2HYXA

Structure of the c-terminal domain of dipz from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
333
structure length
333
Chain Sequence
GAMEIREQLNLGGIVNAQNAQLSNCSDGAAQLESCGTAPDLKGITGWLNTPGNKPIDLKSLRGKVVLIDFWAYSCINCQRAIPHVVGWYQAYKDSGLAVIGVHTPEYAFEKVPGNVAKGAANLGISYPIALDNNYATWTNYRNRYWPAEYLIDATGTVRHIKFGEGDYNVTETLVRQLLNDAKPGVKLPQPSSTTTPDLTPRAALTPETYFGVGKVVNYGGGGAYDEGSAVFDYPPSLAANSFALRGRWALDYQGATSDGNDAAIKLNYHAKDVYIVVGGTGTLTVVRDGKPATLPISGPPTTHQVVAGYRLASETLEVRPSKGLQVFSFTYG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of the C-terminal domain of DipZ from Mycobacterium tuberculosis
rcsb
molecule keywords Protein dipZ
molecule tags Unknown function
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 92
structure length 333
sequence length 333
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF17991 Thioredoxin_10 Thioredoxin like C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.260 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Galactose-binding domain-like 2hyxA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2hyxA01
1J84A 2B1KA 1TU8A 4K8MA 1EZKA 1AAZA 5B4XA 1ZCPA 4OWYA 1BX9A 3A2XA 5JUVA 3O6TA 3ZM8A 1GSUA 1RW1A 3WQBA 4KE3A 2PGTA 4BXSV 1F4AA 1YZXA 1MPXA 1OC3A 4IKHA 5AN1A 5ECQB 2CDPA 2LRTA 4WETA 4POLA 2P0GA 3L9SA 4MF6A 2CQ9A 1R64A 2HSHA 1GQPA 3LG6A 2A4VA 5CRHA 1JZOA 2ZCTA 2DLXA 2LQOA 1ON4A 2M80A 4KI5M 2TRCP 3TKSE 1PQNA 4I97A 5ECMB 2VC9A 4DUWA 1K0MA 1U3IA 2V4VA 1J0FA 1TI1A 2B1LA 4BWSA 4LL4B 1A0RP 4TR0A 1K3YA 3UBLA 2VZPA 5IMVA 2R2JA 1UMIA 3C71A 4BK5A 3RPNA 3WGXA 1QFNA 3Q18A 4JKKA 2V6KA 2HRFA 2OA7A 3WD6A 3RBTA 3F63A 4IJIA 1PX7A 1SJIA 1TK5B 1JLVA 2H1GA 4CW9A 1W99A 2HLSA 4IQAA 4MCUA 4ZBDA 5J4UA 1YKCA 2VQTA 4BL7A 3FEUA 4OO5A 1PMTA 2NPBA 4EVMA 2YFUA 1DE2A 3L9UA 2QKEA 2LNTA 1GSQA 4GQFA 1J83A 1TTZA 3P7XA 5ECPB 3RAZA 1ZL9A 1GTUA 4MADA 3KH7A 2LNSA 1ML6A 4K7NA 2QBXA 1PKWA 4WBJA 2LV3A 1B8XA 3IDVA 5EJZB 4BK4A 3HOBA 3I2GA 3DYOA 1SU9A 4MDCA 2H76A 3HXSA 5F05A 1YY7A 4OYUA 5HXMA 2HZEB 4OZOA 1OF3A 2B6MA 1A24A 4QQ7A 4KA0A 4AGSA 2JD9A 1J9BA 3CYNA 3P2AA 1S3CA 4HU7A 1UN2A 5IMCA 4MABA 4LMVA 1UXXX 4NHZA 4K6XA 6GSXA 3BBYA 5D73A 1Z6NA 3MNGA 3UMAA 2WAAA 2AJQB 3EYPA 5LCZA 2E26A 2IJYA 4IS0A 1H6XA 4G9HA 4Q5FA 4P02B 5A1AA 2C0EA 3ACHA 1OD3A 5DQSA 1CX1A 2PU9C 1RK4A 4IHUA 5IIZA 5DCHA 3UOMA 3SEEA 4ECJA 4ULXA 1H4OA 3TOUA 2VQUA 2BGOA 2IMIA 3ZLPA 2IMEA 1GULA 4QB6A 3MAKA 3GSTA 3EVIA 6GSTA 5DVBA 3IE3A 1DE1A 1Z5YE 4AG4A 2VCWA 3BCIA 4MJBA 1XVWA 3FK8A 4K1FA 1UWWA 2W9XA 3I97A 3EYTA 5H5SA 2VZVA 2EIRA 4GRFA 3CTGA 2LJKA 1OF4A 2WO3A 3I69A 2QQNA 3IAS2 3LEFA 3I3BA 1AIUA 1GLQA 2AB6A 1TJDA 3FR9A 1K0NA 3CQOA 5G5FA 4TXVA 2E32A 1H75A 1XNTA 4GSTA 3J7Yb 2C0DA 1M9AA 3PUHA 2NBSA 3M0FA 5JXIA 3HHVA 4WKWA 2V5DA 4G19A 4KB3A 3WF1A 1OC9A 2YCDA 2F9SA 2VL4A 3KTBA 3FHKA 3C7MA 4CVUA 3VWXA 2MBSA 2C0FA 3TRXA 3T2OA 2VCAA 5DAKB 1TK0B 4BJ0A 1ILOA 2H70A 1WE0A 2BMXA 3G9BA 3WNMA 2WB9A 2PERA 4POMA 1OYJA 3DIEA 2WBKA 4KCEA 1TKDB 4MMMA 1WOUA 2JZSA 3UNPA 3MV01 2H01A 5ECRB 3TJKA 3VD5A 1EP7A 1SK1A 1Z9HA 4DEQA 1K0OA 1EGRA 2JU5A 1XW9A 2IIYA 1GNYA 2YZHA 2H66A 3KD0A 4MPFA 3HVSA 4EDZA 4MOAA 2QC7A 3LWAA 1QUWA 3KEBA 2GZZA 2YC4A 3KH9A 4KSMA 4PQIA 3DEXA 4Q5NA 4RI6A 3LEKA 2X64A 2ALBA 1ULPA 4JX0A 1BJXA 12GSA 3EU3A 4N0ZA 1SHWB 2W87A 3O76A 5GSTA 2YWIA 1CQHA 3GGLA 3C8XA 3QR6A 3HVXA 5D96A 1UY2A 3I2HA 2YPMA 3P6BA 4E8HA 2R3XA 4HG6B 3GHAA 1PX4A 1F4HA 1FB0A 3CRTA 3GDBA 4FIWA 5LA0A 1BAYA 3M8NA 3GXUA 1PD21 3IHQA 3HNYM 2VL2A 3QPMA 4K0NA 3ZYWA 1SK0A 3IRAA 1GP1A 3T0AA 1UYZA 1T00A 4PXOA 3HCZA 3OG2A 1F3BA 4GWRA 1WKYA 3EU4A 4K9ZA 3DYPA 2CDOA 2CVDA 2F8AA 1AW9A 5HR0A 1F2EA 3CMIA 3MDKA 2V1MA 1ULOA 1OC9B 3FL7A 1USBA 4PNFA 2J1RA 2V41A 3CZJA 4XS1A 4UAPA 1JZ6A 1MDIA 2C4XA 1GRXA 3CXGA 2O7KA 2J1TA 4OCFA 3BJ5A 4CU8A 3MBWA 3G7IA 4P00B 2B9VA 5G30A 1X5EA 4RYDA 5G1KA 4D73A 3ACGA 4EE0A 1TG7A 3TDGA 1SKSB 4XS4A 5HPOA 5LD0A 1XCCA 4KDYA 5J1XA 3GKNA 3HPNA 5F06A 2AV4A 3IIIA 3QOUA 3KJYA 3GH6A 1PMHX 5IQYA 5LA1A 1UZ0A 3DVXA 4G10A 2VCXA 2YNXA 1TDIA 1O8XA 4P3YB 2VIMA 2X09A 4H86A 1XW6A 3IAPA 2B7KA 2LRNA 2VCVA 5D8IA 3GX0A 4J56E 4KX4A 5CREA 2VZRA 1YEXA 4L0UA 2F3MA 3GX8A 2I4AA 4X43A 1JYNA 3LQCA 5EPFA 1K3LA 2WZ8A 4LMWA 4ZBAA 4ARXA 2CV4A 4Z2AA 3ME8A 4RI7A 3LEGA 5B8BA 1M2BA 2EIDA 1SJZA 5CRGA 2VOTA 2TRXA 1AC1A 1QGVA 2OBIA 2X8CA 4EUYA 3M9JA 1TK8B 3G7YA 1JYVA 3IAM2 2CZ3A 1ERVA 2VM2A 3W8SA 2VZ1A 4MZWA 1SJ6A 5AISA 1VGLA 3CRUA 1X9WB 4XRAA 4BWQA 2VO5A 5LCWL 3LPGA 1GUHA 4ZBBA 3D3AA 3A2VA 3KCMA 5C00A 4QB2A 1GH2A 1GUIA 2XOMA 2PN8A 3ACIA 2W92A 2DBCA 5D9TA 2PWJA 4F9ZA 1WP0A 3MV11 1M0UA 1UC7A 2DJ2A 1MD3A 5IMAA 1XW5A 3QFAC 2N5BA 5CNWA 2GQLA 2WYSA 1NAEA 2GZYA 1V98A 1W4VA 2H72A 4ZZ8A 2QSIA 4MJEA 1SKRB 1OAZA 5KN1A 4D73B 1ZYEA 3M3MA 3MO4A 4XS4B 3FHAA 3TJFA 3NZNA 3PGTA 1K0AA 2YFZA 2GS3A 5KEJA 4LLRA 4V1Ag 2IMDA 5J41A 3EC3A 1GSFA 4GWIA 4QX3A 3GURA 4O5RA 4I5QA 2GQKA 3ZMKA 2VO4A 4YQMA 5GZZB 2I1UA 4OCEA 4MH3A 1GSSA 1L7RA 4DVCA 4FO5A 4HJMA 3IR4A 5DDLA 3C7GA 2RM5A 3VWUA 1KTEA 2L57A 1F3AA 1CIYA 3VWWA 2VMCA 3H4KA 1T8EB 2C3TA 2KUCA 2XPDA 1EEJA 4YPJA 4ILFA 5CZKA 2PPTA 2JSZA 3BCKA 2W47A 3GKXA 4DSSA 5DJLA 1E6BA 3DD3A 4IP6A 4X1UA 5DQYA 5G5EA 1J08A 2JADA 4OFMA 3JCML 1PSQA 1R5PA 1WRYA 2YOIA 3EB7A 5EVOA 1X9MB 3RHCA 3VDBA 5F0GA 2ORXA 4HOJA 1FVJA 3CBUA 2X05A 2GVPA 5AIVA 4BDVB 1JZ5A 2P31A 1OE8A 3LPFA 2J1VA 2E0QA 2L6DA 4PF1A 5B7CA 3UARA 4DXTA 1GU3A 3VDCA 3OEBA 2K6VA 2FWGA 2YP6A 2CT6A 3W8JA 2Z9SA 2RUFA 3L78A 1SDDB 5B8AA 2VL3A 3H8QA 2WS2A 2JSYA 1B4PA 4IUGA 3HY2A 1G7EA 2GTUA 5IJRA 4XCSA 3PH9A 3CIHA 1NHOA 1X5DA 5DPNA 2JL4A 1V2AA 5J9CA 1GTIA 3PINA 4IQ1A 4POBA 1NKGA 4XURA 1A0FA 2CX3A 2TIRA 4FYUA 2FNOA 2W1UA 4GSNA 2EIQA 2XPEA 3IC4A 3VD9A 2VMEA 3WT2A 2VCBA 2DC5A 1NSWA 2A2RA 2LQQA 4CDOA 1UMHA 4EL1A 4PURA 2ON5A 1OH4A 3A23A 4O7HA 2BERA 2G0FA 2GSQA 5ECHB 4MJCA 4F0CA 4FYCA 2FUG2 2PQSA 3QAGA 1XZOA 2YWNA 3RDWA 5C04A 4QAWA 2C3NA 4E8CA 5HFGA 2C4JA 4GCIA 1TOFA 4D8MA 3GL3A 4YQVA 4NV5A 1F37A 3ECQA 1HNAA 1QK8A 4OFTA 2BGPA 2L4CA 1A8YA 3SKJE 4JEDA 2CAQA 4ZIJA 4A41A 4QX1A 2VR4A 2CZ2A 1ERWA 2I81A 2PBJA 2QQIA 5D9WA 5D9XA 2VL2C 3NNGA 4JKLA 1G7OA 3FW2A 4A42A 4IN0A 4ZY9A 4TR4A 4N11A 1U6TA 1JZ2A 3C73A 3EINA 3CZUA 5IPGA 18GSA 1ZZYA 5JCWA 1W9WA 3K4ZA 2GLRA 4QB1A 3DYMA 4M4RA 4GWJA 3HDCA 2IWTA 3VWVA 4KWUA 1VF3A 2XHFA 4XHMA 4PX1A 2YANA 1ERUA 4E8DA 3GH9A 1THOA 3DKSA 3WF3A 5D9VA 2L9LA 3ZITA 1MD4A 4IW9A 1R7HA 4HZ2A 3I2JA 3WNKA 1Y6EA 3FN9A 1PGTA 1DLCA 1Z7RA 5JMOA 2DIYA 3Q6OA 4MP4A 4GZ9A 1TP9A 3MUY1 5CYYA 2VJXA 1S3AA 3M9KA 4GQCA 4MK3A 3FRCA 4F0BA 4PQQA 1NM3A 3TJGA 3W5MA 5B6NA 3DRNA 2IFQA 1F6MC 4NMUA 5J9BA 3WNNA 3HJMA 3VI5A 2XQXA 1O59A 5KN2A 3GL5A 2DSAA 1DYOA 1JU3A 2Y6HA 2VD0A 4ARYA 2J23A 5CRWA 3H1NA 1I5GA 2QQJA 5F7UA 1SD8A 2C1YA 2CVBA 2H0IA 1GUMA 4UI9L 1XWBA 2BBAA 3HEIA 4DUXA 6GSUA 3IOSA 5ECNB 3ME7A 5JXGA 2VD1A 3BOAA 3SKVA 1AUCA 2H1BA 2FA8A 4YAVA 1JFUA 1QMVA 4LA1A 3NJXA 3ZTLA 3GMFA 3K46A 2MMZA 3F6FA 3FZ5A 4HQZA 3U5RE 2B3SA 5J3RA 3WEZA 3WYWA 3W5NA 2V6OA 2LJRA 1WJKA 3K8NA 4ZL7A 4V2MA 4XTSA 4KUNA 3CSHA 5DALA 2KP2A 4POKA 2W5FA 3TKPA 4LKSA 1CZTA 1GWCA 3FZAA 3LYPA 1B9XC 3QDNA 5EIYB 2B5XA 5G05L 1LNSA 2HFDA 4L5LA 4HQSA 2LUSA 4A44A 2FHEA 2IMFA 2G2QA 3KGKA 4KW6A 2H0HA 11GSA 2DCJA 2ORZA 2JZRA 2F51A 2DJ3A 1JZDA 2VZOA 1GTBA 1WWJA 3IBHA 3Q74A 4ZXEA 3SEPA 4QX0A 3ZL5A 2YN1A 2HNLA 3C8EA 5G2ZA 3EMXA 2QQMA 4F03A 1VF2A 2J9HA 1R4WA 3TKQA 4QDQA 4Z7XA 2JACA 3N9JA 2WO1A 2D2ZA 3UIWA 2EIEA 2L5OA 1F9MA 3LFLA 5COHA 2Z4FA 3VLNA 1HYUA 1O81A 1ST9A 3NJVA 3ZREA 3LJRA 1ERTA 5B6MA 1M9BA 2QQLA 2IFQB 3WF2A 2YWMA 4NV2A 3ZFLA 4UOJA 5B4NA 2DMLA 3ACFA 1A23A 1PL2A 5IFTA 2FWEA 1JI6A 2RLIA 3HVVA 3SBCA 1Z7PA 1IYIA 3FHQA 2NVLA 4TW5A 1A2MA 2K8SA 1B48A 4PUFC 3UAPA 4KGIA 3WSOA 4PUAA 4OUEA 2VTFA 1LJRA 3FYGA 2O8VB 1GLPA 3GYKA 3I43A 3WT1A 2MBTA 1W9TA 4CUBA 1P8JA 4DEVA 1M2DA 1NW2A 2CAIA 2DJ0A 3VPQA 3TRPA 2W91A 3KXOA 2DIZA 4MLYA 1XPWA 2MZCA 4I2UA 3VD4A 3BGAA 2DDUA 2HE3A 1FO5A 4DEJA 2QQOA 2OE1A 5FHIA 1EUUA 2J7MA 3HJRA 3MWHA 4ZXGA 2WZEA 3TKSA 4W50A 3C7EA 1M99A 4ZL9A 2YC2A 5DALB 5CP1A 5ECOB 2K9FA 2W3JA 1SL2B 3GFKA 4IBPA 2GDRA 2R7EB 1UY4A 1T1VA 1V57A 1FHEA 1URMA 4JU5A 2VZUA 2VAFA 1W8OA 1PRXA 4JBBA 5HQPA 5E59A 2W95A 1H6YA 1JYXA 4JKMA 4GLTA 4KMQA 4LPLA 2GT5A 1AXDA 1OVNA 3IK9A 4K0GA 4MF7A 3ZVJD 4XS6A 3KTLA 4KNDA 4ZZ5A 2FLSA 3EWLA 4WF4A 2LJAA 1XOAA 2VOCA 1S3DA 1UY1A 3JXSA 1ZYQB 3L4NA 1JZWA 6GSSA 2ID4A 2XBQA 2OKXA 4W8JA 4FI9A 1I5PA 3K4AA 3U37A 3KMOA 2VZSA 5CAXA 5C70A 1X5CA 4KDUA 1TI3A 5JXJA 1T4YA 2F8FA 2H8LA 2PVOC 2WGRA 3HN3A 3LORA 2WDBA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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