3I9V2

Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex i from thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/asu
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
178
structure length
178
Chain Sequence
FFDDKQDFLEETFAKYPPEGRRAAIMPLLRRVQQEEGWIRPERIEEIARLVGTTPTEVMGVASFYSYYQFVPTGKYHLQVCATLSCKLAGAEELWDYLTETLGIGPGEVTPDGLFSVQKVECLGSCHTAPVIQVNDEPYVECVTRARLEALLAGLRAGKRLEEIELPGKCGHHVHEVE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
publication title Structural basis for the mechanism of respiratory complex I
pubmed doi rcsb
molecule keywords NADH-quinone oxidoreductase subunit 1
total genus 46
structure length 178
sequence length 178
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.6.99.5: Transferred entry: 1.6.5.11.
pdb deposition date 2009-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
2 PF01257 2Fe-2S_thioredx Thioredoxin-like [2Fe-2S] ferredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.1590 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 3i9v201
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3i9v202
2GLRA 10GSA 1TP9A 4XRDA 3GTUB 3S9FA 1UVZA 2J23A 2F8AA 3EVIA 3GKXA 1TI3A 1YF1A 2X99A 4FIWA 4MLYA 2C3TA 2X8GA 4OFNA 4NHZA 2FWHA 4D73A 5DCGA 3QDNA 5IM9A 4RI7A 3G7YA 4V2MA 3M0FA 3NOFA 2O87A 5IOXA 3CRUA 4QL9A 3FR3A 2MMNA 5DQYA 5H5RA 5J41A 3BOAA 3H93A 3HVSA 4L5LA 3ZIVA 5F05A 1K3OA 4OD7A 2GZPA 1XWCA 2FLSA 1K3YA 4KSOA 4PNGA 1PL2A 3LYKA 3KMOA 4TW5A 2RLIA 4K7NA 1VF3A 1MTCA 5IO0A 3GKNA 4YAVA 4MZBA 4GSNA 1ZOFA 3GTUA 4XTSA 3ZVJA 2L5LA 1DBYA 1LU4A 1O8XA 1GSDA 3TUEA 3G7JA 2L59A 1G6WA 2MMAA 4DSSB 3WT1A 1GWCA 4Q5NA 2LRNA 4HQSA 3HKRA 4POBA 4K7OA 3LEFA 3QPMA 2CVBA 2PUKC 3HVXA 4F03A 4WXTA 1O81A 2PBJA 1ZMAA 3WGDA 4MK3A 1X9SB 3I69A 3L0HA 1XWKA 2ZNMA 4DSRA 2PVQA 3IV4A 4MA9A 2VD1A 1SU9A 2IWTA 4I97A 1MDJA 5CRDA 4TR4A 3KCMA 4ZB8A 3GFKA 1IYHA 2NDOA 2RIIA 3ZZXA 3DRNA 2X8HA 4G9HA 3W8JA 4GXZA 4ZILA 1GLPA 1SK0A 5A4WA 1K0CA 1SD8A 2B3SA 1EWXA 5ECPB 2OE3A 3O6TA 2HZEA 2YPMA 5ECKB 5G5EA 2H8LA 4EUYA 5HQPA 2JSZA 3E9JB 4PXOA 2CZ2A 3IA1A 2GZYA 5LD0A 3IXRA 3FYGA 4K8MA 2AV4A 3L9SA 1TJDA 4OWYA 3APQA 4MF6A 5IMZA 1K0AA 3K8NA 3FRCA 1GSFA 3RHCA 3ZLPA 1Q98A 4QQ7A 1YEPA 3TRPA 2VAFA 5CRWA 4LL1B 5ABRA 1AQXA 4N10A 4IN0A 3EC3A 1KTEA 2N5BA 4JRRA 2IMFA 4K9ZA 1OC9B 2E2MA 3PR8A 4AJ6A 3H4KA 2LSTA 1FG4A 3HJPA 1ERTA 4HU7A 2MBSA 1FW1A 1Q4JA 2YJHA 3CBUA 4FYCA 2H66A 4EL1A 1ACVA 4I6XA 3WYWA 3KD0A 2IIYA 4TR0A 3RPPA 3J7Yb 2LS5A 3CTGA 2HNLA 3IK9A 2IL3A 5D96A 5D9TA 3JCML 4QL7A 6GSTA 1M9BA 3F4RA 1OE8A 3VI7A 14GSA 1M0UA 3TKPA 4KAEA 5DVBA 1ERUA 2JU5A 2M72A 1OC9A 5D93A 1CQHA 1VF4A 1YEXA 3Q19A 3MAKA 4XS6A 2V2GA 3QAWA 2CX3A 2DJ3A 4YQVA 5CP1A 4GQCA 2TRCP 2R3XA 2H71A 2KHPA 2R5GA 12GSA 2KUCA 2I81A 5KN2A 1PKWA 3P7XA 1Z7PA 2PERA 2FGXA 5KN3A 3DMLA 4NHWA 4X1UA 3L9VA 1FHEA 4IP6A 5KN0A 5HR2A 3UVTA 1GSQA 3EWLA 4WR4A 4HOJA 2FUG2 4YH2A 4I2UA 4O92A 4GCIA 3HVVA 3EYTA 2B1KA 2DC5A 4KB3A 3I43A 4JZQA 2H19A 4MPGA 4ILFA 1A2MA 5F07A 3TJKA 1TI1A 2YCDA 4KA0A 4Q5RA 3LG6A 5DJMA 4KUNA 1B8XA 2LEGA 3BD2A 4FYBA 4EDZA 2R2JA 2PWJA 1GTIA 6GSUA 2PU9C 4JR6A 3KP9A 1R4WA 1SYXA 2WS2A 1X5CA 4K6XA 4X0XA 3LFLA 1FO5A 2M80A 1R5PA 1THOA 1TOFA 2OE1A 2WCIA 3US3A 4PQHA 2VCQA 3O76A 2VLUA 1VF1A 4NAXA 1ON4A 2KLXA 3FZAA 2XPEA 1GL8A 2ON7A 4GWRA 2VM2A 3IRAA 3KMNA 3TJFA 2YZUA 4J57E 1WE0A 5J5NA 4MMMA 4XS4B 5DBQA 3RPNA 4I2TA 1AW9A 3W8SA 3D4TA 5E59A 1NHYA 4ZBBA 4H86A 4TN8A 3UBKA 4KDXA 3U6VA 5E4WA 4ML6A 1ERWA 1TRUA 2NPBA 3MSZA 5G1LA 5FWGA 5IMDA 2LRTA 3NIVA 4Q5FA 3IHQA 3APSA 3TB2A 2DLXA 2L6CA 4IHUA 2H74A 4JEDA 1MDKA 5IIZA 2BJXA 2YJ7A 4HQZA 2L4CA 2H72A 1HNAA 3KH7A 4K0GA 1NM3A 1V9WA 3DVWA 1V2AA 4IQ1A 2NVLA 4MH3A 4XS4A 1G7EA 1SJ6A 1PD21 2FY6A 1GSSA 1JLVA 4ZXGA 1M2DA 2VCVA 1RQMA 2RUFA 3A2VA 1J0FA 1HNCA 3GYKA 3D22A 1YZXA 2EIOA 1TRSA 4PNFA 5GAPD 2YOIA 4E8HA 5EL8A 2B1LA 4PGTA 2E2GA 2Z9SA 20GSA 1OKTA 2HI7A 1GUKA 3KH9A 5HR0A 2OA7A 5HFKA 4MJBA 3KJYA 5F06A 3P2AA 1DE1A 3RBTA 4MJCA 2FWEA 5ECSA 1ZZYA 1EOGA 5B7CA 4ECCA 1KBNA 2G2QA 3UJ1A 1XVWA 4KDYA 3GKMA 1X5EA 2R4VA 4O5RA 3ZMKA 1FB0A 1XBSA 1ML6A 1K0NA 2HE3A 3G7IA 1EV9A 1W89A 5ID2A 3FZ4A 3ZITA 1PGTA 2DJKA 2ES7A 3DEXA 3EMXA 4AF2A 1A8YA 4XRAA 2XBQA 5IOWA 1A8LA 4KX4A 3CTFA 5G5FA 4IJIA 2ON5A 1SKRB 4NXIA 3BCIA 4CW9A 2LJRA 5AISA 3D4MA 3TJGA 3EINA 4N11A 2YWMA 2NBSA 3PH9A 1M9AA 4NV5A 5EVOA 4E8EA 3HA9A 1V40A 2H76A 3HDCA 4CHSA 4N0ZA 1XFLA 2A2SA 3TGZA 2H0GA 2WGRA 3PGTA 1OC8A 1HYUA 3UVHA 3WGEA 1BJXA 2WJUA 2IMKA 3QD9A 3TKSE 6GSWA 1YY7A 2V41A 5JWOB 2YANA 4BVYA 3GL5A 3KTBA 2B7KA 3IBHA 4G19A 2JACA 3WD6A 1S3AA 4ECJA 6GSYA 1M99A 3QFBC 2L4QA 3EE2A 3EU4A 4V1Ap 4F0BA 4L0UA 1JZRA 1OVNA 4HEA2 4LMWA 3CMIA 3RDWA 1FB6A 2IFQB 2JL4A 2RUEA 1KEBA 1VF2A 5J4UA 2P31A 4K2DA 3RHBA 1WPIA 4KNDA 3WT2A 4ZIJA 1K0BA 1GSUA 1PKZA 2CX4A 1JZDA 4ZL8A 1QXHA 2WDUA 3I9V2 1FVJA 3KM6A 4CDOA 2I3YA 2H0HA 1GSEA 1X9WB 3TRQA 1SJZA 5ECRB 4WBRD 4J2FA 6GSVA 4ZBDA 2QSIA 2HRNA 3UMAA 3LSZA 1SL2B 3C7MA 1GTAA 1U3AA 3TJBA 2H6XA 1T00A 2HLSA 4RI6A 4J56E 3LXZA 3HJMA 1K3LA 1B9XC 2VCZA 3VFIA 2MMOA 1AXDA 4MP4A 4GLTA 2VL3A 1TK5B 3UAPA 4GTUA 3EU3A 1TTZA 2H30A 1X9MB 1GNEA 2IFQA 2DJ2A 5GSSA 2GQMA 1A23A 2LUSA 3PINA 2DJJA 4MABA 2H01A 4I5QA 2TIRA 2CQ9A 1TRWA 4HU9A 3IR4A 3M9JA 2J9HA 2FWGA 3FZ5A 2REMA 4DSSA 3IOSA 3TJJA 2VCWA 1I9DA 4WBJA 2R6KA 3EURA 5IMCA 4AJ7A 3CYNA 4F9ZA 4MJAA 5A4UA 1GRXA 4N0VA 3F4SA 2P5RA 4L5OA 2PN8A 1U88A 3M8NA 3RAZA 3NZNA 1JLWA 4F82A 3ZIJA 1B9YC 2KOKA 3KGKA 3CRTA 2B5XA 3TKSC 4X43A 2WZ9A 2GQKA 1M2BA 2HZFA 1YQ1A 4PX1A 3VI5A 1Z6NA 3M3MA 2L57A 3F9UA 3UL3A 2K18A 1NSWA 1R5AA 4PQ1A 3C1SA 4DSQA 2C8UA 1DUGA 5KEJA 3O3TA 2C0DA 4YQMA 2HXKA 1YKAA 2CZ3A 4OO4A 3LORA 2V1MA 4MF7A 2KP1A 1X5DA 3HCZA 4XIHA 3VWWA 4AGSA 1OYJA 1XIYA 3TKQA 3GKKA 4LA1A 4PQIA 5IPHA 1M7TA 2IMDA 4ACSA 1KNGA 3SBCA 1SD9A 1NW2A 2YWNA 2OJLA 1TXXA 4HZ2A 2HSHA 4PURA 5EY6A 1V98A 2WRTA 3C71A 2XPDA 5D9VA 3ERFA 4V2NA 2C0GA 2OE0A 1DE2A 1SL0B 1UA5A 2H1BA 2EIQA 2BMXA 2F8FA 4FO5A 2O8VB 2GQLA 1WWJA 4BA7A 2C3NA 3GHAA 1V58A 4N30A 3FEUA 1HQOA 6GSSA 3TKRA 2DMLA 2JZTA 5B6NA 1EEMA 4EVMA 3H1NA 1ERVA 3HZ4A 3LXTA 5ECMB 2PMTA 5J9CA 3FHKA 4P3YB 4RQXA 4PUAA 1JZWA 3L4NA 1BAYA 2P0GA 4ZB6A 3HZ8A 1A2JA 3LJRA 1LBKA 4OCFA 3D6IA 2YZHA 2P5QA 3GA4A 1G7OA 1B4QA 1GULA 1T3BA 3EMPA 2LJAA 5F8BA 1SENA 5B8AA 5DAKB 3ZFBA 1ZL9A 9GSSA 3BJ5A 4MCUA 1WJKA 3BCKA 2AB6A 1TW9A 5B6MA 2L5OA 3KP8A 4TKYA 2MZCA 2MYGA 2CA8A 3C8EA 3GH9A 4MF5A 3A2WA 4EXJA 5DALB 1EGRA 4XHMA 6GSXA 3QCPA 2OBIA 1F3BA 4ML1A 2DIYA 3D0ZA 4KDUA 1JZOA 1VRSD 2ZCTA 4TOPA 4EO3A 1G0TA 1NHOA 2AHEA 11GSA 3QMXA 5G31A 3ISOA 5A4VA 3IAM2 3DXBA 1I5GA 5DQSA 1BG5A 1F6MC 2EC4A 1UN2A 4POKA 4BL7A 3QFAC 4WKWA 2H6ZA 2GDRA 2V32A 4FYUA 3CSJA 2GSRA 1K0DA 1LJRA 1HD2A 2JSYA 1BX9A 4OMVA 1GTUA 2VL2A 3VWXA 5HR1A 1ZYEA 2AYTA 5G1KA 4IJ3A 2A4VA 5DAKA 5CRHA 3E3EA 19GSA 4IQAA 1T4YA 1AUCA 2X8CA 1OE7A 1X0RA 4DVCA 2H1AA 3HD5A 5ECNB 3GRXA 1Z5YE 4GSTA 2YN1A 1HNBA 5DALA 4PUFC 2LV3A 2F3MA 4TR1B 3IDVA 4HS1A 4KW6A 2O85A 4Z7XA 2V6KA 2B5YA 1PX6A 4DEJA 3QR6A 2O89A 3GH6A 1O7UA 5GZZB 4GSSA 3L9UA 2OBKA 3HY2A 2PVOC 3DVXA 1RK4A 3KXOA 4HI7A 4IBPA 2H70A 1Y6EA 1PL1A 3TKSA 4POLA 3IAS2 4KCAA 4NV2A 3VPTA 5ECIB 2IJYA 2B7JA 2LNTA 5ECHB 5FT3A 1IYIA 1TRVA 2DMMA 2LNSA 2VIMA 3ME7A 4HDEA 4TR1A 3UBLA 5LNKe 1BQ7A 3ERGA 4NWYA 4JR4A 1O8WA 5IMAA 2K9FA 5C04A 3F3QA 1Z6MA 5D9XA 2WB9A 1FVKA 5CNWA 4D73B 3GURA 1PMTA 3ERWA 1RW1A 1EV4A 3LQ7A 3MWHA 2AAWA 1PN9A 1PRXA 1J9BA 2HSYA 1U87A 2XC2A 3VLNA 1OC3A 1GUMA 3F63A 1UC7A 2LJKA 3UARA 5ECQB 1SKWB 1YKCA 2N5FA 1AAZA 1QUWA 3Q74A 1XW6A 5HR3A 3IC4A 5B8BA 3L78A 4BWSA 5DJLA 2OKAA 2JADA 2GSTA 1ZYQB 5INYA 4KCEA 1A0FA 1Y25A 4GF0A 4WR5A 2F51A 2M46A 1F9MA 2HRFA 1R26A 2YV9A 5C00A 1F2EA 1TK0B 3MDKA 1URMA 5ELAA 2LQOA 1H4OA 2VOCA 4OCEA 2DJ0A 4TR3A 1E2YA 5D9WA 5CYYA 2HT9A 2QGVA 1MEKA 5JCUA 3KTLA 3DKSA 3HJOA 5CREA 5IQYA 1F37A 1YJ6A 2MBTA 3F0IA 2K8SA 2FWFA 1QFNA 4OFMA 1Z3EA 2GSSA 3R2QA 3P90A 2DBCA 5IMFA 1EEJA 3VWUA 4ZL7A 3DWVA 3LYPA 4WEYA 3HXSA 2PPTA 1QMVA 2I1UA 4BPYA 1PQNA 2HZEB 4ZB9A 4TRXA 3FW2A 1XCCA 5GSTA 3FR9A 3TRXA 3QAGA 3BBYA 2R37A 1U3IA 5ECOB 1OAZA 2C4JA 2BTOT 3D5JA 2WFCA 4ECBA 1WOUA 4ECIA 3FR6A 5FHIA 3VWVA 1J08A 5CAXA 4KE3A 4RQRA 2VL2C 1QGVA 1XW9A 2C0EA 4NPBA 2LRCA 2GS3A 5AIXA 2I9HA 3V1WA 2FA8A 1E6BA 3F6FA 1WP0A 4ZBAA 1XPVA 1XVQA 3KEBA 3LGCA 3HYPA 3J7Yk 4XS1A 1GTBA 3KZQA 4YAPA 1A24A 1ILOA 2OADA 1SKSB 1VGLA 3GIXA 2GSQA 2GGTA 4GRFA 5IPGA 3G9BA 4Q5QA 1ST9A 5IMVA 3GL3A 3GSSA 2H1GA 1C72A 1FAAA 1AC1A 2FA4A 2JZSA 2AUVA 2QKEA 5HFGA 4ISDA 4MDCA 4BWQA 5DDLA 4K7IA 4F0CA 3FZ9A 3A2XA 2ALBA 5EPFA 3ZVJD 2I4AA 2OACA 3QOUA 3KIJA 4BVXA 2A2RA 1O85A 1TU7A 5CO3A 22GSA 3U5RE 3H79A 4KH7A 2H73A 1ZGNA 2E7PA 2IPAA 1MD3A 4KGIA 3E0UA 4RUVA 1G6YA 2H0IA 4JU5A 5JCGA 2H6YA 1TDIA 3N5OA 2VL9A 4LLRA 2TRXA 3FKFA 2FCHA 3N9JA 4TXOB 2H75A 3OR5A 3CXGA 4HJ2A 5F0GA 2X64A 3CSIA 5IO2A 1GUHA 1T8EB 3ME8A 1XZOA 3DGQA 1T1VA 1EOHA 3A5WA 2H1DA 4O32A 2MMZA 4LMVA 2DIZA 3GX8A 2RM6A 2F9SA 4XCSA 2KP2A 2LKUA 4FH8A 3F8UA 1AQWA 4POMA 3GMFA 1YDKA 2YWIA 2O7KA 3TOUA 3VURA 1GNWA 1XWGA 1SK2A 2N5AA 2FNOA 1PSQA 1SK1A 3AY8A 3Q6OA 4IS0A 4ULXA 4WETA 3Q18A 1K0OA 5JWRB 1H75A 2C3QA 5A5KA 2B6MA 2VO4A 1M2AA 1S3DA 5G2ZA 3GSTA 4EE0A 4TXOA 1XWBA 1GSYA 2VLTA 3ED3A 2VD0A 1BEDA 1XWAA 3GN3A 1O73A 17GSA 4K0NA 4WF4A 1GLQA 4G2EA 5GAND 2CVDA 5H5QA 4I8BA 5JCWA 1AIUA 1SL1B 4MH2A 3WGXA 2GT5A 5KN1A 1MDIA 3VPQA 3ZREA 4WF5A 1BYEA 1S3CA 4ID0A 2CAQA 2GVPA 16GSA 2XHFA 2XBIA 4L0WA 2NTOA 3APOA 3ZTLA 1R7HA 4NMUA 1T4ZA 1A2LA 1K0MA 2CV4A 1N2AA 5D8IA 3TCOA 5JWQB 2D2ZA 4IGJA 1TU8A 3TOTA 3UOMA 1WMJA 2RM5A 3QAVA 3UEMA 2C0FA 3M9KA 1EGOA 4IP1A 4G10A 2LQQA 1N8JA 4EDYA 4JE1A 4OO5A 4TXVA 13GSA 5ELGA 1B4PA 1XW5A 18GSA 3VK9A 1PX7A 3F4TA 3SWLA 3P8WA 5G30A 3FK8A 2VUPA 1ZCPA 2WULA 1T7PB 1MD4A 1XXUA 3GV1A 3DIEA 3HHVA 1EZKA 3CSHA 3H8QA 4KSMA 2K6VA 4IW9A 1DSBA 2C1YA 2DJ1A 4LL4B 1PA3A 1JFUA 5ENUA 1GP1A 1QQ2A 2FHEA 3GX0A 2HFDA 1WRYA 1WIKA 2JZRA 5L71A 4HUAA 2IMIA 3DYRA 1EP8A 2E0QA 5H5SA 4IELA 1GH2A 2GTUA 3ZL5A 3F6DA 1THXA 2AJQB 4MZCA 1USBA 4AJ8A 1TKDB 4K1FA 1V57A 2YNXA 1XOAA 4YQUA 4JBBA 4V2LA 2G0FA 5J3RA 2IN3A 7GSSA 1TK8B 3M1GA 5AN1A 3LWAA 4EF0A 2HYXA 4F2IA 8GSSA 2V6OA 3F3RA 4IKHA 2L6DA 3IK7A 2YV7A 1SYRA 4O7HA 1W4VA 2K8VA 5LCZA 2YWOA 2PGTA 1XOBA 1O6JA 4TVEA 4OFTA 1Z9HA 1JHBA 3TDGA 4HZ4A 3IPZA 5J9BA 1FOVA 5COHA 2C80A 5CRGA 4L8EA 3MNGA 2DSAA 1AQVA 3ZMLA 4EKZA 2CT6A 5HFIA 3IE3A 3DD3A 3W6GA 2CVKA 5ID2B 3C1RA 2VM1A 1B48A 3A3TA 2EIRA 4EC0A 1YF0A 2GT6A 2QC7A 5DCHA 2VLVA 2B5EA 4ZL9A 3I6AA 4MJEA 2ZUPA 4IVFA 4HJMA 3GNJA 2IMEA 3ZFLA 3UIWA 1F3AA 3C73A 1OKDA 1SJIA 2GZZA 1U6TA 3ZYWA 5AGYA 4MZWA 1EP7A 2YP6A 2LTKA 2VCXA 1A0RP 1CQGA 3FY7A 2VCTA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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