1MH3A

Maltose binding-a1 homeodomain protein chimera, crystal form i
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
421
structure length
421
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTAAAAAISPQARAFLEQVFRRKQSLNSKEKEEVAKKCGITPLQVRVWFINKRMRSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into binding cooperativity of MATa1/MATalpha2 from the crystal structure of a MATa1 homeodomain-maltose binding protein chimera
pubmed doi rcsb
molecule keywords maltose binding-a1 homeodomain protein chimera
molecule tags Sugar binding, dna binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 144
structure length 421
sequence length 421
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF00046 Homeodomain Homeodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.60 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Homeodomain-like 1mh3A03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh3A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh3A01
1US4A 3H6VA 5F0CA 5H8SA 1MXUA 1JW1A 1TWCJ 1Z7NE 2I49A 4LZ8A 4Q0CA 3W9VA 4IO3A 3M3FA 1B3LA 5EG0B 4LVQA 3JREA 2DMQA 2RKMA 3SEUA 2UVHA 4XK4A 3GTQJ 1SDXA 4ECFA 1MY2A 3HEFA 4R2FA 3PUYE 3JRCA 4IY5A 1URDA 3K7AJ 4IGTA 5DYHA 3GTOJ 2RINA 5K7FA 3N94A 1XOCA 4DIGA 3BQZA 1AIVA 4XXUA 3S9NC 4MBPA 2MW8A 3SERA 4IO5A 1XHYA 3O9PA 1MSFC 5E3MA 2LK2A 2UVGA 4M3FA 1URSA 4ISUA 2VHAA 1ZJLA 1P1WA 3I3VA 2H8RA 2ME0A 2I0CA 3K4UA 4XKRA 3S1QJ 3HOYJ 2THIA 3Q29A 1GVDA 1UHSA 2B63J 5I2KB 1XG1A 4CYCB 1B1XA 3OIOA 1H8AC 1OVBA 4YKPA 2QJEA 1ETQA 3RZDJ 1A40A 4MLOA 3HOVJ 1M5DA 3THIA 1Z77A 2CMOA 2UVIA 4JSOA 3RTFB 3G1MA 4LUBA 1MPDA 4NF5B 5B70A 1MQDA 2DOJA 3RGYA 2UVJA 1LFHA 4NF4A 3TTKA 3VPRA 3G3JA 3LC8A 5ICTA 3QUFA 2NVTJ 2REJA 2DMUA 3T96B 2DMTA 4BDNA 1IDYA 4F1UA 3DP8A 3PO2J 4HNVA 1N7WA 3FASA 5K7HA 4X1EA 5EGOA 1OFCX 2F36A 1M5CA 1LSTA 1LLSA 4FE8A 1ETWA 4RPOA 4OXVA 3TTMA 1B40A 5GP9A 3CSGA 1U78A 3JZJA 3G1LA 2ZYOA 4W1UA 3SESA 2H4IA 1A5JA 4ESXA 2AIXA 2RF1A 5JTYA 5IP7J 3O8GA 2L9RA 1FTMA 1X2NA 4V2GA 4I9DA 4QFLA 1MXVA 3TEPA 4YICA 3A03A 4ZEKA 1RETA 1Y1VJ 2JA5J 1NL5A 5L8DA 4XRSA 5C4XJ 2K9NA 2VD3A 2EZHA 4POXA 2HFBA 3MZ9A 1H45A 1LFUP 2O68A 1B2HA 3ONMA 3K1NA 1JTXA 3CSBA 1R9QA 2BJJX 4EDPA 2I10A 2Y7RA 3G3FA 3W15C 2UYEA 4GD5A 3M8UA 4OETA 3LSXA 4DCYA 4DDDA 4BLAA 5I59A 1B7HA 4OTEA 5A5XB 4N6PA 4NTLA 2NOOA 1MPBA 1ZK8A 1JEUA 3O97A 1XVXA 3Q28A 2JA7J 2LY9A 1TFAA 1D4NA 1QUIA 1B5IA 3TQLA 1FJLA 2NVXJ 4KHZE 4JDFA 1VF9A 4NF6B 5I2NA 1DSNA 5H8NA 4N13A 5EF6A 1ATGA 2JJ7A 4H0WA 1QRYA 2ZYKA 4LONB 4WEPA 1JUPA 2Q89A 4OVJA 1XS5A 1NNFA 2QCOA 2PMSA 4C3IJ 2R0QC 1R9LA 3BR3A 1JNFA 4K3FA 1MBKA 3OENA 2HOTA 3PUWE 4JX5A 1PUFB 3OSRA 1JW4A 1VFEA 2DA1A 1H43A 1EH3A 5E3LA 2FA7A 2GHAA 2R92J 3B7DA 1I69A 4M3DA 3QIMA 3K2DA 3CG1A 2MSYA 3U92A 2I3VA 2R5ZB 2LTPA 2Q88A 3U94A 5ELVA 1OMPA 3G1OA 3F0CA 1JVYA 2V3QA 2Z8FA 3T66A 1B58A 3S9MC 1CE2A 3T9XB 1FQBA 2NS7A 1LBBA 3PO3J 1DPEA 3LSRA 4R2BA 3G3HA 1LB9A 2P2AA 5C4JJ 5CMBA 3TDJA 4OHNA 4LZ5A 5KDTB 1I3QJ 2L0KA 3DP6A 1IQ7A 1HSJA 4YAHX 3VDFA 2ME6A 1LAGE 1F43A 1D9YA 3LBSA 5I58A 1M5EA 2YLNA 4F3BA 1QVSA 2X7PA 1VR5A 1UIUA 1IUDA 2VD2A 5CBSA 3GTKJ 1QW0A 3LOCA 4LQ5A 2XXXA 3EF7A 3PD9A 3OSGA 4ND9A 2LVSA 1VNDA 1JQFA 4H6DA 4F31B 1MQIA 1FQEA 3K6XA 3O6HA 1B51A 4Y52J 4KYEA 2JWTA 3E3KA 3KSJA 5LOMA 4YB7A 3N5LA 3R26A 4QSDA 4XIGQ 5H8HA 3H3GA 5TP9B 4F39A 4GOTA 3BR0A 1HDDC 3FUZA 3JRGA 4DCXA 3TW7A 4HTGA 4OYVA 5KCJA 4F1VA 4BDMA 4ONYA 3JV9A 1GV8A 3BG9A 3SKPA 4KYDA 1LE8B 5I56B 3D1NI 2NVYJ 1S9TA 2LLKA 3RN8A 4YKIA 1B5JA 3EHUA 4KI0E 2E0SA 3ZKKA 3GLBA 4UUTA 4G68C 2XXIA 2IBDA 3UGWA 1MY4A 4X1BA 3VLVA 4EUOA 2DA4A 4FTHA 3HOUJ 4F19A 1Y3NA 1Y1ZA 1AU7A 1USYE 4KCDA 4B1RA 1RR7A 4H5GA 3IV5A 2VP1A 3F11A 3IR1A 2TRTA 4C3JJ 4KQPA 3TELA 3EHTA 2ZNUA 1ZTRA 2VKEA 1APLC 1A8EA 1IXGA 2UYFA 3ZQCA 4YMAA 1EZ9A 1CQTA 3V5AA 3S4UA 3AXFA 2V3UA 2HCAA 3C9HA 2JA8J 4YB5A 3E9XA 1TWFJ 4PETA 4J19A 1ITYA 3HN0A 1IDZA 3CMYA 3B6WA 2EQRA 1TWHJ 3IX1A 1IIWA 1H3DA 2XHDA 5L9MA 4G8HA 1A6IA 1O7TA 3FIWA 3MP6A 5FKMA 1VFCA 4N07A 4A3IJ 3I5OA 4H8IA 4FE7A 3BG5A 1B46A 4IO7A 3R6UA 1B3GA 1RYOA 2O69A 2O6AA 2B3BA 1LCTA 4D5CA 4W97A 4QFPA 1MY3A 4IHYA 3HO7A 3TEDA 5TPAB 2GLOA 1JW5A 2F7AA 5K2YA 3T93B 4A3DJ 5L9SA 5IYBJ 1SI1A 3SFIA 1I50J 3PMVA 2OZZA 3LSPA 4NE4A 3ZQLA 1UMQA 3OEMA 3FVGA 3BR2A 4B4CA 5CMCA 1H44A 2DJNA 5AA2A 2E1SA 4MLVA 3KEIA 3CQZJ 3UIFA 3CI8A 4PFWA 2HXWA 3MKLA 4QHQA 4BDLA 2FX0A 4ELOA 1FTLA 3M3KA 2DE4A 5EGOB 3L1PA 2KLFA 2UXAA 2ECBA 3HV1A 3SETA 4E0WA 2QS4A 4LZ7A 4F3PA 1YRNA 4I62A 3N6UA 3KGCA 2XGDA 5I57B 2OJTA 2ZXTA 1Y4CA 1FW0A 1S50A 4I76A 4DE8A 3KN8A 2DQVA 3RKQA 2X6OA 1MRPA 2PT1A 2AL4A 1B05A 4D5FA 3Q25A 3IB1A 3MW0A 2DMNA 1IJWC 3A02A 1HLVA 2V93A 2DA5A 2Y31A 1PBQA 3PPOA 1LBCA 1B0HA 4GLIA 3C4MA 2DMPA 2XD3A 2O9LA 2Z8DA 2DA3A 5FTIA 2QRYA 1Y3QA 5HODA 1FTJA 2DN0A 1MH4A 1FTKA 2LKXA 4Z0IA 3TKDA 1MM7A 1DPPA 5H8FB 1D5YA 1UQWA 5CI5A 2HOAA 1R6ZA 3DM0A 1GR2A 4ZEIA 1D3KA 2REGA 1B9JA 1G2HA 4NMYA 3PUZE 1JKRC 1JEVA 1US5A 2YUSA 1A7LA 4UUSA 3UK4A 2OWSA 4NEDA 1PEBA 2OPTA 4PP0A 4IHWA 2XD2A 1TFDA 1I6BA 1MY1A 3KZGA 1PC3A 2I58A 2ONSA 5EEAA 1AKHA 1FTZA 4KD5A 2NVQJ 5CMKA 4RNSA 1FQAA 4IGRA 3MPKA 2V3TA 3G7WA 4PFYA 4ABZA 1Y9UA 2NOGA 4U21A 3V8XB 3S15J 5H8NB 5F04A 3FJMA 3QYTA 4EQ7A 3Q0UA 5TU0A 3TP3A 3CIJA 1S7YA 3PPRA 1XT8A 1AL3A 2RAEA 3GBAA 3OO8A 3VE1B 4MH5A 1UTHB 2OWTA 4RK2A 2M2EA 3PPPA 2XX9A 4QSCA 3IJOB 1B0LA 2DWJA 2WB1N 1SYHA 4MLQA 1F9BA 3ZQIA 1B7UA 5HM4B 1HF0A 4YZZA 3TCGA 2Z22A 3TCFA 1U9OA 2K9QA 2G29A 3S16J 4F2OA 2XXQA 2O8KA 4FORA 5CM6A 1T33A 3CDLA 2PX1A 4RJZA 4FJPA 3JRHA 5ITOA 2R6GE 4I6ZA 1BW6A 3IO6A 2PMZN 3HGGA 4JWXA 5AE4A 3G3KA 4H8JA 2QL3A 3S1NJ 2O84X 5F08A 1WODA 5H8QA 4RK9A 3E7LA 4GVOA 3K00A 3H03A 1NK2P 2L7ZA 5F0FA 5FHNA 3NAUA 2DVZA 1N0TA 3ZQHA 5JLWA 3HKZN 3E4RA 4JX4A 3FGSA 1AHDP 4GRKA 2CRGA 2M9HA 4D7MA 1SI0A 1SD3A 5AA4A 4RDUA 4F1YA 3IJXB 4BDOA 2F6GA 3FJGA 2DA6A 3DLNA 3KSXA 1AMFA 4BY1J 2G93A 4R73A 3B6TA 5J1DA 1P1UA 2HAVA 3LSFB 4DW6A 3VXCA 1Q1VA 2FQ4A 3IOUA 3T9VA 3QAXA 2EZIA 1JUSA 3LSJA 1QUJA 4Q8RA 5CMMA 1YTVA 3QSLA 1JJ6C 4KFQA 3IOVA 4Y7NJ 2H9BA 4WKMA 4XICA 4G8NA 4ZECA 2E2JJ 1P99A 3PU5A 2F35A 4G68A 2H5YA 2RC7A 3R7XA 1MBFA 3GBGA 3B6CA 2QS3A 4BKXA 2RCAA 3N6TA 1JVXA 1ZQ3P 3I6VA 2ABHA 3UA8A 4DLDA 1W0TA 4LP2B 1B52A 3L6GA 1MXYA 5KCJB 2Y7WA 2NWJA 5J1YA 3FV1A 4R72A 4QRZA 3I4MJ 3WHBA 2PYYA 2XXTA 3IH3A 3C36A 1NK3P 1QPIA 3B6AA 3IO4A 1B8IA 4FISA 3FISA 4Q30B 1ZR2A 3OSFA 2XX8A 5CRYA 5M3MJ 4QFNA 3IAZA 1OLAA 5JEIA 3K02A 1B3FA 5E3NA 1RESA 4XIDA 3CG3A 3VVFA 5EZGA 4R6HA 2QS2A 5J3LA 4F3SA 3HHFA 2GH9A 4BY7J 2HDDA 1OCPA 1B5HA 2X9DA 1IEJA 3SDFA 4QFKA 3VV5A 3PD8A 3LSGA 1OQGA 3CVGA 4ELRA 1S7EA 4QIWN 3TZAA 3K6WA 4F3GA 4ZEDA 1ETXA 4L17A 2XSDC 2MG4A 4A3LJ 4YU0A 1MY0A 1WI3A 2WV1A 4RY1A 4TLMB 4M3GA 2ID6A 1N76A 3VLWA 4DYCA 3MBPA 2ZB9A 2P1SA 2H1KA 1YAEA 4ESWA 1FQDA 3C2BA 1MQGA 5EZHA 3ODBA 3IK6B 1TT1A 4U4SA 4C1TA 1AOVA 1FIPA 1LFIA 4KCCA 3C31A 3H4ZA 1WPKA 4KYSA 4ZEBA 3FXUA 2XXRA 3K6UA 3EN3A 1WCMJ 2JA6J 4HCWA 5B7DA 2ZYMA 3MN2A 2DVCA 1OIBA 3VXBA 3DELB 3OO7A 3HOZJ 4FEBA 2IA4A 4FIMA 4LOCA 4MO7A 1WH5A 1NH8A 3K1MA 4OFLA 3G3GA 4A93J 3ILTB 1PB7A 2QS1A 3GBBA 2CUEA 2HQ0A 1H89C 1HCRA 4DXCA 2E1OA 4BXXJ 2H25A 4O3AA 1N84A 4F22A 3E13X 4C3HJ 4RA1A 5C44J 2LR8A 4RYAA 3OD7A 3FJ7A 4ELQA 1BW5A 5C3EJ 1FTOA 1HOMA 4G12A 1ETKA 4H67A 3RPWA 5JK4A 4BDRA 3KJ7A 3TPAA 3K2AA 3KN7A 2F97A 4JB7A 4MFEA 3P7IA 1YRNB 2VOZA 4OFOA 3O2AA 2O51A 4P0GA 2QPQA 1FQCA 1N7XA 1RYXA 5FJ8J 4PFUA 3SJMA 1MSEC 2E2HJ 1B7ZA 1E3OC 3IOWA 1NNTA 1SYIA 4QF9A 2HZKA 1HDPA 2AO9A 5BNGA 2FNCA 2RCBA 1MQHA 1POGA 1LCFA 2M8CA 3SEWA 1ENHA 2YS9A 2Y84A 1EU8A 3MJNA 2F7CA 4IY6A 4DZPA 1MG1A 2K9SA 1URGA 1WGXA 2NS8A 4A69C 4U4XA 3Q3SA 4U2RA 2XPUA 4EQ9A 2YU9J 1ELJA 4AYBN 4LATA 1TWYA 1LFBA 1R1NA 2X7QA 4UACA 2Q2CA 3D4GA 4OFJA 2R5YB 2ESNA 2IEEA 4XTCQ 3MUQA 2Y2ZA 4XRMA 1MPCA 3EPEA 1JT0A 4EQBA 3ZSFA 2I3WA 2CQXA 4MFIA 3FVKA 1H76A 4UUSB 2Y9YA 2RC8A 1B3EA 4M4GA 5IOYA 1ZU0A 3TW6A 3KN3A 4IO2A 2R93J 2F8DA 2TCTA 3MZBA 4AB6A 2HEUA 4A3CJ 4YKJA 3PPQA 1ORKA 2DYXA 1QJMA 1BIYA 4A3GJ 3S1MJ 2XXVA 3IORA 4U23A 4A3KJ 3FXRA 4OEUA 3PGFA 4ELPA 1NKXA 2Q2AA 3O29A 2VKVA 3EQ1A 5EYRA 1I6HJ 2DXYA 5A5XA 2D21A 4AQ4A 3EHSA 2OF7A 1BP5A 5DS9A 2VGQA 1SANA 3HOWJ 1DOTA 4GFBA 1ZBMA 3MAMA 2I48A 3O8HA 1IZ1A 2HZLA 2F6PA 4HW8A 1LAHE 1NH7A 4NF6A 5BUUA 5DTBA 3JRBA 1IRZA 1D9VA 3TFLA 3OOUA 2I4CA 2AHQA 3PM1A 3SEVA 1DU0A 1GTKA 1SW5A 4QTRA 4OERA 1MH3A 4IO4A 3S2VA 5H8QB 1IC8A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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