3PTYA

Crystal structure of the c-terminal extracellular domain of mycobacterium tuberculosis embc
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
333
structure length
284
Chain Sequence
SVGRSNLQALAGKTCGLAEDVLVELDPNAGMLAPVTAPLADALGAGLSEAFTPNGIPADVGTTAAPGINGSRARLPYNLDPARTPVLGSWRAGVQVPAMLRSGWYRLPTNEQRDRAPLLVVTAAGRFDSREVRLQWATDEQAAAGHHGGSMEFADVGAAPAWRNLRAPLSAIPSTATQVRLVADDQDLAPQHWIALTPPRIPRVRTLQNVVGAADPVFLDWLVGLAFPCQRPFGHQYGVDETPKWRILPDRITELLMRATTVASYLKDDWFRDWGALQRLTPYY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The C-Terminal Domain of the Arabinosyltransferase Mycobacterium tuberculosis EmbC Is a Lectin-Like Carbohydrate Binding Module.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Arabinosyltransferase C
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 65
structure length 284
sequence length 333
ec nomenclature ec 2.4.2.-:
pdb deposition date 2010-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF14896 Arabino_trans_C EmbC C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.940 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3ptyA02
3.40.190.160 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 3ptyA01
3PTYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5JZGB 3T2TA 3HPNA 4ZS3A 5DPNA 3RS6A 1V9U1 1MXXA 5FZDA 1NE6A 3J7NA 5I57B 5C4WA 1QDOA 1TZOA 4CTEA 2V4VA 2RS32 3DGTA 4IV3C 3CJIB 2VMIA 3HIFA 1LOGA 2CZHA 1W6NA 5JAXA 1DFQA 4MNIA 2ZTNA 2YXSA 4EQVA 2P1BA 4OEUA 2VNRA 1NUXA 3PUQA 2MEV3 1UMIA 2NWJA 1RB8G 2WZ8A 4LITA 1COV3 1MS8A 3VZKA 4XUTA 2UWBA 4XTMA 4DB5A 4LVQA 4BDQA 3AKPA 4XDPA 1BVVA 2GH2A 4ESXA 2PHFA 5FJKA 1FTOA 4KNCA 1VBD3 1W8HA 3USUB 3U92A 3ZYFA 1AR82 3LBSA 1B40A 4AFCA 4IV3B 1W03A 3HQXA 2VECA 1EV11 3W5MA 4C0RA 3W9AA 2D6NA 3K6VA 3I2JA 5FY7A 1B51A 2PLV1 5FZFA 2YFZA 2Y6JA 1ULOA 4U21A 4JHTA 5A3MA 3E3KA 1OFNA 1WLWA 1FPFA 3ILFA 3VDDC 4CEYC 1IQ7A 1L7LA 3T4HB 1QH6A 2V93A 4TLMB 4R73A 1DGWA 3PVNA 4R9BA 2VL4A 4YKPA 5F9TA 1CNQA 1MDP1 2VBDA 1W8WA 1OHFA 4JVIA 2XPJA 1LB8A 1GVCA 1MS4A 4HE1A 2I58A 1PEBA 3ILTB 1DLLA 2GMMA 3OY8B 2DVCA 1RUE1 3V5AA 2B46X 3B9IA 3HNYM 3DYMA 4CDUA 4QT6A 4PFRA 2VOKA 1PHMA 1QQP3 5DAPA 5F5CA 1AJOA 2OX0A 3FLPA 1OLCA 1GZTA 3PIGA 1X50A 2QQWA 3VDDB 4CEYB 3ZFGA 4YKJA 4GB33 1O59A 1HSLA 5FO9B 1IMFA 5ET7A 3HV1A 3JZVA 3C4MA 1LHNA 3RWKX 2RC7A 2CTVA 3LCPA 4KYEA 1AR73 1QJX1 4OQOA 5A7OA 2IXCA 1KITA 3T3YA 5HPQA 2XJPA 4PLMA 1QJY3 5A6QA 3SEWA 3PLQA 2HLEA 4GKYA 1P1OA 3P6BA 4B8EA 1LAJA 3ASIA 3NKGA 2R8TA 4QRZA 3BYWA 2EICA 2REJA 5CZKA 1SFYA 5EZWA 3ELNA 4YVSC 3PJYA 5AE4A 1WGPA 3KG2A 4PFYA 1V6LA 3USDA 3SEUA 2V3UA 2WNUC 4NTLA 3W21A 3WINE 4P9LA 4M1VA 2DFCA 4A3ZA 2UVJA 1ZZCA 5I57A 2ZX3A 4Q4Y3 2MKZA 5B4XA 3G3JA 4CDXA 2WABA 5LEJA 4Y1UA 5F2SA 1LBBA 5GLUA 3OUJA 4P9XA 1XSRA 3K48A 3CFLA 4BLIA 2PHDA 2DVAA 2GP5A 1TT1A 3AJZA 1ZBE3 3E6BA 5JI9A 4JRLA 5LRSA 4HVQA 5CMCA 2K0GA 4G68C 3GCWA 4QQHA 5JI7A 1LECA 4HCWA 1FV2A 1CJDA 3ZS6A 5CEHA 4Q4V2 4DI4B 1VBE3 1FRPA 3PHMA 3MUY1 2X7QA 2YPDA 3MWBA 4K3UA 2FZ2A 2QQVA 4QX2A 4Z92B 5FMDA 3H6VA 3USUA 4JVAA 4N9IA 5FTTC 3G7DA 2WR9A 1SVXB 4L0PA 2X8KA 1Y1ZA 1SW1A 4K20A 1JXNA 5I3SA 4HPKA 3GBAA 2ZZXA 4ZU4A 2Q2CA 4R74A 4Q26A 3PMEA 1LOAA 4G9SB 3WX5A 2QJEA 4X8PA 4IEWA 2DCZA 1PVXA 2C5DA 1NLQA 4N91A 5FY5A 1AX0A 1LHUA 4LIUA 3K00A 2QS4A 3CVGA 2ZX4A 4YM0A 5GZGA 2ADDA 4N7UA 3WOGA 3C36A 1BKAA 2BV4A 2BNOA 1Q8PA 1JHNA 4KYDA 1Z78A 5K8SA 4GB31 1W9YA 3WNOA 5T5LA 1VALA 2RS11 5FZLA 3CNAA 5A3OA 3V8XB 4PTKA 1G86A 1F15A 4FFGA 3OY8A 1OOPC 4KPTA 3CQOA 5HI0A 2HWC1 5FYHA 2E51A 1QJY1 3A23A 4I0AA 3EHUA 2R49A 5K9YA 4RFRB 3D0SA 3H7YA 3W9WA 2O84X 3ENRA 3RFRA 1LSTA 3FFZA 2HBUA 1OVSA 2FBEA 1MG1A 3VDDA 2I48A 4CP1A 2ZHLA 3JD71 3H1MA 3FLTA 3MW0A 3LEKA 4RQPC 1BCXA 3U8QA 1AR92 4Q4X1 2I74A 1S2BA 3SNMA 4YB5A 3AL6A 1BMV2 2QNKA 3PVBB 1TXFA 1OOPB 3PUAA 2AR6A 2XVKA 2EIGA 2DYXA 2YU2A 5I8YA 1TMF1 3MV01 3FXBA 3M3LA 1JYXA 1NKGA 4QQOA 4QX0A 4HCYA 1UX7A 2Y7PA 2HWB1 4NF4B 1OKQA 1S55A 1US3A 2J1AA 3C31A 2R6GE 1K5MC 4ITCA 4RQPB 3K0VA 1LBXA 2JB8A 2RDSA 2B4LA 4H8IA 4FOWA 1FPGA 1WMFA 1UOFA 5E1RA 5EQ8A 2V09A 2BVVA 1QOOA 3AMMA 4QX1A 1URSA 4WV8A 3PTYA 1HQLA 2VQAA 4MGZE 1N7WA 3OBZA 3POYA 4XQ4A 2HYKA 1YXWA 3LSLA 3MPKA 1B35C 1LAHE 1NLSA 2RM22 2VOWA 4ISQA 4GWXA 1LLSA 2I3VA 4OHXA 4UW3A 4LO5B 1IHMA 3Q8FA 3K77A 1LGNA 4FOYA 5EQUA 3I2KA 1POV0 5A6YA 4CEWC 3KLSA 1NZIA 4FP3A 3THPA 4PFIA 5GLVA 4RGGA 5I59B 4LUKA 4RD7A 1FX5A 1VRH2 5A7WB 1W9SA 2GNTA 3PD8A 1OA2A 2ARAA 3LOIA 2FIXA 5F32A 3WF0A 2VUJA 1IGOA 3LR1A 4L17A 5IK5A 4A42A 4N07A 4GWUA 5K2XA 2DDKA 1ZVFA 3WZ1A 4MNPA 1B35B 1GGGA 3J26N 2XUEA 4Z7EA 4IL7A 5IHRA 1SLBA 3V83A 1AWBA 2A6YA 4XOGA 4FSJA 1B4ZA 1VE0A 1RUI1 2E7QA 1IKQA 4UABA 5JMCA 4CEWB 1F8VA 5KC6A 2FDJA 1WLCA 3SDFA 3M70A 4UF0B 3VKLA 4OWDA 3A4UA 4DQAA 5K0UA 3L2YA 4XBLA 3RZLA 1S4CA 3FVGA 4D6SA 5JSOA 3TCHA 3KS7A 2ORZA 3LSXA 3NNJA 1OVTA 4EROA 1B52A 3B69A 3Q26A 3V0AB 2XA5A 1LOFA 5FZMA 2P34A 2BGPA 4BCUA 1JYNA 3N35A 5CYYA 4NPMA 1LOEA 3IAQA 4EJRA 4N43C 4MGQA 1O64A 1H8VA 1YQ8A 1KFUL 3T2PA 4F3JA 2GN3A 2VZUA 4N90A 2C9AA 3N9NA 4OHYA 1FPN2 4Y1XA 3RNNA 4OZOA 3U11A 1PVC3 2RS31 3EB7A 5C3QA 2ZPXA 2W68A 3KF3A 3O29A 4O7IA 2OKXA 3VBHC 3Q8CA 3KZ4C 5A5LA 3MIHA 1YUDA 1B58A 3O1VA 3VDAA 2CZLA 4GAZA 1YQCA 1QY4A 4QXDA 4OMDA 1GWKA 4EQ9A 2O1QA 5FO7B 2HAUA 3MUZ1 3QIMA 1Y3NA 4I3GA 3N6UA 4LQ2A 4LLOA 1FTLA 3U14A 3H3GA 1UZVA 5J16A 3O66A 4RQPA 2L9LA 1W0NA 3W9VA 2JXAA 5IFTA 1QU0A 1QJZA 4S2DA 4WM7C 4LHLA 4R9DA 1UY0A 1DTGA 4ZHNA 3KN8A 1AR81 2F5XA 4I01A 3KB5A 3DYOA 2WBKA 3BODA 3G3HA 2UYEA 3FJ7A 5AC92 3EN3A 4WVMA 5AVPA 2DVBA 1WCSA 2PFWA 3TFLA 1H44A 4E4DX 1R9LA 4U1OA 1VMFA 1GZCA 1VDWA 1Q1KA 1BHGA 1AL3A 4Q4V3 3WW1A 4WVVA 1E5RA 5AA1A 4MHUA 2YBSA 1LCTA 1QW0A 4F39A 2KA3A 4A7KA 3JBG3 5IJRA 5I59A 3A0KA 2XD3A 1IPSA 5FPVA 3RT6B 1QVSA 1MS0A 5A7WA 2UWCA 3OTFA 4AK3A 4ZS9A 4YAHX 3EO6A 2BWAA 1J1TA 2NUVA 4Q30B 2Z22A 3QK6A 3ROJA 4OYUA 4LKEA 5FREA 3WR0A 1QIQA 1ODMA 3BGAA 1R1A3 4YGCA 1AYN2 1LJ7A 1FJ9A 1UZZA 4CXYA 2VXJA 3SKPA 1GV9A 3MV11 4FFHA 4Z82A 1KA1A 3ACLA 4MGSA 4IO6A 3AP4A 1AYM2 2RINA 3W59A 4A4AA 3LEIA 2BGOA 1JN2P 4C91A 3U1XA 4GA9A 2HEUA 1GP5A 5FPLA 2NVUB 2EIDA 2X09A 3O1RA 5ITPA 2HYXA 1WCUA 5IVBA 2P37A 5ICQA 3QUJA 1I69A 1GYKA 4QM9A 5DZGA 2GNDA 4A7YA 4YKIA 3V0AA 1OPMA 1ZBMA 2B4KA 3OGRA 2A6VA 3C7OA 3TYHA 5EXOA 4IO7A 2VAUA 2Y64A 1ND3C 5G04L 1LNSA 2W47A 1FW0A 3OB8A 1US5A 4DEQA 4XILA 3CIHA 3RPLA 4LBMA 4I62A 1NKXA 3ISPA 4DRRA 1GOHA 1URXA 3CSBA 1NCQA 3D8CA 1PB7A 3CHXA 2DTWA 3UL2A 2ZYOA 1AUYA 3ZVXA 2ONKE 5FYCA 4LQRA 1N76A 3AL5A 4GBVA 5LWBA 3G7WA 2IEEA 4BE3A 4O8MA 1W2OA 5C8CB 5DW8A 2ZGQA 1SLLA 3VV1A 4R52A 5FPAA 1JETA 2DXYA 3VXCA 4IXLA 2F6BA 1LU1A 1VLNA 1IPJA 4EDPA 3UT0A 2HWE3 2Q8JA 5C3PA 4JGYC 1ND3B 3MPPG 4L97A 3E13X 3H03A 1LENA 3PUZE 4GH4B 1W0PA 4NE4A 1PGSA 4Q4V1 5LBBA 1FNYA 5FKCA 5JXIA 3ES1A 4YZ4A 2VW2A 1NV0A 4LO7A 4JRAA 1KXGA 4MEVA 5CMBA 1NUWA 2RDRA 1ZRDA 1ENRA 4XEQA 2AIXA 2Y0IA 2WZPP 5JUVA 3GCXA 1ZMGA 4AZZA 2JENA 3RZJA 3WW4A 5I0RA 4AG4A 1GKBA 5G05L 4AQTA 1RXFA 5DVJA 4UFMA 2H6CA 4XXPA 1B9JA 1QEXA 2DUOA 3C32A 3POBA 1O7FA 3R7XA 2DE4A 4RPOA 1A34A 4PIXA 4CXXA 5H9RA 4OUMA 2KR0A 4YZZA 1KEXA 5LZ6A 4NGUA 4IGQA 3O1PA 1KQRA 4RSUA 2ZZVA 3FUZA 3PGFA 4XMIA 2DFBA 1JMUB 4B3NA 5HV4A 1XRUA 1XNDA 1BYHA 1DF0A 3C7FA 4EN8B 3S9NC 4XUQA 4PE3A 2I6EA 4I3PA 4BB3A 3OSQA 1DGWX 3E79A 3PMSA 2E53A 2XOMA 4NEDA 2ZJCA 1RUJ2 2W7YA 5IZ1A 4QQPA 3VBUC 2SBAA 2WWJA 2LS6A 2WLPA 5FP4A 2WUHA 1C5IA 3LA2A 2B9VA 3WNXA 4XKRA 3T9VA 5I7IA 4Y5SA 1LEMA 3CU7A 2JE8A 2VCMA 1AR91 3POSA 5TPAA 4N81A 2Y6FA 1H43A 1BMV1 5A3UA 2DVGA 1W6MB 1UYXA 2VGDA 1C4RA 1DDLA 2E26A 2WX9A 1WW5A 4QB1A 4GIZA 3FWEA 5CKMA 1Z7S2 4RYDA 4XKPA 1ZX5A 3MICA 3ZFFC 4PAIA 4OVEA 2Y5LA 2VOVA 1NA1B 1GNHA 2D6PA 2HXWA 3RI8A 1YI7A 3NNMA 4U2RA 1ZZ7A 4NE9A 3T0AA 1H45A 4P47A 4TZDA 3WDXA 1M5EA 2UVIA 5A3TA 2ZEYA 5JSRA 1IEJA 2GRVA 1X8MA 1R093 1ULFA 2BFUS 1UYYA 1YFXA 3JCIA 3I3VA 5C8CA 1QJU3 3ACGA 3HOBA 1OBNA 4N4UA 1SBPA 2B65A 2LROA 2Q89A 1S0CA 3J8F2 3IL1B 2NMNA 1GNYA 2J1UA 4YB7A 1NXD1 4N6PA 1VR3A 3N9LA 3MP6A 2FD8A 3DXUA 4H46A 1KRIA 4H3WA 4NF6A 3ZFFB 1C1FA 2NM1A 2Z79A 5FYSA 1FNZA 2RM21 1TME2 1PGL2 3BPZA 1HLCA 4FAJA 4GH4A 3CO2A 3VXBA 2NZ9A 3VLBB 3AMPA 4CUBA 4EE2A 1UL9A 4RNSA 5H9SA 1UNBA 4LHKA 4JV4A 5I0SA 1VR5A 3Q9OA 1BTJA 3UJQA 3SKJE 3HNMA 2HQ0A 4QX3A 1VRH1 2H0VA 3B93A 2ZXTA 5A6XA 4WVZA 5J96B 3PIJA 2D3PA 5ICTA 3MYXA 3FL7A 3BIWE 1KJRA 3LIGA 1QGLA 4O3BA 2G29A 2A6WA 2OS2A 2VUAA 2YZ4A 2A6ZA 1EH3A 3CMGA 2XHKA 1ZZ8A 1VIWB 3VGIA 5BV6A 4DDDA 2TEPA 2ZHMA 3OO9A 4UXAA 1EYIA 2EXKA 5FOJB 3SCFA 1JZ5A 1MY3A 1WMEA 3AZXA 2I07B 4G8HA 5CFDC 1NOVA 4PF5A 3Q8EA 4YW3A 3LA7A 1AL23 2C9KA 4ZU7A 1RJ7A 5KZTA 3K4DA 1I1EA 1N1TA 1NUYA 1XE0A 2D7FA 3RWNA 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 3PTY A; 
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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