1HSJA

Sarr mbp fusion structure
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
487
structure length
487
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALAAAQTNAAAEFMSKINDINDLVNATFQVKKFFRDTKKKFNLNYEEIYILNHILRSESNEISSKEIAKCSEFKPYYLTKALQKLKDLKLLSKKRSLQDERTVIVYVTDTQKANIQKLISELEEYIKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of the SarR protein from Staphylococcus aureus.
pubmed doi rcsb
molecule keywords FUSION PROTEIN CONSISTING OF STAPHYLOCOCCUS ACCESSORY REGULA
molecule tags Transcription/sugar binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 143
structure length 487
sequence length 487
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-12-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF12802 MarR_2 MarR family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 1hsjA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1hsjA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1hsjA01
1J9IA 3CI8A 2B0LA 3N6UA 5K5RA 4FE8A 5IT3A 3Q9SA 1BKAA 4JSOA 3HHGA 5DD8A 2GHAA 5CBRA 5JFRA 2O03A 2Q8KA 1Y4TA 4YMAA 2L54A 3LA2A 4FT8A 1LAXA 3UA8A 1NNKA 1S6LA 4QSEA 2P7CB 2RC7A 4OERA 4IO6A 1FYLA 1GVJA 4JK1X 5D5VB 3TO6A 1IXCA 3O66A 2AL5A 3K6UA 4RGXA 4ZZLA 2PYYA 4BDNA 2F7AA 5JK4A 4UVAA 2WC2A 4YICA 3G3IA 3RN8A 3ZMTA 5HLHA 2XAFA 3V8LA 4U0YA 4HW0A 5K5QA 2H09A 4PGHA 3KN3A 5EEHA 4ESJA 1QUJA 2D5WA 3LSWA 1TXFA 1ZGJA 5DUIA 2VD2A 2O3FA 4GL0A 5FGMA 4RK2A 2FOKA 5D8KB 3FV2A 1HKSA 1GV8A 1MPBA 1R1VA 5K1YA 1SFUA 4ELOA 3M1EA 1KA8A 2M1BA 2G93A 4M72A 4ASNA 1S29A 4RB0A 2Z5UA 3E13X 2DE4A 3P9KA 1SD5A 3DV8A 1OMPA 3JW4A 4YFKF 5FB2A 1USSA 4OINF 1LCTA 4I98B 3PUYE 4CDGA 4NF6A 2EV0A 3GFLA 3ULQB 2VC1A 3RKYA 3PUXE 3DP6A 3PFIA 3TCFA 1XDSA 2PLYA 1MH3A 4KDPA 4G8MA 3GZGA 2QRYA 5FLXK 1J7KA 2HOEA 3RPWA 1P4WA 4F7ZA 5L3CA 4MEXF 5CMKA 4IJAA 4MFIA 4N9HA 5CVRA 1B51A 2VBXA 4YFNF 3I53A 4CICA 4BHCA 1MDQA 1IEJA 4GRKA 2KJCA 1PB9A 5IT9K 3A09A 2ZNYA 3FWEA 3GFJA 4O6JA 2ZNTA 4WEDA 5E1ZB 5B7DA 2CQKA 4HQMA 3H6VA 4OOIA 3MZBA 3C7JA 3GXOA 4BAYA 2O68A 2EFQA 2RKHA 2ZKZA 4ZZAA 3UK4A 4QFPA 1R7JA 3ECHA 4H67A 1MJ9A 1M5EA 4U4SA 1I6QA 3H6TA 4H5GA 2M8CA 2DFIA 5BWJA 4P9UA 5FHOA 3W15C 4WX9A 2V93A 5DYMA 5H8NA 3HTSB 3TYHA 2W84A 3C35A 4CGZA 1FQBA 5L9MA 3GUDA 4BHPA 3LWFA 4CXFA 2PI0A 4U4XA 2AXLA 3PMWA 4BDQA 1VFDA 3FMQA 4N0BA 2I0CA 2KKOA 3GZ6A 3T1BA 4AD9A 1GTKA 3FVKA 3Q26A 4QFKA 1UIVA 1K7AA 4EQ9A 4ZYEA 3VFZA 4NQWA 3VLUA 1F9BA 3SEYA 4N6PA 1W5SA 5I56B 1A8EA 1KU9A 3N6TA 4RY1A 2EA2A 1HKQA 4O5VA 1IITA 4IPAA 4MEYF 5JTYA 3IL1B 2TDXA 4G94A 4HYEA 2HKOA 1CGPA 4A0YA 4CYDA 1B3GA 3LC8A 2ACJA 1SD4A 2KRFA 3BJOA 3B6WA 3GXAA 4PFTA 3CG3A 4GGGA 1MH4A 1SD3A 1YW7A 1J1NA 4LG0B 1FY7A 3BPXA 3C9HA 4G68C 5CMMA 4F39A 3TOBA 2DO7A 1F4KA 3T96B 3RI4A 4F1YA 3P7NA 2FE3A 3JSPA 3QU6A 4R9FA 2F6PA 1ZAOA 1YS7A 1R9QA 2D45A 4KMUX 3PGFA 3DF8A 1MY3A 1BIAA 4A6DA 3BJAA 3GFMA 3H4ZA 2AL4A 3SDFA 2DK5A 1B7ZA 1HQCA 2DP8A 4CO8A 4UVCA 1W7PB 4NB5A 1W7PD 3CJNA 1US4A 2MBFA 4EV0A 5D5WB 3FIRA 4LUBA 4POWA 1ATGA 1OR7A 3UGWA 2HTJA 1B59A 3U92A 1LDDA 4FATA 1LGBC 4C1UA 4RB1A 2X7PA 3KP4A 2HYFA 1QJMA 4EQQA 1G6NA 3DLNA 3BPVA 1MM6A 1B0LA 3I5OA 4PFWA 3RLFE 4U1ZA 3K6VA 1URDA 1YW8A 2HQNA 4JWOA 5L3DA 1CF7A 2DU9A 2ONKE 4ESXA 3PPRA 1F5TA 5DDGA 2NWJA 1XB4A 1I6AA 4R2FA 3E5QA 1MM7A 3V4GA 3HRTA 4ZYDA 2RF1A 2Y7RA 1BN5A 2ELHA 3SEWA 2IA2A 3MP1A 1JEUA 1MPDA 1DPPA 4ZE9A 5I59A 2ESNA 5HOOA 1YAEA 3M8EA 3L6HA 3T5XA 1LFHA 5CC2A 2EWNA 3O2PE 1IRGA 4KCCA 3IOTA 1XDUA 5ICQA 5AA3A 3ABTA 5ILUA 4UA8A 1ZG1A 2H98A 3JTGA 2O69A 1I6XA 4LK0F 3K69A 3LSTA 3MZHA 4EXLA 3RDIA 3ZP5A 3HYIA 4IRHA 5I59B 1MY0A 3KP6A 1SDXA 3L6GA 4OETA 1B3FA 3LA3A 3ML6A 3MZ1A 3R6SA 3QAHA 3FMRA 3GBAA 1URSA 3RNNA 2GXGA 1FBUA 2QENA 3JTHA 1Y3PA 3LSXA 3J80Z 1LQ1A 4EM1A 3M9AA 2DLLA 5FLXZ 2UVJA 4HV5A 2F6GA 2K27A 1FCKA 2YSRA 4ZZEA 4IO5A 3W9VA 1LB9A 2P6SA 4XBFA 1LBBA 1R6ZA 2MH2A 2QS2A 3O97A 3MW0A 3QXMA 3ZKKA 4RB3C 2O8XA 1A7LA 2FBHA 4F19A 4WEPA 2O0YA 2D1VA 4Z0IA 2VODA 3B02A 4A0ZA 4ZZDA 5LLQA 1LNWA 4MTEA 3CSBA 4IGRA 4ZEDA 1OYIA 3MAMA 3DXJF 4XSXF 1Y1ZA 3N4MA 2JPBA 1YTYA 3CDHA 1O64A 1IN5A 4S04A 1J75A 1LAHE 1RNLA 2F8DA 2XX8A 4MTDA 2M8EA 1B9JA 1J59A 1DUXC 5DVJA 4TQUQ 1R5GA 4IXAA 2VBWA 1LDJA 1FSEA 3H92A 3QU3A 3V8XB 4R9GA 1SW1A 4KMFA 4GXSB 3A3CA 4QF9A 2BBYA 5DEQA 1YO5C 4JDFA 3H06B 4K2EA 1FQAA 4YU0A 2LF8A 1T2KA 2QQAA 3V83A 1GHCA 4AWXB 3ZMSA 2HZKA 2VOOA 4LQ5A 3CG1A 5BMZA 3GW2A 1WI9A 1B46A 2HYGD 1J5YA 4GVOA 1N04A 1ZKBA 4BLAA 3TGNA 5E1XA 4Q5SF 3LBSA 2DK8A 3IO6A 3QP6A 3KSXA 3F11A 1MG1A 2XXPA 2Y7WA 3KN7A 4KCDA 3T22A 2STTA 3LFKA 4ENJA 2RINA 4NMYA 5H8QB 3TTNA 3FX3A 4I2OA 4YMBA 3I58A 3RYPA 4YAHX 4G6QA 1USYE 2THIA 1R22A 1K78B 3QRFF 3W6JB 3EQLF 1D9VA 2NYXA 4G8XA 2COMA 2VOZA 2R6GE 3FUZA 2HCAA 4OIPF 2M45A 2Q2AA 1I1GA 3HSTA 1MQJA 3EHUA 2XD2A 4OU0A 2YPNA 1Q1HA 1NMUA 1G3TA 3EPEA 3M3FA 2REJA 5F1RA 2QWWA 2B3FA 4OTEA 2PJPA 4P5OA 1Q35A 1FBQA 1LVAA 4LP2B 2RQPA 5H8HA 4R74A 1ZMGA 1AMFA 2Y7PA 5KVRA 1S8NA 3KEOA 2MH9A 3WG9A 3VEPA 1IN6A 2R3SA 3VLWA 4PQJA 1MXXA 4HF0A 1IZ1A 3FHZA 4F22A 3HN0A 4HCYA 4O3BA 1K6OA 3L7WA 5EHMA 2F2EA 2O7IA 1G3WA 4KUMA 4G7OF 2ZXJA 2V3TA 5EHSA 2A68F 2G7HA 2NVUB 4G68A 3TODA 3GYHX 1D9YA 3IKTA 2CYYA 3KFWX 1M5CA 1PDNC 1FZPB 2XXRA 1D3YA 5HS9A 4NWDA 4OZ9A 5DEXB 1D8KA 1WRJA 2XXXA 4DIGA 1LEAA 3PUZE 1RUNA 5HS8A 3MZ9A 4AVPA 4ISUA 2KIUA 4U23A 3RJPA 4HOBA 1MDMB 4L0ZB 3SZTA 4ESWA 4F2QA 4RA1A 1H0MA 3GFIA 1RYXA 4L5IA 2O61A 4ZE8A 3E9XA 5I84A 2PFBA 1ODDA 3JZJA 3ZMVA 2XROA 2CWEA 1MXVA 2FU4A 2I0BA 1KU7A 3E6CC 3TTMA 1R1TA 2PEXA 4U0VA 1GXPA 1JEVA 2DW4A 1KYWA 1YIOA 3K0LA 4KA4A 4AIHA 1MQGA 4EF2A 1NH7A 2Q9TA 2H9BA 4YKKA 1SAXA 2M5WA 3GF2A 1SYHA 1NNPA 1EZOA 3VV5A 2UZKA 1QUIA 1PB7A 2HXWA 1Z7UA 1DOTA 3IO4A 2I3WA 3CRBA 5ICGA 2F5EA 3SESA 4THIA 1ZLJA 4R72A 3PQKA 3H3GA 4RK9A 1O7TA 4PCQA 3MAJA 4R75A 3DFGA 1YQAA 5ILVA 2XV4S 1WSUA 2ONRA 1A55A 3S9LC 2Q2CA 3RYRA 2EB7A 2OK2A 3TQWA 3KBRA 1R9LA 4L5JA 4KD5A 4FHTA 2OWTA 3MCZA 1G3SA 1NH8A 1SI1A 5FHMA 5HS7A 4UXNA 3L09A 4RYAA 1UQWA 5I2KA 3VOEA 4GF8A 1F9NA 3EETA 2JTVA 3OXNA 5AA4A 1R58A 2XUBA 2CO5A 1RYOA 5ERIA 3IX1A 3GBBA 4EVIA 3BWGA 3C34A 1TQMA 5IAIA 3R61A 3K2ZA 3O6BB 1LB2A 3KJ7A 1XSVA 3MEXA 3P7IA 2L3DA 5E1WA 4GIZA 2HR3A 1KQ8A 1EV7A 4GOTA 3OV8A 1B3LA 2Z99A 3ZKLA 2EFPA 4MNUA 1QZYA 2QS4A 2ZYNA 5DV5A 1OIBA 3FV1A 1FPQA 4AIKA 2PBIA 3EYIA 3F8CA 2QLZA 5FD5A 1Y9UA 2OZ6A 3E4RA 4MH5A 3COAC 5ICTA 2IW5A 4L0YB 4I0AA 3WGIA 1QPMA 1FP2A 3OEMA 1LAFE 2P5LC 1JXSA 2XXUA 2Z8FA 3KCCA 4ZEBA 4WKMA 1VSOA 4HF2A 1ZLKA 3CUQB 1EH6A 4HX8A 1WQ2A 2O6AA 3IRRA 2AIXA 4XLPF 2WWYA 3N26A 2HKXA 4LZ5A 5IKBA 5HLGA 2QBYA 1HW1A 2XXIA 4I01A 4G8NA 1RIOH 3VB2A 2H6BA 2YPRA 4OESA 3FVGA 3Q28A 2E7WA 4FJPA 4TLMB 4K3FA 3O3KA 4UNOA 4I8CA 3HPIA 2X0LA 1IXSB 4IY5A 1A04A 3E6DA 1ANFA 4OWDA 4RNSA 2A69F 2QBYB 4WWCA 3K6WA 5CVJA 2M30A 5DCMA 1QW0A 3LUYA 4LMYA 3M3KA 2XVCA 3ZN0A 2XASA 1F1ZA 4R1HA 3IJXB 3GEZA 2MLGA 5LEKA 1UIUA 3F3XA 2FEZA 1KQ9A 4WCGA 2VBZA 3H03A 4P0IA 5I57A 5D8LB 3KZYA 2CFXA 4EM2A 3G73A 2OBGA 3V89B 4KFQA 2FMLA 1DPEA 5DCMB 3NEUA 4IO7A 3U1OA 3E3KA 3ILUB 4WXJA 5LHGA 4LD5A 3T9VA 1II5A 4Q4ZF 2XX9A 3TZAA 1AIVA 5F7VA 3KP3A 4DNCA 3R7XA 2V79A 5TP9A 4KQPA 1ZRCA 2O1MA 3RUMA 1E2XA 3FJMA 4JWYA 5ITPA 3TDUC 4CHUA 4KN4X 2A61A 4IO3A 1P4XA 3A3UA 2ZMEA 5BS6A 4HTGA 2RKMA 5FO5A 1B1BA 5FTIA 1N7WA 1UTHA 3PD9A 4G8HA 3J80K 4LK1F 5KCJA 4WXDA 5I58A 2ZYOA 1BJAA 1GR2A 4OIQF 4U21A 4ONYA 5BOXA 4GD5A 1QGPA 4RB2C 2LF7A 2P8TA 3HOSA 2ZMEB 1KQ0A 4NF6B 3OSRA 1PC3A 4KYDA 4HV6A 3I6VA 4AB5A 2Y0MA 3N5LA 1GVCA 4F1VA 1Z05A 1D8JA 3HHFA 4R8HA 4H0EA 1IXIA 3M3LA 4H5FA 3DPTA 2OQGA 3K6XA 2HEUA 4BDMA 3PPNA 1RZ4A 3LQQA 3CFLA 2QMWA 2X4HA 4DCYA 2FRHA 1HSEA 5ISUA 1FLIA 2GA2A 1B3EA 3LR1A 4LZ8A 4ECFA 1FOKA 2XIGA 1PDAA 4XKRA 3RTRA 2LAOA 1B58A 2VXZA 2P0SA 3G3FA 3FJGA 4OEVA 2O84X 1OYYA 4GYIA 3WODF 4WK8F 3G3HA 2ABHA 4Q30B 2DE2A 1O3SA 2F34A 1SW4A 4H1XA 2HWVA 1RI7A 1T0FA 1UTBA 2OZZA 1P99A 1ZU0A 2DQRA 5HVQC 3DP4A 1B1XA 1B5HA 5HDGA 3EHTA 1OLAA 4H8JA 4YG2F 3SERA 4XXUA 4OFLA 4E0WA 5H8NB 2ZNUA 4ZYHA 2GA1A 4M71A 5L8DA 1BI0A 2G9WA 4DLDA 2WTEA 2UXXA 3K1NA 3G3ZA 1UTBB 3TCGA 3VE1B 2FA7A 2IT0A 1IUDA 1POY1 5BPDA 4OMZA 3E3VA 5DYHA 3FF5A 3MWMA 1B9MA 5JEIA 2CSOA 1HSTA 2H27A 4DXUA 3JV9A 5JI6A 2VOPA 1MJBA 1R1UA 5D5UB 1PBPA 2V84A 3U2RA 4IB2A 2XKPA 3FD3A 5JTYB 3MPKA 3I71A 4MHGA 1XN7A 1URGA 2Z23A 3LA7A 4UHTA 3PPPA 2XKOA 3MVXA 4HS7A 3QAXA 3UORA 1ZH5A 3UP9A 3FATA 1FT9A 3DKWA 1I5ZA 2OBPA 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 3T8T A;  1INP A;  3HB9 A;  2E60 A;  2LG4 A;  1RUO A;  4Q47 A;  1MD0 A;  2VD3 A;  5L3G A;  3ERM A;  3CC4 I;  3LSH A;  1N76 A;  2OAZ A;  4KR5 A;  2A5T B;  2H99 A;  1H45 A;  2LY9 A;  1U8R A;  4GWZ A;  2N8G A;  1SPI A;  4QFO A;  4M9Z A;  3RPU D;  4BJ5 C;  4XKQ A;  2DMP A;  1X1D A;  1AL3 A;  3GTK J;  3HIF A;  3P9C A;  3MN2 A;  4F18 A;  1FTL A;  3G4S I;  5H6Q A;  3OO7 A;  1NI9 A;  4MIJ A;  3TFL A;  3TL4 X;  2X6O A;  4PDD A;  1MXW A;  4KPT A;  2WV0 A;  3T0J A;  3CIJ A;  5EQ8 A;  3TPA A;  2M34 A;  2ZYM A;  4P9F A;  2R9J A;  2ZNZ A;  1FSH A;  4NF5 A;  1IN4 A;  1GT0 C;  1R49 A;  4D9J A;  1LB8 A;  5JR3 A;  2M0M A;  4KIG A;  1Q1K A;  3R26 A;  2V9V A;  2EH3 A;  2KQZ A;  3T9H B;  1Y0U A;  4G4P A;  3D0S A;  1H3D A;  2ESH A;  2VQH A;  1RKM A;  2L9S A;  3CES A;  4RBO A;  1TW3 A;  2HTS A;  4XOT A;  1FPL A;  3A01 A;  2ADU A;  4E7I A;  4B1R A;  2WAF A;  3HBL A;  4AS4 A;  4HDV A;  3FXB A;  3OYC A;  4IKF A;  2IS2 A;  1B6H A;  3U8Q A;  5D4S A;  3D5L A;  4ZEC A;  1A6Q A;  4QSD A;  1A54 A;  1XGS A;  1OIS A;  4RMN A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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