3PTYA

Crystal structure of the c-terminal extracellular domain of mycobacterium tuberculosis embc
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
333
structure length
284
Chain Sequence
SVGRSNLQALAGKTCGLAEDVLVELDPNAGMLAPVTAPLADALGAGLSEAFTPNGIPADVGTTAAPGINGSRARLPYNLDPARTPVLGSWRAGVQVPAMLRSGWYRLPTNEQRDRAPLLVVTAAGRFDSREVRLQWATDEQAAAGHHGGSMEFADVGAAPAWRNLRAPLSAIPSTATQVRLVADDQDLAPQHWIALTPPRIPRVRTLQNVVGAADPVFLDWLVGLAFPCQRPFGHQYGVDETPKWRILPDRITELLMRATTVASYLKDDWFRDWGALQRLTPYY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The C-Terminal Domain of the Arabinosyltransferase Mycobacterium tuberculosis EmbC Is a Lectin-Like Carbohydrate Binding Module.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Arabinosyltransferase C
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 65
structure length 284
sequence length 333
ec nomenclature ec 2.4.2.-:
pdb deposition date 2010-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF14896 Arabino_trans_C EmbC C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.940 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3ptyA02
3.40.190.160 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 3ptyA01
3PTYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NV2A 4BISA 4LP2B 3DPRC 2FD8A 2R71A 1SPPA 2E7AA 4PF1A 2RR13 2I4BA 3OSRA 3U4XA 4IE4A 2HBUA 4RY1A 1I6XA 4H8JA 2RC9A 4EQBA 3I2JA 3B01A 1FQDA 2BUKA 1PGW1 2WZR2 5I0UA 2VQAA 1II5A 2F7BA 1DCSA 3UK9A 4LO7A 1MS8A 2PT1A 3PMXA 5FZHA 2BERA 3BKZA 1LGCA 4I01A 2EIDA 2WYKA 5LW9A 2E0SA 3H7YA 5EP9A 1ENXA 4Z07A 1ZX5A 1NUKA 3WNPA 4Y1ZA 5A3OA 4EF2A 1WBFA 1MPXA 3SMHA 5I8YA 3T9HB 3PIJA 2XHNA 1MEC2 4DRRA 1VIWB 3IWZA 5JSPA 5FZMA 2WWUA 3OOXA 3VHOA 4UBHA 4LIUA 1VLNA 4BOWA 4Y5Z0 2BDRA 5BWJA 4PIZA 3SEVA 4OFLA 4ZZ5A 5FMBA 1RUNA 2FDIA 4AQSA 4M3CE 3RPQA 2P2AA 4JWXA 3IBMA 5FK7A 2SBAA 1O4ZA 3HEIA 1OF3A 4IE6A 5D8AB 1P1QA 1AZDA 5KCJB 2QFEA 3T08A 2WUHA 4PC9A 2BU9A 4P9WA 4NPLA 2DWRA 1FOD3 2A1XA 2UVIA 3OO6A 4MUVA 3WHTA 3EQEA 5EWSA 3ZFEA 3N4MA 5KHKA 3WP4A 4YW6A 1K5MC 5FP7A 1NOVA 3BTYA 1NYWA 3TN93 3V83A 4A4AA 3AP4A 4W4ZA 3KVBA 3ZYFA 3WDXA 4B29A 4JDFA 4YVSA 3E97A 2PHLA 2QVVA 1VBC3 1PVC3 2K2SA 4XBNA 1FRPA 3UIFA 1EPWA 1I3HA 2F4PA 1P1WA 1V9U2 2VD3A 2RJKA 4JGYC 1CJDA 2Q1ZB 2YJPA 2CHHA 1FMD1 4IE7A 2XXRA 1N3XA 5H9SA 1NZCA 1VBB1 3K1MA 1ENSA 4F31B 4G77A 3IJXB 1C1LA 4NE9A 4NPMA 5DG2A 5A6QA 3VFJA 4DCXA 4N9HA 1URGA 1V6IA 5FY9A 4UACA 1WMDA 1NXD1 2IVJA 2Z5WA 4Q4V2 4HVOA 1UYYA 3EKIA 3TTKA 2ENRA 5FWJA 3PUXE 3HFUA 2WT0A 2HWF1 1R081 3SXWA 2ZNUA 1ZNPA 3Q27A 2HWE2 2WO1A 1MS5A 3CFXA 3CG3A 3WNXA 2Y26A 3MW3A 3ZX7A 1GKBA 3BVCA 1T6BX 3AB0A 1XPWA 1LOAA 2WNVB 3H0OA 2XWJB 5EYFA 5D8AA 1VBD3 5KCJA 5BNPB 4XTCQ 1WCDJ 4RR3B 3MUQA 1C8M1 1OKQA 3WNOA 3UKTA 3MYUA 1YC61 3ZYBA 5CA6A 2X09A 5CU1A 2Z22A 3S5QA 2EXKA 4YSFA 2ARXA 4CEYB 1RINA 5L7OB 3IDEA 3WUCA 1ZBE3 5I7IA 1LENA 4Z2WA 1FOD2 1DTGA 1V6KA 1WZXA 3PUVE 3O12A 3T96B 2J42A 1OURA 2Y7WA 3O29A 4GALA 3FX3A 3TN92 1JYVA 3ACHA 1FXZA 3MLJA 2UVGA 1GV9A 1U5ZA 1E5RA 1DU3D 2WABA 4JRAA 4OHNA 3ZXKA 4ZHNA 1AR63 4KH9A 1C28A 1FV2A 3IFAA 1GP5A 1HB1A 3LEIA 3OGGA 5DAQA 5IVEA 1UAIA 3E6DA 2PHXA 5JTYB 5DUXA 3IB3A 5JCTA 3IK6B 4S2HA 3GYYA 5J36A 1Q3EA 3T0AA 1M5EA 2WYPA 1QUJA 3ZDVA 5EYGA 1ULCA 3LPGA 2A6XA 3OB8A 3MV01 2LW8A 4YVWB 3X29B 2Q30A 4P47A 5FZKA 3BALA 3JQXA 4DZ1A 5TSWA 1EH3A 1N04A 1N1TA 2OZZA 1FT9A 1XNTA 4AWDA 1O63A 3Q25A 4U2RA 3C7FA 2GNDA 2VD2A 5GKAC 3PPRA 4QX0A 5CKMA 3IB1A 2XKPA 1UMHA 2ZGMA 3I2IA 2RM21 4F39A 5JR2A 4QXKA 4WEDA 3FIRA 2XWIA 3POEA 4P9IA 5K8SA 3PURA 2VW0A 5AVPA 1FPJA 1NUZA 5HCBA 3D0JA 3NAPB 2VM9A 3ZYJB 1SEFA 1YWKA 5SV8A 4XFBA 4XFHA 4YG6A 4COZA 3KJTA 1E57A 2WNVA 5DMYA 4W50A 2UWBA 2Q8DA 5GZCA 1HV1A 2XGXA 4RFT0 5FQ0B 2I49A 5BNPA 3TB0A 1ZU0A 4RR3A 4AI1A 4O7XA 4MEVA 1UY2A 2Q8JA 4P0IA 4CCOA 1IIWA 4IO6A 2VMFA 3ILRA 4YARA 4P1EA 1GOHA 4FPGA 4LBMA 3FLPA 2HYXA 1FNZA 4PHZA 4XFFA 4BMEA 4CEYA 3T22A 2Y8KA 1Q8SA 1S55A 1FPLA 2QJVA 3QBQA 5L7OA 3MF9A 1B58A 1Y4WA 4XE9A 4AEDB 2HEWF 1JZ4A 3HAGA 3POIA 2PAMA 1URXA 5EYHA 4LBJA 3MW0A 3LFIA 2CY6A 3JBG1 2IZWA 2JDKA 1FQEA 2F7AA 1AVBA 1MQGA 1MXVA 3GBGA 2XDVA 2OZJA 3P3NA 2ZGTA 2V3TA 1RUD1 1GNZA 3ZFFB 2XXHA 2VC9A 1WGPA 4I30A 3V56A 1N7XA 2VP1A 4A2UA 3A7QA 1EZ9A 1T6GC 5IGAA 1X8MA 2F34A 3WG1A 4H1XA 4AFBA 3EB7A 1UXXX 3SERA 3ZSLA 5JTYA 5CADA 5ET6A 1RUG1 1SLBA 1VRH3 1NNTA 4FPEA 5F3GA 2YBSA 4FJPA 1AHSA 1AR62 4DY3A 4KU8A 4UFLA 3DF0A 3I97A 1MEC1 5JAXA 2QRYA 4YVWA 5FOBB 1JYNA 5JWPA 2A73B 3KJ7A 2XLAA 1BEV3 2O1QA 4DY5A 5I0RA 2ZZXA 4GL0A 1X9TA 3GJAA 3I2HA 1W6QB 2Y7IA 1B3EA 4BQ4A 5FZOB 1FJ9A 2QJEA 2A75A 2ET7A 2X53S 4FFIA 4BDMA 5JIUA 4AVAA 1RYXA 4PFBA 3E1F1 2VCCA 3NAPA 3ZKLA 3QXMA 2BVBA 2ZA9A 4HE0A 1WLCA 4BLJA 3MLKA 2IVIB 4FCAA 2F36A 1B35C 3JZJA 3K1PA 5FQ0A 2WN2A 4GMP1 2JB8A 3LEGA 5FY7A 4RK2A 1RL3A 2KA3A 1F9KA 4JQRA 5LEKA 1CAXB 1QY4A 3WF4A 3UKVA 3LA3A 3M2MA 5A7QA 1L7RA 1VBE1 4NN0A 5I56B 2D6KA 2XWVA 5GJ6A 1OF4A 4RGAA 1AR93 3IAZA 4KYEA 1K9ZA 3GBAA 4AEDA 3D3AA 1KJRA 4OXVA 3N9PA 1W9YA 4N13A 2VTXJ 4QB6A 2CSGA 2J1TA 5IATA 1CESA 4J1XA 2VW1A 2XX9A 1V9U1 3RWNA 2V4CA 3C7EA 3PUYE 1WD3A 3A29A 2Q8MA 4C91A 4XILA 1YQ2A 4E8CA 5FY0A 3ZFFA 2YY1A 3HSTA 1US2A 1RUI2 1QJZA 2RR11 2A70A 2P4EA 5JIAA 4DNYA 1LOBA 2W47A 3MIGA 1SFNA 2OUJA 3OUIA 4NHYA 2WKKA 3G7DA 5JMOA 2I74A 2H5YA 5DABA 3WQ0A 4GWMA 2P37A 3ECQA 4GBWA 3KC1A 3OPTA 5IHRA 4AK3A 4LTAA 4IGRA 4FAGA 1SFPA 4QFLA 2B4LA 1VRH2 4E2QA 1LHOA 3SKVA 2YU2A 3SHRA 4CCMA 4GOTA 3I2FA 4C1TA 4N43B 2W5FA 3I2DA 1W6QA 1AMFA 2CGOA 1ONAA 1ULFA 2ZZQA 4HANA 3RPLB 2WKYA 5FZOA 1SMVA 1BEV2 2XXXA 4R6KA 1M5CA 2X29A 3CIJA 2ZX0A 3DYOA 5DTBA 4LHLA 3NKGA 1UPSA 4AQ6A 3MPLA 4BDLA 2HWD3 1N3OA 4GJYA 2ZGLA 3E13X 4JAAA 5DUUA 3HHGA 4GX3A 2Y6FA 4B4RA 4OHVA 5HCHA 4IO2A 3VBHC 3CBNA 1KRIA 3H42B 4JZRA 5A3LA 1FOD1 2WRAA 1UY3A 5CB7A 1US4A 2QSXA 1DF0A 1OQDA 2ZGKA 3ITQA 1CAXA 2ZGPA 1W9FA 4XIKA 1KDKA 4QHZA 4UF0B 2RDSA 4JGZB 1GP6A 3KV4A 1GVCA 1SW1A 4NIGA 1J1LA 3SCGA 3T2TA 3TN91 2Z23A 4H7MA 2JG8C 3NV4A 4BLAA 1D7PM 1IQ7A 3H06B 1CZVA 5L9RA 4XDPA 2V93A 3RYDA 1SQ4A 3WV6A 1AR92 1Y9GA 3CL1A 1QVSA 4NPRA 4DB5A 2PX1A 1L7QA 3V89B 3WSOA 1VBC1 1FQCA 1PVC1 1J3RA 4QX2A 4Q4X3 3OMBA 4U23A 2JJ6A 1WKYA 5FYIA 1QOOA 4DXSA 3PD9A 4PGNA 4I9DA 3H3GA 4QM9A 1CZSA 3JXSA 3PPNA 2R7EB 5ABJC 2J7MA 3MWBA 4WVVA 4IR8A 1AL0G 3PUIA 2EAKA 1FPBA 2WC2A 1FJ6A 2NMNA 1RUOA 1ZBA3 1ZZBA 1R9QA 4OETA 1PK6C 1C57A 1MXZA 4CDXB 1O3TA 5FLJA 3K77A 4QGNA 4XUPA 4ZU7A 4R74A 1D4NA 3ZXAC 4N43A 5I5PA 1B3LA 3GYDA 2NZ9A 4IW3A 1JOJA 1VFDA 4OVPA 3M4FA 3TYHA 2YC2A 5J09A 3MLLA 3RPLA 4X1BA 2F8DA 3DELB 4X8RA 2VZPA 3VGIA 1ULOA 3LEMA 1YCIA 2I48A 2XXPA 2ZAHA 3BU7A 2ZYOA 4XABA 4JSOA 2VQUA 3B6QA 4UOJA 1UU4A 3KN7A 2QE3A 1OI6A 2Y5LA 2VCAA 4A6OA 1AX0A 4PLMA 5I2KB 3SCFA 3ES1A 5EHMA 2NVUB 1YXWA 2LALA 1VJ2A 3CRBA 1HV0A 2VD7A 1VBD1 3ZYIB 3LB9A 3FXUA 3EHKA 2DFCA 1H8TC 1EAH3 3KV9A 2VMGA 3PVBB 1PM7A 1GZTA 4KGGA 1DGWA 5JXHA 4MYEA 3H1YA 1MS3A 1RUJ3 2UURA 5C7GA 4JWOA 3A4UA 1VRBA 3I2OA 2FBPA 1DLCA 3NL1A 4TQUQ 4UF0A 1ZBE1 4JGZA 1OMPA 4UFKA 3WNLA 3BIEA 2XJQA 4LBQD 4GAZA 3KEIA 5A3WA 4TN7A 1UOFA 2RKMA 1FPGA 2J1AA 2VZTA 2ZEXA 5LBCA 1Y9UA 4NWCA 5IK8A 5I84A 4XF5A 3OUJA 2YXSA 1DBZA 4Z92B 4O8MA 4FIMA 4AL9A 1ODNA 5F5IA 4D7SA 2XD2A 1W39A 3I3BA 1SPIA 3TRSB 2G9FA 4YGCA 2Y6LA 2LS6A 3W5MA 4YG3A 1S0EA 1UMZA 1BP5A 1NXMA 1AR61 1U0AA 5KR7A 3HQXA 3P1IA 4CTEA 3B50A 4MZUA 2VXJA 5I58B 2WSVA 3O6HA 4BLIA 1ULPA 5I0DA 5FZ8A 5LY2A 1CIWA 4GJZA 2P3VA 2VBDA 4Q4X2 5GZFA 1JETA 4YRDA 2Y60A 5JPNB 2VTXA 4YFWA 5CMKA 1QKQA 4OHXA 1UOGA 4TWTA 1WODA 2WWJA 4M0NA 4RQPC 4LE4A 1URSA 3LSWA 4AQ2A 4N07A 3M8LA 2QBXA 4CDXA 3G3KA 3LIGA 3ZYRA 2KM2A 4BQ3A 2ZTNA 1G9AA 3W5NA 4XDOA 3MP6A 3KT7A 2HQ0A 1J1TA 4P0GA 4JKLA 4PFIA 2E7TA 1WMXA 5FYBA 1MQJA 5KHIA 3ONMA 5EHSA 1VE4A 1UIVA 3QK6A 1E5SA 2B9VA 1ZTYA 4Q2FA 5FHOA 3BFUA 2AIXA 4NJ4A 4R2FA 4PDWA 3A21A 3A23A 4OFOA 3MJNA 4A45A 1A54A 1QUIA 5I2KA 4R9GA 3JD73 4GH4C 4NF4B 3G3GA 3ZFGC 5FTHA 2R6GE 4QHBA 4W6XA 4XJZA 4AGVA 2F3BA 1JS9A 3E5UA 4Y1UA 2YPDA 4YVSC 4DEQA 3CHGA 1VP6A 2ZGOA 4NIHA 4EZHA 4MFIA 1EAH2 4ASLA 3GM8A 4M3CB 3GBBA 2EXIA 2P3YA 2NWJA 5AA3A 1HSJA 4AS5A 2FDHA 1RUJ2 2VG9A 3N6UA 5FJKA 3HR9A 3S7IA 1Y4CA 2E32A 3LGRA 4IUGA 2Y5KA 3C36A 4RK9A 2TNFA 4Z7EA 3CDZB 2NN8A 4AHZA 1W3VA 3GDBA 4GX6A 2XUEA 4FPJA 1LULA 4HE2A 4ELQA 2JWPA 1PO12 1LFHA 4LULA 4FFFA 3W9WA 3MIEA 1NUYA 1VRH1 2Q88A 4HOOA 1X82A 4EN9B 5FPXA 3MIFA 3ISPA 5A7SA 1J83A 4MSVA 3RI9A 3T3YA 3MFAA 1AR83 4XJAA 3WG3A 4HMZA 2ZMBA 4K6BA 3D4GA 3FC0A 3QOPA 1YQ6A 2WZEA 1EP0A 2JD9A 3K2DA 2ZEZA 4MH0E 1SCRA 1BEV1 1RYOA 1SLCA 3PDQA 2E31A 2KD7A 2IWGB 1JBCA 5D8AC 4R73A 5CKNA 5DUVA 1NA1C 3CJIC 2HWB3 4XACA 3CSGA 1QJU3 5T5OA 2AH2A 1IKQA 5FBZA 3ZXLA 3AKPA 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 3PTY A; 
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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