3PTYA

Crystal structure of the c-terminal extracellular domain of mycobacterium tuberculosis embc
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
333
structure length
284
Chain Sequence
SVGRSNLQALAGKTCGLAEDVLVELDPNAGMLAPVTAPLADALGAGLSEAFTPNGIPADVGTTAAPGINGSRARLPYNLDPARTPVLGSWRAGVQVPAMLRSGWYRLPTNEQRDRAPLLVVTAAGRFDSREVRLQWATDEQAAAGHHGGSMEFADVGAAPAWRNLRAPLSAIPSTATQVRLVADDQDLAPQHWIALTPPRIPRVRTLQNVVGAADPVFLDWLVGLAFPCQRPFGHQYGVDETPKWRILPDRITELLMRATTVASYLKDDWFRDWGALQRLTPYY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The C-Terminal Domain of the Arabinosyltransferase Mycobacterium tuberculosis EmbC Is a Lectin-Like Carbohydrate Binding Module.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Arabinosyltransferase C
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 65
structure length 284
sequence length 333
ec nomenclature ec 2.4.2.-:
pdb deposition date 2010-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF14896 Arabino_trans_C EmbC C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.940 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3ptyA02
3.40.190.160 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 3ptyA01
3PTYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3N94A 5LRSA 1OVPA 1ENQA 4FIMA 3KSXA 3SKJE 3VHNA 1OA3A 5C5TA 5DYHA 5JR7B 3DF0A 1CPMA 2V4AA 3T0BA 4UFHA 1V6LA 3N7JA 3RY3A 5BY5A 2UYAA 3EO6A 3MFAA 4WZCA 2P3NA 1SPPA 5IVVA 5I84A 2HH9A 1UF2C 3UKTA 1JW4A 4PDHA 5L9BA 1RYOA 4HXCA 5GLVA 2QQPA 2NLRA 1UTHB 4NE9A 3BFTA 1XVXA 1FT9A 1SLLA 2EIDA 1WVJA 1YIFA 2Q8DA 4XHBA 5ET5A 3BB6A 2Y84A 4CUGA 2MNGA 4OI1A 1DLCA 1QULA 2FDJA 5FXVA 4CA9A 1FPJA 1WMEA 2CYFA 5M0TA 4HW8A 4GAZA 4BXFA 1MPDA 3KN3A 1CZSA 4QB6A 3LOIA 3PUQA 2VG9A 2QJVA 2R9JA 2Y7IA 3IFAA 1SD3A 4N8YA 5KHJA 5FYBA 5BXXA 2VGDA 5I2NB 5FYZA 3ZX7A 4GOTA 3AYCA 3N6UA 2Y7PA 4H8IA 1UXXX 5BNNB 4D6RA 4PGPA 4GL8A 5H8HA 3LDKA 3I59A 1GKBA 1H1MA 3MZHA 4CP9A 5FP9A 5I59B 4GRKA 2V4CA 5DAPA 4RYAA 4F3GA 4B3NA 3NAPA 3NNLA 4X8PA 3NNFA 2Y26A 1ULCA 4LITA 3WDWA 4Q0QA 4YW7A 3UGWA 4FPEA 4IO2A 2Y5LA 3Q8AA 1KS5A 2O84X 4AB5A 5CFCB 1ZTYA 1PMJX 5FMBA 3HMYA 5JZGC 3OUHA 1MS7A 3WG3A 3PJQA 1OKOA 2OUJA 2P3VA 4GJZA 4MFIA 1DZTA 2UVIA 4COZA 5IAIA 3I2HA 5HXVA 4NF4B 2BRTA 1ZBA1 1A8MA 5LK5A 1J1LA 5D8AB 5C8CA 4PDWB 1YLLA 5J37A 3IB0A 2ZZJA 5FZIA 1N1TA 3TEWA 3WHTA 4OTEA 4BCUA 3A7QA 2QFLA 5BNNC 4HVRA 2JENA 3G3KA 3OCPA 4XEQA 2DCYA 4RK2A 1V9U3 3R6UA 4WVMA 3IOWA 3B6TA 2XWBB 2UY8A 4RHV3 2VZOA 1W9FA 4KFQA 1LFGA 1ZREA 2GMPA 4ZONA 3ZXFA 1GQPA 4FBFA 3KSCA 4GX6A 1UY1A 1CAWB 1J83A 4XACA 1R1A1 2ZGPA 3B5LB 3GM8A 2D5FA 3C7GA 3ZXKA 3VUOA 2GNBA 3QIMA 4JSOA 5CFCC 3EBRA 4GWIA 1DQ5A 3HPIA 4YAHX 1GP6A 3PV0E 3K4UA 4X04A 2E31A 5C3SA 2G9FA 4LZ8A 1PVC3 2J1RA 4CCCA 2V3UA 5F1QA 2VW0A 1UIKA 2AENA 2HHMA 3OSRA 4J1XA 1UZWA 1MPBA 3BCWA 1QW0A 3OOAA 1M5BA 4O3CA 2WKYA 5D8AC 4A6SA 4PDWC 4COUA 4JX0A 4ZS9A 1N1YA 4PF1A 1AR61 4RK9A 3DV8A 1LFIA 2WSUA 1OLCA 1VBC1 3DLNA 3B8BA 4R2BA 3AP5A 4JGYA 4AW7A 3OYWB 4AQTA 2HFBA 2FIXA 3VBHA 2DCTA 4FQ4A 1HSEA 3C7OA 1FOD3 1UIUA 2XWVA 3WNXA 3GBGA 2R1DA 2VM9A 2UU8A 4Y1ZA 4IGPA 4ZPIA 4D6SA 2Q0AA 4KQPA 3U8QA 2ZTNA 2WRAA 3OUJA 4DXTA 1GVCA 4N9HA 2WQ4A 4N7IA 2W92A 4OULA 2XL9A 1U5XA 4OHWA 2VL4A 1C8M3 4MG2A 1FMD2 2XHKA 1FV2A 1BTJA 4UXAA 2VZ3A 1ZBE2 2SBAA 2ZZXA 4YZZA 3JV9A 3WG4A 4MUVA 3O97A 5A33A 1YC61 1B9JA 2LW8A 4ELOA 2ZHKA 2YY1A 2ARAA 3E97A 1Y4TA 3ILFA 1X33A 2R71A 3HFUA 1HQNA 1OUXA 5BUVA 1ULOA 1XSRA 3MPPG 5KXDA 3I2GA 4N13A 1V0AA 5K9YA 3VDDC 1Q35A 2WYKA 2HKXA 5J96B 2HPGA 2J22A 3KMHA 4G8NA 4P9WA 3RG0A 2P1SA 3ZYBA 5FQ0A 1IZ3A 5KBFA 2JEMA 4UFIA 4AVVA 4DXBA 4U1OA 4JV4A 1W05A 2VD7A 1QGXA 5DEXA 4OQ9A 4FEDA 4EQVA 5IVJA 4XQ4A 1HXS3 3H7JA 1GUIA 1B05A 1ZRIA 3W20A 2RS53 5FY9A 2W1QA 2BNMA 1OXCA 5H8NB 4UAPA 4JGZB 3VD9A 4CP0A 5FZMA 1K9YA 4GLIA 1VFEA 4LR4A 4IB2A 4DINB 1O3SA 2E7AA 3WLUA 1QKAA 1I5PA 3BOPA 3ACIA 2IA4A 4E9KA 3WCRA 2ZGTA 4MAGA 4IE6A 4BDVB 4XJ9A 4LK7A 1S7YA 4FO9A 3WF0A 2JWPA 3GDBA 3H42B 3K4ZA 1BBT3 5ET7A 2P0SA 1UPIA 1MXUA 1WW6A 5L7OB 5DAWA 1LOFA 4LHSA 1A55A 4MHUA 3N7KA 4IUGA 5BWJA 5ICQA 1EV13 1JI6A 3CG1A 1MM7A 3KZGA 1CZTA 4GMP3 3PU3A 1Y3TA 1MY4A 1N84A 3RWKX 2W46A 2GU9A 4JXIA 3UESA 1JETA 4CEWB 1B7ZA 4GWOA 2Q88A 4JTNA 1HRV1 2WNOA 1ND2A 1ZLQA 4LUMA 5IW0A 4GWSA 1GICA 1POV1 4JGZC 1DHKB 2I07B 4R75A 1LULA 4GD5A 3PTRB 1JEVA 2PAMA 2R072 1J58A 3K3NA 1UTBA 4FXKB 5I56B 1GBGA 4JWOA 5CVRA 4BDOA 1RUF2 4XMIA 4OHYA 1XS5A 1AYN1 4BHPA 1UU5A 3H6TA 5LK7B 2B9UA 5T5PA 2NQYA 2QTWB 3T1LA 4CDXB 3C7EA 3RZHA 5FZFA 5LA9A 4QMAA 3M4FA 4EF2A 5A7NA 4G61A 4NF5B 1DQ0A 4OFGA 4AVBA 2JIJA 5I3SA 4RGKA 3GYYA 3APBA 3WQBA 3CNAA 3FVGA 5FOBB 3O66A 3UJOA 4EN6B 3GALA 3TPAA 2QQUA 3GZEA 2I48A 4XCAA 4KBBA 4YVWB 3ZSMA 3MGUA 4F29A 4XUTA 1OPOA 4DXCA 3GHMA 2WDBA 3TDJA 3PUVE 5CNAA 4OETA 4LK6A 1JW6A 1WMDA 1L7LA 2YBPA 5JXGA 1OH3A 3J8F1 3T30A 2XG3A 1CD3G 4NWDA 2FNCA 1E57A 4P14A 4XF1A 5B7DA 3MVXA 3FATA 3CF6E 2ZX1A 3FIRA 1U5ZA 3LQCA 1JQFA 5JLVA 1XVYA 2PQQA 2HAVA 2BOJA 1KWHA 1RB8G 3PL0A 2NMOA 1M06G 3DP6A 1VBA3 5BNOB 1V6NA 4P9GA 3O2AA 2Q1MA 4XETA 5CG9A 2A3XA 3OO9A 5CKMA 1XE0A 2Y6KA 4LIUA 3WNOA 2P3IA 5IM2A 4DUWA 4IEOA 5L8DA 3NL1A 3RRDA 4KQ7A 3U75A 1B46A 2ZHMA 4CDUA 3I3QA 3K6XA 1KQRA 4RQPB 4HLTA 3UV9A 3JD73 3VBOA 4O7XA 2O1LA 3LKJA 4MZUA 1IG0A 3CHGA 4YVWC 3T93B 1F5JA 1EPZA 4MHFA 2X09A 2XX8A 4QHBA 1YQ8A 4YM0A 2WNUC 4URAA 5C3PA 5BPXA 2A3WA 4P9LA 3TCHA 3C31A 2YV8A 4OA4A 3BGAA 1B1HA 1BXHA 5IWFA 1B35A 3MIGA 4Q1PA 3O1VA 4AZZA 2XXXA 1ZZ8A 4RA0A 3UJQA 2G1MA 1SCRA 4H7MA 3NWKA 4BIFA 2Y7WA 4JKLA 3LEGA 3BTAA 1N3QA 3I8TA 2AL4A 4YVSA 3CVGA 4IQPA 1LFHA 3IO6A 3KOTA 3N5LA 2XX9A 4F3SA 4KGGA 1UZZA 3AMMA 4XDOA 5TPAA 4UI9L 3VB9A 4JVDA 5F24A 2EIBA 1V9U2 1A8DA 3AKTA 3MVYA 2FHRA 3FHAA 3VZNA 1XYPA 4UFLA 4RHV2 2GP5A 3UK4A 2D97A 4OI2A 4XFHA 5KXBA 3G3FA 1IS5A 4A6OA 2KLFA 2EALA 1NCQB 2CAUA 3LSEA 4CDQB 2QVSB 3EHKA 4YKKA 3KM5A 3WOGA 1CJDA 4D7YA 2GP3A 4GMP0 4RL7A 2ZX0A 4WVWA 1QKQA 2XMLA 2CMOA 4DE8A 3I5OA 4FFIA 3KF3A 1GFF2 1GR2A 2JDKA 4FORA 3TMGA 5IVYA 3X29B 1PVC2 4Q27A 2XWOA 3QK6A 2Z4FA 2ZHNA 1PO13 5J3UA 2VUAA 3KOSA 2CEYA 2DE2A 3RTFB 3QOPA 4RS5B 5FLIA 2BJIA 4P9KA 2JDHA 1K45A 5DDJ1 3PMXA 1I6XA 5DVFA 1TMF3 1JHJA 2C0ZA 2YROA 1MY1A 3SH5A 4RA1A 4Y22B 2Y6GA 2PVUA 5C9AA 4BIOA 1I9RA 5IGAA 1H3DA 1POTA 4C1WA 2OZJA 2WKKA 1N3OA 2W08A 1H45A 3CJIB 1YQ6A 3RMYA 1LHWA 3WNMA 4MH5A 3ZFEB 3KG2A 4FECA 4NIHA 1FOD2 1XC1A 4AFAA 4CDQC 2EIEA 2F8DA 4AWDA 3LR1A 3SC7X 2YC2A 4JDNA 3MW0A 1CONA 3MFCA 1WW5A 5K0UB 2QS3A 3ZYRA 1RUF1 2W94A 3AKRA 1DF0A 3HQXA 2VTFA 1C4RA 2WA4A 3VLUA 1VBE1 5LRRA 1GSLA 5AVPA 2KR0A 1C8M2 3KC0A 3TELA 4CCLA 5H9PA 4RS5C 4RGGA 3E78A 2CSGA 3VXBA 4DDDA 3Q9OA 1CIWA 2D93A 1CPNA 5FPUA 5HBAA 5F6KA 4FSJA 4P9XA 5IZZA 4Z2AA 3VBUB 5DUXA 5DZGA 5A1LA 5IVFA 5F5CA 3PUSA 4NAMA 4HT1T 3ZFFA 2ZZVA 1GNZA 3ZFEC 2VMHA 1FPDA 1PBPA 1SPPB 3MF9A 2WR9A 4AXOA 5FIXA 1S2KA 2I3VA 1HXS2 5I0DA 4LIVA 4R72A 2RS52 3BALA 1X8EA 1XXNA 5JXHA 3UNPA 5AA1A 4L92A 3PDQA 3H6UA 2O7IA 2XBO3 5FTTC 4XF9A 2DWJA 1V6KA 3WNKA 1OVBA 2XB6C 2W3JA 4F3PA 1JYNA 2C4XA 4NGUA 1DGRA 2ANJA 4X8NA 1JZ3A 3URFA 4BQYA 1KDMA 1YQ2A 5LWBA 5GLUA 3WSOA 4P02B 5T5LA 4BQ1A 1VR5A 3EJKA 1LOAA 4GULA 3VBUC 1G0HA 4PTKA 4BWOA 2DTWA 1BBT2 3KJ7A 4OERA 3K48A 1UL9A 3NSTA 4HS7A 3KF5A 2FYIA 4K8FA 2GZWA 4IGOA 5JPNB 1WD3A 5LA2A 1FPEA 1EV12 1US2A 2WA3A 3EKIA 5H8HB 3I59B 3LAGA 2XUEA 3TRSB 1FTJA 3Q28A 4XUOA 1U5IA 5EP9A 4K3FA 1LCLA 4CZSA 3NAPB 2OWZA 3RNNA 1PMHX 2V09A 3OOXA 3U10A 1ND3B 1DQ2A 1BHGA 5CZKA 4BH9A 5FZKA 1R6ZA 1NOVA 3POEA 3LF7A 4XTMA 5CAZA 1JYWA 1XRUA 2RS11 5HPOA 4W6XA 1D0GA 4G4PA 5JDBA 3GBBA 3CLPA 5I0SA 1V9U1 2THIA 4FTSA 4ELQA 1KJLA 4EE2A 4H8JA 3GXUA 4DZ1A 1GZTA 4RHV1 4XFBA 1Q5OA 3SH3A 2Q2CA 2VMGA 1N3PA 3HV1A 3JB4C 5LOMA 3LWCA 5C8CB 2A73B 3BKZA 3RN8A 4Q8LA 1ZZCA 3MC2A 4N7UA 1MZ6A 4XBQA 3M70A 1LOEA 3PPNA 2W9XA 2RC9A 5EQAA 4B4RA 4NR1A 4IO7A 3B7DA 1DG6A 5IK5A 3EPEA 4WVMB 1PVC1 5H9QA 2XXVA 2B7YA 2O68A 2G4IA 2HXWA 4QQ2A 2XD2A 4H7LA 1LNSA 4X6RB 2P3YA 5I0RA 4FTBA 5A3WA 2MPFA 4H5FA 3WG2A 3PPPA 3N4MA 3CR9A 4ZDMA 1LU2A 3TFLA 3U65A 4F18A 1IXCA 1DZQA 2JE8A 2FDIA 4J25A 4XF5A 5ET6A 5T50A 1OMIA 3J26N 4EZ4A 1B3FA 1FOD1 3K6WA 2B9VA 2Z23A 2WWJA 4QPIB 2Q8JA 2GH2A 4RFT0 1K9ZA 3POFA 3ZN4A 2D6OX 1DSNA 1Z0HA 4GX3A 4DLDA 1FX5A 1QOOA 3J7MA 3W58A 3C34A 2NP0A 4XZPA 3OTFA 4JGYB 2VJXA 1OT5A 1URGA 1C8M1 3JD72 3VBHB 1PDAA 4X6QB 3PD9A 1TNRA 1X9TA 4ATEA 2NXOA 1OLRA 1P1QA 1H2LA 1OQGA 1C5IA 5FYSA 2PMSA 5FPZA 4NTLA 3THDA 4LJHA 3A29A 5AC93 1CX4A 1PC3A 5T5JA 2RMU3 1LAJA 3GYDA 3ZIXA 2XKPA 4ZEKA 1UZ0A 5DN2A 1RYYA 1RTVA 1UIVA 4NWCA 1S0CA 4HANA 3BPZA 4FOVA 1VSOA 1SFPA 4D8MA 3LA7A 2VCBA 1XU1A 5LBBA 2A6YA 3NNMA 5A33B 3OSQA 4DRVA 3PD8A 3MV11 4JTOA 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 3PTY A; 
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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