2FUG2

Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex i from thermus thermophilus
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
178
structure length
178
Chain Sequence
FFDDKQDFLEETFAKYPPEGRRAAIMPLLRRVQQEEGWIRPERIEEIARLVGTTPTEVMGVASFYSYYQFVPTGKYHLQVCATLSCKLAGAEELWDYLTETLGIGPGEVTPDGLFSVQKVECLGSCHTAPVIQVNDEPYVECVTRARLEALLAGLRAGKRLEEIELPGKCGHHVHEVE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus.
pubmed doi rcsb
molecule keywords NADH-quinone oxidoreductase chain 1
molecule tags Oxidoreductase
total genus 43
structure length 178
sequence length 178
chains with identical sequence B, K, T
ec nomenclature ec 1.6.99.5: Transferred entry: 1.6.5.11.
pdb deposition date 2006-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
2 PF01257 2Fe-2S_thioredx Thioredoxin-like [2Fe-2S] ferredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.1590 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 2fug201
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2fug202
4POMA 4ZXGA 10GSA 5EY6A 3LYPA 2EIOA 1ON4A 3LXZA 4I5QA 4O5RA 3VI5A 3LG6A 2VCXA 2LJAA 5DCHA 2HFDA 3WD6A 5ECQB 3QPMA 4AJ8A 2WULA 20GSA 4J56E 2H19A 2J23A 2HYXA 3TJKA 3FK8A 2IN3A 2IL3A 3J7Yk 3ZIJA 1U6TA 1GLPA 3DD3A 3F0IA 5ECMB 1GSYA 3DGQA 1R7HA 2RLIA 3L4NA 2YN1A 2DSAA 1WE0A 2KOKA 3GH6A 4YQMA 2B1LA 2D2ZA 2AUVA 4OO4A 5ID2B 4HZ4A 3F4SA 5KEJA 1O73A 3IBHA 4FO5A 3ZREA 1A8LA 3C7MA 3G7JA 3M3MA 5IO0A 1SKWB 1XW5A 2A4VA 1ML6A 1K0AA 4HS1A 1BX9A 3D21A 2LJKA 3KZQA 2X8HA 4DVCA 3APOA 3FYGA 4JZQA 4DSRA 1GP1A 1FOVA 3IK9A 4L0UA 3PR8A 4O92A 3BBYA 3LEFA 4POKA 2P31A 2DJ2A 4K7OA 4KAEA 3QDNA 2AYTA 4QL7A 1GUMA 3F8UA 1OC8A 2HRNA 2YANA 4NXIA 2VM1A 3KM6A 2LTKA 1ILOA 5HR2A 1E6BA 2GT5A 4V2NA 4DSSB 4IKHA 2O7KA 4XS4A 5DCGA 3GX0A 4MABA 1GSSA 3CRUA 4OFNA 2AHEA 1TJDA 2YWNA 4EC0A 1XWCA 2I3YA 3C71A 2TIRA 1NSWA 5LNKe 2C3QA 1JLWA 2HI7A 1DE2A 2GZZA 2YV7A 6GSYA 5IMAA 2VM2A 4EDYA 4LMWA 5JCWA 4KDUA 1J0FA 1V2AA 1ZCPA 1GTIA 4MZWA 3MWHA 3IC4A 4K7IA 4MLYA 3ZL5A 2H6YA 4X1UA 1G7EA 3GUSA 4N0VA 4PXOA 2R5GA 3HVVA 5CRDA 2AV4A 4KB3A 5C00A 2PMTA 1B4PA 4HU9A 3TDGA 1X0RA 4F03A 2DMMA 2K9FA 2CV4A 4RQXA 4EE0A 4LL4B 5G30A 4E8EA 6GSSA 1GSDA 1EEMA 2VD1A 3NIVA 1Z6MA 2PBJA 1TU7A 3G9BA 4N10A 1A2LA 3HCZA 5IMZA 4MF6A 13GSA 1T1VA 1I5GA 18GSA 3N5OA 3S9FA 2VL9A 2C1YA 4GXZA 4PX1A 1JZOA 1XW6A 4NAXA 3J7Yb 5IPGA 4ECBA 2VL2A 3HJPA 4ECCA 3ISOA 4ILFA 2XPEA 3V1WA 4Q5NA 2PGTA 2PVQA 4XTSA 1PX6A 3HXSA 2QC7A 3ZFLA 4PUFC 4D73B 5E59A 2VLUA 3O3TA 4EKZA 4HU7A 2VLVA 3QCPA 3LFLA 4IQAA 2FY6A 3H93A 3FZAA 2WJUA 5ECNB 2MBTA 3DXBA 2CX4A 2IPAA 1YZXA 4K6XA 4HI7A 1XPVA 3ZMKA 2O89A 3RPPA 4ZL8A 1A24A 1VRSD 5J41A 4L0WA 2FWGA 4NMUA 4F9ZA 1O8WA 3FR6A 2FWFA 2GLRA 3F6FA 4KUNA 3TRXA 1O81A 4KH7A 4WBRD 1A0FA 3M8NA 1T8EB 4XCSA 5ID2A 3H79A 5CP1A 4HQSA 3I9V2 5H5SA 1YKCA 4AGSA 1TXXA 5LCZA 5INYA 3VURA 1BJXA 1KNGA 2REMA 1X5DA 2CVDA 3MSZA 2V41A 3EU3A 3UEMA 4LMVA 4L5OA 2VCZA 1HNBA 1XOBA 4PQ1A 2MMOA 4YQUA 5IPHA 4GSNA 12GSA 3LXTA 1UC7A 2LV3A 1LU4A 3ERGA 2F51A 3F4TA 1WRYA 2H72A 3MNGA 5IO2A 3CXGA 5IQYA 1W4VA 3TKPA 1GTAA 4QQ7A 2DJ3A 3K8NA 4KE3A 6GSXA 4GSSA 5D96A 5B6NA 2LSTA 2MMZA 3FZ9A 5ENUA 3GKNA 1FG4A 3QAVA 2L6CA 4DSSA 1BQ7A 3GL5A 2P5RA 1PQNA 2H1BA 5HFGA 1Z6NA 1H75A 5GAND 3G7IA 4JEDA 1SL1B 2GT6A 4J57E 4F82A 2HNLA 5LD0A 2KP2A 1X5CA 1YF1A 5HFKA 4XIHA 1OE8A 1YEPA 2E7PA 1R26A 1SK0A 3KJYA 4MF7A 1PMTA 1THXA 2MMAA 3ZYWA 3HHVA 3A2XA 1YKAA 1S3DA 1X5EA 3HDCA 4XRAA 3WT1A 4HJMA 4CW9A 2WDUA 2GZPA 2PVOC 5J5NA 2VCQA 5JWQB 2VL2C 2IJYA 3DIEA 1IYIA 3Q18A 5ECKB 3NOFA 5GZZB 1GL8A 3DWVA 1XBSA 3CRTA 3KD0A 4IS0A 2L4CA 4MF5A 4IJIA 3O6TA 1VF4A 3VLNA 1PD21 1OE7A 3RDWA 2X64A 5CRGA 4ZILA 3ZTLA 4K9ZA 2C0FA 2GZYA 3KP9A 4GQCA 3GV1A 4ZL9A 4D73A 4NHWA 3GX8A 3I69A 2BJXA 3FR3A 3A5WA 1JZWA 1A2JA 2AJQB 2IMDA 2IWTA 4OO5A 1SKSB 2PU9C 1QMVA 3LYKA 1AXDA 1B8XA 2YCDA 4J2FA 3EURA 5G1KA 4JRRA 4IGJA 5DALB 4MPGA 2NDOA 3N9JA 5F8BA 2YJ7A 4NWYA 3D6IA 3GKXA 2HZFA 1V9WA 3RHCA 1ERWA 4YAVA 3VWWA 1R5PA 2H8LA 3R2QA 2GSQA 4ML1A 2V32A 2FGXA 2B7JA 3AY8A 1TK8B 4IVFA 3SWLA 5DDLA 3RHBA 3W8JA 3GL3A 3CTGA 4BVXA 1VGLA 2P0GA 5G5FA 3P90A 5J9BA 2KLXA 2O85A 2YWIA 1VF2A 3BCIA 4IP1A 1TI1A 3UMAA 5ABRA 2JACA 4WF4A 1PRXA 2N5BA 1HD2A 4IQ1A 1GSQA 3ZRDA 3LQ7A 5IMFA 1GSFA 2IMFA 2HSYA 1T4YA 1QK8A 2WZ9A 2YV9A 2PERA 1HQOA 5CREA 5HR3A 2GSSA 1RQMA 3LWAA 2B5XA 1EOHA 2ON7A 1Y25A 1AC1A 2VO4A 1CQHA 2I81A 1EGRA 2FWEA 1AQXA 5A4WA 2YWMA 5ECPB 5IOXA 1H4OA 3TJFA 4GRFA 2J9HA 3Q74A 3CBUA 2ON5A 4ID0A 3KTLA 2LNSA 1JZDA 2JZRA 2O87A 2TRCP 2L5LA 4ZB6A 4RUVA 3GA4A 4TR0A 5G31A 1DBYA 1FVJA 2C8UA 4OD7A 3QOUA 5AN1A 2CZ2A 2ZNMA 1FB6A 2PN8A 1PX7A 2AAWA 1QQ2A 2RUEA 4WEYA 2H30A 5FHIA 1U3AA 3HJOA 1TW9A 5KN0A 2PPTA 2HZEB 3TOUA 1OKTA 3UJ1A 4EF0A 3US3A 3WT2A 2DJJA 2OADA 1V40A 3VWXA 1JFUA 5CNWA 1B9YC 2KP1A 3KMOA 2ES7A 1GSEA 1PKZA 3PH9A 1V98A 1Z3EA 1R4WA 5F05A 4G2EA 2DJKA 6GSWA 6GSUA 4N11A 1ERVA 1M7TA 2B1KA 1BG5A 4MP4A 2NBSA 1O7UA 3GH9A 3IV4A 4TR1B 2HT9A 1TK0B 1K3YA 3QAWA 2FWHA 1PSQA 4PNGA 4YAPA 6GSVA 4CHSA 3DRNA 5J3RA 1MTCA 1Z5YE 3HVSA 1GTBA 5KN3A 3SBCA 3L9SA 1HNCA 1N2AA 2FA4A 2X8CA 1XWGA 2R6KA 1TRVA 4OFMA 4FYCA 2V6OA 4I8BA 2G2QA 3QFBC 5DALA 3GFKA 1HYUA 1SJ6A 2VIMA 3TKSA 3IAS2 4YQVA 4AJ7A 2FD3A 1PGTA 5CRWA 1UA5A 2JADA 4G19A 5B8AA 1EWXA 3IR4A 1DE1A 3I43A 1QUWA 5G5EA 2VCVA 1RK4A 4OCFA 5AGYA 2YJHA 2KHPA 4X0XA 4NPBA 3UBLA 1JZRA 5HQPA 2R2JA 4ZL7A 4ZBAA 5JWOB 1DUGA 2JSYA 2HSHA 1T00A 3P2AA 5A4VA 3UIWA 2IFQB 3IA1A 1ZYQB 2X8GA 2DIYA 1EV9A 2HRFA 2AB6A 1VF3A 3P7XA 3VPQA 1FO5A 4GCIA 3RBTA 1FHEA 1AIUA 4MA9A 5CO3A 1O6JA 4N30A 3JCML 4KCEA 4O32A 1ABAA 4CDOA 1J08A 3HYPA 3UAPA 4TR4A 4GF0A 3RPNA 1EP7A 4I2TA 5FWGA 4HDEA 2ALBA 1XVWA 5B8BA 1OYJA 3KEBA 1FVKA 2VCWA 4ECJA 1UN2A 3ERWA 1DSBA 2R3XA 5D93A 3M0FA 3GRXA 4POLA 1ZYEA 3GTUB 3TKSE 2YZUA 5CYYA 1GNEA 2CVKA 3HVXA 3E9JB 3FR9A 3D22A 2VAFA 1TKDB 1TRWA 3VPTA 3E0UA 1BAYA 4F0CA 4TR3A 5EL8A 5IMDA 4NHZA 5CRHA 5HR1A 3UBKA 1XVQA 3Q19A 2VL3A 1F2EA 2HZEA 1MDJA 2VUPA 2WRTA 5FT3A 3L0HA 1K3LA 2CZ3A 4JR4A 2RUFA 5AIXA 1TOFA 1XXUA 1YQ1A 4HZ2A 3TJGA 2H01A 3KH7A 5AIVA 2XBQA 2V2GA 1TRUA 1G6WA 4MMMA 1TI3A 3A2VA 4ACSA 3U5RE 2L4QA 3U6VA 2Z9SA 1M0UA 2FA8A 3M9KA 4K7NA 2B6MA 1XFLA 1YF0A 4Q5RA 1LJRA 3Q6OA 2JL4A 1ACVA 4HQZA 3L9UA 4GTUA 4JU5A 4V1Ag 4NV2A 3FKFA 4KCAA 1K0DA 1XWAA 1T4ZA 4TXOB 3PGTA 1PL2A 4TR1A 1JHBA 2A2SA 3LGCA 17GSA 2I9HA 3CSHA 1TTZA 4N0ZA 2R37A 1GRXA 1W89A 1GSUA 3EYTA 5DAKB 1PL1A 3IDVA 3GSSA 4TN8A 1KBNA 1F9MA 2LS5A 2H71A 2YPMA 3WGXA 2DBCA 5DVBA 4AF2A 1MDKA 4KSMA 2H0IA 2VOCA 2XPDA 2C0EA 3EMXA 3H8QA 2YWOA 3HZ4A 2N5FA 5A4UA 3ZLPA 1HNAA 3HJMA 2V1MA 2RIIA 3EVIA 1WP0A 1WOUA 3M1GA 3UOMA 4X43A 4IJ3A 5DJLA 1R5AA 1BEDA 1C72A 1NW2A 1TP9A 1Z7PA 2A2RA 2BMXA 4DSQA 2CX3A 3IPZA 5ECOB 1G0TA 1VF1A 4HOJA 2JZSA 1X9SB 1T7PB 3BD2A 2CQ9A 1TRSA 4YH2A 2IFQA 1TU8A 4HJ2A 4LLRA 2DLXA 1SJZA 2GTUA 2YNXA 1F37A 1ZZYA 4PUAA 3HZ8A 3GNJA 4KSOA 2JU5A 3VWUA 2ZUPA 3IXRA 5JCGA 4MZCA 4V2MA 3BCKA 1TDIA 3C8EA 1SL2B 1EZKA 1FAAA 3ZVJA 2EIQA 5ECLB 3EINA 4WR4A 1M2AA 3D5JA 2LRTA 4BA7A 2GGTA 3A2WA 2L59A 1A0RP 8GSSA 2MZCA 1GUKA 5ECIB 1B48A 1THOA 4PURA 4QL9A 5DJMA 3L9VA 3GTUA 5GAPD 1BYEA 3FZ4A 4PQIA 4TKYA 1YJ6A 4FH8A 2XBIA 3TRQA 3QFAC 3HY2A 3TUEA 6GSTA 4F0BA 1U88A 5KN2A 2JSZA 1URMA 4IW9A 4BVYA 2IMKA 2OBKA 1U87A 3GIXA 1M2BA 3ZITA 5A5KA 2GVPA 1ZMAA 4ZB8A 4JR6A 2DMLA 2RM6A 1WIKA 4G9HA 4KA0A 1USBA 2R4VA 2DIZA 1OC3A 1AW9A 3G7YA 3GHAA 4V1Ap 4PQHA 4RQRA 3ERFA 2OE1A 2YOIA 14GSA 2G0FA 4IP6A 3PINA 3VK9A 1MD4A 2F3MA 3EU4A 4RI6A 3D4MA 5B7CA 2TRXA 2EC4A 3TOTA 1SD8A 2GSRA 4OMVA 3C1RA 1OAZA 2O8VB 3TJJA 4ZBDA 2LUSA 2NVLA 1ERTA 1J9BA 4TRXA 2N5AA 2V6KA 5ECRB 3DVWA 3ZZXA 4TXOA 3HKRA 3H1NA 3A3TA 5GSSA 4EXJA 3ZMLA 5J9CA 1MDIA 19GSA 3C73A 1A2MA 1EOGA 3F63A 3NZNA 2LJRA 5ELAA 1N8JA 4BWQA 2H1AA 2I1UA 2XHFA 3FW2A 5G2ZA 2WS2A 4XHMA 4I2UA 4MK3A 5DAKA 1E2YA 4MCUA 5IM9A 1K3OA 4OWYA 4MPFA 2LNTA 1FW1A 2H1DA 1A8YA 1G6YA 1NM3A 3DYRA 5F07A 1WPIA 3MAKA 1FB0A 4KDYA 5IMCA 1ST9A 3W8SA 1AAZA 3CYNA 3LORA 3VI7A 3GURA 4BWSA 4XS6A 1Z9HA 2H6XA 3ZVJD 1XOAA 1XWKA 11GSA 1OKDA 1SYXA 1PA3A 3TKRA 4KGIA 1A23A 1B4QA 2HXKA 3KP8A 1YDKA 4G10A 4IBPA 4KW6A 2WGRA 4EVMA 1EEJA 2PWJA 5D9WA 4LA1A 2E0QA 1EV4A 3TJBA 2C0GA 5B6MA 1F3BA 4WR5A 4KX4A 4XS1A 1MEKA 4FIWA 2GSTA 2OBIA 9GSSA 4WXTA 2QSIA 3WGDA 3RAZA 3ME7A 3KTBA 4WKWA 1UVZA 5D9VA 1M2DA 2B7KA 2MBSA 4NV5A 2E2MA 5H5QA 1GNWA 3CSIA 2K18A 1KTEA 2M72A 1K0OA 1X9MB 2X99A 2I4AA 1M99A 3DEXA 2QKEA 2F9SA 3OR5A 4HEA2 2C80A 4Q5QA 2H75A 2DC5A 4POBA 3ZIVA 1GUHA 2RM5A 1AUCA 2H0HA 1AQVA 4I6XA 2EIRA 1XWBA 2GQKA 1ERUA 5D9TA 3GSTA 2L5OA 3EWLA 1GH2A 2L6DA 2C3TA 2FNOA 3UVHA 1F6MC 2DJ0A 4TXVA 1S3AA 3APSA 5IOWA 1M9BA 4V2LA 3FHKA 4K2DA 2XC2A 2F8AA 4IELA 4Z7XA 4GQFA 3D4TA 4FYUA 3KGKA 3DVXA 2WCIA 2GQLA 2B5EA 4EL1A 2FHEA 5COHA 3TRPA 1XZOA 3F6DA 3GYKA 2P5QA 3TGZA 1ZGNA 3F4RA 1Y6EA 1WJKA 3IE3A 3F3QA 2VD0A 2HE3A 2NPBA 1PN9A 1V57A 4MH2A 3CSJA 1OC9B 1KEBA 1M9AA 1K0CA 3F3RA 2OA7A 3UARA 3ME8A 2PUKC 4ZB9A 3IHQA 2E2GA 3IK7A 4ECIA 1RW1A 2H73A 4MH3A 3QR6A 4L5LA 1NHYA 4TW5A 1GWCA 1ZOFA 4L8EA 5EPFA 2LRNA 4LL1B 1I9DA 1SYRA 1U3IA 3IAM2 3TB2A 3TCOA 4WETA 2IMEA 3IOSA 2M80A 1Z7RA 2YP6A 2L57A 3GKMA 3APQA 4TVEA 3BJ5A 4MDCA 1LBKA 2WB9A 2IIYA 5F0GA 4ISDA 2H74A 3GKKA 3FY7A 2B3SA 3P8WA 2HLSA 3E3EA 2NTOA 2BTOT 1V58A 2CA8A 1MD3A 3EE2A 1PKWA 1SK2A 2DJ1A 5ECHB 3LJRA 5HFIA 2H70A 1K0BA 4PNFA 4WF5A 1GLQA 3H4KA 2CVBA 3C1SA 4GSTA 2M46A 5E4WA 1QFNA 1T3BA 5D73A 4IHUA 3QMXA 2K6VA 4I97A 1WWJA 2CT6A 2OJLA 3VWVA 3IRAA 3LSZA 4JBBA 3WGEA 2LQOA 2K8VA 4XRDA 1SK1A 5G1LA 2ZCTA 3CMIA 3KXOA 4MZBA 2CAIA 1QGVA 4K8MA 4MJEA 2VLTA 3FEUA 4EUYA 1CQGA 2WFCA 3CTFA 1IYHA 3TKSC 3ED3A 2C3NA 4ML6A 5GSTA 4E8HA 3W6GA 4KDXA 3GMFA 1QXHA 1Q4JA 1WMJA 2OE0A 1SL0B 3ZFBA 5J4UA 2LQQA 1GULA 5DQYA 1NHOA 5DQSA 2GS3A 4H86A 1YY7A 3GN3A 4RI7A 5EVOA 2JZTA 2F8FA 3I6AA 4O7HA 1XIYA 2FCHA 4PGTA 1Q98A 2IMIA 3FRCA 5JCUA 2K8SA 2OKAA 3M9JA 1ZL9A 1GTUA 4KNDA 1YEXA 2LKUA 5F06A 3FZ5A 16GSA 4HUAA 1SJIA 2B5YA 4K1FA 3UVTA 3HD5A 3DKSA 1TK5B 4XS4B 2FLSA 2LRCA 4OFTA 3DMLA 5D8IA 3QAGA 1O85A 5JWRB 5D9XA 2H76A 4GWRA 2GQMA 4MJAA 2OACA 3EMPA 5DBQA 4BPYA 22GSA 1EP8A 2H1GA 1K0MA 4TOPA 1OC9A 1JLVA 3VFIA 4OCEA 2LEGA 4JE1A 1O8XA 1SD9A 5KN1A 2H6ZA 4Q5FA 3EC3A 1B9XC 3KH9A 3KMNA 2QGVA 4ZIJA 4FYBA 2KUCA 2FUG2 7GSSA 1EGOA 2H66A 1SENA 4MJCA 1X9WB 3F9UA 2H0GA 2YZHA 3MDKA 1XCCA 5L71A 3QD9A 2C0DA 4IN0A 1OVNA 4P3YB 4EO3A 5C04A 1AQWA 4K0GA 1XW9A 4F2IA 3HA9A 3KCMA 4ULXA 3WYWA 2VCTA 4GLTA 5H5RA 1SKRB 3L78A 2MMNA 5ECSA 4AJ6A 5HR0A 2CAQA 1F3AA 4ZBBA 3O76A 4WBJA 4EDZA 2C4JA 2GDRA 3UL3A 5CAXA 2OE3A 5IMVA 4BL7A 3TKQA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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