3PTYA

Crystal structure of the c-terminal extracellular domain of mycobacterium tuberculosis embc
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
333
structure length
284
Chain Sequence
SVGRSNLQALAGKTCGLAEDVLVELDPNAGMLAPVTAPLADALGAGLSEAFTPNGIPADVGTTAAPGINGSRARLPYNLDPARTPVLGSWRAGVQVPAMLRSGWYRLPTNEQRDRAPLLVVTAAGRFDSREVRLQWATDEQAAAGHHGGSMEFADVGAAPAWRNLRAPLSAIPSTATQVRLVADDQDLAPQHWIALTPPRIPRVRTLQNVVGAADPVFLDWLVGLAFPCQRPFGHQYGVDETPKWRILPDRITELLMRATTVASYLKDDWFRDWGALQRLTPYY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The C-Terminal Domain of the Arabinosyltransferase Mycobacterium tuberculosis EmbC Is a Lectin-Like Carbohydrate Binding Module.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule keywords Arabinosyltransferase C
total genus 65
structure length 284
sequence length 333
ec nomenclature ec 2.4.2.-:
pdb deposition date 2010-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF14896 Arabino_trans_C EmbC C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.940 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3ptyA02
3.40.190.160 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 3ptyA01
3PTYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3BIWE 3PUAA 5LW9A 2XX8A 4O7XA 4ZZ8A 1J59A 2R042 3T0DA 3LOBA 2EIDA 3ZYBA 1STMA 2Y64A 4XBLA 4CEYB 1URDA 1CIWA 3VDDB 1QKQA 3WY6A 5BNNC 4A4AA 1HKDA 4O61A 1OQEA 5BPXA 4YW1A 1GANA 2ZNTA 1DMBA 4IO7A 4GQ7A 1UOJA 2Z8DA 1B3EA 1CNQA 4DUWA 2RS12 5JR7B 3C8XA 4IEWA 1MPCA 1XNTA 4THIA 2Q30A 2P3KA 2W9XA 1DTZA 4FEDA 2WZEA 3HVDA 1T6BX 2R073 3N6TA 5I8YA 3I59A 4YGDA 2WS91 4R75A 1OVSA 3PUIA 4EQVA 3U4SA 2OKXA 4EN6B 3DLNA 1TQ5A 3G6JB 1FOD3 1UX6A 4QQHA 2RM23 5JMCA 2ZACA 1A8FA 2D6MA 1PGL2 2NMNA 3QUJA 5F5CA 4YKKA 2YFUA 5IZ1A 1NCRB 3A21A 1COV3 5EHMA 3VLWA 3ZYHA 1P99A 4UW5A 3LB9A 3TELA 4CDQC 1NA1B 2V4AA 2WWSA 2Z2SB 2IFRA 4UXAA 3RTWB 5JI9A 3RWKX 1I6BA 3G3HA 4YVWB 2VTFA 5FY0A 3OUIA 2ZZXA 4NWWA 1DQ5A 4PIXA 3FE5A 1INPA 2FMYA 2BTVC 3LPFA 3NO8A 4PBOA 3BGAA 4EN7B 2F36A 1X9PA 3M8LA 5AA2D 1X7NA 3KT7A 3POFA 2D6OX 2RC7A 3N36A 4QXCA 2JG8B 1W03A 5DDJ2 1SLIA 4LR4A 4XETA 4XJZA 4MO3M 4XTMA 3SEWA 2VOVA 2XVKA 4G68A 3IORA 1R6ZA 4NRMA 3O28A 2VMDA 3T93B 4RHV2 5CADA 2OBGA 1JI6A 3U11A 4Q8LA 3JBG1 4AB5A 4O8MA 2XG3A 2O8QA 5FZ1A 5JVVA 2JDNA 3WP6A 3ZXEA 5M0TA 2E9QA 5CKQA 4Q0CA 3LD8A 1V9U1 3KBZA 4H14A 4E4HA 2IXLA 3SEVA 1IQDC 4KH9A 4KBBA 3N4MA 4FPEA 1FJ9A 1XNCA 2J7MA 1ZZ7A 1IGOA 3T2OA 1GFF2 2XVLA 3JD71 5FY9A 4NEDA 4P08A 3POEA 1WLTA 3USUB 1S0IA 3OBTA 4GWWA 4BDQA 1LB9A 4PDHA 3KEIA 4F83A 5TPAA 5T5PA 3BTZA 3VB9A 1PO23 4WVMA 3L6GA 3FV1A 4QX7A 3PUVE 1ND2A 5K2XA 5AC91 5GJ6A 5L7OC 4PCRA 4Q4W2 1UTBA 1XXNA 1JVYA 4RS5B 1UKRA 3L6HA 5FY1A 4I62A 3CL1A 1GZ9A 3D5OA 2BFUS 2NMOA 3NAPB 1ZBA2 2CGNA 4NHYA 4QXKA 4WXJA 3EYPA 1Q8QA 4XIGQ 2HAUA 2P0SA 5J09A 5FHMA 4IEOA 3QLQA 4KR5A 1WDNA 2Y26A 3ZFGA 4OMCA 4AEDA 1JHNA 5DN2A 4E9KA 4MFIA 4XMIA 4GMP0 4OI4A 3B6QA 2O1QA 2Y7PA 4MEVA 5CRYA 2PHUA 4NHXA 4G8MA 2A3XA 2Y0IA 4QAWA 2C26A 2XWKA 4BMEA 4MZUA 1YQ5A 2RS31 4P8BA 2JKXA 2O7UA 1VSOA 4HETA 2IEEA 1K5JA 4BHPA 2XXRA 3FHQA 5FQ0B 4IEPA 1XI6A 3MDPA 4AG4A 1RUE3 3RWNA 2BPA2 4O3BA 4TN7A 3ZFEA 4TLGA 2ET7A 3PMXA 3SEYA 3QYTA 3RPLB 5FXXA 1D4NA 2D7FA 1SW2A 5HV4A 4Y4YA 3MF6A 1U12A 3MBPA 1MXXA 2I2SA 1POV0 1ZZCA 4GWIA 2WNUA 4Q8RA 3K2DA 5FZOB 5HXVA 5K9YA 1WKYA 4YG6A 4WEPA 4DOUA 1LHUA 3V0AA 3VDAA 4TYSA 3ZMOA 4AYUA 3BI3A 2DUOA 2XB6C 1OLAA 2DCZA 4UF0A 1D4M2 5EXOA 1JVXA 2HHMA 5LA2A 1RUJ3 4K8RB 4MJOA 1MVQA 4F2QA 2DS9A 3THCA 4D7YA 4Q0PA 3FJGA 4BLIA 4HW8A 2C1FA 4XUTA 5C3QA 5C9AB 5DUVA 1B32A 4HOOA 2HWD2 2VULA 4JTOA 1NXMA 3DXTA 3FASA 5HCFA 3AL6A 2Y0OA 3VBUA 4ES9A 3UNPA 2DU0A 3T2QA 3ZYIB 4F1UA 2DVCA 3SZPA 4NF8A 4CUCA 2B3BA 5KHHA 1SLLA 1YYZA 4OTEA 3TEWA 3K01A 2MKZA 5I8TA 3S9LC 4ZU4A 4BB3A 2ESNA 2QTWB 4LKSA 3E3KA 2ABHA 1DHKB 3HPIA 1W2TA 4BDRA 3PMEA 1QQP2 2VL4A 1N7XA 3TDJA 5FREA 4OESA 4AI3A 2CZLA 4DXBA 3TQWA 3J7NA 1BEV2 4P14A 3JB4C 2KA3A 3HFUA 1RDZA 4Q0UA 3ES4A 4F18A 2MEV1 4NG7A 3WQ1A 5TSWA 3ZVXA 1JZ8A 1O3TA 4EN0A 3PJYA 4O7MA 1P8JA 1G8WA 4QB1A 2DVDA 1P1WA 4LZ7A 4ET7A 3C34A 4IV3C 1SEFA 2IXIA 2G1MA 3WF3A 1PDAA 2Q2CA 1UOFA 2EVXA 4GD4A 2ZYMA 1R1A3 2VUCA 4NX1A 2YLNA 2C5DA 3KT4A 3UA8A 3CNAA 1OMIA 3CJIB 3MP6A 4H6DA 5CMCA 4QFOA 2UVJA 1FBDA 2BVVA 1PZ7A 2PAMA 4QHQA 1AVBA 3A7QA 5IUQA 4LZ5A 5A7WB 2YXSA 4AQ6A 4HE0A 4OHWA 3NNLA 4U1ZA 4AVAA 1NKGA 4DB5A 5D2AA 1NX9A 1AL3A 2F34A 4NWCA 4Q4Y3 3VVFA 3K77A 2RJKA 5LDZA 2WC2A 3TB0A 1AR71 5JWPA 1PMHX 1VBB2 3GBGA 2CHHA 2WO7A 3LSXA 1W9WA 2WWJA 1WUVA 3PMSA 4XIOA 2FQPA 4NF4A 2P2KA 3ZPOA 2QFEA 3OUHA 2EICA 2F5XA 3DUIA 4OCTA 1AR62 1AZDA 2XJSA 2H6CA 5A7NA 4FECA 4I9DA 4QKBA 2FDGA 2ZTNA 3U65A 5I56A 1ZX5A 3GDBA 5GLZA 1Z78A 3UP9A 1IMFA 1F9KA 3LZZA 4B7EA 4FPOB 4PIZA 4IO5A 4OETA 1JZ7A 4ZDMA 1J3QA 3IT8A 5E8AA 2RC9A 4Q26A 1FPDA 3A22A 4XJ9A 2ARAA 4IERA 1FPN3 1OFNA 3OTFA 4R6HA 1LGBA 3VE1B 3E5UA 3PUQA 2GALA 1G9CA 1SW5A 3CBNA 1AOVA 5IK8A 2C0ZA 3MW0A 4AI0A 1BVVA 1CVNA 1I1EA 3M3IA 5DABA 1EYKA 3W9VA 1BLZA 1FQCA 3BFTA 2XOMA 1AH5A 3SKJE 4S2DA 3VZMA 1DG6A 4GD5A 3TTRA 1NV7A 1JW4A 4TLLB 1DYKA 3AYAA 3ECRA 2PVUA 1PC3A 3AVSA 2RINA 1KWHA 2PLV2 1IXIA 1DQ4A 4LATA 1FBEA 3AZYA 4C1TA 3KVAA 1V70A 5FMOL 3POJA 3N9QA 4MXWA 1MM7A 5CFCC 1A8DA 2VXJA 1U5YA 2N7GA 4QPGC 3TPAA 1BKZA 2XQRA 2ERFA 1HXS2 3NQHA 3VZOA 1TMF2 3VBFB 4P9WA 4MGQA 3LDBA 1GZWB 3I3DA 2W68A 3N7JA 1DPPA 3AZXA 4X8PA 3VBOC 5JMOA 3PD8A 5DAVA 3MW4A 2XXQA 3LA7A 3UJQA 2D44A 1YAEA 2O6AA 5A1FA 2Q1FA 1OI6A 4N43B 1CGPA 2GC3A 2VQ0A 3AYCA 1Z0HA 1RUH3 4QPIA 1SMVA 2WA4A 4JGYC 1ZZ6A 4XHXA 1Y20A 4NF5A 3KF5A 1XNDA 3I2OA 3H6UA 5FKBA 2H25A 4DCYA 2XVGA 2QBXA 3WG3A 3QOPA 2Q8DA 2HXWA 1AIVA 2FIXA 2RE9A 2RS51 3ZSEA 3TYHA 4B1LA 3NVCA 4MUVA 4PETA 1IQAA 1LOCA 4BQWA 4QDSA 3RMXA 2FZ1A 4IEYA 1IG3A 3AFKA 4C0HA 3CFLA 2W95A 3RSJA 1F15A 1QJZA 4N91A 1B1HA 3KV9A 4R4ZA 3E6BA 2VBPA 3VBSA 2YHJA 1QUKA 3OG2A 3MLLA 1UOGA 5EYYA 3PVNA 4RNSA 1NXD1 5KDTB 5K2YA 3IR1A 3B50A 4FEBA 3TN91 5A70A 4NIAA 4PF5A 5FYVA 2AACA 3ZLIA 1AR92 1GYKA 4EV0A 3KOSA 4UAPA 4FFIA 4M3CF 1BHGA 4LBQB 1XVYA 3AC0A 4PBQA 1RJ8A 1OVTA 4BOWA 4OANA 4XABA 4KCDA 1ZREA 1QDCA 4I0WB 3TCHA 1EAH3 5CISA 5FP4A 1R092 4XUPA 2D21A 5LRRA 4LKDA 2BVBA 5FO7B 2BUKA 5IM2A 1LOFA 5FY5A 3RGBA 1ZYBA 2VQTA 1GWMA 1SDWA 1QHDA 4PAKA 5DZEA 1MS8A 3WP5A 3LFIA 3RG0A 4XFEA 2H0VA 5CFDC 3U4XA 2HWC1 4OQOA 2FBPA 1LU1A 5A3OA 1NUYA 1JYCA 1IXHA 3NL1A 4LPLA 5M2VA 1SACA 4LJHA 4EZ4A 1RJ7A 1PEBA 3ODBA 4XDQA 4LITA 1IKPA 3O6GA 1AWBA 1K9ZA 2QQLA 3ZFFB 2PQQA 2Y7RA 4LEJA 3WINE 1W8FA 5ANNA 1HB4A 1RUD2 1D0GA 1XB9A 3ENRA 4CUGA 4KD5A 3WDXA 1LRHA 1RYXA 3HQUA 1UW8A 1OXCA 2ZX4A 3HHGA 4GWSA 1ENSA 3GZAA 3OO7A 1ALYA 3U14A 5LK7B 3P5BA 5ABJA 2W7YA 1MPDA 3WNLA 2NUVA 1V6KA 5D21A 3S7IA 4B4QA 1VBD1 3U07A 2Q8OA 2GP5A 4NAMA 1AL23 1LBYA 4IGTA 4Q4V2 4HK8A 5CG9A 2QZ2A 5C8CB 5HCBA 1HJFA 1F31A 4GWYA 2DOJA 5LBEA 4UFKA 2DCJA 1F5FA 1GWKA 1WCSA 3ST7A 3O6IA 4OQ8A 4M01A 1W2UA 3HSTA 3AL5A 4WM8B 3T9UA 1FI2A 1NNTA 4GZ9A 4HANA 1W8WA 4P0GA 2Q1ZB 1G6NA 2EIGA 3E97A 4IL7A 1AYN1 5AFEA 3MF9A 4ZEIA 4RR3C 3GJAA 3THPA 4HS7A 2DWIA 1QUIA 4JCKA 4MGIE 3RNSA 2H0BA 2HEYF 2JG9A 5ITOA 2VUDA 5IGAA 1X33A 5FR3A 5J96B 1BBT3 4XILA 3DL3A 4YICA 1W6PA 4NUBA 5JPMB 1BTJA 3SEEA 2NOOA 2ZGRA 3AXFA 4Y33A 1MXWA 3L9JT 4CA9A 2ARBA 1DLCA 3OCPA 3FZ3A 3VDDA 3T4VA 1KFUL 1TME2 4URAA 1C57A 4K20A 2QQMA 2YC4A 5C8WA 2DCTA 3FC0A 2FCVA 3BKIB 3K75B 1IXCA 4HFSA 3VKLA 4CEWC 3IJXB 3R7XA 3JU9A 2BJJX 2R16A 3QXMA 2IA4A 3LA2A 1VBC1 2OS2A 4COUA 4K1ZA 1P1UA 2P37A 3VBRB 5FY7A 3OBAA 2WFF3 1IKQA 1NCQA 2RDRA 1Z7S3 3ORJA 4Y1VA 3VGIA 4YM3A 2JENA 1QDOA 3MW3A 1LKNA 4FFGA 4AGVA 4XF5A 4BXSV 1OURA 2B8MA 4PHZA 3C31A 1ASJ2 1MDP1 3BODA 2JICA 3OSQA 2P17A 1D9QA 1EH3A 1NLQA 1NCRA 2B7YA 2F7AA 5FZ8A 3AJZA 1LENA 4YKJA 5ISLA 2UU8A 4GAZA 4QX2A 4E2GA 1A8EA 2JXAA 4I3EA 5FHNA 3PUHA 2WUHA 2QE3A 2VQUA 3OELA 4O65A 1W2NA 5FWJA 2JEMA 5A3UA 3K6UA 2D40A 3MGUA 5H8NB 4GH4B 2CZKA 4FOQA 1OQ1A 1MY3A 2VCMA 5J16A 3IPVA 4QM9A 4XEZA 3I2HA 3GF6A 4Q4X1 2B42B 2IFWA 2KXLA 2HWB1 2FA7A 3IO6A 1ND2C 4LZ8A 4RQPB 2J1RA 2VVDA 2ZHKA 3H3LA 5FZKA 1OVBA 2ZMLA 5FZLA 1Y4TA 1OA4A 1RXGA 3SCGA 1HIXA 1B35B 2P1BA 1W8OA 3O6HA 3GZUC 2W46A 4BPZA 2HEWF 1CN1A 5AFBA 1YUDA 1B3GA 4DQAA 1J84A 1XE0A 2CV6A 3KMHA 1KZ8A 1PGW2 4FXGB 3KV5A 1FMD1 4IO6A 4EE2A 4NHKA 4JSDA 1GOFA 1YO8A 3MUZ1 4F8AA 2XJVA 4Y24A 4N6PA 4DUVA 5JZGB 1NL5A 3OEKA 3K0VA 3MIEA 4OEVA 5A3MA 3FXQA 4Y20B 4AI2A 1DSNA 4LE4A 2ZJCA 3M1HA 4E0XA 2Y38A 5DDJ3 2DURA 1MS3A 3IDEA 1WW4A 5DT6A 1UN1A 5A3LA 2I45A 5K0UB 1KEXA 4BDOA 3GNEA 1BK4A 5IYYA 2XUEA 1J1TA 4IEZA 4RHV3 5I2KB 1UZ0A 2CY6A 3E9XA 4YMAA 3R4UA 5HPQA 5T3NA 3NV2A 1O64A 3NAPA 1NNPA 4P9KA 1CR7A 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 3PTY A; 
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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