4AIUA

A complex structure of btgh84
Total Genus 226
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
226
sequence length
585
structure length
576
Chain Sequence
SLQPPPQQLIVQNKTIDLPAVYQLNGGEEANPHAVKVLKELLGMLISIGEKGDKSVRKYSRQIPDHKEGYYLSVNEKEIVLAGNDERGTYYALQTFAQLLKDGKLPEVEIKDYPSVRYRGVVEGFYGTPWSHQARLSQLKFYGKNKMNTYIYGPKDDPYHSAPNWRLPYPDKEAAQLQELVAVANENEVDFVWAIHPGQDIKWNKEDRDLLLAKFEKMYQLGVRSFAVFFNDISGEGTNPQKQAELLNYIDEKFAQVKPDINQLVMCPTEYNKSWSNPNGNYLTTLGDKLNPSIQIMWTGDRVISDITRDGISWINERIKRPAYIWWNFPVSDYVRDHLLLGPVYGNDTTIAKEMSGFVTNPMEHAESSKIAIYSVASYAWNPAKYDTWQTWKDAIRTILPSAAEELECFAMHNSDLGPNGHGYRREESMDIQPAAERFLKAFKEGKNYDKADFETLQYTFERMKESADILLMNTENKPLIVEITPWVHQFKLTAEMGEEVLKMVERNESYFLRKYNHVKALQQQMFYIDQTSNQNPYQPGVKTATRVIKPLIDRTFATVVKFFNQKFNAHLDATT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Metabolism of Vertebrate Amino Sugars with N-Glycolyl Groups: Intracellular Beta-O-Linked N-Glycolylglucosamine (Glcngc), Udp-Glcngc, and the Biochemical and Structural Rationale for the Substrate Tolerance of Beta-O-Linked Beta-N-Acetylglucosaminidase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords O-GLCNACASE BT_4395
molecule tags Hydrolase
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
total genus 226
structure length 576
sequence length 585
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2012-02-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
A PF18344 CBM32 Carbohydrate binding module family 32
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 4aiuA03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4aiuA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 4aiuA01
2JALA 1MW0A 3MUY1 1GHRA 5A95A 1JI1A 2XFFA 3ZT6A 1DWIM 5M03A 3WDJA 3T2PA 2WCGA 5LYRA 2ZXAA 1HJWA 1MFUA 4OUEA 3SCQA 5IFTA 4Z2JA 3A4WA 4JKLA 1BYDA 2OSYA 3FNDA 4TVDA 2CPUA 2W67A 5E6YA 1BGAA 1XYZA 4QAWA 1WNOA 1JZ6A 1I75A 4HU8A 5IDIA 1TCMA 3RMEA 1WDPA 1JD9A 1PZ2A 3AIBA 2YLAA 4W8AA 1B90A 2E9LA 1H0GA 5DFAA 4TX6A 3AMDA 1C90A 2VUYA 4MNJA 4U33A 3AS1A 1BG4A 1DWHM 2J79A 1Q6DA 1X6LA 4XZBA 1VJZA 3OLEA 4AD3A 4D6GA 4ACZB 1X6NA 2CBIA 3OLDA 4MDPA 1JXKA 3N15A 4CN1A 1CYGA 1B1YA 3IJ7A 4PCTA 5AC4A 3F4VA 1M03A 3TONA 3VOCA 2QLYA 5GPRA 3O6AA 1U2YA 1BVZA 5LA1A 2PC8A 2Y8KA 3AS3A 3WSUA 3DHPA 3DYOA 1EQCA 2CERA 1H09A 4N42A 2DH2A 5ABHA 2UY5A 5D9MA 3SCTA 2O9PA 1HL9A 4L4OA 1NP2A 1E4IA 3G6MA 1QHZA 2CNCA 3DC0A 3FAWA 4YN5A 2WMIB 2J7GA 4LQ1A 1MW2A 1JZ4A 4AIOA 3WELA 3SUSA 2G3NA 5E9AA 2CBJA 5D9NA 1NQ6A 3VNYA 2YL8A 1UR1A 2ZUNA 1UG6A 3WFLA 3N9KA 2ZIDA 1MQPA 4OOZA 2W62A 2DPEA 1E1FA 4EANA 2WK2A 3E1F1 5A6SA 1VFOA 3TTQA 4XZWA 1G9HA 2Y24A 4W5ZA 1VRXA 1MW1A 2A3BA 5GQBA 1MW3A 5A8NA 2BXZA 3VD5A 1GQIA 3ARPA 1E4LA 1JI2A 3WDIA 2DT0A 1JZ5A 1JF5A 1TA3A 2WSKA 2CBVA 3CO4A 2AOSA 1M04A 2DSKA 1UQYA 1B9ZA 2GDVA 1UUQA 4BQ5A 1E0XA 4TOQA 3TA9A 3MKKA 1K9EA 1PX8A 3D3AA 1GQKA 1JNEA 3AIRA 1V02E 2WNWA 5A8OA 4GINA 4J27A 3VGFA 6CGTA 4ACYA 3QR3A 4PMRA 3ZR5A 2V3DA 2QF8A 5BCAA 4AISA 4WIWA 5E0FA 1V6XA 1WP6A 2WCAA 2VZSA 4K68A 4MJ4A 3CTTA 5DT5A 4HPGA 1PIGA 4MAZA 4LGXA 1MYRA 1ECEA 4H7VA 4HMEA 2W66A 1AQMA 3AMGA 1OB0A 2PWHA 5FIPA 2AMGA 1G01A 2O9TA 4C91A 4AEEA 3MUZ1 3WDHA 3NJ3A 5A8MA 4U2ZA 1NP0A 3EDFA 3PN8A 1KCLA 3W37A 1WO2A 3WNLA 3KWXA 3MMDA 3GXDA 1ODUA 3BSHA 3TTOA 1W3KA 2FGLA 3VPLA 1GOWA 4UFJA 4HOZA 3POHA 3AIQA 3NSMA 4JFUA 4MDOA 3RO8A 1W9DM 1JAKA 4OZOA 2BVYA 4NZCA 4MB4A 4KRUA 3AIVA 2ZUSA 1E55A 7TAAA 1GQJA 3I3EA 8A3HA 2ZUUA 4CGTA 2BXYA 5FD0A 2YJQA 4JFSA 4KH2A 1CGWA 4PMXA 3BAWA 4CCEA 2XIBA 3ZQ9A 3FW6A 2PB1A 4CD6A 3K4DA 4KGLA 4F66A 5A69A 4ZE4A 4JCMA 4JFVA 3ZSSA 1AMYA 1VF8A 3RM8A 5LA0A 2DQXA 3AZTA 1J0KA 2ZX8A 4MAVA 5EFFA 3WBEA 1VBRA 1CLVA 4GKLA 4U3AA 1W1TA 4W86A 4U2YA 3OIHA 2BHYA 1KXVA 1C7TA 5A6KA 1E9LA 3OZOA 1JL8A 4D72A 3UEQA 2DSWA 2VTFA 1V6UA 4OJYA 1UR0A 4WKAA 1HIZA 3KL5A 5EBAA 2WWCA 2BS9A 1XV8A 1UYQA 4GZJA 4CD4A 2XPKA 3AZRA 2OYLA 1CGXA 4UQDA 2PBGA 6A3HA 1W3LA 1UR9A 3W81A 1JNDA 1BQCA 3WQVA 3MMUA 4WKFA 2QV4A 4JZ5A 3VMNA 4D6IA 1ITXA 5IHRA 2XWEA 2NT0A 3RILA 4M82A 3VDHA 4URIA 1LL6A 4H41A 2W92A 1I1XA 4HZ6A 3L4WA 4UNIA 4UQBA 1B31A 3SIMA 3VGHA 3MU7A 4U5IA 4X0NA 2PI6A 4NSBA 2XM1A 1CLXA 2YA1A 3VD9A 4OBRA 3WBAA 3IK2A 3QOMA 3PZMA 5CLTA 2J7HA 3WD2A 3FHQA 1UD4A 5CQ1A 3PHAA 4KMQA 1GQLA 2JIEA 1ISXA 1ITCA 2EQDA 3HMCA 4CVUA 1E15A 3N13A 1CXKA 3HJEA 1CXFA 1QNPA 1W9PA 3WH8A 3WH5A 4W93A 4UFLA 4HOWA 2FHFA 1JFHA 5DO8A 3SCNA 1VIWA 3WD3A 4PSRA 3AROA 2EPOA 2WMHA 1HNYA 4V27A 2GK1A 4BCEA 1J0HA 1TFVA 1CBGA 1E0WA 1MQQA 3VDBA 5FL0A 4AZ7A 1J0YA 2XHYA 1CWYA 4CD7A 3CMJA 1UD3A 1E1EA 1E5NA 4BZYA 4HA3A 4CU6A 1DWAM 4Q22A 3GNPA 1V3IA 4MB5A 3QHMA 2A3HA 3CUHA 5BXRA 3VGGA 1HP4A 2VR4A 2FHCA 2VOTA 5GNZA 1UD2A 1W9BM 3OLGA 1E6NA 3BAYA 4CU8A 3AI0A 1CXEA 4XX6A 2VX7A 3OB8A 3WQ5A 4JFWA 3VIMA 2WZIA 4MNMA 5GNXA 1K9TA 3VTRA 3WFZA 5AYBA 4E4PA 1JD7A 4UQEA 2F2HA 2ZUVA 4WF7A 2BFGA 1PJ9A 2XSAA 4IUGA 4W7VA 4GI6A 4P7NA 3BCFA 3PTQA 2XVPA 4PEEA 5F7UA 1E70M 2DSVA 3CZEA 4TTUA 2BHUA 1BSIA 3ZR6A 4PRWA 1PPIA 2J7CA 1UKOA 1J10A 3AIEA 3K8KA 1IZKA 1ZJAA 1SMDA 3W6LA 2GDUA 4DUXA 2NW0A 5I77A 3B8SA 4HMCA 4E8CA 5CPTA 1UQZA 1CXLA 3LPFA 1BHGA 2ZX9A 4AWEA 4D6FA 4PUEA 1TR1A 4WJXA 2ZUTA 4Z2GA 1JGIA 3MSDA 1WZKA 1UA3A 1JFXA 1VEPA 4JAWA 1W1PA 3DECA 1HKIA 3WUBA 1HVXA 3ZT7A 4PN2A 2WKGA 2VI0A 3VIGA 1JIBA 4A3HA 1KXQA 5CG0A 4ZFMA 4P7QA 1EDGA 1JYVA 3A47A 3NIYA 1FFRA 4D6EA 2WC7A 1TVNA 1HXJA 1D2KA 4PMDA 3VX1A 4Z2LA 2VZUA 5HXMA 4MB1A 3N04A 4GPNA 1YHTA 1FP9A 1L8NA 1TA3B 1B3YA 3OG2A 5CGMA 1BF2A 3WN6A 2CHOA 3AHVA 3VX0A 3CZKA 5BXSA 3VGEA 1LG2A 4AZGA 1QHOA 1E6RA 3AOFA 2BV9A 1W32A 3BXWA 2PWEA 3AYSA 1NOUA 3EDJA 5A6MA 2X0YA 3AMLA 1I1WA 2VC9A 3L2MA 3PZ9A 1GW1A 1B3WA 2J4GA 3DYPA 1H5VA 1CIUA 1LF1A 3UCQA 1PX3A 4AZHA 1E71M 3K4AA 2DGAA 3N18A 2YDSA 3PBGA 2DSZA 1TG7A 4GIAA 3O2LA 2WXDM 3MV01 2FGZA 3CZ8A 4LYQA 3K1DA 3A3HA 3VIFA 4PMYA 2J7EA 1AQ0A 3U7BA 2D3NA 1RH9A 2UWFA 1QHPA 2FH6A 1NWSA 5D9PA 2EPMX 4GQQA 3VM7A 3NUKA 3VM5A 2XM2A 4IM4A 1FH7A 2YOCA 3SUVA 5A8PA 3M7SA 2ZUMA 1ESWA 3N12A 3MSGA 1BGGA 1E6PA 1GCYA 4W7WA 4UFHA 1GOQA 3W82A 1TMQA 1L0PA 5EMYA 4PMNA 5A6LA 2YA0A 5A8QA 4RE3A 3WMCA 1B3VA 2EPNA 1UZ1A 1S46A 4P7LA 1QNRA 4AW7A 1VJSA 1K6AA 1JDAA 2ZX5A 3S6TA 2YBUA 5JBFA 2XYLA 2WHJA 3EMCA 5JUVA 3MUAA 2EPKX 2VZOA 4RL3A 2J7BA 3WQWA 2B31A 2BY2A 1QI0A 1WZLA 1WPCA 4OIFA 4M29A 2D24A 1PZ3A 1WDQA 1E72M 1ISWA 4A3YA 4GO8A 2G3IA 3MANA 2CIPA 1WAWA 1QNOA 3NDZA 3T2OA 1V3JA 4HTYA 4WLCA 2BY3A 3LPOA 1J9YA 1KWKA 1V3MA 2WMJA 2AAAA 2IXUA 2GJPA 3LMYA 1N82A 1HJVA 1W9UA 3I3BA 4F79A 1H49A 1C8QA 1HKMA 2QMJA 5A6JA 1BAGA 1J12A 2YLLA 4MTVA 5I78A 1QI5A 3BGAA 3L4VA 5HPCA 3ZSTA 4B15A 4EAMA 3GXMA 1F4HA 1K9FA 4E8DA 4DWSC 5M17A 2ZICA 3PZNA 1KBKA 3PZOA 1QNSA 3WEMA 3PZGA 3BAJA 4EKJA 4XUYA 3NSXA 3TP4A 3AISA 2WHLA 1J0JA 2XTKA 4AY1A 5IXEA 2YL5A 2XG9A 1ISZA 4ATWA 1UR2A 1KB3A 1V02A 1EH9A 3F5JA 1ZU8A 2J75A 1VFUA 1IV8A 1UD8A 2C8NA 3ARVA 2V5DA 1TVPA 2WB5A 2W91A 4ZXLA 1UWIA 1TZ7A 4UZUA 1KQYA 1LWHA 3T0BA 2W63A 4LPCA 1E40A 2OSWA 1G0CA 4CU7A 4PMOA 1W91A 3WF0A 4FLQA 4D6HA 5DEZA 2WC4A 3WNKA 1XH0A 2WCSA 1JYNA 3UETA 2EBNA 3VIJA 3MS8A 3OGVA 4HU0A 2VR5A 3SCPA 3BCDA 1FH8A 1OD0A 1R7OA 2WLZA 4ATLA 4LYPA 1KXTA 7A3HA 4MNLA 4AEFA 1NWUA 3VNZA 3VMPA 4W7UA 1ZBVA 1E4MM 3ZJ6A 1QVBA 3FN9A 2GVYA 5AYIA 3WF2A 2JEPA 1F4AA 4UOQA 3EDDA 4P8XA 3L4XA 1UWRA 2GK1B 1JZ7A 1XHGA 1Y7VA 1LWJA 1XSJA 3M07A 5C71A 7CGTA 3UR8A 1V3LA 2E8YA 5BROA 2XVKA 3BH4A 2X05A 3AS2A 4GZEA 3OGSA 1DWGM 2ZXBA 3MMWA 1OCQA 2VNCA 3WENA 1R85A 5EB8A 5BWFA 4AIEA 4JL1A 2O9RA 4CVWA 3U5UA 1CGTA 2VX5A 3HN3A 2D1ZA 5ABGA 1EHAA 2CEQA 2JEQA 1DTUA 4S3KA 1Z32X 1NWTA 1ODZA 3PZUA 3J7HA 3ALFA 4AD1A 4QLLA 4C7GA 4CD8A 3CGTA 1QW8A 1BVNP 3SCOA 1W9VA 2JFEX 4KGJA 3WKZA 1H3GA 1UWUA 3IANA 2V5CA 4WSJA 4QLJA 1VBUA 1FFQA 3U7VA 1EHNA 1DWJM 1GHSA 3RM9A 4B3LA 5I3DA 2WZHA 1V3KA 3W27A 2X1IA 1J01A 2RGMA 3ARZA 1GZJA 2ESCA 1KFWA 1E3ZA 2XFYA 5BXTA 1C93A 3GNRA 5HNNA 1JZ3A 3CHDA 4M24A 3WEOA 3GBDA 2VO5A 5FCZA 2VZVA 3BAIA 1BYAA 4CN6A 5ABFA 3NCOA 3N17A 4GZIA 1W1YA 1V6YA 1GVYA 2Y5EA 3BAXA 2CITA 2OLHA 4CN4A 1KBBA 4QLKA 3EBVA 2G4FA 5M3WA 2J25A 3W24A 4MB3A 1HJUA 1DP0A 1NARA 2WC3A 3ALGA 3VMOA 3L4YA 5BYWA 3SEPA 1E5JA 3B9DA 1E6XM 1V0MA 3CBWA 1MQRA 3AFBA 2YIHA 4M80A 4B3KA 3CZLA 2F61A 3IAPA 2WLYA 1OM0A 2UY3A 2XVNA 1C7SA 1NOWA 3T0AA 3BAKA 3CZGA 1KXHA 2Z1KA 3JUGA 1XGZA 1XD1A 5AY7A 3UESA 3WEZA 1O7AA 2D2OA 3OBAA 4W8LA 2CKRA 4YPJA 2PBOA 2G41A 1U33A 2PWGA 4PTXA 4FLSA 5DMYA 2O9OA 2XSBA 4Z2IA 2YKKA 3CUIA 3PTMA 2QHAA 1GONA 2V3FA 3HU7A 4Q7NA 3ARUA 1QOXA 2WAGA 3A4XA 2E9MA 3K8MA 4J3XA 1TUXA 3ARRA 4BA0A 1SYTA 3VIIA 1LL4A 5D8WA 1IZJA 2WHMA 4EK7A 4CUCA 3S2CA 2J78A 4F8XA 2MANA 1FHLA 2XFRA 3BC9A 3PZVA 5CPSA 3W53A 1JYWA 4MADA 1MXGA 1B3XA 5FKYA 4MNKA 2PWFA 4D71A 2EPLX 4UQCA 1E6ZA 4PYSA 4M81A 5JIPA 5A1AA 5ABEA 5AC5A 4D6JA 5JBEA 3ARYA 1HKKA 3ARXA 3EMQA 2HVMA 5I5RA 2E0PA 3VD4A 3TOPA 1H2JA 1XD0A 1VB9A 2X0HA 1K9DA 4JHOA 4DWSD 4ZENA 5CSUA 1CXIA 4JFTA 1FHDA 9CGTA 3KEHA 1A3HA 3VINA 4J3UA 3GDBA 2BVDA 1A47A 1US2A 1TE1A 3ZIZA 4LYRA 1EA9C 3CHCA 4R27A 3CUFA 3GBEA 2WVSA 3K46A 4QDMA 4WK9A 3ZM8A 4JKMA 1W3JA 3QOKA 4AZCA 4KRTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 2JAL A;  1MW0 A;  3MUY 1;  1GHR A;  5A95 A;  1JI1 A;  2XFF A;  3ZT6 A;  1DWI M;  5M03 A;  3WDJ A;  3T2P A;  2WCG A;  5LYR A;  2ZXA A;  1HJW A;  1MFU A;  4OUE A;  3SCQ A;  5IFT A;  4Z2J A;  3A4W A;  4JKL A;  1BYD A;  2OSY A;  3FND A;  4TVD A;  2CPU A;  2W67 A;  5E6Y A;  1BGA A;  1XYZ A;  4QAW A;  1WNO A;  1JZ6 A;  1I75 A;  4HU8 A;  5IDI A;  1TCM A;  3RME A;  1WDP A;  1JD9 A;  1PZ2 A;  3AIB A;  2YLA A;  4W8A A;  1B90 A;  2E9L A;  1H0G A;  5DFA A;  4TX6 A;  3AMD A;  1C90 A;  2VUY A;  4MNJ A;  4U33 A;  3AS1 A;  1BG4 A;  1DWH M;  2J79 A;  1Q6D A;  1X6L A;  4XZB A;  1VJZ A;  3OLE A;  4AD3 A;  4D6G A;  4ACZ B;  1X6N A;  2CBI A;  3OLD A;  4MDP A;  1JXK A;  3N15 A;  4CN1 A;  1CYG A;  1B1Y A;  3IJ7 A;  4PCT A;  5AC4 A;  3F4V A;  1M03 A;  3TON A;  3VOC A;  2QLY A;  5GPR A;  3O6A A;  1U2Y A;  1BVZ A;  5LA1 A;  2PC8 A;  2Y8K A;  3AS3 A;  3WSU A;  3DHP A;  3DYO A;  1EQC A;  2CER A;  1H09 A;  4N42 A;  2DH2 A;  5ABH A;  2UY5 A;  5D9M A;  3SCT A;  2O9P A;  1HL9 A;  4L4O A;  1NP2 A;  1E4I A;  3G6M A;  1QHZ A; 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