5CYYA

Structure of the c-terminal domains of dipz from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
333
structure length
333
Chain Sequence
TGTEIREQLNLGGIVNAQNAQLSNCSDGAAQLESCGTAPDLKGITGWLNTPGNKPIDLKSLRGKVVLIDFWAYSCINCQRAIPHVVGWYQAYKDSGLAVIGVHTPEYAFEKVPGNVAKGAANLGISYPIALDNNYATWTNYRNRYWPAEYLIDATGTVRHIKFGEGDYNVTETLVRQLLNDAKPGVKLPQPSSTTTPDLTPRAALTPETYFGVGKVVNYGGGGAYDEGSAVFDYPPSLAANSFALRGRWALDYQGATSDGNDAAIKLNYHAKDVYIVVGGTGTLTVVRDGKPATLPISGPPTTHQVVAGYRLASETLEVRPSKGLQVFSFTYG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of the ectodomain of the electron transporter Rv2874 from Mycobacterium tuberculosis reveals a thioredoxin-like domain combined with a carbohydrate-binding module.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule keywords Protein DipZ
total genus 91
structure length 333
sequence length 333
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF17991 Thioredoxin_10 Thioredoxin like C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.260 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Galactose-binding domain-like 5cyyA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5cyyA01
2Y6KA 4IP1A 2PPTA 1PL1A 4A3ZA 1A0RP 3WGDA 1XW6A 4IELA 3WYWA 3V1WA 3WNMA 1DE1A 4IW9A 5IOWA 4NMUA 3F6DA 3SKJE 3KJYA 2D2ZA 3Q19A 3IK9A 2GGTA 2HSYA 3VLNA 2EIBA 1KEXA 3IBHA 2VMDA 1PX6A 1XXUA 3E9JB 4XS6A 1YF1A 5HR3A 2DCJA 1UMIA 3K77A 3T0BA 4XIHA 3IHQA 1TJDA 5G1LA 3CIHA 3APOA 3IPZA 1JZ4A 3IC4A 3CTFA 3HY2A 3C73A 2H8LA 1IQDC 3T08A 2C80A 3VWUA 2JE8A 3CZUA 2YWNA 1RQMA 4KCEA 1A8YA 1EV9A 5ECOB 4CW9A 5GAND 2W1QA 5DAKA 2HFDA 2VQTA 3VD5A 2JD9A 4TR4A 3A2XA 4BDVB 2W3JA 3ZLPA 1T00A 2YN1A 1RK4A 2CDOA 4LLRA 4DUVA 1BYEA 4JKMA 2VL2A 1BEDA 2X64A 5E59A 4ILFA 5FT3A 5FHIA 3ME7A 5A1AA 4TTGA 2XHFA 5IMVA 3MWHA 2VCBA 3D3AA 2YG0A 2YCDA 2YPMA 4DSSB 2E26A 4YQVA 2RJ2A 2DC5A 2WGRA 4KSOA 2KD7A 4BK5A 3OEAA 4TXOA 5C00A 5AISA 4AG4A 4ECCA 3GGLA 4XZUG 3E0UA 4M4RA 1TI3A 1EWXA 5F7UA 2JSYA 5LCZA 5CYYA 4ZY9A 5D8IA 4IHUA 4KA0A 4JE1A 2CDPA 3LPFA 1SENA 1A8LA 19GSA 2W46A 4N11A 1G0TA 5A4VA 1O85A 1SJIA 4PF1A 5J3RA 1GNEA 3HNBM 4DSSA 2B6MA 1TVGA 5ECNB 4MZWA 4ML6A 1ULOA 2YB7A 3THDA 2J23A 1GOFA 1B48A 2Y6LA 3QOUA 1O81A 3LXTA 4TKYA 3J7Yb 5J4UA 1GU3A 1PGTA 1H75A 2VD0A 5EJZB 4KUNA 2W47A 1GSEA 4JRRA 3WEZA 5CZKA 3PGTA 2OBKA 3TJKA 4ZB8A 1B9XC 2J7MA 1QMVA 4IQAA 5J1XA 2WULA 5IMFA 3EMPA 1EP8A 3M3MA 3CTGA 1O8SA 1GSDA 1VRSD 1R26A 4ZBDA 4MMMA 2B5YA 3GL3A 4UI9L 3J7Yk 3CDZB 5G04L 2LJKA 2MMOA 1VF3A 2H75A 3GM8A 2VZ3A 1USBA 2H72A 1B4PA 1XPVA 3CZJA 2W94A 4Q5QA 3UOMA 2AJQB 3CKHA 5IFTA 1S3CA 2DSAA 2C3NA 3FW2A 3GHAA 4IS0A 4HJ2A 4P5YA 2YJ7A 5D9XA 3L9UA 1EP7A 1BG5A 3FY7A 5IPGA 3GTUA 2TIRA 5IPHA 2W92A 1C72A 3MDKA 3I2JA 1OKTA 2PN8A 1EGRA 1O8PA 1AIUA 3CMIA 4JR6A 1AAZA 2LRCA 3GV1A 3UVHA 4P02B 1UVZA 1FAAA 1V58A 2X09A 2RIIA 5G2ZA 3WNOA 4V2NA 3LQ7A 3EYTA 4PNFA 1IYIA 3LEGA 4XUQA 1PMJX 3K4DA 1IYHA 1K3IA 2VZUA 2IMDA 1SK0A 3I97A 4DXTA 3W5NA 4TRXA 3P7XA 5JWOB 4QAWA 3UL3A 3GDBA 1PKZA 3W6GA 4L0WA 1UN2A 1ILOA 2B5EA 4OCFA 1YKCA 2YWOA 1K42A 2N5AA 1ZMAA 3KCMA 3JXSA 3MSZA 1ON4A 2CV4A 4I8BA 1LU4A 3KM6A 3ERGA 3NOFA 1VF1A 4NHWA 3P6BA 3ACIA 3ZIJA 3EVIA 2M46A 1UYYA 3D4MA 4MABA 2V5DA 4XUNA 3VD3A 4AAXA 2L9LA 2DDUA 5CNWA 3RBTA 4QDSA 1AQXA 1KEBA 4OD7A 3FR3A 2VIMA 2VD1A 1O73A 4GWRA 2VCCA 1B4QA 5F06A 4XUPA 2DIZA 5H5SA 3Q74A 3JCML 2KUCA 1WOUA 1JFUA 2VQUA 4CUAA 4RI6A 1JU4A 4BVXA 4BJ0A 1Z3EA 5B4XA 3LJRA 3QMXA 2ON7A 3PINA 4NV5A 3UMAA 3CMGA 4LQRA 4V2MA 3KMNA 4HS1A 3H1NA 1UY4A 5JCWA 1ACVA 2PERA 3GL5A 3DYOA 1J84A 5IMCA 4ZILA 2FWFA 2C9KA 2QKEA 3L4NA 3KMOA 2I4AA 1W4VA 3UESA 4BWQA 1ZL9A 3EWLA 4Q5NA 2ZXQA 1MDIA 3WQBA 1TW9A 3OB8A 4NXIA 2VMEA 2FD3A 4TXWA 1QQ2A 1UWWA 1DUGA 1I5GA 3DIEA 1R4WA 2O87A 4TXVA 4I97A 3VDBA 4MZCA 2WN2A 1GL8A 2FCHA 4XVHA 1T4YA 2HZEB 2H6YA 3LEFA 2FY6A 1YEXA 3T09A 3CYNA 1UYXA 3U37A 2FHEA 4KDYA 1DYOA 4XUOA 4GXZA 4FYBA 3C1SA 3KXOA 4DXSA 5DALA 4BK4A 2OA7A 4OFNA 1SL2B 2VZSA 3ZFLA 3FK8A 4HQZA 1XPWA 4IQ1A 2IMEA 1XOAA 2H0HA 5DVBA 2DIYA 2B1KA 2VM9A 2LNTA 2EC4A 4F0BA 1K0DA 3ZL5A 1SYRA 3O3TA 2VCTA 4J2FA 4JKLA 2Y64A 2OBIA 3ME8A 3FHKA 2ES7A 3ZVJD 2YJHA 1HNBA 1EUTA 4P08A 5HQPA 3DYPA 2WRTA 4MGSA 2YV9A 3KTLA 4QX0A 5D93A 4L5LA 5IQYA 2V1MA 2C4JA 4MH3A 1PSQA 4IGJA 2AB6A 4OMVA 2JZRA 2AV4A 1JYXA 1JHJA 3MV01 4E8EA 4ZL8A 2LUSA 4ET7A 2MBSA 1PX7A 3LFLA 1JZDA 2F8AA 4ZBAA 3FR9A 1DLCA 3D6IA 3WGXA 3TKSC 1BQ7A 1HN1A 1FW1A 2E2MA 3VI7A 4KDXA 4EDYA 4ZIJA 4MH2A 2C3TA 3ZITA 3RPNA 2VZOA 4KAEA 4P00B 5D96A 2P0GA 1K0BA 1TDIA 2V41A 4CU8A 1URMA 1DP0A 4NPBA 5ECHB 1Z7PA 2F51A 3PUIA 3Q6OA 1A2MA 3FZ4A 1RW1A 4IJ3A 1O8XA 2E2GA 2FUG2 4V2LA 3EC3A 4GQFA 3FN9A 4OYUA 4ZXEA 4QX3A 2ZUPA 3C8EA 3EB7A 2VL9A 1JZ3A 2R7EB 1WMJA 3I2GA 4XS1A 1QFNA 2CZ3A 2VL4A 3GURA 4N30A 1GUHA 2HRNA 1OT5A 1GNYA 5EVOA 3KGKA 2FWEA 3SEPA 3IR4A 4MJCA 1BJXA 3HJRA 2XPEA 2XBQA 3F6FA 3KP9A 3BCIA 4TOPA 1ML6A 4I5QA 1SKSB 2H76A 1EV4A 3T2QA 3CRTA 1SKWB 4RQXA 4FH8A 1Z9HA 2J1EA 1UA5A 1LJRA 3GH9A 3HVXA 4K0NA 4L8EA 1UY0A 4ML1A 1SL0B 3WF0A 2H1AA 1WP0A 3C7GA 3IB3A 4QL7A 2ID4A 3FRCA 4CHSA 1R5AA 2QC7A 3L9VA 4GCIA 3WNNA 2VM2A 1GH2A 3IE3A 1UY1A 3M8NA 4K0GA 3LWAA 2WABA 2FWGA 1G6YA 4WF5A 4ULXA 5DCHA 1A2LA 3QD9A 2YANA 3NRUA 4MCUA 3ZMLA 3GXUA 2X10A 3I69A 4PXOA 3HZ8A 4AJ8A 4EE0A 2YP6A 4ZB9A 3LYPA 5JUVA 2KP1A 5IFPA 1M0UA 4N0ZA 4TR0A 1BHGA 1PN9A 2OADA 2W1UA 3VPTA 5CO3A 3VDAA 4MF5A 4OZOA 3IRAA 4PURA 3HNYM 3GX0A 1H6XA 2DLXA 5C7GA 2VC9A 3DD3A 3UEMA 2VCAA 1X5EA 2YC4A 5G30A 2VCVA 3BCKA 1GTBA 2WYSA 4TR1A 1W8NA 3NJVA 3VD4A 2YOIA 1UYZA 3M0FA 4HOJA 1WRYA 3PR8A 1OH4A 1JHBA 5I0DA 3C8XA 1M2DA 1NM3A 3G7JA 1SHWB 1UX7A 1FHEA 3I2FA 2WFCA 1GNWA 3ERWA 4BPYA 1PD21 3DWVA 3DECA 1KGYA 2ZNMA 1ZYQB 3ACFA 3EURA 1V57A 4QB6A 1XW5A 2REMA 5DAKB 2M72A 3BN6A 3I6AA 3F63A 4XHMA 2DMMA 4OFTA 3IAPA 3F4SA 3IAM2 3WSOA 4POMA 3I3EA 1M7TA 1HYUA 1AC1A 5ECRB 5JXJA 2J1SA 4X0XA 3HVSA 5JXIA 1UXXX 1THOA 2LRNA 1EGOA 3HA9A 1CZSA 3MNGA 1TKDB 18GSA 5G05L 2IFQA 4BVYA 1J08A 5IMDA 4TXOB 4HDEA 2H0IA 3I2KA 5EJ1B 5DQSA 1ERWA 5B6MA 1NX9A 4XS4A 3N5OA 3C1RA 2WO1A 1XC6A 11GSA 2W91A 3F4RA 2TRCP 3ZM8A 3F9UA 3IAS2 2L6CA 2LS5A 3QAWA 1SU9A 3T0DA 4ZL9A 2QSIA 1WKYA 1X9WB 2AHEA 1OE8A 2VTFA 2YFZA 4ARXA 4PUAA 2ZEWA 4N10A 2W87A 2VZ1A 4PQQA 2GLRA 4PT6A 4WEYA 2DCKA 2LSTA 3FYGA 2P5RA 2HZFA 1ZOFA 4MPFA 1PL2A 2X05A 3ZMKA 2VCQA 3WF2A 2WAAA 2C1YA 1J9BA 3I9V2 4O92A 4KI5M 3SEEA 2RVAA 1JI6A 2X8CA 4LA1A 4MLYA 1HNAA 2HSHA 2J1RA 1EOGA 4BA7A 5IJRA 4OMCA 3US3A 1UXZA 1XW9A 2LJAA 1JZ8A 4KMQA 4KSMA 2F9SA 3MUY1 2RLIA 4IJIA 3LXZA 4PQHA 1CZTA 2JZSA 1PA3A 1BAYA 1WIKA 1W9SA 1CIYA 3FL7A 4DUWA 3VD7A 3IK7A 4EO3A 2I3YA 1T7PB 1T8EB 1EEJA 2EIOA 3DMLA 4FI9A 4G19A 2WZ9A 3D22A 1TK0B 2WB9A 5AIVA 2GQLA 3CSJA 4BWSA 2I1UA 5G5FA 3GTUB 4F0CA 3G7IA 2VMCA 2G2QA 2VZVA 1JLVA 1GUKA 1M2BA 2QQIA 3I43A 4BXSV 1MDKA 3H93A 4D73A 2H1BA 1I9DA 1ST9A 1NSWA 2K8SA 1UY2A 1V9WA 5JCGA 1F3BA 3N9JA 1JZWA 1KTEA 2N5FA 2FWHA 3T2PA 2WN3A 2C26A 4J57E 1NAEA 3ABZA 1XOBA 1TU7A 1X5DA 4NHZA 4IUGA 5B8BA 4AJ6A 5DBQA 4MADA 4MO3M 5DMYA 4O7HA 1VGLA 1YQ2A 1AQWA 3P1IA 5AIXA 2HNLA 1D7PM 1JYWA 3ZRDA 2K8VA 3IDVA 3VURA 1GUMA 1O6JA 4G9HA 1TU8A 2NVLA 1X9MB 4CDOA 5B6NA 1K3YA 4NWYA 1H6YA 2IMFA 4KDUA 1W9TA 3DVWA 5D9VA 1Q98A 12GSA 2VL3A 5ECSA 3OBAA 1A23A 1T4ZA 3HEIA 2C0GA 2H6ZA 3C7HA 4V1Ag 3HN3A 4ZZ5A 4GZ9A 4X43A 4MDCA 3S9FA 4AJ7A 3T0AA 2FA4A 1AW9A 4PX1A 4BL7A 1W8OA 5IYYA 3ZYWA 1F4HA 2VJXA 3O76A 3A2VA 3NQHA 5D9WA 3KH9A 4JZQA 1MD4A 2E7PA 2GDRA 4MJAA 2OKAA 4V1Ap 3UVTA 5ABRA 1R64A 1EUUA 2C8UA 3ACGA 2CQ9A 1WPIA 2LW8A 4QL9A 1O8WA 3G7YA 2XC2A 5JWQB 5DJLA 1T2XA 2WO3A 1F6MC 1HQOA 1GSUA 1PMTA 4A4AA 2DJ2A 3DYRA 3ERFA 1X0RA 3UJ1A 1NUKA 2LV3A 4XUTA 2H71A 4MJEA 5IMZA 3GH6A 10GSA 3EE2A 2RM5A 2AUVA 3EU4A 3W5MA 1JYNA 5IOXA 2C0DA 1G6WA 2G0FA 3GUSA 1TI1A 3BGAA 1OC9A 4TR3A 4ECJA 4WKWA 3OGRA 2HLSA 4Q5RA 2GSQA 1W99A 3FHQA 3OGVA 4HEA2 2BERA 2Z4FA 1XBSA 3QAVA 2IPAA 3J7HA 3P2AA 3K75B 1GRXA 2ALBA 4QPWA 5HXMA 2XBIA 6GSUA 1EZKA 5DALB 3DKSA 2X99A 13GSA 4MK3A 5J41A 3WGEA 5LCWL 5JCUA 1BX9A 3TJJA 4TN8A 1K45A 1OD3A 1U3IA 4ID0A 4CU9A 2VO5A 1GSYA 2QQJA 2VOTA 4D0QA 1Z5YE 2ZEZA 2VZQA 2X8HA 2GZZA 3M9KA 2PMTA 3K8NA 2WDUA 2O7KA 1G7OA 3VD9A 4NV2A 1K3OA 2LNSA 3DRNA 1CQGA 3GYKA 5CREA 2JSZA 4K7IA 2BBAA 5CRDA 4O32A 2ORXA 2ORZA 5J5NA 1DE2A 4JX0A 5G1KA 4YH2A 3ZVJA 1XWCA 1UZ0A 1XVWA 4MJBA 3QAGA 1F37A 2JKXA 1Z6NA 4PUFC 1NW2A 2A4VA 2V6OA 4KB3A 1Z7RA 4HU9A 2HT9A 3ZFBA 3DEXA 4EXJA 1GTAA 4AGSA 5ID2A 4KNDA 3IA1A 1MEKA 2L4CA 2MMNA 2EIRA 4E8DA 1NHOA 1RYYA 1XWAA 3APSA 3H8QA 3TUEA 4DSRA 3RPPA 1YF0A 3G9BA 3KP8A 1WCQA 2L4QA 5IM9A 1XNAA 7GSSA 2L59A 3DXBA 5J9CA 5DDLA 3L9SA 2GSSA 4EDZA 1K0NA 4UAPA 2X8GA 1ERTA 2CAIA 4YPJA 3OGSA 3TKPA 2YFUA 1JZ6A 1YJ6A 2PVQA 4GF0A 2VUPA 4E8CA 1M9AA 3DVXA 3EMXA 3FZ5A 2HI7A 3GKMA 4EVMA 3CSIA 3UBLA 20GSA 2OJLA 2AYTA 4OFMA 1W9WA 1QGVA 1W0NA 2O85A 2GT5A 4GSTA 3AC0A 1GMMA 5LD0A 3NZNA 1FVKA 6GSXA 3A7QA 3HYPA 5L71A 3UBKA 4RYDA 3HOBA 2TRXA 4QB1A 2YZUA 5DQ0A 3KIJA 5DJMA 4POLA 3WF1A 2QQMA 4Z2AA 1GSFA 2PGTA 4ACSA 4YQUA 5F8BA 5DCGA 4LL4B 5D9TA 14GSA 3LEIA 2LKUA 3BBYA 5DN2A 1LNSA 4WR4A 5GSSA 2NBSA 2GTUA 5ECIB 2RUEA 1K0CA 4LMVA 1WJKA 2IMKA 5A4UA 1UC7A 1TTZA 4AF2A 3BOAA 1E2YA 4ZZ8A 4MPGA 5CAXA 4XTSA 4F9ZA 6GSWA 3HD5A 2B1LA 3QFAC 4EL1A 4DEQA 2H0GA 2VOCA 1TOFA 3TKQA 3D0ZA 1GULA 4G10A 2Y8KA 1OF3A 3R2QA 5LA2A 1A24A 1GWCA 2B3SA 3A5WA 4K2DA 1XFLA 3GKXA 1O7UA 3THCA 2VL2C 4OO4A 2ON5A 2GSRA 4EKZA 5AN1A 4RI7A 3GNJA 1FO5A 2DJJA 3E1F1 2RM6A 1PQNA 1SJ6A 3LQCA 3LE0A 4UOJA 1XWKA 4TR1B 5C71A 3A23A 1PKWA 5ECMB 3TDGA 1ERUA 1JZRA 3T2OA 3F0IA 2Z9SA 1Z6MA 4JU5A 2Y6JA 1R7HA 4EC0A 1XZOA 3CBUA 2V6KA 2LEGA 1K0MA 4RQRA 2QGVA 5LA0A 4POKA 2EIEA 3OG2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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