4AISA

A complex structure of btgh84
Total Genus 243
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
243
sequence length
712
structure length
637
Chain Sequence
SLQPPPQQLIVQNKTIDLPAVYQLNGGEEANPHAVKVLKELLSGKGMLISIGEKGDKSVRKYSRQIPDHKEGYYLSVNEKEIVLAGNDERGTYYALQTFAQLLKDGKLPEVEIKDYPSVRYRGVVEGFYGTPWSHQARLSQLKFYGKNKMNTYIYGPKDDPYHSAPNWRLPYPDKEAAQLQELVAVANENEVDFVWAIHPGQDIKWNKEDRDLLLAKFEKMYQLGVRSFAVFFDDISGEGTNPQKQAELLNYIDEKFAQVKPDINQLVMCPTEYNKSWSNPNGNYLTTLGDKLNPSIQIMWTGDRVISDITRDGISWINERIKRPAYIWWNFPVSDYVRDHLLLGPVYGNDTTIAKEMSGFVTNPMEHAESSKIAIYSVASYAWNPAKYDTWQTWKDAIRTILPSAAEELECFAMHNSDLGPNGHGYRREESMDIQPAAERFLKAFKEGKNYDKADFETLQYTFERMKESADILLMNTENKPLIVEITPWVHQFKLTAEMGEEVLKMVEGRNESYFLRKYNHVKALQQQMFYIDQTSNQNPYQPGVKTATRVIKPLIDRTFATVVKFFNQKFNAHLDATTDYMPHKMPLQVKANRVLISPVEIELDAIYPGENIQINAGLQKAPVKFVRQFVLTIEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
publication title Metabolism of Vertebrate Amino Sugars with N-Glycolyl Groups: Intracellular Beta-O-Linked N-Glycolylglucosamine (Glcngc), Udp-Glcngc, and the Biochemical and Structural Rationale for the Substrate Tolerance of Beta-O-Linked Beta-N-Acetylglucosaminidase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords O-GLCNACASE BT_4395
total genus 243
structure length 637
sequence length 712
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2012-02-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
A PF18344 CBM32 Carbohydrate binding module family 32
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 4aisA03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4aisA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 4aisA01
1DWIM 3RMEA 3GBEA 2DT0A 3QHMA 3DHPA 1UD5A 2WWDA 3VILA 3W81A 4PMUA 5A6BD 2EXOA 2VCBA 4HA3A 3W26A 3ARZA 4L4PA 3RJXA 3RM9A 3VD3A 4AZ6A 1WZKA 4ACZB 1BGAA 1HKMA 2J7DA 4J3TA 3UETA 4M56A 2WC7A 4GZIA 3I3EA 2D3NA 2J7EA 3NJ3A 1UQZA 3ZIZA 3WUFA 1GZJA 3TTSA 3T0BA 4OJYA 1V08A 1ISYA 1V0KA 2W63A 4Z2IA 1I1XA 5DF0A 1B9ZA 3NDZA 4JFTA 1ECEA 4BQ4A 1S46A 1DEDA 3NSXA 4PMQA 3AIUA 2JALA 4QCEA 1PEZA 2XIBA 1AQHA 5A8MA 4AIOA 3K8MA 3II1A 1JDAA 3WBAA 1JXJA 1O6IA 4GQRA 1PAMA 5JUVA 2DEPA 5LA1A 1KGXA 5DEZA 1I75A 1JIBA 1XSIA 3RCNA 1C3FA 3LPFA 1KXTA 5M3WA 2O9TA 4AISA 4TTGA 1SFSA 1ODZA 5JBDA 3SIMA 3ARTA 2YL6A 1XD0A 4J28A 1W3LA 5E0FA 5FCZA 3PTQA 4QLKA 1WZAA 2D20A 3PZUA 3S6TA 1HN1A 1GQLA 3LPOA 2Z1KA 3ALGA 3AMDA 5CPSA 4OBRA 4UOQA 2J62A 6TAAA 1U2YA 3MUY1 4PYSA 4LQ1A 4AD3A 1W2PA 2CESA 4CVWA 4CD6A 2YA2A 3LMYA 4AZ7A 4MNKA 4B9YA 5I77A 2AAAA 3CZ8A 2X05A 3WDQA 4C90A 3MU7A 2AOSA 5EFFA 3OG2A 4GPNA 4UOZA 5CQ1A 1BF2A 1OT2A 3THDA 4WKAA 5A6JA 3SUUA 4JKLA 2JF7A 3N1AA 4W8LA 4F66A 3M46A 3N11A 4PSPA 2ZUUA 1UR1A 4U2ZA 2E9LA 3VD5A 4HU8A 4U3CA 2UY2A 4MPKA 5HOSA 1DTUA 4LGXA 3WUEA 1C8YA 2RGLA 3CUGA 4PSRA 3L2MA 1E0XA 1FFQA 4CN6A 2O9PA 1EOKA 2Y4SA 3WF1A 2J78A 1W9BM 4WKFA 3EBVA 3GNOA 1E55A 4CGTA 2G3NA 2BVTA 5I2UA 3F5JA 3PZTA 4EAMA 2ZXBA 2WZIA 2BVDA 4UZUA 2WWCA 3MUAA 3VUPA 1QHPA 3WDHA 1CGVA 1R7AA 3ZJKA 4EE9A 1UZ1A 3VGEA 1KBBA 4M81A 3W4RA 3WFZA 5IHSA 1GQJA 1SMDA 1E6NA 1MXDA 1MQPA 2VCAA 5A6AA 4WIWA 1ITXA 3WNOA 3OZPA 3AMGA 2WK2A 1RP9A 2OYLA 1E6RA 3S2CA 3GTNA 2Y24A 4YHEA 2EBNA 3FHQA 1V3HA 3G6LA 2PBOA 3CHCA 1VF8A 1US2A 5ABFB 2WVTA 3L2LA 1KXQA 1V3LA 3SCVA 4W7VA 3ZT7A 1CXIA 4H7VA 1KWKA 4CD7A 4H8UA 4FLRA 2XGBA 1CXFA 2J47A 4MNMA 2WMIA 1BTCA 2YJQA 1BG9A 2WPGA 1CGTA 1JZ7A 2WVSA 1BFNA 1VFFA 3UG3A 2DT3A 3AIQA 3GXDA 1JZ6A 1D7FA 1PX3A 3AIBA 4MB3A 3WY1A 1B0IA 2WKLA 5AYIA 2ZUMA 1B1YA 3K46A 4JL2A 1V0MA 2CBUA 4KH2A 1GVYA 2QPUA 4KWUA 1EO7A 2E0PA 3BAKA 4AYSA 4QLLA 1RH9A 1C93A 2ZWZA 1CPUA 1ZL1A 5LA0A 3WDJA 4HA1A 1N82A 2Y8VA 4Q7NA 1OCQA 4F9DA 9CGTA 4QP0A 1B31A 1VEOA 3BSHA 1QPKA 1LF1A 2BY0A 4UFHA 3WQ4A 2ZX6A 2WMGA 3BCFA 1VIWA 5I6SA 1ISZA 4UQEA 5I0DA 4H8HA 3NUKA 1QNPA 3ZQ9A 2J4GA 1RP8A 3VIMA 1UKQA 5DFAA 4J3VA 3RIKA 1WE5A 2WVUA 5A2BA 4AZIA 1E5JA 1TCMA 1NP0A 4XB3A 3ZOAA 3PN8A 2J7BA 2QMKA 4D6GA 5A1AA 3GH4A 2WHLA 1MW3A 2WANA 3RO8A 2VTFA 4JL1A 4UR9A 2VJXA 2VL4A 1G5AA 5D4YA 3D3AA 4AEEA 3MMDA 1CECA 5I3DA 2WMKA 5CXPA 5FOOA 3EYPA 2C7FA 3BMWA 2ZXDA 4QDMA 2ZUWA 1VAHA 4EKJA 4W89A 1VRXA 2YBUA 4D1IA 2VOTA 5A8PA 4PTXA 1ZBKA 2Z1SA 3WF3A 1IV8A 1FH8A 3VGHA 2ZWYA 1HXJA 1TA3A 4HPHA 5A6BA 4GZJA 1IT0A 1WNOA 2UWFA 6A3HA 1E71M 1UWIA 1HJUA 3EMQA 1Q6CA 2G3IA 1BYDA 2XJ7A 1Y7VA 4BA0A 1G94A 1MW2A 1W3KA 1QNOA 2J7HA 1TG7A 3A3HA 3GDBA 3B9EA 4PTMA 3RPMA 3OGVA 3WF2A 1UWRA 4CD4A 4FLOA 1GUVA 3OLEA 4U5IA 2NW0A 3OBAA 4J3WA 3OZOA 3WEMA 1CXLA 3K4AA 3FY1A 4CCDA 4D71A 1E43A 4W7UA 4CU6A 2XVLA 3B8SA 2FGLA 4A3YA 1JD9A 4UQ9A 1KGWA 2WBGA 2OYKA 5IHRA 4GI9A 3VPLA 4WKHA 3U7BA 3SCPA 3WNMA 2J7FA 5A6LA 1J12A 3G6MA 1BQCA 3AXIA 4J3SA 5D9OA 4PCSA 2XFYA 4E8CA 3CHDA 5I24A 1FP8A 1CNVA 4W8BA 4M29A 4OOZA 3VGFA 5JBEA 3W38A 1WZLA 1XH1A 4RL3A 3MV01 3CGTA 8A3HA 1VBUA 4P8UA 1J0ZA 5A8OA 2UY4A 1KCLA 2V3EA 5GNXA 1QI4A 1P6WA 2G41A 1UOKA 2PWGA 2DIJA 1E0VA 3CPUA 2A3EA 1EOMA 1HP4A 1JZ5A 1W9DM 3GBDA 5HBFA 4S3JA 3ARQA 1JL8A 3OGRA 4UCFA 4B3LA 2VZTA 1Q6DA 2GJXA 3AS2A 4AZ5A 3FN9A 3MUIA 4DWSB 4AD4A 2EEXA 3CMGA 3WH5A 2YIHA 3GNPA 3HJEA 4IISA 1JZ2A 3NSMA 2OYMA 4XX6A 2HISA 4H41A 3WD1A 3N9KA 3BAYA 4B3KA 3IJ8A 3GZAA 3D5HA 1CLXA 3N04A 1G01A 4Z2GA 2OSXA 5CGTA 2VMFA 1K9DA 1VEMA 4JCLA 3WNLA 5CPTA 3ZM8A 2OLHA 1QHZA 4E8DA 3AHXA 2WB5A 2WSPA 5D9PA 1E6SM 3UR7A 1GNXA 2WBKA 2CHOA 2CIPA 1GQIA 1JYNA 4FLSA 3PZOA 3WIJA 4JZ5A 2YOCA 5EB8A 2VZUA 4CUCA 2D24A 3GH5A 1UH3A 3IJ7A 1L0PA 1VFMA 3O6AA 7TAAA 3CHEA 2QPSA 1JF6A 1J0JA 1FH9A 3KZSA 3WEZA 2JIWA 1DHKA 2PWHA 4WSKA 1Q6GA 2CBVA 1V3IA 3KE0A 4QFUA 1J0IA 3DYOA 1E56A 2X2YA 4WJXA 1A47A 3WBEA 3AROA 1B3VA 2OWXA 1E15A 5BXRA 4J7RA 4FLQA 3VNYA 2BHUA 3L4VA 4GI8A 1R8LA 1WO2A 2EPOA 4JHOA 1W3JA 2E9BA 1VJSA 1HVQA 6CGTA 1OWQA 3M07A 1XH0A 2ZUNA 3GXFA 3PHAA 3T09A 3IANA 1XCXA 4AWEA 4AD5A 4MAZA 4JAWA 2CHNA 1HJQA 3CUIA 5LYRA 2GDUA 3ARPA 3IJ9A 4OIFA 5BYWA 1XSJA 2UY5A 2XVPA 4DM1A 3AI0A 3WUBA 1MXGA 2EJ1A 2CEQA 2XWDA 1WCGA 3OA5A 2E9MA 4W84A 2A3CA 1HNYA 4JFWA 4Z2LA 4AY1A 1BYBA 1PPIA 4MNJA 1PIFA 2F61A 3F5LA 2CBJA 5HXMA 4F8XA 5A2CA 3ECQA 4AZCB 1XRVA 2WSKA 1GW1A 3BGAA 3SCTA 4HA4A 1NARA 2Y5EA 1LG2A 4PMXA 1I1WA 2E4TA 1V6XA 4ZXLA 4EK7A 1M53A 1JD7A 3AYSA 4JFUA 2D2OA 3SUSA 1UD3A 4UFLA 3SCQA 3BMVA 4ZEPA 4MNLA 4RE3A 2V3DA 3CIVA 3WEOA 2PC8A 1H1NA 1TVPA 2V5DA 1GPFA 1TZ7A 5DT7A 3VIFA 1HKIA 2J7GA 2WC4A 3MUZ1 1OINA 1NM9A 1PIGA 3CUJA 3VTRA 1NOUA 5ABGA 4JFVA 3VGDA 4LYRA 3A47A 1E0WA 1E72M 4MB4A 4P7OA 1KQZA 1ZU8A 2YDSA 4PTVA 4UOJA 1B3YA 1PBGA 4D6FA 4HPGA 3VD9A 1XV8A 2ZXAA 1JZ3A 2W4XA 3CZEA 3EMZA 4GIAA 3GXIA 1GHSA 1E4IA 3MMWA 1UKOA 2GK1B 4DM2A 2NT0A 1W9PA 3I3DA 2CPUA 3WDIA 4NI3A 1U33A 2VURA 2WNWA 5TD4A 2XWEA 4DWSA 1QI5A 5BXSA 4JHZA 3TP4A 2BFGA 1BVZA 1UWTA 1CLVA 3U5YA 3WQWA 4NRRA 4D6IA 3WFLA 4P7RA 1OD8A 1B3ZA 3AYRA 1BHGA 4Z2HA 4UFKA 4OBSA 1UA7A 1W91A 3VNZA 1R86A 4PMOA 4W5UA 4HZ7A 3RJYA 1H0IA 4U31A 4P7QA 2WLYA 2WLZA 1D2KA 4IPLA 1C7TA 3UERA 5C70A 4CCEA 3AIRA 3OGSA 2XYLA 3ARRA 3UCQA 5FL0A 2J7CA 4PMYA 4XV0A 3PZMA 3BLPX 2VNCA 1E70M 2XIIA 1ISWA 2GJPA 3ARXA 2HVMA 4DUXA 3VMOA 4D6DA 4HZ6A 1JYWA 4IPNB 1V03A 1WB0A 5BRPA 4ATLA 1EQCA 4UQCA 4U3AA 1EDTA 1GONA 2A3AA 4JFSA 2ZUTA 1LL6A 4XUYA 1E1FA 3EDJA 1TR1A 2X8RA 2VO5A 3J7HA 4MJ2A 3LPGA 2XM1A 3AISA 3FXYA 3VMPA 1WDQA 1TUXA 4NF7A 4P7NA 3WD0A 4UZSA 5FD0A 3RM4A 3CZJA 4C7GA 1H3GA 1XH2A 4CU8A 5IFPA 3MANA 1JGIA 2UY3A 4AZGA 1B90A 1UD6A 3WH7A 1JZ4A 1QNSA 3SUTA 3WF4A 2QLYA 1JZ8A 3UR8A 2J77A 1DWFM 1OIFA 2TAAA 1JYXA 4U5KA 5GQBA 1W1YA 1UH2A 3O9NA 4K68A 2W5FA 3PTMA 2ZOXA 2OSWA 2E8ZA 3CUHA 4H04A 1A3HA 3K8LA 1H0GA 1W1PA 4JCMA 4UTFA 1UD4A 2DT1A 2X0HA 1HVXA 5HNNA 1H41A 7CGTA 4ACZA 3QOKA 1K9EA 1V0NA 1DWJM 1PX4A 5EMYA 1JAEA 4V2XA 4FK9A 1EHNA 1NP2A 2PF0A 3L4XA 2VX5A 4WSJA 3SCRA 1HJSA 3POHA 3MS8A 4A4AA 4OOUA 1QOXA 3WMSA 4UFIA 2D3LA 1V6WA 1KWGA 3ZO9A 3B9DA 4XZBA 2C0HA 2XSAA 1VEPA 3M7SA 4HOZA 2AMGA 1VB9A 1E4LA 3QHNA 3CZLA 5BCAA 1MFVA 3U7VA 1SMAA 3BC9A 4L4OA 1FHDA 4ZFMA 3DECA 2D22A 2NT1A 3W29A 5C71A 2VX6A 4AMCA 2XFRA 2E8YA 2D0GA 4MB5A 1LL7A 3SCWA 1FFRA 4OZOA 1K9TA 1E4NA 5I79A 4BQ5A 2DSKA 5DO8A 2JF6A 2J75A 4A3HA 5E0CA 4CVUA 1ISXA 2B31A 3WL0A 2WCSA 3M6DA 2DPEA 2RGMA 4IUGA 3AZRA 3T2OA 4GZEA 3MMUA 4W88A 4ZXOA 3HN3A 3VVGA 1OSEA 4TUFA 1PJ9A 4ZENA 4PMRA 1C8XA 3NSNA 5ABHA 1QHOA 1PX8A 1WDRA 5FIPA 2D0HA 4UQAA 1GOOA 3ZJ6A 1VJZA 3AZTA 3EDDA 4M24A 3WKZA 5A69A 4CN4A 1E9LA 5CSUA 1FP9A 3APGA 2XVNA 4DWSD 2GUYA 3OLDA 2BY1A 1UG6A 2F2HA 3L4WA 1J9YA 2CBIA 5A2AA 2XPKA 2EPNA 4URIA 1Q6EA 4LX4A 1MQRA 2BXYA 2WYSA 5HDRA 2GDVA 2WAGA 2VZOA 3OIHA 4TVCA 5M5DA 1LQ0A 3WNKA 4KRUA 5DT5A 3O2LA 3CTTA 4UQDA 4C91A 4AW7A 5CPQA 5HPOA 3AMKA 4MAVA 3ZR6A 1KR1A 2XUCA 4N42A 1HP5A 1EIBA 5E70A 5KEZA 1V3KA 2CNCA 1JNDA 3FNDA 5E6ZA 4RE4A 4AXNA 2WZEA 4IM4A 2W67A 2VVNA 4LPCA 1QNRA 3EDEA 3K4DA 1H49A 3AHTA 2CYGA 1J0YA 5JIWA 1W32A 3K1DA 3WENA 5A6MA 8CGTA 3JUGA 2OWCA 1V3MA 4ATWA 4D72A 1HL8A 1E6ZA 1JI2A 3W6MA 1CZ1A 3ARWA 4X9YA 3CUFA 4Z2KA 1ZBCA 1UYQA 1W9UA 4BZYA 2WCAA 4GI6A 7A3HA 2VQTA 2A3HA 2JE8A 2YLLA 1CGXA 3NDYA 4U2YA 5ABFA 1QBAA 4MB1A 1C7SA 1XGZA 2YL9A 1CGYA 4QCFA 3EDKA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1DWI M;  3RME A;  3GBE A;  2DT0 A;  3QHM A;  3DHP A;  1UD5 A;  2WWD A;  3VIL A;  3W81 A;  4PMU A;  5A6B D;  2EXO A;  2VCB A;  4HA3 A;  3W26 A;  3ARZ A;  4L4P A;  3RJX A;  3RM9 A;  3VD3 A;  4AZ6 A;  1WZK A;  4ACZ B;  1BGA A;  1HKM A;  2J7D A;  4J3T A;  3UET A;  4M56 A;  2WC7 A;  4GZI A;  3I3E A;  2D3N A;  2J7E A;  3NJ3 A;  1UQZ A;  3ZIZ A;  3WUF A;  1GZJ A;  3TTS A;  3T0B A;  4OJY A;  1V08 A;  1ISY A;  1V0K A;  2W63 A;  4Z2I A;  1I1X A;  5DF0 A;  1B9Z A;  3NDZ A;  4JFT A;  1ECE A;  4BQ4 A;  1S46 A;  1DED A;  3NSX A;  4PMQ A;  3AIU A;  2JAL A;  4QCE A;  1PEZ A;  2XIB A;  1AQH A;  5A8M A;  4AIO A;  3K8M A;  3II1 A;  1JDA A;  3WBA A;  1JXJ A;  1O6I A;  4GQR A;  1PAM A;  5JUV A;  2DEP A;  5LA1 A;  1KGX A;  5DEZ A;  1I75 A;  1JIB A;  1XSI A;  3RCN A;  1C3F A;  3LPF A;  1KXT A;  5M3W A;  2O9T A;  4AIS A;  4TTG A;  1SFS A;  1ODZ A;  5JBD A;  3SIM A;  3ART A;  2YL6 A;  1XD0 A;  4J28 A;  1W3L A;  5E0F A;  5FCZ A;  3PTQ A;  4QLK A;  1WZA A;  2D20 A;  3PZU A;  3S6T A;  1HN1 A;  1GQL A;  3LPO A;  2Z1K A; 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