2HYXA

Structure of the c-terminal domain of dipz from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
333
structure length
333
Chain Sequence
GAMEIREQLNLGGIVNAQNAQLSNCSDGAAQLESCGTAPDLKGITGWLNTPGNKPIDLKSLRGKVVLIDFWAYSCINCQRAIPHVVGWYQAYKDSGLAVIGVHTPEYAFEKVPGNVAKGAANLGISYPIALDNNYATWTNYRNRYWPAEYLIDATGTVRHIKFGEGDYNVTETLVRQLLNDAKPGVKLPQPSSTTTPDLTPRAALTPETYFGVGKVVNYGGGGAYDEGSAVFDYPPSLAANSFALRGRWALDYQGATSDGNDAAIKLNYHAKDVYIVVGGTGTLTVVRDGKPATLPISGPPTTHQVVAGYRLASETLEVRPSKGLQVFSFTYG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of the C-terminal domain of DipZ from Mycobacterium tuberculosis
rcsb
molecule keywords Protein dipZ
molecule tags Unknown function
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 92
structure length 333
sequence length 333
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF17991 Thioredoxin_10 Thioredoxin like C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.260 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Galactose-binding domain-like 2hyxA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2hyxA01
2I3YA 4XUQA 4MJCA 2L4QA 3RPNA 1DLCA 2LS6A 3G9BA 4BDVB 2YJHA 2LTKA 3SEEA 1JZWA 4P02B 1TU7A 4IW9A 1CQGA 3MO4A 4M4PA 2YFZA 4WBJA 3P1IA 3KMOA 5J5NA 1YKAA 1JZ5A 4X0XA 3CQOA 2LQOA 3KCMA 1AXDA 3ZITA 2DBCA 1EP8A 4CU6A 4ZL8A 2KLXA 4GSNA 2RUFA 1EEMA 4L5OA 4JKLA 2YFUA 4HG6B 5EPFA 2HLEA 3TRQA 1W8NA 3CKHA 4LL1B 4KAEA 3TJKA 3VD9A 3C1SA 3FKFA 3O76A 2VL2A 3IA1A 1EUTA 2LJAA 2Y6LA 2WULA 3I3DA 5DCHA 1FG4A 1F2EA 2C8UA 2DCJA 5DN2A 5A4UA 8GSSA 1XWCA 4V1Ag 1GNYA 4LPLA 2I1UA 5DALB 3K75B 1Y6EA 2GTUA 3LG6A 4N0ZA 3QDNA 1Z5YE 4UAPA 2WGRA 2HXKA 1G0TA 4D73B 1GLPA 4KW6A 5F0GA 3TB2A 3M8NA 3ZIJA 13GSA 1ST9A 3THCA 5IHRA 4A42A 3CDZB 2VZSA 4YQVA 3EYPA 4RUVA 4LL4B 1DE2A 2YPMA 1W0NA 3C8EA 1NAEA 1E2YA 3W6GA 3K4DA 2K9FA 2L9LA 1LNSA 3VD4A 3MUZ1 4V2NA 3VPQA 4Q5NA 3FR3A 5F06A 2M46A 2W1QA 4DSSA 2ZCTA 3DXBA 1QK8A 2VZPA 3LPGA 3I9V2 3ACHA 5AIVA 3HEIA 5IO0A 4QL7A 4MZCA 1TK0B 4ZBDA 1OC3A 3E0UA 3M1GA 2H71A 1PQNA 1TI1A 4FI9A 4QX2A 3MAKA 2HSYA 5F05A 2C4XA 2J23A 2VOCA 1IYHA 1RW1A 1AC1A 1O8SA 2C26A 4MGQA 1EV4A 2RV9A 1ZCPA 2MZCA 3RBTA 3CZJA 4LMWA 2WRTA 3UMAA 3A21A 1GSYA 4QDSA 2E2MA 2FGXA 4HJMA 5H5SA 5A1AA 4QDRA 2NVLA 4MK3A 2H1DA 3CYNA 3QAWA 2YC4A 4H86A 3T2PA 3W8JA 3TKQA 5FWGA 4POBA 2VR4A 3VWVA 2MBTA 1AQWA 5LA2A 2QQJA 2W3JA 6GSYA 3KEBA 5JR2A 3ACFA 4CVUA 5B7CA 1GOHA 2P5QA 2W95A 3CSHA 2DSAA 3A3TA 2JSYA 1PMJX 3L0HA 5JWRB 3CMGA 3KP9A 1BHGA 4DUXA 1YF1A 2DC5A 3EB7A 1GSSA 4K8MA 5HFKA 3GA4A 4XS6A 5DAKA 1F3AA 3GYKA 2LJRA 3C7GA 5EL8A 3GH9A 1K0DA 3EVIA 3WNLA 3NZNA 3DIEA 1N8JA 4HQSA 2P31A 4TR3A 2XPDA 3N9JA 3ZZXA 3D4MA 4IBPA 2FCHA 1G7EA 2QQLA 1YJ6A 5D9WA 1XXUA 2GT6A 2R6KA 1Z3EA 3HKRA 5JMOA 2C0GA 2FWEA 2IPAA 2FA4A 2E31A 4ULXA 3A22A 1L7RA 4KWUA 3WGDA 2H0IA 4ZIJA 4QB6A 3O3TA 3ZFBA 1TP9A 2TRCP 1PX7A 4NHWA 4Q5QA 1X9WB 1QUWA 3CTGA 2EIDA 1R5PA 1ERTA 2C0DA 3PINA 1Z6MA 2JDAA 4QAWA 2J1EA 3ED3A 1V57A 2R2JA 2J1RA 2H72A 5D8IA 3M9JA 1U6TA 2XC2A 3MWHA 2N5FA 1YEXA 4XS1A 1JLVA 3A5WA 4QL9A 3HJPA 1AQVA 3BJ5A 5IMAA 1SK2A 1O85A 4PNFA 3WT2A 4RI7A 1GRXA 4KX4A 3SWLA 1K0MA 6GSSA 2VTFA 2VL9A 3HDCA 3F3RA 1SD9A 1UZ0A 2F51A 1A0RP 3A7QA 1G6WA 4DXSA 4IJIA 3ZRDA 4IKHA 2V2GA 4MDCA 4WKWA 2WN2A 2IIYA 3FN9A 4DEQA 1OAZA 4NAXA 1X5CA 1K42A 1UC7A 4XUPA 2HLSA 1M2BA 3P2AA 4NMUA 1MDKA 4XS4B 3L9UA 3H79A 2VUPA 3NJVA 1OE7A 1M9BA 3EE2A 3EWLA 2CQ9A 3F4RA 1NKGA 1A2JA 2XHFA 4IHUA 2AV4A 3ME7A 3O6TA 3C7OA 3HNBM 4ZB6A 3IBHA 4WXTA 5JXGA 1H4OA 1GUKA 4K6XA 1SYRA 3Q19A 3NOFA 1K0CA 3KGKA 2VCCA 3UEMA 1SYXA 5A4WA 2VZRA 4K7NA 4YH2A 3A2VA 5KN0A 3HCZA 4JU5A 1UY0A 2EICA 1UMHA 5L71A 4BJ0A 3MSZA 1GTAA 1TRWA 3IC4A 1EOGA 3ETPA 4AJ8A 5ID2B 2YB7A 4QX0A 4L0WA 2VCTA 5ECNB 4IP1A 1UY2A 3F6FA 2XHNA 1URMA 3W5NA 1OVNA 2L5OA 2YV7A 2PU9C 3WQBA 4HS1A 3TOUA 2V4VA 1U3IA 2C0FA 1A24A 4KI5M 1U87A 5J1XA 3FZ5A 3NQHA 4A45A 5HQPA 2DIYA 2EIOA 2X64A 2HFDA 3FR6A 5G2ZA 19GSA 2IJYA 4XURA 1J08A 1JU4A 1OH4A 3VFIA 2LNSA 2HNLA 4BL7A 2C3NA 4QB1A 4E8HA 2VMDA 5DALA 3D21A 4CDOA 2WN3A 3MV11 2B5YA 4PF1A 1R7HA 4HQZA 4GWJA 1PKWA 5JCUA 4Z7XA 1TU8A 4TR0A 4MJEA 4EDYA 4EDZA 4I2TA 4D73A 3KTBA 4CHSA 4OCEA 4BWSA 4GRFA 4LMVA 2K6VA 4A3ZA 5CRWA 3GL3A 4ZZ5A 5J9BA 1MDJA 1US3A 2VCZA 4A44A 2B9VA 1W9TA 4XHMA 2M80A 4IP6A 1VF1A 1Z9HA 3F3QA 1QXHA 4HDEA 3SEPA 1YDKA 5DQ0A 2FWFA 3N5OA 1JU3A 3UIWA 3P8WA 2X09A 2FWHA 2N5AA 3W8SA 5C71A 2J9HA 2CX4A 5CRHA 1JZ4A 3FW2A 4EC0A 4LKSA 2WAAA 2WFCA 1CIYA 3DMLA 4ARYA 1FAAA 1GUHA 3QPMA 4RYDA 5J4UA 4MGSA 1OC9B 4PQQA 1RYYA 1ACVA 1BQ7A 2FY6A 2ON5A 3HZ4A 4HOJA 4TXVA 4RQXA 4F82A 3U37A 3CRUA 5LA0A 2VM2A 4GWRA 3LWAA 4POKA 2MBSA 3WGXA 2H8LA 2I9HA 2BGPA 3DYOA 1E6BA 3WT1A 3HD5A 2WDBA 5DVBA 4PT6A 4RQRA 5HR1A 1XCCA 5E59A 1JFUA 4KH7A 2L6DA 3E3EA 3ERWA 3ERGA 2DLXA 3P7XA 3E1F1 4IQAA 2IMKA 3HVSA 3TDGA 4GQCA 1GL8A 4GXZA 3IB3A 1CZVA 1WMJA 1T4ZA 4K2DA 1KEXA 1ON4A 1PN9A 4ZBAA 1THOA 5ECOB 3C7HA 2NDOA 3VWUA 3I97A 5EJ1B 1F37A 2W9XA 1PX3A 3IOSA 2VIMA 2YP6A 1YKCA 2YWIA 4CU7A 2L59A 4LLRA 3WF2A 4ACSA 4ZB9A 2MMOA 3CIHA 2JL4A 3G7IA 3IAM2 1ERVA 1ERUA 4XZUG 1JYVA 3GMFA 3UVTA 4EF0A 3GKMA 3ZYWA 2V5DA 3ZM8A 2IN3A 1X5EA 4KCEA 3SBCA 9GSSA 1TVGA 2O8VB 1JI6A 2LUSA 3UL3A 3ZFLA 2XONA 1NX9A 3ERFA 2V41A 2GZYA 3U5RE 3BGAA 4K9ZA 1Q4JA 2ZEYA 1V9WA 1W9SA 2DDUA 5FUIA 3TJBA 4I5QA 4GZ9A 3J7Yk 4OO4A 2GGTA 4A41A 2WJUA 2B7KA 3P90A 2MMNA 2O85A 3CSIA 2QQMA 2EIEA 3CXGA 3UJ1A 3ZIVA 2W1SA 4MADA 2GLRA 4BPYA 1PMHX 4TVEA 2AYTA 4CW9A 3DEXA 2I4AA 2VL3A 4P5YA 3G7JA 1EGRA 1M2AA 4NPBA 5A5KA 2QQOA 1WCQA 3T0AA 2VMCA 5IYYA 3UNPA 4XS4A 4OMDA 3PUIA 1AAZA 5H5QA 2XBQA 2PVOC 2PVQA 3GFKA 2ORZA 1B4QA 4WBRD 5G5EA 5GSSA 2IMIA 5HPOA 3H8QA 2VL4A 2IMEA 4A6OA 4ID0A 3GKXA 4KUNA 3P6BA 2WYSA 2W47A 4YAVA 5COHA 2VZQA 4IQ1A 3Q74A 2ZEWA 5ABRA 14GSA 1ERWA 2WCIA 4WEYA 3IPZA 4POLA 2DMMA 1SL0B 4NWYA 1SKSB 1SD8A 1GOGA 1TG7A 2VMFA 1GSEA 4P00B 1KGYA 1PL1A 2W46A 1HQOA 2VCWA 3OR5A 4TKYA 3PUHA 3K4ZA 4ZY9A 2FWGA 4GSTA 2HZEA 4MPGA 1FW1A 1JZDA 2VZUA 1QGVA 4NXIA 1JZ2A 4F0BA 1TOFA 3WSOA 4ML1A 20GSA 2H1BA 3IXRA 1GUMA 2WQ8A 3WNMA 4YQMA 1TTZA 2VCAA 2V32A 4BA7A 1GQPA 2EIBA 2LNTA 3ISOA 4I2UA 3F2ZA 1NUKA 1DUGA 2EIRA 5IJRA 5LA1A 2H1GA 1B4PA 2WAOA 3TKSC 1AQXA 3LYPA 3L9VA 4PQIA 2L5LA 3HA9A 3HNMA 4KMQA 2B3SA 2H01A 2H1AA 2VLTA 5F7UA 1S3DA 4K0NA 5C00A 2EIQA 3KIJA 4GSSA 1S3CA 4MOAA 1ZYQB 6GSWA 1M7TA 2Z9SA 1B9YC 4XUOA 4KSOA 3DECA 4XUNA 2B1LA 1XBSA 4WR5A 2VO4A 1ILOA 5KN3A 2N5BA 2BERA 2W87A 3LXZA 1RQMA 2J7MA 4EL1A 4KSMA 4MF5A 1HD2A 2R4VA 2VC9A 2DMLA 2GQMA 4NV2A 2M72A 4P3YB 5IMCA 2TRXA 2X8GA 1PRXA 3DYMA 3H4KA 3UAPA 4L8EA 3GRXA 6GSXA 2J1TA 4E8DA 2NBSA 2XBIA 2ALBA 3BD2A 3VI5A 4EVMA 1XNAA 3KZQA 3WF0A 4UI9L 1O6JA 1UY4A 1I5PA 1NM3A 2WZ9A 4CUBA 4HU9A 3UARA 2W1WA 3IK9A 1B48A 4L0PA 4O7HA 2W1UA 1DSBA 3I6AA 2CZ2A 2VM1A 4IJ3A 3PGTA 4W50A 4XRDA 2OKAA 3I2IA 3ZREA 1FB6A 4TXOB 4HUAA 1XWKA 2ZXQA 1TKDB 1TI3A 4L5LA 4JHZA 2B7JA 3US3A 3GXUA 4MLYA 3C73A 2LSTA 4HZ2A 5KEJA 5C70A 1UWWA 4N11A 1PKZA 2PGTA 3GSTA 2QKEA 1SJIA 2C1YA 1ZGNA 1SENA 5DQSA 3HY2A 2NPBA 3DYPA 3VPTA 1PL2A 3A2WA 3KD0A 5JWOB 1YF0A 3QFBC 2X10A 4JEDA 3QCPA 1H75A 3BN6A 5ECHB 5G1KA 2HRNA 2X99A 2W91A 1XW6A 2X8CA 3NNGA 2DJ3A 2PMTA 3RAZA 4WF4A 4LQRA 2HSHA 2GQKA 1GMMA 2H30A 3I3EA 5CO3A 2RM5A 2Y6KA 1UA5A 4D8MA 1GLQA 2K8SA 2CV4A 3BCKA 4ECJA 3ME8A 1XFLA 2BBAA 1UXZA 4OFMA 2J1SA 1K3LA 1AUCA 1W99A 2WB9A 3CSJA 3QR6A 5CP1A 1XW5A 3I69A 3UETA 4PNGA 4HU7A 4FYBA 2B4KA 2F3MA 3FL7A 1W8OA 4DXTA 4JR4A 4V1Ap 1X0RA 1GNWA 5IMFA 4W4ZA 1FO5A 4ECIA 2QQNA 1UXXX 4EE0A 4O32A 1WKYA 5DQYA 1OF4A 2XQXA 5IMDA 3J7Yb 3FHKA 2K18A 3APOA 3HYPA 2AB6A 3D0ZA 1M9AA 3LXTA 1A23A 3HZ8A 4BXSV 3WF3A 2FLSA 1US2A 1TK5B 2H66A 1A8LA 1PMTA 4J57E 1TJDA 1K0NA 5ENUA 2CVKA 1SL2B 2E0QA 1N2AA 3KXOA 4X1UA 1OT5A 3SKJE 1Y25A 3GM8A 5CZKA 5B4XA 1OKDA 2V6KA 4ZXGA 2OE1A 2ZEZA 3OB8A 4J2FA 4OWYA 2LS5A 5G04L 1SG3A 2WABA 2D2ZA 5HR2A 5DJLA 4KCAA 2WO1A 5JXJA 4MH3A 1A0FA 4ZILA 4ILFA 4OMVA 5CRDA 4KNDA 5I0DA 2H74A 3M3MA 6GSTA 3AY8A 4DUVA 1BJXA 1JZRA 3RHBA 7GSSA 2BGOA 1J83A 4ZZ8A 3UESA 3TJGA 4MH2A 2YN1A 2RVAA 1EOHA 2VQTA 1GP1A 2OADA 5GAND 2Y64A 2E26A 3RPPA 3DVWA 1VF3A 2YOIA 1X9SB 4I97A 4NHZA 2ORXA 4DEVA 3GKKA 2WUHA 4N10A 2H70A 2L57A 3OEAA 2B1KA 1KBNA 1VRSD 4EKZA 3WNOA 1C72A 2CVBA 4K7IA 4BWQA 1SK1A 2OA7A 5D93A 5GAPD 3WD6A 5DDLA 4PGTA 1T8EB 1TRUA 3FEUA 3IDAA 1XW9A 2HI7A 5B8AA 3S9FA 2XOMA 4JX0A 4JZQA 1JZ3A 1XWBA 2CA8A 3GHAA 1ZYEA 1G7OA 2MYGA 2K8VA 5EIYB 1KNGA 1RK4A 2GT5A 2JADA 3UOMA 5EVOA 2YJ7A 4OO5A 1UX7A 1SK0A 5C04A 1K0AA 3I2FA 4MMMA 3HJOA 3GX8A 2QC7A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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