2FUG2

Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex i from thermus thermophilus
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
178
structure length
178
Chain Sequence
FFDDKQDFLEETFAKYPPEGRRAAIMPLLRRVQQEEGWIRPERIEEIARLVGTTPTEVMGVASFYSYYQFVPTGKYHLQVCATLSCKLAGAEELWDYLTETLGIGPGEVTPDGLFSVQKVECLGSCHTAPVIQVNDEPYVECVTRARLEALLAGLRAGKRLEEIELPGKCGHHVHEVE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus.
pubmed doi rcsb
molecule keywords NADH-quinone oxidoreductase chain 1
molecule tags Oxidoreductase
total genus 43
structure length 178
sequence length 178
chains with identical sequence B, K, T
ec nomenclature ec 1.6.99.5: Transferred entry: 1.6.5.11.
pdb deposition date 2006-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
2 PF01257 2Fe-2S_thioredx Thioredoxin-like [2Fe-2S] ferredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.1590 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 2fug201
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2fug202
2FA8A 3TJFA 1T4ZA 1EOHA 1WJKA 3TDGA 4HZ2A 4MK3A 3UBKA 1ZOFA 2LRCA 3AY8A 4HU9A 3GSTA 4PUAA 3RHCA 1VRSD 1XWKA 4KX4A 1K0NA 1MDKA 3K8NA 1HNCA 2V6KA 1QMVA 1Z6NA 4F82A 1A2JA 3Q74A 5B6MA 3O6TA 3M8NA 3J7Yb 6GSWA 4HDEA 1AUCA 3EYTA 4QL9A 3D5JA 1GSSA 3D22A 4ID0A 5HQPA 1LBKA 5GAND 4AF2A 5L71A 3RAZA 5B8BA 1SKSB 2H6YA 1J9BA 2VM1A 1GNEA 2PGTA 1ZYQB 3DWVA 5IO2A 2CZ3A 1NHOA 2V1MA 4LA1A 5D73A 1R4WA 3C8EA 4FIWA 3QFAC 1W89A 4GLTA 2P0GA 2H70A 1GSUA 2WDUA 3GTUB 1YKAA 2I4AA 3WGDA 5D8IA 2R4VA 4ZB6A 4KDUA 2JZSA 3Q6OA 2WS2A 2CVKA 5ECIB 5JWRB 4NPBA 1PKWA 3RBTA 2I81A 5JWOB 3ZTLA 2NTOA 2GZPA 3FEUA 4IW9A 3H93A 5COHA 14GSA 2VIMA 4EE0A 3GTUA 3WGXA 3KIJA 4V1Ag 4D73B 4EL1A 1VF3A 1V98A 1U3IA 2JACA 4TOPA 2O8VB 5H5RA 1SKWB 2C1YA 4NV2A 3C7MA 4LLRA 1YEXA 3V1WA 2FLSA 1DUGA 2IPAA 1R5PA 3VPTA 2RLIA 2PMTA 2PPTA 17GSA 3ZREA 1R26A 5KN1A 2VAFA 1TK5B 2EIOA 2N5BA 1SL1B 3MWHA 5D9TA 5G1KA 1JZDA 4JRRA 5B8AA 2AB6A 4OFMA 1NM3A 2XBIA 2PVOC 2B7KA 5DBQA 1EEMA 4MH2A 4L0WA 3IXRA 3WGEA 2R6KA 4PX1A 1R5AA 3P7XA 6GSTA 1GSEA 2HZFA 2QKEA 4KH7A 1SD9A 5B7CA 1YY7A 4FYUA 5ECMB 4KW6A 2YJHA 2VLUA 2L59A 4LMWA 1MD4A 3F4RA 4WR4A 5CRDA 4MZCA 2GVPA 3IAS2 3ZFBA 2LRTA 5JCGA 2PBJA 5GAPD 5G31A 2D2ZA 5H5QA 2CVBA 5D9WA 3IR4A 2LKUA 4NWYA 3EU3A 2MBSA 1TU7A 2HXKA 3DD3A 4OO4A 4JU5A 3IHQA 1YKCA 3F8UA 2FD3A 4PXOA 1VF1A 1T00A 5A4UA 1RW1A 4TR3A 3LJRA 1OE8A 2DJ2A 3IE3A 5HFIA 4K7IA 4ZB9A 3BBYA 4BPYA 1H75A 4YAVA 2F9SA 4N0ZA 4ZILA 3VPQA 1X9WB 5HR2A 2WFCA 4YQMA 2H1DA 2H1BA 2M72A 3UARA 3KP8A 1ST9A 5H5SA 4KA0A 1B4PA 2HI7A 2TRXA 2R37A 1G6WA 1JFUA 3KH9A 4EDYA 5J9CA 2BJXA 2J9HA 4I6XA 3DEXA 1YDKA 2Z9SA 4KAEA 5IMCA 4ECJA 1PGTA 1WE0A 3TJJA 2B7JA 3DIEA 2L57A 2P5QA 2X99A 2IN3A 1Z7PA 5B6NA 5JWQB 4V2NA 1PL1A 4KGIA 2QSIA 1TI1A 2XPEA 1GTIA 4RQXA 3RDWA 3ZMLA 2CVDA 4KUNA 1BJXA 3ZVJD 1V57A 4IP6A 2YZUA 2FWEA 4RI7A 2MYGA 4OMVA 1ZYEA 1SK1A 4KDYA 5IMVA 4XRDA 2IMDA 5EL8A 5CRHA 5AIVA 1U88A 3GSSA 3LGCA 4MPGA 2X8GA 1M2DA 2DMMA 2WRTA 2GTUA 2PWJA 3QAVA 3F4TA 4I2TA 3NOFA 1NW2A 3L0HA 3EE2A 2LQOA 1IYIA 2H6XA 2C3QA 5D9XA 1B48A 3NZNA 5J5NA 2OE1A 2FGXA 3ZRDA 2ON5A 5A4VA 1PKZA 1SL0B 3LFLA 3N5OA 2RUEA 2IJYA 2KP1A 4NHWA 4H86A 4EKZA 1ZL9A 3UVHA 1KTEA 1AQXA 1PD21 4GQCA 3GN3A 2CX3A 2O87A 2WJUA 4FYCA 4IS0A 4Q5NA 2VL2A 3GHAA 4OFTA 1GSQA 4PURA 2IIYA 3LEFA 1GUKA 1NSWA 1XWCA 4K0NA 1EGOA 1B8XA 1OC9A 2HE3A 3WT1A 1F3BA 1K0BA 3GL5A 3VWWA 3HVVA 3BOAA 4JEDA 5AGYA 2K9FA 1OC3A 4NHZA 3P8WA 4PNGA 3GMFA 4L0UA 3L78A 3LQ7A 2VD1A 1ZMAA 1HYUA 3PR8A 2OBKA 1QUWA 5DVBA 5CRGA 1ZZYA 4XS6A 5C04A 1AW9A 2J23A 2GT6A 1X5CA 2YWMA 2VCWA 1CQHA 2C0DA 5DQSA 1V58A 4MJBA 4KNDA 4KDXA 5A4WA 4LMVA 3H1NA 2XBQA 1XIYA 2C0EA 2YWOA 3F4SA 3SWLA 3VI5A 4EC0A 2XHFA 1GLQA 1OYJA 3IRAA 4QL7A 1A0RP 2LEGA 2LJAA 1M2AA 4X1UA 3F9UA 3TOUA 2NBSA 1X9MB 1TJDA 4MF6A 3ERGA 1DE2A 2LV3A 1QXHA 2JZRA 3QFBC 1LU4A 4ACSA 5DALB 3IV4A 2VO4A 1I9DA 1T8EB 1MD3A 2WGRA 3APQA 1G6YA 2FA4A 1YZXA 3FR3A 4OCFA 5GZZB 4IP1A 1OVNA 1F6MC 1WWJA 4MA9A 4NMUA 2WCIA 1XVWA 5ELAA 2LUSA 3EVIA 3BCKA 5KN2A 1AQVA 3EURA 5DCHA 3TRPA 1GUMA 3DVWA 2VM2A 4X43A 4GWRA 3TKQA 4QQ7A 4XRAA 2VL9A 2B1KA 2B3SA 1AAZA 5DDLA 3TKSC 19GSA 3FZ4A 3F6FA 2X64A 5ECPB 2WULA 1SYXA 1PX6A 1ABAA 1EZKA 5G30A 4ECBA 1E6BA 1XWBA 4L5OA 3CTFA 2C3NA 4IHUA 1B4QA 5HFKA 1GSYA 5J41A 5KEJA 3FRCA 3L9UA 1JLWA 1Q4JA 1K0CA 2DJKA 2ZNMA 4ZL8A 4GRFA 4F03A 2KLXA 3GH9A 3M0FA 1T4YA 5DAKB 1GNWA 3FYGA 1DSBA 4GCIA 3IK9A 1F9MA 5IOXA 2QC7A 4IKHA 2VL2C 2H72A 5AISA 4ZIJA 5FHIA 5IMAA 4MP4A 3QOUA 1A8LA 3VWUA 4TR1B 1MDJA 4O7HA 3EC3A 4POLA 5DAKA 4V2LA 5ECRB 2YWNA 3GUSA 1ON4A 4OO5A 3ZYWA 2HSYA 4AGSA 2I1UA 5FWGA 1XXUA 4GSTA 2F3MA 5CO3A 1ILOA 3QMXA 5IMZA 3VI7A 1KBNA 4HJ2A 4PGTA 1ZGNA 4I5QA 3C1SA 4RUVA 1UN2A 1V9WA 2VD0A 3W8SA 3N9JA 4GXZA 2H1GA 6GSVA 4JZQA 2PVQA 4BVYA 1BQ7A 3A2VA 3ERFA 4XS4B 1OC8A 2DIYA 1T1VA 2B5YA 1T7PB 5G5FA 2JADA 3GKXA 3G9BA 1BAYA 2OE3A 11GSA 4Q5RA 1FO5A 1KNGA 3L4NA 3DYRA 4XS1A 1Z7RA 4N0VA 1ERUA 1PSQA 5ECOB 3A2XA 3TB2A 2DJ0A 1O73A 3APSA 3GX8A 3EMXA 3RHBA 1THOA 4FH8A 4ISDA 4XS4A 4K9ZA 4TXVA 3SBCA 2B6MA 2ZCTA 1BG5A 4D73A 1YEPA 3FZ9A 2LSTA 5IPGA 1WMJA 3FHKA 1SENA 1PA3A 4WBJA 4O32A 4HUAA 1TP9A 3US3A 1LJRA 2VCVA 5GSSA 2LNSA 4OD7A 2F8AA 2R2JA 2YNXA 4F2IA 1JHBA 5DCGA 2EC4A 5JCUA 1YJ6A 4AJ8A 3BCIA 1GTBA 5HR1A 4O92A 3I43A 5F07A 1Z6MA 4V2MA 2DIZA 4E8EA 3FK8A 2KOKA 2AAWA 4F9ZA 1X9SB 1TXXA 2H1AA 2CAIA 3GNJA 1K0DA 3Q18A 4IELA 2OACA 3TKRA 1XBSA 3E3EA 2V41A 1FOVA 6GSYA 5IM9A 5CAXA 4OFNA 2YZHA 5KN0A 2NVLA 2P5RA 1EWXA 1X0RA 1JZOA 3TGZA 2LQQA 5F06A 3ME8A 3EU4A 1B9YC 3HYPA 5ECSA 3RPNA 3A5WA 3FZAA 1BYEA 2DC5A 3DVXA 5IMDA 5J4UA 4MJCA 3PINA 2YV7A 4HS1A 2F8FA 1K0OA 3A2WA 1FAAA 5JCWA 3GIXA 1DE1A 3DMLA 1ERWA 2M80A 2PERA 4HJMA 4P3YB 10GSA 1EGRA 1VGLA 3HXSA 3W8JA 3GL3A 5A5KA 4ECCA 2K8VA 3APOA 1T3BA 1Y25A 2HZEB 3M3MA 3D21A 4TVEA 1XWGA 2YWIA 1K3LA 4J2FA 3UBLA 4MJEA 2OE0A 2IL3A 4MABA 2PUKC 2CA8A 4RQRA 1QFNA 2GQLA 2MZCA 2VLVA 1XPVA 2JZTA 18GSA 4L5LA 3OR5A 3GYKA 2L5OA 1A0FA 3KCMA 4EDZA 2VUPA 2KP2A 1PN9A 3U5RE 2HZEA 3LWAA 2LJKA 4FYBA 1HD2A 2GZZA 5LCZA 22GSA 3DXBA 3QR6A 1E2YA 3WT2A 4BA7A 4ULXA 4MH3A 3ZLPA 4MF5A 2HSHA 1YF1A 4DEJA 1TRSA 1Z9HA 5D93A 3TKSA 2V6OA 3HA9A 5ID2B 2I3YA 2GT5A 2L5LA 1U87A 2AYTA 1DBYA 2DLXA 2FWGA 3ERWA 4N10A 1W4VA 1K3OA 2VOCA 5IIZA 4GSSA 2FCHA 4DSQA 3U6VA 1U6TA 1FB0A 1UVZA 4JE1A 3HZ8A 4HI7A 2NDOA 2MMNA 5ID2A 1R7HA 1NHYA 1K0MA 3MNGA 3G7JA 2GLRA 1N2AA 3RPPA 2MMZA 1FVJA 3GRXA 4G10A 4K1FA 3VK9A 2L6DA 1RQMA 1X5DA 1EV4A 2XPDA 3PH9A 4ZXGA 2FY6A 4JR6A 2V32A 2FWHA 2X8CA 2HT9A 3M9JA 1SJ6A 5LNKe 4ZBAA 3FW2A 4WR5A 4ZL7A 4CHSA 4BL7A 2X8HA 3A3TA 5DJMA 5HR0A 2O89A 2LRNA 2ES7A 2NPBA 5J9BA 3EWLA 3I69A 3CYNA 4GTUA 4TXOB 4J56E 1O8WA 2BMXA 2YOIA 3CBUA 2CT6A 3TKSE 4X0XA 3QD9A 1OKDA 4RI6A 5F05A 1M9BA 4E8HA 3CXGA 1G0TA 2YN1A 2CQ9A 9GSSA 2H01A 2CZ2A 5AIXA 3L9VA 2RUFA 2CX4A 2B5EA 1Z5YE 3P2AA 4WF4A 1AXDA 4EUYA 12GSA 3GKKA 1N8JA 3UIWA 4FO5A 2HYXA 2VCTA 1A2MA 5LD0A 1XW9A 1WIKA 2MBTA 2ZUPA 3MDKA 4TW5A 4IQ1A 1KEBA 4PQHA 4TXOA 4DSRA 3VWVA 1WOUA 3P90A 3DRNA 4Z7XA 5ECKB 3TJBA 2GDRA 4JR4A 5DQYA 2MMOA 2YPMA 5CYYA 5G2ZA 2IFQB 5HFGA 2IMKA 1PL2A 3KD0A 3FKFA 5DALA 4Q5FA 3IAM2 5ECQB 3IC4A 2LJRA 3ZIVA 3S9FA 2JSZA 3CRUA 1SJIA 3LG6A 2VCQA 2L4CA 3JCML 2R3XA 3HZ4A 1GP1A 2EIQA 3QPMA 2GSTA 3NIVA 1M9AA 3KMOA 2WB9A 2WZ9A 3M9KA 3GH6A 3VLNA 3CRTA 3GV1A 3F6DA 2IFQA 2VLTA 2C80A 4G19A 3TKPA 4BVXA 1TK0B 4LL1B 2CAQA 6GSXA 2A4VA 2EIRA 3HHVA 4HQSA 5E59A 3UMAA 1XW5A 2E0QA 3ZVJA 2K18A 2C4JA 3KMNA 2V2GA 2DMLA 1EV9A 6GSUA 4NXIA 3UOMA 1TRWA 2LTKA 3KP9A 1OE7A 1K3YA 2C0GA 1AIUA 4KE3A 3HY2A 3KXOA 4V1Ap 3IDVA 2JU5A 4ML1A 4ZBBA 3ZITA 1ML6A 2H19A 3QAWA 1U3AA 1TOFA 3TCOA 4IBPA 3GA4A 2YP6A 3UEMA 4HU7A 2DSAA 1JZRA 2H0HA 3UAPA 1Z3EA 8GSSA 1THXA 3ED3A 2DJ3A 4TR1A 2KUCA 2YANA 1A23A 1TK8B 3KTBA 1MTCA 4MPFA 1HNBA 2L6CA 3FZ5A 1XZOA 1SL2B 4ZB8A 4PNFA 4HQZA 5EY6A 3ZIJA 5HR3A 3FR6A 3UVTA 2H76A 1USBA 4MDCA 1X5EA 3KZQA 1H4OA 1MDIA 4WKWA 4KB3A 3D4TA 1A24A 3IOSA 3E9JB 1XOBA 1GSFA 2H0GA 4POMA 5IQYA 3HJPA 5C00A 4BWQA 3D6IA 4IGJA 5CP1A 1HQOA 5E4WA 5FT3A 1TTZA 1VF4A 1O85A 5INYA 1HNAA 2A2RA 1BX9A 3KH7A 2AJQB 3TUEA 4XCSA 2JSYA 1WP0A 4LL4B 4YQVA 4GQFA 2LS5A 4OWYA 3WD6A 3ISOA 4HZ4A 1UA5A 3TJKA 2DJ1A 3EINA 2OADA 4MF7A 3W6GA 5AN1A 4DVCA 2RM6A 2K8SA 1SJZA 2OA7A 1B9XC 20GSA 3HDCA 4IN0A 2IWTA 3G7IA 1GH2A 4KCEA 2RIIA 3FR9A 2B5XA 1S3AA 3CSHA 2FHEA 5IOWA 2IMFA 3KGKA 4K0GA 1IYHA 3LORA 4TN8A 5IO0A 4K2DA 4GF0A 1F3AA 4YAPA 1XOAA 2C3TA 1F2EA 3BD2A 4GSNA 4MJAA 1GSDA 1M0UA 4POBA 1OKTA 5CRWA 2K6VA 4O5RA 4PQ1A 3D4MA 1GTAA 1GLPA 1ACVA 3I9V2 2PN8A 3CTGA 5G5EA 4YH2A 2E2GA 3IPZA 3I6AA 1SU9A 3CSIA 5EPFA 1JZWA 3H4KA 4ZBDA 5ENUA 4WEYA 3HCZA 1EP8A 2I9HA 3LYKA 1M99A 2A2SA 3KEBA 1PQNA 3TJGA 3DKSA 4I97A 1SK2A 4N30A 3KJYA 4TR4A 1GRXA 2CV4A 3O76A 3CSJA 2H75A 3PGTA 2QGVA 1TI3A 2GSSA 2HNLA 2GQKA 2H66A 1TRVA 3BJ5A 1AQWA 2GQMA 4N11A 2HFDA 1OAZA 4MZWA 3KM6A 2GSQA 2HRNA 1TW9A 1SK0A 4XHMA 1XVQA 1TDIA 4PQIA 3MSZA 4MMMA 5CNWA 4KSMA 4F0BA 5DJLA 3LSZA 3VWXA 2YV9A 3DGQA 2YCDA 5ABRA 1Y6EA 2H73A 1VF2A 3QCPA 1WPIA 5D96A 5IPHA 3HJMA 4MCUA 1I5GA 2PU9C 3R2QA 4AJ7A 1K0AA 1V40A 4IQAA 4EF0A 2TIRA 2BTOT 1M7TA 2FWFA 2C8UA 1FG4A 4PUFC 3F3RA 3O3TA 1RK4A 1ZCPA 5D9VA 3IK7A 3GX0A 1GUHA 1O81A 3C71A 4WF5A 3LXZA 3IBHA 1FB6A 2OJLA 3M1GA 1YF0A 1EEJA 3ZFLA 2R5GA 4XIHA 3H8QA 1WRYA 2OKAA 2E7PA 3ZL5A 3J7Yk 4KSOA 1PMTA 1QGVA 1SYRA 5J3RA 5KN3A 1S3CA 3G7YA 1O6JA 2VCXA 13GSA 2G2QA 1PRXA 4TR0A 1GTUA 3HD5A 1QQ2A 3TRXA 2H6ZA 7GSSA 2E2MA 2H8LA 4POKA 5G1LA 2TRCP 4HEA2 5EVOA 3C1RA 2O7KA 2IMEA 2DBCA 4MZBA 4I8BA 3GFKA 2ALBA 1S3DA 3HVXA 1V2AA 1URMA 4WETA 2B1LA 4IJIA 3ME7A 3UJ1A 16GSA 2ON7A 1UC7A 4ML6A 3GURA 5F8BA 1XWAA 3L9SA 3UL3A 4K6XA 4K8MA 4I2UA 4Q5QA 2AUVA 2O85A 3F3QA 3QAGA 2VL3A 3HJOA 2FNOA 1JLVA 1OC9B 4JBBA 3KTLA 1PX7A 2M46A 1SD8A 4L8EA 1GWCA 3TRQA 3ZZXA 1F37A 4G2EA 1GULA 2H30A 4IVFA 4KCAA 1A8YA 1MEKA 3F63A 1TU8A 1QK8A 5CREA 3TOTA 4J57E 2REMA 5F0GA 4EVMA 1ERTA 3Q19A 2H0IA 4NV5A 3MAKA 3E0UA 2JL4A 2GZYA 2H74A 4DSSB 3VURA 4AJ6A 2N5FA 2C0FA 1G7OA 2IMIA 3HVSA 2AHEA 4WBRD 3IA1A 1O8XA 2G0FA 4WXTA 4MLYA 3VFIA 2H71A 5ECLB 1ERVA 1C72A 2F51A 1XCCA 1J0FA 3H79A 3CMIA 5GSTA 1AC1A 3LYPA 2DJJA 4BWSA 4ZL9A 2N5AA 6GSSA 2MMAA 4K7OA 4NAXA 3FY7A 1G7EA 3HKRA 1O7UA 3D0ZA 4DSSA 4ECIA 1A2LA 2GS3A 4G9HA 1EOGA 3WYWA 1FW1A 2GGTA 3EMPA 2YJ7A 3ZMKA 2XC2A 4EO3A 3QDNA 1J08A 4ILFA 5IMFA 2RM5A 1TKDB 4EXJA 4TRXA 4OCEA 1XW6A 1XFLA 4CDOA 3GKNA 4K7NA 1CQGA 2VCZA 3LXTA 2AV4A 1SKRB 2GSRA 3GKMA 1M2BA 5ECNB 4YQUA 4HOJA 1EP7A 3C73A 4CW9A 2FUG2 4TKYA 1FVKA 5ELGA 4IJ3A 1Q98A 2P31A 1FHEA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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