5CYYA

Structure of the c-terminal domains of dipz from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
333
structure length
333
Chain Sequence
TGTEIREQLNLGGIVNAQNAQLSNCSDGAAQLESCGTAPDLKGITGWLNTPGNKPIDLKSLRGKVVLIDFWAYSCINCQRAIPHVVGWYQAYKDSGLAVIGVHTPEYAFEKVPGNVAKGAANLGISYPIALDNNYATWTNYRNRYWPAEYLIDATGTVRHIKFGEGDYNVTETLVRQLLNDAKPGVKLPQPSSTTTPDLTPRAALTPETYFGVGKVVNYGGGGAYDEGSAVFDYPPSLAANSFALRGRWALDYQGATSDGNDAAIKLNYHAKDVYIVVGGTGTLTVVRDGKPATLPISGPPTTHQVVAGYRLASETLEVRPSKGLQVFSFTYG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of the ectodomain of the electron transporter Rv2874 from Mycobacterium tuberculosis reveals a thioredoxin-like domain combined with a carbohydrate-binding module.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Protein DipZ
molecule tags Membrane protein
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 91
structure length 333
sequence length 333
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF17991 Thioredoxin_10 Thioredoxin like C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.260 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Galactose-binding domain-like 5cyyA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5cyyA01
3FW2A 3W5NA 4LMWA 2MZCA 1K0BA 1O7UA 2VZQA 5JR2A 4FYBA 4A44A 4N0ZA 4JZQA 16GSA 1SK0A 2EIRA 3APOA 1GSEA 3I69A 4POMA 3K4ZA 4XTSA 3H4KA 2ID4A 2ZCTA 5AN1A 2H01A 2H66A 3LYKA 4Q5QA 1H4OA 3ETPA 2K6VA 1K3YA 1M9AA 2AJQB 4KH7A 4RQXA 4TTGA 3A2VA 3A21A 5ECKB 2VM2A 1MDIA 5A1AA 3MV11 3GV1A 2A2RA 1CIYA 2QQIA 3IV4A 2B5YA 1JHBA 4HJMA 3K75B 2HYXA 5CYYA 3CTGA 1OF4A 3GL5A 4PQQA 3TOUA 5HFGA 4N30A 4ZZ8A 2C0GA 1YEPA 1GUKA 4ZL9A 4HQZA 1AC1A 4EVMA 2XONA 2VZ3A 2R7EB 2F3MA 1XNTA 4PF1A 3A3TA 2YOIA 5B6MA 1JYXA 3FY7A 1HNAA 2FA8A 4KAEA 4PX1A 1QK8A 3NOFA 1XW5A 4JKKA 4V1Ag 3TJKA 2IFQB 3VWVA 2Z9SA 1O8XA 3GNJA 4MCUA 1BJXA 2TRXA 3F4TA 3F2ZA 1GUIA 4MJCA 4MZCA 2YWIA 1EV4A 1UY0A 1OKDA 2FCHA 3KH9A 4HI7A 4GXZA 1M9BA 1JLWA 3P6BA 2MBSA 3HYPA 3GHAA 3M1GA 1FO5A 2FGXA 5HR3A 3HNBM 4XUOA 1TRUA 3W6GA 3CBUA 2H72A 1ERVA 3D0ZA 4OO5A 5JUVA 3FZ4A 4NHWA 2W95A 4ZILA 5C04A 2FWEA 3CSHA 3FYGA 1BG5A 2OE3A 4YQMA 3WGEA 2QGVA 5HR2A 5JXIA 4L0WA 1PX3A 1WP0A 1ST9A 4ZL7A 3GTUA 1GUHA 1KEBA 1JU3A 4K7OA 1JI6A 2O87A 2PBJA 5H5QA 4LA1A 3TKSC 4BVXA 5A4VA 3QFBC 6GSYA 3MO4A 2H76A 5A4UA 2KUCA 1GRXA 4HZ2A 3ZMLA 5IM9A 3UOMA 1UN2A 3WGDA 2VQUA 5GZZB 2OBIA 4BJ0A 5JWQB 4YQUA 1QGVA 3ERFA 3OGSA 8GSSA 3GMFA 4F2IA 2VC9A 3GX0A 1WMJA 2FLSA 2WO1A 4AJ8A 2JL4A 4BVYA 3WF3A 1JZOA 2WB9A 1VF4A 2LNTA 5AISA 3UBKA 3IAPA 3WNNA 3BCKA 4GLTA 3C71A 2OBKA 4BWQA 5ECMB 1ZL9A 1T00A 5FWGA 1SKWB 10GSA 4XUQA 5JMOA 4PNGA 2Y6KA 5KN1A 1GOHA 2VMEA 2QQJA 3TGZA 5LCZA 2QQLA 14GSA 3WNOA 3F4RA 4N11A 1R5AA 4XS6A 4ECIA 3APQA 1MDJA 1X0RA 5F8BA 2PPTA 3IAQA 2WN3A 1OKTA 4YH2A 4V1Ap 4MH2A 4KI5M 4YAPA 2VZRA 5J9BA 3CYNA 1K3OA 4IJIA 4OMDA 1U87A 1HNBA 2B6MA 4EL1A 2X09A 1Q4JA 4G10A 4GTUA 1T2XA 5B4NA 2DIZA 2E31A 3HA9A 2C80A 5EJZB 2E26A 2CX3A 3MBWA 4OUEA 2R3XA 3TJGA 1PX7A 3TKRA 2ORXA 2VTFA 5JWRB 3VD7A 1EZKA 3F9UA 5ECOB 5HFIA 1W8OA 2GZYA 3LORA 2DMMA 1G0TA 1JHJA 2VMCA 2XOMA 4I2TA 2CDOA 1MPXA 1UA5A 4P02B 3RPNA 2B9VA 1TK0B 3QAWA 2V1MA 3FKFA 5COHA 4ML1A 3ZYWA 2VJXA 3P2AA 2EIDA 4NAXA 22GSA 2B3SA 2V6KA 1NAEA 2VLUA 4Q5RA 1PRXA 1PN9A 1GU3A 19GSA 3HDCA 1ILOA 1SL0B 3C7FA 3L9VA 6GSSA 1JZ4A 2O89A 2YPMA 4MABA 5D93A 4MOAA 4I97A 2V5DA 1GLPA 4NV2A 1KEXA 2J1AA 2J1TA 2L6DA 1F4AA 4ET7A 3GFKA 2OKXA 9GSSA 5B6NA 1SD8A 1K42A 1OH4A 3N9JA 4AJ7A 1WE0A 1X9MB 5CNWA 2DSAA 1GSUA 1V40A 2WZEA 4WEYA 2YG0A 3TRQA 1AQVA 4ZZ5A 4IN0A 5ECRB 2DJ3A 1K0NA 2GLRA 3KXOA 2XPEA 2CVDA 2VZSA 2L4CA 1OYJA 4P5YA 3VURA 4PT6A 1PQNA 2VCAA 1PL1A 4K6XA 3VD3A 1A8YA 2CAIA 1ULPA 3HCZA 4XS4B 4QL7A 2OJLA 2DCJA 5DBQA 5J5NA 4DUVA 5ECIB 2M80A 2PWJA 3EC3A 2JZTA 3GA4A 1GL8A 1T8EB 1XXUA 2CV4A 1GSQA 3VWXA 4QDSA 2R5GA 4HG6B 4ML6A 2XBIA 4KSMA 3VWWA 1B8XA 1VF2A 3IC4A 3DKSA 1FVJA 2J7MA 2W1WA 4RN5A 3PUHA 2YWOA 1J9BA 3FL7A 2IMFA 1FB0A 1TRWA 3QMXA 2V72A 1TRSA 2M72A 3LGCA 2VR4A 1OC9B 3TRPA 4HU7A 1PKZA 3MSZA 2LSTA 4PGTA 4PURA 1YZXA 3LWAA 4XRAA 1F3AA 1EUUA 2FWGA 1AW9A 1SHWB 2VCZA 5DQ0A 2VL4A 2XHFA 3LEKA 1LJRA 1YQ2A 4O92A 2VD0A 4K7IA 3IDAA 2R2JA 4Q5NA 5IMDA 3VPTA 2W1SA 4QX0A 2KHPA 4TXOA 4DSRA 4KWUA 1V57A 1YY7A 4D73A 3M8NA 4UI9L 1NW2A 1SU9A 3GSSA 3L0HA 5ID2A 2LJAA 1B48A 1Y6EA 4MF7A 4NPBA 2CX4A 3DVWA 5ECNB 2W91A 2X99A 1ULOA 2LW8A 3I2FA 3WF2A 1Z6NA 4OWYA 4QX3A 5DALA 2K8VA 3WYWA 2AAWA 4KCEA 5I0DA 4OFMA 1W9SA 3DYRA 4NMUA 2VCBA 4ULXA 2QQNA 3ME8A 4J57E 4FYCA 1SD9A 1JZDA 3GUSA 1B4PA 3AC0A 3TJBA 1PX6A 2F8AA 1VRSD 3IBHA 3O3TA 2YWMA 5INYA 5HPOA 2GZZA 5F7UA 2DJ2A 3GM8A 2QKEA 1W9TA 3WEZA 4HZ4A 3QR6A 1U3AA 3T08A 4MJAA 1CZSA 3HKRA 5J4UA 5ELAA 3CKHA 4E8CA 2J1EA 2H1BA 1B9XC 3JCML 3V1WA 2KOKA 2HZEB 2GGTA 3O6TA 1UXXX 5IQYA 2W1QA 2H6XA 3LQCA 5LCWL 4RQRA 3ACGA 3SKJE 4CVUA 1XZOA 1OD3A 1TU7A 1PMJX 4LL1B 4TVEA 4MZBA 1GMMA 1OF3A 1R4WA 2VCXA 3I6AA 1AIUA 5FUIA 1U3IA 1HN1A 5J9CA 2C3QA 1GNEA 3DMLA 4ARXA 5GSSA 2IJYA 5CP1A 3QOUA 5DAKA 3WF1A 4HJ2A 3LSZA 3IPZA 4HS1A 3CZJA 1FHEA 1FVKA 4GWJA 1BQ7A 1X9SB 3GX8A 1B4QA 4ID0A 1J84A 2XQXA 3CDZB 4MK3A 1OC9A 2FA4A 5G2ZA 3HEIA 2JSYA 1ERUA 1VF1A 2C4JA 5EL8A 3I3EA 4PQ1A 2YCDA 4PUFC 3HY2A 4KNDA 1TU8A 2YWNA 2B7KA 4KX4A 1V9WA 3US3A 2ZNMA 3TJFA 2CT6A 4OO4A 4WBRD 2GQMA 3CRUA 2NVLA 4GRFA 2YC2A 3NRUA 2N5BA 1X9WB 1AXDA 3R2QA 3WT2A 3VDAA 2J1UA 4ECJA 1G6YA 2C0FA 5G1KA 1NSWA 2LNSA 3HVXA 3FZ9A 3KZQA 4XZUG 4MDCA 2H74A 3K4AA 3MUY1 3BBYA 3SEEA 4JKLA 1XFLA 2IL3A 5ENUA 3IR4A 4MA9A 2YC4A 2XBQA 3K46A 1JLVA 2HE3A 3W8JA 1E6BA 4Z2AA 1TJDA 2KD7A 2I9HA 2FNOA 1TI1A 2D2ZA 2JADA 4MF6A 4BK5A 3QDNA 4ZIJA 3A2WA 4LLRA 12GSA 1K0OA 1WWJA 1PMHX 5B4XA 3ZIVA 4CW9A 3W5MA 1S3CA 2BTOT 4AG4A 1Z6MA 3F4SA 4BWSA 4IUGA 2FY6A 1EP7A 4HOJA 3ZL5A 1GLQA 2IMEA 2LRCA 2WQ8A 2YV7A 4PNFA 5KN3A 3CSIA 3UMAA 2VM9A 2F8FA 4MO3M 4KE3A 3F3QA 2VZUA 5D8IA 1T4YA 1DE2A 1EOHA 5CZKA 5IMFA 3T2QA 1R64A 5EVOA 4K1FA 3P7XA 4DUXA 4XCSA 3FHQA 3UVHA 5A4WA 3WSOA 2HFDA 5JXJA 1B9YC 3I9V2 1GSYA 2R37A 4CUBA 2WZ9A 3L9SA 2X8CA 4KCAA 4A42A 2YZHA 1WJKA 3C7EA 3NJVA 2WDBA 5CAXA 3LEFA 2WCIA 4O32A 3E9JB 4CUAA 2FHEA 5GAND 4P3YB 3F6DA 1TOFA 5IPGA 3WF0A 2CQ9A 3LFLA 1JYNA 2GSRA 4IQ1A 1GTUA 2PU9C 1UC7A 2G0FA 1J83A 3U6VA 1GQPA 4UOJA 3LG6A 4OFTA 1N8JA 3KEBA 3PGTA 1EGOA 2GSTA 1Z5YE 3IXRA 4RI7A 5DMYA 4F03A 3HNMA 2VZPA 1AQWA 1GP1A 5ECHB 4JR6A 3GL3A 13GSA 3TB2A 4XS1A 2KP1A 3HPNA 2IIYA 3H93A 4IW9A 2MMZA 2YJ7A 4JBBA 4MMMA 1PL2A 5B8BA 4WXTA 4DXSA 1HQOA 1K0MA 2GDRA 2WULA 3IRAA 1T7PB 2N5AA 3GKXA 4N0VA 1A0RP 4TR1A 1DBYA 3TDGA 1K45A 3APSA 1QMVA 1TK8B 4YAVA 2V6OA 4K7NA 1GNYA 4QB2A 4DSSA 5CRHA 3WQBA 4V2LA 1R5PA 1QUWA 3GXUA 1R26A 4X1UA 1NKGA 2PMTA 4L5OA 5IPHA 3D6IA 5DPNA 1S3AA 1M2AA 1RQMA 1XOAA 2BMXA 3KD0A 2QC7A 2IWTA 4DXRA 4V2MA 1AAZA 1GSSA 5AGYA 1ERTA 3AY8A 4GQCA 5ELGA 2WBKA 5DVBA 3FR6A 4DXTA 1XVQA 3BOAA 4ARYA 1EWXA 1YDKA 2XC2A 3E0UA 3CQOA 1GH2A 3GDBA 1ERWA 2CA8A 2K8SA 2H1AA 6GSVA 3ZMKA 1EOGA 3T0BA 4OD7A 2HSYA 4BDVB 2VZOA 1US2A 2QSIA 1ZOFA 2BJXA 2ORZA 5AIVA 3KIJA 2WRTA 4G9HA 3UVTA 2L57A 5DCGA 5JXGA 4ZBDA 5E4WA 3VD4A 3C8EA 5G5EA 3ACIA 4QL9A 3QFAC 4JX0A 2P31A 2H6YA 5G05L 4PQHA 3KH7A 3QD9A 3IE3A 4F0BA 3F63A 4HUAA 4NWYA 1GTBA 3VD5A 4HU9A 1TG7A 1SJ6A 3M3MA 1JYWA 1M0UA 3VI7A 2WO3A 1O8SA 2YZUA 3RDWA 2ON7A 2IMKA 3ZLPA 2IFQA 4GSSA 1K3LA 1JZWA 4ECBA 2W87A 1CX1A 3ABZA 2GSSA 5D9XA 2PN8A 1JZ2A 2HZFA 3ZIJA 5L71A 2RUEA 5LA1A 1SKRB 6GSUA 1WCQA 3TKSA 3J7Yb 3HOBA 4X0XA 5A5KA 1OC8A 1U6TA 4GSNA 2C3NA 3LPGA 7GSSA 1LNSA 17GSA 1CQHA 4XHMA 3MUZ1 2GT6A 5H5SA 1SYRA 2DIYA 3CMGA 3KJYA 5HXMA 4KB3A 1BEDA 1XWKA 2J1VA 4MF5A 4L5LA 3A2XA 2BERA 1OE8A 3A5WA 2FD3A 2DC5A 1GOFA 5C70A 2H30A 1T4ZA 3DGQA 1MD4A 3KCMA 1W99A 5GSTA 4W50A 3WNPA 2V41A 4ZY9A 5IMZA 1YKAA 3U5RE 2TIRA 2N5FA 3HZ4A 4OCEA 1W89A 2GS3A 4ZBBA 1BX9A 4O7HA 2W1UA 1BAYA 3Q6OA 2P0GA 3F3RA 2VCCA 3SEPA 1DYOA 3I2KA 1G7EA 2YP6A 1EEMA 2JD9A 1K12A 2W92A 2LKUA 2FWFA 4V2NA 3C1SA 1O73A 3OGRA 3G9BA 5B7CA 3IHQA 3I43A 4WR5A 4BPYA 2P5QA 2K9FA 3MV01 1KBNA 3HJPA 4W4ZA 3HVSA 3LXZA 3W8SA 2ZXQA 4G2EA 1A0FA 3T09A 3HHVA 3LEGA 3HZ8A 1PX4A 4MJEA 1SL2B 3F0IA 1ACVA 2H6ZA 1SENA 2VOCA 4POKA 5DQYA 1ML6A 1VGLA 2OKAA 4IP6A 1K3IA 3CRTA 2RM5A 5F05A 3F6FA 2L4QA 2PERA 4A45A 3D4TA 1W9WA 3UETA 5IMCA 5B8AA 3D3AA 1K0DA 3KGKA 1LBKA 4EF0A 2WYSA 4WETA 2VL9A 4MPGA 3FK8A 1V98A 2EIQA 2OACA 1GSFA 4XVHA 2EIOA 4MZWA 2LV3A 5G04L 2OE1A 3IK9A 1H6YA 2EIEA 5KN0A 5JCUA 1CZTA 1JZRA 1MEKA 5FT3A 2RVAA 2E2MA 5J1XA 4GF0A 1FAAA 1SK2A 1NUKA 1UYZA 3JXSA 3D21A 2LS5A 3G7IA 2ES7A 3BCIA 3IA1A 1GOGA 2X64A 5JWOB 2VAFA 1AQXA 1QFNA 1XWAA 2RM6A 5AIXA 3GN3A 3TRXA 2WDUA 1XWCA 5DN2A 4JE1A 4I5QA 2Y6GA 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2YANA 2C4XA 3EB7A 2AYTA 2H75A 3GKMA 3KTBA 2JZRA 4J2FA 1A2MA 1I5GA 4LMVA 1M2DA 3ACHA 2WABA 1TXXA 2DJ1A 1JU4A 3UBLA 2B4KA 3QAGA 1XWBA 2PQSA 5IO0A 3L9UA 5G31A 3LQ7A 2O7KA 3FEUA 4IJ3A 5G30A 4Q5FA 5IFPA 1OE7A 2IMIA 2JE8A 3FR9A 4TR0A 4M4RA 3FHAA 4JKMA 6GSWA 2LJKA 1F9MA 4EE0A 2CVBA 4X43A 3K4DA 3UNPA 3Q18A 2GVPA 3FZAA 2LRNA 3BGAA 3NIVA 1Q98A 3GKKA 1TVGA 1EGRA 3EURA 5D9TA 3GH9A 5CREA 3EU3A 1WPIA 1YKCA 5C7GA 2RJ2A 3TKPA 2MMAA 4KSOA 2VL3A 4A4AA 1L7QA 4TXVA 2HZEA 4RYDA 1H6XA 4J56E 3GYKA 4TXWA 1K0AA 5J3RA 2QBXA 5DDLA 1XVWA 2CDPA 1ZYEA 1W4VA 1IYHA 5C71A 2NDOA 4MGQA 4KDYA 5IYYA 2EIBA 4E8DA 4CU7A 4CUCA 5E59A 4ILFA 3OEAA 4QX2A 2VZVA 1P8JA 2W46A 4QPWA 2BGPA 2Y8KA 3ZVJA 3K8NA 4HEA2 2LRTA 2VCQA 3FZ5A 4GWIA 3BN6A 1UY4A 5ECSA 3CXGA 4CDOA 4MH3A 4MJBA 3T0AA 2C8UA 2VMFA 3TKQA 1FB6A 2HNLA 1T1VA 3I97A 2JACA 1DP0A 2LJRA 3EMXA 3EU4A 3VDCA 4FYUA 4K9ZA 4EO3A 2DMLA 2Y6JA 4DEQA 5IMVA 1OC3A 1UXZA 2NBSA 5J41A 3ZM8A 3H79A 1KTEA 3HNYM 1FG4A 1WKYA 1Z7RA 2RIIA 1XCCA 3DXBA 3GRXA 2AV4A 3QPMA 20GSA 1O8WA 3C8XA 4FIWA 1SG3A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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