4AIUA

A complex structure of btgh84
Total Genus 226
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
226
sequence length
585
structure length
576
Chain Sequence
SLQPPPQQLIVQNKTIDLPAVYQLNGGEEANPHAVKVLKELLGMLISIGEKGDKSVRKYSRQIPDHKEGYYLSVNEKEIVLAGNDERGTYYALQTFAQLLKDGKLPEVEIKDYPSVRYRGVVEGFYGTPWSHQARLSQLKFYGKNKMNTYIYGPKDDPYHSAPNWRLPYPDKEAAQLQELVAVANENEVDFVWAIHPGQDIKWNKEDRDLLLAKFEKMYQLGVRSFAVFFNDISGEGTNPQKQAELLNYIDEKFAQVKPDINQLVMCPTEYNKSWSNPNGNYLTTLGDKLNPSIQIMWTGDRVISDITRDGISWINERIKRPAYIWWNFPVSDYVRDHLLLGPVYGNDTTIAKEMSGFVTNPMEHAESSKIAIYSVASYAWNPAKYDTWQTWKDAIRTILPSAAEELECFAMHNSDLGPNGHGYRREESMDIQPAAERFLKAFKEGKNYDKADFETLQYTFERMKESADILLMNTENKPLIVEITPWVHQFKLTAEMGEEVLKMVERNESYFLRKYNHVKALQQQMFYIDQTSNQNPYQPGVKTATRVIKPLIDRTFATVVKFFNQKFNAHLDATT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Metabolism of Vertebrate Amino Sugars with N-Glycolyl Groups: Intracellular Beta-O-Linked N-Glycolylglucosamine (Glcngc), Udp-Glcngc, and the Biochemical and Structural Rationale for the Substrate Tolerance of Beta-O-Linked Beta-N-Acetylglucosaminidase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
molecule keywords O-GLCNACASE BT_4395
total genus 226
structure length 576
sequence length 585
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2012-02-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
A PF18344 CBM32 Carbohydrate binding module family 32
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 4aiuA03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4aiuA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 4aiuA01
5I2UA 1JZ5A 4N0RA 4C91A 3VVGA 5A6SA 1OGBA 1W9UA 2J7HA 4HOXA 4X9YA 2XVKA 2JIWA 4U5IA 5KZ6A 2PI6A 3IK2A 4U3AA 4EANA 1N82A 2IUZA 2GJXB 2XGIA 1KXHA 1E3ZA 1NQ6A 1UKPA 1X6LA 4B3KA 5F7UA 4CN1A 1C8QA 2WNWA 1I75A 1NOUA 3ARYA 3MV11 4YPJA 1PBGA 1JAKA 1W1TA 1HN1A 5IHSA 4PCSA 4W87A 4ACZB 2GJXA 2ZUUA 4HTYA 3OGRA 2X09A 3GH4A 3UG3A 2XHYA 2OLHA 4LPCA 4JAWA 2WZIA 3MU7A 4Z2IA 4P8UA 1J11A 1JXJA 4WKAA 2Y8KA 3KEHA 5BRQA 4X0NA 3W82A 3RMEA 2DT3A 4V2XA 1JNDA 4HP5A 2ZUMA 1Q6CA 4ACZA 2VCBA 4TVDA 3CHFA 3VIHA 1UR8A 3D3AA 5M03A 3AISA 2G3MA 3VTRA 3S2CA 3ARTA 4HZ7A 3M46A 2IXUA 2QPUA 4IPLA 1UKTA 5A2AA 1GVYA 4FF5A 2JF7A 3VDCA 4AISA 2XPKA 1C93A 1UHVA 1JD7A 3N17A 3DC0A 3AHYA 1EDGA 3CZKA 3WBAA 1V0MA 2XSAA 1DWJM 1G9HA 3ZSTA 2UY5A 5AC4A 3EBVA 1DEDA 5HBFA 3ZT5A 4L4PA 3S6TA 4P7OA 3WENA 4PTVA 3PTQA 1W1VA 1ISYA 5D9OA 1Z32X 2G3IA 4AZHA 1E70M 1V6YA 4GZEA 2XFYA 2X8RA 4WKHA 1Q6FA 2XGBA 2XFFA 2JF6A 1H3GA 1TG7A 2G8ZA 4OUEA 2YIHA 3UETA 2DT1A 4IPNB 5HDRA 2A3CA 3B9DA 3F5JA 1W9PA 4PMVA 3WL0A 1C8XA 4BA0A 4DM1A 1JYNA 5BXPA 2BHYA 5A2CA 4BCEA 4ZE4A 1EHNA 3VIOA 1ZBWA 4W7VA 1UZ1A 2VI0A 4JFSA 1M04A 1H41A 2WMIB 5I77A 3VX1A 1QI0A 1JZ8A 3FHAA 4D6CA 1J0YA 2VZUA 1TFVA 1E5NA 3PZOA 2WLZA 4YN5A 4CU8A 3VGFA 4ACYA 4OZOA 2XVGA 1CXHA 5A8PA 4CD8A 4AZIA 1PX8A 1UD3A 1OWQA 3A47A 1XH2A 5I78A 4CN6A 1JZ3A 2WMIA 3CZ8A 4PSRA 3AHZA 1F4AA 3TTOA 5JUVA 3AS1A 4CU6A 2BHZA 3WD4A 1NOWA 3CTTA 3WMBA 3WFZA 1DWGM 3BAXA 2DQXA 3ARQA 3CUFA 1P6WA 4QLLA 4ATDA 4UFHA 2GDVA 2Z1SA 4CN4A 2V3EA 1A3HA 1ZJAA 2VVNA 1EHAA 1WCGA 3HJEA 3TA9A 4Z2HA 3AIRA 2OYMA 6CGTA 1H4PA 3AMLA 2O9OA 5EB8A 2D23A 1WE5A 3WMCA 1JF6A 2WC4A 1E0VA 3NDZA 4R27A 2DH2A 3CUJA 4NRSA 4XX6A 2QHAA 3PTKA 1AQ0A 1XSJA 3G6LA 1JAEA 2QMJA 2CXGA 2VOTA 3U5UA 3PBGA 4PMYA 1LF1A 1RP8A 3PZTA 2J62A 1KR0A 4WSKA 1NP0A 1E6NA 4GO9A 4OJYA 5D9PA 2WM0A 2NT1A 3WF0A 4JCLA 2ZWZA 4GKLA 4AZBA 1CTNA 2HVMA 4OBRA 1ISWA 1QI3A 1XGZA 1KB3A 3GZAA 2FGZA 3FXYA 2X0HA 1J0ZA 5C8BB 1QPKA 1UR1A 2WK2A 3W37A 3ALGA 3CHEA 2VNCA 3WDPP 4BQ5A 4J3VA 5DT5A 1MW2A 1CZ1A 5CSYA 1WZKA 1EGZA 3AI0A 3N12A 1G5AA 3OA5A 4UOJA 4M80A 3LPFA 3T2OA 4DWSD 2WKLA 3GXDA 1ZS2A 3KE0A 5AC5A 4D6GA 4DUWA 1WDPA 1E3XA 5D8WA 2O9PA 1E6ZA 3BSHA 3OBAA 2DSKA 2ZXQA 3ARPA 2WKGA 3SCSA 3A4WA 3IJ8A 1OD8A 3D5HA 1UQYA 4C7GA 5JIPA 1D3CA 3M7SA 3CZJA 1GQLA 2DSUA 3F5LA 4MAVA 3W28A 1ECEA 3VNZA 1GOMA 4M56A 4W85A 6A3HA 3VIIA 5A95A 3N04A 3VD4A 3AZTA 4MNMA 4J3SA 2VR5A 1M01A 4QDMA 1EQCA 1BYDA 1VFOA 2WW5A 4AD1A 5I6SA 2WCGA 4HA4A 3TTQA 5BXTA 5AYIA 1MXGA 1J0KA 2G3NA 3L4TA 2D0FA 1ISVA 3VUPA 4C90A 1Q6DA 1NWUA 3CZLA 4D1JA 2VRJA 2D22A 1AQHA 4UQCA 2XJ7A 4BQ4A 1TR1A 3BGAA 1NARA 3GXIA 4J3UA 1WDRA 3MS8A 4YHEA 5LA2A 3RILA 4PUDA 1ZU8A 2O92A 1DWHM 3WQ5A 4LYRA 1MFVA 4RL3A 1XHGA 2VUYA 1H0IA 4NI3A 1GHRA 2D0GA 5KEZA 3A3HA 5GQBA 2BVTA 1B3WA 1BVZA 1R87A 1UD2A 3SCTA 1JIBA 2J7CA 2CNCA 1E73M 3SUWA 1HKKA 3ZIZA 3A4XA 1GQIA 3PN8A 4AC1X 4H8UA 3OB8A 3FHQA 1FHLA 3F4VA 3GXMA 3I3BA 2Y5EA 1HJVA 1OB0A 1NWRA 5E6ZA 4CKQA 5E09A 3VIPA 3SUSA 4WKFA 4JFUA 4WJXA 3WF1A 4MB4A 1NOFA 1OIFA 3VU2A 2GJPA 4IM4A 3WQ4A 1QHZA 2A3EA 3WQ6A 3ARRA 1QW9A 1KQZA 1B3XA 1SMAA 2OYKA 1OSEA 3T2QA 1J0HA 2WYSA 3AMKA 2VO5A 1TUXA 1VFFA 5BWFA 4JKKA 3LPOA 2UWFA 4FLSA 1W91A 2OWXA 3VKKA 2CIPA 3GYCA 2E9BA 3THDA 3ZMRA 1LL6A 3ECQA 2CEQA 2YL9A 1V0KA 4H8HA 1V0LA 4S3KA 1DWAM 2WC3A 1JI1A 3JUGA 3NJ3A 4TUFA 4QLKA 3AZSA 4UFJA 2VCCA 1VIWA 5LA1A 4Z2JA 2E0PA 4MJ2A 1CIUA 2WCSA 1R7AA 1J0IA 3II1A 4P7RA 3RIKA 3T08A 4EE9A 1S46A 2BY0A 2BY2A 2YBTA 5IXEA 2YDSA 3W29A 2GVYA 3BAKA 2ZOXA 3MMWA 3PZNA 2ZIDA 3NDYA 4PMOA 3UERA 3MMDA 3T2PA 3OLIA 1V02E 1JL8A 2V3GA 4M82A 2Z1KA 3WF2A 5A69A 1FH7A 3AIUA 3N15A 4OIFA 4W5ZA 4W8BA 1OGSA 4W93A 2J7BA 4AD2A 3UEQA 4WF7A 1B0IA 1PEZA 5CPSA 1JDDA 1D7FA 3VOCA 2BS9A 3TP4A 3BXWA 1V3LA 1HX0A 3WH6A 1JD9A 3DYOA 5BYWA 1E4IA 2UY4A 2WVVB 3AMGA 3OZPA 4X0VA 2BXYA 3VX0A 5A6BA 4KRUA 1V02A 4UQBA 1LJYA 3UCQA 4ATLA 3AJ7A 1B90A 5A6MA 2VZTA 3QOKA 1HJXA 3APGA 1O6IA 2J8FA 3AZRA 2J7GA 2EO7A 2YOCA 3WUBA 5FIPA 4UR9A 5A3HA 4KGJA 3GBEA 4W7UA 4WSJA 2CYGA 4J3TA 2WVVA 2BV9A 4C7FA 3ZJKA 1QBAA 3MKKA 3W24A 4UQDA 2JALA 4FLRA 1W9XA 2BXZA 2ZX9A 2CBIA 2WHLA 3BAJA 4E4PA 2YA2A 4LX4A 3LMYA 4ZEPA 3VIJA 5HXMA 2DSZA 1HJSA 1ISXA 5AY7A 3WSUA 2O9RA 3K46A 1M53A 3AS3A 1WP6A 1W3KA 2XG9A 4JKLA 1J18A 2G41A 2CKRA 1JYWA 2PWFA 1QHOA 4AW7A 3CUIA 5CXPA 3N18A 5TD4A 2WMFA 1W9DM 1EDQA 2V38A 5D8ZA 5CGMA 2YL6A 4PTXA 4AXNA 4J27A 1G01A 4NF7A 3VIGA 1WDSA 5BROA 1OT1A 1WDQA 2J25A 1BGAA 3AXIA 3CUGA 4M81A 1L8NA 2GDUA 5CG0A 1W9VA 2BFGA 1IZKA 1E6PA 1RD6A 3CHDA 1BPLB 2W66A 1GJUA 1UZ4A 3AXXA 3WD3A 3UR7A 4GQQA 4UQEA 3QHNA 5DF0A 6TAAA 4UNIA 4D72A 1R8LA 3WDQA 4D71A 5CQ1A 1BYBA 4ML4A 1JYVA 1QI4A 2FH6A 2CESA 1UA7A 3DECA 4IUGA 4CGTA 5HNNA 1B3ZA 1FH9A 5CLTA 2WSPA 5E70A 3WQ8A 1HF6A 4K68A 1W3JA 4WIWA 1FHDA 2YA0A 3B8SA 4TX6A 5ECUA 4A3YA 4FK9A 1GW1A 1US3A 3AHXA 1GOKA 1Q6GA 1GOIA 1TVPA 1XYFA 3W38A 4UQ9A 3WIJA 4JFVA 4PMDA 4E2OA 2YDRA 3VM5A 2YKKA 3M07A 1QI2A 4GO8A 2YLAA 4OOZA 1CLXA 2YBUA 4PBGA 4FMVA 5A8OA 2C7FA 2XWEA 1TA3B 1FA2A 2B31A 2C8NA 3AMCA 3EMQA 2X1IA 1H11A 3ARZA 2DGAA 1HVXA 1XCXA 1UWTA 2EPKX 3AIWA 1E6RA 5I3DA 3WELA 4GI9A 4JZ5A 1E55A 3L2MA 3BLKA 4P7LA 1GJWA 4CD6A 1UA3A 3GH7A 1K9EA 4JHOA 1GVIA 4B15A 1XH1A 1HJQA 4BQ3A 2C0HA 1UWRA 1TA3A 2EBNA 2VRKA 4MADA 3VM7A 2D24A 2PF0A 3W6MA 1EQPA 1V3HA 4J3XA 3ZO9A 2WMHA 2D20A 2VJXA 4URIA 3CH9A 3UESA 1WZMA 4NZCA 3AOFA 2EPNA 4H2CA 3DYPA 1G0CA 3T0AA 1WKYA 1I1WA 3WY1A 2VMFA 2GUYA 4GZIA 4PCTA 3VINA 3TONA 2WB5A 1UD5A 3RM4A 1X6NA 2JFEX 3ARSA 2EQDA 5AYBA 4QAWA 5CPTA 3BMVA 1CGVA 2VCAA 4JKMA 4AEFA 4DUXA 4TVUA 1CXLA 4W5UA 2CCRA 1TZ7A 2FGLA 1FOBA 1SYTA 1EDTA 2ZXDA 3AIEA 3BCFA 2OWCA 1V08A 1XRVA 3M6DA 4P7NA 3WDIA 4AZGA 2VQTA 4JL2A 1EO5A 1V03A 1FP8A 3L4UA 3K4AA 2CHOA 3BCDA 1LG1A 5EMYA 3VD5A 1W3LA 5JBDA 3ZT7A 1KXVA 1JZ6A 4UQAA 3WEMA 1KGUA 2DSWA 2PC8A 4LGXA 3CMGA 4CD7A 5BXSA 2E8YA 2YJQA 1KWKA 1MQQA 4CCCA 2JE8A 1CGWA 4M29A 3AMDA 4U5KA 1XH0A 3I3DA 1HKIA 3PZIA 3POHA 3ZR6A 1EXPA 2NSXA 1BSIA 1HL8A 1KCKA 1MW3A 1JFXA 1FP9A 2ESCA 1CXFA 2XVPA 3SEPA 2YL5A 5GNZA 1U30A 3CPUA 1E56A 3VDAA 4UFKA 3GNOA 4PMZA 4D6FA 1E4MM 3PZ9A 2VZVA 1ODUA 5DO8A 5M17A 5DEZA 3VGEA 5IHRA 3ARVA 1E1EA 2BVYA 4XV0A 3RJYA 3QHOA 1UOKA 2UY3A 1W3HA 1WNOA 3FW6A 2UY2A 1HP5A 4MDPA 4P8XA 4AZ5A 3T0DA 3DHUA 2ZICA 4AIOA 1WZAA 2ZUVA 1CLVA 1LL4A 1DTUA 2VX4A 2HISA 5EBAA 1GUVA 3VMPA 3POCA 2DIEA 3IAQA 2E9LA 3WEOA 4B16A 3NSMA 5HOSA 1VFUA 5ABHA 4P7QA 3AYSA 4W89A 2Y4SA 2W5FA 5ABGA 4AY1A 8CGTA 3WNNA 3AHTA 2YDQA 4PUEA 3L4XA 5A6LA 1Q6EA 3GTNA 3PTMA 2DSVA 4ZXLA 3G6MA 1B9ZA 3WH9A 2VZSA 4CUCA 3WL1A 4UOQA 3FY1A 1ODZA 4KWUA 3PZMA 4PEEA 5I23A 3CIVA 3TTYA 3MUY1 3VGDA 1C3FA 4GZJA 4C7DA 5A94A 3CO4A 4Q22A 2CPUA 3WH8A 4GQRA 4DWSB 4W88A 4HA1A 3WDHA 3K8LA 4AD5A 3DHPA 1CPUA 2Y2WA 4TOQA 3WNMA 2A3BA 4XUYA 5CLWA 2VR4A 3U7VA 1R7OA 2CHNA 1PX3A 3AFBA 2PWGA 2YLLA 2X05A 3EMCA 1GQJA 3SURA 1XSKA 3O2LA 4CVUA 2CETA 4MNKA 5A8QA 1H1NA 4ZE5A 2G3JA 1HL9A 2PWHA 4HPGA 4DWSA 1WAWA 3A6OA 3CZGA 5I79A 3VILA 1K9DA 1KBKA 2QLYA 4MJ4A 3KL5A 3OGVA 1B31A 4V27A 3N11A 1MVYA 1R85A 2J8GA 4UFLA 3W27A 2WPGA 3KL0A 5FKYA 2XM1A 1V3MA 1KCLA 2D3NA 4J3WA 5BXRA 3HN3A 3RPMA 1VEMA 2DEPA 1GOQA 1J12A 4AEEA 1IV8A 3GM8A 2ZX7A 1HVQA 1AVAA 2E4TA 1UR4A 3WH7A 4TVCA 4JIEA 4LXFA 4RE3A 2W63A 3AHVA 4DUVA 1MQPA 4KGLA 1US2A 3VD3A 2PBGA 1FH8A 2XTKA 2GJRA 3IJ9A 4IISA 1RH9A 3T0BA 4P8WA 1OINA 1KGWA 1JI2A 1G94A 1U2YA 3I3EA 3MV01 1AQMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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