4ZXLA

Cpoga d298n in complex with drosophila hcf -derived thr-o-glcnac peptide
Total Genus 233
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
233
sequence length
579
structure length
579
Chain Sequence
NQVLVPNLNPTPENLEVVGDGFKITSSINLVGEEEADENAVNALREFLTANNIEINSENDPNSTTLIIGEVDDDIPELDEALNGTTAENLKEEGYALVSNDGKIAIEGKDGDGTFYGVQTFKQLVKESNIPEVNITDYPTVSARGIVEGFYGTPWTHQDRLDQIKFYGENKLNTYIYAPKDDPYHREKWREPYPESEMQRMQELINASAENKVDFVFGISPGIDIRFDGDAGEEDFNHLITKAESLYDMGVRSFAIYWDNIQDKSAAKHAQVLNRFNEEFVKAKGDVKPLITVPTEYDTGAMVSNGQPRAYTRIFAETVDPSIEVMWTGPGVVTNEIPLSDAQLISGIYDRNMAVWWNYPVTDYFKGKLALGPMHGLDKGLNQYVDFFTVNPMEHAELSKISIHTAADYSWNMDNYDYDKAWNRAIDMLYGDLAEDMKVFANHSTRMDNKTWAKSGREDAPELRAKMDELWNKLSSKEDASALIEELYGEFARMEEACNNLKANLPEVALEECSRQLDELITLAQGDKASLDMIVAQLNEDTEAYESAKEIAQNKLNTALSSFAVISEKVAQSFIQEAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A mutant O-GlcNAcase as a probe to reveal global dynamics of protein O-GlcNAcylation during Drosophila embryonic development.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase/peptide
source organism Clostridium perfringens (strain atcc 13124 / nctc 8237 / type a)
molecule keywords NAG-PRO-SER-THR-ALA-Thr-O-GlcNAc containing peptide from dro
total genus 233
structure length 579
sequence length 579
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2015-05-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 4zxlA03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4zxlA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 4zxlA01
1WNOA 4MAZA 1HJVA 3BAJA 1PX3A 4OUEA 3UR7A 2DT1A 1ISWA 2VZUA 2WHJA 3FNDA 2VX6A 2WYSA 3VDHA 1W9PA 1M03A 2CETA 2DDXA 3AHYA 3WFLA 4Z2IA 5CSUA 1O7AA 4AZCA 4PN2A 3EDKA 2E9MA 1M04A 3A47A 1UG6A 3LMYA 4PMUA 2GJXA 4AZGA 1ZJAA 6CGTA 3MMUA 3QHOA 3BLPX 4FLQA 1VRXA 5E6YA 1E43A 4GPNA 1WE5A 2F2HA 4P8XA 3WL0A 2Z1SA 1GOOA 3VKKA 3AIWA 1UYQA 1JL8A 1BVNP 1EDQA 2PWGA 4B9ZA 1BGAA 2W63A 2AMGA 1UOKA 1KR1A 2VUYA 2GVYA 1JGIA 1UWTA 1JDCA 1KFWA 3WMSA 4N0RA 5FIPA 4HA1A 4AWEA 3CGTA 2VMFA 1HJUA 1JG9A 4PYSA 1BG4A 2QMJA 2UWFA 5I2UA 4AXNA 4W8LA 3T08A 2CKSA 1C92A 4MB1A 3VIJA 1V6XA 1GOMA 3N04A 1ISVA 3VX0A 1UD5A 4BZYA 2D0FA 3MUAA 3VM5A 3CUIA 3VU2A 4MNMA 1E56A 1OGBA 4B9YA 1CGUA 3B9AA 3WEOA 4AZ6A 4JFTA 3ARWA 1DHKA 2BXYA 1VIWA 5HPOA 2VC9A 5M3WA 4ZE4A 3VIOA 4CN1A 1H41A 3ZIZA 4Z2GA 1GQLA 5CGTA 1TMQA 5A2AA 2D0HA 4CKQA 2V3EA 5I79A 1CXFA 1QNQA 4CU6A 2WANA 1CTNA 1E40A 1W91A 1BSIA 3OA5A 3T0AA 4UFKA 2Y2WA 3WF3A 5I78A 3J7HA 1CYGA 3WF4A 4UFHA 2WPGA 2X09A 2HVMA 1V6YA 2ZUSA 2ZX9A 1MW2A 2X0YA 3GNPA 5IFPA 1JZ6A 4IISA 1KXQA 3T2OA 5FL1A 1E15A 4GQQA 1UR1A 2GJRA 2FHFA 4CD7A 2PWDA 3ARRA 3FXYA 2WWCA 1LF1A 1NP2A 5I3DA 5ABHA 2BXZA 1VFMA 2PBOA 3AIRA 4W86A 3EBVA 5A69A 3WD3A 2J7HA 3L4TA 3VMPA 4H41A 3CO4A 3AS3A 1E4IA 1KXTA 4OIFA 2VJXA 2A3BA 2YBUA 3GTNA 4LYQA 4TX6A 5A2CA 1BHGA 1H5VA 1W1TA 3SURA 1WB0A 2YA2A 1VBRA 4DM2A 2DQXA 2BY1A 4AD4A 1I75A 2VNCA 2ZUUA 5I6SA 2FHCA 2JF6A 2WMHA 3PHAA 3I3BA 2W62A 4WKAA 4JKKA 1CXLA 2J8GA 3AMDA 1UUQA 1E0XA 4ATDA 4S3KA 1CDGA 3PZMA 4URIA 4MDOA 3CUHA 1CNVA 5GNXA 4M82A 5I77A 2C7FA 4B3LA 5E70A 3TTSA 2EXOA 3VMOA 2OYMA 1G9HA 2TAAA 5HDRA 4MNJA 2V38A 2A3HA 2CPUA 4UOQA 1DWHM 1GHSA 4BCEA 3UCQA 2QPSA 4DWSA 3E1F1 3VIFA 4LGXA 1BYDA 1W9VA 2XVGA 1MFVA 2BY0A 3RDKA 1UD4A 5HPCA 1LQ0A 1UQYA 3OZOA 4W85A 3GDBA 2DT2A 3PZTA 4MADA 3WH9A 2WMIA 4UTFA 1D7FA 1D3CA 3ARZA 4D1JA 1VF8A 5CLWA 1JI1A 1HXJA 1E3XA 4V27A 4WIWA 3ARSA 4UZSA 3VD5A 3WBAA 5A1AA 1GHRA 1ZB5A 4AZHA 2XVNA 4IPNB 2XHYA 1NWTA 1X1NA 2YLLA 1GUVA 3HU7A 3ARYA 2WC4A 1JF6A 3G6MA 1PIGA 1UQZA 2W5FA 1OCQA 3WH8A 4D6DA 1R85A 4JFVA 5D9OA 1KBKA 2WCSA 3BAIA 1QW8A 4JFSA 1Q6DA 2W67A 1WZAA 4P8VA 3ARXA 1KGUA 2FGZA 1X6LA 3SCQA 5CSYA 1CXEA 4HZ8A 3BLKA 1OM0A 3N11A 3W6MA 3SCRA 2WVUA 3ARPA 3WD1A 1BAGA 2WK2A 1DWFM 1JZ4A 3PZQA 1GOWA 4J27A 1GNXA 2FGLA 1XV8A 1W9XA 4D71A 1E6ZA 1HX0A 1G0CA 1KGWA 3NIYA 3RMEA 1B3YA 1AQMA 1OINA 1VBUA 2X0HA 2GDUA 2Z1KA 3PZOA 4AIEA 1JXKA 2ESCA 3CPUA 1E5NA 2VZVA 3HMCA 5A6MA 3RJXA 1B1YA 1K6AA 2GK1A 1GQIA 3OLIA 3B9DA 1ZBVA 4EAMA 4CVUA 3BSGA 3WNNA 1CPUA 1TVNA 5BXRA 4IPLA 4PUDA 4OJYA 3W24A 1NOFA 2DH3A 1KXHA 5C8BB 3SCTA 1HJWA 3A3HA 5CPSA 3SCOA 1BVZA 4LPCA 3KL0A 3AHZA 5A94A 1W9UA 2WCGA 1TR1A 2J7FA 4J3SA 2UY5A 2OSWA 3WF2A 3EDJA 2OWXA 3GXMA 5JIWA 5CGMA 1B3VA 3W81A 1VEPA 4P8UA 4HPHA 4TVDA 3ZSTA 5CG0A 5JIPA 3AHVA 5ABFB 3W37A 2J25A 4AY1A 2XFYA 1OWQA 2VCBA 2J7CA 4CN6A 5LA2A 4EE9A 2QV4A 3W38A 3ALFA 1MW0A 2EPNA 1FP8A 1GOQA 1KCLA 4FLSA 3ZJKA 2J7BA 1H49A 2J79A 2J7GA 4JL1A 1E6NA 2NT0A 4WSJA 1HVQA 2G3NA 1SMDA 1BYCA 1ECEA 4TVCA 1HL9A 2Y8KA 3ZSSA 1PIFA 2BHZA 3NSMA 1EO7A 3L4XA 1UKSA 3PTKA 2PB1A 2DPEA 3N15A 3LPGA 4AW7A 2WZHA 5ABEA 4PMDA 1OIFA 3PZGA 4F9DA 2XM2A 3EMZA 1OT1A 2VO5A 4X0NA 1JFXA 4D6IA 4LYPA 2BS9A 1NOUA 2VZTA 2VI0A 1I1WA 4U5KA 1TA3B 3OLEA 2JIWA 1KQYA 2DGAA 4CCEA 3AXXA 4W8AA 2CERA 3BAYA 3VNYA 3AIBA 5JBFA 1QBAA 3G6LA 1GJWA 1WCGA 4F79A 3VTRA 1XRVA 5EBAA 3W0KA 3RILA 2QHAA 3TA9A 4HU8A 1LL7A 3AS1A 3MKKA 1UKOA 3GBEA 3D5HA 2J7EA 3ZQ9A 1W1YA 3NYDA 3VM7A 2VR5A 3ARQA 3VINA 1EIBA 1B31A 4U3AA 3M07A 1KBBA 3VOCA 2XIIA 3GBDA 3VUPA 1VFUA 2VRQA 2B31A 3W53A 1FFQA 4AC1X 3SCNA 1QNSA 1UH2A 3L4YA 5FKYA 3ZM8A 1WDPA 5I5RA 3N12A 3GZAA 1E6XM 1W9DM 3CTTA 1NH6A 5CQ1A 2WLZA 2E0PA 2DH2A 1ITCA 2QMKA 2ZIDA 3NUKA 3W29A 5D9PA 3NDYA 1FH9A 4KWUA 2WM0A 5JUVA 1B9ZA 3ZJ8A 1VFOA 2CIPA 5D8ZA 4GO9A 4JFUA 5HXMA 4IUGA 1DP0A 1WDQA 4W7WA 1PEZA 1UH4A 1XSKA 2CHNA 1AVAA 3GH7A 4H04A 2OSYA 3MS8A 3UETA 1J0KA 1IV8A 3PZVA 5BROA 1Y7VA 1MWOA 3QOKA 1OBAA 3WH7A 1GVIA 3BGAA 2X2YA 2CCRA 5E9AA 4F9JA 1KWKA 3CBWA 2D0GA 3WD2A 4CVWA 1CGTA 1K9DA 2E4TA 1W2VA 1JZ3A 1TUXA 3EDFA 3MUIA 1TG7A 1J01A 2A3AA 1QHOA 1Q6FA 4MB4A 3WEMA 4AIUA 1G94A 2A3EA 2VTFA 4M29A 4C90A 2Y8VA 5I23A 1O6IA 4PTWA 2RGMA 2CITA 1UA7A 3ZR6A 1DEDA 5BCAA 3ARUA 1R87A 3ALGA 1DWIM 5BXSA 1JYNA 1ZBCA 2ZUMA 4C7FA 2G3IA 1UH3A 1R8LA 4W5ZA 4FLOA 2YOCA 4MTVA 3ECQA 4UQCA 3WD4A 3WUGA 1H3GA 2D3NA 3AROA 1VEOA 4W7UA 1GCYA 4GQRA 1OGGA 4M81A 1W1VA 4E2OA 2EPLX 2CYGA 5A6JA 2BFGA 2WSKA 1RP8A 2EBNA 1VJSA 2QLYA 4UQ9A 5A8OA 5I0DA 2WKLA 4NSBA 4OZOA 2CXGA 2XGBA 4KGLA 1E9LA 3PZNA 1GQKA 3TTQA 2JF7A 3MO4A 4QLKA 1QI5A 2WHMA 4PEEA 5EFFA 3POHA 2JE8A 4KMQA 3N1AA 5A8QA 3WFZA 1CGVA 1JFHA 3WNKA 1PZ3A 1BYAA 5EB8A 5BXTA 4D6HA 1HKIA 3WQ6A 3WDQA 2PWFA 4D72A 2ZUWA 1K9TA 4UQAA 3WN6A 2JFEX 3IK2A 3KL3A 1HNYA 4PRWA 2ZUNA 4F66A 5CPTA 3NSXA 3CZGA 1XGZA 4OKDA 4CD4A 2DSZA 3WUBA 4XUYA 1QNPA 1JNDA 3FN9A 1DWGM 4BQ3A 2PWEA 3SCUA 3F5KA 3OGVA 4DWSD 4PCTA 1WP6A 5IXEA 4ZEPA 1XYFA 3T09A 1R86A 1E1FA 1NWRA 1VEMA 1JNEA 1CXHA 4CUCA 3IJ7A 2GDVA 3THDA 2IUZA 1JAKA 1WZKA 1LLOA 3M6DA 4CGTA 3HN3A 3AHXA 3OG2A 5BXPA 4Z2JA 2VX5A 2WBKA 3MSDA 1JYVA 3AFBA 1KGXA 4B3KA 4C7DA 1RP9A 3CIVA 3FW6A 4Q22A 1Q6GA 3UG4A 7TAAA 2O92A 2RGLA 2WC3A 2WNWA 1UWRA 4V2XA 4CU8A 4J3TA 4U3CA 3VGFA 1JXJA 1TZ7A 3W26A 1K9FA 4D6FA 1SR0A 3ARTA 3RCNA 2VVSA 2WHLA 3HJEA 3WD0A 4QFUA 4XZWA 5IHRA 2GSJA 2CEQA 4P7QA 1E55A 2X8RA 3VDCA 2D2OA 3VIGA 1NQ6A 1EGZA 3VIMA 3RM8A 4BF7A 2VRJA 3AOFA 2YDSA 3FHAA 3RM9A 2XJ7A 2Q8XA 3DHUA 4DUVA 2J62A 3WQWA 1MW3A 2J8FA 3TONA 1XH1A 1ITXA 4DM1A 2VZSA 4CN4A 5CPQA 4U2ZA 3T2PA 1V02A 1V0LA 4PTMA 5LYRA 3KL5A 3DYPA 4DUXA 5E0CA 1H0IA 3TTOA 3CUFA 4Y7EA 3ZT6A 1C91A 6TAAA 5HOSA 3BC9A 4HA3A 3ZO9A 3WNMA 4YPJA 4XX6A 4J3WA 2YDQA 3VMNA 1H4PA 3WF1A 4TVUA 5KEZA 1LWJA 2NW0A 1E6PA 3K8MA 4PMQA 4W87A 4OOUA 1JD9A 4HMEA 1GORA 3AS0A 2WZEA 3PTQA 1XD0A 2E9BA 1HN1A 1QBBA 2YLAA 3W82A 1UD3A 2WXDM 5EFDA 3AJ7A 2E8ZA 3CMJA 2ZX7A 2VX4A 3GH5A 4W93A 2VURA 4RE4A 2VVNA 2F8QA 5A95A 3CZJA 1V3MA 1ZL1A 2AAAA 3WQVA 2XYLA 3SIMA 1IT0A 1JIBA 3CHEA 2WAGA 2WMKA 2G3MA 3FAXA 4BS0A 3IANA 4GI9A 4LYRA 1E70M 4KH2A 1E4NA 1NP0A 4UOZA 5EMYA 3OB8A 1FFRA 3AZTA 4A4AA 4RL3A 4CD6A 3WKZA 1EHAA 1DTUA 4KGJA 3AS2A 1V3LA 1V0NA 3GXDA 3W27A 4X9YA 4N42A 3LPOA 2OWWA 1ISXA 4J3VA 4JKLA 2ZXBA 4QP0A 3U7VA 5GNYA 1E0VA 1MQQA 2WVVB 1MVYA 4Q7NA 3AISA 5IDIA 5BRPA 1E6RA 1XD1A 4ZXOA 3BAXA 1MQRA 3CUGA 2FH8A 4E8CA 1R7AA 4H8VA 1G01A 3DYMA 1G5AA 1C8QA 5LA1A 2VR4A 3N18A 2XPKA 3K8LA 3CH9A 2AOSA 3VVGA 1PBGA 2VCAA 3POCA 4UFIA 4V28A 2YL9A 3AYSA 3OGSA 4CCDA 3MV11 2XVPA 3A4XA 3I3EA 3CHFA 3WY1A 4TTUA 1QHPA 4JHOA 4MAVA 4PMNA 2UY2A 1V3HA 1HP4A 4RE2A 3BMWA 2XWDA 1EXPA 1US2A 2J74A 3MMWA 2DSWA 1W2PA 3CHCA 3VDBA 3JUGA 4QDMA 1IZJA 2O9TA 4WF7A 4TXEA 4HOXA 5CLTA 1V02E 1LL6A 5GQBA 3VD4A 1C8XA 1W32A 3BAKA 2CESA 3SEPA 3K1DA 3LPPA 1QOXA 2WVSA 1EA9C 3SUWA 1J0ZA 1VJZA 4HTYA 3O2LA 1UA3A 3WIJA 4M24A 1HKMA 4P7OA 3VIIA 1TVPA 4GKLA 3PZUA 4PTVA 1ZS2A 3ZT5A 3UERA 1EOKA 2IXUA 4TTGA 3L4UA 4M56A 2J77A 2Y4SA 3W6LA 2WHKA 4OBRA 3GNRA 1BPLB 1JI2A 1EHNA 1J9YA 4S3JA 3MV01 3WF0A 3A4WA 2DSKA 1RD6A 4AZ5A 3IAQA 4UOJA 1UKTA 4JAWA 3CZLA 2WLYA 3VGDA 3WMCA 1LG2A 1L0PA 1SMAA 2YDRA 3AYRA 3OZPA 1J11A 5D4YA 3RIKA 5F7UA 2Y5EA 1QHZA 1C3FA 2WSPA 3AIUA 4DWSC 1J0JA 4AEEA 2ZICA 5BWFA 4RE3A 2JALA 3UESA 4PMZA 8A3HA 5BRQA 1W3HA 1CGYA 4GIAA 4MB3A 2XFRA 4TUFA 3IJ8A 1CZ1A 1XH2A 3KEHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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