1HSJA

Sarr mbp fusion structure
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
487
structure length
487
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALAAAQTNAAAEFMSKINDINDLVNATFQVKKFFRDTKKKFNLNYEEIYILNHILRSESNEISSKEIAKCSEFKPYYLTKALQKLKDLKLLSKKRSLQDERTVIVYVTDTQKANIQKLISELEEYIKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of the SarR protein from Staphylococcus aureus.
pubmed doi rcsb
molecule keywords FUSION PROTEIN CONSISTING OF STAPHYLOCOCCUS ACCESSORY REGULA
molecule tags Transcription/sugar binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 143
structure length 487
sequence length 487
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-12-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF12802 MarR_2 MarR family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 1hsjA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1hsjA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1hsjA01
2FSWA 1QQIA 1QULA 5H8FB 2CW0F 2HKXA 2EV0A 3MUQA 4Q5SF 3VVEA 3RKWA 1U5TC 4P11A 5HS7A 4F7ZA 1ZMGA 4MQVA 2X7PA 1IXSB 1WI9A 1MXYA 3CO7C 4RAYA 4CO8A 5ILUA 4I8CA 2FBKA 3EYIA 5CYVA 3WGGA 1A8FA 4RPOA 4UV8A 3VXCA 4P0IA 2CGPA 3N5LA 4KDPA 1ZH5A 1S7AA 4X9TA 4BDLA 1XMAA 3FASA 4GYIA 1WKMA 2BGCA 4BHCA 1ULYA 3HSTA 1FTJA 1JXSA 1VFEA 1W5TA 4JWYA 2F6GA 2UXXA 3PQJA 1F4KA 2GHBA 1FP1D 1B52A 3ZMTA 3CUQB 4O3CA 2L01A 1BI2A 3KOTA 3IORA 1WWXA 1W5SA 2DQRA 1DTGA 2Q2CA 3H6UA 3EDPA 4ZECA 2ZJ2A 3U93A 2FOKA 3J80K 1GVCA 1B3GA 2OU2A 2H27A 2W24A 2XIGA 4P55A 5L3BA 4PGHA 4E70A 1BC7C 1DPUA 3CJNA 1U5TA 1FQAA 4PGGA 2FYIA 4KFQA 3H3UA 4XRFA 4XSXF 3UGWA 5ERIA 5EEHA 1A8EA 4HX8A 3I71A 3MZYA 5K1YA 2XKOA 2AYSA 2EFWA 5H8QB 4C0RA 4HTGA 1ZRFA 4OETA 2RKHA 3VE1B 2DWHA 4XLNF 3R60A 5HDGA 1PDAA 2Z5UA 2D45A 3GZGA 3IOVA 1U2WA 2FXAA 3RI4A 3R0AA 4Z7EA 3SFZA 4ZZAA 4NF4A 2A61A 4IVNA 5DTBA 3F21A 5H8HA 2O6GE 3RT8A 2PMUA 3LSLA 2PX1A 3WTUC 2A69F 2G9WA 3P9IA 2IA4A 4QWQA 3KP7A 3PD9A 2CMOA 3V8LA 4OMZA 2OBPA 4FX0A 3PMVA 4M71A 2EFPA 2QWWA 2F5XA 1TQIA 3I59A 4I0BA 1FQCA 2UVHA 1Z91A 1IXIA 2ZNZA 1B5HA 4YAHX 2LAOA 4I2OA 4FEBA 3HSRA 4P0GA 3IR1A 4KYSA 3K6WA 4JQFA 1DP7P 2DAOA 2PLYA 3OSQA 4U0YA 4MTDA 3G3KA 3ZP5A 3TUSA 1FBSA 4OIQF 4IF4A 4BXUA 4WEDA 1A7LA 1XGNA 3GFMA 3J7AO 3R0JA 1FTKA 5H6QA 3T8RA 4CICA 1D9VA 5L3EA 2FRHA 4HYEA 3L00A 3VOEA 3A09A 1LCFA 2O03A 5CVUA 2DPUA 3CI8A 3IK6B 2H4IA 3W9VA 2ZMBA 4KR5A 2O3FA 4OFJA 1AH5A 4GD5A 4EF2A 1MPBA 3K6UA 4C1UA 1MDQA 3K4UA 2V25A 3T9VA 3F72A 4BQAA 1DDNA 1XDUA 1PBPA 3WU0A 3E6MA 2F97A 3HPIA 3I3VA 2IVMA 1KU2A 1OLAA 2HXWA 3FXQA 2Y7KA 4OMYA 3PD8A 4F3PA 1JHHA 4IY5A 2VBXA 1UIVA 3T9UA 2O0YA 3D5LA 3I54A 3F23A 1LAHE 5H8NA 5K5RA 4FORA 1YW8A 2A3SA 4U1ZA 1N7XA 2A5TB 2LF7A 1CF7A 3V7SA 5DUKA 2CYYA 4HQEA 2F36A 1ZG3A 4G7HF 1LB2A 4UVCA 4PE5B 2UVIA 3Q5FA 2Z22A 5LGUA 4CDGA 4Q4ZF 3H6WA 1STZA 3TTMA 4KN7X 2V9VA 3DP7A 1O3QA 1SW1A 5CRYA 1MJ9A 1YPNA 4ESXA 4LONB 2DVCA 5E20A 1QNTA 2HDCA 2XX7A 4LATA 5CVIA 5ICEA 3O97A 2P7VB 2RNJA 4A6DA 1HKQA 4GCVA 4F2OA 2NS0A 4M6XA 2GRVA 3V8JA 5EHMA 3ILUB 1MY1A 3RLFE 4OQOA 1LNWA 4UNOA 4WXHA 2FNPA 3IWZA 4DQ2A 4R1HA 2P5VA 1T39A 2D3IA 1BIBA 3ILTB 4U4XA 1QW0A 1H76A 4WKMA 1CB6A 2VOOA 3FUZA 4OESA 3LFKA 1CGPA 1RIOH 2CSOA 4XKPA 1Z1DA 3GFIA 3BWGA 3DFGA 1T98A 4XBFA 3G3FA 4RGSA 3V7RA 1MY3A 4KYDA 1AL3A 3DP8A 5CM6A 2NUVA 5A2QZ 1YW7A 3V8KA 2DE2A 3I64A 2MLGA 2F7CA 1EH6A 1LVAA 3E97A 1HW2A 1BKAA 4BDRA 5EYFA 2V3QA 2W85A 4IO6A 2BE5F 2O51A 4QRZA 3L7WA 4MH5A 4AB5A 1MQHA 1SFEA 1B9JA 2ESNA 2RC4A 3OXNA 4G6QA 3TCGA 4A6EA 5BPIA 2V3TA 2XHDA 2ANJA 5TJJA 5I58B 1PP8F 2ZNSA 3QXMA 4U88A 3DEUA 1OPCA 4HX4A 1RUNA 1RYOA 1LAXA 2XASA 3O6IA 1ZREA 2ZMEA 4RYAA 2DI3A 1MPDA 4PZJA 3K02A 5FD5A 1ZTYA 2OA4A 1FX7A 4NF8B 3WTZA 3QUJA 2GXBA 5ISUA 1OVBA 4XKNA 3QAHA 2VBWA 3RTFB 2DOJA 1PP7U 4G8MA 4OU0A 3Q28A 2EV5A 3ZN0A 2VC0A 3LSFB 2FU4A 3TDJA 1B59A 2ONSA 2JTVA 4N07A 5FD6A 3HRTA 3JSOA 2I6EA 1YYVA 2ZFWA 1FTOA 4LMYA 1HBXG 1TQMA 2CZLA 1XCVA 3QPTA 3PUXE 3EETA 2RINA 5FHOA 3WG9A 3GYHX 1O3SA 4QFNA 2PBWA 4IO3A 3RTWB 3EYYA 2YPRA 2COMA 3FATA 4L9JA 3TFLA 3ZKKA 2EB7A 3MPKA 5DCFA 4TOZA 4YMAA 3KEQA 3FHZA 5J6XA 2MLKA 3OOPA 4B09A 2Z33A 1B9NA 5ICTA 2XROA 2W84A 2WWYA 1LDDA 1G3TA 1B32A 4H67A 4LQ5A 2MA3A 3HYIA 1ZU0A 2F8DA 3FX3A 3JTGA 2O68A 5CJ9A 3T93B 4R9FA 1VE4A 1M5BA 5AIQA 1Z7ME 2B3BA 2PT1A 4PFYA 3HO7A 4XIGQ 1YS6A 4WXCA 1LAFE 5E17F 1OLCA 2HQ0A 3PGFA 4ZYGA 4ENKA 3PPNA 4LB5A 1B6HA 5DT6A 3FJMA 1XVYA 4GQOA 2THIA 3FWEA 1X3UA 4DXUA 2HOEA 2OZZA 2OLBA 5KVRA 3BJAA 1LJ9A 2GHAA 5LBQA 2AL4A 2VHAA 3W6KB 1D3KA 2V93A 2VONA 1T6SA 2QMWA 4LZ5A 2OZUA 1MPCA 2ACJA 1B4AA 4ZE9A 2IPQX 1B9MA 3QAXA 2O61A 3RPQA 4P96A 4GWOA 3QK6A 4DDDA 1FY7A 2E7WA 4ZZDA 2O84X 1ZLQA 4JSOA 1XGOA 3CFLA 3W9WA 2R7DA 3K1MA 3F8NA 4G77A 1FSHA 3SEUA 2FA5A 3SEWA 3USDA 2REGA 2V1XA 3E5QA 3OD7A 5K5QA 3LBSA 3BBRA 4Y15A 1BTJA 1PB9A 4RGRA 3GO5A 4EQBA 2DLLA 2KIFA 4A0XA 4U21A 3V8XB 1WODA 4XSZF 2I4CA 3VODA 3F11A 1FQFA 3HIFA 2XAQA 1ZG1A 5J1DA 5TPAB 3WTYC 3K00A 1I69A 4Y17A 3GXOA 3KE2A 3WAEA 2O7IA 4F39A 2DO7A 3KP2A 4IGTA 2QM3A 2YPNA 4I7HA 2RDPA 1FQDA 1G3SA 2P8TA 1IN8A 4BDOA 2RC7A 3VV5A 4RK2A 3FF5A 3U1OA 1IN6A 3WE3A 5L9OA 2AL5A 1FPQA 1SI1A 4AIJA 1KQ0A 1S8NA 5TP9B 1TFAA 2Z3YA 4O3MA 3EF7A 5HBCA 3G3HA 3S9NC 2HAVA 2DFIA 4KUMA 4GRKA 2A6HF 2RQPA 1MGTA 3P9CA 1ATGA 3KFMA 5DD4A 3K1NA 5A2QK 2AIXA 3MC2A 4LJZF 1PUEE 3TO6A 5JK4A 4E0XA 2IA0A 2P6TA 5CBRA 3H06B 2YX7A 4EJTA 3H7MA 2A6EF 3IRRA 3HCQA 3HOTA 1NKXA 4Q48A 3GFLA 3VVFA 4KT5C 3U1DA 1MQDA 2G7UA 3MVYA 3M3KA 4EMSA 3VDFA 3S9EA 3SZPA 5FHMA 1DSNA 1H45A 4HF0A 5HLGA 4P5OA 4OFOA 5ILVA 5I56B 4LK0F 4JSDA 2FF4A 2RGVA 4M1VA 1XGMA 2H25A 1P4AA 5AA3A 2OAZA 4XLPF 4FEDA 1MDMA 2M8EA 3U92A 3HV1A 4LLGF 3KG2A 3ZS6A 5H8HB 2DYXA 2IT0A 3K0VA 1S6LA 5F6FA 5DVFA 4NF5A 3I58A 3ECRA 2X4HA 1US5A 2HTJA 2EFOA 3KP6A 4P9UA 1J75A 2STWA 2OZ6A 1BI0A 1TXFA 1TTYA 2PQ8A 3MJNA 1NNFA 2W25A 4H1XA 5LGNA 3UIFA 4LB6B 2M1BA 4HLXA 4MHGA 3VLVA 2Y7WA 5I2NA 2FBHA 4LD5A 4H8IA 1IIWA 3H3GA 3QSLA 2JZYA 5F1RA 3D0SA 3LA2A 2I4BA 4EJUA 2PBIA 2Y0MA 3BROA 3REOA 3RKYA 2NRAC 2XD2A 2B0LA 4G6DA 5ITOA 2R71A 3F3XA 3LQQA 2HQRA 3FVGA 3BJOA 4HZFA 4KI0E 3TAJA 1LFIA 1S29A 4HA8A 3C33A 4LGWA 1SFUA 2P5KA 1D5VA 1ZIUA 2FNAA 5DCMA 3U9GA 1JW5A 1NH8A 2I3WA 3F6OA 3GXAA 4BHBA 4I98B 5JR3A 4UA8A 4GXSB 2V79A 3LUYA 3TYHA 4H5GA 1IW7F 1HKSA 4G8NA 1LCTA 1GXQA 3T8TA 4YU0A 2XXVA 3QP6A 2EFNA 4LFUA 4CXFA 3COAC 5HLHA 3EPEA 2PG4A 4FX4A 2PJPA 2I3VA 3SERA 1HSEA 4BDQA 2XAFA 3CDHA 5TRDA 1B0HA 2HGCA 2OQRA 3S4UA 1I1GA 2MH2A 1PB7A 3KFWX 4BAYA 5ICCA 4HV6A 1BC8C 3TO9A 3I5UA 1MM7A 4ELPA 2E1NA 5TU0A 1Z7UA 3VB2A 3CG3A 1ODDA 5K5OA 5H8NB 3OSRA 2Z8FA 4EJWA 2Q2AA 2EWNA 2VT3A 3KGCA 1Q1KA 1PC3A 4R6YA 1R9QA 3TO7A 5K2XA 3HRSA 4ZDMA 3PFIA 1POY1 2E1SA 5AA4A 5D5XB 1QVSA 3HRUA 4PETA 3PU5A 3R26A 2BBYA 1EZPA 1BM9A 1IN7A 3V4GA 3I5OA 4JBZA 5DYHA 5JI6A 1TW2A 5I2KA 3R6SA 3KSXA 3GFJA 2YLNA 3NRVA 2Z99A 3MZBA 1F5TA 1SW5A 4G9YA 1LFHA 3CSGA 3M7GA 3WU1B 1AOVA 4DCYA 2OJTA 3DPTA 1MJBA 4LZ7A 2EA2A 4FHTA 4CZZA 4O6JA 2AXLA 1P1QA 1J5YA 1AOYA 1SD5A 5CVRA 3R7XA 5DEQA 3K6XA 2HR3A 2HEUA 5KCJA 3LSTA 3T5XA 1U78A 4OWDA 2ESHA 4AB6A 3MZHA 1N3XA 1I6XA 4R72A 3O2PE 3WODF 1ZLKA 2GH9A 3MZ1A 1XDSA 4H0WA 4RGXA 1I5ZA 2IJLA 3T9XB 4RA1A 1B51A 4FATA 3M8EA 2ZO4A 4U7DA 1SVXB 1AIVA 2Q0OA 3E5XA 5AONA 3T22A 4YKJA 1KYZA 1R00A 4BH9A 4F29A 2H6BA 2G93A 2QS4A 1IQ7A 4WEPA 3V83A 3SEYA 5ELVA 1P4WA 4EGZA 4OIPF 3IKTA 2W7YA 2QQ9A 5FFZA 1P1WA 2L02A 2H98A 1U6GA 4EUOA 3FV1A 1HXDA 5D4RA 2QL3A 4GXOA 3C1DA 2QQAA 2P2AA 2DTRA 4NF6A 2ZMEB 3OEMA 4MLQA 4OIOF 2VOZA 3RDIA 2RVCA 4RY1A 3LA3A 4LVQA 5DVJA 1SMTA 1BP5A 2A5SA 1OKRA 1QJMA 1LB9A 3E3VA 5AA2D 5M2VA 1LQ1A 4PFUA 3GLXA 4WXJA 3RGYA 2HZKA 5LEKA 3C36A 4ONYA 1MY0A 3ULQB 1ZRCA 3D4CA 3L6GA 3MQ0A 3VEPA 1B0LA 1B7ZA 3G7WA 3PUWE 4ZEDA 4O5VA 1XS5A 4GFRA 1JW1A 2P1SA 4KCCA 3VFJA 5CMMA 1ONVA 4UHTA 2Q8JA 4MNUA 4Q5TA 3KN8A 2OD5A 3AXFA 2Y84A 2ZNYA 5D6FA 3N94A 4R79A 3RTRA 1QKBA 3GZ5A 4AWXB 3B73A 4POXA 3HOSA 1SMYF 1ZARA 3JAMK 2NNYA 2GIVA 2QSXA 2XAHA 5KDTB 2ISZA 3ONMA 2DWIA 3L09A 3GBBA 4BHPA 2YR2A 4GL8A 1OYIA 1S7OA 5D4SA 1FW0A 2NXOA 5CC2A 4BDNA 2Y7IA 1V4RA 2F7BA 3GX4X 3PPQA 3J81K 1FTLA 1Y9UA 4KNYA 3B6QA 5JTYB 4GIZA 2DP8A 4KFCA 1YW9A 1FCKA 3JZJA 2DK8A 1FQBA 4JWXA 1AWCA 1DPEA 4KIBA 4ECFA 3G3ZA 5IT9K 3CIJA 4LZ8A 1QUKA 1W4MA 1Y3QA 3EHTA 4F3BA 1M5CA 1HW5A 3S2VA 4OTEA 1KU7A 4G4PA 2PN6A 3TCFA 1J1NA 4ESFA 5LHHA 1Y4TA 1ZRDA 4KQPA 1SYIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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