2CA 2ZUSA 5EFDA 2IUZA 3WMSA 4YHGA 2F8QA 1E6RA 1V3LA 3AZRA 4MDPA 1ITXA 3SUUA 3GH5A 4J3WA 4V28A 2VURA 1VFMA 3I3EA 3OGVA 1XSJA 2BVTA 1DHKA 2D3NA 1BHGA 3TTSA 1H49A 3CZGA 5HPOA 3G6MA 4JL2A 2QHAA 1I1XA 1ODZA 3AMKA 1L0PA 4NZCA 3BCFA 4PMDA 1J0YA 3CHCA 1XGZA 3KL0A 3WNPA 4NRRA 1V0LA 1JF5A 1LWJA 1B90A 3VD5A 3WD4A 3WDRA 5BYWA 1BG4A 4M29A 3M7SA 1E9LA 1HJUA 2VQTA 2WANA 1KXTA 3AZTA 3GTNA 1CWYA 1HP5A 4TVCA 3VGFA 4BZYA 1UYQA 4W8BA 1E3ZA 4UQEA 1C8YA 5EMYA 5CSYA 5IHRA 1UD2A 4P7NA 2J7EA 4BF7A 5GNZA 2XUCA 2VL4A 4D71A 1OM0A 3TOPA 2WBGA 5JBDA 2XFYA 2WC7A 2OSWA 3GNOA 3ZT5A 2V5DA 2D2OA 2X0HA 5BRPA 2A3HA 1TCMA 4W93A 3GNRA 4IM4A 5CLWA 3THDA 1J10A 2V3EA 3SUVA 1FFRA 1WDQA 4GO9A 5A94A 1WE5A 5FCZA 3POCA 3AHXA 4JZ5A 1W3HA 1PPIA 5F7UA 1ISVA 4GQQA 1NP2A 3W24A 3CPUA 3AI0A 1HJWA 4B15A 1J9YA 2ZXBA 2WMIA 3AJ7A 3WL1A 3OA5A 4MTVA 5D9NA 3APGA 1VEOA 5HDRA 1UWSA 5DT5A 1QW9A 1BFNA 4D6CA 3ARXA 1D7FA 3I3BA 3W38A 2G3IA 4HOXA 4J3TA 3VVGA 1W9VA 2CYGA 4GZEA 1V6VA 3AIUA 1BGAA 4RE4A 2HISA 3S6TA 1HN1A 1WPCA 1PX3A 3A4WA 2TAAA 1ISZA 1BVZA 1CXEA 4KGJA 1G0CA 1VRXA 4CU6A 3KL5A 3VGHA 4J28A 1MXDA 5A8QA 1E56A 5I23A 1S46A 4U31A 1FH7A 1E0WA 2EPMX 2XVNA 1DWIM 1UWUA 3CHFA 4CU8A 5BXSA 4D72A 1GOWA 1M01A 3MU7A 5ABFB 1JXKA 4D6FA 1TZ7A 2W91A 4WF7A 1OSEA 3AQUA 2J62A 4TXEA 1QNRA 4NF7A 1ISWA 4JFTA 3SCUA 1RP8A 4QAWA 3WD3A 3BCDA 2EXOA 3UEQA 2G8ZA 1E5NA 2ZUWA 2JEQA 2E9BA 2FDMA 2DIEA 4PCTA 2ZUNA 4C90A 1V0MA 2WCGA 3WEOA 4ZXLA 3SUSA 1JI1A 1W9PA 1GVIA 3WY1A 4DWSB 4H7VA 2A3CA 2QLYA 2Y8VA 1LL7A 2CPUA 1V02E 3TA9A 5HOSA 3WL0A 1C3FA 1WAWA 4LQ1A 1JYVA 4HZ7A 1B0IA 1E3XA 4Z2GA 3L4VA 3QR3A 1CENA 2Y5EA 2VRJA 3RMEA 2Z1SA 1JYXA 1G01A 1KB3A 3FNDA 2BY3A 2YKKA 1UKQA 1ZS2A 1G5AA 1E4MM 1W3LA 1OIFA 2D0HA 1LLOA 1V0KA 1TA3A 4Z2KA 5FKYA 3BAYA 3TTYA 3W26A 3F4VA 5HBFA 2WWDA 1KBKA 1CXIA 4HA3A 3WQ8A 1CBGA 3GXFA 2J7BA 2VZUA 1AQ0A 3L4YA 1NOWA 4PMVA 3PBGA 4MDOA 2QV4A 1BQCA 2VCBA 4AZ5A 1UWTA 1UD3A 3ECQA 4UFJA 3VOCA 2O9PA 3L4TA 2WSPA 3LPOA 2BV9A 1KGWA 3CGTA 5GQBA 1QI4A 3LPGA 5BWFA 3CMGA 3CUJA 2DPEA 1KBBA 1UKOA 1V08A 1JYNA 4CD7A 1A3HA 5CZKA 2ZUUA 1OIMA 4KH2A 1G94A 1VFOA 2FGLA 4PYSA 4B9ZA 4UQAA 5CG0A 2J7FA 2WC3A 5IHSA 2WAGA 2X1IA 2PWEA 3CLWA 2PC8A 2D20A 5C71A 1E6QM 3N11A 3PZOA 1EXPA 3IJ8A 1VIWA 1E43A 1CLXA 1W1TA 2PBOA 1VJSA 4PTXA 4GXPA 1D2KA 3ZJ8A 4HZ8A 4UQBA 1Q6CA 3SCTA 2VVSA 1KGUA 4A3HA 2VVNA 5DT7A 2OWCA 3T2QA 1W91A 1JI2A 3D5HA 5A3HA 1B3WA 2GJRA 4W87A 2VCAA 1R8LA 3ARSA 3DYOA 1UH3A 2ZUTA 5IXEA 4EAMA 4WIWA 1PEZA 1GOKA 3GBDA 1W1PA 4PMYA 3GM8A 1WDSA 3VD7A 3BSHA 4PMOA 4PMXA 4MB1A 4OUEA 3SCQA 4IPNB 5IFTA 4XZWA 1U2YA 1EOKA 3U5UA 3ZM8A 4CU7A 2V38A 5DMYA 4NRSA 1M7XA 4JFWA 2VT0A 4HP5A 2J77A 4PCSA 3CZKA 4UCFA 2YDRA 2Y8KA 4CVWA 1QNQA 1KCLA 2QF8A 3AMDA 4K68A 4EANA 2OWXA 3AIBA 5I79A 2OYMA 1MFUA 1UQZA 2WMFA 2BY1A 4UQDA 4GKLA 3WFLA 1J12A 3WNNA 3WBAA 9CGTA 1BLIA 1FFQA 3NSNA 2BHUA 1X1NA 1B2YA 2RGMA 4ZE5A 4KRUA 3AZSA 4BCEA 3VTRA 2GDUA 5FL1A 2RGLA 1H5VA 3WD1A 2AOSA 5KEZA 3T08A 2D0GA 4M81A 2NT0A 3TTOA 3VDCA 4MNLA 4U5IA 1B31A 4E2OA 4M1RA 2ZE0A 2WVSA 2X2YA 3KZSA 3WDHA 5JBFA 2IXUA 5ABHA 3AS3A 1XYFA 2GDVA 4UFMA 4OBSA 2A3BA 2OYKA 3W82A 3LMYA 1VAHA 4AD3A 2QPUA 5AY7A 4E8DA 3WH5A 5CLTA 1KWGA 5FD0A 4XX6A 4LGXA 3T09A 2XVGA 1ZBKA 4ACZB 1SYTA 4P7RA 4UOJA 3AHTA 3EMQA 3O9NA 1H41A 3DC0A 3HN3A 3VX1A 1UR0A 1W9DM 3WDJA 3AMGA 1GW1A 4TX6A 3GZAA 1O6IA 1Y7VA 5I77A 3PZIA 4LX4A 2GSJA 4ATWA 2DSVA 3O6AA 2A3AA 2NW0A 2X05A 1OD0A 1VFUA 6TAAA 3RJYA 4EK7A 1Q6FA 3DECA 4GPNA 2W63A 2W66A 3VGBA 2WZEA 4IPLA 1CGUA 1P6WA 3CUHA 4MJ2A 3MUIA 3OGRA 4NSBA 1V3IA 2CESA 3VGEA 1JG9A 1TFVA 3PZMA 2JIEA 4UQCA 1MQQA 3ZJ6A 3AXIA 4E8CA 4U5KA 1EGZA 3W6MA 5D9PA 1HKMA 1ISYA 2EPKX 2ZICA 6CGTA 5ABFA 1JDCA 2VZTA 2DT0A 1J11A 2ESCA 3CO4A 4W7WA 1R86A 2CERA 5DO8A 5GNXA 2J7HA 4KMQA 4DUXA 2EQDA 2CKSA 1TG7A 1E6PA 2PI6A 4JFUA 3B8SA 1ITCA 1C90A 2J75A 1GOIA 3QOMA 1US3A 1JAKA 3K46A 3K8KA 1V6XA 5A8NA 3BGAA 1QI3A 1CLVA 3WQ5A 1K9FA 5BCAA 3AS0A 1C93A 4WKHA 2XM2A 4DWSA 4FMVA 1JZ6A 1KWKA 2ZX7A 3VD4A 2AMGA 2DDXA 2VNCA 2VUYA 1GZJA 1KQYA 5I2UA 2YDSA 1VJZA 3SIMA 3NDZA 1PX4A 2F61A 3ARQA 1E40A 4HMEA 3PZ9A 4J7RA 2VX6A 4GI9A 2EJ1A 4WKAA 4BQ2A 4R5EA 1ZJBA 2JALA 1H4PA 1XHGA 1CGXA 5BXPA 4MNMA 1UZ1A 1JL8A 3BAJA 3VIMA 2YL6A 3WQVA 4UFHA 4UFIA 4C91A 3SCSA 4UNIA 3WDIA 2ZOXA 4HOZA 2Y2WA 1NM9A 4UFLA 5A6JA 2G3NA 4HTYA 1CXKA 4W89A 4XB3A 4CD6A 2GFTA 2J25A 2CBIA 1HF6A 3WMCA 4CUCA 3VDHA 2XGBA 1VBUA 4D6DA 1HIZA 3SCPA 1MQPA 4D6HA 2FHCA 3CZLA 4KWUA 3GH7A 4ATLA 2EPLX 1NH6A 4AZIA 2WZHA 4A3YA 3WQ4A 2OYLA 4Q22A 1BSIA 3GH4A 5EFFA 3RIKA 3S2CA 4CGTA 4ZENA 1B3ZA 4QDMA 5HPCA 1IZJA 2BVYA 1QNPA 1G9HA 1HJVA 5E09A 2PWGA 2YL8A 1EHNA 3WUFA 3AHZA 3DYMA 1MW3A 4MAVA 1J01A 2JFEX 4JFSA 3OLGA 2O9RA 1E55A 2VX7A 4YN5A 1HKIA 1BAGA 1MYRA 3VDBA 2W62A 3L4XA 5I6SA 1E1FA 2EO7A 1NWSA 1E15A 1PIGA 4M82A 3ZIZA 1FH8A 1GHSA 1MFVA 3EDEA 3ZOAA 1EO7A 2NT1A 2O92A 1W9BM 1IT0A 3WNKA 3W81A 2WK2A 2X8RA 1JZ5A 3L4WA 3CIVA 4HMCA 4PEEA 5BXRA 1CPUA 4LYQA 1UD6A 2CNCA 5AC5A 3ZQ9A 1GOMA 2F2HA 2GUYA 4IUGA 4EE9A 3M07A 1TMQA 1US2A 2JF6A 4LYPA 3PZQA 2GVYA 2ZUMA 4GZIA 1JZ7A 4CN1A 4XUYA 1WO2A 1IZKA 3THCA 4W8LA 3BSGA 1QVBA 2G3MA 2WHLA 1FP9A 4P8XA 1BYBA 3ARYA 4CD5A 3AOFA 4W88A 3BAWA 5M5DA 1UHVA 3VO0A 1EHAA 4AZBA 3EDKA 1A47A 1FHLA 1HKJA 1LG2A 1M03A 4H41A 4W7UA 1FOBA 1KXHA 3AIEA 2DSUA 3FAWA 1E4LA 1GOOA 4KRTA 1XRVA 1CECA 4AD5A 4D6JA 2UY2A 1GJUA 2VX5A 3BXWA 4AEEA 1UD4A 1HL9A 3QHNA 3MMWA 5AYBA 1E6XM 4GI8A 1OINA 4TOQA 1OBAA 4WLCA 5A6BA 1KR0A 4URIA 3WSUA 4ACYA 2J7CA 2VRKA 1JYWA 3GXIA 3WN6A 3WMBA 3SCOA 3N04A 4GIAA 5JUVA 4UOZA 2FHFA 4KGLA 1DWHM 5A69A 1H1NA 4RE3A 1LG1A 1HXJA 2UWFA 1H0IA 1SMAA 1WP6A 1TR1A 3WD2A 2D1ZA 5CJ5A 1UG6A 2BFGA 3VIOA 3WF3A 4JHOA 1QOXA 3WDPP 3FY1A 5ECUA 1JGIA 1TE1A 4L4OA 1WZAA 2J7GA 3WBEA 2ZWZA 5E0CA 4QFUA 1NOFA 5LA1A 2XIIA 4ACZA 4PRWA 3RJXA 3OBAA 2WMKA 1VFFA 3AYRA 4U2YA 1E6NA 3MUZ1 7CGTA 4AISA 3U7BA 1MW1A 2GJXB 5D4YA 5A8OA 1W2VA 4PMQA 3NDYA 4PTMA 3RM4A 8A3HA 1JZ8A 3VGGA 1PZ2A 5I5RA 3VM5A 4FLQA 2UY5A 2WKGA 3VMNA 1LL6A 3VMOA 4YHEA 1GVYA 1KXQA 1QPKA 5ABGA 3B9EA 3KWXA 1R85A 4S3KA 5M03A 4M24A 3VIIA 2ZIDA 3SCWA 3A3HA 4TTUA 2EEXA 3OGSA 2NSXA 4DUWA 3CUIA 3ARZA 2FH6A 1V02A 3WF1A 5CGMA 1K9DA 4J3VA 1ISXA 4MJ4A 1CEOA 4W7VA 4M56A 1OCQA 3B9AA 1HJQA 5LA2A 1J0ZA 1UH4A 1HT6A 3W53A 4F9JA 4F66A 2D24A 2G4FA 1E73M 3BC9A 2QMJA 2WVVB 5CQ1A 1MVYA 1W32A 1DEDA 1CYGA 1ODUA 3ARUA 2VQUA 2YA0A 2BNJA 2BY0A 2DQXA 4JKMA 2VZOA 1QHOA 1JDDA 3GXMA 2Z1KA 3EDJA 3CZ8A 4AW7A 2PB1A 1CIUA 3M46A 5KZ6A 1J0HA 2ZX5A 3NUKA 4P7OA 2W4XA 1E0XA 2OSXA 4HOWA 1UWIA 1XYZA 3CZEA 2YL9A 3AICA 5IFPA 4YPJA 1DWFM 3BLPX 1ZJAA 3W0KA 4Z2LA 2DIJA 2V3GA 1NWRA 3OB8A 1VBRA 4MB5A 4J3SA 2WKLA 3SUWA 3UETA 1RPKA 1ZBCA 3CMJA 1XH2A 1F4HA 3EMCA 2CBJA 4QCFA 1ZBVA 2ZUVA 3RCNA 4F9DA 4Z2HA 4PUEA 4N42A 3W28A 4MB3A 3BH4A 1W3KA 1CGWA 4TX8A 3W6LA 4PUDA 2WBKA 1CXFA 3L2MA 1VEPA 3WNOA 3BAKA 2WC4A 3EMZA 1CXHA 1GOQA 2CITA 4GINA 1QNOA 3A4AA 2OLHA 3N9KA 4PMNA 3QHOA 4W86A 2VC9A 2WSKA 3FAXA 5A1AA 5LYRA 3VIHA 2XHYA 1OGSA 2XM1A 4P8UA 4OOZA 3OZPA 1B3XA 5JIWA 1JZ2A 1GQKA 2WM0A 4MB4A 5DEZA 2WB5A 2CEQA 1WZMA 2OSYA 4WJXA 5LA0A 4UTFA 2VI0A 1XH0A 1UZ4A 3VIGA 1CZ1A 4TVUA 3WNLA 3PZGA 4AZ7A 1HL8A 4TUFA 2DSWA 1W9XA 3U7VA 1LL4A 4F8XA 1J0JA 3WD0A 1UA3A 2WW5A 3CTTA 3FW6A 3ARPA 2ZXQA 3BMVA 4H8UA 2CHNA 1GQJA 1B3YA 4UQ9A 3T0DA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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