4ZXLA

Cpoga d298n in complex with drosophila hcf -derived thr-o-glcnac peptide
Total Genus 233
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
233
sequence length
579
structure length
579
Chain Sequence
NQVLVPNLNPTPENLEVVGDGFKITSSINLVGEEEADENAVNALREFLTANNIEINSENDPNSTTLIIGEVDDDIPELDEALNGTTAENLKEEGYALVSNDGKIAIEGKDGDGTFYGVQTFKQLVKESNIPEVNITDYPTVSARGIVEGFYGTPWTHQDRLDQIKFYGENKLNTYIYAPKDDPYHREKWREPYPESEMQRMQELINASAENKVDFVFGISPGIDIRFDGDAGEEDFNHLITKAESLYDMGVRSFAIYWDNIQDKSAAKHAQVLNRFNEEFVKAKGDVKPLITVPTEYDTGAMVSNGQPRAYTRIFAETVDPSIEVMWTGPGVVTNEIPLSDAQLISGIYDRNMAVWWNYPVTDYFKGKLALGPMHGLDKGLNQYVDFFTVNPMEHAELSKISIHTAADYSWNMDNYDYDKAWNRAIDMLYGDLAEDMKVFANHSTRMDNKTWAKSGREDAPELRAKMDELWNKLSSKEDASALIEELYGEFARMEEACNNLKANLPEVALEECSRQLDELITLAQGDKASLDMIVAQLNEDTEAYESAKEIAQNKLNTALSSFAVISEKVAQSFIQEAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title A mutant O-GlcNAcase as a probe to reveal global dynamics of protein O-GlcNAcylation during Drosophila embryonic development.
pubmed doi rcsb
molecule keywords NAG-PRO-SER-THR-ALA-Thr-O-GlcNAc containing peptide from dro
molecule tags Hydrolase/peptide
source organism Clostridium perfringens (strain atcc 13124 / nctc 8237 / type a)
total genus 233
structure length 579
sequence length 579
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2015-05-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 4zxlA03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4zxlA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 4zxlA01
2WVVA 1HNYA 1CGWA 1LLOA 3BLPX 5TD4A 3ZT5A 1QHZA 3TTQA 3B8SA 3BAYA 2VCAA 1CECA 2VZVA 4J27A 3MMUA 1GOMA 3WH9A 3L2LA 2BY2A 3FNDA 4CD7A 3BXWA 2WBKA 4BZYA 3WQ8A 4JCLA 1E0WA 3WN6A 1VENA 3VIOA 3DHUA 3ZT6A 3WKZA 2ZUTA 3PBGA 1RP9A 5AYIA 1W1TA 3ZMRA 5A6LA 5LA1A 3WEMA 3KZSA 1M53A 3FHQA 5CSYA 2YLAA 1J9YA 1I1WA 3N1AA 4PMVA 3CZLA 3UR8A 4AYSA 4B3LA 1OT2A 3OIHA 1UWRA 3GH7A 1VJSA 1B0IA 3HMCA 1GVIA 2QF8A 1K9EA 1X1NA 3GNRA 3BMWA 3AHVA 4AZGA 2F2HA 3MANA 2G3JA 3WEOA 4QAWA 3AS1A 4UOZA 1HIZA 3OLIA 5I2UA 1ZJBA 1HJQA 2XJ7A 3HN3A 3WDPP 1KCKA 4MNJA 4TX6A 4TX8A 4ZXOA 5CGTA 5C71A 3WF0A 3I3DA 1UA7A 1CWYA 1PIGA 2YDQA 3QOKA 3SUVA 3CHFA 1ZU8A 2PBOA 5FL1A 2GJRA 1KWKA 3CBWA 4QFUA 5EMYA 1JZ5A 4TOQA 1IV8A 3ALFA 1HL9A 2JFEX 4N0RA 3RMEA 1NWTA 3PTMA 3AMGA 1LL4A 4FLQA 5DF0A 3CTTA 4XZWA 4S3KA 2QMJA 5DMYA 2ZX8A 1B2YA 3UETA 3WL1A 1GORA 2IUZA 3U5UA 3ARWA 4C7FA 2OSWA 2J75A 1QNPA 2ZWYA 4F79A 4JIEA 3WFZA 1W1VA 2X0YA 1KGXA 2DH2A 4LYRA 4QP0A 3VDBA 4AZBA 2D20A 1XH2A 3SCPA 5A8NA 2W91A 3WF1A 2BY0A 2JIEA 2E9BA 3SCVA 3OZPA 3QHNA 4YHEA 1QBAA 4GI9A 5E0FA 1B3ZA 4M82A 5ABFB 3FAWA 2XWEA 2D23A 2CPUA 2BHYA 3L4UA 5FOOA 4JFTA 2CIPA 2WXDM 2FHCA 3AOFA 1EDGA 4IISA 4QCFA 5E09A 4Z2HA 3B9DA 1MYRA 1XSJA 5LA2A 2GJPA 2O9TA 1NWRA 1XD0A 2WVUA 2XVPA 2NSXA 2CHNA 4OBRA 5IFTA 4HA1A 4MTVA 3IAQA 2ZXAA 1BSIA 3NIYA 5FIPA 2VTFA 2WSKA 2J25A 1JNEA 4F9JA 2X09A 4P7LA 1CYGA 3DYMA 3RIKA 2VCBA 4LYPA 3PN8A 3W25A 2PWGA 1I1XA 4D6IA 1MFUA 1Q6CA 1NP2A 2A3CA 3WNOA 4PMUA 3BCDA 4UFKA 1KCLA 3CGTA 1UH2A 1BGGA 2ESCA 4PN2A 3VDAA 2XTKA 5A8MA 3AIEA 5HPOA 1G5AA 1JI2A 3QHOA 2W66A 2Z1KA 3GXMA 2WMKA 2CHOA 5A8QA 2OWCA 3PZOA 2XSAA 4ML4A 3WD3A 2BNJA 1LWJA 5DO8A 2FDMA 1HKKA 3WSUA 1HP4A 2XFRA 2YL5A 1RP8A 5AC4A 3M7SA 2J7EA 1WPCA 3MUZ1 4P8WA 2YLLA 1MW0A 1R7OA 3CO4A 3W6LA 4ZE4A 3QHMA 3WY1A 5JBDA 2VR4A 1GOWA 1U33A 2VRQA 3BSGA 5A2AA 4GXPA 1KR1A 2XIBA 1AQ0A 1EGZA 1H0IA 3T2QA 1DHKA 5BROA 2WPGA 3VD9A 1Q6GA 1E6NA 2YL9A 3EDFA 2Y4SA 5DEZA 3VDCA 3A47A 4W8LA 4P8VA 2BVTA 2HVMA 1QNSA 3AICA 3NJ3A 1GNXA 2QPSA 3VD3A 1I75A 1C90A 1G1YA 3VGBA 2YBUA 1VFFA 3AS0A 1FFQA 1XV8A 5BXPA 3UCQA 1EO5A 4E8DA 4PSRA 5AYBA 4CCEA 1R87A 4GI6A 4XB3A 2XHYA 3K8LA 5ABEA 4AD4A 1UWSA 3WBAA 5A6KA 1O6IA 4L4OA 1E9LA 2E0PA 5IHRA 3T2PA 3VOCA 4CN6A 2ZXDA 1CENA 4AD2A 2WKGA 1UH4A 4B9ZA 1V0MA 4GPNA 1VAHA 2BFGA 4OOZA 4XUYA 4AEEA 1D2KA 1H4PA 3QOMA 1KXQA 3U5YA 4JHOA 2YOCA 4U3AA 4FLSA 1V0NA 3AXIA 4Z2KA 3ECQA 5I0DA 3G6LA 4UFIA 2XYLA 4CUCA 3LPPA 4UZSA 2GVYA 1CZ1A 1LG2A 2J8FA 2ZXQA 2W92A 1Y7VA 4GZIA 4UFHA 4J3SA 1EA9C 1H3GA 2DIEA 1J0KA 1DEDA 5HXMA 2XFFA 5I77A 4OIFA 2VNCA 2J79A 3AYSA 4DUWA 1YQ2A 7TAAA 4YN5A 4MNKA 4H7VA 4D6GA 1K6AA 3U7BA 1E1EA 3BAXA 1TMQA 3W24A 1A3HA 1C8XA 4D6CA 4PTXA 1P6WA 4PTMA 1E4MM 1MW1A 5GPRA 2PWFA 2ZUMA 4UNIA 1QNOA 3EMCA 1B1YA 1GOKA 3SCOA 2PWHA 3J7HA 2VURA 2YL6A 2VJXA 2BVYA 2WC3A 3A4XA 1VIWA 1QHOA 3ALGA 2WZHA 1HP5A 3MO4A 4ACYA 1JFXA 3I3EA 5EFDA 1OD0A 5DT7A 2DSUA 1E56A 1HT6A 1US3A 2VZUA 1NWUA 2JEQA 4CU6A 1OB0A 4CU7A 3ARQA 1BVNP 1V3LA 2WVSA 2J7HA 4FF5A 3APGA 3F5KA 4CD4A 3CMGA 4W89A 4PEEA 1VFUA 3WENA 4LXFA 5CPSA 4JAWA 2CBVA 1K9TA 4JFSA 5JIPA 3AS2A 3VD4A 4B16A 5A6JA 3MSDA 4URIA 1E6QM 1W1YA 4CCCA 2DH3A 4P7QA 2BHUA 2WVVB 1TE1A 1W9BM 4UFLA 5GNXA 1JD9A 2EO7A 1GHSA 1V6VA 4XV0A 1IZKA 2CETA 4NI3A 2X1IA 1JD7A 1S46A 4ZXLA 1E3XA 1HJXA 4RE4A 1US2A 2VUYA 3PZVA 1J0JA 1JDDA 1EDTA 3KL0A 3THCA 3T09A 3CHDA 4W84A 4AWEA 2ZICA 1W1PA 3MSGA 3IAPA 5I78A 4FLOA 1UKTA 4JKLA 5I23A 3JUGA 1WAWA 3VGDA 3T2OA 1J0ZA 1GW1A 2XM1A 2VVSA 1HN1A 3GDBA 4TTGA 1OWQA 1B9ZA 2WYSA 1C8YA 1JZ4A 1OIFA 7CGTA 5M3WA 4KGJA 1K9FA 3II1A 3AMKA 2ZWZA 1CXIA 3MS8A 2Y2WA 2GSJA 4GIAA 3F4VA 4AZCA 2AAAA 1HKJA 4D6EA 1E0VA 1B3YA 3WQ5A 1HKIA 4GZJA 2VT0A 3VIGA 1BHGA 2BY1A 3VKKA 3VIIA 2DQXA 5BRQA 5HBFA 3CUHA 1C91A 3WMBA 1KXTA 1R85A 2JE8A 2V3EA 2TAAA 3BAKA 4J3XA 1BG4A 4BQ5A 1DWIM 1Q4NX 1H2JA 1SYTA 4RE3A 2XVKA 4B9YA 1JF6A 3RDKA 4HPHA 5ECUA 3ARXA 1J0HA 1DWFM 3NDYA 2WHKA 3WNMA 1PBGA 1EDQA 4IPNB 1ZB5A 4P8XA 4E4PA 3MV11 2VX6A 2JALA 2WWDA 3PZ9A 1W3KA 3TTYA 1XYZA 1ZJAA 3W29A 2WMHA 3OBAA 5A6BD 2XUCA 5IFPA 2FH8A 4Z2GA 2OWWA 1UG6A 2FHFA 2J47A 2NT1A 3CMJA 1GOOA 3QR3A 3GZAA 2WMJA 1FH7A 3VO0A 2EPLX 4TVUA 3ZOAA 3EDJA 1JYNA 4D72A 4X0VA 1JF5A 1IT0A 1EOKA 2YA0A 3WMCA 4CD5A 4J3WA 1HVQA 1XSKA 2UY4A 4MDOA 5JIWA 1WE5A 3PHAA 2VMFA 4PMYA 1E5JA 4KRUA 2WHLA 4X9YA 2VRKA 4W5ZA 3VX1A 4JKMA 1TG7A 2GDVA 3POHA 4V2XA 3L4WA 1R86A 5A6SA 1CLXA 5HNNA 1E4LA 1KR0A 2FH6A 3I3BA 6A3HA 2PBGA 4BS0A 1W9PA 2CXGA 1XCWA 2EEXA 1CXFA 2VVNA 4K68A 4FLRA 2VZSA 2J4GA 5FCZA 3PZQA 3VMOA 1KXHA 3SIMA 2ZUNA 4HU0A 3N12A 1SR0A 3NSXA 3ZSTA 3CIVA 2EJ1A 4DWSD 4PTWA 3VNYA 3PZIA 3EMQA 3FAXA 2UY3A 1QW8A 1WCGA 4JL2A 1E15A 3ARSA 4W85A 1JNDA 4FMVA 3AHTA 3SUSA 3VPLA 1E3ZA 5ABGA 4C7GA 4U5KA 4EKJA 2Y8VA 4GI8A 5I5RA 4A3YA 2DT2A 2QLYA 2WANA 1B3XA 3VIHA 8CGTA 5I79A 4U5IA 2YL8A 2VQTA 1UKSA 1M7XA 1DWAM 3OG2A 2J74A 3BSHA 1OGSA 2PB1A 2O92A 2X2YA 3CH9A 4A3HA 5LYRA 1WDQA 1JZ6A 3NSMA 4Q7NA 2G3IA 2RGMA 3WEZA 2VCCA 2V5CA 1RD6A 3WQVA 1BVZA 1ZL1A 3TP4A 3VIMA 2EBNA 1VEPA 2W61A 2YDRA 1GZJA 1UH3A 3BCFA 2D3LA 4W8BA 3RJXA 1ITCA 2DIJA 2J7DA 3SURA 1QI0A 1W3HA 5A94A 1VBRA 1JIBA 4R5EA 5FKYA 3VIPA 4OJYA 4IUGA 4LQ1A 1UKQA 1EQPA 2XSBA 4QLKA 3THDA 3CUIA 3W38A 4RL3A 1UWUA 3AXXA 2OYMA 1HVXA 3WUFA 2X8RA 3ZJ7A 2DT0A 3NCOA 5D9MA 1LL7A 5BXTA 3DYOA 3ZJKA 3A4WA 2J7BA 2JEPA 5AY7A 3MKKA 3WH8A 2VO5A 3ARVA 6TAAA 1GOIA 4P7OA 3WF4A 1EXPA 2YKKA 1CBGA 4RE2A 5EBAA 1EIBA 1CDGA 4FK9A 1J11A 2UWFA 1TCMA 2DSWA 4PMDA 3VGGA 2DSKA 3NUKA 2W62A 4H8UA 2J62A 1UZ1A 3WD4A 3GXDA 3B9EA 5D9OA 1W32A 2CKRA 1R8LA 3OB8A 3E1F1 4HA3A 4WJXA 4DWSC 1MXGA 3SUWA 2WHJA 3CZEA 1H09A 1J0IA 2GK1A 3F5JA 4DUVA 1E0XA 1E4IA 4JFWA 3KL5A 4PMOA 2EQDA 1ZBWA 4D6DA 1V02A 1NOWA 2GJXA 2OLHA 3WD1A 1CXKA 2XPKA 3ARZA 3CUGA 3GH4A 4BQ4A 1KB3A 1QNRA 4V27A 2A3EA 1W2VA 3BAJA 1DWJM 2WHMA 1WDRA 4N42A 3N13A 1KXVA 4KWUA 1W9DM 1N82A 3AZTA 1J01A 1Q6EA 1V08A 4D1IA 4M29A 1WKYA 4J3TA 2V5DA 3RM8A 2XM2A 2WMIA 3WF2A 3BAIA 1V3HA 1CLVA 4AZHA 3FW6A 4PMXA 7A3HA 3K4AA 4CU8A 1RH9A 2Y24A 1F4HA 3VIFA 4AIOA 5BXRA 4UFJA 3AI0A 4AD1A 3TTOA 4AY1A 2GFTA 3PZMA 4M81A 1QHPA 1JZ3A 4KH2A 3VILA 1BQCA 5BCAA 4UQCA 5E70A 2XVLA 1E43A 1U2YA 3W81A 1QVBA 2PWDA 4YHGA 2BXYA 1UHVA 2D0FA 1H1NA 3RO8A 3N17A 3WUEA 4PMQA 5DT5A 4MJ2A 2CEQA 2DGAA 2DSZA 5BRPA 3UR7A 2WNWA 4W7WA 3UESA 1M03A 3BGAA 3AJ7A 4ZENA 3VDHA 2DSVA 3SCWA 1GONA 3KE0A 2WMGA 3MV01 3KL3A 4JHZA 1BLIA 4PBGA 4QDMA 2E9LA 4HOXA 1UR8A 3O9NA 1EHAA 1KWGA 4AD3A 2CESA 4DUXA 1E5NA 4W88A 4HU8A 1UD5A 5A2CA 2BXZA 4ACZA 1CGTA 1KBBA 2CNCA 3AHXA 2FGLA 2XG9A 2XWDA 5CPTA 1U30A 1BG9A 1W9VA 2XVGA 3O2LA 1CEOA 4CVWA 4AZCB 3CHCA 5GQBA 1UD2A 5CSUA 3CPUA 5A6BA 2D22A 5CZKA 3VM5A 3ARPA 5IHSA 3TONA 2ZE0A 1OM0A 1AQHA 4PMRA 4HZ7A 1LQ0A 1JDAA 1EH9A 4D6FA 1PX3A 3WUGA 3G6MA 3OA5A 2V3GA 3M07A 4D71A 2J77A 3GTNA 2ZUSA 1VEOA 1E73M 1G01A 3MU7A 4PTVA 4JL1A 2YJQA 1GQLA 5HOSA 3WQ4A 5HPCA 4W8AA 3MUIA 3ZSSA 4LGXA 2HISA 3W27A 4UOQA 3WNPA 2Y8KA 3IJ8A 3WNKA 2WB5A 5GNZA 2PF0A 3WH6A 2VZOA 1H49A 1ZS2A 3AIUA 1CXHA 1HJVA 1V6YA 4CGTA 4CD6A 1CGXA 3MMWA 1H0GA 1E6RA 2QHAA 2WSPA 4UZUA 1LF1A 3CZJA 1PJ9A 3GYCA 4AIEA 3WFLA 2XVNA 3W28A 5E6ZA 1UWIA 2E9MA 3RM9A 2XFYA 4MDPA 4ZFMA 4GINA 2E3ZA 1QBBA 2PC8A 2W4XA 1UWQA 4IPLA 1EO7A 3A3HA 1GOQA 1QI2A 3OLGA 1UR9A 2G41A 1GJUA 2D3NA 1MFVA 1KGUA 3DC0A 1GJWA 3D5HA 3VMPA 1M04A 1Q6DA 3EMZA 2J7GA 3T0BA 4W87A 4F9DA 3AHYA 3VGEA 1DWGM 4DWSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 2WVV A;  1HNY A;  1CGW A;  1LLO A;  3BLP X;  5TD4 A;  3ZT5 A;  1QHZ A;  3TTQ A;  3B8S A;  3BAY A;  2VCA A;  1CEC A;  2VZV A;  4J27 A;  3MMU A;  1GOM A;  3WH9 A;  3L2L A;  2BY2 A;  3FND A;  4CD7 A;  3BXW A;  2WBK A;  4BZY A;  3WQ8 A;  4JCL A;  1E0W A;  3WN6 A;  1VEN A;  3VIO A;  3DHU A;  3ZT6 A;  3WKZ A;  2ZUT A;  3PBG A;  1RP9 A;  5AYI A;  1W1T A;  3ZMR A;  5A6L A;  5LA1 A;  3WEM A;  3KZS A;  1M53 A;  3FHQ A;  5CSY A;  2YLA A;  1J9Y A;  1I1W A;  3N1A A;  4PMV A;  3CZL A;  3UR8 A;  4AYS A;  4B3L A;  1OT2 A;  3OIH A;  1UWR A;  3GH7 A;  1VJS A;  1B0I A;  3HMC A;  1GVI A;  2QF8 A;  1K9E A;  1X1N A;  3GNR A;  3BMW A;  3AHV A;  4AZG A;  2F2H A;  3MAN A;  2G3J A;  3WEO A;  4QAW A;  3AS1 A;  4UOZ A;  1HIZ A;  3OLI A;  5I2U A;  1ZJB A;  1HJQ A;  2XJ7 A;  3HN3 A;  3WDP P;  1KCK A;  4MNJ A;  4TX6 A;  4TX8 A;  4ZXO A;  5CGT A;  5C71 A;  3WF0 A;  3I3D A;  1UA7 A;  1CWY A;  1PIG A;  2YDQ A;  3QOK A;  3SUV A;  3CHF A;  1ZU8 A;  2PBO A;  5FL1 A;  2GJR A;  1KWK A;  3CBW A;  4QFU A;  5EMY A;  1JZ5 A;  4TOQ A; 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