2FUG2

Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex i from thermus thermophilus
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
178
structure length
178
Chain Sequence
FFDDKQDFLEETFAKYPPEGRRAAIMPLLRRVQQEEGWIRPERIEEIARLVGTTPTEVMGVASFYSYYQFVPTGKYHLQVCATLSCKLAGAEELWDYLTETLGIGPGEVTPDGLFSVQKVECLGSCHTAPVIQVNDEPYVECVTRARLEALLAGLRAGKRLEEIELPGKCGHHVHEVE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus.
pubmed doi rcsb
molecule keywords NADH-quinone oxidoreductase chain 1
molecule tags Oxidoreductase
total genus 43
structure length 178
sequence length 178
chains with identical sequence B, K, T
ec nomenclature ec 1.6.99.5: Transferred entry: 1.6.5.11.
pdb deposition date 2006-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
2 PF01257 2Fe-2S_thioredx Thioredoxin-like [2Fe-2S] ferredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.1590 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 2fug201
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2fug202
1ML6A 3EINA 4ML1A 2BJXA 5EY6A 3N9JA 3BCIA 5ID2A 4OO4A 2YJ7A 2C0DA 3C71A 3TKSC 1ZYEA 10GSA 1EP8A 1R26A 4ILFA 4GF0A 3W8JA 1F6MC 1GWCA 4K7IA 2QSIA 5JWOB 1V40A 4Z7XA 4DSRA 2PGTA 3DRNA 3Q74A 4DSSB 5KN0A 2K8VA 1EP7A 4F9ZA 1DE2A 2P0GA 3P7XA 3DIEA 4XIHA 3F3QA 3K8NA 2OA7A 5D9XA 2EC4A 1XWKA 3GYKA 1K3LA 2A4VA 5IIZA 4EC0A 3HY2A 5F07A 3LORA 3FKFA 3KJYA 4IVFA 1PKWA 5GZZB 4MF6A 1EV9A 4KCAA 2IPAA 1SJIA 1GSQA 1XWGA 2FA8A 3EVIA 2IIYA 2PWJA 1M0UA 1B9XC 3IC4A 6GSWA 1JLVA 3TJGA 1OE7A 1AW9A 1H75A 1FOVA 1LU4A 1X5CA 4D73B 3D4TA 2J23A 2VL9A 1TK0B 3F6DA 5C00A 2L4CA 2O87A 5FWGA 3UBLA 1BEDA 3DMLA 4BWSA 1QMVA 3GNJA 5CO3A 4F0BA 2PPTA 3IRAA 3VPTA 4IS0A 1TI1A 5JCUA 3I43A 3QAVA 4QL7A 4NHWA 4WBRD 2XBIA 1EGOA 5G1LA 2GGTA 2JZRA 2H72A 2VLUA 5D96A 4O92A 1YF1A 2FGXA 3RDWA 1S3DA 3TCOA 2DC5A 1GSFA 4CW9A 1K0MA 2QGVA 5DAKB 4K2DA 4MZWA 3M0FA 4EVMA 1M9BA 2QKEA 1K0CA 3F6FA 2LQQA 5GSTA 3NZNA 3GUSA 2PERA 1EEMA 2TIRA 2DJ0A 4K6XA 1OVNA 2HZEB 1XW5A 3A3TA 2WZ9A 4ID0A 2L5OA 3ZVJD 5ID2B 1TOFA 2M72A 3DEXA 4V2LA 1XOBA 2CX4A 3EMXA 2DJKA 4TKYA 5IMCA 4WR4A 1GULA 2DSAA 3WGDA 1YKCA 3GMFA 3IPZA 4N0ZA 3TRPA 1Z7RA 2HLSA 3RPPA 3TJBA 2LRCA 5IMDA 1JZRA 2YWMA 3ERGA 1JHBA 5EPFA 2CZ3A 2VL2C 5H5QA 1JZOA 2L6DA 3VPQA 4V2MA 2B6MA 2IMFA 2YV7A 1WP0A 2HZFA 5ELAA 5IMAA 1VF1A 4FYUA 1R7HA 1VRSD 3R2QA 3E9JB 3F8UA 1E6BA 5FT3A 5D9VA 2OBIA 4MPGA 4YQMA 4J57E 5IM9A 5DJMA 1GSSA 2MBTA 2YNXA 3IA1A 1V2AA 3HVSA 2FLSA 2GQKA 4IHUA 5ECIB 3CSHA 1J08A 2VCXA 2B3SA 5ECHB 1YZXA 4OCFA 3HVVA 1SD9A 2I9HA 3UMAA 4MABA 2GQLA 2H6ZA 1GTAA 7GSSA 3CBUA 1T4YA 1USBA 1XWAA 3V1WA 4J2FA 1M2AA 1FVJA 3ZREA 1AC1A 2DBCA 1LJRA 1KEBA 1WIKA 1OKTA 3M3MA 1J0FA 3GN3A 1X9SB 5IOWA 2LJAA 3LWAA 1H4OA 3KMOA 1TRUA 1WWJA 2LV3A 6GSUA 4JU5A 4AGSA 3EWLA 3FYGA 2FHEA 3MNGA 4DSQA 4OD7A 1I5GA 1B4PA 3KD0A 4IP6A 5DDLA 3DD3A 1ST9A 4N0VA 4EE0A 5D9WA 1AQVA 5ECNB 2PMTA 3J7Yk 5G30A 1UA5A 4PQ1A 1BYEA 2YZUA 2LNTA 1JZWA 1A2LA 1SK1A 1Z7PA 1S3AA 2NBSA 2OKAA 5CRDA 4I6XA 1AUCA 5D8IA 1V57A 3ME8A 2H74A 4HEA2 1YKAA 3DVWA 4HU9A 1ZCPA 1RK4A 3GX0A 4AJ6A 4I8BA 1XWBA 2GS3A 1TU7A 3F4TA 2C1YA 1XPVA 4EF0A 1SJZA 4KE3A 4PNGA 4I5QA 1T3BA 1SD8A 3ZRDA 1T1VA 1WPIA 4KGIA 1A23A 1GH2A 3TKSE 2YPMA 1K0OA 2EIRA 2D2ZA 2LQOA 2CVDA 5KEJA 1SK2A 2K18A 3WYWA 2B5YA 1Z9HA 4MZCA 1IYHA 3RHCA 1ZOFA 2NDOA 4BVYA 2LNSA 3KMNA 4IJIA 5HR3A 4LMVA 3TGZA 5ENUA 1VF4A 1A8LA 3HKRA 2AYTA 3FK8A 4MDCA 4OFNA 3GHAA 3ZFBA 2V6OA 4FYBA 2P5QA 3ZVJA 1R4WA 5KN2A 4MJEA 2HXKA 1TTZA 1JZDA 4OFTA 1SU9A 1O73A 5JWQB 2FNOA 4ZB8A 3CXGA 2JACA 1MDIA 5ECMB 3MSZA 1X5EA 1AAZA 4J56E 2HNLA 5JCWA 1RQMA 2RUEA 2VCZA 5LD0A 2X8HA 4MF7A 2DIZA 2HRNA 1MTCA 3MWHA 1YY7A 4RQRA 1HNBA 2E7PA 1E2YA 2HSHA 4O7HA 1A0RP 4I97A 4EUYA 1F37A 2H01A 3HHVA 1S3CA 3EU4A 4I2TA 2V6KA 4MP4A 4HQSA 1MD4A 2X8CA 3P8WA 4FYCA 3CTFA 2YP6A 3OR5A 3F0IA 4OFMA 3M1GA 3RPNA 1EV4A 5CYYA 3F3RA 5IPHA 3FZ5A 1WJKA 1WMJA 2C8UA 5FHIA 1PN9A 3KM6A 3LJRA 4WBJA 4DEJA 3GKNA 5IO2A 4TN8A 2DMMA 1KTEA 2XBQA 2VL3A 5LNKe 4GWRA 3TUEA 3KH9A 1Z6NA 3FEUA 2EIQA 1DE1A 1GUKA 1OYJA 2X99A 2FWHA 2BMXA 2L4QA 1GSDA 1G7OA 5HFGA 3ZITA 1C72A 2RLIA 3ZZXA 2E2GA 2VM2A 4JEDA 3ERWA 2WB9A 3UBKA 5ECRB 2C4JA 5ECLB 2YJHA 4WXTA 1MDJA 4L0WA 2B1LA 2NVLA 1WE0A 1ACVA 3GRXA 1GSUA 3FW2A 2HZEA 1GLPA 2VO4A 3HYPA 2OACA 2LEGA 2WFCA 3NIVA 3PINA 5J41A 3RBTA 1ZZYA 3ZLPA 2IFQB 4HJ2A 4AJ7A 3GL5A 4CHSA 4GQCA 2H30A 2E0QA 2C0FA 1G7EA 1DUGA 3UVHA 3TJJA 1TW9A 3US3A 3VI5A 4MH2A 1SKRB 2JU5A 5J9CA 2VD0A 1X5DA 4KA0A 1O81A 3GV1A 5G31A 3HJMA 4F82A 1ZYQB 3IR4A 4K0GA 1ZGNA 2ALBA 4KSOA 3W6GA 3TDGA 4TR0A 3ZMLA 1FAAA 1Z5YE 4PQHA 2X64A 4PUAA 3EC3A 2DIYA 1TRSA 2B7JA 1MD3A 2AB6A 2GDRA 4TVEA 3SWLA 5GAND 5COHA 2EIOA 3D22A 4NWYA 2YWIA 1XIYA 4EO3A 3D0ZA 2KUCA 2WDUA 1SKSB 2H1AA 5G2ZA 1V58A 1NHYA 3QR6A 3FZAA 2Z9SA 4POLA 3KIJA 5H5SA 2VCTA 2AJQB 2WULA 1U87A 2H70A 2NPBA 3QOUA 4IQ1A 4KSMA 1A24A 1U3IA 2MBSA 4YQVA 3M9JA 3Q18A 3F63A 4TR1B 3IE3A 4RI6A 1YDKA 3WGEA 2WGRA 3HJOA 2H75A 2B1KA 4F03A 1M2DA 5J3RA 3FZ4A 3TJFA 2I81A 2GQMA 4F2IA 1V98A 4PNFA 5F06A 1GSEA 4HJMA 4GSTA 2VCWA 1ZMAA 1SL0B 2ZCTA 5AIVA 3UEMA 1GP1A 1OAZA 5L71A 4LL1B 2KP2A 3JCML 4ULXA 3C1RA 5A5KA 4ZILA 4HZ2A 3TKRA 3HXSA 1NW2A 2K8SA 2K6VA 4G19A 4JE1A 1F2EA 2LRNA 3U6VA 1FB0A 4IKHA 1NM3A 2GVPA 5D9TA 5KN1A 3O6TA 4IELA 1GUHA 4EDYA 1W89A 4K8MA 5CP1A 4JRRA 2KLXA 2R3XA 4QQ7A 3D21A 4GQFA 5CAXA 1OC8A 2CQ9A 3HD5A 1ERUA 5G5FA 2HYXA 1TXXA 1EZKA 4ECIA 2V32A 3TKSA 4TXOA 1FVKA 2P5RA 5GSSA 4NV2A 2IN3A 2KHPA 1EWXA 2CT6A 2L59A 1XBSA 2C3TA 3DVXA 3KH7A 3QPMA 2YANA 3APSA 1PA3A 1Y25A 2WCIA 3QD9A 3TOUA 2H66A 3KCMA 3UAPA 3TKQA 1I9DA 1SL1B 4GLTA 1T4ZA 1SYRA 1HYUA 3ZIJA 4TR3A 3RAZA 2PVQA 4I2UA 2VLVA 3L9UA 3ZTLA 2H0HA 5IMZA 3GTUB 1NHOA 1XFLA 1A2JA 4PQIA 3QAGA 5IPGA 2I3YA 2FY6A 3HZ4A 1GNWA 4ECJA 4O5RA 5A4WA 1KBNA 5H5RA 2C80A 2LJKA 1T7PB 2CV4A 3BOAA 2OE3A 1GUMA 1AXDA 2ZUPA 3L0HA 3FRCA 2MMAA 4L0UA 1PD21 2HRFA 3C7MA 2A2RA 1BAYA 2MYGA 2VUPA 1EOHA 2VIMA 3Q19A 3TKPA 1BG5A 14GSA 4POKA 1FG4A 3PH9A 2MMNA 4GCIA 5B6MA 1K0DA 4LA1A 4X1UA 11GSA 3APQA 3GH6A 4BA7A 1ON4A 4JBBA 5F8BA 1WRYA 1XCCA 2O8VB 1BJXA 2FWFA 1ERTA 2RIIA 3C1SA 4PX1A 1J9BA 3BJ5A 1ABAA 1QXHA 3QFAC 4IGJA 2QC7A 1PRXA 2YCDA 4GTUA 1AQXA 4MCUA 5IOXA 1FO5A 3G7JA 1SL2B 4YQUA 3DYRA 2JSYA 5ECOB 4P3YB 3G7YA 5HR2A 1AQWA 2JZSA 2YWOA 4WR5A 3RHBA 3WGXA 5CRGA 5HR0A 3LXZA 3A2XA 3GIXA 4K9ZA 4K0NA 4KB3A 2VAFA 3FZ9A 4XS1A 1YEPA 2IJYA 2XHFA 4MZBA 5CRHA 3ED3A 3H79A 1XOAA 2WJUA 2XC2A 4KDXA 1URMA 3O76A 2C0EA 1PQNA 1SJ6A 5EL8A 3IDVA 5JWRB 4TXOB 2LRTA 2J9HA 2IFQA 4H86A 5AIXA 2I1UA 1QQ2A 5DCHA 3KXOA 3IK7A 2BTOT 3UL3A 1UC7A 2H8LA 3QFBC 4POBA 2VL2A 3GL3A 4G10A 1PX7A 1G6WA 4MJAA 4ZL7A 1F3AA 3FR3A 3LYPA 3VWXA 2FWEA 1AIUA 3P2AA 1EEJA 1K0NA 1VF2A 4FIWA 4XS6A 4HI7A 4E8EA 2CZ2A 1THXA 3L9VA 1T00A 4N10A 1BQ7A 1XW6A 3H93A 2N5BA 4ZIJA 2YOIA 5ECSA 3D4MA 1LBKA 1QGVA 5IO0A 2VOCA 4E8HA 4WKWA 3PR8A 1OKDA 1Z6MA 2V41A 3BCKA 1VF3A 3AY8A 4XRAA 2C3QA 2IMKA 5B8BA 2OADA 4BL7A 1RW1A 8GSSA 4V2NA 4HZ4A 2GZPA 3ZYWA 3IK9A 2TRXA 3WT2A 1VGLA 3CYNA 5B7CA 1O85A 1XZOA 4MH3A 2GSQA 2VLTA 5KN3A 3HCZA 2YV9A 2IMIA 1N8JA 2E2MA 1K0BA 5C04A 4XHMA 2HI7A 2IMDA 2TRCP 3ZL5A 2IWTA 4OCEA 1XVWA 4PGTA 2I4AA 2R6KA 4NV5A 4IP1A 4TR1A 1U6TA 1TK8B 2OE0A 3P90A 2DJJA 4BVXA 4ZB9A 4N30A 2L57A 5ECKB 3FR6A 3M9KA 3IOSA 3MDKA 3O3TA 4KW6A 4NHZA 4GRFA 2MMZA 3UARA 2WRTA 4XS4B 2CAQA 2YWNA 4EL1A 4KX4A 4GSSA 1SK0A 2NTOA 5DALB 5J5NA 2VCQA 4MA9A 1K3OA 2GTUA 3IXRA 5IMVA 2PBJA 1TDIA 1XXUA 3L78A 1OE8A 5A4UA 1TJDA 1JLWA 3CTGA 2R5GA 4X43A 2C0GA 4TXVA 3I6AA 1HNCA 1TK5B 1PGTA 5ABRA 3F4SA 1B4QA 4K7OA 4PUFC 2P31A 4ECBA 1F9MA 2KP1A 1GLQA 1GNEA 3APOA 4RQXA 1PMTA 3M8NA 3GKKA 2LS5A 2DMLA 4HS1A 3J7Yb 3FR9A 2LSTA 3DWVA 3ZMKA 2V1MA 5DQYA 5F05A 1HQOA 2M46A 3GX8A 2MMOA 1TKDB 3A5WA 3DGQA 4YAPA 4ML6A 2G0FA 5E59A 4MK3A 1GL8A 4HOJA 2F3MA 4GSNA 3ISOA 3UJ1A 4HDEA 4IBPA 3KP9A 1GTUA 4MJBA 3VFIA 3KTLA 3GTUA 1ERWA 4Q5QA 4HQZA 6GSXA 4BWQA 4OMVA 2H19A 2HT9A 3F4RA 5AGYA 3VK9A 3U5RE 5D93A 3LFLA 2R2JA 1Y6EA 5G1KA 2MZCA 3KTBA 4KDUA 2R37A 1PKZA 3D5JA 1M7TA 4TW5A 4G9HA 3GURA 2RM6A 3HDCA 4JR4A 4Q5FA 4IQAA 3GSSA 2B7KA 4IJ3A 4PURA 1O8XA 2HFDA 3VWWA 5IQYA 4O32A 4NAXA 3GFKA 2A2SA 4ACSA 1YEXA 3LQ7A 1OC9B 2HE3A 2LKUA 1PL1A 1K0AA 4TR4A 2AAWA 3KZQA 4V1Ap 4Q5RA 4TOPA 4MMMA 2YZHA 5B8AA 1IYIA 3L9SA 5CRWA 1XVQA 2GSSA 2H1BA 3EURA 1Q98A 2REMA 1BX9A 4AJ8A 3Q6OA 3TOTA 4EDZA 1W4VA 2XPDA 3VI7A 1O6JA 3GA4A 3H1NA 4ZXGA 2R4VA 1R5PA 4ZBAA 3QDNA 4TRXA 2VM1A 2DJ3A 2LJRA 2PVOC 3GKXA 1M2BA 4HU7A 3UIWA 5D73A 5G5EA 4RUVA 1O7UA 2PN8A 5HQPA 2V2GA 3E3EA 5HFKA 1ILOA 2JL4A 3LEFA 3FY7A 1X9WB 5DJLA 5CREA 3KP8A 2O89A 4MF5A 2H1GA 3FHKA 5ECPB 1TP9A 3H8QA 16GSA 4XRDA 3HJPA 1QFNA 4HUAA 2CX3A 1A8YA 2HSYA 3CRUA 19GSA 3E0UA 1SKWB 3SBCA 6GSTA 20GSA 3EE2A 1UVZA 4PXOA 5IMFA 2B5EA 3C73A 1EOGA 5A4VA 3QAWA 1JFUA 1TU8A 1CQHA 6GSYA 4EXJA 1U3AA 5AN1A 4JR6A 5B6NA 4OO5A 3VURA 2YN1A 1F3BA 1YQ1A 4KNDA 3UOMA 3GH9A 1B8XA 2OE1A 1TRWA 2ZNMA 5DBQA 1PSQA 12GSA 2WS2A 4GXZA 1DSBA 5CNWA 3DKSA 4LMWA 1K3YA 4AF2A 3WD6A 4KH7A 5DCGA 3G9BA 2GZYA 4ECCA 1FHEA 3BD2A 3EMPA 2G2QA 3BBYA 4CDOA 4G2EA 1Q4JA 3IAS2 5ELGA 1NSWA 2FCHA 2H0GA 4POMA 5HR1A 4EKZA 5EVOA 2LTKA 4XTSA 1B48A 9GSSA 2F9SA 3GKMA 4NPBA 1O8WA 1DBYA 2RM5A 1GRXA 2KOKA 3WT1A 3C8EA 1M9AA 2JZTA 4Q5NA 1XWCA 5J4UA 3F9UA 2FA4A 1WOUA 2PUKC 2FD3A 5F0GA 4FO5A 1PX6A 4ZL8A 4MPFA 2L5LA 6GSSA 3ME7A 4ZB6A 4WEYA 1YF0A 2H6XA 2ON5A 2N5AA 18GSA 3IHQA 1T8EB 4N11A 2IL3A 1ERVA 4OWYA 1FW1A 5JCGA 2OJLA 3EU3A 4K1FA 3IV4A 3CMIA 4K7NA 3UVTA 2IMEA 4XS4A 4FH8A 5HFIA 5AISA 3VLNA 4XCSA 5ECQB 1R5AA 3IAM2 5DALA 3TRXA 5DVBA 4IW9A 1CQGA 1TI3A 4NMUA 4BPYA 3LG6A 1GTBA 2M80A 2K9FA 4JZQA 3W8SA 1GSYA 3I69A 4ZBBA 2F8AA 1SYXA 13GSA 2L6CA 1B9YC 2GSTA 3A2WA 2H71A 2DJ1A 2X8GA 2ON7A 4KDYA 4X0XA 4L8EA 4WF5A 2F8FA 4KAEA 5DQSA 4NXIA 2GZZA 3D6IA 4KCEA 1SENA 3EYTA 3VWVA 2H76A 1G0TA 3LXTA 2N5FA 3H4KA 3TJKA 3HZ8A 4ISDA 5INYA 3LYKA 6GSVA 2AHEA 3QMXA 4WETA 3HA9A 1V9WA 4F0CA 1OC3A 2CVKA 4LLRA 3N5OA 1TRVA 2GT5A 2H1DA 1PL2A 1M99A 4DSSA 3S9FA 5J9BA 5GAPD 1MEKA 2OBKA 1QUWA 2XPEA 3NOFA 2ES7A 3G7IA 1YJ6A 2LUSA 2CVBA 3LSZA 2H73A 1HNAA 17GSA 1A2MA 1MDKA 2JADA 4RI7A 3HVXA 1X0RA 2DJ2A 1GTIA 2DLXA 1X9MB 2H6YA 1N2AA 1THOA 2PU9C 3CRTA 3DXBA 3ZIVA 4ZL9A 2GT6A 5E4WA 2AV4A 3GSTA 3MAKA 1KNGA 4ZBDA 5LCZA 4YAVA 3TB2A 4L5LA 2B5XA 4YH2A 1FB6A 2GLRA 1EGRA 3TRQA 4MJCA 3A2VA 1OC9A 2GSRA 3ERFA 4D73A 4QL9A 2FWGA 2FUG2 2O7KA 3CSJA 2AUVA 2F51A 1HD2A 1XW9A 2C3NA 4MLYA 1U88A 1ZL9A 1Z3EA 2VD1A 3QCPA 1G6YA 3LGCA 2CA8A 3KGKA 4V1Ag 2JSZA 3L4NA 2VCVA 3I9V2 4IN0A 2H0IA 3VWUA 4WF4A 4DVCA 2O85A 4KUNA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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