1HSJA

Sarr mbp fusion structure
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
487
structure length
487
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALAAAQTNAAAEFMSKINDINDLVNATFQVKKFFRDTKKKFNLNYEEIYILNHILRSESNEISSKEIAKCSEFKPYYLTKALQKLKDLKLLSKKRSLQDERTVIVYVTDTQKANIQKLISELEEYIKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription/sugar binding protein
source organism Escherichia coli
publication title Crystal structure of the SarR protein from Staphylococcus aureus.
pubmed doi rcsb
molecule keywords FUSION PROTEIN CONSISTING OF STAPHYLOCOCCUS ACCESSORY REGULA
total genus 143
structure length 487
sequence length 487
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-12-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF12802 MarR_2 MarR family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 1hsjA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1hsjA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1hsjA01
2FSWA 1IXSB 2XHKA 5J8CA 4LMYA 2HEUA 3EF7A 2MH9A 1U3EM 3N97A 3ZMSA 3EDPA 1K7AA 4QSCA 4MLQA 3R0AA 1BIBA 4XSZF 2F5DA 3BFTA 3HUGA 1BOAA 4WXJA 5L8DA 4U1ZA 4ASNA 3IJXB 4IO2A 2KIMA 2RN7A 1B5IA 3K00A 2PT2A 4P0GA 4DLDA 4KIBA 4BH9A 2FOKA 3FXUA 2HFBA 2JPBA 3HO7A 3TZAA 2HXWA 1SD5A 4I09A 2I4CA 3RUMA 3IX1A 2VBZA 2XXRA 4C1UA 2L01A 3FJ7A 3CVGA 3VDFA 1AOYA 5EYFA 3T9VA 1MY0A 3IWZA 3PUXE 1DPRA 3I58A 4LG0A 2P6SA 1S29A 1E2XA 3ZQ7A 3MVWA 3OEMA 5DCFA 4BXUA 3ZSFA 2F36A 4M6XA 4BDOA 3DKWA 5EEHA 2GH9A 5JFRA 3E5XA 1XS5A 5BWJA 3I6VA 1B51A 5EHSA 3K2ZA 3F21A 5I56A 2RC4A 2RC8A 1UCRA 3FM5A 1FOKA 2W24A 3E5UA 1Z1DA 4YIFA 2O68A 3IKTA 5L3FA 2HQRA 3GFIA 1LDDA 2OK2A 2QS1A 3GLBA 3IRRA 3TODA 5JEIA 4M9SA 2VD2A 2EV0A 1M5DA 5CBSA 1XB4A 1MXWA 3BOQA 2HQ0A 3TCHA 5BPIA 5DEXA 1LCFA 1BN5A 2Z5UA 2IA0A 3K69A 2XD2A 1KQ9A 1FQEA 2O1MA 5K2YA 4OENA 4XSXF 5DD4A 4OIRF 5H8NA 5I2KA 4HQMA 4FECA 2UZKA 3F3XA 2QS3A 5KZTA 1H43A 2QWWA 1B3HA 5TU0A 4FX4A 3C36A 4OFLA 3GW2A 3UIFA 2YPNA 3CSGA 1LDJA 4GXOA 4H0EA 2DP8A 1ZREA 5AIPA 1NH8A 4TOZA 4MF3A 3RPQA 1REPC 2Y7RA 2ZYOA 1UIVA 4LQ5A 1ODDA 1MDP1 5ILVA 2B65A 3VXCA 2ZMEB 1FC3A 4BHBA 3L9FA 2H5YA 3K2DA 4YICA 1SYHA 3LSTA 2JSCA 4I0AA 2F6PA 2I4BA 2W84A 4ELPA 4ZYDA 3FMRA 5FTHA 3U2RA 1WODA 3UORA 1QQIA 4EGZA 4IB2A 1YO5C 2ZYNA 2I3VA 3ZKKA 1TQMA 4PDKA 4JB7A 1MQJA 3T66A 5KDTA 1XD7A 3LA7A 1QUIA 2COMA 4ENMA 1URSA 4KR5A 4DXBA 5H6QA 3I54A 4L9JA 4Q5SF 4YZZA 2FBKA 2A5SA 4HS7A 3QK6A 3IWFA 3N26A 1UTBA 1I1GA 4R6HA 3E3VA 1CB6A 1WWXA 3HSFA 3T93B 2F8DA 2DSFA 1PBQA 5LOMA 2Y7WA 3KEIA 3U8QA 1B3GA 2ELHA 1FT9A 3PMVA 4NF5B 3FVKA 2MLGA 4KICA 2DI3A 3SEVA 3O6IA 2QS2A 2HQNA 2Z3YA 4BHPA 1OR7A 2WV0A 3DQVC 4OU0A 5ITPA 1WQ2A 3V89B 1N0TA 2BYVE 1U78A 5HS8A 1BI1A 5L3CA 4TQUQ 3TO9A 1SD7A 2DXYA 2RGVA 3JTGA 3Q25A 1NFTA 4JWYA 2HYFA 2FQ3A 1OIBA 1RNLA 3CLOA 5DVJA 2F7AA 3BPXA 3P9CA 1L3LA 3ML6A 5IAIA 3TOAA 2FA7A 2OAZA 3MVXA 5CJ9A 2HOEA 1XC1A 3DP4A 4KMFA 1R23A 2FE3A 3CSBA 1XCBA 4NF8B 2IVMA 4BQAA 3O3KA 2PBWA 1POTA 2VBXA 2VC1A 2BGCA 3K6VA 3TCFA 5HM4B 3L7WA 2VP1A 1N7WA 1B3EA 3H92A 5FFZA 2UXAA 2PX1A 1FX7A 2EFWA 1U2WA 1B46A 4ESFA 1DTGA 4H5GA 3I59A 4OETA 1SFEA 1LNWA 1CGPA 4EQQA 1QZZA 3T8TA 3RT8A 2FBHA 5FHMA 2ADUA 4ZYHA 5KVRA 3G3FA 5H8FA 2STTA 3O6HA 2VT3A 3RTFB 1O7FA 5FGMA 1LEAA 5D4SA 4LUBA 4CXFA 2QS4A 4KCDA 4N07A 2IP2A 4G94A 5HPQA 1B59A 1B2HA 4UV9A 5ICGA 1Y0UA 5D5VB 2GQQA 2F97A 4R75A 4HZFA 4LZ8A 5D4RA 4U4SA 1XMKA 5K5OA 3HHFA 2O61A 2F34A 4HV5A 4LP2B 2JZYA 2HR3A 2EFPA 3IR1A 3GFMA 3DXJF 3DP8A 3QPHA 4RB3C 4JSDA 2EV6A 4KYWA 2A6HF 2STWA 2DQVA 6PAXA 4PCQA 3LA3A 5LLQA 4QFOA 1IN4A 5H8SA 1AOVA 4P9FA 1QPMA 1B9MA 2H99A 3MZYA 3C3WA 1SW5A 4R1HA 4DXUA 1TWYA 1B3FA 4K3FA 4HCWA 1SVXB 2NAZA 3L09A 1LJ9A 3OO7A 1GR2A 1NNFA 1R9LA 4HLXA 1N3XA 1MM6A 3FHZA 4FIMA 2O7UA 3KP3A 5JHUA 3W6KB 1XOCA 2ZJ2A 2DXRA 1MG1A 2XXIA 3V7RA 1YTYA 1IXIA 1IXHA 1Y3NA 2DO7A 4OQOA 3F22A 1DPPA 5A5XB 3OD7A 2HTSA 3QP5A 1MXVA 5ERIA 4F3PA 3PU5A 2F5FA 4UACA 4OEVA 2Q88A 3RIRA 4MTDA 3MC2A 1TTYA 3DLNA 2L02A 3HTSB 3T96B 3EUHA 1QNTA 1A40A 4GD5A 3ABTA 4PP0A 1BJAA 1Y9UA 4H1XA 3QXMA 3S9LC 1MXXA 4ETSA 2IJLA 3O6GA 1RYXA 1V4RA 1H45A 1QZYA 4U22A 1KU3A 4HV6A 5LEKA 2Q8JA 4NF4A 2CQKA 1SW4A 4KD5A 4A0ZA 1FSEA 1BLFA 5D8KB 3K6WA 3CFXA 4Q0CA 2LAOA 5M2VA 5TJJA 1YPNA 5DUIA 3CO7C 1OLAA 1UTHB 3ROUA 4IY6A 3SEWA 1OLCA 2Z8EA 1XGNA 4IRHA 1MQHA 2ONRA 1STZA 4RGXA 1USSA 3LC8A 1P4XA 3OO9A 4DQ2A 2GAUA 1RKMA 1SQYA 4P0IA 1U5TA 5AA4A 1B4ZA 4DNCA 3GFLA 1R6ZA 3SEYA 4IRGA 3R7XA 4EDPA 4LZ7A 1B7ZA 1B3LA 2XX7A 4JSOA 3HRSA 4MLVA 1Z7ME 2H6BA 3EYIA 3CG3A 1CF7B 1R1NA 2XXPA 3PGFA 4I8CA 3FV1A 4ELRA 1HSEA 2F6GA 4F3BA 1VFEA 4G8XA 1S50A 1FBQA 4R8HA 1MDMA 1Y4CA 3I5OA 4R74A 3FASA 2NUVA 1HKTA 1MGTA 4KYEA 4QSEA 4XLNF 3ECHA 2K7LA 2RKHA 3KP4A 1PP8F 1J75A 2HZKA 1RI7A 3V5AA 3USDA 1GXQA 4B8XA 1R1VA 3BFUA 1EH8A 1XMAA 2GZWA 3IAZA 1IEJA 1JW5A 3H6WA 2X4HA 1DPEA 3LAJA 1B6HA 3KJTA 2ZYKA 3RT6B 2HS5A 1FWZA 2E1NA 3SFZA 4R2BA 1W4MA 4H0WA 1MJ9A 1BIYA 1TBXA 5I2NB 4MHGA 2F5XA 2YPRA 1P6RA 4MEXF 3MEXA 4EM0B 2BE5F 5AIQA 2CW0F 2XVCA 2QL3A 4RNSA 1W7PD 4L18B 3LAPA 3O9PA 3OENA 3QAXA 2ZMBA 4O3CA 2Q2CA 4OIOF 1BBYA 4F22A 3SHFA 1ZGJA 2OZUA 2J5OA 4L5JA 3KOSA 2V3UA 3GVAA 2E0SA 4HOBA 2XX9A 4Y13A 2ANJA 1Y3QA 2QMXA 3E4RA 1TW2A 2XAQA 3W9VA 4G9YA 4ZE8A 1MQDA 1XDUA 1AWCA 1FQAA 4R72A 3KG2A 1LFGA 3QUFA 4YB6A 2DWIA 1II5A 1RIOH 1GTKA 4HBLA 2OWSA 3B7DA 5H20A 5E8IA 2V6CA 3IO4A 1W5SA 3KEQA 1F4KA 5IT3A 3TEPA 3DP6A 3D4GA 3ISPA 3TTRA 4ZS9A 3KLOA 1QULA 1FQBA 3JSPA 2OBPA 2DW4A 5CC2A 3UA8A 3QOPA 4PFUA 3L6HA 5E8GA 2XKOA 2A6EF 3MZ9A 4XXUA 2P4WA 4H67A 4KT5C 5L3BA 3PPRA 3ABUA 2W85A 2QQBA 3WGHA 4Y15A 1P1OA 4HW8A 4U7BA 2Q8KA 4C0RA 3QAHA 1JHHA 1QKBA 3K1PA 3M3LA 3GXOA 3P7IA 2Z9OA 1U5TC 4CZZA 2VE8A 3B73A 5LHGA 2OLBA 3V7CA 3O97A 4O5VA 3TTNA 4NF5A 1ZTYA 4KCCA 2O8XA 3TGNA 2ALUA 3VE1B 1QUJA 3PUVE 4NEDA 2FXAA 5CVVA 3A3CA 3WAFA 3G3ZA 1B5JA 2DE4A 3T8RA 2RF1A 2Y48A 2V9VA 1ATGA 4JBAA 2ESNA 4G68B 1QGPA 4R9GA 1Z7UA 3BROA 1O7TA 4RK2A 4ZE9A 1IRGA 2M5WA 4EXKA 1JQFA 3WE3A 2LKPA 1WKMA 2DFIA 2ZFWA 1DP7P 3C1DA 1JW4A 1LGBC 4X1DA 4A2UA 3MWMA 1IAWA 1A54A 4U88A 1ZRDA 3ZMZA 3H03A 1US5A 3K4UA 2F7CA 2VC0A 4RA1A 5HOOA 3T9XB 4NF8A 4OHNA 4ESJA 3RPWA 4RGRA 1ZH5A 2XX8A 2DTRA 2V25A 1JETA 3FJGA 1GVCA 4QLCU 3IC7A 5LGUA 5DD8A 3FXRA 1ZN2A 3DELB 4UXNA 1B9NA 2O6AA 1MD0A 2XASA 4I98B 4U0VA 4AIJA 4XKPA 4OVJA 3F6VA 3KEOA 3PQKA 4GGGA 4M73A 4K2EA 1D9YA 3OSRA 3H06B 4EQBA 1QW0A 3MJNA 3H3GA 4UVBA 1PDAA 1HW1A 4FJPA 3T9UA 5KCJA 2HWVA 4GYGA 1N04A 5B70A 4IRIA 2HZLA 3M7GA 1MPBA 2PN6A 4A6EA 2A61A 2PFBA 5LRRA 3GYHX 1B4HA 4LATA 2GXBA 4ZYGA 1MY3A 3F8MA 4GIZA 5FTIA 2WWYA 3EQ1A 2EB7A 4FAJA 3T0YA 4JWXA 5FHNA 3I53A 1URGA 1BIAA 2W57A 1D3KA 1K78B 4NMYA 3JTHA 4HX4A 1FSHA 2GA2A 3CIJA 4ESXA 1ZKBA 1SBPA 3OOPA 1D9VA 4HTGA 3HRTA 4P11A 4F1VA 3H6UA 1TQIA 4RS8A 2B0LA 3RJPA 5TP9A 3RTWB 3WODF 3KP5A 3CI8A 4BDRA 2HZTA 2O1LA 3EHSA 2QZ8A 2PMSA 3F8CA 4N13A 2R71A 4KN7X 1JEVA 2E1SA 1O57A 2P2AA 2YX4A 4F19A 1WVJA 3VVEA 4EMSA 3MAJA 4L5IA 4IXAA 1B40A 2QMWA 3BP8A 2KIUA 3VFJA 3TO6A 3VXBA 3SZPA 1NNTA 5L3DA 4WF2A 5LGNA 2P0SA 5AONA 2VOPA 5CRYA 1D8JA 1ZAOA 3V4GA 2XD3A 3ZP5A 1PUEE 4DZ1A 1TXFA 4NF6B 3U94A 4OTEA 4EQ7A 2D1HA 5DEQA 2Y7IA 1F9BA 4ZDMA 1VR5A 5AA2A 2Y7PA 3MCZA 2P5VA 5E20A 2RCBA 3LR1A 4YMAA 4S05A 3BBRA 2G93A 1ELJA 2K02A 1Z91A 2XUBA 3SDFA 3BJ6A 3FUZA 2YSRA 1GVJA 1LB8A 4RY1A 3CO6C 1OQHA 4RXLA 1R58A 1YTVA 4EJWA 4RPOA 2X26A 2Z22A 2HFHA 3TQLA 1G3YA 1YS7A 1R1UA 3TAJA 5CLSA 3E5QA 3DFGA 2IRFG 1OVTA 2ZKZA 2NNYA 3MP8A 1XT8A 1UFMA 3N6UA 4OMYA 3LBSA 1YQAA 1ULYA 3B6WA 2R6GE 3DF8A 3H4ZA 1US4A 4CGZA 1F9NA 3BY6A 2QQ9A 3TYHA 1EH7A 1R36A 4ZYEA 2FU4A 3RTRA 2YX7A 1Y1ZA 3TOBA 4XTCQ 3VODA 4R2FA 2QM3A 1J59A 1ZG1A 4Q8RA 1YAEA 2DE2A 4F29A 1FZPB 4JK1X 1O3QA 2MBFA 1IXGA 2H9BA 3PMWA 2Y0MA 5CMBA 2HGCA 3SESA 4M72A 2HEOA 3F11A 3VV5A 4LFUA 1IIWA 2Z8FA 2VOZA 3TDUC 1YFHA 5CMCA 3IO6A 3ODBA 4F1YA 3LSLA 3PPOA 3PMXA 4ND9A 3U1OA 2A07F 2ZXTA 4RB0A 1SI0A 5D8LB 4XBFA 4LZ5A 4CDGA 5I58A 1T98A 4D0PA 3O2PE 3GXAA 5I59B 1P2FA 3VB2A 2EK5A 4LLLA 2ONKE 4MNUA 4PGGA 2I49A 3IB1A 1MH4A 5LHHA 3QIMA 4UUVA 2KJCA 2IW5A 3DPLC 3EYYA 2H98A 1I5ZA 3PUZE 4LLNA 3LSFB 4E0WA 2RV8A 3N6TA 1KU7A 4JBZA 1IN6A 1K79A 1G3WA 3VLVA 3JYRA 2O3FA 2UVGA 4MEYF 5F64A 4RGUA 1JGSA 1PBPA 3HN0A 1FQFA 5DYHA 1S6LA 3NRVA 1RYOA 5I57B 1W7PB 1LFHA 1YW9A 4NWDA 4AB6A 3KZGA 5DCMA 4HA8A 1N7XA 1HBXG 3EHTA 2F78A 2HTJA 2A5TB 1I6BA 2ISYA 3KZYA 4GWOA 4KI0E 1M5CA 4L0YB 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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