1MH3A

Maltose binding-a1 homeodomain protein chimera, crystal form i
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
421
structure length
421
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTAAAAAISPQARAFLEQVFRRKQSLNSKEKEEVAKKCGITPLQVRVWFINKRMRSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into binding cooperativity of MATa1/MATalpha2 from the crystal structure of a MATa1 homeodomain-maltose binding protein chimera
pubmed doi rcsb
molecule keywords maltose binding-a1 homeodomain protein chimera
molecule tags Sugar binding, dna binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 144
structure length 421
sequence length 421
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF00046 Homeodomain Homeodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.60 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Homeodomain-like 1mh3A03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh3A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh3A01
1QPIA 3ZQGA 2EQRA 3OOAA 3O8GA 2I4BA 4N13A 1MY3A 3EQ1A 4XIGQ 3SFIA 4A3MJ 4YZZA 2XGDA 2REGA 4YKPA 1DMBA 4UUSA 3PGFA 1MY0A 1S50A 3QPLA 2XPUA 2LK2A 3M3YJ 2ZYKA 5TPAA 1N3WA 1ZGWA 5EYRA 1H44A 4V2GA 1RKTA 1W0UA 2DVZA 5EDNA 5TU0A 3PPRA 4GXAA 5H8SA 4IO4A 3PMVA 3K6UA 4Q30B 2ECCA 5M5YJ 3N6TA 1MXWA 2Y7KA 3DELB 5AA4A 3IO4A 2V3QA 5E3OA 3MBPA 3IH4A 3IB0A 2TCTA 1B9JA 3IL1B 2AHQA 2IA4A 4U1OA 1ZLQA 5I59B 3CR9A 1TC3C 2UYFA 3CDLA 1ZIUA 1FTMA 1Y1VJ 1B3LA 1IDYA 2Y31A 4JWYA 4C3HJ 2O84X 4XKPA 3S9LC 2XXXA 2OWTA 3CG3A 5K7HA 2DA2A 4KR5A 2ZB9A 3W6VA 4BBSJ 4H67A 3DM0A 1JEVA 1OFCX 4MLQA 3S2VA 4F1YA 2DQVA 2VOZA 3VV5A 2WV1A 2XD2A 5ELVA 5IOYA 1HSJA 3K6VA 3K6XA 3USDA 4U22A 2OJTA 2EZKA 2DWHA 2UXAA 1H8AC 3M3KA 3MZBA 4THIA 3KSXA 5ICTA 1Y3PA 2CQXA 4KHZE 3T9XB 4R9GA 1XC1A 3K2AA 3ZQFA 3G3GA 5JTYB 4OEUA 1ZK8A 2WB1N 2H99A 2ONRA 2H4IA 3GTLJ 4NTLA 4H5FA 4Z0IA 5DEXB 3IO6A 2DMQA 1LB8A 1LGBC 1DTGA 4JX6A 1NMUA 1NNTA 3QAXA 1FQFA 3K00A 1Z77A 1B58A 1ZKGA 3KOSA 2QCOA 1B4HA 3RZOJ 3UKGA 2DA1A 1IXCA 1JW1A 4I6ZA 3G1LA 5AA2B 1LBCA 1BJZA 4KCDA 1JNFA 4QSDA 1JTXA 5JLXA 1VNDA 2DA7A 1ZJLA 3B6QA 5M3FJ 3PO3J 5I57B 3H03A 1NNFA 4NF8B 1MBGA 3IJOB 4F2QA 5FKKA 2XPVA 3PUZE 5C3EJ 1TXFA 2OPTA 2AL5A 2CQQA 1IC8A 3RT6B 2F97A 3I4MJ 3GTMJ 2THIA 4AYBN 5ISUA 3U8QA 5B7DA 1ANFA 3MJNA 3V89B 4HW8A 4OHNA 3H7MA 4A3BJ 1AIVA 4C2MJ 1WDNA 1MS7A 4DLDA 4DYQA 3TQLA 4EF1A 3HM5A 4ELRA 3S17J 1DOTA 1B5IA 1MPDA 2XHDA 3LSFB 2O68A 1HLVA 1FTOA 4CYCB 3S4UA 2Q89A 3OEMA 1NTCA 4IO3A 1WGXA 2M8CA 1B72B 5BUUA 5JTYA 5AE4A 1HDPA 3LSPA 1PEBA 2Q2CA 1XC5A 3HOWJ 4N6PA 3C31A 2HFBA 5DEXA 1QULA 4G68C 4ESXA 5TP9B 3HGYA 3PUVE 2XPWA 5HODA 1K61A 2XSDC 4H1XA 1URSA 4MH5A 4M3EA 1B7UA 1TT1A 3ZKLA 3RTWB 4M3DA 4GXSB 2I58A 1P1UA 3D4GA 2GM4A 4JSOA 2QPQA 4Q5TA 1JT6A 3VVFA 4L17A 4ZEDA 1U9OA 3EPEA 3N6UA 3TYHA 3P7IA 1LLSA 5JEIA 5FLVA 5AA2A 2O7UA 3SJMA 3Q0VA 1B40A 3TEPA 2D21A 4J19A 1FIAA 1M5BA 2H5YA 1D5YA 5E3NA 4MIMA 4A3EJ 3FD3A 4OTEA 5I57A 3MQ9A 1LFHA 2L7ZA 1IIWA 4NF8A 3SEWA 4JWXA 5L9MA 3MVPA 1FW0A 4TLLB 3O8HA 1RYOA 4QTRA 3FK7A 2X6OA 2OWSA 1MSFC 5E3MA 3IJXB 3ECRA 2Q8JA 1Y1WJ 4FIMA 4DXUA 1PBQA 2EH3A 1S7YA 1CQTA 1EF4A 4MFDA 2PBWA 1UHSA 2XGCA 4G8MA 2F5XA 4GVOA 2F36A 2Y0SN 5KCJB 2HDDA 2JA5J 1MY1A 2XXIA 3MZ9A 1NL5A 2IEKA 4CYCA 3ODBA 2YS9A 1B32A 1I6HJ 1MXXA 2I3WA 1MBKA 2K40A 4GOTA 1B72A 5KZTA 3C2BA 1PB7A 3KJ7A 4FEBA 4QFOA 2E2IJ 3PO2J 4M1VA 4RK9A 1MXUA 3GTKJ 2AO9A 1NK3P 1LAXA 4FTHA 3OD7A 4X48A 5TP9A 2UYEA 1XT8A 2HEUA 3R6UA 3S1RJ 2K9NA 2OF7A 4A3CJ 3PU5A 1H88C 2HAUA 4R72A 2TRTA 1FTTA 1B51A 1MQJA 5K2YA 5BWJA 3K2DA 4YU0A 3F0CA 1MBFA 2DMTA 1IGNA 1IEJA 3QUFA 1NH8A 1QUIA 2VD2A 4C0RA 2O1LA 1FJLA 2H9BA 3MKLA 4W97A 4F22A 1B0LA 4QRZA 3JRDA 2G0EA 4BXXJ 4RJZA 1TFAA 4R6HA 1Z0XA 3HOZJ 2L0KA 5EZGA 3ZKKA 4MFIA 5C4XJ 3O6IA 2G29A 3O9PA 4KPTA 3A01B 4EF2A 3BFTA 2VPRA 2XRLA 1Y3QA 5CM6A 2ZYOA 2YJPA 3JZJA 1EZOA 3Q0UA 1SYHA 4NE4A 1P7IA 3RZDJ 2MW8A 5GP9A 5I2NB 3KG2A 1GUUA 5IYDJ 2QS2A 3Q28A 5L8DA 4FATA 1N7WA 3T96B 4JWOA 3CMYA 4XKRA 3PPNA 5DYHA 1D9VA 1L5TA 1TWFJ 1ZR4A 3BR5A 3M3FA 3HGGA 2HCAA 4X9TA 3GBGA 3T9VA 1AHDP 1PB8A 3IORA 1N0TA 3FKIJ 4FE8A 3WAEA 2I4CA 5KCJA 2W7YA 4QSEA 2Y7IA 2NOOA 5FJ8J 5JK4A 2IAIA 1B7HA 4POXA 2DOJA 5J3LA 2F34A 4K3FA 1MNMC 5AA2D 2RAEA 1IUDA 2IEEA 1IXGA 2DMUA 4G8HA 5C44J 4ZECA 2H1KA 3JRHA 2UVHA 3KZGA 4H6DA 3BG5A 4QIWN 3QQAA 3E3KA 1MBHA 4GD5A 1WCMJ 3KGCA 3KJTA 3NAUA 2B3BA 2JK3A 3E9XA 1BIYA 3H6WA 1ETOA 3S9EA 3BG9A 3OSGA 4XICA 3JRCA 3U1OA 1RETA 2L9RA 2ZNUA 1GV2A 3H4ZA 1B5JA 1QKAA 3C35A 1Z7NE 1SANA 2LAOA 2XXUA 2JJ7A 4ISUA 1II5A 3FVKA 1YCJA 1B2HA 1GVCA 3FISA 1BKAA 2IBDA 4ZE9A 1LFUP 2X7QA 3IV5A 3T9UA 1OJLA 4MF3A 3B6TA 5EHMA 1B05A 1BW5A 3PM1A 3IK6B 5HBCA 1RESA 4R73A 4C1UA 3KN7A 1AU7A 1SW2A 3KEIA 1HDDC 4C1TA 4G68B 2R71A 3OSFA 4YAHX 1IUFA 1NNPA 1D3KA 1JW4A 3VXBA 4O3AA 4LVQA 2I10A 3LBSA 1SYIA 2A5TA 4R2BA 2HZKA 3LSWA 3E13X 2M8GX 3MVXA 1DPPA 1SBPA 1I3QJ 2AIXA 3IOTA 2DXYA 3VXCA 4U1ZA 3FJMA 2RCBA 4RYAA 3BTJA 3ZQHA 1LCTA 2I0BA 4AUXA 4OZ9A 3SEUA 3Q3SA 2FA7A 5FHOA 3HSTA 1OVBA 2OCUA 1EZ9A 5K7FA 2DMPA 1LFBA 3HHGA 3OO8A 1YAEA 2ALUA 3CVGA 4F31B 4KI0E 3IR1A 2JA6J 2LR8A 1ETXA 1JEUA 1USYE 4FE4A 1VFCA 4PE5B 4MO7A 3B6CA 1MPCA 4AQ4A 4NEDA 1LFGA 1OMPA 2XB0X 2Z8FA 3HBLA 3PPQA 3LC8A 2R92J 4FE7A 1AMFA 1JUSA 3OIOA 2VP1A 4GQOA 3VLWA 2DWJA 3UIFA 4RNSA 5FKMA 1R6ZA 1A7LA 4Q8RA 1FTZA 2F7CA 4F29A 1U9NA 3DEWA 3CSBA 1B8IB 4G68A 4WEDA 2F78A 3TUSA 1O64A 2VD3A 4ZZEA 3K1NA 3BQZA 5DVIA 3TTNA 2XXVA 3FK6A 3K1MA 4DXCA 1P1QA 2RF1A 1DU6A 3BKIB 4ZEFA 5F0FA 5F08A 1DTZA 4XRSA 5IYCJ 1PC3A 2E1SA 1UMQA 3TTRA 4BY1J 1AKHB 2X7PA 4G4PA 4X1DA 1USYH 4M3BA 1OCPA 2KDZA 2Y7RA 1AOVA 3W9WA 4RDUA 3O2AA 1ELJA 5GPCA 4B1RA 3LSJA 3IAZA 1KWHA 1GT0C 4F3SA 2HQ5A 5J1RA 3K4UA 4OXVA 3VLUA 2NWJA 3VLVA 3UORA 3FXQA 1IRZA 2EZLA 3BR0A 4RXLA 2DMNA 3GTPJ 4YICA 2UVIA 4TLMB 2PMSA 3VPRA 4PQJA 1AL3A 2HQ0A 3I5OA 2PT1A 2ZNTA 4BDNA 1GR2A 4KYSA 2GHAA 1MXVA 3RT8A 5I2KB 3OEKA 2M9HA 4H0WA 1IZ1A 5I58B 4LATA 2YLNA 3K02A 2W48A 2O7IA 1FTJA 1JJ8C 3HCQA 4NMYA 4X6AJ 5JLWA 3OO9A 3TAJA 3MN2A 3LUYA 3S9MC 2Z8EA 2A5SA 3BR6A 1B8IA 3FIRA 1O63A 2YU9J 2XX9A 1JKPC 1A99A 1MBJA 1M5EA 3H06B 4LQ5A 4P0GA 4IGRA 1LFIA 4OMBA 1MM7A 2R7ZJ 3L1PA 1MY4A 3EF7A 4RPOA 3FIWA 1N7XA 2ZYNA 5IP6A 1P1NA 1HOMA 2Y84A 3ONMA 5CMCA 2RC9A 1AKHA 2LTPA 1RPWA 2HOAA 4IO7A 4A3JJ 1WH7A 2WKYA 5EG0B 4NF5B 1ZBMA 2CU7A 3GTOJ 3G7WA 1P1OA 4I1DA 3IX1A 1PUFB 3JRBA 3EHSA 4JSDA 3Q29A 3G3KA 1POTA 1XOCA 1WODA 1NFTA 1FEXA 1MRPA 1A6IA 4A3IJ 1N3XA 2Q9TA 4DIGA 3Q27A 4XRSG 1LSTA 2RINA 3N26A 3G1MA 5EYFA 3G3FA 1I6QA 2EZHA 4XXUA 1ETWA 2DWIA 1ZR2A 5I2KA 3BG3A 2JMWA 5I58A 3KOTA 1RR7A 3DCFA 2JA7J 1N04A 1JTYA 3T9HB 3A09A 2OZZA 4PP0A 4R2FA 2ME6A 4NWDA 4R6YA 3FXUA 4PFYA 3H3GA 1XG1A 2JN6A 4GIZA 4BDMA 3WHCA 2ZMBA 5DTDA 3E4RA 3FV2A 2KT0A 2ONKE 1IG7A 4G77A 3S9NC 5CBSA 3MPLA 5ICQA 1MQGA 2VKEA 2DN0A 4E0XA 4I76A 3FV1A 1XS5A 5M3MJ 5F1QA 4O3CA 2E2HJ 1NNKA 3BBRA 2P81A 4HS7A 3RQTA 1BTJA 1B3HA 3HN0A 4JX4A 4I8CA 1QJMA 1GV8A 5H8NB 4RBOA 2P1SA 3M3LA 3O28A 1MDQA 3HOVJ 2XXTA 1P99A 1EZPA 3IB1A 1MBEA 4H65A 4EEFG 1TWAJ 2L7MP 4H5GA 5EG0A 1MG1A 4NF5A 3SEVA 4HCWA 2VUMJ 3K01A 4EQBA 2COBA 2QS3A 1Q1KA 3O6GA 5B70A 4RA1A 1WI3A 1PUFA 5CI5A 4I62A 4YMAA 1VSOA 2QRYA 1M5CA 4GFRA 3UP9A 1POGA 2FNCA 3Q25A 2O7OA 3MWBA 1VE4A 1ZQ3P 4LA9A 2GRVA 1MH4A 3MVWA 4FISA 3W15C 3JYRA 5CC2A 2HZLA 1F36A 3BR1A 1LE8A 1EH3A 3OXNA 3O66A 2WAQN 4RK2A 2CJJA 1GV5A 2PVUA 4M3GA 1X58A 4R74A 1BLFA 3MVYA 4O3BA 2Y9YA 3T93B 3I4NJ 2ID3A 3TTLA 1DPEA 2M2EA 4GL0A 2FX0A 3MPKA 3H6VA 1RYXA 4U21A 4D5CA 2GBYA 3OELA 1E3OC 1G2HA 1FTLA 1OIBA 5BNGA 2DE2A 2CRGA 4PFUA 1Y9UA 3OO7A 1B46A 1QUJA 4KQPA 1Y20A 4G12A 3CFLA 4HTGA 5H8NA 2M0CA 5IPAA 2V93A 1NK2P 3OMBA 5I84A 2B65A 3OO6A 3F11A 3C32A 2LVSA 4XTCQ 1WVJA 2Y9ZA 3DP4A 2Y2ZA 2DJNA 3L6GA 3JREA 2DSFA 2OLBA 1Y4CA 1N84A 2HI3A 3QXMA 3G3HA 4AB5A 5H8QB 5EZHA 4M6VA 2HXIA 2X9DA 1SW5A 2PMZN 4TQUQ 4OEVA 4OFOA 2V84A 4FECA 4POWA 5CBRA 3U94A 2ZYMA 4H8IA 3V5AA 2LFBA 1SQYA 2XXHA 4NDLA 2A5TB 3TTKA 1TWCJ 2G93A 5EEAA 1B1XA 4FAJA 2FJ1A 1XVXA 4GFBA 1AH5A 3ZQLA 1W0TA 4BDOA 3CG1A 2OBGA 4KYEA 4E0WA 3S1NJ 4F3PA 1VR5A 2FYIA 3CFZA 3N5LA 4PFWA 1JQFA 2NS7A 2O69A 1MPBA 1UQWA 1SDXA 1IXHA 2D5WA 4BDRA 4FJPA 4ZZAA 4BKXA 2YPNA 4LZ5A 5FKNA 1LCFA 3JRGA 1PB9A 2NUVA 5L9OA 5FTHA 3QYTA 3SKPA 1FQEA 1BW6A 2PT2A 4ZEIA 1M5FA 3OSRA 3M8UA 1UTHB 1MQIA 5KDTB 1ETYA 5HM4B 2DE4A 1QVTA 2CUFA 5C4JJ 4F19A 2XXRA 4LQ2A 2I0CA 5EGOB 2QL3A 1ZTRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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