4AIUA

A complex structure of btgh84
Total Genus 226
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
226
sequence length
585
structure length
576
Chain Sequence
SLQPPPQQLIVQNKTIDLPAVYQLNGGEEANPHAVKVLKELLGMLISIGEKGDKSVRKYSRQIPDHKEGYYLSVNEKEIVLAGNDERGTYYALQTFAQLLKDGKLPEVEIKDYPSVRYRGVVEGFYGTPWSHQARLSQLKFYGKNKMNTYIYGPKDDPYHSAPNWRLPYPDKEAAQLQELVAVANENEVDFVWAIHPGQDIKWNKEDRDLLLAKFEKMYQLGVRSFAVFFNDISGEGTNPQKQAELLNYIDEKFAQVKPDINQLVMCPTEYNKSWSNPNGNYLTTLGDKLNPSIQIMWTGDRVISDITRDGISWINERIKRPAYIWWNFPVSDYVRDHLLLGPVYGNDTTIAKEMSGFVTNPMEHAESSKIAIYSVASYAWNPAKYDTWQTWKDAIRTILPSAAEELECFAMHNSDLGPNGHGYRREESMDIQPAAERFLKAFKEGKNYDKADFETLQYTFERMKESADILLMNTENKPLIVEITPWVHQFKLTAEMGEEVLKMVERNESYFLRKYNHVKALQQQMFYIDQTSNQNPYQPGVKTATRVIKPLIDRTFATVVKFFNQKFNAHLDATT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Metabolism of Vertebrate Amino Sugars with N-Glycolyl Groups: Intracellular Beta-O-Linked N-Glycolylglucosamine (Glcngc), Udp-Glcngc, and the Biochemical and Structural Rationale for the Substrate Tolerance of Beta-O-Linked Beta-N-Acetylglucosaminidase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords O-GLCNACASE BT_4395
molecule tags Hydrolase
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
total genus 226
structure length 576
sequence length 585
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2012-02-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
A PF18344 CBM32 Carbohydrate binding module family 32
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 4aiuA03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4aiuA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 4aiuA01
4CU7A 3ARTA 3TONA 4AXNA 4ZFMA 4CVUA 1CXLA 3K4DA 3OBAA 1QVBA 4LYQA 2J62A 2J75A 5HPOA 3POHA 1ZBVA 1VBRA 5IFTA 3CBWA 3VDAA 5DFAA 1R85A 1XCXA 1GJUA 1UR9A 2YL9A 2EQDA 4Z2JA 3GH5A 3NYDA 3MV01 3T2OA 4M81A 4PMRA 1JYXA 1AQHA 3ZR5A 2O9TA 1J0JA 1W9PA 4V27A 4MPKA 3N04A 2C8NA 1CXHA 4Y7EA 2VR5A 1W1YA 3CZKA 3WD3A 4ZXOA 3RO8A 4WKHA 2DT2A 1LJYA 3WNKA 1V02A 1QNSA 2XFFA 4EKJA 5ABEA 2JF7A 3WD1A 1TG7A 1RD6A 1W9VA 1CENA 3NUKA 1VJSA 1WZKA 1GOQA 5DT7A 1RH9A 1B30A 1WAWA 2YLLA 5A2CA 2AAAA 1XCWA 1KR0A 1KQZA 1QNRA 2BXZA 1W2VA 1WB0A 3ALGA 1YHTA 2EJ1A 1R86A 3THDA 3VX0A 3B8SA 5A6JA 4P7OA 4JFTA 4ZE5A 2D24A 3GXFA 1PEZA 2F2HA 3W27A 2Y24A 4HOWA 1H49A 1UH4A 1V0MA 4PTMA 4BQ3A 2WC4A 2VRKA 4R5EA 4CN1A 1E15A 2XSBA 1H11A 4DWSC 1QNOA 1JZ6A 1ODZA 1KXQA 2WLZA 3VKKA 2J4GA 1XYZA 1QNPA 1ITCA 2CPUA 4TOQA 1UD5A 1ISVA 1KGWA 3UETA 4W89A 1E6QM 1HL8A 2YL8A 1DEDA 3WUFA 3CHCA 2W92A 5IHSA 1MW3A 3WF3A 4L4OA 5HXMA 5A6SA 2WK2A 4M56A 1SMDA 2VZTA 1LL6A 3MU7A 1Q6GA 2WZIA 2ZX7A 3WF0A 3ZJ7A 2W62A 3VDCA 4URIA 4AEEA 4MB1A 2FHBA 5AY7A 4H7VA 1UA7A 4D6FA 1E0WA 1FH8A 3EDFA 3WDQA 1HKJA 1UWUA 1KQYA 4HMDA 1B3YA 5E6ZA 3WENA 2VRQA 2WCGA 4PMQA 3GYCA 1JYWA 1OSEA 3MMDA 4KRUA 3CZGA 1BTCA 4P8UA 2X05A 4GI9A 3AIBA 4UQ9A 3POCA 1XD1A 5A69A 3QOKA 1TUXA 1WZLA 2XFYA 3KE0A 3WBAA 1JXJA 2CITA 3NCOA 4V28A 3CUJA 4LPCA 3AS1A 4QCFA 4LGXA 4Z2HA 3BAYA 4QP0A 2FDMA 1R87A 1VFMA 4BA0A 4CCDA 1CXIA 1XC6A 3VGDA 1CLVA 3GH4A 3VMPA 1HP4A 5D9OA 2D22A 2VX7A 3AJ7A 3ZJ8A 2WHLA 3PZUA 4GKLA 1MQPA 1W1VA 4UFJA 2RGLA 3PZOA 2OLHA 1TE1A 4U5IA 3W4RA 2G3JA 5GNYA 2DSWA 4EE9A 2VCCA 3GBDA 3ZOAA 2VZUA 1E3XA 5FKYA 1QW9A 3ARRA 3MUY1 4HA3A 3SCPA 5E6YA 4D6IA 4DUXA 2CESA 3VIPA 2A3EA 4PMZA 3WDHA 4PBGA 3SCNA 4AZGA 2XYLA 1DWHM 3ZT6A 2E0PA 2UY2A 4E8DA 4GI6A 3WL0A 2BV9A 2WHKA 1E6SM 2VNCA 4C7GA 4UZUA 4CD6A 2VCBA 4B15A 4M80A 3PZ9A 4CU6A 3THCA 3TA9A 2DSVA 1HVXA 5GNZA 1ODUA 2OWWA 4FF5A 1WP6A 2QMKA 1B31A 1TMQA 2F8QA 3S6TA 3TTQA 1VF8A 2D23A 2ZUUA 5LYRA 5C70A 1W32A 2XVPA 3L4UA 3E1F1 3A47A 4HTYA 4PUEA 4XUYA 5ABGA 4QLLA 2O9PA 3W6LA 4PN2A 3ZT7A 4E8CA 5HBFA 2WWCA 1UWSA 4EK7A 3U57A 3WDJA 4JFVA 3VIOA 5BXPA 3UESA 3MMUA 3VIFA 1H3GA 5EFFA 4HZ8A 4UQEA 1B0IA 1HJSA 3AHTA 1XH1A 3DYMA 5CLWA 2BS9A 1V6WA 1BVZA 4QCEA 2G3IA 2CBUA 1UR0A 1GQLA 1QBAA 1V03A 2ZXBA 2AMGA 1E43A 4U2ZA 5CGTA 4OBRA 4X0NA 1UQZA 4FLOA 4CVWA 2WVVB 2IXUA 1LWHA 3WKZA 5A8OA 5IFPA 3CZJA 4OKDA 4GXPA 3AOFA 3SURA 3QHNA 1PAMA 4W8LA 3GXMA 4UCFA 2ZUVA 1DTUA 1NWSA 5LA2A 3WH5A 3NIYA 1W9UA 2UY4A 2BY2A 1DWGM 3BMVA 5CPQA 2JE8A 3KEHA 4DUVA 1OWQA 2CKSA 1HX0A 1CTNA 1E6PA 3WSUA 3AXHA 3VM7A 1E71M 3ZQ9A 1MFVA 1KB3A 1E55A 1JYVA 1J0ZA 2V3EA 3PN8A 1PZ3A 4LX4A 2ZUWA 1TVNA 2GJRA 3SCOA 3IJ8A 4J3XA 4AIEA 2DIEA 2YIHA 5A95A 4GQQA 3VD7A 2WXDM 1UKOA 4C7DA 3W53A 1E0XA 4PTWA 1VB9A 4H2CA 1K6AA 4P7RA 2WSKA 4KGJA 4KH2A 4MAVA 4GINA 1EIBA 3EYPA 1TA3B 3O6AA 1ZU8A 4C7FA 2FHCA 5AYBA 4HP5A 4AIOA 3M6DA 5I0DA 2CNCA 4MB3A 3SCVA 3ZSTA 1LWJA 3OG2A 3OGVA 1Q6EA 3WEMA 3VD3A 2DT0A 4U3AA 2D0FA 5AC5A 2DDXA 3U5UA 1VJZA 3PZMA 3AROA 1B90A 4TXEA 3ZO9A 1KR1A 2J7GA 1G9HA 2C7FA 1DHKA 4RE4A 1VEPA 4J3WA 5A8PA 1VEOA 2WBKA 2WYSA 4ZENA 3VD4A 4H8HA 3ARQA 3GXIA 5IDIA 3FAWA 3MANA 4UOQA 1H1NA 2GFTA 2BY0A 1NQ6A 1SFSA 4BQ4A 1GONA 1UKQA 1FHDA 1JDCA 2J7BA 1OIFA 5I24A 1KXTA 4JFSA 2JEPA 1E3ZA 1UQYA 1DWAM 2BHYA 2O92A 3A3HA 3AZTA 3D3AA 5JBFA 3AMGA 1AVAA 8A3HA 1V6UA 4HZ6A 1D2KA 3WNMA 1NWTA 2YOCA 1IT0A 2J77A 3VNYA 1WNOA 1JFXA 4UOJA 4CU8A 1MWOA 1J01A 2Y2WA 5FIPA 3GTNA 4JKKA 3K8LA 2FGLA 5BYWA 3II1A 3LMYA 5CGMA 5GNXA 1NP2A 4UQAA 1OGBA 4J3SA 2DPEA 4F66A 3A4AA 4DWSB 5A8NA 4FK9A 4IISA 2XM1A 1CGTA 4IPNB 2XVLA 3VMNA 1FHLA 4IPLA 2O9OA 4U2YA 1UWIA 4XV0A 1QI2A 3ARSA 1RP9A 5CQ1A 1OGGA 4C91A 1E56A 2ZOXA 3CIVA 4NRRA 1JL8A 4OIFA 1ZJBA 2YDQA 1VENA 3WMCA 5I6SA 4BQ5A 1C91A 3DYOA 2EXOA 4UZSA 3W24A 1BG4A 4JHOA 1MW2A 2YBTA 3PZNA 3SCQA 4AZHA 3FHQA 1UZ4A 4HA1A 4MNKA 2PC8A 3WFZA 4UNIA 2B31A 1BYAA 3KL5A 3LPGA 2J79A 1OM0A 4PMYA 4J3VA 4AD2A 5E0FA 1NWRA 2XVGA 1UKTA 2VI0A 2ZICA 5A1AA 3N18A 3HMCA 4CN6A 2E8YA 1SYTA 1J0YA 3GBEA 1QOXA 5IHRA 3IANA 1B2YA 2VO5A 1E6NA 1UZ1A 1K9TA 5CG0A 1Q4NX 2J7FA 3RJYA 4ATWA 2VCAA 5FD0A 2OYMA 3EDDA 1JGIA 3QR3A 3B9EA 3SUSA 4ATDA 1BG9A 1EOMA 1NOUA 5BRQA 3ZJ6A 5LA1A 1UOKA 2WZHA 3APGA 3AMKA 3CHDA 3PZGA 2ZUTA 2WWDA 2BHZA 4UR9A 2YDRA 3OLGA 1BYDA 3J7HA 2X0HA 1NARA 2NT1A 2XWDA 2YA1A 3OGSA 3W37A 3T09A 1H09A 2CERA 1WPCA 1MQQA 3SUTA 3K1DA 4MB4A 2WC3A 5JIPA 3AYSA 1UWRA 2OSYA 2XFRA 1ZBWA 4W84A 2QHAA 2W4XA 1MYRA 2IUZA 4KMQA 1X1NA 1MW0A 5I5RA 2ZX6A 4JCLA 3D5HA 4D6DA 3T2QA 5HOSA 5DO8A 1EA9C 3MMWA 2VC9A 1GJWA 3N1AA 2J7HA 5FL0A 2CHNA 3ARWA 3GNRA 5TD4A 3BCFA 3VU2A 1SR0A 1UKPA 2J78A 1ISXA 2IXVA 3GNOA 3MO4A 2E9BA 4FMVA 1XHGA 3CTTA 3VX1A 4AZBA 1PPIA 1C90A 1UG6A 5CPSA 4HA4A 4XX6A 3F5LA 3WF1A 3WUEA 1HKIA 3OLEA 4W8BA 3OZPA 4RL3A 4UTFA 3VD9A 1CGXA 4EAMA 2PWHA 3FNDA 1R7AA 4AD5A 1V3MA 2D3NA 4ATLA 1VRXA 4AZ5A 4LYRA 1CLXA 2MANA 4ZXLA 2VZSA 1B3WA 1GW1A 4S3JA 1C7SA 2YLAA 2WNWA 3VNZA 2CEQA 3CUHA 3PZVA 3W6MA 5A6AA 1GOWA 1XD0A 3M7SA 4E2OA 1EOKA 1EH9A 2WC7A 7CGTA 2CIPA 4CCCA 3AISA 4X0VA 9CGTA 4KGLA 1HJWA 2WANA 2NSXA 1HF6A 2GDVA 3SCTA 1TA3A 3IAPA 3VGEA 1A3HA 1EO5A 4ACZA 1JF5A 3NSNA 3VIJA 2BVYA 2CBIA 3UR7A 1J0IA 2WMGA 3AHYA 4UFIA 2ZUSA 3BAJA 3A4WA 4QAWA 3AHZA 1W3KA 5A2AA 4F9DA 1CWYA 1K9FA 4NZCA 1IZKA 3ALFA 4C90A 1OT2A 1B3ZA 1R8LA 2Y8KA 1JIBA 4FLQA 1V3HA 3BGAA 2X0YA 3EDEA 1OBAA 2WW5A 4NRSA 3AMLA 2DT3A 2QMJA 1G0CA 3GDBA 4PCSA 3OA5A 1V0NA 3AXIA 2NT0A 1GPFA 1QHPA 1LG2A 3M07A 1ISWA 3AI0A 3VIMA 4AZIA 3WY1A 1UUQA 2A3CA 1H0IA 4U3CA 3IAQA 3BSGA 3WQ6A 4W87A 3RILA 4B16A 2XIBA 1OB0A 3WH6A 3KL0A 1E4LA 4JAWA 3BH4A 2ZWZA 1U30A 1UWQA 2J7EA 3MV11 2BY3A 1CXKA 1H0GA 3VILA 4CD4A 3RM8A 3VDBA 1GZJA 1JFHA 2GK1B 4H41A 4N42A 2AOSA 3CH9A 2VTFA 3EMZA 3WL1A 2WLYA 2ZE0A 1CDGA 2JIWA 2VR4A 2BVDA 4TX8A 4BCEA 1Z32X 4WIWA 1D3CA 1HJXA 3O9NA 3MUAA 3WMSA 2XWEA 3WH8A 4FLRA 3VGHA 2WMJA 3QOMA 2E40A 3L4VA 2RGMA 4HPHA 2WSPA 3CUGA 1DWJM 4DWSA 4JIEA 4H8VA 5M17A 4JFUA 2Y4SA 4YHGA 2YKKA 5E70A 3CPUA 3WF2A 1E9LA 3TTYA 4GI8A 1BFNA 1J11A 3WIJA 4P8WA 1CBGA 1V6YA 2OSWA 3BMWA 4D1JA 1M03A 2CCRA 4Z2IA 4F8XA 5ABFB 1M04A 4AWEA 2X1IA 1VIWA 3WUBA 1X6NA 4OOUA 1GUVA 4MAZA 1CXEA 3ZM8A 2WPGA 1CIUA 4M8UA 3W29A 6A3HA 2VRJA 2ZWYA 1X6LA 3VTRA 3AZRA 1JZ4A 3TTOA 1E70M 4CN4A 3T08A 1ISYA 3WDIA 1WZMA 3A6OA 2V3GA 2J8FA 2XSAA 4GQRA 4UOZA 2BXYA 5FL1A 5DF0A 2QF8A 1L8NA 3L4XA 4EANA 1OCQA 1C93A 3QGVA 3MSDA 2XM2A 4PMXA 5HDRA 4AZCB 4UQBA 2DQXA 1E6XM 2VX4A 3T2PA 2ESCA 4D6JA 4J7RA 1BVNP 2E8ZA 3AXXA 2GJXB 3I3EA 4M24A 4CCEA 3WEZA 1QPKA 3L4WA 1J12A 1W9BM 1C8XA 3ARPA 4W7UA 5HPCA 4TTUA 1H5VA 5A6LA 5DMYA 1G94A 2G3MA 7A3HA 1J0HA 3W25A 5C71A 1HN1A 1XSIA 3SUWA 2V3FA 1GQJA 1WDQA 5CSYA 3GM8A 1JZ8A 3AS3A 3O2LA 1RPKA 2Q8XA 1JXKA 1C92A 1GOIA 2G8ZA 1CGUA 4M82A 4B9YA 3BAIA 4OBSA 2BFGA 2ZIDA 2VVSA 4IUGA 4PMNA 4UQDA 1UD6A 1KCLA 2DT1A 5M3WA 1JZ7A 4JFWA 2WHJA 4KRTA 1LLOA 2QV4A 1QI0A 1UD4A 1CGWA 3IJ7A 1RP8A 4HPGA 1V08A 1H41A 3UR8A 4M29A 4GO9A 2E3ZA 1JZ3A 1PX3A 3VVGA 3FY1A 4N0RA 1E40A 4MDOA 4MNJA 1QHOA 3GXDA 5A6BA 1ESWA 1EQCA 2VL4A 1C3FA 5CJ5A 1PX4A 1SMAA 4Z2LA 3DYPA 3SCWA 1EO7A 1EHNA 4WSKA 1XYFA 1JD9A 2PB1A 1HP5A 3AFBA 2NW0A 1LQ0A 4PTVA 4A4AA 3MSGA 3A4XA 5A2BA 3CLWA 1E4MM 1KXHA 1Q6DA 4YN5A 3PTQA 4PSRA 1J10A 2EEXA 1V0KA 1E6ZA 3ARUA 3G6MA 2DSKA 3VIGA 5D9MA 2WMHA 3MUIA 2EPMX 5AYIA 1S46A 2WMIB 3WNLA 4DUWA 2ZXAA 4AD4A 2ZX8A 3WDRA 1A47A 1KCKA 1E72M 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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