4ZXLA

Cpoga d298n in complex with drosophila hcf -derived thr-o-glcnac peptide
Total Genus 233
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
233
sequence length
579
structure length
579
Chain Sequence
NQVLVPNLNPTPENLEVVGDGFKITSSINLVGEEEADENAVNALREFLTANNIEINSENDPNSTTLIIGEVDDDIPELDEALNGTTAENLKEEGYALVSNDGKIAIEGKDGDGTFYGVQTFKQLVKESNIPEVNITDYPTVSARGIVEGFYGTPWTHQDRLDQIKFYGENKLNTYIYAPKDDPYHREKWREPYPESEMQRMQELINASAENKVDFVFGISPGIDIRFDGDAGEEDFNHLITKAESLYDMGVRSFAIYWDNIQDKSAAKHAQVLNRFNEEFVKAKGDVKPLITVPTEYDTGAMVSNGQPRAYTRIFAETVDPSIEVMWTGPGVVTNEIPLSDAQLISGIYDRNMAVWWNYPVTDYFKGKLALGPMHGLDKGLNQYVDFFTVNPMEHAELSKISIHTAADYSWNMDNYDYDKAWNRAIDMLYGDLAEDMKVFANHSTRMDNKTWAKSGREDAPELRAKMDELWNKLSSKEDASALIEELYGEFARMEEACNNLKANLPEVALEECSRQLDELITLAQGDKASLDMIVAQLNEDTEAYESAKEIAQNKLNTALSSFAVISEKVAQSFIQEAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title A mutant O-GlcNAcase as a probe to reveal global dynamics of protein O-GlcNAcylation during Drosophila embryonic development.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase/peptide
source organism Clostridium perfringens (strain atcc 13124 / nctc 8237 / type a)
molecule keywords NAG-PRO-SER-THR-ALA-Thr-O-GlcNAc containing peptide from dro
total genus 233
structure length 579
sequence length 579
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2015-05-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 4zxlA03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4zxlA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 4zxlA01
3BAIA 2WPGA 3WH9A 1GCYA 1BFNA 4OJYA 4GZEA 4HPHA 2WBGA 4FMVA 1GQIA 1I75A 1V6XA 2YL5A 2JEPA 2Y5EA 4BQ2A 3W81A 4KRTA 1C7SA 2OLHA 3VIGA 3WBAA 1OGGA 3W26A 1TE1A 5A3HA 4XZWA 2A3BA 1O7AA 3CZ8A 1V6VA 3NSNA 2DSKA 3GBDA 3BAYA 3ARSA 4A3HA 2YL6A 2VQUA 3A4WA 3CHFA 3JUGA 3NJ3A 5E70A 5HPCA 4MJ4A 2Z1KA 1ESWA 1UH3A 2YL8A 3VGDA 3AIEA 3VILA 4UOQA 4DWSC 4DUWA 2VI0A 4BF7A 3LMYA 1UKQA 5JBDA 3OZOA 1JZ7A 1CENA 3GXDA 1E43A 4AZCA 4PMYA 3KL0A 3CIVA 4J3SA 1C90A 4PMRA 1X1NA 4C7DA 1G5AA 2VX6A 2X09A 4TVDA 3AS2A 4QCFA 1XSKA 4AYSA 1VAHA 3CZJA 3GH7A 5CPSA 5CG0A 1J01A 1V03A 4B9ZA 1GVIA 1GHRA 3WF3A 4D6DA 5E0CA 4BA0A 1HJVA 1V6YA 3TTYA 3OB8A 1J0YA 1KCLA 2EPNA 4ACZB 1G9HA 2BHUA 3D5HA 2PBOA 1AQMA 2UY4A 3CMGA 1HJSA 4W8BA 1PIFA 2RGLA 2VRQA 3ARTA 4D6CA 3AHZA 2J7FA 2OYLA 3VOCA 2YDRA 3MMWA 4PMZA 2WAGA 4LXFA 4UFJA 1HX0A 5GNXA 1JNDA 1E4NA 2VL4A 4W87A 1XC6A 4AIOA 1TA3A 2Y4SA 4AEFA 5A69A 1EQCA 5A8OA 1J0ZA 1MFVA 1KCKA 4J3WA 4UOJA 1OB0A 2JF6A 2WB5A 1LJYA 2X05A 1WDRA 2JIEA 1TMQA 1G94A 4U2YA 1PBGA 2GK1B 1GW1A 4WSJA 1OSEA 1OIFA 1K9EA 2ZWYA 1B3XA 1XD1A 2ESCA 2VURA 1B3WA 1W2PA 4AC1X 1OD0A 3VGFA 2CBUA 4WKFA 3QGVA 1BSIA 4W8LA 2E9MA 4YHEA 2V38A 5FIPA 3SUUA 3L4WA 1XSJA 3L4YA 3QHMA 1DP0A 4MB4A 1PX3A 1MXDA 4GI8A 1V0MA 2DH2A 4HMEA 4P8XA 2VRJA 3ARRA 4QLJA 2ZX6A 4GINA 1GJWA 1CXKA 1LWHA 2YIHA 1E4LA 3ALGA 3HMCA 1JFHA 4AZ7A 2VCCA 1CXFA 4WJXA 2ZUVA 3WQ5A 4TX8A 2BY2A 2WLZA 3UR7A 1GZJA 1UQYA 2W63A 4D1JA 1GOOA 1HKJA 3M07A 2CERA 1DWAM 5JBEA 1ISYA 5BXSA 4H7VA 2FHFA 2WHJA 4EANA 5CGMA 1MXGA 1YQ2A 2GFTA 4AZGA 3AZSA 3RM8A 2CIPA 2V3EA 3POCA 1CGXA 1E55A 3AIUA 4Z2HA 2PWFA 4WKHA 4B9YA 3F5JA 4CD4A 4AWEA 3WH5A 4ZE4A 2D22A 3VMOA 5EBAA 1BYBA 3VMNA 2NSXA 3LPFA 5LA0A 2OSWA 4CCDA 2GUYA 1MYRA 1B30A 1I1WA 2DT1A 3EDDA 4D6IA 2VC9A 5IFTA 1UZ1A 1BAGA 5I23A 3PZMA 4ACYA 3ARUA 3VX0A 1D7FA 1E71M 3N11A 3VGBA 1ZU8A 4OIFA 1BYCA 2X8RA 3NUKA 2YA1A 3RDKA 4AIUA 4U2ZA 1E6PA 1EHAA 1H09A 4D6EA 1CWYA 3MU7A 3I3BA 1NOFA 4WK9A 4M24A 1UH2A 3ARWA 4OUEA 4BQ3A 2QLYA 3AMGA 4PTVA 5D9OA 4YN5A 3ZSTA 4W93A 1H5VA 1NWSA 1TG7A 1CDGA 4W5ZA 1NOWA 4GI9A 3WNNA 1D3CA 2FHCA 3EMZA 2F2HA 1H1NA 3KE0A 3L2LA 1WAWA 4CD8A 2X1IA 5KEZA 3KEHA 1IV8A 2EPLX 4BS0A 3W27A 3WH7A 2XVKA 2D3NA 1R8LA 4MB1A 1OWQA 2BHYA 4PMOA 5A6BD 4CN6A 4C7FA 3QHNA 3PZNA 4MNJA 1CPUA 1K9FA 1DTUA 3ARXA 4UZUA 1UKPA 2HISA 3A4AA 2D24A 3WUEA 3CMJA 2GK1A 3K8KA 2ZXQA 3DYOA 4JL1A 1TVNA 1EOMA 3EDKA 2FHBA 4P7LA 4PTWA 3THCA 1AQ0A 2VZVA 1FA2A 2QF8A 4AW7A 2YLAA 4HA1A 3RM9A 3OBAA 4ATLA 1ZBCA 4W85A 4F79A 1J0IA 1UR2A 3RM4A 3VD9A 2XWEA 3SCTA 2C8NA 5AYIA 1RP8A 3W4RA 2WVSA 5BRQA 4V27A 4TOQA 3WNLA 1AMYA 2XVLA 4W88A 3TONA 2WHMA 3W24A 2J7DA 1H11A 3L4VA 5I78A 1HVXA 3BMVA 4BQ5A 1V3JA 8CGTA 2BXYA 5ABFA 3VKKA 2J8FA 2A3HA 3VINA 3MO4A 3VM7A 1BYAA 5A6KA 3CUFA 3T2QA 4IPLA 4FK9A 2F61A 3VVGA 1JDAA 2D0HA 4LYRA 1AQHA 2XIIA 3AHXA 3W0KA 1FP8A 3QR3A 4KRUA 4KWUA 4A3YA 1W1TA 1PX4A 3L4TA 1E6ZA 2CESA 3ZSSA 1KGWA 3CGTA 4R5EA 4OOZA 1DWHM 4AZCB 3WDQA 1BYDA 1ZL1A 1ZJBA 1W3JA 2CETA 2EPMX 3VIJA 2DEPA 3A6OA 4PYSA 4AD4A 1KXHA 1V3KA 3AZRA 3L2MA 5DF0A 4NI3A 4U3AA 3MKKA 2WCSA 4FLSA 1UA3A 1H49A 1LWJA 3BCFA 3A3HA 1GOQA 2Y8KA 2PBGA 1NM9A 2WNWA 1H41A 1UWSA 5CZKA 2YA2A 2ZOXA 4PTXA 2VZUA 4LQ1A 4J27A 1JDCA 1E0VA 1UR9A 3WQWA 4UTFA 2J79A 3WIJA 1FHDA 1ITXA 3K4AA 2J75A 4M80A 4UNIA 3VD4A 1E9LA 2FGLA 4W8AA 5HDRA 1A47A 2XFRA 4AZ6A 2YLLA 3VNYA 1E70M 4MNKA 1Y7VA 1JL8A 3POHA 1TA3B 4J3XA 1V0NA 1BLIA 1ECEA 1GOIA 1P6WA 3W6MA 4E8DA 1JYNA 1WPCA 4AD5A 1JZ3A 1E0XA 4Z2LA 1V02A 1C8YA 1BPLB 3WEMA 2E40A 4JCMA 1QNPA 3PZUA 3SCWA 2Y2WA 1FH8A 4J7RA 2GJXB 1UD6A 3AI0A 4W84A 3WF1A 2WC4A 3FXYA 1UUQA 2OSYA 1W3LA 3T0DA 1W9DM 2CBJA 1HL8A 1M04A 4YPJA 1U30A 3AQUA 1YHTA 1JIBA 2V3GA 3RPMA 4MADA 1VF8A 1V08A 4QDMA 5FD0A 2UY5A 4MNMA 3OLDA 2WYSA 3SURA 1XH1A 3PZGA 2FDMA 2XTKA 1NOUA 4AZ5A 4GI6A 3WUBA 1JFXA 2ZUWA 1J18A 3M7SA 2BV9A 3MANA 4TXEA 2ZX7A 3S2CA 1JI2A 3MSGA 2GSJA 4UFHA 3BCDA 1E5NA 1L0PA 4H8HA 1QBBA 2BHZA 2XWDA 1HIZA 2O9TA 3WN6A 1EO5A 3O2LA 3NCOA 4JHZA 1NQ6A 3NIYA 4KGLA 1CECA 2Z1SA 4JKLA 3WF0A 2A3AA 1OBAA 1J0JA 3CO4A 2GDVA 4J28A 1H3GA 3ZJ8A 1QNQA 2CHNA 4JAWA 3SCUA 3UG4A 4MAVA 3CZGA 2ZUMA 1I1XA 2WWCA 1S46A 3ZMRA 4E2OA 4WLCA 3VNZA 4GO8A 3N13A 1M03A 2ZIDA 3BC9A 1BTCA 2NT1A 4H2CA 2VVNA 5A1AA 2W62A 3AS0A 1DWJM 3MMDA 1UYQA 2D3LA 5HPOA 1QI4A 3VIHA 1UR0A 2VQTA 3ZQ9A 2G3NA 1ISVA 1IZJA 1UD2A 3AFBA 5I77A 4JIEA 4PMDA 1U2YA 1B3VA 3FHQA 4W7WA 1C8QA 2EJ1A 2ZXAA 3GTNA 2VTFA 3DYPA 2JEQA 4QP0A 3SCRA 2VT0A 1C3FA 2DIEA 2GJRA 1R86A 1UWQA 2FGZA 4AMCA 4ZXLA 5A8PA 1MQQA 1EIBA 1PZ2A 1B0IA 1E5JA 1HJXA 3N1AA 1WB0A 4PSRA 1KWKA 1K9TA 5DT7A 1JDDA 1J10A 3VUPA 3WNMA 2AAAA 7CGTA 5IFPA 1W91A 4GQQA 2J25A 1UD3A 2WZEA 3AIWA 3VIOA 1V3IA 2W66A 5A2CA 2PF0A 3GM8A 3LPPA 1H4PA 5A6SA 5M3WA 1AVAA 4A4AA 2ZUSA 2VRKA 7TAAA 2WMJA 2D20A 1JI1A 1EDQA 2GVYA 2DSVA 2FH6A 4JL2A 2CITA 5HBFA 3A4XA 5A6AA 1MVYA 1OCQA 3CLWA 3KWXA 1CLVA 2V5DA 3N18A 3CTTA 2XHYA 1E6RA 3BXWA 3WQ6A 3EBVA 3T09A 3FAWA 2WCAA 1US3A 4AZBA 3U5YA 2WSKA 4CU6A 2VJXA 3AMCA 5GPRA 1FFRA 1JF5A 3VIMA 1V3LA 5LA2A 2IUZA 4PUDA 1OT1A 3BSGA 1IZKA 4PMVA 3GH5A 1TUXA 3WEZA 3MUZ1 4AZHA 2PB1A 4ML4A 6TAAA 6CGTA 3IAQA 2GJXA 1MWOA 3ZIZA 5A95A 2CCRA 1MW2A 1BGAA 5IHRA 2J4GA 4GO9A 3OIHA 1R85A 3VD5A 1CBGA 3UETA 5I0DA 1V3HA 1EOKA 3DECA 1XV8A 1KR0A 2IXUA 1E72M 4PSPA 2YJQA 5D9NA 1KQZA 2EPOA 4ZEPA 2OYMA 3VD3A 1HJUA 3S6TA 3AICA 5E09A 3ZT5A 3GNOA 3G6MA 1HKIA 1E40A 3ALFA 1QVBA 3B9EA 3T2PA 4WSKA 5ABFB 1DEDA 5BXRA 4X9YA 2ZX8A 1CXHA 1MQPA 2ZICA 1CTNA 2WVTA 2XSAA 3WF4A 1QPKA 4HA4A 1OT2A 4CU7A 1E4MM 1UWTA 4R27A 4C7GA 4M81A 1BQCA 2D0GA 2XSBA 5JIWA 4M56A 3OGSA 1ZS2A 1QW8A 1FHLA 3PZTA 1JYXA 4BZYA 4B16A 2WKLA 2XYLA 1GQJA 4PMNA 1GPFA 3GNPA 4UR9A 3VGHA 2OWWA 1LL4A 1UD8A 1TCMA 1XH2A 5HXMA 1KXTA 2DT2A 3LPGA 3BSHA 3EDEA 2E0PA 1W1YA 1OD8A 1C91A 3WD2A 3THDA 1UKSA 2WC7A 1GJUA 3ZJ7A 1IT0A 5LYRA 1O6IA 4UCFA 5I6SA 2J7HA 3OLEA 3AYRA 1EDTA 4ZENA 4W7UA 2XPKA 1LG2A 2O9PA 3BLPX 3WENA 2E8YA 2G3MA 1BVZA 1VFUA 4OZOA 3PTQA 5GQBA 4ATDA 2NW0A 5A6LA 1E6NA 5JUVA 3VD7A 1F4AA 4CD6A 4ZXOA 5KZ6A 2CBVA 1M7XA 3EDFA 4AXNA 2E3ZA 3NYDA 3CZLA 1B3ZA 5GNYA 2XVPA 3BMWA 1BG9A 1UQZA 5FCZA 2CHOA 1J12A 4LX4A 3AISA 5ECUA 3ZO9A 3TTQA 3L4XA 1ZB5A 1HKMA 4IPNB 3IK2A 2VCBA 4KH2A 1C92A 1E73M 4UFKA 1HF6A 5DEZA 3WMSA 3VDBA 2O9OA 1E1EA 1JF6A 4LPCA 4HOXA 2W61A 3W38A 3AYSA 2X0YA 4D6HA 1UZ4A 3A47A 3WNKA 2ZUNA 2IXVA 3K4DA 4BQ4A 2Y8VA 2A3EA 1V3MA 1PEZA 1E6SM 1SFSA 3F4VA 2VNCA 1HP4A 3GXIA 1M01A 3SIMA 1HJQA 1VBRA 1CYGA 4J3UA 1VEPA 5A8QA 1UWIA 4QAWA 4P8VA 3UERA 4CKQA 5ABGA 1U33A 1VB9A 3UG3A 2BS9A 1FP9A 1W2VA 1E4IA 1GHSA 3WDIA 1M53A 3PTKA 4JFVA 3VIKA 2XM1A 5CQ1A 1QOXA 3AZTA 1PIGA 3T0AA 4HZ6A 5D9PA 1VIWA 5BXTA 1ISXA 4QCEA 1OGSA 1GORA 4JZ5A 3E1F1 5CSUA 5A6MA 1F4HA 3BH4A 4GQRA 3CUIA 3SCSA 3CHEA 4J3VA 5ABHA 1HJWA 4M29A 1TVPA 2XM2A 1JXJA 4HZ7A 3T2OA 4UFMA 4LYQA 2QMKA 4P7NA 5HNNA 2JIWA 1LF1A 3AS3A 1KQYA 1W9XA 1WDSA 2XFFA 3AS1A 2D23A 2UY2A 4OOUA 2OSXA 1QI2A 1QNSA 2WLYA 2B31A 4EE9A 5A6BA 4HTYA 4X0NA 4UZSA 4D6FA 2WK2A 1NWTA 3U5UA 4CU8A 3WQVA 4CGTA 2WSPA 3VM5A 4F9JA 3VPLA 1PAMA 1BG4A 1GONA 3W37A 1VEMA 1QHOA 1W1PA 1KFWA 1W9PA 1UR4A 3CZEA 5FL1A 2AMGA 3AHYA 3N15A 4XUYA 3WELA 2VR5A 3WEOA 1Q6GA 1EDGA 5D9MA 3MSDA 4TVUA 2DGAA 2CPUA 2DT0A 4PMXA 3FW6A 5M03A 1GOKA 1J0HA 1W9VA 1XYFA 2WMGA 2QMJA 3CBWA 1WZAA 2J78A 3WQ8A 3QHOA 1MW1A 2W5FA 3WMCA 2BVYA 4MB5A 3WUGA 3SUTA 3OGVA 3AIQA 1KWGA 3NDYA 3WL0A 3GH4A 4AD3A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 3BAI A;  2WPG A;  3WH9 A;  1GCY A;  1BFN A;  4OJY A;  4GZE A;  4HPH A;  2WBG A;  4FMV A;  1GQI A;  1I75 A;  1V6X A;  2YL5 A;  2JEP A;  2Y5E A;  4BQ2 A;  3W81 A;  4KRT A;  1C7S A;  2OLH A;  3VIG A;  3WBA A;  1OGG A;  3W26 A;  1TE1 A;  5A3H A;  4XZW A;  2A3B A;  1O7A A;  3CZ8 A;  1V6V A;  3NSN A;  2DSK A;  3GBD A;  3BAY A;  3ARS A;  4A3H A;  2YL6 A;  2VQU A;  3A4W A;  3CHF A;  3JUG A;  3NJ3 A;  5E70 A;  5HPC A;  4MJ4 A;  2Z1K A;  1ESW A;  1UH3 A;  2YL8 A;  3VGD A;  3AIE A;  3VIL A;  4UOQ A;  4DWS C;  4DUW A;  2VI0 A;  4BF7 A;  3LMY A;  1UKQ A;  5JBD A;  3OZO A;  1JZ7 A;  1CEN A;  3GXD A;  1E43 A;  4AZC A;  4PMY A;  3KL0 A;  3CIV A;  4J3S A;  1C90 A;  4PMR A;  1X1N A;  4C7D A;  1G5A A;  2VX6 A;  2X09 A;  4TVD A;  3AS2 A;  4QCF A;  1XSK A;  4AYS A;  1VAH A;  3CZJ A;  3GH7 A;  5CPS A;  5CG0 A;  1J01 A;  1V03 A;  4B9Z A;  1GVI A;  1GHR A;  3WF3 A;  4D6D A;  5E0C A;  4BA0 A;  1HJV A;  1V6Y A;  3TTY A;  3OB8 A;  1J0Y A;  1KCL A;  2EPN A;  4ACZ B;  1G9H A;  2BHU A;  3D5H A;  2PBO A;  1AQM A;  2UY4 A; 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