2HYXA

Structure of the c-terminal domain of dipz from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
333
structure length
333
Chain Sequence
GAMEIREQLNLGGIVNAQNAQLSNCSDGAAQLESCGTAPDLKGITGWLNTPGNKPIDLKSLRGKVVLIDFWAYSCINCQRAIPHVVGWYQAYKDSGLAVIGVHTPEYAFEKVPGNVAKGAANLGISYPIALDNNYATWTNYRNRYWPAEYLIDATGTVRHIKFGEGDYNVTETLVRQLLNDAKPGVKLPQPSSTTTPDLTPRAALTPETYFGVGKVVNYGGGGAYDEGSAVFDYPPSLAANSFALRGRWALDYQGATSDGNDAAIKLNYHAKDVYIVVGGTGTLTVVRDGKPATLPISGPPTTHQVVAGYRLASETLEVRPSKGLQVFSFTYG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of the C-terminal domain of DipZ from Mycobacterium tuberculosis
rcsb
molecule tags Unknown function
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule keywords Protein dipZ
total genus 92
structure length 333
sequence length 333
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF17991 Thioredoxin_10 Thioredoxin like C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.260 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Galactose-binding domain-like 2hyxA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2hyxA01
1T3BA 2KP2A 1TK5B 4L5LA 4NPBA 3WYWA 3IPZA 3MAKA 2DC5A 3HA9A 2YFZA 3FR3A 4ECJA 1SD8A 4X0XA 5HPOA 1E6BA 1NUKA 4OFMA 4LMVA 3LQCA 2IL3A 1NKGA 3LEGA 1IYIA 2CZ3A 3L0HA 4XS1A 4CW9A 3MNGA 3RDWA 3VPTA 2R7EB 4A41A 1XCCA 3L9SA 4HQSA 5IIZA 2JD9A 1JYVA 4PQQA 1A2MA 2X05A 2V1MA 1O8XA 4NV2A 2QSIA 3E1F1 2E7PA 1YF0A 5LA0A 3GX0A 4ML1A 3WNPA 1HN1A 1FG4A 3ACHA 2R5GA 3GXUA 3GH6A 1CQHA 2FHEA 3PR8A 3BGAA 3G7YA 3ZVJD 4EDYA 2VMEA 1G6WA 2JZSA 5ECRB 3F9UA 4O5RA 2V2GA 1TU8A 1PN9A 5FWGA 4OO5A 4ZB6A 1YQ2A 2WO3A 3KZQA 3IAQA 2VM9A 5EVOA 2LRTA 2L4CA 4TXOA 2NDOA 3VFIA 2AAWA 3CRTA 3CSIA 2VQTA 3BCIA 1TJDA 2EIRA 2PQSA 1OAZA 2TRXA 4BVXA 2KOKA 3MO4A 3EWLA 4ZBBA 1PX6A 5ELAA 3IK7A 1UYYA 3HKRA 4BK5A 2YWMA 1V58A 1GOFA 3KH7A 5D93A 2H75A 4LL4B 3O3TA 3EU4A 3K8NA 3GGLA 4OCEA 2WO1A 5J4UA 2HFDA 1TK0B 2H8LA 1ZOFA 3WGDA 2H76A 1VF1A 2B7JA 4GXZA 2PPTA 1UWWA 3HNYM 4MO3M 2GSQA 4CUBA 3C7MA 1F4AA 5LCZA 3OG2A 1C72A 2HYXA 4ECBA 2EIDA 3CSHA 4IBPA 3WF0A 2MMZA 2AV4A 3TKRA 2EIOA 2NTOA 4PUFC 1GSFA 1G6YA 3ACFA 3IOSA 3WGEA 5LD0A 3F4RA 1NM3A 3DECA 1K0DA 3ZVJA 10GSA 1HNBA 1UXZA 1IYHA 4BK4A 2JZRA 3QD9A 3IAM2 1T4YA 3BJ5A 1UMHA 4XUOA 3T08A 4KA0A 4ML6A 1SD9A 2H01A 2K6VA 2IMFA 4A42A 3HOBA 3FZAA 2VCAA 1XFLA 1PD21 1CX1A 3NZNA 5B7CA 4I2TA 2XPEA 1UVZA 4FO5A 4OMVA 1D7PM 2DLXA 4FI9A 2E2MA 5IJRA 2FA4A 4ZB8A 5A4VA 1M9BA 2RUEA 1R5AA 5AIVA 1RW1A 2GLRA 3C71A 4GZ9A 3UL3A 2NPBA 4PX1A 1GLQA 3DXBA 3Q74A 2Y6KA 1OC9B 5IQYA 4IVFA 5ELGA 4HG6B 5E4WA 5AN1A 3SKVA 4MDCA 3W5NA 2I81A 1Z6NA 3D4MA 6GSTA 2LW8A 3GNJA 3MV11 1EV4A 2E33A 1V40A 1EEMA 2C8UA 4JEDA 1KBNA 3G7JA 1J84A 3PUHA 3GV1A 1YF1A 4ZILA 2BJXA 1GRXA 4DEJA 3ZZXA 1V57A 3U5RE 4I5QA 1JZ5A 1JYXA 1SG3A 1MTCA 1JHJA 4BPYA 4GRFA 4ZIJA 1K3YA 4OO4A 2VIMA 2KD7A 1SL0B 1FO5A 2VZUA 4EC0A 1O81A 2X64A 3SWLA 3LSZA 4KSOA 3OBAA 3VDBA 4L0WA 3WNKA 1W99A 3TOUA 2WCIA 5G5FA 2H6XA 2PBJA 2JADA 2VCCA 2WZEA 5I0DA 4A44A 3WT2A 2CDPA 5ECKB 3WF2A 1EWXA 2VM2A 2LJKA 3TKPA 5JWOB 3K4DA 1ERTA 3WGXA 3DYRA 2REMA 1JYWA 19GSA 4O32A 2RLIA 2ZEZA 1I9DA 3C7GA 1MEKA 2C0FA 4FYBA 3FZ4A 2L59A 2CVDA 3RHCA 2W1WA 3TRQA 2IIYA 4IQAA 2JSYA 1JZ7A 4H86A 3KP8A 3HJMA 2WGRA 1M0UA 5CO3A 2CVBA 5IYYA 1R5PA 2W92A 2H1DA 4PNFA 4ZBDA 5EJ1B 3TJFA 1J83A 3MDKA 4K2DA 3AC0A 1B4PA 1VF3A 1L7QA 1SJZA 1K0NA 1P8JA 1JLVA 4RI7A 4YPJA 1PKWA 1H4OA 1US2A 3F63A 3EYPA 1QXHA 4GLTA 2YWNA 3P8WA 4KB3A 4MP4A 2IFQB 5DCHA 3IHQA 5HXMA 1AW9A 2VCZA 3CXGA 1U6TA 3VWVA 3GKMA 2LRCA 4M4RA 3VWWA 1NSWA 3HVSA 4EVMA 1FB0A 2GS3A 4PQIA 2EIQA 5DCGA 1GSSA 3VURA 2H0IA 2YB7A 3O76A 3SKJE 2LQOA 2JACA 3EYTA 4QL7A 2OA7A 1K0BA 1UX7A 1TRSA 2ZUPA 4ZXGA 5DVBA 4GWIA 4IW9A 4LLRA 5HFGA 3LQ7A 1ERWA 2EICA 1ZZYA 2E32A 1XW5A 5KEJA 3ZIVA 2C4XA 2CAIA 4QAWA 2DIYA 5A1AA 9GSSA 1BG5A 4V2LA 4ZZ8A 2O7KA 4CUCA 2L57A 3FHKA 5KN1A 4PUAA 1RYYA 4NWYA 1AQXA 2JL4A 4KW6A 2YCDA 3W8JA 4JR6A 3BN6A 3F8UA 5J9CA 3F4SA 1XVQA 4D73B 5DDLA 4X43A 3K46A 4DSSB 4I2UA 1RK4A 1K0CA 2E2GA 2WZ9A 2O87A 2V6KA 4DUVA 1QUWA 2WDBA 2H72A 3OGRA 4I97A 2OKXA 4MADA 4PQ1A 3VD9A 3QFBC 4CDOA 3VWXA 3HJRA 5CZKA 1OF4A 4YH2A 5D9TA 3IV4A 1JLWA 4V2NA 2ORXA 2VZSA 5ECPB 3HY2A 2M80A 3M0FA 2HRFA 2J1EA 2VMDA 2B5EA 1A2JA 4EL1A 3NJVA 2KHPA 4WBRD 2AB6A 3RPNA 3BOAA 2C3NA 3WNOA 4TW5A 2X8GA 3VK9A 5EJZB 1PMTA 1THXA 2LQQA 5DJLA 2W1SA 2VO4A 3F3QA 1ST9A 1WPIA 3QAVA 1GTIA 4L8EA 2LV3A 3TOTA 2X09A 4IGJA 4Q5FA 1GUHA 3HJPA 3UBKA 2V5DA 1YQ1A 1SJ6A 5DN2A 2CQ9A 4QX3A 4XS4B 2ON7A 1O73A 4MCUA 1JHBA 4AGSA 1BAYA 1XC6A 1SENA 3MWHA 3WD6A 3IB3A 1F3BA 4TVEA 4ZB9A 2PMTA 2X8CA 2VZVA 1B9XC 3D22A 3I3EA 4PGTA 2GSTA 1XWKA 4I6XA 2K8SA 4CU6A 2BBAA 1SYXA 2MMAA 1M9AA 2LUSA 5HR2A 2MMNA 4HJMA 3FEUA 1M99A 5D9WA 4BXSV 3MUY1 3VDAA 1GUKA 4QB1A 5B6NA 2QBXA 1VRSD 3QDNA 3UESA 1W89A 2CZ2A 3GH9A 2LTKA 4OCFA 3QOUA 4FH8A 2Y6HA 1A23A 5CAXA 3ZM8A 5JMOA 1UYXA 4G9HA 1A0FA 3T0DA 5G1KA 4MJEA 5F05A 1CZSA 4QDQA 3GMFA 4IP1A 3VI5A 2VJXA 1XWCA 1XWAA 2I3YA 1WP0A 3IIIA 2L6DA 1WWJA 1TI3A 1WCQA 4XTSA 2VR4A 2VCVA 4MPGA 2GDRA 3H93A 3HXSA 2OE3A 5INYA 11GSA 1SJIA 2VZRA 1FVKA 2NVLA 2DDUA 1GSUA 1YJ6A 3THCA 2XONA 3J7HA 1PKZA 4DSQA 2VO5A 3C1SA 3NQHA 3I97A 2H0HA 3KGKA 1B9YC 4OZOA 4V2MA 3ZRDA 4KWUA 3DKSA 4TN8A 3WF3A 4QPWA 2HNLA 4WBJA 1F3AA 5IMZA 2RM6A 6GSUA 1A0RP 3ED3A 1EP7A 3IK9A 2I4AA 5HFKA 2XPDA 5F8BA 2IPAA 1NW2A 2B3SA 2L9LA 4MJCA 4NHZA 3UARA 2JU5A 1MD3A 3C7EA 3M8NA 1SHWB 5CP1A 2IFQA 5B4XA 2YJ7A 1OC3A 1VGLA 3GURA 5B8AA 5EY6A 3J7Yb 2O89A 5A4UA 4K9ZA 1W0NA 3L9UA 2DBCA 2GQKA 1URMA 4G10A 2PERA 1Z5YE 2LS6A 5B4NA 1GTBA 5JXJA 1F9MA 4BJ0A 4MF6A 4TRXA 1PX7A 3PINA 3UVTA 2DIZA 5EL8A 3SEEA 2GT6A 2FWFA 4TR3A 1M7TA 2LEGA 4UAPA 1TXXA 3KMNA 4ZL9A 2H6ZA 4CUAA 2XQXA 3H79A 1K3OA 1PA3A 3IRAA 5B8BA 1Z3EA 5ECLB 5H5QA 4HUAA 4EUYA 2WULA 1USBA 5IMVA 4A45A 1GQPA 4ACSA 2YNXA 1UY4A 1SKWB 4KX4A 3WSOA 2WN3A 3WF4A 4XCSA 2ES7A 2N5BA 3P90A 4F03A 5JUVA 2DJ3A 4DSSA 3VPQA 1X5EA 3ME7A 2OBIA 2N5AA 1XIYA 3H4KA 5L71A 2D2ZA 3C8XA 5GZZB 1KTEA 3F4TA 1EV9A 2R6KA 4KCAA 3HHVA 3ECQA 1TU7A 5G05L 4JKMA 4W8JA 3VLNA 1TG7A 2YPMA 1XWBA 3S9FA 2BGPA 5HR3A 5IHRA 2IJYA 2FNOA 4K7OA 1YDKA 4A4AA 1JZOA 1TW9A 3LEIA 4G2EA 1Z6MA 4KMQA 1EGOA 3ZL5A 3W6GA 2RIIA 3A22A 3HJOA 2CVKA 2DCKA 2XHNA 1GOGA 2L6CA 3SEPA 1E2YA 3QAGA 4GF0A 1F37A 4TXVA 3GHAA 5CRGA 2LS5A 2B1KA 1QGVA 2JZTA 2GT5A 2W3JA 2MBTA 3ZMLA 3ERGA 3HNBM 3US3A 2P5QA 1BYEA 2WABA 2VLVA 1UYZA 3KP9A 1ZL9A 4JE1A 1S3CA 2OBKA 4TR1B 3LYKA 1T8EB 2IN3A 3LYPA 4XS4A 4JKKA 3KTLA 5ID2B 2XBQA 1LNSA 1UY3A 2B4KA 1LBKA 3TCOA 4XRDA 1K0MA 5D9XA 4XHMA 2K8VA 1HQOA 1O7UA 4OMCA 5IM9A 2VCWA 5C7GA 3WNNA 1TRVA 2KP1A 5IFPA 1K0OA 4N0VA 2QQIA 3DYPA 2FWGA 4P08A 1TDIA 3UBLA 1KNGA 1N2AA 4QQ7A 5AIXA 3ZMKA 1KGYA 3GDBA 4L0PA 2YZHA 1U3AA 3LPFA 4KDYA 3NRUA 3A2VA 4EF0A 5DAKB 3FHAA 1O8PA 1ERUA 2QKEA 3BBYA 4MZCA 3M1GA 3T2QA 3TUEA 3ZITA 3KTBA 5G2ZA 1B4QA 2WB9A 2EIEA 3GA4A 3EC3A 2VOTA 5ECMB 2QQJA 2K18A 2P0GA 3TJBA 1EOHA 3D6IA 2YC4A 4QX1A 1L7RA 1GSYA 3GTUB 3UNPA 5FT3A 5ABRA 1V98A 3K4AA 5IO0A 2W95A 3I6AA 3T09A 5GAPD 2ZEWA 1EOGA 2PVQA 1PGTA 3I2IA 3IAS2 3DWVA 1WMJA 3KM6A 4CU8A 2CX4A 5IOXA 2ZXQA 5ECQB 1FB6A 4K7NA 4O7HA 1FAAA 2C4JA 3GRXA 4KAEA 4YQUA 2M46A 4LKSA 2AHEA 5C00A 2KLXA 4WF4A 2WS2A 3I3BA 1S3DA 3QAWA 2V41A 3LFLA 2CT6A 4PT6A 2OADA 4QDSA 1TRUA 4QB6A 2FGXA 4MH2A 4N11A 3CMGA 4W4ZA 1SK0A 2KUCA 3LG6A 4IQ1A 4MA9A 3DVWA 5D9VA 2C0EA 3JXSA 4QX0A 4WR4A 1SYRA 4AAXA 3GYKA 4OMDA 1JI6A 4CU7A 4L5OA 1R7HA 2YWIA 3ISOA 3APQA 1YEXA 2BMXA 4J2FA 3A21A 3BCKA 3Q18A 1CZTA 2Y64A 1Z9HA 3QMXA 4ET7A 1X0RA 1OE7A 1UZ0A 2QQKA 4P5YA 3F6FA 1AQWA 1EEJA 4ZL8A 3DVXA 2WFCA 4POKA 1Y6EA 3IA1A 2WQ8A 4EXJA 2QGVA 4WETA 3OEAA 4YQVA 6GSSA 2GSSA 5IMAA 1UY0A 1SK2A 4XVHA 1SKSB 4NMUA 5HFIA 1KEXA 4K6XA 1UY1A 4IUGA 3DRNA 3E0UA 2G0FA 2GTUA 1JZ6A 1W9WA 6GSVA 4MMMA 3C7FA 2VZ1A 5LNKe 2Z4FA 3ETPA 5B6MA 2VD1A 3AY8A 1GNWA 4EDZA 4TR0A 2H66A 1F4HA 5DMYA 1K12A 1TTZA 2W87A 2J9HA 2HI7A 4V1Ap 1ABAA 3I2FA 1MDKA 4MLYA 3DYMA 3OGVA 2OE1A 2H1AA 2Z9SA 1GP1A 1GNYA 1R64A 1GUIA 1W8OA 2DCJA 5GSTA 2TIRA 1AXDA 3MUZ1 4J56E 1UMIA 3DEXA 2IWTA 4WR5A 5IMFA 4HU7A 1A8YA 3C7OA 1WE0A 1OKDA 4WF5A 2WAOA 3IDVA 3M3MA 1W9SA 2FWEA 4XZUG 1SKRB 4DEQA 5J5NA 3EU3A 1JZ4A 1M2DA 4JU5A 5LA1A 3TKSC 3M9JA 3RPPA 5IPGA 4MABA 3UIWA 2H30A 3VD7A 3VD4A 2YG0A 3FKFA 3QCPA 1PX4A 5JCWA 5GSSA 2W1QA 2J1SA 4TKYA 4POBA 1M2BA 3D3AA 2J7MA 8GSSA 4LQRA 2JSZA 2VOCA 4CHSA 2X10A 1EZKA 3D0ZA 4Q5QA 1PX3A 1XW9A 5G04L 3FW2A 1GWCA 5F7UA 1BQ7A 1JZDA 3EURA 2R3XA 3LE0A 4ISDA 4N0ZA 2YFUA 2HZEB 2I1UA 1NX9A 1GMMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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