3PTYA

Crystal structure of the c-terminal extracellular domain of mycobacterium tuberculosis embc
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
333
structure length
284
Chain Sequence
SVGRSNLQALAGKTCGLAEDVLVELDPNAGMLAPVTAPLADALGAGLSEAFTPNGIPADVGTTAAPGINGSRARLPYNLDPARTPVLGSWRAGVQVPAMLRSGWYRLPTNEQRDRAPLLVVTAAGRFDSREVRLQWATDEQAAAGHHGGSMEFADVGAAPAWRNLRAPLSAIPSTATQVRLVADDQDLAPQHWIALTPPRIPRVRTLQNVVGAADPVFLDWLVGLAFPCQRPFGHQYGVDETPKWRILPDRITELLMRATTVASYLKDDWFRDWGALQRLTPYY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The C-Terminal Domain of the Arabinosyltransferase Mycobacterium tuberculosis EmbC Is a Lectin-Like Carbohydrate Binding Module.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Arabinosyltransferase C
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 65
structure length 284
sequence length 333
ec nomenclature ec 2.4.2.-:
pdb deposition date 2010-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF14896 Arabino_trans_C EmbC C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.940 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3ptyA02
3.40.190.160 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 3ptyA01
3PTYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SXWA 4MLOA 1LAGE 1BHGA 5ET5A 2YY1A 1PVXA 4JQTA 1NCRC 3RZGA 1B3EA 1SLTA 1PGW2 1F8VA 4AOCA 1KA0A 3ZDSA 2GNDA 1OOPC 2FD8A 1LHOA 4HVRA 4FPFA 4FECA 3HPNA 2Y0IA 1KQRA 2VMDA 3QD6A 1FV3A 2BWAA 3O9PA 1PGW1 2VNGA 2A5TA 1AR61 3BALA 5T55A 3HJRA 1H8TB 1VE4A 2ZAHA 5J7MA 1IKPA 1XC6A 3VXBA 4YW1A 2JG8A 1KDKA 4LT5A 4BMEA 3ZFGA 5F5AA 2UYAA 2OJTA 4ESXA 4IEUA 4PFIA 3KHBA 2WS93 2VTFA 2CAVA 5CEHA 1HRI2 5EHDA 4KPTA 5FMOS 3LSFB 1OH3A 3GCWA 1F4AA 1SFNA 2THIA 2QQNA 2G93A 5I2KB 5B7DA 2V73A 4XZUG 2VOZA 2VQUA 1EU8A 4LOSA 5FCCA 1QIQA 1IZ1A 2WZR2 4PBPA 4JSDA 5LBCA 4WM7B 3W5NA 3PLQA 1JZ3A 3WP6A 1DCSA 1GWMA 3E1F1 4AYUA 1KITA 5FXXA 4Y3OA 1FBGA 4PBQA 1WCKA 1O63A 3QUJA 2D98A 3D0JA 1MM7A 1OKOA 5GJ6A 3RZLA 4UYBA 1B35C 4BM8A 5FTIA 2KLFA 2OWTA 3MIFA 1AHSA 4WXJA 2BWCA 3Q8AA 5LRSA 4H1XA 2WABA 1DQ4A 5FUNA 4JX0A 2QS2A 1JS9A 5HCFA 3FGSA 3V0BA 1NG0A 4KQPA 2Q1FA 5J98B 3H3LA 2RVAA 3T66A 5FYTA 1O5LA 1E57A 1CJPA 4HG6B 3RUMA 2A6WA 3VBFA 5LK5A 1ZBA3 4KU8A 5CMKA 4GWWA 1I9RA 5DZGA 5CBRA 1NA1C 2XWKA 2P37A 1R093 3FL7A 2F3DA 5ESYA 1LBVA 2V4CA 4KWLA 1SVXB 3NNFA 3HSTA 4QPIB 4BB3A 3UKNA 3NW4A 4C0RA 3FHAA 1Y4TA 1F9BA 2GHBA 1VRBA 5GLUA 3TNPB 4N53B 1JYIA 1PX4A 2GHAA 2D43A 4AGVA 3LE0A 4JGZC 1N0TA 5DABA 3MIHA 4OXVA 3D82A 3I3MA 3WW1A 1W6NA 2Z8FA 4QSDA 1XNTA 4AHZA 4GA9A 4IR8A 2Q89A 2ZGNA 1WZXA 4PFUA 4U23A 1JQFA 4HSJA 4B8EA 5IFPA 5FO9B 2HWC2 4F39A 5FOJB 4EQ9A 5C8CB 3KGLA 2BJSA 3PUWE 3I2OA 4GQ7A 3T0DA 5A7SA 1QUKA 3ABZA 2W5FA 3AZXA 2HXRA 2A6VA 4GQOA 4KL1A 2HWC1 2OBGA 3OO7A 4RPNA 3K2OA 4W65A 3KEIA 1GOHA 2LTNA 3NJZA 1PB8A 1SLCA 3ZDVA 2WJSA 3VBRC 1P1UA 3HBKA 2BJIA 1B1HA 1C8M3 2R16A 2PCRA 3M1HA 1SLIA 1INPA 1U5XA 3THIA 1FBHA 3K3NA 4E8DA 3KV4A 1AXKA 4XFBA 1SW1A 4FXKB 1SW2A 1V70A 4W8JA 4FJPA 1ULFA 1CAUB 4DEVA 2YBKA 4XZPA 5JTYB 3THCA 1JOJA 2HQ0A 1BTJA 2DP8A 2ZGQA 2XXUA 1US3A 4GD5A 3K4ZA 1OQGA 1QY4A 5GM0A 3FIRA 3HQRA 4BXFA 3T08A 4OQ9A 2ZZVA 4BK5A 5IZ3B 3LB9A 1IUDA 1ZBE2 1YIFA 2MKZA 3WF2A 2VNOA 2XWJB 3ASIA 4K21A 2RMU3 1W9FA 5GZDA 3J7LA 3ROUA 4DOUA 2QL3A 4IE4A 1RUD2 1OQ1A 2WLPA 3L2HA 4DRRA 2EAKA 1WD3A 2ZZQA 5LBFA 4XBLA 1W8OA 2QFLA 4Q8KA 1RUF3 3TODA 2UVGA 1POTA 3SH3A 5DAPA 3TCGA 4PQQA 1R083 1Q9DA 2VOTA 1RUD1 2P6HA 4H2AA 4E2SA 5F2WA 1XE8A 2OQ6A 3CDZB 3HAGA 1LODA 3USUA 1UY4A 3E97A 3PU3A 3KVBA 1VRH3 3VBHC 5JSPA 2KXLA 2Y6GA 2R1BA 1DSNA 5JLVA 4FPYA 3WNOA 5BV6A 1Z7NE 3RFRA 3FHQA 5FR3A 3MIEA 4KG8A 5ABJA 4IO5A 1NE4A 3ZFFA 5A80A 4NHBA 3SQOA 4LULA 2VD7A 2I49A 3ETQA 1F15A 3E5UA 4NR1A 5D1IA 2J1AA 2XMLA 4LXLA 3IM0A 4POWA 4AG4A 4QX3A 3ZSMA 2VL4A 3I3VA 4XBNA 2ZGPA 3S9NC 2VNRA 2VUDA 4OI2A 4IEZA 1TZOA 3IO6A 5IZ1A 4NTLA 5LDZA 2WZ8A 3CG1A 1VBB2 1SI1A 1QDCA 1SLLA 3TCFA 3POBA 1PNFA 1K9YA 5T5JA 1H45A 1AJKA 2BDRA 2VZOA 4BQWA 1CB6A 3K0VA 5JMCA 2GN7A 1FTLA 4ZS2A 1VBB1 5CFCB 5JZGC 2HZKA 3RMYA 3OJBA 2O7UA 1V9U1 1MG1A 2KA3A 4FBFA 2CGPA 1C57A 4IGPA 2DF7A 3U65A 3S5AA 3LUYA 4JC1A 1OLCA 1TT1A 3ZFEC 1VFDA 3C35A 4K20A 4GH4C 2ORZA 3RI9A 2VZ3A 4DUVA 2RS31 5JDBA 2QQOA 3MW4A 5FAXA 1LOFC 5GZGA 4ESWA 2Y8KA 4PE5B 2R30A 2HWF2 2EXKA 4WVMA 2VGDA 3WF4A 1ND2B 2IFWA 3OY8A 1IPKA 4IGQA 2BNMA 2BOIA 4B4RA 4JZRA 3PUAA 1PM7A 3TFLA 3MGUA 1GU3A 2ZACA 4IUGA 2HWF1 5F6KA 1EZOA 3N7JA 2BW8A 2YGLA 3U11A 1PB9A 3DLNA 4QPGC 3VHRA 1IQ7A 2YV8A 1U5IA 1XBFA 1LBBA 1WLTA 4PAKA 2W1WA 1SG3A 3LSDA 4KXPA 4CUCA 4NRQA 4CSWA 4IL7A 3AJZA 2VQAA 3EKIA 5HV0A 4FBPA 2OWSA 3RZMA 1ZLQA 1K12A 4M3CA 1LAJA 1Q8VA 2R062 2AYSA 3FJMA 1SW5A 5FKCA 1SDXA 3PVNA 2XXYA 5EJ3A 1NV4A 1YC61 2F6PA 2PLV3 4GWIA 3PD8A 4AEDC 5DG2A 3TCHA 4KFQA 2R061 1BLZA 4JHTA 2DYCA 3FLRA 2C9KA 5ITPA 1UTBB 4XF1A 2F35A 5F8PA 3S7IA 1HDKA 1UZ0A 1AMFA 2QQIA 3C7GA 1CAXA 2ET7A 4PJYA 4MXWB 4XJZA 1ZZCA 3WY6A 3O1VA 2RG4A 4KGGA 4DQAA 2IA4A 1NLRA 4OMDA 2RE9A 3J7HA 2IUWA 1UPSA 4JKLA 5L7OC 3Q9OA 3WQBA 3AMMA 2ZZXA 5FBJA 3ZKYA 4LKFA 4GX6A 1H9WA 1XYNA 2JWPA 2WAAA 5FZAA 5CAZA 5C4WA 1VFEA 4JBZA 2XJPA 1K3IA 1W9SA 2JDHA 2GRVA 2SLIA 3OBRA 4Q2FA 4CU9A 3FXBA 1RTVA 2ZTNA 3AL5A 4TSVA 5EIYB 4MGSA 4RHV2 3KZGA 2ZGOA 3DYOA 3AK0A 1IMAA 1X33A 3MZ1A 2WKKA 2GH8A 1RUJ1 2D7FA 3PVEA 5F3GA 4C90A 3I59A 2ZNSA 4RHV1 4Y1VA 5KDTA 1UZWA 4XKNA 4FP3A 3H8XA 1DZTA 3FWEA 2P3VA 4GXSB 1NH8A 1PMHX 4P9LA 1RUOA 2PAMA 3OOAA 4XEQA 1R1A3 1QJX2 1ZYBA 1ZZ9A 2F17A 2OZ6A 3BTYA 5K2XA 5DAXA 1LU1A 1H4GA 3TYJA 3HIFA 4UFHA 1S9TA 1WW5A 3O1SA 1RUG2 1ND3A 3ILTB 4FPHA 1QJX1 4HE1A 4N8YA 4I1DA 1SI0A 4OI1A 1PBQA 2E1SA 4X1BA 4AFAA 4YZ3A 4RQPB 3IAQA 1PO13 3D8CA 4Q4V1 1RUG1 4ELOA 5JAXA 4ZE8A 4HXCA 5JVVA 3VVFA 4LK7A 5I84A 2UXAA 2BGPA 5AC93 2ALUA 3EO6A 3WV6A 4QHOA 5T5PA 2P3NA 1QF3A 2XPJA 5JCTA 5TPAB 4OZOA 3VHOA 3OGRA 2HJIA 1XU2A 3T9XB 3TTRA 1ZMGA 5FZIA 3RT8A 2CAUA 1OLQA 5CFDA 1YHFA 1LHNA 2EAAA 2V72A 3BIWE 4CDWB 3WOGA 4OTEA 3D4KA 1XVYA 2JDNA 4RK9A 4I2OA 2HWB3 2BJJX 3QH6A 2D97A 2XWBB 3LZZA 2F36A 4HETA 1DQ2A 3FV2A 1FAYA 1WDNA 4BQXA 4YGDA 4NWWA 2FZ2A 4NF0A 2EALA 4DXRA 2WZPP 3ILFA 2ADDA 1QMJA 2VW2A 2F7CA 4OWDA 4LE4A 3I2HA 2EXJA 3WW3A 3JQXA 3HBZA 4UF0B 1OFSA 1GZWB 3K77A 4Q4Y3 1I69A 1GWLA 1AZDA 2J42A 4R4ZA 4DY3A 1XS5A 2JJ6A 1T6GC 1WCDJ 2ZX3A 4GVOA 2OPWA 2XJSA 2AZ5A 2WFF3 3FE5A 4MHRA 4IE5A 2GQ1A 1WGPA 5A3MA 3F2ZA 3BIHA 2EIBA 1RVF2 4Y33A 3MYUA 3THDA 3GBFA 4NQ8A 4RS5B 5BNPB 2IWGB 1FMD3 1FT9A 3LEIA 1W8TA 3CIHA 4GXLA 1XNBA 3OBAA 5A6XA 1Q5OA 4G68C 3N9PA 4FPLA 4Z1VA 1K9ZA 2JDUA 4LNVA 3QXMA 1VBC3 4OHZA 4YLZA 5H9PA 5C8CC 1X8MA 1LTEA 4NUBA 1W04A 3V64A 4PFWA 4M3CF 2GN3A 4I62A 1LHUA 4F3JA 2QMXA 3RI8A 3B02A 3B6TA 2Y26A 3ZIWA 3DN7A 1UMHA 3ZSFA 4FQZA 5C3PA 4PFTA 5LATA 2J7MA 3BYWA 4OZXA 1BK0A 1TMF1 1B5IA 4YZ2A 3O12A 4HT1T 3U92A 1CGPA 1LJ7A 4OHNA 4P47A 1H1MA 3RTFB 3K2DA 1LBXA 2YBSA 4BDLA 4YM3A 1S7YA 5K0UC 4I0BA 4D6RA 5CG9A 4QQPA 2XWOA 5CMBA 3CZJA 4P08A 2XXIA 3UV9A 2W39A 2Z4FA 1F4HA 4AB5A 3UK4A 2GALA 3M4FA 1C1FA 3MC2A 5CMMA 1FQEA 4ZZEA 4DXBA 4ZEBA 4J1WA 4G8MA 4XVHA 5BUVA 3RYDA 3LWCA 1YYNA 1AL3A 1GICA 3FZVA 2VVFA 1CX1A 5AA3A 3MVYA 5J48A 1QQP2 4N43B 1V6LA 1L3JA 2DVFA 3OMBA 4UFIA 3CBNA 1FPGA 1ZZ8A 4NIIA 4K3UA 3N26A 3C4MA 1QQP1 1Y4CA 3MF9A 2WNVB 2O51A 3URFA 4OHVA 2IXCA 1NMUA 4FAJA 1KEXA 3V0AA 5K8SA 3UETA 4H45A 4S2DA 1EYKA 4EXKA 3FXRA 1OPMA 2NMOA 4ET7A 1NV6A 3ZXDA 2F34A 2H5YA 4I3YA 4P9YA 3E6DA 3DYMA 2Y0OA 3HOBA 4E0WA 2P17A 3ECRA 1IPSA 3O1UA 4XF3A 4FXGB 1WMDA 2B8MA 4OVTA 4N7IA 1OVTA 1ULPA 3NJYA 5J3UA 3MVXA 2YPDA 1B0LA 1Y20A 1WMEA 2F4LA 5J36A 1GP4A 2O6AA 1VMHA 1DOTA 2FHYA 3D1RA 4FO9A 1MS3A 1VMJA 3IKWA 2BNOA 2DBIA 4BHPA 4X8PA 3ZN6A 2VOVA 2HEWF 1RHI3 3SEPA 3ZKLA 1EPWA 4NN3A 1J1TA 2XBO3 4A7YA 2ZEWA 4AI8A 4W50A 5EP9A 1YCJA 2L9LA 5H8QA 1PGL1 2Q8EA 2F97A 5J1DA 3KB5A 3VLBB 3DYPA 2W08A 4NG7A 1MQGA 1H6XA 2I2SA 1I1EA 1ZM1A 2KD7A 1SBDA 4OI4A 3POJA 4QKDA 4D6SA 1QXPA 3RZKA 2GZWA 5AA4A 1OSGA 3VLWA 3INAA 2E0SA 4OVQA 4BXSV 3ZXFA 4UOJA 4GD4A 3LDRA 3B00A 2QPQA 2VPOA 3R0RA 1CAWA 3MVWA 3FVOA 1A55A 4N9IA 3SH4A 2O8OA 4NRMA 5A6YA 3ROJA 1UF2C 3D5OA 1C8NA 4M0NA 5BWJA 4R73A 5DQ0A 1FYUA 2JDZA 4B4QA 4QX8A 2NWJA 3I54A 1UIVA 3ILNA 4IE6A 3MUZ1 5EQAA 1DCUA 5F3EA 1E5SA 2HWD3 3VZJA 1XC1A 5EYGA 3CZUA 2XJTA 3TAJA 4Q4W3 3CJXA 4LHNA 4IY5A 4URAA 1K5MC 2I48A 3ZYJB 4NIDA 2ZGKA 1US4A 3IB0A 3N7KA 4R2FA 3T4HB 3F95A 2ZHKA 2Y60A 4JV4A 4YKIA 1G9AA 5JR2A 3M7AA 4XF4A 5FY1A 4A6SA 1IXGA 4YM0A 3O1MA 4KG0A 1HKDA 5FPAA 4F29A 4EWEA 1DZRA 2W94A 4C91A 5JWPA 3POEA 1YXIA 1O5UA 2WINB 1EP0A 1CD3G 4P00B 2C5DA 1G6NA 5CI5A 4RJZA 2GC0A 5FXZA 3LDKA 4GALA 1B3HA 1N3WA 5H9RA 2DOJA 2ZBJA 1OMIA 4MGTA 4N7UA 2WWSA 1LLSA 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 3PTY A; 
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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