3PTYA

Crystal structure of the c-terminal extracellular domain of mycobacterium tuberculosis embc
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
333
structure length
284
Chain Sequence
SVGRSNLQALAGKTCGLAEDVLVELDPNAGMLAPVTAPLADALGAGLSEAFTPNGIPADVGTTAAPGINGSRARLPYNLDPARTPVLGSWRAGVQVPAMLRSGWYRLPTNEQRDRAPLLVVTAAGRFDSREVRLQWATDEQAAAGHHGGSMEFADVGAAPAWRNLRAPLSAIPSTATQVRLVADDQDLAPQHWIALTPPRIPRVRTLQNVVGAADPVFLDWLVGLAFPCQRPFGHQYGVDETPKWRILPDRITELLMRATTVASYLKDDWFRDWGALQRLTPYY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
publication title The C-Terminal Domain of the Arabinosyltransferase Mycobacterium tuberculosis EmbC Is a Lectin-Like Carbohydrate Binding Module.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Arabinosyltransferase C
total genus 65
structure length 284
sequence length 333
ec nomenclature ec 2.4.2.-:
pdb deposition date 2010-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF14896 Arabino_trans_C EmbC C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.940 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3ptyA02
3.40.190.160 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 3ptyA01
3PTYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NPMA 4NF8A 3VDAA 4LIUA 4NN3A 2XJSA 5FP3A 1QWRA 1I5PA 3G7DA 4OETA 4YVWC 4F3GA 3P1IA 3NNGA 3FHIB 4FPEA 5BNOB 2BVBA 3DP6A 5IYYA 4L9BA 4O8MA 3GBAA 4UF0B 4OVJA 4IV1A 2ADDA 3VLWA 3A29A 2BOJA 3RZLA 1HJFA 1URGA 4QGLA 2ID4A 3H7YA 4OLLA 4B4PA 5LA1A 4EROA 4NIDA 3BBRA 5EYGA 4LBQB 4U2RA 1C4RA 3HN0A 3CU7A 3S5AA 4TTGA 4HE2A 1JYIA 4QX2A 4MUVA 2V25A 2EXIA 5I58B 1YHFA 3OGJA 2BBAA 4F2QA 4S2GA 1ULOA 4I3YA 4XW3A 4QSDA 4AYUA 3H8XA 1G7YA 4N91A 1H2NA 2EIGA 2MHFA 4XBQA 3SZPA 5IVBA 4RY1A 2WUHA 3V89B 2CV6A 2ZA9A 1RUNA 2NN8A 3CEWA 1Y3QA 4WXJA 1H2KA 2AYSA 4GXAA 4AVVA 2XLAA 3NQHA 1S0DA 5IZZA 4Y33A 1GV9A 1FBDA 3S4UA 3UKVA 4B4QA 3W58A 4PQQA 4GH4C 3POIA 1UKRA 2MEV1 1FX5A 1AYM2 4E9KA 4CDUA 3USDA 2DFBA 1D3KA 3LFMA 2CEYA 5ACA3 2VW1A 1ZZ9A 1VPHA 4LATA 4PLMA 4W6XA 5HBCA 2E31A 2AGSA 3UIFA 1AL21 2JB4A 4KL1A 3GZAA 4TWTA 1W3VA 4MZUA 4XEZA 4XTPA 1KJLA 4QM8A 1UWWA 1HQNA 5CG9A 1VRH1 3B8BA 3QSLA 1TG7A 3CJIA 5GALA 2ZAHA 2ZHKA 5FHNA 5ITPA 5F37A 2CDOA 1VBE3 2QMWA 3C7GA 4UI9L 3IOTA 1OIBA 3HPNA 5LBEA 4EN8B 4FECA 3TELA 3N3HA 1DGRA 3RPLB 2IXKA 1ZZ6A 1LLSA 5JI7A 1C28A 2PHUA 5DVFA 3EHSA 4B7KA 5FMCA 2PVUA 4FFGA 2QBXA 4YVSB 2Q1FA 5E89A 3A4UA 2XQXA 3OELA 3SMHA 4Q0VA 3O12A 2M8CA 1NCRB 3AKSA 1TE1B 1RUF2 2PAKA 2DURA 4IE5A 4MXWA 2R7EB 2VBPA 4E4DX 3ZYJB 4CP0A 3WP3A 3PPNA 4YGEA 4BPZA 4WVMB 4XBNA 3OOXA 1VBB2 1UX6A 3GM8A 3PTRB 3SEWA 3S0MA 4A3XA 5ANQA 3MIDA 5KXEA 1LOBA 2WFPA 2QRYA 1KJRA 3ZPOA 4RYDA 3H1MA 5LA9A 3WDVA 1RUE3 4YZ4A 2PCRA 1XQNA 1ZBE2 2Y0OA 1WMEA 4M3CF 2ZEWA 5I5PA 1W6PA 1WLCA 3OO9A 3OTFA 2UVHA 2C6SA 4CDWB 2QS1A 2BDRA 4P1EA 1LU1A 2W1WA 3MUY1 2ABHA 3OB8A 5CB7A 3OEMA 5A3PA 3SKVA 5DUWA 2VUJA 2B3FA 1D4M3 4ZDMA 2E33A 4IV1C 4NGUA 2WKKA 5GLZA 2XHNA 2WFF2 1NLQA 1DP0A 3DP4A 3I2DA 2XJUA 1BBT2 2YYOA 3UT0A 1GQGA 5E1RA 2VR4A 1GWKA 2FDJA 5JZGB 4G2ZA 2VD3A 4HVQA 2RF1A 1XRUA 3H8UA 3K46A 2V4AA 4BXFA 3VLBB 1XVYA 1W6NA 3KCYA 1W05A 2EAAA 3BVCA 3MYUA 4F2OA 4L97A 1J84A 4CU7A 4XKRA 1Z7NE 3FUOA 3WVJA 4JDNA 4ARXA 1US3A 2Q0AA 1LOAA 5CKMA 1N3PA 1O63A 3DXUA 4XDQA 4AL9A 2WZPP 5A3MA 4YAHX 1CVNA 4NVPA 3KQRA 4H7MA 3LOIA 3K4ZA 4OEVA 3D82A 1NMUA 4PI2A 4QX5A 1RUI2 5BPXA 4OYVA 3UJOA 4E2SA 1YIFA 4QPIA 3VDCA 5TU0A 3O28A 2DVDA 3K48A 4OFGA 5A7SA 4BMEA 4RHV2 3WLUA 2A6YA 4Y1ZA 4KYSA 5DAVA 3P5BA 3QBQA 3OCPA 3VDFA 2XQRA 4ZS9A 4FT8A 2JG9A 4JB7A 3D3AA 4FTEA 2OCUA 3T96B 4OZXA 2BPA2 1LOCA 4GWIA 1ND3B 4TZDA 3SEUA 4YZ2A 2NPIA 1MQJA 3SDFA 3U78A 3IOWA 2WL1A 4WZFA 3RZHA 1YQ2A 3B94A 4E27A 2Q4SA 2Q74A 5FXVA 5JWPA 4NWWA 3WCRA 1DTZA 4YG6A 2QQPA 3OY8B 2YBKA 1R092 1H2MA 1N1YA 4N43B 3WW2A 4IW3A 3CIJA 3MZHA 2LAOA 4CCMA 1AJOA 4DIGA 1KA0A 2V73A 5A5LA 1GP6A 4FO9A 3RYKA 5I91A 2C9AA 1RMU3 2PHRA 4IO3A 3MW3A 3DPRB 2O8OA 2QVVA 1SW5A 3A0KA 3J7HA 1AYN1 1YI7A 1UIJA 5FQ0B 3HV1A 1Y4CA 4GB32 1MS9A 1KS5A 5KXDA 4MF3A 5L7OB 4LE4A 1ZNPA 3RG0A 2GDFA 4XFBA 4DPNA 4AZZA 3PVEA 5HXVA 2Q8DA 3M8LA 4UWDA 1FPN3 2NLRA 4CRQA 3RT8A 3PU8A 3DGTA 5C5UA 1IQ7A 4MO3M 1EU8A 4AEDA 4YPJA 3MVWA 1L5TA 3JB4C 1YYNA 3T09A 4AVCA 1GQHA 4FXKB 2WINB 4HE1A 1PO23 3E3KA 4Q26A 4M3CE 2ZJCA 3DYOA 3TEXA 2YBSA 5EWSA 3WQBA 5H8FA 1QIQA 1VE0A 1POV3 1ZBA2 3L2YA 3FC0A 2F4PA 4KH9A 1DPPA 3LCPA 1VE4A 1MQIA 1B5JA 4R4XA 3GBBA 3W15C 4A7ZA 3VBFC 2WAOA 3K3NA 2XJQA 5IK5A 4QQHA 4RGGA 1BMV2 1YNAA 2F35A 3ZXGA 1YC61 5C8WA 5APAA 3RN8A 4C1TA 3AKTA 1RL3A 3ELNA 3AMQA 4FPYA 1J59A 3HN3A 4BZ4A 2P3KA 1JW5A 4IEPA 4LO6B 2QUOA 4C1WA 3KOSA 3PUIA 3U1OA 3B50A 4CCLA 2O1QA 3LEGA 1DGLA 5LDZA 4GD4A 2JDAA 5BWJA 1A55A 4BQ4A 3SXWA 1XNDA 1XYNA 3T4HB 4DLDA 2W95A 4P5YA 3A21A 3CG3A 4G9SB 1XJAA 5C9AA 3TQWA 2XHDA 1NXD1 4L92A 1PEBA 1JYNA 4C0RA 4A41A 1RUH1 1NFTA 5HBAA 2GC0A 5B4XA 4YW4A 1B3HA 3ACLA 4CYDA 1CPNA 1Y9QA 3LEMA 4IXLA 4XOGA 5AFBA 1NV3A 1OF3A 3WDYA 3K01A 4Q4X2 2PHWA 4CDQA 3LC8A 2DU0A 4XACA 4R4ZA 1Y9MA 3C7EA 1M4WA 1B1XA 3R4DB 2A75A 4XDPA 4P1LA 2VUDA 4DMIA 4ZU7A 5CG8A 2X29A 1B4HA 1OUSA 2UY8A 2UVJA 4MX3A 3LIHA 5J3UA 1LOFC 2THIA 3AK0A 4YW3A 4FPHA 2QSXA 1UIKA 3IO6A 1NCQA 5FP4A 2ILMA 3LZZA 1UX7A 4GIZA 4PGPA 5FHMA 2OIIA 1PO11 4I2OA 1V70A 3KGCA 1NA1A 3J8F2 4META 2CZLA 3W59A 1CIWA 3VVEA 2JJKA 2WNOA 2XOMA 4RK2A 4S2HA 4DRVA 1B5IA 4PAFA 1POY1 4GQ7A 3D4KA 1BKZA 4HMZA 1I6XA 4R6HA 4FQ4A 1PK6C 2E9QA 4OFOA 1LBBA 2GQ1A 3M2MA 2HJIA 3ZYIB 1W8HA 3I3MA 2RCBA 2QVRA 4QPGA 1CAWA 2RCAA 4MNIA 1IS4A 3IBMA 1NLRA 1EYJA 3UA8A 2XXPA 3ZMNA 2JENA 2VMGA 2YV8A 4Q5TA 3N5LA 1SZBA 1IQDC 1ASJ3 5EHMA 4DXTA 3FLRA 1WBLA 3MJNA 4QXBA 3VBHA 3PJYA 1NV4A 1SFYA 3O97A 1YTVA 4AEDC 1SLCA 4QDQA 1NUKA 4N7UA 1FMD2 4OI4A 1W8ZA 4IV3B 3N7KA 4GWZA 5FJKA 3A22A 4MH0E 5GZGA 1HRI2 1PNGA 5B70A 3M3LA 1DZTA 5JXIA 3OUHA 4HVRA 3M1HA 3CLPA 1VBD3 1S0FA 3JD73 3JXSA 4COWA 5C33A 5M0TA 2HBTA 1ATGA 2WA4A 4HSJA 4F7ZA 1JZ3A 3LA2A 5I0TA 1CAUB 1ZU0A 2F6PA 1MEC2 3KN8A 1MVQA 4FTSA 3RPWA 1ZIUA 4P08A 5FP9A 5GZFA 5I8SA 3ZSLA 5ACA1 1SI1A 2Z23A 3PIGA 4CU9A 1LB2A 1CR7A 2B4MA 4Q4W3 1V6MA 1MY4A 1NNKA 1OF4A 2RR12 1JODA 1PX4A 2JG8B 1ND2B 3ZO0B 3DXTA 1AOVA 3IM0A 5G04L 2Y7KA 3KVBA 1CONA 3VBOA 1Y9UA 1LENA 2DWHA 1RUD2 1MZ6A 1PVC3 4QFNA 3D4CA 2Y7IA 5C9AC 3ONMA 1XE8A 2JWPA 4Z2AA 1PIV1 1XNBA 1NUWA 3LR1A 3AVRA 5J37A 4CXWA 2K9ZA 4EWAA 4O7XA 1QQP2 1TME3 4PETA 4MX6A 2E0SA 3S7IA 1FCKA 2YMZA 3H6TA 1S7YA 2CY6A 2XWOA 4A6OA 5H8HB 1IIWA 4NF5B 5CI5A 2LTNA 3OGVA 2QQKA 2W7YA 2RV9A 1UY4A 1FBGA 5DMYA 5D8AB 5L9RA 3ZKKA 1A40A 1FPLA 5FZ6A 3THDA 2D6MA 3TFLA 4ZS2A 2JECA 1DCSA 4P0GA 4AQTA 3NWKA 3P3PA 3O1RA 5CBSA 5J09A 1EZ9A 2B8MA 1G6NA 4HFSA 2UY9A 1T0KA 1NA1C 1Y3PA 3ZFFA 1RUE1 2NP0A 2O14A 2DVCA 4I30A 4AFMA 5CMMA 4KWJA 1W8FA 4FQZA 4JSDA 5K9YA 1YYZA 1MQTB 3RQTA 5FXXA 1UU5A 3ILRA 2WO1A 4JV4A 3OUIA 3HQUA 1WLWA 3DF0A 2XKOA 4OMDA 4XCAA 1D4M1 5SV5A 4UXAA 1FPFA 3FX3A 3H1YA 5C4WC 4X8PA 3POJA 2HBUA 4YICA 2DCTA 3O6HA 5I56A 4NF8B 2JD4A 3GHNA 5ELVA 5GLWA 1A54A 3OGGA 5DPNA 2VMEA 2XXZA 4H5FA 4WM7B 2WQ8A 2XB6C 4DY5A 2VY0A 5EP9A 4RA1A 1US5A 4MJOA 2O7UA 3ZYGA 3E5XA 3KV9A 3PUSA 3KN3A 3MV01 3S30A 3A0NA 1HB1A 5LCWL 2BNMA 2WA3A 4CTEA 3SHRA 4Z8BA 2Y33A 5FYIA 2BW8A 3P6BA 5GM0A 1NE6A 2QQVA 3TB0A 1JYVA 1CGPA 4P14A 1LGNA 1H6YA 5BNPC 1OVSA 1JS9A 5FPXA 1YI9A 1B2HA 4OENA 3FXQA 4AGVA 3GCWA 2W2IA 1P1OA 4KGGA 5AA4A 4MNPA 5EQ7A 1LBCA 3KSJA 3N9MA 4Y5SA 2MEV2 3CVGA 2W68A 5KHKA 3RNNA 1UXZA 3OPTA 1QGXA 2Q2CA 4FBPA 2HHMA 1HDKA 3S5QA 3N9NA 5FOJB 2Q9TA 5CYYA 4D0QA 3WUDA 1SPPA 3KZ4C 5I8TA 1JBCA 1OVPA 1VRH2 3N9QA 1O59A 5I7IA 4ZKTB 1W8NA 5JCTA 4I0BA 4ZZEA 4MADA 1WW5A 1XVXA 3SH5A 3T0AA 4JRAA 4CDUB 5A1LA 1VR3A 3T08A 3RUMA 1MG1A 3B6WA 4BDQA 3MQ9A 4EQ9A 4Q1RA 2W1SA 2QQIA 2IFRA 3HOBA 5BNQA 1QKQA 1H76A 3D0SA 4F8AA 2A3WA 4QKBA 4GVOA 2FNCA 2GH8A 4NX1A 1I5ZA 4YW6A 3HMYA 4XTCQ 2A1XA 3PV0E 3ZFGA 1RMU1 3ISPA 1KFXL 3ENRA 2BJSA 5ERLA 1YWKA 5IVCA 4PF6A 3OO7A 5FZIA 1CAVA 1GFF2 2QMXA 4JSOA 2Y64A 3BOWA 1P1QA 3OPWA 3M4FA 3SKJE 4XJZA 2ADEA 4W8JA 2B3BA 2TBVA 1FXZA 1QH6A 4Q0SA 3SNMA 3WD5A 2VMFA 1QOOA 2JE8A 2ALUA 2I3WA 5FYHA 4QFKA 1USYH 2VUCA 5FZOA 1RUF3 3GZTB 3RFRA 4E2QA 4YKIA 1LHOA 1JMUB 4Q1PA 1T2XA 1V00A 3WSOA 4LIVA 4I3GA 3IB0A 1RVF2 3HAGA 1PO21 4MGKE 4ORFA 3U65A 2YXSA 1JU3A 5FPBA 5EJ3A 2YLNA 1ZBE3 2VXRA 2GP5A 5JOWA 5ESYA 2DE4A 4IUGA 4GBVA 1IXIA 3JYRA 3WG3A 2RVAA 5EXOA 4NR1A 3HQRA 3OBZA 5FIXA 1WCQA 3RWNA 2ZZWA 3USUA 3IMMA 2PFYA 3FXBA 3IK6B 2VNOA 3VKLA 4EN9B 4FORA 2VW2A 1F5JA 1W04A 1OD3A 2XVLA 4OUSA 3E9XA 3O0WA 3CZUA 4BHPA 4XILA 2WFF3 5JSRA 1QDOA 2UU8A 2D5WA 3VBRB 1BBT3 1B51A 5FZ9A 4GMP1 3DECA 1QUJA 4OUMA 4XQDA 4PAIA 2N7GA 3BIHA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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