4ZXLA

Cpoga d298n in complex with drosophila hcf -derived thr-o-glcnac peptide
Total Genus 233
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
233
sequence length
579
structure length
579
Chain Sequence
NQVLVPNLNPTPENLEVVGDGFKITSSINLVGEEEADENAVNALREFLTANNIEINSENDPNSTTLIIGEVDDDIPELDEALNGTTAENLKEEGYALVSNDGKIAIEGKDGDGTFYGVQTFKQLVKESNIPEVNITDYPTVSARGIVEGFYGTPWTHQDRLDQIKFYGENKLNTYIYAPKDDPYHREKWREPYPESEMQRMQELINASAENKVDFVFGISPGIDIRFDGDAGEEDFNHLITKAESLYDMGVRSFAIYWDNIQDKSAAKHAQVLNRFNEEFVKAKGDVKPLITVPTEYDTGAMVSNGQPRAYTRIFAETVDPSIEVMWTGPGVVTNEIPLSDAQLISGIYDRNMAVWWNYPVTDYFKGKLALGPMHGLDKGLNQYVDFFTVNPMEHAELSKISIHTAADYSWNMDNYDYDKAWNRAIDMLYGDLAEDMKVFANHSTRMDNKTWAKSGREDAPELRAKMDELWNKLSSKEDASALIEELYGEFARMEEACNNLKANLPEVALEECSRQLDELITLAQGDKASLDMIVAQLNEDTEAYESAKEIAQNKLNTALSSFAVISEKVAQSFIQEAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A mutant O-GlcNAcase as a probe to reveal global dynamics of protein O-GlcNAcylation during Drosophila embryonic development.
pubmed doi rcsb
molecule keywords NAG-PRO-SER-THR-ALA-Thr-O-GlcNAc containing peptide from dro
molecule tags Hydrolase/peptide
source organism Clostridium perfringens (strain atcc 13124 / nctc 8237 / type a)
total genus 233
structure length 579
sequence length 579
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2015-05-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 4zxlA03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4zxlA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 4zxlA01
1W1TA 2XJ7A 1CGVA 3EMCA 3W26A 3T0AA 4GIAA 2O9RA 1OGBA 2O92A 1GQIA 3B8SA 3NSXA 2V3FA 3GH5A 3LMYA 3DHPA 3TP4A 2EO7A 5D9NA 1QW8A 5LYRA 2V3DA 1GONA 2BHUA 1E4NA 4HU0A 3U57A 2VZTA 1UKOA 5BXTA 2ZOXA 2D0HA 5I77A 4ACYA 4QFUA 3TTQA 2E9MA 1D3CA 2VVNA 1K9DA 4NRRA 1JZ7A 4JKMA 2EJ1A 4BF7A 3GDBA 3UR8A 3WF2A 1V6WA 2WVVB 4KGJA 4H8HA 4AD4A 3AS2A 3AHTA 3ZO9A 4OJYA 3VOCA 6TAAA 3SURA 2WMFA 3DC0A 1ESWA 1CWYA 2J78A 2DT0A 3WNOA 4MDOA 1UWTA 4S3KA 4GI8A 2WMHA 4CN6A 2CYGA 1TA3A 1IV8A 4Z2HA 3OBAA 2VR5A 3AIVA 1R85A 2XFYA 4MDPA 3MSGA 3M07A 4EKJA 5IFTA 2VI0A 3BAJA 4UQDA 1KR1A 1XRVA 2VQTA 1E0WA 3AJ7A 4AY1A 1E0VA 4QAWA 5C8BB 2WNWA 3VDHA 3A4XA 3WEMA 2XVLA 4TVUA 4KMQA 4PMNA 1QI4A 3WD0A 3WQ6A 3OIHA 5D4YA 2F61A 3SCOA 1JDAA 3OZPA 1BG4A 3WBEA 3F5JA 2YLAA 2XYLA 1GJUA 2XVNA 3VD4A 4AZGA 1UH3A 1QHPA 5CQ1A 4PMZA 2J7BA 4H04A 1H41A 5CPTA 3S2CA 3PZNA 3IANA 3L4VA 3A47A 5I24A 1GPFA 3T2PA 1KXTA 1TG7A 3T2OA 1KWGA 1HN1A 3L4ZA 2YA2A 2J75A 2XG9A 4ZE5A 1QBBA 5ABFB 1NQ6A 3QOMA 4M8UA 3WMBA 1BYBA 3GBDA 3N1AA 1VFMA 2VL4A 2DT2A 3AZTA 4AWEA 2Y8VA 3AMDA 3ARYA 3PHAA 4GKLA 5C71A 4AMCA 2OWWA 1DWJM 3T0BA 1MW1A 2E0PA 5BRPA 1HL8A 1AMYA 3ALGA 1UWSA 3VGHA 3L4TA 4HPGA 2A3EA 2WYSA 5JUVA 4PUDA 2QMJA 1LWHA 1OBAA 5AC4A 1BVZA 1QOXA 3N9KA 1ZJAA 2PBOA 4XUYA 3AIQA 5FCZA 1MW3A 1FH9A 1JZ2A 1US2A 1C92A 3GH7A 1NWTA 1HIZA 4MNMA 3F5LA 1QNOA 5LA2A 5GNZA 1E4MM 2FHBA 4CCCA 1H4PA 2GFTA 1FH7A 3WDJA 3MU7A 4GPNA 3VTRA 4AZ5A 4B15A 3CIVA 2W61A 1QI2A 4TTGA 4OKDA 2V5CA 1HKJA 1C93A 1TE1A 2QPUA 2WM0A 5GPRA 3ARTA 3B9DA 1E70M 3BAKA 3VMPA 1GVIA 3GXMA 3OLDA 5CGMA 2WZHA 3WDRA 3N18A 2WMKA 4QLKA 3NDYA 4PMYA 3OGRA 2WCAA 1JYWA 1CGTA 4CD5A 4Y7EA 2YDQA 1GOMA 3ZT6A 3WH6A 4A3HA 4GO9A 3BH4A 2HVMA 3KE0A 4QCEA 2WC3A 4WIWA 5E0FA 5LA1A 4J28A 4PUEA 3PTKA 4UFLA 5A6AA 5M5DA 2W63A 3SCTA 1R87A 5FIPA 3MUIA 2G3JA 5TD4A 2J7CA 4TOQA 3AROA 1PIGA 2J4GA 3OA5A 3VD9A 2EQDA 1AQHA 2X1IA 1PEZA 1EGZA 3OB8A 2XFRA 4XX6A 2ZICA 3BMVA 3WD1A 3JUGA 3WFZA 2E8YA 1VBRA 2FGLA 4E2OA 3TONA 2Q8XA 4QP0A 2WW5A 1LJYA 2J8FA 2DIJA 3VKKA 1JAKA 1FHDA 3WNLA 5E0CA 1WPCA 4UQCA 5A2AA 4PMDA 5ECUA 3RO8A 1V3IA 4AZ7A 3PZIA 2D3LA 3O9NA 1XD0A 1JG9A 2BV9A 3VD3A 4D6GA 2BVTA 1KCKA 1Q6GA 1BVNP 1NP2A 1VEMA 1EDQA 2J7EA 3SUWA 1XH1A 1FHLA 2J77A 2B31A 1W3HA 2CBJA 4LYPA 2ZUUA 4CCEA 3PTMA 1W1PA 1HVXA 3ECQA 4JAWA 2A3AA 3L4YA 1VB9A 1JZ6A 2ZUNA 4YHGA 1W9VA 3M46A 5A95A 3D5HA 3OZOA 2E40A 4NZCA 4D1IA 3WNMA 1H1NA 2VRKA 4PMXA 4LX4A 4MJ2A 3CH9A 4JFUA 2Z1SA 3AZSA 4WK9A 1OB0A 1W9XA 1TVPA 1ZBKA 2C0HA 5CLTA 2J79A 1VENA 1WDPA 4AZHA 3CHFA 2BVDA 5D8ZA 2EPKX 2BY1A 1F4HA 1OIFA 3VIGA 1WDSA 4P8XA 2GJPA 5A2CA 5FD0A 4CGTA 1G94A 3CHCA 3GTNA 1EOMA 1D2KA 1BF2A 1M7XA 1V3JA 4W84A 5A8QA 5DEZA 1EHNA 2YBUA 4W5ZA 1AVAA 2VRQA 1QI3A 4W86A 4Q22A 4AD5A 4P8UA 1H11A 4PMVA 1LQ0A 1KFWA 4HOXA 2E8ZA 1WDRA 1W3KA 2W67A 2ZWZA 2AOSA 2Z1KA 3CTTA 1DHKA 4BQ3A 2YL6A 4PMRA 5IHRA 3O6AA 1IT0A 1J0IA 5EFDA 4HMEA 3M7SA 3AMKA 3F5KA 1NARA 1QI5A 3PZUA 1NOFA 3WF4A 2BS9A 3VM7A 5DF0A 3GH4A 1KB3A 3WDPP 3TOPA 1H2JA 1LWJA 2JEPA 1W1VA 2XVKA 1UKSA 3E1F1 3AMCA 1CIUA 1FP8A 4UZUA 5E09A 3W38A 2W91A 3BXWA 4P8VA 4FLRA 3LPGA 2VCCA 1BGGA 1NWRA 1EIBA 1FP9A 1TA3B 1MYRA 3IJ8A 4JL2A 2WWDA 4P8WA 7A3HA 1XGZA 1BFNA 3BAXA 4CVUA 3EYPA 1C3FA 5DMYA 4ZE4A 2JE8A 4UOJA 3ZJ8A 3WQ4A 3WFLA 2WLYA 4F9DA 3BCFA 3TTYA 1SMAA 4BS0A 1JIBA 4M80A 4OOUA 2MANA 2GJXB 2BXZA 3GXIA 4U5KA 3ARUA 4RE4A 2JF7A 1CXEA 4AEEA 1UZ1A 1PIFA 4F8XA 1BPLB 1R86A 1B9ZA 3NIYA 2X0HA 1UHVA 1D7FA 2ESCA 4B9YA 2XIIA 1M53A 5EBAA 5BXRA 2XIBA 3W82A 5EB8A 4W7VA 1CGWA 1UQYA 3S6TA 4TUFA 4W88A 3N11A 1WZAA 4HMCA 1KGWA 1ITCA 1KBKA 5DO8A 1BYCA 2WBGA 4MAZA 4ZXLA 1HXJA 4A3YA 2AAAA 4B3KA 1WZMA 1BYDA 1PAMA 3CUFA 3CZJA 3LPPA 1HT6A 5CZKA 1PX8A 1GNXA 5FKYA 4CD6A 1VF8A 1EO5A 3GXDA 4GINA 4EAMA 4A4AA 3ARXA 1HP5A 2G41A 4PEEA 5I6SA 3QR3A 2D0FA 4D71A 2WLZA 2CBIA 5E6YA 3NJ3A 5HPOA 1CLXA 1GCYA 2TAAA 1R7OA 3ALFA 1M04A 1UR8A 5CPQA 3OGVA 3RIKA 4J3XA 1H49A 3AIWA 4BQ4A 1I1WA 3FY1A 4CKQA 5CSUA 2DGAA 4IPLA 1G9HA 3ZR6A 5EFFA 1BLIA 2G3NA 4OBRA 2OSWA 1ECEA 1QI0A 1EDGA 4MB1A 4U5IA 3RM4A 5D9MA 3AHVA 4QCFA 4YN5A 2NSXA 4XZBA 3OLEA 5I23A 4HU8A 1G01A 1LL4A 2J7GA 5BCAA 1ISZA 2OYKA 3MKKA 1ZL1A 2YA1A 4DUVA 4JFVA 3THCA 1OT1A 4MJ4A 1X6LA 2WCGA 1UR0A 2PWDA 4JIEA 2WC4A 2QLYA 5DFAA 3T08A 5A6JA 1DEDA 3WL1A 3AFBA 3BAYA 3VGDA 3PZOA 2GJRA 4GO8A 3WY1A 3FAXA 2C8NA 3AIRA 5HDRA 4CN4A 5BRQA 3G6MA 2EPNA 4OUEA 1V6YA 4MNJA 4WKAA 3VO0A 4UQBA 2D22A 5D8WA 2PF0A 4AYSA 4W89A 2J62A 1E1EA 4L4PA 2YL9A 1GW1A 4LGXA 3VGBA 1HX0A 1GOQA 2ZUMA 3CMJA 3SCRA 1Q4NX 1JZ4A 5CLWA 4UFMA 4XB3A 1HJWA 3WNPA 1U30A 3NSNA 4PN2A 2JFEX 1P6WA 2XHYA 3W24A 1XYFA 2YJQA 2YDSA 3IK2A 4PCSA 4TX6A 5CPSA 2WVUA 5IFPA 5IHSA 2BY0A 3TTSA 3ZQ9A 1OGSA 1CXFA 1H09A 2BHZA 3QGVA 5JBFA 3VDAA 3CUJA 4HOWA 3TA9A 2AMGA 5BROA 2CIPA 2GJXA 4X0VA 4FMVA 3AQUA 8CGTA 1NM9A 1ODUA 2J74A 4J7RA 4C90A 2XM1A 4E8CA 1VJZA 3PBGA 3OLIA 4JFSA 3BLPX 1JZ8A 1LF1A 1PPIA 2BXYA 3EBVA 4IISA 1VAHA 4PMUA 4JHOA 2XWEA 3CHEA 3N04A 2EBNA 1WB0A 1QHOA 4J3SA 1Q6EA 1XCXA 1JF6A 4C7FA 2DQXA 1TZ7A 4D1JA 1XSKA 2YIHA 5A2BA 5AYIA 1BGAA 1BYAA 4M29A 3I3BA 2W66A 2FHCA 5CSYA 2O9PA 2ZXDA 3G6LA 1B1YA 1UD6A 2Y5EA 2WWCA 3IJ9A 2VZUA 4M1RA 1CPUA 3VGEA 1QHZA 4RE2A 4AD0A 3SCSA 3FHQA 2EXOA 4CU6A 5A6BD 1CGUA 3PZTA 3VDBA 2QPSA 3WIJA 1A3HA 1DWGM 1CENA 4C7DA 2X0YA 3U5YA 3PZVA 1UOKA 4CD4A 1NOWA 1WO2A 2XSBA 4AW7A 2X8RA 2ZXBA 4JHZA 1BTCA 4W7UA 1JFHA 4H8UA 3WL0A 3VGGA 3VX1A 3W37A 1UWRA 1FOBA 3AHYA 3VPLA 2YLLA 2XTKA 3CMGA 3WQ8A 1TCMA 3ZR5A 4ATDA 2E9LA 4JKKA 4UR9A 2WANA 2CCRA 3EDKA 2YOCA 1WZKA 3W0KA 2DDXA 2WHJA 3SUVA 2CITA 1HL9A 3AXIA 3BGAA 1KCLA 3MMUA 2V38A 3U7VA 1TVNA 4MAVA 1YHTA 4D6DA 1LL6A 1V6UA 4HPHA 3VIKA 3MUZ1 3AIEA 1MW2A 4F79A 1E71M 1E9LA 3AHXA 1J0HA 2D20A 4X0NA 3HJEA 1JAEA 4UFKA 5JBDA 4MNLA 3ZSTA 5FL1A 1QBAA 2ZUTA 1UYQA 3L4WA 5A6LA 1B2YA 2DSVA 2EPMX 2W62A 2ZUSA 2NT0A 3CO4A 3AIBA 3ZM8A 4JZ5A 1UKQA 4WSJA 1HJVA 3SCVA 4HA1A 2WZEA 1OINA 3N17A 4UQ9A 1F4AA 4E4PA 3SCNA 2FHFA 3POHA 1JNDA 1UKPA 2D3NA 2RGLA 3ARZA 2NT1A 1LL7A 4AC1X 1B3ZA 3VIIA 2XGBA 1XCWA 2W5FA 4ACZA 4EANA 1RD6A 2WVSA 2CXGA 2XWDA 2ZUWA 1Y7VA 1KXHA 4HZ7A 1E40A 3AHZA 1VFOA 3FN9A 1KBBA 1VJSA 1GQLA 5F7UA 4BQ2A 2G3IA 1TFVA 1E6XM 2PC8A 1UWQA 4WKFA 2XM2A 2WCSA 1NOUA 4Z2KA 3ZT7A 1HJQA 3ARWA 1MFVA 3WDHA 3ZOAA 1CXIA 3WN6A 2FH6A 4UFHA 5GNXA 3K8MA 1OD0A 3DYMA 2V5DA 4QLLA 4R27A 4F66A 1UD8A 3ARRA 2BFGA 1WNOA 4GQRA 4QLJA 2G8ZA 4Z2JA 1M01A 2W92A 1V0MA 1W91A 1ZBWA 5AY7A 1G1YA 3AXHA 1CGXA 5LA0A 4J3WA 5HXMA 4WF7A 1KWKA 3FW6A 5A6BA 3GZAA 3A4AA 4AD1A 1V3KA 3OG2A 3VD5A 4PSPA 1V08A 3W4RA 3A6OA 1BSIA 1J11A 3CLWA 3T2QA 3MMDA 1OSEA 4TTUA 3WEZA 3SCUA 5FOOA 1AQMA 1KGXA 2WHMA 2VZVA 4MPKA 4GI6A 4F9JA 2A3HA 7CGTA 1E6ZA 1H0GA 1GQJA 3CZEA 1Q6CA 1NWUA 3AI0A 4E8DA 1ZB5A 3EDDA 3SCWA 4N42A 5C70A 3RPMA 4AZCB 1G5AA 1HVQA 4PTMA 3IAQA 2GK1A 5E9AA 1C90A 4B16A 2CKRA 3AYRA 7TAAA 2E3ZA 1A47A 2WB5A 3ZJ6A 1JGIA 1W32A 1ISWA 3WMCA 2WC7A 2DEPA 1GORA 4JCMA 3RJYA 3RDKA 2JALA 1UUQA 3HMCA 2PI6A 1HJUA 4RE3A 1L0PA 1NWSA 1DTUA 2EEXA 3AS3A 4PYSA 4K68A 2DSUA 1VEPA 1I75A 2D1ZA 2CETA 5ABGA 1IZJA 3DECA 2DT1A 1CEOA 2PWHA 3DYOA 1PJ9A 1TR1A 4J3UA 2GUYA 3BC9A 1B30A 3CZGA 2FGZA 1QNPA 1XH2A 2YL8A 4ZXOA 3GXFA 4AZ6A 1BAGA 1ZBCA 4U3AA 3EDJA 2VOTA 2CKSA 1MQPA 3SUTA 1ZJBA 1K9FA 3UERA 3WEOA 2VTFA 2OWCA 3W28A 4D6CA 5GQBA 3ZJ7A 2VVSA 4MTVA 1QW9A 1GOOA 1W9BM 1OT2A 3ARQA 4BZYA 3T0DA 4C7GA 1UH2A 4LYRA 4D6FA 3POCA 5A8MA 3B9EA 1DP0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3MO4 A;  2C0A A;  3SUS A;  4H2C A;  4JTI A;  1W3J A;  3AOF A;  2CPU A;  2H7O A;  1CB2 A;  4LXF A;  2W79 A;  4W5U A;  2ZE3 A;  1OX5 A;  3RCY A;  3W87 A;  4PCN A;  3OVR A;  1SE7 A;  3AE1 A;  3ZJ1 A;  1ZFJ A;  1RPK A;  1V3M A;  4JFW A;  3L9C A;  4P7O A;  4WJE A;  2NQ9 A;  2DZB A;  5FVK A;  3E0Z A;  2QNE A;  1V6V A;  2A3B A;  3EB2 A;  2D2O A;  4FPS A;  2V81 A;  3T09 A;  3LGE A;  3I3D A;  1M7P A;  1WP6 A;  1IZK A;  3LTY A;  3QXB A;  3O1J A;  2I1O A;  1EP1 A;  3KS5 A;  2QF8 A;  1XC6 A;  1D1A A;  2CE7 A;  3E02 A;  3AXX A;  3IJQ A;  4NF7 A;  4QBX A;  5HAT A;  1R46 A;  1YE6 A;  2WAU A;  1H5V A;  1LG1 A;  2KWH A;  3W6M A;  3LHZ A;  1P7T A;  1SJB A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 1W1T A;  2XJ7 A;  1CGV A;  3EMC A;  3W26 A;  3T0A A;  4GIA A;  2O9R A;  1OGB A;  2O92 A;  1GQI A;  3B8S A;  3NSX A;  2V3F A;  3GH5 A;  3LMY A;  3DHP A;  3TP4 A;  2EO7 A;  5D9N A;  1QW8 A;  5LYR A;  2V3D A;  1GON A;  2BHU A;  1E4N A;  4HU0 A;  3U57 A;  2VZT A;  1UKO A;  5BXT A;  2ZOX A;  2D0H A;  5I77 A;  4ACY A;  4QFU A;  3TTQ A;  2E9M A;  1D3C A;  2VVN A;  1K9D A;  4NRR A;  1JZ7 A;  4JKM A;  2EJ1 A;  4BF7 A;  3GDB A;  3UR8 A;  3WF2 A;  1V6W A;  2WVV B;  4KGJ A;  4H8H A;  4AD4 A;  3AS2 A;  3AHT A;  3ZO9 A;  4OJY A;  3VOC A;  6TAA A;  3SUR A;  2WMF A;  3DC0 A;  1ESW A;  1CWY A;  2J78 A;  2DT0 A;  3WNO A;  4MDO A;  1UWT A;  4S3K A;  4GI8 A;  2WMH A;  4CN6 A;  2CYG A;  1TA3 A;  1IV8 A;  4Z2H A;  3OBA A;  2VR5 A;  3AIV A;  1R85 A;  2XFY A;  4MDP A;  3MSG A;  3M07 A;  4EKJ A;  5IFT A;  2VI0 A;  3BAJ A;  4UQD A;  1KR1 A;  1XRV A;  2VQT A;  1E0W A;  3AJ7 A;  4AY1 A;  1E0V A;  4QAW A;  5C8B B;  2WNW A;  3VDH A;  3A4X A;  3WEM A;  2XVL A;  4TVU A;  4KMQ A;  4PMN A;  1QI4 A;  3WD0 A;  3WQ6 A;  3OIH A; 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