2FUG2

Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex i from thermus thermophilus
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
178
structure length
178
Chain Sequence
FFDDKQDFLEETFAKYPPEGRRAAIMPLLRRVQQEEGWIRPERIEEIARLVGTTPTEVMGVASFYSYYQFVPTGKYHLQVCATLSCKLAGAEELWDYLTETLGIGPGEVTPDGLFSVQKVECLGSCHTAPVIQVNDEPYVECVTRARLEALLAGLRAGKRLEEIELPGKCGHHVHEVE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords NADH-quinone oxidoreductase chain 1
total genus 43
structure length 178
sequence length 178
chains with identical sequence B, K, T
ec nomenclature ec 1.6.99.5: Transferred entry: 1.6.5.11.
pdb deposition date 2006-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
2 PF01257 2Fe-2S_thioredx Thioredoxin-like [2Fe-2S] ferredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.1590 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 2fug201
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2fug202
1VGLA 1WIKA 3GX8A 3RHCA 4KA0A 3QMXA 5HR0A 1XWCA 2HI7A 2J9HA 4RUVA 1MDIA 1SKRB 3IAS2 3HZ4A 3UVTA 3ZLPA 1TRVA 5IMCA 3W6GA 1I5GA 2GS3A 4X0XA 1R7HA 3DIEA 2VM2A 3OR5A 4WXTA 4NMUA 4TXOA 5CREA 1BG5A 2KUCA 3PR8A 3C7MA 3DRNA 3CSJA 3ZYWA 2X99A 3HKRA 2A2RA 4YAPA 2DBCA 4ULXA 4L8EA 3EU3A 2C3QA 3LORA 1YF0A 1XZOA 3DWVA 3IHQA 4V2LA 1GSDA 2A4VA 1BYEA 1EP8A 4BVYA 5DAKB 2WS2A 1UVZA 5ENUA 1U88A 3PH9A 3WGEA 1LBKA 4L0WA 1F3AA 2PERA 4WR4A 3A2XA 2AAWA 1J0FA 2LNSA 2HSHA 3GKXA 3GYKA 2IFQA 4KH7A 2F3MA 4X1UA 3TJJA 1A23A 4WEYA 2H72A 3P2AA 2BTOT 3DXBA 1AQWA 2E2GA 2YPMA 3LXZA 6GSVA 2A2SA 2OADA 6GSTA 1R5PA 4GWRA 3VI5A 5IOWA 4ZBBA 3UVHA 1KNGA 2C80A 4G9HA 3NZNA 3IA1A 3LQ7A 4XS1A 3MAKA 8GSSA 1S3DA 2RIIA 3H4KA 2EIRA 3KGKA 2PVOC 2OE3A 5H5QA 2MMAA 5DALA 4XHMA 3PGTA 3VLNA 5ECIB 4HQSA 4GXZA 1DE1A 1K0AA 2I81A 5F05A 2YWMA 3CSHA 1QK8A 2H1DA 2YOIA 5GAPD 3CTGA 1TK5B 4KCAA 2I1UA 2CA8A 4GSSA 4ZBDA 2G2QA 1OKTA 4XS6A 1OAZA 4O92A 4PNFA 2YZHA 4KW6A 1GUKA 4G10A 1X5EA 2C0DA 4MH3A 4HZ2A 5D9XA 3SWLA 5IM9A 2REMA 2P5RA 3KTBA 1VF2A 1GSEA 2YJ7A 4IBPA 1V57A 2RUFA 3HCZA 4POMA 1M2DA 3UMAA 1Z6NA 4TR1B 2H76A 5COHA 5D9TA 1IYIA 3IBHA 2I9HA 3ZIJA 5GAND 2VL2A 1YJ6A 2WZ9A 5G31A 1YKCA 1G7OA 3DMLA 1F2EA 3P90A 4V2NA 3IR4A 2GDRA 4HI7A 3D6IA 2KP2A 3FHKA 4IP6A 1GTAA 3H93A 3QFBC 2YANA 2L6DA 5B8BA 2HNLA 1JZWA 2V2GA 2IIYA 1N8JA 1KEBA 3C1SA 1X9SB 2H71A 2P5QA 3N9JA 1Z3EA 4YH2A 4IELA 18GSA 2LNTA 3M3MA 4RQXA 1T1VA 1Z9HA 3HZ8A 3TRQA 4K6XA 4AF2A 2IN3A 3EURA 5ECRB 1TRSA 2IMDA 3KH7A 2B5YA 3L78A 3GNJA 4MCUA 1FHEA 1J9BA 2GSRA 4MF7A 3UEMA 1ZYEA 1EGOA 1SKWB 3TKPA 1Z7PA 1MD3A 3TJBA 2EIOA 2M80A 5AIVA 5A4WA 3P7XA 1FB6A 3KCMA 2OACA 3IDVA 3VWXA 1K0BA 4D73A 5FT3A 3F4RA 4EE0A 3GHAA 4TR4A 1QGVA 3M8NA 3TJGA 5JWRB 3LYKA 2FGXA 2WRTA 4ISDA 1B9XC 2E0QA 5ECKB 1EV4A 3KP8A 4HUAA 5GZZB 5DJLA 2HFDA 2PVQA 2AJQB 4GLTA 3L4NA 1XWAA 1EEMA 1XVQA 3D4MA 2NDOA 3IK7A 2WCIA 4X43A 4YQVA 2NVLA 4V1Ap 5C04A 5HR3A 2BMXA 3UBKA 2VOCA 2LJRA 2JACA 4MDCA 4HDEA 2VIMA 3UAPA 2R6KA 4DEJA 2H66A 1OC8A 2H0HA 5KN2A 5D93A 2MYGA 4GSNA 1K0MA 16GSA 4GF0A 4GCIA 1Q4JA 1EZKA 3FY7A 3UBLA 3NIVA 1O8WA 4F82A 3VFIA 4K0NA 2LJKA 4EO3A 2C0FA 4NV5A 1SK0A 1TW9A 1O81A 4K8MA 1X5DA 2OE0A 2ZUPA 2L4CA 1OC3A 3F6DA 1BEDA 5D96A 4KSOA 2FWEA 4N11A 6GSSA 1G6YA 3VI7A 1SL0B 3O3TA 1SL1B 2VCVA 1PQNA 1NW2A 2CZ2A 2CT6A 4LMVA 2E7PA 2H1AA 4HZ4A 4WETA 4ML1A 3IK9A 3IE3A 4I2TA 2WFCA 10GSA 3F3QA 5HR2A 3IRAA 2H73A 4O32A 1XWKA 1TRWA 2H19A 4KNDA 14GSA 3GIXA 5IQYA 4N30A 4I5QA 4JRRA 1RK4A 1ZGNA 2FLSA 3D0ZA 2NBSA 5DALB 4AJ7A 4OO5A 1AIUA 3IOSA 4WBRD 3TOTA 3HHVA 1XIYA 3PINA 4F0BA 3GTUA 1TU8A 2R2JA 3QR6A 2F51A 3DGQA 4MJAA 1HQOA 1VF1A 2YCDA 1BX9A 1USBA 2BJXA 3TKSA 3DEXA 5LNKe 3ZITA 3WGXA 3U6VA 2VM1A 4LA1A 3QCPA 5ABRA 3APOA 4IN0A 3KZQA 1Z5YE 2B7JA 2N5AA 3HJOA 1F6MC 3ZREA 3Q19A 3L9SA 1PL1A 1ON4A 1URMA 3EMXA 1PSQA 4OWYA 1GWCA 2GVPA 6GSYA 1QQ2A 3KM6A 4TRXA 4L0UA 5G2ZA 2JSYA 1AQVA 2VCXA 2MBTA 5F8BA 3ME8A 4IS0A 3IAM2 2R37A 1YDKA 4JZQA 1G0TA 2LQQA 3APQA 2AUVA 2NTOA 3LSZA 1DSBA 1DE2A 2YWNA 2WJUA 5EVOA 2F8AA 3KTLA 4MP4A 4K7IA 3HA9A 5G30A 3R2QA 1JZDA 3TJFA 1A8LA 3DYRA 5CRDA 1R5AA 5HFKA 4YAVA 5HFGA 3F6FA 4N10A 4IQ1A 2GLRA 1U87A 2HRNA 1TRUA 3TJKA 2RLIA 3VWVA 3WD6A 4MJBA 13GSA 4NWYA 1GNWA 2MMZA 2GT6A 4DSSB 2X8CA 2OJLA 4EVMA 4KB3A 5INYA 2HXKA 1JZOA 3LFLA 1GULA 2FCHA 3W8SA 2O8VB 1GTIA 2O85A 1OE7A 4QQ7A 1FOVA 4POKA 1ZMAA 2L5OA 4HJMA 2WGRA 4FYUA 5FWGA 1TK0B 1C72A 3E0UA 1JLWA 3RAZA 2KHPA 3TKSE 2VD1A 4HJ2A 3RPNA 4JR6A 5B6MA 1PX7A 3HVVA 1XW9A 1GSYA 2PGTA 4ECIA 2ON7A 3TCOA 2PWJA 1AAZA 2VCZA 3KP9A 7GSSA 5AGYA 4D73B 2QC7A 1TOFA 3GSSA 2B5XA 2LKUA 1OE8A 5JWQB 1SYXA 4KCEA 1VRSD 2GSQA 3BCKA 2EC4A 1O85A 1Y6EA 2TRCP 2LUSA 1K0NA 2IMEA 3A3TA 2WULA 2XPDA 4RQRA 3FR3A 2GQMA 2GT5A 2LTKA 1GTBA 4K9ZA 5LCZA 3C8EA 2DJ0A 1SU9A 2H0IA 5J3RA 4TKYA 4F9ZA 1SKSB 6GSWA 3KH9A 3KMOA 1FB0A 3VWWA 2FWHA 1XOAA 3FKFA 4JE1A 3TOUA 1I9DA 1FVJA 1CQGA 4KDUA 3MDKA 5ECSA 5J41A 1OVNA 3ZIVA 3EC3A 1R26A 3KD0A 1B9YC 2V6KA 2C3TA 2YZUA 2VL2C 1EV9A 3ZZXA 1GNEA 2O87A 2OE1A 1XVWA 2PUKC 2LRNA 4TOPA 1K3YA 2XBIA 4RI6A 1GLPA 2IL3A 5CRGA 3QAVA 1ERTA 5J9CA 2K9FA 2L57A 4O5RA 5F06A 3FZAA 1BAYA 3EWLA 2PBJA 2WB9A 4DSRA 2K8VA 4EUYA 1GUMA 1TI1A 2CVBA 1PD21 5IO2A 1OYJA 2C3NA 3JCML 3QAGA 3TRPA 5AISA 3GKNA 2GSTA 1K0CA 1PMTA 1ST9A 4ML6A 19GSA 3QPMA 2H1GA 1GRXA 11GSA 4KDYA 1NM3A 3BBYA 2YN1A 1WOUA 1A24A 1A2MA 4H86A 2PMTA 4BWQA 2O89A 2IPAA 2ZNMA 4BPYA 4I6XA 1ZZYA 3D5JA 1M0UA 5ECMB 3HDCA 3EVIA 1YZXA 4FYCA 3UJ1A 4DSSA 1HNCA 2JADA 3UARA 1W4VA 3CBUA 1O7UA 1LU4A 3M0FA 1R4WA 3CRTA 1G6WA 4PXOA 4ECJA 3GTUB 2P0GA 3GH9A 1GSQA 4EKZA 1U3IA 1TTZA 3EMPA 5AIXA 3TGZA 1GH2A 4N0VA 2G0FA 1MTCA 2AYTA 2WDUA 1PKWA 1M9BA 4NHWA 2HT9A 1B4PA 1TU7A 2C4JA 2CQ9A 4LL1B 3KMNA 1T4YA 2LQOA 2GZZA 1ERUA 1WRYA 3N5OA 2NPBA 2JSZA 3KEBA 1A2LA 3ZFBA 1ML6A 2DJJA 4QL9A 3GH6A 3G7JA 4FIWA 5B8AA 1F3BA 3FZ9A 3VPTA 5G1KA 1HD2A 4LLRA 5EPFA 1GTUA 3MWHA 2GTUA 1PRXA 2DJ1A 2KLXA 3KXOA 4LMWA 1WJKA 6GSXA 3ISOA 2JL4A 1XWGA 3A5WA 5JCUA 4IJIA 5IMZA 2GGTA 5ECHB 2VLTA 3APSA 2D2ZA 2H8LA 3EU4A 5C00A 3ZFLA 4OFMA 4GTUA 1M99A 1A0FA 1ABAA 1NHYA 3KJYA 3UOMA 2FA4A 1Z6MA 1Q98A 1XCCA 1VF4A 3DVXA 3A2VA 1A2JA 2RM6A 4NV2A 2ON5A 1O6JA 3HYPA 2LV3A 1ZYQB 3GX0A 4ZXGA 1PN9A 1XW5A 3NOFA 4JEDA 4LL4B 3US3A 1RW1A 4ID0A 1XBSA 5ECOB 3BCIA 2E2MA 2K8SA 3QAWA 4NHZA 5DBQA 1V98A 4IHUA 3O76A 4ACSA 4GRFA 4K2DA 1AC1A 1V58A 3DKSA 1QMVA 1GP1A 5JWOB 2I4AA 3LWAA 1KBNA 3TUEA 3IV4A 4I8BA 3TDGA 4G2EA 4FH8A 2VLVA 3I6AA 3LG6A 5ECPB 4FYBA 3HVSA 4P3YB 3FRCA 3EINA 2MZCA 3GKKA 3CXGA 1PKZA 3H8QA 1WWJA 3LXTA 4J57E 1LJRA 4NPBA 1PGTA 2M72A 1FO5A 2LJAA 1ERWA 4ECBA 2JU5A 1UC7A 1N2AA 4CW9A 1YKAA 3WT2A 3J7Yb 5KEJA 3IC4A 4BVXA 5HR1A 4OMVA 3IPZA 1W89A 3ZTLA 3TB2A 1EEJA 2JZSA 1JFUA 3TKSC 2ALBA 3LGCA 5CO3A 3TKQA 2RUEA 1AUCA 1TP9A 3CMIA 3ZVJA 3DVWA 3O6TA 2MMOA 1E6BA 4XRDA 4ZB9A 3FR6A 4NAXA 1SK2A 2HE3A 1UA5A 3M9KA 5KN1A 1PX6A 4PX1A 2QSIA 4MJEA 3CTFA 3WYWA 4PQIA 4PQHA 3RPPA 5F0GA 1FG4A 3LYPA 4HU7A 1FAAA 17GSA 3FEUA 2MMNA 4GQCA 1T4ZA 4XCSA 4EDYA 2MBSA 4E8HA 1TJDA 1B4QA 4WR5A 1EGRA 3IXRA 4OD7A 1K3OA 3S9FA 1ERVA 4OFNA 2VUPA 2JZTA 3CYNA 3MSZA 4BL7A 1SK1A 4XRAA 5J9BA 3RHBA 4PGTA 4F2IA 2DIZA 5ELAA 1IYHA 1WE0A 1RQMA 5IMVA 2VAFA 4L5LA 4BWSA 5IPHA 5HQPA 2L59A 4PUFC 3GRXA 4I2UA 5IMAA 4YQMA 4IKHA 4MF5A 1J08A 2QGVA 5H5SA 2OA7A 1XFLA 1THOA 1XWBA 1U6TA 3Q6OA 4KX4A 1ZOFA 4GQFA 4PNGA 4MK3A 3FZ5A 5KN3A 2IMFA 3WGDA 3QD9A 1B48A 1GSFA 2FUG2 1NHOA 2HZEA 4PURA 5D73A 2I3YA 5D9WA 3RDWA 1T3BA 4PQ1A 3Q74A 1SENA 3TKRA 22GSA 4ZBAA 4KDXA 2IMIA 2VCQA 1DBYA 4KE3A 2GQKA 3GUSA 4EL1A 5DQYA 3BD2A 2DSAA 2LRTA 5A5KA 4HOJA 4J56E 5D9VA 3SBCA 3BOAA 3ME7A 2RM5A 3MNGA 2PPTA 2L4QA 2OBKA 2V1MA 2YNXA 2CAQA 2TRXA 2CV4A 4KGIA 2AB6A 5CAXA 4TVEA 1Y25A 4ZL8A 1H75A 4EF0A 5DCHA 5CRWA 3HJMA 2V6OA 4MA9A 5IMDA 3G9BA 1SD9A 3C71A 3I69A 5LD0A 1E2YA 4POLA 1QFNA 4XS4A 5GSTA 2K18A 1V9WA 5GSSA 1SL2B 2AV4A 4Z7XA 3FK8A 3HVXA 4NXIA 5ELGA 1QXHA 1WP0A 4KUNA 3M1GA 2DMMA 4JBBA 2CAIA 2VD0A 2H6ZA 2H70A 3LEFA 2FHEA 2CZ3A 3F8UA 2H6YA 1SJIA 1HNAA 2VL9A 2QKEA 2N5BA 2AHEA 3LJRA 2XPEA 2GZPA 1H4OA 3D22A 3HJPA 3HY2A 2CX3A 1OC9A 4ZB6A 4TR0A 5CP1A 3AY8A 2XBQA 4Q5RA 3HXSA 1XW6A 2H74A 1YEXA 1X0RA 3H1NA 3D4TA 4Q5QA 1GL8A 5ID2A 3GSTA 2B6MA 1V40A 2B7KA 2P31A 2J23A 3K8NA 1F9MA 1EOGA 4MPGA 3ZRDA 4K7OA 4KAEA 3C1RA 2LS5A 2DMLA 5IPGA 1X9WB 4BA7A 3DD3A 3VPQA 3L0HA 4MF6A 20GSA 2LRCA 3U5RE 5IO0A 2L5LA 2C0EA 2XC2A 1JHBA 3ERGA 4ZL7A 3G7YA 5J4UA 4GSTA 4AGSA 9GSSA 3Q18A 4EDZA 2VCWA 3QOUA 1OKDA 5EY6A 1TK8B 3A2WA 4PUAA 2F9SA 3I43A 2HYXA 3ZMKA 5EL8A 4E8EA 4G19A 4MABA 3RBTA 4OCFA 2CX4A 3F4TA 2B3SA 4ILFA 1GSUA 3GL3A 4MH2A 1YF1A 1AXDA 4MMMA 2X8HA 1O8XA 4Q5FA 1XXUA 3F4SA 2HLSA 2DJ2A 2HRFA 1X9MB 5E59A 2DC5A 5L71A 2K6VA 4QL7A 2KOKA 3ERFA 1QUWA 2V41A 1DUGA 3ED3A 3W8JA 4K0GA 2L6CA 2FY6A 2CVDA 3FZ4A 5A4UA 1UN2A 2N5FA 1FVKA 4JU5A 2PU9C 2LSTA 2DJ3A 2FNOA 3CRUA 3GA4A 4Q5NA 4CHSA 1NSWA 2B5EA 1WMJA 1TXXA 3FYGA 2O7KA 2C1YA 1PL2A 3FR9A 4TXVA 4DVCA 4FO5A 4K1FA 3BJ5A 4MZWA 3QFAC 2YP6A 4ZB8A 1G7EA 2IWTA 3GURA 5F07A 4IJ3A 5DAKA 1SJ6A 2X8GA 3VK9A 1U3AA 1B8XA 1KTEA 4KSMA 3ZVJD 5DDLA 1X5CA 1K0DA 3J7Yk 2IMKA 4V2MA 2ZCTA 1T7PB 4ZL9A 4HS1A 1YEPA 4K7NA 3UL3A 1XOBA 2GSSA 1JZRA 4HEA2 4HU9A 3ZMLA 5D8IA 3EYTA 3GKMA 4IQAA 5ECNB 4OFTA 4N0ZA 3E9JB 5IMFA 1Z7RA 5H5RA 2M46A 2R4VA 4MZBA 4XIHA 3GV1A 1O73A 2KP1A 4IGJA 2VO4A 4EC0A 2HZEB 5CNWA 4F0CA 5KN0A 4HQZA 1K0OA 3CSIA 4MJCA 4DSQA 1EOHA 1TDIA 2FWFA 4V1Ag 2GQLA 1CQHA 4F03A 2YV7A 1MEKA 3ZL5A 5DVBA 6GSUA 2IJYA 4XTSA 3F0IA 4TXOB 1PA3A 3GL5A 2LEGA 2YWOA 4J2FA 2PN8A 1XPVA 1SYRA 5IOXA 1A8YA 2C8UA 3F63A 3F3RA 3L9VA 2C0GA 5G5FA 1SJZA 4ZIJA 2DLXA 3P8WA 5JCGA 1GLQA 4OO4A 3I9V2 3VURA 1FW1A 2VLUA 4MLYA 4TR1A 4WBJA 4TR3A 1AQXA 3GMFA 2H01A 2R3XA 3G7IA 2XHFA 2DJKA 1EWXA 4XS4B 4WF5A 2CVKA 2H6XA 2B1KA 4I97A 2X64A 1MD4A 2ES7A 4TW5A 1JLVA 1S3AA 1MDKA 1YQ1A 3EE2A 1V2AA 3GN3A 2IFQB 4WKWA 5B7CA 3L9UA 4WF4A 5JCWA 1AW9A 4AJ6A 5CRHA 3UIWA 2FA8A 1A0RP 5ECQB 2R5GA 2FWGA 4IVFA 1ILOA 1TI3A 5IIZA 1S3CA 4EXJA 5CYYA 1GSSA 1BJXA 1OC9B 2JZRA 3V1WA 1M2AA 2VL3A 1BQ7A 1ZCPA 2H75A 5DJMA 1TKDB 5J5NA 1GUHA 2Z9SA 12GSA 4RI7A 5B6NA 1VF3A 1ACVA 3VWUA 4L5OA 1T8EB 1HYUA 2H0GA 3QDNA 2YJHA 5ID2B 1THXA 2TIRA 5E4WA 3GFKA 3M9JA 3KIJA 5DQSA 2F8FA 4YQUA 5G5EA 5AN1A 5HFIA 4O7HA 2EIQA 1WPIA 4POBA 1M7TA 1HNBA 4CDOA 2VCTA 1SD8A 1F37A 3HD5A 3E3EA 4IP1A 3TRXA 1ZL9A 2HSYA 3WT1A 2YWIA 1T00A 1YY7A 2V32A 3ERWA 2OBIA 2H1BA 4TN8A 2HZFA 5FHIA 4MPFA 2FD3A 4JR4A 2B1LA 2YV9A 3H79A 5A4VA 2DIYA 3C73A 5DCGA 4ZILA 1M2BA 1M9AA 2H30A 4AJ8A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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