5CYYA

Structure of the c-terminal domains of dipz from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
333
structure length
333
Chain Sequence
TGTEIREQLNLGGIVNAQNAQLSNCSDGAAQLESCGTAPDLKGITGWLNTPGNKPIDLKSLRGKVVLIDFWAYSCINCQRAIPHVVGWYQAYKDSGLAVIGVHTPEYAFEKVPGNVAKGAANLGISYPIALDNNYATWTNYRNRYWPAEYLIDATGTVRHIKFGEGDYNVTETLVRQLLNDAKPGVKLPQPSSTTTPDLTPRAALTPETYFGVGKVVNYGGGGAYDEGSAVFDYPPSLAANSFALRGRWALDYQGATSDGNDAAIKLNYHAKDVYIVVGGTGTLTVVRDGKPATLPISGPPTTHQVVAGYRLASETLEVRPSKGLQVFSFTYG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of the ectodomain of the electron transporter Rv2874 from Mycobacterium tuberculosis reveals a thioredoxin-like domain combined with a carbohydrate-binding module.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Protein DipZ
molecule tags Membrane protein
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 91
structure length 333
sequence length 333
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF17991 Thioredoxin_10 Thioredoxin like C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.260 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Galactose-binding domain-like 5cyyA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5cyyA01
3MSZA 4F82A 4YAVA 3I69A 5D96A 4F0BA 5HR2A 4ZIJA 2LKUA 3T2PA 4K0NA 4CVUA 2H76A 2NBSA 22GSA 2E31A 2VCQA 1GSUA 1SU9A 4GSNA 2YNXA 2EIBA 3OR5A 3LFLA 1FAAA 2FUG2 3S9FA 2AHEA 1QGVA 4ZB9A 4LHSA 4HI7A 4FI9A 1XIYA 3BN6A 1VGLA 1QFNA 3HJOA 2A2SA 3CKHA 3M0FA 2H1GA 4KUNA 3TOTA 5DVBA 3F3RA 2DMMA 4WF5A 5DBQA 3GNJA 3VURA 5H5RA 2HZEA 3MNGA 4RQXA 2PUKC 1FHEA 1JLVA 2H0IA 3IIIA 4Q5RA 2VMDA 4KA0A 3L4NA 1UN2A 1A23A 1KEBA 3R2QA 3UMAA 1Y6EA 3HNBM 5HR3A 5EIYB 2FWHA 3IK9A 1O6JA 2R7EB 1X5DA 4AJ7A 4N10A 3MUY1 3PUIA 3LEFA 5G5FA 3TRQA 1B4QA 4V1Ag 1JZ6A 2X10A 3FKFA 1OT5A 3GSTA 3ZFBA 3G7YA 5ELAA 1TKDB 2I3YA 4V1Ap 3UVTA 2H6XA 3UOMA 1EP7A 1GSEA 3ZLPA 1IQDC 3TKSA 4ZBAA 1M2AA 4W50A 1K3YA 2DJKA 2L6CA 4POKA 3PGTA 3VPQA 1GNYA 2K8VA 4DEQA 2WUHA 4X1UA 3ZVJA 3K75B 4QDSA 4BWSA 3CRTA 2YWIA 4IGJA 2C3QA 1OKTA 1SENA 4OFNA 5FHIA 4D0QA 2IMDA 5CYYA 4Q5FA 3LXTA 1J9BA 2I1UA 5DQYA 4XIHA 3O6TA 2YCDA 1A2JA 4MABA 1G7EA 2YZHA 5ECKB 2B7KA 2BJXA 3WSOA 1JZRA 1AAZA 1PMHX 4OYUA 4J57E 1R7HA 3FZ4A 3KMNA 2PVQA 1XOAA 3C7HA 4N11A 2H6YA 2IMFA 3F3QA 1M2BA 2IPAA 1W0NA 3F0IA 6GSVA 4XS6A 2E0QA 4V2LA 4J2FA 3H79A 5ECPB 4TTGA 2IJYA 4QX1A 4LL4B 2HI7A 3SKJE 3EMXA 3KH7A 2V41A 5JWRB 1YEXA 4JE1A 1R5AA 2YWOA 2LEGA 2R3XA 4MGQA 3WQBA 4MZCA 5KN2A 1O7UA 1BHGA 2VZRA 2YFUA 1Z6MA 3IAS2 4ID0A 2YJ7A 2V1MA 1L7QA 5EY6A 3ZIVA 2OE3A 3FRCA 5ECMB 4HQSA 2RVAA 2W1QA 1UX7A 1GNEA 2VCCA 4IHUA 1DP0A 5IMFA 4QB1A 2VL2C 20GSA 4G10A 4ULXA 2E33A 2OJLA 1VRSD 4JU5A 5HR1A 2CVDA 2XQXA 3TKRA 1TXXA 2WAOA 2V2GA 1GSFA 3KTLA 4HDEA 1EP8A 5J9BA 4ZZ5A 1QK8A 1RYYA 5COHA 3M8NA 4EVMA 3EYPA 2YANA 2O89A 1EEMA 1KGYA 3D21A 2WGRA 3F9UA 3TRXA 3DYPA 3M1GA 3ZYWA 1H4OA 4TXOB 2J1TA 3FEUA 4MK3A 5E59A 4ARXA 1GSDA 3PR8A 4KX4A 2P31A 4X43A 2NTOA 2FD3A 4UOJA 1ZCPA 2Y6GA 3QPMA 6GSXA 1UY2A 4OCEA 5IMCA 2W1UA 3WF1A 1XBSA 4JEDA 3F63A 3I43A 3KM6A 2W1WA 5IIZA 4CUCA 5A1AA 3QCPA 2P5QA 3KJYA 4NPBA 5JXGA 2AAWA 1ZYEA 1VF4A 4HJMA 4JR4A 4KGIA 5IFTA 3OBAA 5FUIA 2GDRA 1R26A 5ENUA 3C7GA 3F2ZA 4RYDA 3MV11 1CQGA 3TJBA 3RHBA 2AJQB 3HXSA 2YP6A 4IQAA 2Y6KA 4KI5M 1EV4A 2LUSA 1V58A 3I2HA 2E2MA 3P2AA 2LS5A 3GYKA 5CRGA 4HOJA 4GQFA 1AQWA 4KCAA 1YDKA 3BD2A 3N9JA 1GTAA 1NAEA 3UESA 5IPGA 1SKRB 3QMXA 2OKXA 3WF2A 3TKSC 2W1SA 1VF1A 4I97A 2BZDA 2L5LA 3TRPA 5CAXA 3QOUA 1TRVA 1W4VA 4I8BA 1XCCA 4DUVA 3KP9A 2CZ3A 2VZTA 1GLQA 4WBJA 4XHMA 5JXHA 2TRXA 3BCKA 2MMNA 4WR5A 1XWBA 1XXUA 1TI3A 3QFBC 4PGTA 2J1EA 3VWUA 2H0GA 11GSA 3ERGA 4WXTA 4ZL8A 4AAXA 2GQLA 5C04A 2VMEA 1XVWA 4K9ZA 2FLSA 2BBAA 2C26A 2JE8A 3FK8A 3FHQA 2VCTA 3OB8A 3IR4A 1U87A 3HVXA 2DIYA 1JZOA 3I2JA 4TXWA 4ZZ8A 4GF0A 3OEAA 3Q18A 3DYMA 1HN1A 2YV9A 3GA4A 5LD0A 1XWAA 1J84A 1WKYA 1PMTA 2C80A 2J1RA 4MLYA 2LRNA 3IAPA 1U3AA 4I5QA 3QD9A 4OMCA 2PERA 3HCZA 5H5QA 3UBLA 4CU8A 3D22A 1A0FA 1A2MA 5JCGA 4MJEA 3T2OA 4GXZA 2KUCA 3CZJA 1US2A 3I97A 3KXOA 1WP0A 5IO2A 2I9HA 3MBWA 1ULOA 1VF3A 2LRTA 2ZCTA 2HZEB 2J1SA 3QR6A 1URMA 2VAFA 2ORZA 4A45A 5CREA 5B8AA 4QDRA 1WMJA 4GTUA 1BX9A 5ECOB 3C8XA 3D4TA 2EIOA 4RI7A 3C7EA 5D9WA 4NV2A 5G5EA 4NAXA 3THDA 1NSWA 1GMMA 3F8UA 3HJMA 2CZ2A 4FYBA 1JU3A 4HU9A 3P90A 5GAND 2XPEA 2CX3A 3K46A 4XVHA 1MD3A 3MWHA 2VZUA 1K0NA 3KZQA 2L4QA 5A4WA 3GDBA 4POBA 4GQCA 1SG3A 1FG4A 1B9XC 2GVPA 1E2YA 2JSYA 2GLRA 3LYPA 1TRSA 4EKZA 5GSTA 1JZWA 2WJUA 2LNTA 1O59A 5CNWA 2WO2A 1T4YA 3QAVA 4L0WA 3FW2A 1XNAA 2MBSA 1NM3A 3WNKA 3HPNA 2VJXA 1SK0A 2L4CA 2JDAA 1PD21 1NHOA 3EU4A 4KAEA 2XONA 4MOAA 5KN1A 5HPOA 1O85A 3EB7A 2F3MA 1S3CA 1X0RA 3RPNA 4BXSV 1AQXA 3AY8A 3IAQA 4Q5QA 3DEXA 2HYXA 2C0DA 2DJ1A 2IWTA 4GWJA 3WGEA 3IXRA 3HOBA 1JYWA 1F9MA 3IV4A 2QC7A 1GL8A 4V2MA 3LPFA 1T8EB 3VI7A 2VQUA 1GWCA 4O92A 3VDBA 3PH9A 4FIWA 3W8JA 1GRXA 4IVFA 1LU4A 1V57A 1K0AA 3M9KA 3APQA 4K7IA 2JKXA 1HYUA 3NJXA 1JZ3A 4PXOA 3I3DA 2GS3A 2MMOA 3LXZA 1O8PA 3SKVA 1GOHA 5CRHA 2DLXA 4E8EA 3HKRA 3ME8A 3LSZA 1JYNA 2GSRA 4HUAA 4DSSA 2VCAA 2CA8A 2FNOA 1QUWA 4ZY9A 4ARYA 1EWXA 4K7OA 2DJJA 16GSA 1PL2A 1W9SA 3UETA 1CZTA 5JCWA 4LPLA 2O87A 1EOHA 1QQ2A 3MUZ1 1TK8B 1EEJA 1K42A 2VL2A 4EL1A 1SJ6A 2ZXQA 4TVEA 4JR6A 4G19A 2E7PA 2J22A 1H6XA 2WULA 4GCIA 2AB6A 5F06A 1W99A 1ABAA 2C4JA 1UZ0A 1E6BA 2VC9A 3EC3A 3WF4A 3RPPA 3GX8A 3A22A 2MBTA 5D9XA 3UVHA 3Q74A 3VI5A 4DEVA 2ZUPA 3KEBA 1YF1A 2HFDA 1ST9A 2HLEA 4PQIA 4IJIA 3L9SA 4BL7A 3A2XA 2Y64A 3WNMA 5ECSA 3TJGA 1PX3A 2GSQA 2MZCA 3OEBA 3W8SA 1ON4A 2YB7A 2V6KA 4YPJA 4MZWA 3CQOA 2PGTA 4QX2A 4ZBBA 2PVOC 2QSIA 1UXXX 3HY2A 4F2IA 1YEPA 1MTCA 1XC6A 3LEKA 4XUOA 1JYVA 1USBA 2W3JA 1YY7A 1G6WA 1BYEA 2EIQA 5JCUA 4KSMA 5DCGA 4OMVA 5G31A 1TOFA 1US3A 5F7UA 2VL4A 3ACFA 2E2GA 5D9TA 1HD2A 5DJMA 1EUUA 2FWGA 2H72A 3KMOA 3L9VA 2V5DA 4XURA 2ID4A 4LKSA 3GKMA 4ECJA 3H93A 4XS4A 1EGRA 3FZ5A 3K4DA 1U6TA 5IO0A 1YZXA 2RUEA 2RJ2A 3DYRA 2J1UA 4A42A 2V4VA 5IPHA 3H8QA 2WZ8A 1Z7RA 4XRAA 3D3AA 4MJBA 5DMYA 3VWVA 4EF0A 2HT9A 3HHVA 4PNGA 3P8WA 1NKGA 2I4AA 3ZRDA 1YQ2A 1N8JA 2WABA 4HZ4A 8GSSA 2GZZA 3H1NA 1F3BA 1A0RP 1WRYA 3WNLA 1OH4A 2VLVA 2WS2A 3UIWA 4HZ2A 3C1SA 2K9FA 3G7IA 4TN8A 3O76A 1JYXA 1FVKA 2G0FA 2VO5A 5F07A 1FOVA 3VWWA 3JCML 4EC0A 1MEKA 1ILOA 1F4AA 4N30A 4IJ3A 2IN3A 2W47A 3W5NA 2VZOA 4EE0A 2M46A 2IFQA 1RW1A 3DGQA 3G9BA 3A2VA 2Z9SA 1OF4A 3VD9A 2CAIA 2VO4A 1A2LA 3C73A 3GX0A 5KN3A 2CAQA 1QMVA 1J0FA 1YQ1A 2VTFA 2HRNA 3D0ZA 5DJLA 2DJ0A 1X9SB 1JLWA 4JX0A 2KHPA 4L8EA 3D5JA 1EV9A 1T1VA 2NPBA 2KP1A 3HVSA 4HU7A 2W5FA 4TKYA 2X8GA 1PKWA 4ET7A 4PF1A 2Y6HA 1KEXA 1ZMAA 1F2EA 1SJIA 3V1WA 4ZXEA 2H1BA 1JU4A 2PWJA 2H01A 4BVYA 4PURA 2C3NA 2WQ8A 4G2EA 4QPWA 3OGSA 3WF3A 2B7JA 1ACVA 2DMLA 1O8SA 2LS6A 3GV1A 1L7RA 2JZTA 4POMA 4QB2A 17GSA 3TOUA 2J9HA 4I2TA 1OD3A 1BG5A 2HXKA 1SHWB 4DXRA 1JZ5A 3EYTA 4F03A 3U37A 4XTSA 3WYWA 4DEJA 3U5RE 1UY0A 2GT6A 2BTOT 1BEDA 2WBKA 3J7HA 1NW2A 4ZB8A 4DUWA 2NDOA 2CVBA 1AXDA 3IPZA 5ECQB 4M4RA 2LJRA 2QQKA 3DKSA 1FO5A 4OFTA 3GM8A 3SEPA 3OG2A 1M7TA 1AQVA 1X9WB 4IKHA 1GSSA 1PA3A 2GQKA 1W8OA 4KH7A 4G9HA 4X0XA 2H6ZA 3AC0A 4BWQA 4WBRD 3K77A 3A23A 3VK9A 3P1IA 4JRRA 3GN3A 3IRAA 4LMVA 2DJ2A 3KD0A 2WO3A 3ZM8A 3U6VA 1GULA 2QGVA 5DQ0A 3VDAA 2LJKA 4CHSA 3BJ5A 3CSHA 2LSTA 2KD7A 3UBKA 5EVOA 2GSSA 1AC1A 6GSTA 4GWRA 2R2JA 2QQOA 3WNNA 3ZZXA 5B8BA 1TI1A 13GSA 3WT2A 1TRUA 3F4TA 4XZUG 5IOXA 2QQNA 4MADA 2AV4A 4K6XA 3IA1A 2X05A 2L6DA 1UXZA 5J4UA 3F4SA 2DBCA 2B3SA 3C71A 3VD7A 4JKKA 3Q19A 4ECBA 2VD0A 2VUPA 3CDZB 3VD3A 2R37A 3M3MA 4NV5A 1WIKA 3CTGA 4K8MA 2C0EA 4JZQA 4UI9L 2CDPA 2G2QA 4IS0A 1UC7A 3CTFA 1PQNA 5G30A 5LA1A 1JZ8A 2TIRA 1XPVA 2CQ9A 2VCVA 2C0GA 4YAPA 2WZ9A 3ZFLA 1SDDB 14GSA 3BOAA 5CO3A 3WNPA 1PGTA 1SYXA 4IP1A 1TRWA 7GSSA 4IUGA 2JL4A 2RLIA 5LA0A 3NNGA 1S3DA 2VZPA 3MV01 2JZRA 3A7QA 3GKKA 4QAWA 3EWLA 3HYPA 2OACA 3TB2A 3FY7A 2YC4A 1T3BA 4GRFA 2K18A 5JUVA 2VLTA 1CZSA 3FL7A 5DAKA 5J1XA 3UARA 3GHAA 4OFMA 2VL3A 4PQQA 2HRFA 1YJ6A 5IM9A 5FWGA 5HQPA 1PMJX 4HQZA 2Y6JA 4L0PA 2VR4A 5J41A 3ERWA 1O81A 3F4RA 2L9LA 5EJ1B 3VFIA 1LNSA 3IDAA 4TR1A 4JKLA 4DSSB 3NIVA 3J7Yk 1F6MC 5EJZB 5D8IA 4MF5A 2J7MA 2C9KA 4E8DA 3I2IA 1TTZA 1ZGNA 2OKAA 4A4AA 4WETA 4HG6B 4MJCA 1W9TA 5JXJA 3G7JA 1FVJA 1BJXA 3GURA 3QFAC 4P08A 2OE0A 3DWVA 1M0UA 3CZUA 3GKXA 2EIDA 2ZEXA 4TXVA 3LGCA 4TR3A 4DXSA 5DQSA 3DIEA 3GL3A 5AIVA 3NOFA 18GSA 3Q6OA 1V9WA 1SL2B 4BVXA 3I3EA 3CMGA 2XPDA 2FA8A 2VQTA 3IHQA 4MGSA 1WOUA 2C1YA 2KLXA 1G0TA 4K7NA 1N2AA 1EGOA 5ECLB 1YKCA 1KBNA 2EICA 5C7GA 2CVKA 2DCKA 2X99A 5DPNA 1G6YA 1Z7PA 1SD8A 1JHJA 3ECQA 2WO1A 3QAWA 2XOMA 2YV7A 4CU7A 1UVZA 4O7HA 1NHYA 4XS4B 4HEA2 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 4ACS A;  1TDI A;  3DML A;  3VLN A;  5G2Z A;  4ZXG A;  3APS A;  5ELG A;  2FY6 A;  5HFG A;  4CU6 A;  3GGL A;  4HS1 A;  1WE0 A;  2HSH A;  4ZBD A;  3GKN A;  2GZY A;  2L59 A;  2MMZ A;  3ZMK A;  3FHA A;  2C4X A;  4OZO A;  4CU9 A;  4ZL9 A;  1CX1 A;  1XWG A;  3GL5 A;  5JWQ B;  3C7F A;  4N0Z A;  1ERV A;  3WNO A;  4RUV A;  4EDY A;  1HQO A;  4PUF C;  3KCM A;  3I2G A;  2J1V A;  2PU9 C;  1F3A A;  3DEC A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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