1MH3A

Maltose binding-a1 homeodomain protein chimera, crystal form i
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
421
structure length
421
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTAAAAAISPQARAFLEQVFRRKQSLNSKEKEEVAKKCGITPLQVRVWFINKRMRSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Insights into binding cooperativity of MATa1/MATalpha2 from the crystal structure of a MATa1 homeodomain-maltose binding protein chimera
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding, dna binding protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords maltose binding-a1 homeodomain protein chimera
total genus 144
structure length 421
sequence length 421
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF00046 Homeodomain Homeodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.60 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Homeodomain-like 1mh3A03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh3A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh3A01
5LOMA 3RQIA 2ECCA 3TP3A 4OFOA 3FK6A 5AA2A 1AIVA 5IPAA 3PMWA 1Z77A 4DDDA 4U2RA 3IL1B 3FASA 3OELA 4W97A 2I3WA 1WH7A 1FTMA 2Y31A 1SBPA 2OZZA 4B1RA 5DS9A 1B3GA 1GGGA 1A7LA 3ZQFA 1MY4A 3K1MA 4IB2A 5DEXB 5FKMA 3E7LA 2ZNSA 5IOYA 1MXUA 4U1OA 2CQXA 1MG1A 4IO4A 2K40A 3ZQLA 3RKQA 4F29A 2HAVA 4EF2A 3UGWA 4H5FA 3KBRA 1B0HA 1QKAA 1AHDP 3QPSA 2Y7RA 3TP0A 3R26A 3BR1A 3S1QJ 2XD3A 1TWCJ 4RBOA 2KDZA 3O29A 3C4MA 3SEUA 3BTCA 3PV0E 1MXVA 3MQ9A 3B6WA 4Y7NJ 1P1NA 5TP9B 3DCFA 2IBDA 3BTIA 2DA3A 2X7QA 5K7HA 4MFEA 2Y7KA 5AA2B 4THIA 1B51A 1PBQA 4JWYA 3G3IA 5DTBA 2XXYA 3CQZJ 4DYRA 3FJGA 3CCYA 3GTJJ 4EDPA 4OFJA 1OMPA 3S4UA 4DCYA 1IUFA 4C3IJ 1OQHA 4YKKA 2L0KA 1ETVA 2ZYKA 1UQWA 2Y9YA 1UIVA 3RY3A 4DZ1A 2ZNUA 4UUTA 1O63A 2F36A 2XRLA 4XK4A 1ZKBA 1ZKGA 1MPBA 4LQ5A 2R0QC 5K2YA 4OZ9A 1PEBA 4YB5A 3KSXA 2VI6A 5GPAA 4GIZA 2V84A 3HGGA 2JA5J 2EZKA 1DOTA 2E1SA 4OHNA 2M8CA 2O1MA 2WAQN 1P7IA 4ZECA 4G68C 4N6PA 1GUUA 4R9FA 1TWFJ 1MQIA 3SESA 4EQ7A 3S9LC 3EHSA 4NF6A 3U93A 1R1NA 2AYSA 3OENA 4FORA 1IV6A 2Y7WA 1JEVA 2DE2A 1SW2A 4M3BA 3SERA 3B6TA 3L1PA 2O69A 1P1OA 2O84X 3SKPA 1MS7A 3PUXE 4FATA 4QFKA 1JTYA 3EQ1A 1JT0A 4GFRA 2IA4A 3RUMA 2EZLA 3S16J 1T33A 4QHQA 4PE5B 1BP5A 1B72A 1JJ6C 4JWOA 2ESNA 3HB9A 5EHSA 3BG5A 3GTKJ 1IZ1A 2DOJA 3WAEA 1S7YA 1E3OC 3MVXA 5C3EJ 4YZZA 5IP7J 4LZ7A 1IXCA 2DYXA 1B4ZA 2XX7A 3Q26A 2XXVA 4H67A 1DPPA 4O3CA 5CMKA 3V89B 1MH3A 5I56A 5F0FA 3K6UA 2LY9A 1NK3P 1B3EA 4GFBA 1D3KA 4GXSB 4D7NA 2AL4A 4R6YA 4H8JA 1JW4A 2XXIA 4F2QA 3VLUA 3UORA 1S7EA 4LQ2A 5I58B 3PD9A 1FQCA 1Y1MA 4C1TA 3Q25A 2LP0A 3TZAA 4QTRA 3A03A 3HHFA 3MAMA 3MC2A 1H76A 4XRMA 2NVUB 4I9DA 1T56A 2H98A 2QS2A 1IG7A 5HPQA 2G0EA 3HBLA 1B46A 1B72B 2RC9A 2TCTA 3UA8A 2B65A 3IB1A 2MSYA 2NS8A 3GXAA 4YB6A 1LCTA 5CC2A 3PPPA 2ME0A 2NVTJ 3LC8A 2ZB9A 1Z7ME 2I0BA 1BW5A 1FTLA 2RC7A 3G3HA 1K83J 5I56B 5CMMA 4DZPA 4Y52J 2I58A 3GBGA 1URDA 5E3MA 4G77A 5F1QA 2UYFA 4FEDA 3O28A 4A3EJ 4GQOA 4YKPA 2DTZA 2LVSA 1O4XA 3D4CA 2RINA 1XC5A 1HCRA 3VDFA 2F97A 3GBAA 2A5TA 1ATGA 1PDAA 2DJNA 3GTGJ 1IITA 1QW0A 3VV5A 3ILTB 4MLVA 3PPQA 4XIDA 4AB6A 1ANFA 3C2BA 4A3KJ 1POY1 2QF7A 1MBKA 3ZQCA 1LAXA 2O9LA 2QJEA 4G8NA 1A6IA 3K0VA 4L17A 4P0IA 3VXBA 2XPVA 3FVNA 3F0CA 2GLOA 4GL8A 3FJ7A 2DA1A 1M5EA 1SW5A 4IHXA 3FXUA 3O9PA 4A3MJ 5M5XJ 3IK6B 3IH4A 3D1NI 1RKTA 3PO3J 5CMCA 4F22A 3G7WA 1VR5A 1MXZA 4U4XA 2QPQA 1SW1A 1I6QA 3W9WA 5J1DA 3TTLA 4R6KA 4N13A 1VNDA 1B9JA 3THIA 1HDDC 3JRAA 1SVXB 3G3GA 2DA6A 2P81A 1IRZA 1MRPA 3IAZA 2LTPA 3RGYA 1JT6A 2CZLA 3HDDA 2QS4A 3VE1B 3JRDA 3LSWA 3SEWA 3C33A 3MP1A 1K61A 4IHWA 3IOUA 2HQ0A 1WODA 1BJZA 3MKLA 1UHSA 4MF3A 5F1JA 1U8BA 1IIWA 1B7HA 2UVJA 3BQYA 2HDDA 3B6CA 4YKJA 1LFHA 1JVXA 3TCFA 2DS9A 3VFJA 2QSXA 2XXPA 1LB8A 1PB8A 3S9NC 1DTGA 3HN0A 1JUSA 5B7DA 1BKAA 2EH3A 2H99A 3K6VA 4LATA 2K9QA 3N26A 5KCJB 2RKMA 2JA7J 2OBGA 3IO6A 4P11A 1QVTA 2PX1A 4TOZA 4JSOA 4RPOA 3K00A 3T66A 4M3EA 1TWGJ 4QSHA 5M2VA 4UACA 1XS5A 4KI0E 3PM1A 1A55A 1M5BA 3Q0VA 1WPKA 3H06B 4XXUA 4TQUQ 4G68A 4YMAA 2I48A 1NNTA 3FXRA 3A01A 3MBPA 1FQBA 2F34A 1MY1A 1ZIUA 2GHBA 4TLLB 5H8NB 2CMOA 2HXWA 2PBWA 3CDLA 2X6OA 5KZTA 3C32A 3BR5A 3FIWA 4AQ4A 1YRNB 5AA4A 3MVPA 5EHMA 1OFCX 9ANTA 2Z8FA 4H5GA 2V93A 5I57B 2NVYJ 3QQAA 1Y1WJ 2D3IA 2NUVA 3C34A 2XB0X 4FECA 3CG1A 3AXFA 2V3QA 3TEPA 2Y2ZA 4DYCA 4M4GA 4X9TA 4KFQA 4BDRA 3O6HA 4KD5A 3IX1A 1M5FA 2F6PA 4Q30B 4QRZA 5E3NA 3N6TA 4ZZEA 1QRYA 4BDNA 1MXXA 5L9MA 3DP6A 3GTLJ 2DWHA 4XIGQ 2K9NA 2DXRA 2NXOA 2DMQA 1B3FA 1X58A 2GRVA 1VFDA 4OMBA 5J1RA 1N7WA 3H3GA 4F3SA 3O2AA 4DLDA 4NE4A 2I4CA 3TAJA 1JKQC 4M3GA 1KWHA 1Y4TA 1B4HA 1LE8B 2ANJA 3TEDA 3A01B 2H5YA 5C4XJ 1ETYA 1MXYA 4ELRA 1TWYA 1ELJA 1MSEC 4AB5A 2WB1N 3I5OA 5EF6A 1JKRC 2R5ZB 1F43A 5AA4B 2HFBA 2XX9A 4S0HB 4H6DA 3OD7A 4OFLA 1SD3A 4F3BA 3Q28A 1BL0A 4YU0A 3HKZN 3IH3A 1F9BA 1FJLA 1VI0A 3LSXA 1IDZA 1PB7A 3FVKA 2FD5A 1II5A 4FCYA 3RTWB 1VE4A 5E3LA 4EF1A 3T9UA 5TP9A 1JTXA 5IYDJ 4R73A 3A3UA 4Q0CA 3IH2A 3Q0UA 2ZYNA 4A3JJ 3IOWA 3OOAA 4Z0IA 3VLVA 3DELB 3PUWE 1P1UA 1MDP1 1QKBA 3TUSA 4NF4A 4A93J 3MJNA 4JSDA 4Q5TA 1PUFA 5FJ8J 4MO7A 5E3OA 1B52A 5AE4A 3A09A 4GRKA 4FAJA 3QUFA 4F39A 1TWHJ 3CFXA 3WAFA 1I6HJ 1OIBA 3ECRA 2D5VA 4EQ9A 3BFTA 4BDMA 4A3CJ 1FCKA 1SI0A 4WKMA 4JDFA 5I2KA 2E2HJ 4M3DA 5FKLA 2DA7A 1Y1ZA 3JRCA 1JNFA 3S17J 1AL3A 3H7MA 1XHYA 1URSA 2DA2A 2DWIA 1XOCA 3G3KA 4AC0A 4RYAA 1USYH 5EGOB 3IR1A 2HYJA 1O7TA 1SI1A 4HS7A 5F7VA 3SEXA 3K4UA 2HOAA 1JW1A 4NEDA 1ETQA 2OF7A 1ETOA 1JQFA 2B3BA 3H4ZA 1OLAA 4RNSA 5ITPA 4IEJA 3K2AA 1PC3A 4JB7A 4F1UA 4NF4B 1H8AC 4YICA 1B32A 1PUFB 4ZEBA 3I3VA 3IORA 2UXAA 3JR9A 1R9LA 5F27A 3OEMA 3LSFB 3I4NJ 3WHCA 1ZTYA 3USDA 3S9EA 3HOVJ 3PMVA 4NDLA 2O7OA 1IXIA 3BR6A 5CI5A 3MZBA 1JETA 4LA9A 1OVBA 5J1UA 4MBPA 3UIFA 2R9JA 2XXTA 2XHDA 1MBEA 1NNFA 4OENA 4YKIA 4ZEDA 5I2KB 3L6HA 1ZBMA 1EH3A 1NH7A 3PGFA 2AO9A 2XB5A 1FTZA 1A54A 1GV8A 5DVJA 3PO2J 5M5YJ 1RKMA 2REJA 3G1LA 1OQGA 3CG3A 2F8DA 3R6UA 3ILUB 1EZPA 2XPWA 5CRYA 1LAGE 2OLBA 3ZOBA 3CVGA 4X48A 4ZE9A 1I3QJ 3VVFA 2O7UA 4WEPA 5I58A 3JRFA 1B6HA 4ELQA 1H89C 3C31A 3Q29A 2QS3A 4M3FA 4LZ8A 1Q1KA 1Q35A 5ICQA 4IY5A 1MBFA 4OTEA 3HOWJ 3KGCA 4MIMA 1XVXA 2YPNA 2AL5A 1YTVA 3E9XA 4I6ZA 5JK4A 1WVJA 1B58A 5JLXA 4LP2B 1TWAJ 2H8RA 2VD2A 2VPRA 3FATA 3OSFA 2ABHA 2XSDC 3DM0A 4HW8A 4RPNA 5DVFA 3HHGA 4UA8A 1D4NA 2YJPA 1LFUP 4A3IJ 4F31B 5TPAA 5GPCA 4X6AJ 3PUYE 2L7MP 1GTKA 4BKXA 5KDTA 2EZHA 1QVUA 4A3FJ 2PMSA 5F08A 4GOTA 3U92A 5ELVA 1SFOJ 3R7XA 3GTQJ 2V3TA 3PU5A 3LBSA 1ZR2A 2XXRA 3GLBA 4A3DJ 5EG0B 2XGDA 4IGRA 4XKRA 2ME6A 2DP8A 2DE3A 2PVUA 3T9XB 2Z23A 3NAUA 1UTBB 1DSNA 2DWAA 4FE8A 4OEUA 2XXWA 3A02A 1QJMA 1Y3PA 2Q9TA 2O8KA 2Q2AA 2GH9A 1D9VA 2R93J 2ID3A 3T96B 2DVCA 4FIMA 4F3GA 4HCYA 1SYIA 1RPWA 4BBSJ 5BWJA 3RZOJ 4X1DA 1JGGA 2XXQA 2NOGA 1HSJA 1LSTA 3K6WA 3PPOA 4ZEKA 2D5WA 1B5JA 3BG9A 1TXFA 5F0HA 1XT8A 3TQLA 4RXLA 4J19A 4ZEIA 4PFYA 2YLNA 5K7FA 4ELOA 3MWBA 3BR2A 1IC8A 5C4JJ 5TPAB 4ELPA 1WDNA 4MFDA 5KDTB 2KT0A 1U9NA 2ZYOA 3KN7A 4KPTA 2DMTA 2HZLA 1R6ZA 4V2FA 4FEBA 1TC3C 3S1MJ 2HXOA 3S9MC 1DMBA 2GHAA 3TKDA 4OERA 4R9GA 1B3HA 1YAEA 4BLAA 4DE8A 3BR0A 1ORKA 1UMQA 5L8DA 1EF4A 2YU9J 4OVJA 1QUIA 5I84A 1XVYA 2Q8JA 3B6QA 4G8MA 4OXVA 2ONSA 4ZZAA 3M3FA 3KOSA 1MBGA 1WI3A 2K9SA 2NWJA 1ZQ3P 3HGYA 1MY0A 1XS9A 4RDUA 3HPIA 4KYDA 3IB2A 3N5LA 3TW6A 3LSRA 4O3AA 2E1OA 4XICA 3V83A 2E19A 3S14J 3GBBA 4DXUA 2QL3A 3FISA 2R6GE 5IP9J 2F6GA 3IOVA 3DLNA 1TT1A 1AKHA 3OO8A 3PD8A 1ZGWA 2PT2A 3FZVA 5KCJA 1TFDA 2E2IJ 2KLFA 2VD3A 2ONKE 2I0CA 3RT8A 1HSLA 2F35A 1RESA 4A3BJ 4WXJA 3B7DA 1MXWA 1QULA 2JMWA 4OWDA 2XGCA 4I8CA 1R9QA 4H8IA 5B70A 1DU0A 3KZGA 3HCQA 3FVOA 2IAIA 2Q88A 1HLVA 4I62A 1LFGA 5EZHA 3TTNA 1S9TA 1USYE 4WEDA 3VLWA 3MZ9A 2JA8J 1QVSA 1MQDA 1MQJA 3H6UA 4RY1A 2OPTA 5H8NA 3TMGA 4PP0A 5M3FJ 5H8HB 4DZJA 1GVDA 1R9TJ 1XG1A 1GV2A 5L9SA 4C1UA 3PPNA 1YRNA 5J1YA 2O68A 1MNMC 1ZLQA 1AMFA 3PUZE 2LK2A 3KSJA 5I57A 1FQDA 4QFOA 4Z7EA 5FHOA 3SEYA 1X2NA 2ALUA 3PMXA 2DA4A 2O1LA 1LB9A 3KN8A 5AA3A 4R2BA 2NVXJ 2I4BA 2M0CA 3U72A 5AA2D 3LSPA 3HOXJ 3LNQA 1Z7NE 4GL0A 1AKHB 1ZK8A 1B40A 3FIRA 3JV9A 4LONB 1EZ9A 4OEVA 3MPLA 5IOZA 2H9BA 1JKOC 4M1VA 5ITOA 3OO7A 3U1OA 3RT6B 2LR8A 2QCOA 1CE2A 3TCHA 3RZDJ 2JN6A 2R7ZJ 4KYEA 1NKXA 1UG2A 3V5AA 2R92J 5IYBJ 1IGNA 2IEEA 1LBBA 2Q2CA 1FQAA 5FHMA 3IV5A 1I50J 1JEUA 1PB9A 1G2HA 3VVEA 3W6VA 4ISUA 1LE8A 3V8XB 4BDOA 3B6AA 1DPEA 2ECBA 2JWTA 4NTLA 1HSEA 4FISA 4KHZE 2ONRA 5H8QA 1GV5A 3M3YJ 2Y7IA 3K1PA 4JX5A 3IOTA 4DW6A 3SDGA 4XRSA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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