1HSJA

Sarr mbp fusion structure
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
487
structure length
487
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALAAAQTNAAAEFMSKINDINDLVNATFQVKKFFRDTKKKFNLNYEEIYILNHILRSESNEISSKEIAKCSEFKPYYLTKALQKLKDLKLLSKKRSLQDERTVIVYVTDTQKANIQKLISELEEYIKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of the SarR protein from Staphylococcus aureus.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transcription/sugar binding protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords FUSION PROTEIN CONSISTING OF STAPHYLOCOCCUS ACCESSORY REGULA
total genus 143
structure length 487
sequence length 487
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-12-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF12802 MarR_2 MarR family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 1hsjA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1hsjA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1hsjA01
2IW5A 4OETA 1ZRCA 4AWXB 4JDFA 5I2NA 4EGZA 1Z05A 1OYIA 1UTBB 3CG3A 4ZZAA 2H4IA 5I59B 3PQKA 1ELJA 5CBRA 4UVAA 3IJOB 2Y7PA 1EU8A 1URSA 4H0WA 4BDQA 2CG4A 3QYTA 3HSEA 5H8NA 1R1VA 3KN7A 5L3DA 1XGSA 1OMPA 4HBLA 3CJNA 2V3UA 4F18A 4RNSA 4EQQA 4Z0IA 1NH7A 1BIYA 5F7VA 3GF2A 4KMUX 2EFWA 2CO5A 3EHTA 1SD4A 3QP5A 4DE8A 1I1GA 3J81K 2HYFA 1IQ7A 3GVAA 1BIBA 2V25A 1LEBA 4JB7A 2D1VA 3A3CA 4OERA 3R0AA 4G4PA 3JSPA 1O3RA 3RYPA 3UIFA 1DP7P 4EJVA 4G8NA 5AA2D 1FYLA 3G3KA 2ZYNA 1KYZA 3MW0A 5AA3A 3E6CC 1FTKA 4F19A 2YPNA 1D9YA 3LQRA 3TYHA 1LGBC 2Q89A 3C32A 2M5WA 2HQ0A 1S29A 4O3AA 2P6SA 4EUOA 3LWFA 1SW5A 4F22A 2ZKZA 2D21A 4DXBA 4U1ZA 3WODF 2A6HF 3I58A 1B3HA 3CFZA 3K4UA 4DCXA 4CGZA 4GXSB 3C1DA 1GHCA 1I69A 4G2ZA 2DS9A 3E5QA 3R6UA 1S7AA 1R22A 4U88A 1FYMA 2E0SA 3KOTA 2QVOA 2OA4A 1BI3A 1BC7C 2X26A 1YTVA 4M74A 2J5OA 3E5XA 3T9HB 4KNYA 2DPDA 2XXHA 4UA8A 3BBRA 2FBKA 3QP6A 3GUDA 2G7UA 2YPRA 3PMWA 3CTAA 4YKKA 1Z7UA 2PYYA 4I8CA 2XXIA 2H6BA 2IJLA 2ABHA 2PVUA 3T0YA 2A6EF 2ZCWA 3IL2A 3I53A 2REGA 2DT5A 4MHGA 2ZXJA 5EYFA 5I2KB 5CJ9A 1P1UA 1RKMA 3I6VA 4JK1X 2NNYA 4ZE8A 3BKIB 2GAUA 3CDHA 3NRVA 4GYIA 3PPRA 5A2QK 3SZPA 2UXNA 3MZHA 1ODDA 1TNTA 5HDGA 4FATA 2BE5F 4MTDA 4WXCA 5E1XA 3RTFB 4ECFA 3LUYA 4HX8A 4KUMA 2EV5A 4I09A 3V8LA 1SBPA 4E0XA 1J2XA 2FSWA 2XGXA 3VDFA 1LAFE 3WGHA 1TWYA 2O8XA 5ILSA 3MUQA 2P1SA 4ZEKA 3W9WA 4LB6B 4F1YA 3T5XA 1S8NA 3SEXA 4DCYA 4P0GA 1I27A 5ICCA 2HCAA 4R73A 1S7OA 2LNBA 4NF6A 3HRSA 3TDUC 1MQGA 3EQ1A 3COAC 3G7WA 5E8GA 3WAFA 3BFUA 3E6MA 3TUSA 1GR2A 1Y4CA 2R71A 3U72A 4ZEFA 2DXRA 4IO4A 2OK2A 4H6DA 4DQ2A 5LHGA 5BPDA 1JE8A 4KD5A 2HZLA 1VFEA 3HRUA 1SD6A 3K6UA 2MC3A 3VFZA 3D0SA 4YMBA 4XKQA 4KPTA 1O3QA 4Z2YA 2V84A 4BDMA 2AYSA 1B59A 3T96B 5JEIA 1PBPA 3O2PE 5H8HB 3M8EA 4MEYF 1C0WA 2XAHA 5D5XB 3UORA 2VD2A 4R6HA 1UQWA 4HYEA 2ZNZA 1MY3A 3OSQA 5E1WA 1IXCA 3F23A 2Q9TA 4U7BA 5DVIA 1Y20A 3ZMZA 3KJTA 3TODA 4A5MA 3TKYA 5J8FA 5DCMA 3LR1A 3EYIA 1IITA 3FVKA 3MAMA 2GH9A 4R74A 1MDMB 2F5CA 5B7DA 3I54A 3KFMA 3M3LA 3E5UA 3TTRA 1QPMA 3FF5A 1JGSA 2V3QA 1S50A 2VOPA 3MQ9A 4RAYA 3FASA 4G68A 5KCJA 1NKXA 2Z8DA 4IY6A 4NWCA 1BIAA 5ILUA 3R7XA 1Z9CA 3F8FA 3I5OA 5LEKA 3G3ZA 1KA8A 1DTGA 1ON2A 1I1SA 3OEMA 1SMTA 3MCZA 5A5XA 4M73A 4F2QA 1Y1ZA 3GLXA 2ONSA 2RCBA 3T8RA 5F6FA 2PMUA 2F5EA 3K02A 2RGVA 3FMSA 1MY0A 4HF0A 5FHMA 2XAGA 3WTYC 4QLCU 2DO7A 5I58A 2VE9A 3V7CA 3ZN1A 1EH3A 3ABUA 2FA5A 1W4MA 4LGWA 3RT6B 1US4A 1SW4A 4JWOA 3K1PA 2DWIA 3OO9A 4OEUA 3HUGA 1B3FA 3GFIA 3KBRA 4NTLA 1LBBA 4PFWA 3TTKA 4GRKA 4U0YA 1FPQA 3VVEA 2QS1A 1LAGE 1G4DA 1AMFA 1OPCA 3GW2A 4EF2A 3QPTA 4S04A 4YG2F 1P2FA 1LDKB 1LB8A 2DPUA 1FCKA 2ZNYA 4R72A 4ELPA 4AQ4A 4G6QA 2Q2CA 3V5AA 3T66A 1XCBA 1CE2A 1UHMA 5H8FA 1ZHFA 2DQVA 4E70A 3IOUA 4LVQA 4A12A 3S9MC 2GA2A 3FM3A 3M1EA 5HBCA 2DLLA 3U2RA 4BXUA 2ONRA 3LC8A 1DTZA 5LHIA 4KIBA 2PN6A 1U3EM 3HRTA 3LQQA 3R26A 3DM0A 5AE4A 4LFUA 2Z22A 4CO8A 4HLXA 5K1YA 5K5RA 1WWXA 2NS0A 2QUFA 5HLHA 2ADUA 2RC8A 2Y7KA 3FXQA 1UIUA 2FRHA 4OESA 3MQ0A 4RA1A 1MXWA 2JZYA 4ZE9A 4DNCA 1S7YA 2CGPA 2EWNA 1QKAA 4I0AA 4QFOA 3FX3A 4ZEDA 4EGYA 5FD6A 4OYVA 4HW0A 4M71A 4PFYA 2GQQA 4ZDMA 1W7PD 1JNFA 2DAOA 2QRYA 3FIRA 4I98B 4R9GA 4G9YA 2HGCA 5KDTA 2I58A 1BJAA 5CYVA 1KGSA 3W9VA 4M4GA 2OAZA 4L9TA 1FW0A 1EV7A 1IUYA 1TT1A 4I9DA 3T9VA 2V9VA 2EFOA 4BHCA 2RC9A 1URDA 1KWHA 1B32A 3CO7C 3IJXB 2YJPA 4QF9A 4JSOA 5I57A 3O2AA 2O1MA 2MH9A 1HW2A 1E2XA 2GRVA 3ISPA 5LGNA 2LKPA 1ZG5A 4KYWA 3ZS6A 1AWCA 3HSTA 4FECA 4EJUA 4WXJA 2X7QA 3K2DA 4KQPA 5DEXB 4OQOA 5L9OA 4HX4A 3JAMZ 3HO7A 2KIMA 2M87A 3PMVA 4B8XA 1WI9A 3Q26A 1PB8A 4PGHA 4NF8B 5H8SA 1LEAA 4O3MA 2B3BA 2QBYB 4BDLA 4Q47A 2ONKE 3ZKKA 1ZLKA 2JRTA 2QWWA 3DP6A 1DDNA 3SEVA 1VR5A 3VXBA 1XSDA 4QRZA 1FX7A 1VE4A 5ED4A 2F78A 3OSRA 4U2RA 2VOZA 3SKPA 4XKNA 3TKDA 1F1ZA 1CGPA 1ZBMA 2V93A 4A6EA 2RNJA 3BJAA 5J8CA 3Q29A 2XAJA 3E6DA 2RINA 4U1OA 1YW8A 2DE3A 5DYMA 1VFDA 1H0MA 3EETA 3QXMA 4H8JA 4OTEA 4XBFA 3U93A 1RZ4A 1U5TA 4K2EA 1IIWA 3N94A 4PP0A 4LG0B 1LAXA 1PP8F 1OQGA 4DZ1A 4K3FA 4O3BA 1UTHA 1LFGA 3CG1A 4YKJA 2PI0A 1XGOA 4BDOA 3RTRA 3QRFF 1FTLA 3H03A 2XXTA 1B4AA 1HKTA 2HXWA 2FBHA 1L5TA 3S4UA 4KFQA 1SYIA 3VLUA 3BJ6A 1P1QA 4YFKF 1CB6A 4I01A 2XASA 3DP4A 5HVQC 1DMBA 2H99A 3IB0A 4BHBA 4U0WA 1R6ZA 2ZNSA 2R7FA 2HTSA 2EFQA 3S2WA 3S9EA 4Z7EA 3KG2A 4LA9A 3MPKA 4LQ5A 6PAXA 4JWYA 3HHGA 3HYIA 2XXPA 3LSLA 2L3DA 1B51A 3BOQA 1STZA 3R0JA 2HOEA 4R6KA 5FHOA 5CMKA 1Z6TA 4F39A 1RUNA 1TQMA 1KQ8A 5AONA 1BLFA 1XSVA 2PMSA 2Z3YA 3OXNA 5IT9Z 2Z33A 1MY1A 3U92A 5HS9A 1FSHA 4R1HA 3TOAA 3FHZA 1YTYA 1QJMA 4ESBA 1OVBA 3V8KA 1IRFA 3VEPA 2W25A 4GD5A 1V3FA 3DKWA 1IXIA 2VP1A 4RGRA 5TPAA 3HHFA 2Q8JA 2IPQX 3QU6A 3DQVC 2A5TA 3B02A 3KZZA 1BBYA 3CUQA 1ZARA 4LLNA 1Y3NA 2H09A 1Y4TA 3JTHA 2H27A 2I49A 2Y7WA 3E13X 2RN7A 4HAMA 3HIFA 4HW8A 3R60A 2HAUA 2MBFA 4FX4A 2MD5A 4EQBA 3PPQA 3MC2A 1EH6A 1B2HA 1ZIUA 4UVCA 4DXUA 3FMQA 3J80Z 5EEGA 2PBWA 5JFRA 2ZNUA 3GXAA 1FBUA 4EV0A 3KOSA 1G6NA 2ZNTA 3F72A 4G68C 2PQ8A 1WODA 4L17A 5CVVA 5BUUA 3FWEA 3V8JA 3G3FA 5DV5A 2XXVA 1QW0A 2HDCA 3O6IA 1USTA 1YIOA 3R61A 1I5ZA 3MEXA 2HFBA 4I1DA 4S05A 3WTUC 5DTBA 1LB2A 4P9FA 1P1WA 2FNPA 3OV8A 4M6XA 2XXRA 3B6QA 3N6TA 2DOJA 3QU3A 1SVXB 1AL3A 4DDDA 5LOMA 1QQIA 5D6EA 1YYVA 5AIQA 1UTBA 2F7BA 5I59A 1Z7ME 4ZYGA 5CMCA 2XXQA 4JWXA 5CLSA 3TOBA 1HXDA 3L6GA 3F21A 2O1LA 5CRYA 3PUXE 5K5OA 1O7LA 3LAJA 2B0LA 3KP3A 1O3TA 1ULYA 4Y17A 3DP8A 1FTJA 3T22A 2Z5UA 1MPDA 4G6DA 3PPPA 1IUDA 1RYOA 2XHKA 3QOPA 2UYEA 2WKYA 3OELA 2O51A 3EYYA 3KZYA 2CQKA 4GCVA 1FQFA 4RYAA 1ZJLA 5HLIA 3PFIA 1P1NA 5I56A 3B6TA 3RY3A 2Y7IA 1T0FA 2EB7A 2VE8A 4OWDA 4NQWA 5CBSA 4GL8A 1I6XA 2XV4S 2F36A 3IOWA 2XX9A 3UN6A 3KP5A 1URGA 4X1BA 3IOVA 4AIJA 1LCTA 4WXHA 2K02A 1MY2A 2FMYA 1JW5A 2F6PA 4EJTA 4ON0A 3K2ZA 1F4KA 1OKRA 3ROUA 1O3SA 1IN6A 1US5A 4IF4A 4A0YA 2K86A 2HZTA 1ZKBA 3KETA 2BJJX 3S9LC 2DQLA 3U1DA 3BPVA 3TCHA 2M1BA 1ATGA 3BFTA 1T2KA 4Q30B 3E3VA 5ICTA 4U23A 2DVZA 1YLFA 5ERIA 4KA4A 3JAMK 1YCJA 4IHSA 3KCCA 3F8MA 4OIRF 2IA2A 2OU2A 3SXYA 5IT3A 4IO3A 1SI0A 2DWJA 5FFXA 1HW5A 4ESJA 1P92A 4EM2A 2CSOA 2UYFA 2EA2A 3E97A 4HF1A 4BDNA 2O3FA 5ISUA 5ICQA 3RJPA 1W5SA 3CSBA 4FAJA 3RN8A 4ESFA 1FBSA 5HDKA 5JR3A 4TQUQ 4RK2A 3B7DA 3FV1A 5BWJA 4NF5B 1MQHA 1U6GA 1JEVA 1B0LA 1B1BA 1FP2A 2DBBA 2EA4A 5AA2B 5I2KA 2ZO4A 2OQRA 3QAHA 4HS7A 4BAYA 2P6TA 4TLLB 3VVFA 3H3UA 2M30A 5K5QA 1OLCA 2OBPA 2A5SA 3VODA 4IRHA 2F6GA 2HYGD 2HEOA 1IEJA 2ZMBA 2FEZA 2PG4A 4NB5A 1H45A 2EV6A 3QUJA 3KGCA 1Q1KA 4R79A 4RGUA 3DPTA 2GFEA 4H5GA 1PB9A 2QQAA 3DELB 3U9GA 1B0HA 4XIGQ 1OYWA 4GFRA 3RPQA 5F1RA 2TDXA 3O6BB 5E1ZB 1QO0D 1LSTA 4HOBA 4TV7A 3IL1B 1NNPA 2GHAA 3FD3A 1NNKA 2GIVA 4ONYA 3TZAA 3MP8A 1YO5C 1OLAA 2DTRA 1B7ZA 2ETHA 2Z99A 2RQPA 2UVHA 3LSTA 2H98A 1SFXA 1TFAA 3CLOA 1K7AA 1QULA 3PUYE 4RPNA 3MVXA 2VBZA 5JI6A 2XIGA 1IXHA 3OO6A 2DK5A 2Y7RA 4ZZDA 3USDA 5JVTA 5DCFA 1U5TC 3AAFA 5B70A 4H1XA 3WE3A 1B5IA 4M6YA 4RGXA 4A6DA 3I3VA 5H6QA 4MTEA 4AIHA 1IF1A 4GO1A 4C1UA 2XVCA 2Y84A 3EDPA 3IO4A 1B4ZA 3H4ZA 1N84A 1R5HA 3KEQA 3MZBA 4EXKA 2FNAA 2PBIA 2ESHA 3I5UA 2L4MA 2EJRA 3DPLC 2QS4A 1T39A 4ENNA 2XXYA 2FQ3A 4HLYA 4L0YB 1J75A 4L5JA 3DFGA 4RPOA 4KICA 5IT9K 3RUMA 4MLQA 4OFJA 3N6UA 5H8HA 3C18A 5TU0A 2DI3A 3HTSB 3KP2A 1JQFA 5TRDA 1EH7A 2G29A 4CXFA 1M5DA 2I0CA 3C31A 5LBQA 4ENJA 4OFLA 5FHNA 4H65A 4X48A 1SQYA 2E1SA 1Y3PA 1XVYA 1MH3A 1MGTA 4P96A 2BYVE 3WGGA 4GXOA 1FQEA 3K01A 1KQ0A 4ASNA 1FQBA 4Q5TA 4YFNF 2D3IA 2L4AA 1LBCA 1Q35A 1J9IA 4MH5A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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