4AIUA

A complex structure of btgh84
Total Genus 226
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
226
sequence length
585
structure length
576
Chain Sequence
SLQPPPQQLIVQNKTIDLPAVYQLNGGEEANPHAVKVLKELLGMLISIGEKGDKSVRKYSRQIPDHKEGYYLSVNEKEIVLAGNDERGTYYALQTFAQLLKDGKLPEVEIKDYPSVRYRGVVEGFYGTPWSHQARLSQLKFYGKNKMNTYIYGPKDDPYHSAPNWRLPYPDKEAAQLQELVAVANENEVDFVWAIHPGQDIKWNKEDRDLLLAKFEKMYQLGVRSFAVFFNDISGEGTNPQKQAELLNYIDEKFAQVKPDINQLVMCPTEYNKSWSNPNGNYLTTLGDKLNPSIQIMWTGDRVISDITRDGISWINERIKRPAYIWWNFPVSDYVRDHLLLGPVYGNDTTIAKEMSGFVTNPMEHAESSKIAIYSVASYAWNPAKYDTWQTWKDAIRTILPSAAEELECFAMHNSDLGPNGHGYRREESMDIQPAAERFLKAFKEGKNYDKADFETLQYTFERMKESADILLMNTENKPLIVEITPWVHQFKLTAEMGEEVLKMVERNESYFLRKYNHVKALQQQMFYIDQTSNQNPYQPGVKTATRVIKPLIDRTFATVVKFFNQKFNAHLDATT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Metabolism of Vertebrate Amino Sugars with N-Glycolyl Groups: Intracellular Beta-O-Linked N-Glycolylglucosamine (Glcngc), Udp-Glcngc, and the Biochemical and Structural Rationale for the Substrate Tolerance of Beta-O-Linked Beta-N-Acetylglucosaminidase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords O-GLCNACASE BT_4395
molecule tags Hydrolase
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
total genus 226
structure length 576
sequence length 585
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2012-02-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
A PF18344 CBM32 Carbohydrate binding module family 32
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 4aiuA03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4aiuA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 4aiuA01
5A6BD 4DUVA 1E73M 2IUZA 4D72A 4W5ZA 1JYWA 1WO2A 2DT1A 2WC3A 1W1TA 3SCTA 4AZCA 4PCSA 1GVIA 4C91A 4EAMA 1K9EA 4NI3A 4HMDA 4AD5A 1H1NA 1PX3A 1QI5A 4D6IA 5JBDA 1GQJA 1IV8A 7TAAA 5DMYA 3CHEA 4UQBA 1EXPA 1L8NA 4HPGA 2Y4SA 1V02A 1PX8A 2HISA 5LA0A 4D6EA 4W7VA 1LLOA 4XZBA 1WCGA 1BVZA 4AY1A 4CCCA 5IDIA 2W63A 3PTQA 4KGLA 4R27A 4KRTA 3VD5A 4Z2KA 1JFHA 2QPUA 1TA3B 4RE4A 3AS1A 2XIIA 3VD7A 1OM0A 1TZ7A 3RPMA 3T2QA 4URIA 5AC4A 3VVGA 1V3IA 1WZLA 4ACZB 4J3WA 3VM5A 4D6GA 1QW9A 4HZ7A 2YBUA 3LPGA 3LPOA 3FY1A 3GZAA 3WMBA 1VB9A 3WDIA 4QFUA 4JHZA 2ZX7A 1J01A 2ZUNA 1OBAA 2C7FA 4W86A 3RO8A 2V3FA 2XVPA 1B3WA 1EQCA 4DWSC 1UWQA 2O9TA 4S3KA 3N11A 2WLZA 1UD4A 3W0KA 1CWYA 3AROA 2EPMX 3CUIA 3J7HA 4J7RA 2AOSA 1BYCA 3UG4A 1CXHA 2GJXB 1G9HA 1GOKA 1TMQA 1U33A 4OIFA 3A47A 2PWFA 4QLJA 2DGAA 1VEPA 1PIFA 1VEMA 5A2BA 1HKMA 1Q6CA 2XGIA 3SCNA 4MDOA 2ZUUA 1ISVA 3W25A 3FW6A 3KWXA 5EFDA 2PBGA 4OBRA 1OD8A 4PTMA 4PRWA 3SUUA 3PZNA 2WMJA 5BXTA 2W91A 1LWJA 1RD6A 3ZJKA 1E70M 3VGFA 5A94A 3FXYA 3N13A 3VILA 3RIKA 3BSHA 1BPLB 1CDGA 1E3XA 4CU8A 1KCKA 1KXQA 4IM4A 5GNZA 1E6SM 1JZ7A 4Y7EA 2VZSA 3NDYA 4ATWA 1MWOA 4LQ1A 4HA4A 2EO7A 3ARQA 3MSGA 3ZMRA 2QPSA 2XVGA 3VMOA 1AQ0A 1QHZA 1BG4A 1R7OA 3AS3A 1V03A 3HMCA 5F7UA 1CTNA 1NWUA 1J0HA 4CD8A 1E4LA 5CGTA 1P6WA 3AIEA 1E55A 3GXMA 2J8FA 1MW3A 2WMIA 5M3WA 3ARRA 2FGLA 3WMCA 3SUSA 5ECUA 3FAXA 3EDKA 5E9AA 1I75A 3PZQA 3N1AA 1JI1A 4LYRA 1UKTA 2D1ZA 4D6JA 2VX7A 3WKZA 1MYRA 5DT7A 1E6NA 1UR1A 3SCQA 1HJSA 3EDJA 2VOTA 4CU6A 2EXOA 1OB0A 1JDCA 4JIEA 4P8WA 1K9FA 4KMQA 1FHLA 4DM1A 3WQWA 2YA2A 4AD4A 3QHNA 5CJ5A 5IHSA 1GOMA 2HVMA 1B0IA 3VGDA 1LJYA 3DHUA 5A8QA 5TD4A 1JXKA 4F8XA 1HVQA 3T2PA 4A4AA 2OWXA 3CO4A 3OA5A 2BHYA 1EOKA 4JL2A 4WK9A 2ZX6A 1UR2A 2X2YA 1TVPA 1ISZA 3GYCA 3T0DA 2JF6A 2QF8A 3WQ4A 5A69A 1KQYA 4FLRA 3W24A 1GNXA 1LF1A 3OGSA 1EOMA 3CH9A 2GJRA 3F5JA 4ZEPA 5LA2A 3THCA 1WE5A 5CGMA 2X05A 1V6VA 3CHCA 1VRXA 5GNXA 2Q8XA 1ITXA 3UERA 2J7FA 5D8ZA 1E4MM 1E15A 3AIVA 3AJ7A 2YLAA 5A6LA 2A3AA 4AIOA 2CBUA 4GZEA 3WDPP 4X0NA 5FKYA 5FD0A 1QHPA 3AISA 3DECA 3RMEA 2ZXBA 1WDQA 1E6PA 4A3YA 4XV0A 2Y8VA 3K8MA 3WSUA 2E9BA 2CNCA 1R87A 3WF1A 3WUEA 4TTGA 2UY5A 4MDPA 4WIWA 1US2A 1V08A 1MVYA 3F5KA 2G41A 1UD3A 4UFHA 1SFSA 4ZFMA 1VFFA 4FLQA 2WKGA 4HOXA 1ISYA 3OGVA 1XHGA 1JG9A 2VCAA 4EANA 4S3JA 1J18A 5I0DA 1ECEA 4H04A 4U3CA 4WKFA 3T2OA 2O9RA 5BXPA 2BVYA 4U2YA 5HDRA 2W66A 3AIBA 3OZOA 5LA1A 3BAIA 3O2LA 4OOZA 4AIEA 3AOFA 3L2MA 4UQCA 5HXMA 1MQRA 4HMCA 1TUXA 5AYBA 2D24A 4D6CA 3KL0A 3BLKA 1Q6GA 2FHBA 4B15A 1DWJM 1S46A 2ZX5A 2BHZA 1D3CA 2OWCA 1UKSA 1DWIM 1GPFA 2YDQA 2ZIDA 4ATLA 5HPOA 4U5IA 2EPNA 3POCA 1VFUA 4K68A 2FHCA 2XTKA 5M17A 2J79A 4U3AA 2WVVA 3L4ZA 2YDSA 1US3A 3WUFA 2E9LA 3VNYA 1NWTA 3DYMA 3WELA 5HPCA 1PPIA 3BH4A 1DWFM 1OGGA 3ZR5A 3VIGA 5E0CA 4UFLA 3BLPX 2BY2A 3EDEA 3KL3A 3K4AA 2E4TA 4OOUA 5A1AA 1BG9A 2EBNA 1GZJA 3SIMA 2D3NA 4N42A 4J3VA 1MQPA 3K46A 5CXPA 3MO4A 4EKJA 2G3MA 1W3LA 1E4IA 1VF8A 1CNVA 2PB1A 1W3JA 5JBEA 2XFYA 1SR0A 2E8YA 1LL7A 3L2LA 2BY0A 4X0VA 1BAGA 2UWFA 1UH2A 4PEEA 4CN6A 2J62A 2FGZA 4CN1A 2D0FA 4L4PA 4LPCA 1UKQA 1KWGA 4D6DA 1QW8A 1WNOA 3VMPA 1UZ1A 3D3AA 3OBAA 5FOOA 5C8BB 2RGLA 4AZGA 1E9LA 1JZ4A 1NOUA 1CXEA 4R5EA 5DT5A 3RCNA 1BLIA 3RM4A 5A6KA 1B3YA 4W5UA 2G4FA 2DPEA 2BXYA 3ARPA 4YHGA 3PTKA 1W9BM 2ZWYA 5BCAA 3CGTA 1UWSA 2BVTA 3W6MA 1IT0A 1Q6FA 3PZOA 4OZOA 4PYSA 4W87A 4N0RA 1B90A 1VFOA 1V3HA 2CETA 1UR4A 2A3CA 3PZ9A 1V3JA 3A6OA 3EMQA 2NT1A 1XCXA 4M56A 1NARA 2VRKA 3ALGA 3VDCA 4M82A 3RDKA 4GXPA 2CEQA 1MQQA 1DTUA 3GDBA 1UA3A 2WK2A 4OKDA 4W8AA 2DQXA 2YA1A 2BNJA 4KGJA 4UQDA 4DUXA 5JIPA 1JL8A 1MW2A 4PMZA 1WAWA 5D4YA 3THDA 2DH3A 1G94A 2F2HA 2QHAA 3WNLA 1UR0A 4EE9A 1ZBKA 1H49A 3WF3A 1EGZA 3G6LA 1C7SA 2V5CA 1I1XA 4IUGA 2X09A 1IZJA 2WAGA 3WIJA 5A2AA 2WXDM 4TTUA 2DT2A 1W2VA 4JCLA 1QBAA 2WCSA 2PWHA 4ATDA 3L4XA 3AXIA 4AD0A 3GNRA 4DM2A 3L4TA 4YN5A 3WDJA 4AZBA 1H5VA 1E71M 5BYWA 1UYQA 3AHXA 2G3JA 1D7FA 2J74A 3OLDA 3U57A 4PTXA 1HP4A 1WZAA 2GUYA 4TX8A 5CLTA 3M46A 3AYRA 4GPNA 3OLGA 2WNWA 3MKKA 3JUGA 3UEQA 4MADA 3MMUA 3UESA 4P7LA 5ABHA 2CBVA 2GK1A 3CBWA 3TOPA 1JF6A 3K8KA 4GZJA 2CCRA 2X0HA 5E70A 2D0GA 4FMVA 2YL6A 3PZTA 4V27A 3GNPA 3VOCA 4NF7A 1E1FA 3ARTA 4BA0A 4ZXOA 5A2CA 1EDTA 1EHAA 2W92A 1JXJA 2E9MA 4D6HA 3WH6A 9CGTA 2OYLA 4C7GA 3VDBA 1M04A 1B3ZA 3LPFA 2DSZA 1JYNA 3WDQA 1WB0A 2D3LA 3ZT6A 5EMYA 4PMOA 3MSDA 3AHTA 2WCAA 1XRVA 4W8BA 3BXWA 4F9JA 1K6AA 4XUYA 5A8PA 3VUPA 2DT3A 4JL1A 4XX6A 2VRQA 1EDQA 4P8VA 1XSKA 4AEFA 4AZCB 1HVXA 1HL9A 1BTCA 5CPSA 4CCDA 3RILA 2EJ1A 3DHPA 2BHUA 4Z2JA 2CPUA 1E5JA 3VKKA 5BXRA 4AZHA 4M29A 1PJ9A 2DSVA 4V28A 1JFXA 1E6ZA 2CIPA 2CBIA 1CYGA 1PAMA 3TONA 4MPKA 3IK2A 3GBEA 4PMQA 6TAAA 2WZEA 4PBGA 4Z2HA 3SUTA 4JFVA 1GJWA 1HJQA 1EO7A 4CKQA 4C7FA 1V0KA 3WQ8A 1UD5A 3UETA 1NM9A 1DHKA 1TE1A 4LXFA 3GBDA 3BCDA 2ZXDA 3L4UA 4PUEA 4F9DA 1VIWA 2WMHA 2CYGA 3WD4A 5I78A 2VUYA 2VL4A 1FFQA 3POHA 4AISA 1UD8A 2VZUA 1HKIA 4JFSA 1H3GA 1CECA 1CGXA 1J10A 5ABGA 3PTMA 1JZ8A 1QI4A 2CXGA 1QVBA 2VO5A 4PTVA 2DT0A 2EPOA 4UQ9A 1FP8A 7A3HA 4LGXA 5C70A 1UD6A 2D22A 2FHFA 4W7WA 1GW1A 4UOJA 1YQ2A 4WSKA 3VIPA 2Z1SA 3EDDA 2ZUWA 4LYPA 1WZKA 1UWUA 2VMFA 3VIOA 1V3MA 4FF5A 1U2YA 1UR9A 1OT2A 2DIEA 5IFPA 1V6WA 3VD3A 4WLCA 3IANA 1NWRA 3NIYA 3OZPA 3KZSA 3ZT5A 5I77A 4TVUA 1KXVA 4H8HA 1ITCA 1GOOA 3S6TA 1J0YA 1BSIA 3ALFA 3ARYA 1MFUA 1QNRA 4P8UA 3ZR6A 1JD7A 1E0WA 4CN4A 3AHYA 5CG0A 3A4AA 3WDHA 1C7TA 1E0XA 4OJYA 4E2OA 3N9KA 3WF4A 1OGBA 3DYPA 3ZJ8A 3CZ8A 4AC1X 5AYIA 1QOXA 2BV9A 2W61A 3GXIA 1J0JA 1E40A 2ZE0A 4U5KA 3WD1A 2PWDA 3VD9A 4B16A 1FA2A 1JIBA 4CUCA 2D20A 1UG6A 3MUAA 1RP8A 4D1IA 3MV01 1HKKA 1UH3A 3CZJA 4CD5A 4EK7A 4QCEA 3VIMA 4A3HA 2UY2A 4WF7A 1AQHA 4GI8A 4HP5A 1ZU8A 4J3UA 3WNPA 5I3DA 3FHQA 4BF7A 1R85A 3L4VA 3W53A 3U5YA 2VR4A 3IJ8A 3TA9A 4X9YA 4JKLA 1MXGA 5CZKA 2C0HA 2YJQA 2WC4A 1QPKA 1ODUA 4E4PA 1FH9A 5I79A 2WMIB 3N17A 1V6YA 2J7EA 3EBVA 1EQPA 3MS8A 5FL1A 1C93A 3M07A 2CERA 2VNCA 5GQBA 2JEQA 3WL1A 5AC5A 4TX6A 1CGUA 3WEMA 3VGEA 3VIJA 3VO0A 1JZ2A 2BY3A 2VQUA 2J7HA 4ML4A 3M6DA 2WMFA 1AMYA 2JE8A 4PMRA 3AYSA 4CVUA 3AMDA 1KWKA 1PZ2A 2EQDA 2XFRA 2WMGA 2QLYA 2VC9A 3UG5A 3IAPA 4RE2A 4AXNA 5FL0A 5ABFA 3MUIA 1XH0A 2NT0A 4CU7A 3FHAA 3ZJ6A 1EIBA 2J7GA 1WZMA 5LYRA 3WENA 1E56A 4UFJA 1NQ6A 4W88A 3PZUA 3RJXA 5A6MA 1GJUA 3AIRA 5CSYA 4NZCA 4CCEA 5ABFB 5C71A 2NW0A 3AMLA 2V3GA 2XGBA 2WANA 3CUJA 2ZUSA 2JIWA 3WD0A 1ZBCA 4HPHA 3GXFA 3CLWA 1J9YA 1KR0A 2WWCA 3VU2A 1MW0A 3W29A 4D71A 1J0IA 3UR7A 1XD0A 2Y5EA 5A3HA 1NH6A 3WNNA 4AEEA 3IJ9A 3AMKA 3PZMA 1HJWA 1QHOA 3SCSA 1TVNA 1V02E 4W8LA 2WVSA 2CBJA 2Z1KA 3TTQA 4WKHA 4M81A 1M7XA 2E3ZA 4MNLA 3RJYA 4AD3A 2A3BA 1ESWA 1FH7A 3SCUA 1ZJAA 3I3DA 1IZKA 4TUFA 5IFTA 1W3HA 2BXZA 1XYZA 1PIGA 3AHVA 3NDZA 3WDRA 2XVNA 1HT6A 1CBGA 5I23A 2ZXAA 2JFEX 1UKPA 5E0FA 4QP0A 3WF0A 3SCOA 4JZ5A 1E6XM 3VIHA 4ZE4A 3WF2A 1BGAA 2W4XA 2G8ZA 1OINA 4PMVA 1V0MA 1UWIA 5HNNA 3DYOA 1UUQA 3VX1A 1XH2A 4WSJA 3WN6A 2PWGA 1ISXA 2GJPA 2J7DA 2XHYA 2BFGA 1EO5A 1B3XA 3OB8A 3ZJ7A 2CHOA 1C8YA 4BS0A 3CUGA 1V0NA 2WHLA 3CMGA 3GH7A 5CPTA 2WVVB 2WVUA 2YL8A 1BYDA 2WKLA 2Y8KA 2A3EA 3CZEA 5A95A 3UG3A 1LL4A 3NSNA 1Z32X 4YHEA 4B3LA 1NP2A 3MANA 2YDRA 1HNYA 1R86A 1RH9A 1XGZA 5CLWA 1DP0A 1XYFA 3CMJA 1OIFA 4PSPA 5E6ZA 1G01A 5DO8A 3CZGA 3VNZA 1J0ZA 5JIWA 2XFFA 1GQKA 2WC7A 2ZWZA 2BS9A 4GQQA 1X6LA 1W1VA 2V5DA 4CD7A 3WD2A 4HA1A 1JAEA 2XYLA 1UWTA 3EYPA 3D5HA 3W6LA 1FH8A 2J25A 3TTOA 1MFVA 4MB5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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