4HEA2

Crystal structure of the entire respiratory complex i from thermus thermophilus
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
178
structure length
178
Chain Sequence
FFDDKQDFLEETFAKYPPEGRRAAIMPLLRRVQQEEGWIRPERIEEIARLVGTTPTEVMGVASFYSYYQFVPTGKYHLQVCATLSCKLAGAEELWDYLTETLGIGPGEVTPDGLFSVQKVECLGSCHTAPVIQVNDEPYVECVTRARLEALLAGLRAGKRLEEIELPGKCGHHVHEVE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the entire respiratory complex I.
pubmed doi rcsb
molecule keywords NADH-quinone oxidoreductase subunit 1
molecule tags Oxidoreductase
total genus 45
structure length 178
sequence length 178
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 1.6.5.3: Transferred entry: 7.1.1.2.
pdb deposition date 2012-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
2 PF01257 2Fe-2S_thioredx Thioredoxin-like [2Fe-2S] ferredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.1590 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 4hea201
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4hea202
9GSSA 4MH2A 4EKZA 3ZLPA 2VLUA 5HR3A 4AJ7A 3ZZXA 2IMEA 3L9UA 4EXJA 5C00A 2LJRA 3G9BA 2OJLA 3HY2A 4K0NA 2ES7A 4WR5A 5IPGA 1M9AA 2JADA 1HNBA 1GNWA 1U3IA 3IC4A 1XPVA 3UAPA 3C71A 4YQMA 2HXKA 3TJFA 3I6AA 6GSXA 4PURA 1TRWA 5CRGA 1PL1A 2MBSA 1G0TA 2OE1A 2GTUA 1A23A 5EVOA 1B9YC 5LNKe 3JCML 3E9JB 1TRVA 3GIXA 1T00A 3F0IA 4DSSB 3F6DA 2R3XA 4L0UA 4KDYA 3VWVA 2K18A 4WF4A 2CV4A 2GT6A 2HE3A 2MMZA 4MJBA 4L0WA 1CQGA 4MABA 2KOKA 6GSSA 4ZBDA 2PERA 3FEUA 2K9FA 4EO3A 4EL1A 1X5DA 1YJ6A 2WULA 4GQFA 3D0ZA 4OO5A 3P7XA 3EWLA 1TK8B 2V32A 4MJAA 4G19A 4BL7A 4KDXA 3BD2A 3LG6A 1UA5A 3M0FA 4EVMA 3ME7A 2B7JA 4HQSA 3QAGA 4KAEA 1XOBA 2IJYA 2H76A 2TRXA 18GSA 2I4AA 3QCPA 3EVIA 1R4WA 1QFNA 2YWNA 2KP1A 4XIHA 3QDNA 1RK4A 5DBQA 2GSQA 1YEPA 2LRTA 3WGEA 4XRDA 4MPGA 4YQVA 2JSYA 3ZVJA 1SD9A 2EIQA 3UMAA 4KNDA 5E4WA 2CA8A 2RIIA 2WS2A 3DD3A 2FHEA 5D96A 3GN3A 3VI5A 2VCQA 2OBKA 1MD4A 4PXOA 2H72A 3DIEA 1B8XA 2E2MA 2K8VA 1Q98A 2VO4A 5GSTA 1FVJA 2C0DA 1U87A 2RM5A 2GVPA 2GS3A 2F3MA 1HD2A 3FHKA 1R5AA 1VF3A 4PQIA 4MZWA 5HR0A 1YKAA 2IMDA 4KDUA 4E8EA 3PINA 5AISA 3CTGA 4WKWA 5GSSA 3RPNA 1B48A 3EE2A 3D5JA 1OC9A 5LCZA 1S3AA 2BTOT 3A5WA 3GMFA 4J57E 4NPBA 5ECPB 4KH7A 2IMFA 1X9SB 3LEFA 3IBHA 5H5SA 2PVQA 4Q5RA 4IVFA 4ZILA 3KXOA 1X5CA 1OC8A 5J41A 4MMMA 1FOVA 1CQHA 1OC9B 1O8XA 4XS1A 3A2VA 1X9WB 2GSTA 2LS5A 4XCSA 1EWXA 2N5BA 2B7KA 1PSQA 4N0VA 3UVTA 2KHPA 4K9ZA 3TOUA 2FUG2 1ZL9A 1F9MA 2B5XA 1GTIA 4TVEA 1MEKA 1K3LA 3C7MA 4FH8A 3LGCA 3DMLA 2YZUA 5KEJA 2OADA 5H5QA 3CRUA 4AJ6A 6GSVA 2PU9C 3GKXA 5AN1A 2FD3A 2H71A 4MK3A 1EV4A 5AGYA 2DC5A 1ZZYA 4O32A 2DIZA 1OC3A 1OKTA 5ECHB 2MYGA 2H01A 1XWCA 3UVHA 5CAXA 1UVZA 3NOFA 2AB6A 3IK9A 1QQ2A 1Z9HA 1WIKA 3EYTA 4LL1B 3I69A 4CHSA 2PVOC 1XWAA 2XPEA 5EY6A 1K0OA 4EC0A 2YV9A 5G2ZA 2N5AA 1EP7A 1J08A 2VCZA 4AJ8A 2JZTA 1AC1A 3LXZA 3DGQA 3GL5A 1ON4A 3TKPA 1AQXA 2C4JA 3TKQA 4ECBA 1T4ZA 3HXSA 3RDWA 3EINA 3AY8A 4NWYA 5JWQB 2L6DA 3H79A 1GRXA 2I1UA 4TR1A 1BJXA 2VUPA 1XW9A 2YANA 1O85A 3GH6A 3M9JA 1K0CA 2BMXA 1FVKA 2LNSA 1JZWA 3BCKA 1TRUA 2YP6A 1XVWA 3IPZA 5IPHA 3QAWA 2L5LA 2HSHA 1TTZA 5ENUA 3VK9A 3U6VA 3U5RE 5DVBA 3L4NA 2PUKC 4TXOA 3KP8A 3TJJA 4YAPA 3TB2A 2DLXA 2HZEA 3GH9A 3F63A 1GULA 2KP2A 4OMVA 3D4TA 2VLTA 3HDCA 2QSIA 5A4UA 4KGIA 5HR2A 2RUFA 2WGRA 5J9CA 3KIJA 5JCGA 4F03A 2HZEB 1M7TA 4IELA 4ECJA 4Q5QA 1SK1A 2P31A 2XPDA 1OE8A 3HVVA 4WR4A 3D22A 4HUAA 2IPAA 1A2MA 4V2NA 2VCXA 2O85A 5F8BA 3GSSA 1KNGA 4ML6A 3M9KA 2PGTA 1YF0A 4MF7A 4MLYA 4K8MA 2LKUA 4TN8A 5CRWA 2H1GA 1JLWA 1ZOFA 3P90A 6GSYA 2XHFA 3D6IA 2HRFA 4G9HA 5G1LA 3I43A 4GF0A 1EOGA 2R5GA 1G6WA 2GDRA 2HYXA 1A2JA 2IMIA 5ECIB 1PKZA 1LJRA 3HJMA 5HQPA 2R2JA 4MZBA 1WJKA 1GUKA 2F8FA 4WBJA 2AV4A 5DALB 4AF2A 4KX4A 2CZ3A 2DSAA 3WGXA 4E8HA 1XBSA 2DJJA 1E2YA 1F6MC 4OWYA 12GSA 5IMFA 4NAXA 2JL4A 5HFGA 2R4VA 3QR6A 4RI7A 4OFTA 4ZL8A 1M2BA 3G7IA 3L9VA 5B8BA 1A0RP 2GZYA 3IDVA 2DJ3A 3HVSA 3GKNA 2ON5A 4GSNA 5B6NA 3ZIVA 1GSEA 4BVXA 3ERFA 2H75A 1V98A 2F9SA 1PRXA 1GNEA 2PN8A 3KGKA 3E0UA 2D2ZA 1EV9A 4V2LA 1QGVA 4MJEA 1QUWA 2NBSA 3GRXA 1S3CA 1B9XC 4OD7A 1A8YA 5CREA 1N8JA 5ECOB 3C1RA 2LEGA 2YCDA 4PQHA 2QGVA 5F06A 5AIXA 4ZL7A 2CZ2A 1PQNA 2YJ7A 1MDKA 5B8AA 3KMNA 4MP4A 5DJMA 2R37A 3EU3A 4JR4A 5E59A 5DCHA 3CSJA 5J9BA 1ZYQB 3LXTA 2DJ1A 2L4CA 3HD5A 5EPFA 2RLIA 4DSSA 2ZCTA 1GSFA 2OA7A 1X5EA 2H19A 1WP0A 1GTAA 2X64A 4O7HA 5CYYA 2LNTA 5KN0A 4GXZA 3UJ1A 2JZSA 5ECSA 4Q5NA 1I5GA 2CVKA 3TRXA 1GTBA 3VPQA 4XS6A 2WCIA 3KJYA 4ZB6A 4LA1A 1Z3EA 5G5FA 5ELAA 2V6KA 1EP8A 1NHOA 5D9WA 3GA4A 5ABRA 1XWKA 1GSDA 3H8QA 2B5EA 4POKA 1C72A 3KH7A 1PX6A 1M99A 2C0EA 1F2EA 4KB3A 3ZTLA 3M3MA 2QC7A 2CX4A 3F4RA 5ID2B 1FW1A 1Y6EA 2B1LA 1OVNA 2E0QA 2YN1A 1O8WA 4OFNA 4JEDA 4LMVA 1HQOA 2LSTA 2WDUA 3MDKA 2HI7A 2GZPA 2JACA 1QXHA 3PGTA 3IRAA 3VLNA 5CP1A 3D4MA 4XRAA 2E7PA 3GKMA 1ABAA 1PMTA 4BA7A 2F51A 2X99A 2IMKA 3MWHA 1GSUA 1FAAA 1GSYA 4JZQA 1XOAA 3FR6A 2HSYA 2H0HA 3N5OA 3GX8A 3ZL5A 4IP6A 3ZITA 4GWRA 4ML1A 2PBJA 1SK0A 1J9BA 1F3AA 3RHCA 2DJ2A 2TIRA 4K0GA 3TUEA 2VCVA 1SL1B 4HJMA 6GSWA 5EL8A 4RI6A 4POBA 4NMUA 4YQUA 3ZVJD 3DVWA 2GQKA 1BG5A 2H74A 16GSA 3W8SA 2V6OA 5FWGA 3RBTA 4HZ4A 3GURA 4PQ1A 4WF5A 5IIZA 1K3YA 1SJIA 5D73A 2G2QA 5JWOB 5D9TA 4J2FA 1YY7A 2ZNMA 5D8IA 1GP1A 2XC2A 4IKHA 3ZIJA 3P8WA 1XWGA 3US3A 3IHQA 1SJZA 3UEMA 3GTUB 1A8LA 4FIWA 4IJ3A 3FZ4A 2VM2A 3SBCA 1URMA 3TJKA 4P3YB 3UARA 3TOTA 5ECNB 5A4VA 3GL3A 5FT3A 1KTEA 3ISOA 2HT9A 3M1GA 2YZHA 4OFMA 4KCEA 1FB0A 5CRDA 2NPBA 4GRFA 2LQQA 2VAFA 3VPTA 2WB9A 3ZMLA 1K0BA 2B3SA 2M80A 5ECLB 3EURA 2LRCA 3C73A 5DAKA 2VCWA 2LJKA 2IFQA 5IMAA 5A5KA 1G7EA 4N11A 3FR9A 1W89A 4NV5A 4ILFA 3VURA 5ECRB 1ERWA 2H66A 4HEA2 2GSSA 1KBNA 1T1VA 5DAKB 3KMOA 1V58A 2LRNA 4BWSA 19GSA 3O6TA 1BYEA 1K0NA 4PUAA 2IFQB 1YQ1A 2FWHA 3HJOA 1VF1A 1PL2A 1QK8A 2FWEA 4N0ZA 4RQXA 2O7KA 3GKKA 2OKAA 5DJLA 2C0GA 4I2UA 4G10A 1XW6A 3S9FA 3O3TA 11GSA 2H1DA 5IMZA 2LUSA 4TW5A 5CO3A 13GSA 1O73A 3IA1A 2CVBA 1EGRA 3GYKA 1UC7A 2VD1A 2XBQA 4IW9A 4F0CA 4RQRA 5DCGA 1VRSD 4OCEA 1GUHA 2VL2A 2QKEA 1GUMA 1AUCA 1X9MB 1WWJA 4K1FA 4KCAA 4WEYA 3F4SA 4LMWA 3KD0A 4HQZA 3KTLA 1V2AA 3M8NA 1K0MA 5COHA 4HU9A 3A2WA 2LV3A 2HZFA 4KSOA 2L5OA 1SJ6A 2MMOA 1JLVA 3BOAA 5G30A 1VF4A 1ZGNA 3WT1A 3QFBC 4ID0A 4GLTA 3QMXA 1Z7PA 4HOJA 2IN3A 5IOWA 3ERWA 2NDOA 2H1AA 2CAQA 5G5EA 2OACA 5CNWA 4QL7A 5F07A 4XTSA 4GSTA 1ML6A 4V1Ap 2FA4A 3GV1A 2G0FA 2VL2C 1WRYA 4EE0A 1AAZA 3GFKA 2H70A 2K6VA 3EC3A 4I97A 2EIRA 1TOFA 3KP9A 3FYGA 3UBKA 4HDEA 2FGXA 4ZBAA 3TJBA 1WOUA 2L57A 1PA3A 2MZCA 4MJCA 1XW5A 3F6FA 5KN1A 4FYCA 2LTKA 3FR3A 2MMNA 3WT2A 3GNJA 1M9BA 2WJUA 4DEJA 1YF1A 5B7CA 4N30A 3DXBA 2EIOA 4J56E 3LORA 3VI7A 4D73A 3MSZA 4HZ2A 1ERUA 3UBLA 4GQCA 4MCUA 4EUYA 1PGTA 5IO0A 5DALA 2HFDA 4D73B 3ZMKA 3ZRDA 3F8UA 3IXRA 1F37A 3A2XA 1FG4A 4TXVA 3ME8A 2J23A 1JZOA 3APQA 3GHAA 3KM6A 2V41A 1M0UA 5JWRB 17GSA 1YKCA 3HCZA 5IO2A 2C80A 4I8BA 3TGZA 3WGDA 2H1BA 2DIYA 3CXGA 3K8NA 2AUVA 3LJRA 1TP9A 2DMMA 2X8CA 4PUFC 2C0FA 2GGTA 5JCWA 4ZL9A 1R5PA 2OBIA 3LYKA 3F3RA 2YPMA 2OE0A 1TK0B 3N9JA 1E6BA 2YWOA 1EGOA 3O76A 1Y25A 1MD3A 2CT6A 2VLVA 5HFIA 3BBYA 1BQ7A 2FWFA 2DJKA 5AIVA 1SKWB 1ERTA 4XHMA 2AAWA 4HS1A 2C3TA 5IMCA 3H93A 5FHIA 1A24A 2R6KA 2YOIA 2FCHA 2FNOA 2L59A 1NM3A 3VFIA 2I81A 3BJ5A 3P2AA 3EMPA 4IJIA 2KLXA 4WXTA 3QD9A 3IE3A 4F82A 1HYUA 3F9UA 2FY6A 5LD0A 5G31A 1QMVA 3GSTA 3CRTA 4CDOA 5D93A 1Z7RA 2H6YA 3GUSA 4V2MA 3CTFA 2OE3A 4F0BA 3ZYWA 4I2TA 8GSSA 4NHWA 1MDIA 4IS0A 2FLSA 3DVXA 1EEJA 3LSZA 3ED3A 1SYXA 2YJHA 5INYA 4KW6A 1A0FA 1HNCA 1YEXA 4I5QA 4MH3A 1OE7A 1EZKA 3PH9A 4TR4A 1TI1A 3LYPA 4IHUA 1VGLA 5C04A 4WBRD 4FYUA 1DUGA 2EC4A 4ACSA 14GSA 3J7Yk 10GSA 5J3RA 3CSIA 2P5RA 5ID2A 2V2GA 3QPMA 4N10A 4X1UA 3LFLA 5CRHA 3FW2A 5GZZB 3HKRA 2O89A 3IK7A 3IOSA 4ZBBA 2DMLA 4K6XA 1ST9A 2ZUPA 2I3YA 4FO5A 5G1KA 1PKWA 3J7Yb 2NVLA 5HR1A 3LWAA 2A2SA 3TDGA 1DE1A 3WD6A 4TRXA 1ILOA 1SL0B 4L5LA 2VL9A 4OO4A 1NHYA 1XWBA 4IGJA 1AW9A 1FHEA 3HA9A 1T7PB 1TXXA 3EMXA 1AIUA 2IIYA 4NV2A 1W4VA 1H4OA 3FKFA 2VM1A 4MA9A 4MPFA 1RQMA 4H86A 4HU7A 4EDYA 3FY7A 4L8EA 1THXA 1PD21 2KUCA 2AYTA 2GQLA 4MZCA 1X0RA 5L71A 2C1YA 4PNGA 6GSTA 2K8SA 1DE2A 4JBBA 2M46A 3HZ4A 1IYHA 1WPIA 2B6MA 2DJ0A 4LLRA 3UIWA 2PMTA 3Q74A 2VOCA 4YAVA 2JZRA 3VWXA 3C1SA 4F2IA 1Q4JA 3L78A 1DSBA 2BJXA 3UOMA 5IQYA 4BPYA 4YH2A 4TOPA 1H75A 2JSZA 4MDCA 4WETA 1J0FA 1XIYA 1GL8A 1LBKA 2C8UA 3ZREA 3H1NA 1U3AA 2HLSA 3CMIA 1EOHA 1PX7A 3UL3A 2CX3A 2C3QA 1ZYEA 1TRSA 3GTUA 4JRRA 1XCCA 3C8EA 3F4TA 1LU4A 3APSA 3E3EA 3NZNA 1G7OA 2RM6A 4CW9A 3GX0A 2X8GA 2N5FA 2XBIA 4QL9A 1N2AA 1SK2A 1SKRB 1GLPA 3H4KA 1WMJA 3KTBA 1RW1A 2VCTA 3IV4A 5ELGA 4F9ZA 4I6XA 5DQYA 1TDIA 4ZB8A 1M2AA 3WYWA 4ULXA 1USBA 4RUVA 1XFLA 2CAIA 3KH9A 1U88A 1SENA 1TU8A 1OKDA 4EDZA 3D21A 4O92A 4IBPA 5ECQB 4MF6A 1M2DA 3TKSE 3FZAA 1R7HA 1O6JA 5HFKA 2YV7A 3PR8A 1TJDA 1F3BA 2H30A 4V1Ag 5D9XA 1EEMA 1T8EB 4EF0A 3MAKA 4ZB9A 3VWWA 2CVDA 5KN3A 1NSWA 1GTUA 2I9HA 4LL4B 5KN2A 2TRCP 2YNXA 1V9WA 3FZ9A 1YDKA 4NHZA 5IM9A 3EU4A 3TRQA 2L6CA 4IN0A 2B5YA 1T3BA 4HI7A 2H73A 2VL3A 3SWLA 4HJ2A 1K3OA 2HNLA 4PGTA 1HNAA 5A4WA 5DDLA 2GT5A 5GAPD 1IYIA 2MBTA 3BCIA 2ON7A 1ZMAA 3CYNA 1FO5A 2M72A 1B4QA 2E2GA 1O7UA 2Z9SA 1AXDA 3Q6OA 4GSSA 1VF2A 2LQOA 3QOUA 1T4YA 2GZZA 3CSHA 3DWVA 1GWCA 4PNFA 4KA0A 1OAZA 2GLRA 3DEXA 3IR4A 3I9V2 3FRCA 3L9SA 4K7IA 1GH2A 5J5NA 3HYPA 2DBCA 3Q18A 2B1KA 2VIMA 4L5OA 3DKSA 1XXUA 1Z5YE 4TR3A 1WE0A 1SL2B 1BX9A 4DVCA 2GQMA 20GSA 2H0IA 5F05A 4IQ1A 1Z6MA 4IQAA 2PPTA 2FWGA 3F3QA 4JE1A 3IAS2 4IP1A 4TKYA 3TKSA 5J4UA 5F0GA 2H6XA 4KUNA 1A2LA 2WZ9A 7GSSA 1TU7A 1B4PA 1JZRA 2A4VA 1JZDA 1TW9A 2P5QA 3HVXA 2HRNA 2C3NA 5ECKB 2REMA 4NXIA 4Q5FA 2H0GA 1ERVA 3HZ8A 4POMA 1NW2A 1V57A 2WFCA 4Z7XA 3DRNA 4TR1B 3VWUA 1KEBA 4ISDA 4GTUA 3G7YA 1XZOA 2GSRA 3NIVA 5IMDA 1S3DA 2O8VB 2IL3A 4OCFA 2O87A 3A3TA 1BEDA 1SD8A 4DSQA 4PX1A 3V1WA 2LJAA 3DYRA 2V1MA 4G2EA 1JHBA 1G6YA 2WRTA 5IOXA 2MMAA 3TCOA 5JCUA 1GSQA 1Z6NA 5B6MA 2YWMA 4TXOB 3KCMA 1V40A 1U6TA 1OYJA 3OR5A 1AQVA 4JR6A 4ZXGA 3TKSC 1UN2A 3CBUA 4ZIJA 4DSRA 3KEBA 5IMVA 4K7OA 2A2RA 3RPPA 2ALBA 3TRPA 1R26A 5H5RA 3HJPA 3ZFBA 1TKDB 2FA8A 4O5RA 2YWIA 3QFAC 3R2QA 2RUEA 3RAZA 4QQ7A 1MTCA 2F8AA 1TK5B 2JU5A 1PN9A 2IWTA 3L0HA 2L4QA 3RHBA 4GCIA 1XVQA 3LQ7A 3W6GA 4BWQA 1K0DA 1DBYA 3TJGA 2VD0A 1YZXA 3FZ5A 1THOA 2PWJA 5GAND 1GLQA 1SYRA 3HHVA 5ECMB 1SKSB 1BAYA 1ZCPA 4AGSA 2J9HA 5D9VA 4ECIA 3ZFLA 1AQWA 2P0GA 1ACVA 2NTOA 3IAM2 4X0XA 3ERGA 2AHEA 5DQSA 3W8JA 4XS4A 4POLA 1TI3A 3FK8A 4K7NA 4BVYA 1K0AA 4X43A 2H6ZA 4ECCA 3MNGA 3QAVA 4K2DA 2CQ9A 1O81A 4KE3A 4XS4B 4TR0A 22GSA 6GSUA 3G7JA 3TKRA 3Q19A 4JU5A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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