4AIUA

A complex structure of btgh84
Total Genus 226
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
226
sequence length
585
structure length
576
Chain Sequence
SLQPPPQQLIVQNKTIDLPAVYQLNGGEEANPHAVKVLKELLGMLISIGEKGDKSVRKYSRQIPDHKEGYYLSVNEKEIVLAGNDERGTYYALQTFAQLLKDGKLPEVEIKDYPSVRYRGVVEGFYGTPWSHQARLSQLKFYGKNKMNTYIYGPKDDPYHSAPNWRLPYPDKEAAQLQELVAVANENEVDFVWAIHPGQDIKWNKEDRDLLLAKFEKMYQLGVRSFAVFFNDISGEGTNPQKQAELLNYIDEKFAQVKPDINQLVMCPTEYNKSWSNPNGNYLTTLGDKLNPSIQIMWTGDRVISDITRDGISWINERIKRPAYIWWNFPVSDYVRDHLLLGPVYGNDTTIAKEMSGFVTNPMEHAESSKIAIYSVASYAWNPAKYDTWQTWKDAIRTILPSAAEELECFAMHNSDLGPNGHGYRREESMDIQPAAERFLKAFKEGKNYDKADFETLQYTFERMKESADILLMNTENKPLIVEITPWVHQFKLTAEMGEEVLKMVERNESYFLRKYNHVKALQQQMFYIDQTSNQNPYQPGVKTATRVIKPLIDRTFATVVKFFNQKFNAHLDATT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Metabolism of Vertebrate Amino Sugars with N-Glycolyl Groups: Intracellular Beta-O-Linked N-Glycolylglucosamine (Glcngc), Udp-Glcngc, and the Biochemical and Structural Rationale for the Substrate Tolerance of Beta-O-Linked Beta-N-Acetylglucosaminidase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords O-GLCNACASE BT_4395
molecule tags Hydrolase
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
total genus 226
structure length 576
sequence length 585
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2012-02-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
A PF18344 CBM32 Carbohydrate binding module family 32
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 4aiuA03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4aiuA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 4aiuA01
2CBUA 4JFTA 1NM9A 4PN2A 1CXFA 4YHGA 4IPLA 3I3EA 1VIWA 2CBJA 3GXMA 1NARA 4JFVA 3ZO9A 3S2CA 3T0BA 1V0MA 1JZ5A 1ZL1A 6TAAA 5A8OA 2XTKA 5CJ5A 4PUEA 5I23A 2YDQA 3S6TA 1S46A 2JIEA 3WQWA 2EO7A 2XG9A 3WH5A 2WCAA 4PSRA 1JZ3A 1GVIA 1OT2A 3L2MA 3THDA 1UUQA 2OSWA 2BY2A 3VU2A 3AMGA 1WPCA 1EQCA 1C8YA 4GQRA 3WUBA 3O6AA 4LXFA 5A6BA 1K9TA 3GTNA 3MV11 4CU6A 3VKKA 4WKFA 4WJXA 3ARRA 5ECUA 4AEEA 3FHQA 3SUTA 4M81A 1ZJAA 3WD0A 1XGZA 1B3VA 1AMYA 4X9YA 3EMZA 1LLOA 4TVCA 2DDXA 1XRVA 2J25A 3ZJ6A 2Q8XA 1QNOA 2J47A 1UR4A 2BHUA 4W85A 5A1AA 2WMJA 3N12A 2WNWA 4J3VA 1HXJA 2VTFA 4D6CA 4UZSA 1W9UA 3A4AA 4TUFA 1FP8A 2FDMA 3FY1A 1J01A 1XSJA 3CUHA 3SUWA 2W91A 1TMQA 1V3HA 3RIKA 4R5EA 1UQZA 3MV01 2VZOA 3GYCA 2WLYA 1JXKA 2GFTA 4JCLA 2D3LA 2WKLA 2WMGA 2D23A 3MUIA 2VI0A 3VVGA 3BAKA 3AMDA 5JBEA 2XGIA 1BG4A 1OGGA 3AIVA 3BCDA 1BVNP 2WC7A 4PTVA 2BY0A 3PZTA 3SCQA 1E1EA 3VILA 3QGVA 2UY5A 1TZ7A 1ECEA 3CMJA 1E9LA 2MANA 1Y7VA 1WZLA 1QI3A 4CU8A 1HJQA 2QLYA 2J78A 3CHDA 4DWSD 2O9OA 4IM4A 4CD8A 1X6NA 4JKMA 4MNKA 3UESA 2FHBA 2ZWZA 1BF2A 1LF1A 5A6LA 3T09A 5HPOA 1JIBA 1NP0A 2VO5A 1ODUA 2RGLA 3AROA 3OA5A 4P8XA 3RCNA 1VBUA 4MB3A 4ZXLA 2BVTA 2WVUA 1M53A 2WSKA 1CLXA 2FHCA 1XCXA 1UWSA 1JI1A 2ZUMA 1QVBA 4OBSA 1UKQA 2QMJA 2D2OA 2VT0A 3VNZA 1KGWA 4FK9A 3WMSA 3OLEA 4U2YA 1EIBA 2WSPA 4UQDA 2J7EA 5A8QA 1TE1A 2EJ1A 4GI9A 3ARSA 5E6ZA 4BQ3A 1VJSA 1W91A 1R7AA 3CH9A 3SURA 2GJXA 4UQ9A 3DYMA 5D4YA 5M5DA 5D9PA 3VX0A 4DUWA 4N0RA 1XYFA 4UOQA 5DT7A 3IAQA 2FH8A 2X0YA 3N11A 1Q6FA 4LX4A 4B15A 1O6IA 2IXUA 3RM8A 5BRPA 2Z1SA 3UCQA 5M03A 1VAHA 3MMUA 5GPRA 1HJUA 1DWJM 3QOMA 5BWFA 3RM9A 1JZ6A 5CLTA 2E40A 5M17A 3WMBA 3RJXA 4GZEA 4PUDA 4LQ1A 2CNCA 3WEMA 1W9DM 4KWUA 1ZBVA 3N04A 3VIMA 2BY1A 2DEPA 3UG3A 3SEPA 1CECA 1W2VA 1W3HA 1VEPA 3PZGA 4DUVA 5FD0A 1ODZA 3U57A 3CHEA 3PZMA 3EDDA 3OLGA 1KR1A 1C90A 1E40A 3WBAA 3SCUA 3DYOA 4CU7A 3RO8A 1B3WA 3MUZ1 1OWQA 1WE5A 4CD6A 2GK1A 1U30A 1PPIA 2WVTA 2V38A 2G4FA 1E5NA 1Q6EA 3U7VA 4ZFMA 3QOKA 1FFRA 1F4AA 2FHFA 3PZOA 1NWUA 2JIWA 1W3LA 1XSIA 4XZBA 1C93A 4M1RA 3VIPA 1KWKA 2A3HA 2D0FA 2W92A 3WELA 1UKTA 4PMRA 1JYVA 3W53A 5CG0A 2V3FA 2JFEX 4F66A 4HZ8A 3W81A 2DSVA 2J8FA 2YBUA 1G1YA 3EMQA 1DP0A 3WEZA 1R8LA 3ALFA 4W88A 1WZKA 2OSYA 1HKMA 3W37A 3VD4A 4GO8A 3GNOA 3CUIA 4Z2HA 4MB1A 1CGTA 2O9RA 1HP5A 3SCPA 5DO8A 1V3JA 1MWOA 1BVZA 5I5RA 5BXRA 2BHZA 2QHAA 4PMYA 4WIWA 1PX8A 1E70M 1KBKA 2J4GA 4JL1A 3TONA 4KGLA 5FOOA 4HA1A 4WKAA 4D1IA 3MU7A 1DEDA 2F8QA 1BG9A 3F5LA 3WH9A 1D3CA 1FH9A 4AEFA 3CUJA 5DMYA 2XIIA 2YLLA 1HVQA 4UTFA 3GNPA 2E8YA 3LPPA 2J62A 1QW9A 1JXJA 2C0HA 4QLJA 1IZKA 2GJXB 1G0CA 3IJ9A 1ZS2A 1ZJBA 3AQUA 2W61A 3BGAA 5A8MA 4ZE4A 1B9ZA 1MW3A 2VZSA 5CZKA 3VDHA 2ZIDA 4H8HA 1QNSA 2Y8KA 1E1FA 5JIWA 1ISWA 5A2BA 1PIFA 4F9DA 1KCKA 1B30A 4B9ZA 3EDFA 3K8LA 3K8KA 2VNCA 4AD3A 2PWDA 1B90A 2WB5A 1MVYA 3AIUA 3BH4A 3F5JA 2ZUVA 3N1AA 2W66A 5A6SA 2WBGA 4ZEPA 2VQTA 2V5DA 1RD6A 3LPFA 3T2PA 3WDPP 3M7SA 2QV4A 5ABFA 5IHRA 2ZUSA 1OIFA 1KR0A 1L0PA 2A3BA 1OCQA 1CNVA 3T2QA 2QF8A 4W84A 4UR9A 1EGZA 4AD2A 3WH6A 1VEOA 5EMYA 5M3WA 5HOSA 2ZOXA 2ZX7A 1E43A 1DWFM 8CGTA 1V3KA 2WAGA 3II1A 4B9YA 3DC0A 4EK7A 1W1TA 4ACZA 1C92A 1E0VA 3AYSA 2VCBA 3VIHA 1B3ZA 3BSGA 5DT5A 1JAKA 3WDRA 2GK1B 2FGZA 4WKHA 1JI2A 1JNEA 3GM8A 2CCRA 4CVUA 1J12A 1UYQA 3A6OA 3I3BA 5ABHA 4ATDA 4EKJA 6CGTA 2A3CA 4LYQA 3DHUA 5FCZA 3FAWA 2DT3A 1HT6A 2VRQA 4WF7A 2WWDA 3U5YA 1I1XA 4D6DA 2EBNA 4K68A 2J7HA 3OGSA 4JCMA 3WDQA 3WFLA 2GSJA 4KRTA 4GIAA 4WK9A 4UFIA 4W5ZA 4CCDA 1KQZA 3OIHA 3RDKA 1W1PA 2QPSA 2UY4A 3W6LA 1UA7A 3RM4A 4E8DA 2CPUA 1CGYA 3BCFA 3GBEA 4NZCA 1PX4A 1QNPA 2CERA 2UY2A 4N42A 2PB1A 1N82A 1QBBA 4OJYA 1GORA 4JHZA 4V28A 2WANA 3WQ8A 3RMEA 1NQ6A 3GXDA 8A3HA 2DT2A 4M82A 4AZGA 3W28A 3GH4A 3U7BA 3WF3A 3A47A 4JAWA 3EBVA 4PMDA 2DIEA 1CENA 5A6KA 4MAZA 1MFVA 4HU8A 3MSDA 2WZIA 4PBGA 3CZGA 3SCRA 4F8XA 3WF2A 2PBOA 3BAYA 4U2ZA 3WF0A 4GQQA 3GH7A 1V02A 1XH0A 4RE2A 3EDEA 2G3JA 5CPQA 4HA3A 1GOOA 1OD0A 1GNXA 2OYMA 2DSKA 2D0HA 4CN6A 2W4XA 1P6WA 4A3YA 3CMGA 2A3EA 1E6PA 1WO2A 1A47A 5D8WA 4AZIA 4PRWA 1CXIA 4UOZA 2BXZA 1OGBA 3SCWA 1QNRA 5FKYA 3AIEA 1EH9A 1J0YA 4EANA 1EDGA 4XX6A 4H8VA 3AYRA 3VX1A 1J0ZA 2G3IA 4H2CA 4JKKA 1I1WA 3CZLA 1GQLA 1E3XA 4U5IA 3ZT7A 2XM1A 3VUPA 2WLZA 2WMKA 4JKLA 2DQXA 1OGSA 1OSEA 3CLWA 4CN4A 4J3XA 1H0GA 4R27A 4D6GA 4ACZB 3WQ4A 1QPKA 2YDSA 3CGTA 5BROA 5FL1A 2GDVA 3WN6A 4E2OA 1EO5A 1VENA 1XCWA 2Y24A 4OOUA 4W7UA 1E6SM 1PAMA 4KGJA 2WHMA 3SUSA 2WPGA 3CPUA 1H5VA 1W9VA 5E09A 3ZR5A 3QR3A 3AICA 4MDPA 1H09A 1G5AA 3TP4A 4GPNA 4HMCA 1E4IA 3BXWA 4MB5A 2YA0A 3HMCA 2VZUA 3A4WA 1J9YA 1B3YA 3WD4A 2ZUTA 3ALGA 1BYDA 1GZJA 3VD7A 4GKLA 4MJ2A 2XFYA 1V6VA 1CYGA 3BMWA 1V0NA 2PC8A 3AHVA 2F61A 3VIKA 2TAAA 4OOZA 1VB9A 5I79A 3PBGA 1EQPA 1WZMA 1JAEA 4PTXA 1M04A 1GCYA 5KEZA 4C7GA 4L4PA 4QCFA 2Y5EA 2ZE0A 1TR1A 3VIOA 2VMFA 2WC3A 4OKDA 3VO0A 3IANA 1HJVA 4PMOA 3EYPA 1FH8A 1JD9A 4TTUA 3MUY1 4P7LA 1MXGA 2PBGA 1LQ0A 1WB0A 2W62A 1UD8A 2PF0A 4V27A 3UR8A 4AZCB 5CSUA 4J7RA 3GH5A 1BHGA 1EDTA 1UD2A 1US3A 5HDRA 5LYRA 5I2UA 3VMOA 5LA0A 1V6UA 3AXXA 1ISVA 2DT0A 4UQAA 2XGBA 1HF6A 3NSNA 4PCSA 1JDCA 4HPGA 1R86A 4P7OA 2V3EA 1KXHA 1NP2A 3FN9A 3SUUA 2YL9A 3W24A 9CGTA 1JFXA 3AXHA 3GZAA 4GXPA 3HN3A 2C8NA 5HXMA 2HISA 4D6HA 1LG2A 1JG9A 4X0NA 2BNJA 2DPEA 2J7FA 3AIRA 1H2JA 4AD1A 2D1ZA 2VZVA 1QOXA 2ZX9A 3AI0A 4XUYA 2V3DA 2EEXA 4PMUA 1LL6A 1UWIA 1MYRA 1H0IA 2YJQA 2XHYA 4CKQA 1VEMA 3MSGA 3OB8A 4H7VA 1KB3A 1TVNA 2UWFA 1K9EA 1V3IA 1RPKA 1UD4A 2V3GA 4GI6A 1FP9A 3AXIA 1GQKA 4PYSA 4HOZA 5D9OA 3VD9A 1DWHM 1US2A 1E3ZA 4NF7A 4NI3A 4UFLA 2CETA 3WIJA 1BYAA 3CTTA 3MANA 5I0DA 1LL4A 4HU0A 2V5CA 3THCA 3MKKA 1JNDA 1R87A 4U3CA 1Q6CA 4V2XA 2WZEA 1MW1A 1C91A 1MW0A 4UOJA 1W1YA 3TTOA 1J0KA 5A3HA 2OWXA 2CESA 1H4PA 2BFGA 4MAVA 3WL1A 3WFZA 4D6IA 2VX6A 1XD0A 3LPGA 3ZSTA 3MS8A 4ATLA 1LWJA 2BS9A 5HBFA 3L4XA 1BPLB 1KXQA 2VZTA 5AC5A 3AHYA 3ZSSA 5CSYA 4Y7EA 2F2HA 3VTRA 2ZX6A 2WVVA 2VJXA 4TTGA 1H1NA 3L4UA 4DWSC 5HPCA 1UR2A 2CBVA 1IZJA 1BLIA 2WYSA 3L4VA 2E9BA 1J0IA 1R85A 1UWRA 3AS1A 4C90A 2VR4A 2J7CA 4CCEA 5AYBA 1E71M 1GOQA 5CPSA 3O9NA 1GONA 1YQ2A 1RP9A 1MFUA 4JHOA 3IJ7A 1L8NA 1EDQA 1OT1A 3VINA 3HU7A 1E72M 3GXIA 1UH2A 3ECQA 3CBWA 3AHZA 3D3AA 2VCAA 1VRXA 1DHKA 5CGMA 1TA3A 3WDHA 1AQMA 2X09A 1HKKA 2CEQA 7CGTA 1B1YA 1XHGA 4FLOA 1QBAA 1Q6GA 2DH3A 1FA2A 2YLAA 1JL8A 1JF5A 4JFWA 1NOWA 4ZENA 3W29A 5A94A 1FHDA 1OM0A 5IDIA 3RJYA 3ZMRA 3F5KA 2WW5A 1SR0A 2XVGA 3ARWA 4AIUA 3CZ8A 3WY1A 1E6RA 4JFSA 5FIPA 4MNLA 2WKGA 4M80A 4W7VA 3TOPA 3B9EA 1ZB5A 1UD3A 2G8ZA 5IHSA 2J8GA 2ZX8A 1J10A 4M8UA 2CIPA 4CD7A 4P7QA 4HZ6A 1OBAA 1PBGA 1V02E 4P8WA 3MMWA 2A3AA 5AC4A 2PWEA 1HJWA 1HIZA 1BFNA 3ARXA 4TX6A 4D6FA 4HTYA 5LA1A 2CYGA 1HL9A 3VD3A 2EPKX 5IFPA 2VL4A 3AISA 2J79A 3VIGA 3OLIA 1XSKA 2YA2A 3NYDA 1HL8A 2G41A 5D9NA 1HJXA 4Z2LA 1ISYA 2NT1A 1UR0A 1EO7A 1V6XA 1UWQA 4P7RA 1JDAA 2WWCA 1EA9C 3CHFA 4MADA 3RILA 3SCTA 1WKYA 4H41A 1J11A 3AMLA 5A6BD 3VGDA 1UWTA 2WBKA 2DSUA 5BXPA 4CGTA 3U5UA 1W3JA 2AAAA 5CPTA 4JIEA 1W9XA 1UH4A 1UA3A 1AVAA 5I6SA 4IPNB 2WHLA 4DUXA 4AXNA 3AJ7A 3N13A 4BCEA 5I24A 1GOIA 1UR8A 4W86A 1BSIA 4M24A 4FLRA 1UZ1A 2VC9A 1V3MA 3T08A 2NW0A 3OZPA 1GJWA 2DGAA 1VBRA 4IUGA 3ZQ9A 4DWSA 2CXGA 3PZVA 2XJ7A 3K46A 1CDGA 1QI2A 2J74A 1J0HA 1BGAA 4U33A 5AYIA 1SFSA 2ZICA 3J7HA 5FL0A 1TVPA 3HJEA 2XPKA 1VFMA 2X05A 4ACYA 2DH2A 4J3UA 1KFWA 3ARVA 2YBTA 2ZXQA 4J3SA 2XYLA 1CGVA 1QNQA 3BAIA 3CZJA 3M07A 1SYTA 1CXKA 4JFUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 2CBU A;  4JFT A;  1NM9 A;  4PN2 A;  1CXF A;  4YHG A;  4IPL A;  3I3E A;  1VIW A;  2CBJ A;  3GXM A;  1NAR A;  4JFV A;  3ZO9 A;  3S2C A;  3T0B A;  1V0M A;  1JZ5 A;  1ZL1 A;  6TAA A;  5A8O A;  2XTK A;  5CJ5 A;  4PUE A;  5I23 A;  2YDQ A;  3S6T A;  1S46 A;  2JIE A;  3WQW A;  2EO7 A;  2XG9 A;  3WH5 A;  2WCA A;  4PSR A;  1JZ3 A;  1GVI A;  1OT2 A;  3L2M A;  3THD A;  1UUQ A;  2OSW A;  2BY2 A;  3VU2 A;  3AMG A;  1WPC A;  1EQC A;  1C8Y A;  4GQR A;  3WUB A;  3O6A A;  4LXF A;  5A6B A;  1K9T A;  3GTN A;  3MV1 1;  4CU6 A;  3VKK A;  4WKF A;  4WJX A;  3ARR A;  5ECU A;  4AEE A;  3FHQ A;  3SUT A;  4M81 A;  1ZJA A;  3WD0 A;  1XGZ A;  1B3V A;  1AMY A;  4X9Y A;  3EMZ A;  1LLO A;  4TVC A;  2DDX A;  1XRV A;  2J25 A;  3ZJ6 A;  2Q8X A;  1QNO A;  2J47 A;  1UR4 A;  2BHU A;  4W85 A;  5A1A A;  2WMJ A;  3N12 A;  2WNW A;  4J3V A;  1HXJ A;  2VTF A;  4D6C A;  4UZS A;  1W9U A;  3A4A A;  4TUF A;  1FP8 A;  2FDM A;  3FY1 A;  1J01 A;  1XSJ A;  3CUH A;  3SUW A;  2W91 A;  1TMQ A;  1V3H A;  3RIK A;  4R5E A;  1UQZ A;  3MV0 1;  2VZO A; 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