1MH3A

Maltose binding-a1 homeodomain protein chimera, crystal form i
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
421
structure length
421
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTAAAAAISPQARAFLEQVFRRKQSLNSKEKEEVAKKCGITPLQVRVWFINKRMRSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into binding cooperativity of MATa1/MATalpha2 from the crystal structure of a MATa1 homeodomain-maltose binding protein chimera
pubmed doi rcsb
molecule keywords maltose binding-a1 homeodomain protein chimera
molecule tags Sugar binding, dna binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 144
structure length 421
sequence length 421
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF00046 Homeodomain Homeodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.60 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Homeodomain-like 1mh3A03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh3A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh3A01
2DA2A 1CE2A 4GF8A 4OEVA 4A3LJ 1TC3C 3H4ZA 1R9LA 4GD5A 1VF9A 2DMTA 1BW6A 1OLAA 3O28A 4H65A 2XSDC 4IGTA 1HOMA 2OZZA 3O8GA 4C2MJ 2XXWA 3JZJA 3K4UA 2DVCA 2TRTA 5FHOA 1MSEC 4NDLA 4BKXA 3L6GA 5A5XB 1QUJA 3LSXA 3BR3A 4LZ5A 3FV2A 4LQ2A 2VD3A 2RC9A 1R1NA 1ZIUA 4G77A 3PUVE 1FTTA 3S9EA 4G2ZA 3BG3A 3QYTA 2F6GA 2PT2A 1ETYA 2CMOA 3OD7A 1FQDA 3HB9A 2I0BA 5ISUA 4OEUA 3IB1A 4THIA 2V3QA 5BNGA 3FXRA 1OQGA 1B3GA 2FD5A 2NWJA 1KWHA 1DPPA 5AE4A 2XXQA 2L9RA 1ZKGA 1LBBA 4Y52J 5IYDJ 2DQVA 4OMBA 4RJZA 2OCUA 3ZOBA 2Z23A 2ELKA 2X7QA 3ONMA 2NS8A 2OF7A 5DT6A 5H8NA 2O8KA 2V93A 1SBPA 4P0IA 4IEJA 4FE8A 4ZZEA 5E3OA 1N76A 2O7IA 4IO3A 3S2HJ 5EYFA 2DMUA 4BDRA 1K83J 1U9NA 4CYCB 3S17J 2PX1A 4KD5A 4FATA 1Y4CA 2R6GE 3IJXB 1B0HA 3PD8A 3CFZA 3TQLA 2DOJA 3MVYA 3VFJA 4A3BJ 1LFUP 1HSEA 4EDPA 4O3BA 2XB5A 5GPAA 4YB5A 1WODA 1PB8A 2M34A 1YAEA 4C1TA 1B7UA 3LSGA 1IDZA 1A7LA 3PPRA 2H99A 2QS4A 3PPOA 4ISUA 3V8XB 4BDOA 4W97A 5JEIA 4OENA 4RPNA 2ECCA 2F7AA 2GFEA 3F0CA 1RYXA 3K6WA 1MXUA 2QJEA 3SJMA 3MVZA 3ILTB 2PMSA 3HOYJ 5DYHA 3O9PA 3W9WA 1PUFB 4KYDA 1GDTA 3HN0A 3FJMA 1TT1A 1NMUA 4G8NA 3RT8A 5J1YA 3ZQCA 1A99A 1JW4A 1IXIA 4IY5A 1S9TA 3T96B 4R6HA 1FTZA 5DVJA 3VVFA 5GP9A 2E1OA 2VKEA 2EH3A 2F78A 3MN2A 2P0SA 4JBZA 4C1UA 3OOUA 1A8FA 5I2KB 3A02A 2G29A 1M5BA 4Y7NJ 3OO6A 2QCOA 3IX1A 2X26A 1DU0A 1U78A 4PQJA 1ZGWA 3U93A 3UK4A 1OCTC 1P7IA 3IOWA 2I48A 3E3KA 1DTZA 1N7XA 3H6TA 5FHNA 2O84X 1D5YA 1X58A 2PVUA 2IEKA 3MWBA 2LY9A 2QF7A 1URGA 5M5XJ 3KZGA 4G68C 1O7TA 3AXFA 4JXIA 1B5JA 3K02A 1B40A 4H8IA 2FJ1A 4RY1A 3PM1A 2PMZN 3RUMA 1ETWA 2RC7A 5TP9B 5JLXA 2XD2A 3O6IA 4JX6A 2L0KA 2Z8FA 1Q1VA 5KZTA 3DLNA 4KYSA 1FQFA 2CUFA 3LBSA 1US4A 5CRYA 2RCAA 4GRKA 3VXCA 2X7PA 1H89C 1LE8A 1QUKA 4B1RA 1X2MA 3PO2J 2REJA 3U92A 4XKQA 5EG0A 3CVGA 3UN6A 2XXTA 2KT0A 1B6HA 4EXLA 3BTJA 4Q0CA 3Q3SA 4MFDA 1Z7NE 2DA6A 1QW0A 4MFIA 1B72A 1USYH 3HGYA 1FQCA 3A01B 5AA4B 2KDZA 2K9QA 2CZLA 2PYYA 2P81A 2Y9ZA 1URDA 3JRHA 2NVQJ 1PBQA 3IOUA 5EGOB 2VPRA 3K1NA 2JN6A 1LBCA 1XOCA 2F97A 5TPAB 3S9NC 1F43A 1WH7A 3KBRA 4P0GA 1XS9A 4OESA 3LR1A 5M5YJ 5IPAA 4NEDA 1EF4A 4R6YA 1BW5A 4ZEFA 3TCGA 1GGGA 5I2NA 3K1MA 3LC8A 1B46A 3RTFB 1LAHE 1JW5A 3RLFE 3FIRA 1QKAA 2H98A 2ONSA 5CMMA 2A5TB 3FJGA 2HQ0A 3N94A 2HZKA 4I8CA 4QSHA 2OLBA 5HM4B 3BTCA 5GPCA 5F08A 1PB9A 2R93J 4HCWA 4FTHA 4M1VA 3R6UA 4PETA 4FAJA 4F1YA 1ETKA 4NF8A 3PO3J 4R2BA 2Q8JA 2DTZA 3OO7A 1P1WA 3BR5A 5I57B 2MG4A 3S1MJ 4F22A 1UTBB 4NF5B 2YJPA 3KOSA 4D7MA 2ONKE 3VXBA 4JSOA 3U1OA 1MH4A 1I6QA 2V3TA 4M3GA 5FKNA 3PMWA 3QIMA 2R9JA 4DLDA 1T56A 3K1PA 1A40A 2DMQA 2F34A 3TQWA 3OOAA 3SERA 4F2QA 2HYJA 4WKMA 3WHBA 4YU0A 5J1RA 1MRPA 4YB6A 3FVNA 3KG2A 3DELB 3S14J 2E0SA 4ESWA 1DU6A 3HKZN 4A3FJ 1W0TA 3NAUA 1B3FA 2UYFA 5AA2B 5BUUA 3BFTA 1TWYA 1VE4A 4F3GA 1O4XA 2O7UA 4K3FA 3T9VA 4XIDA 1FTLA 4MIMA 1II5A 2LP0A 4BLAA 2O69A 3SEWA 1NL5A 2Y0SN 1Y1ZA 5C4XJ 2Q9TA 1Y3NA 1S7YA 2GRVA 3USDA 1F36A 1RKMA 4TLLB 3S1RJ 3L1PA 3FKIJ 2RC8A 3C2BA 3BR0A 1TWAJ 4XKNA 3BT9A 3JRAA 3DP6A 2XXIA 3DM0A 5KCJB 3VV5A 2D5VA 2P1SA 1XT8A 1A54A 2HAUA 2WB1N 2KLFA 4XRMA 4IHYA 4PFYA 4V2FA 4F3PA 1JJ6C 1POY1 1JTYA 3PUWE 4RYAA 2A5SA 3KJTA 4ELOA 2Q88A 4R2FA 3IH3A 2ZNSA 2ECBA 4JWYA 1S50A 1H45A 1MXYA 1QRYA 4GIZA 2F7CA 4QFPA 2XGEA 4F31B 2QRYA 5DTBA 1QVSA 4RXLA 3QAXA 1HF0A 1JUSA 3TDJA 1VFEA 1VSOA 2Q89A 1ENHA 3V89B 1LAXA 3F11A 3QPLA 4DCXA 5M5WJ 2L7FP 3UORA 1ZU0A 4R6KA 5K7HA 1JEVA 3T66A 2LTPA 1RETA 4ESXA 1OIBA 2QS3A 2VKVA 1Y3PA 1T33A 2ID3A 5CBSA 2R0QC 2HOTA 4GOTA 4OWDA 3CFLA 5L9SA 3MZ9A 3TZAA 2B65A 1QKBA 2Y30A 4YB7A 1MM6A 5E3LA 3RZDJ 2E2IJ 2YU9J 1HSJA 3MVPA 1LCTA 1P7JA 4BY7J 3SKPA 1IZ1A 3IV5A 4TLMB 3GTQJ 2LKXA 2OJTA 2THIA 4L5EA 1FCKA 3HPIA 1FEXA 3ECRA 4OFJA 2AYSA 5F7VA 4PE5B 3SFIA 2XXXA 1R6ZA 1SW1A 2HQ5A 1LCFA 2PT1A 3GBBA 1MXZA 5M3FJ 4KQPA 3GTJJ 3EHTA 3FGSA 1NH8A 5C44J 3Q0UA 5DVFA 4XIGQ 3JRGA 1IXCA 5H8HA 4YAHX 2DYXA 3MZBA 4RK9A 1SYIA 3QPSA 3MP1A 2IAIA 2NVTJ 1JNFA 3PUZE 4LZ8A 5H8QA 5HPQA 4NMYA 4NTLA 1MXWA 2DXRA 4EF2A 1B32A 2YUSA 3K6XA 1OQHA 1QVUA 4HS7A 3C9HA 3BQZA 1Z7ME 2F36A 2NOGA 5ICQA 3D4GA 2HXIA 2XXHA 3ZKKA 2QMXA 1WGXA 3MJNA 4F39A 2ZB9A 5TP9A 2XGDA 1TWGJ 1B05A 4HNVA 4LONB 4J19A 5I58B 3RZOJ 2ZYKA 1P1NA 3TP3A 1IDYA 1IITA 4A93J 4QHQA 3GTLJ 3PMVA 4H67A 3GTPJ 4G4PA 2H4IA 3E4RA 4LP2B 4NWDA 5JLWA 2PBWA 5JTYB 4OERA 4YKKA 2P2AA 3CG1A 2CQXA 3QQAA 3C32A 1O63A 1N3WA 3M3FA 4P11A 3M3KA 4EQBA 3PD9A 3TEDA 4FJPA 1D9VA 3IL1B 3TP0A 3LUYA 4FEBA 1E3OC 3K2DA 3O29A 3ZKLA 3WAFA 3FD3A 1P99A 3K01A 1QPIA 1EZPA 2JMWA 3QSLA 1GV5A 3GTGJ 3JV9A 5FTHA 2XPVA 4O3CA 3RTWB 1FTKA 2EZIA 4MLQA 5IP7J 4UUSB 3P7IA 2OWTA 1APLC 1AKHA 3O2AA 1B0LA 3IOTA 4XICA 1AH5A 1OMPA 4R9FA 3FK7A 4JX5A 4JDFA 3RNNA 4YKPA 5I56A 3TCFA 1NNFA 4DZJA 5H8FB 3Q27A 2JJ7A 3EHUA 2HAVA 2QMWA 3HHFA 4LA9A 1ETVA 3KEIA 3C36A 2E2HJ 4UACA 2ZNUA 3SDFA 4A3DJ 4POWA 3C35A 4U1OA 1VFDA 2XX9A 1UG2A 3T93B 3GXAA 3H03A 1MXXA 1AOVA 3EN3A 2O7OA 3D1NI 3T22A 5I57A 3DEWA 3TKDA 2AO9A 3A09A 4OVJA 5DEXB 5JK4A 3MP6A 2XRLA 2HFBA 3RY3A 5IOZA 4DXCA 3HOWJ 3OMBA 2L7ZA 3B6QA 2DA3A 4V2GA 5IP9J 4QFOA 4W1UA 3C4MA 4LVQA 4DYRA 2I3WA 3IK6B 3GBAA 4NF4A 1NK2P 3MW0A 4A3MJ 2VD2A 1RPWA 5EYRA 1B9JA 3ZQFA 4N07A 2XXYA 1UTHA 4WEPA 1JW1A 4C3IJ 1PB7A 1MBFA 4A3KJ 1Z0XA 1Y1MA 2D3IA 3BR1A 4FEDA 1YRNB 2DWJA 1PEBA 5E3NA 3JREA 3T9UA 3WHCA 2VGQA 3VLWA 1YTVA 4NF6A 4N13A 4XK4A 2DMNA 1UIVA 1Y1WJ 3KSXA 2Y7KA 2XPUA 3EHSA 1XC1A 2CUEA 1DOTA 1JETA 2IEEA 2R5YB 3MAMA 4RNSA 3H06B 1B5HA 4GVOA 5HODA 4DCYA 2DA1A 3TMGA 4F1UA 1NFTA 5IKBA 1HCRA 1SANA 4HTGA 5KDTA 3SESA 4A3GJ 1J1NA 2MGQA 3H0GJ 3QUJA 2B3BA 4YKJA 1S7EA 4MBPA 1BA5A 5F0CA 3SEXA 3TUSA 2GHBA 1MBHA 4TQUQ 3HO7A 2NVXJ 1SI0A 3BBRA 1WCMJ 3MC2A 5TU0A 3HGGA 3MBPA 4KHZE 1GTKA 4Q5TA 3DP4A 2MW8A 5FLMJ 4Q30B 1B51A 3FZVA 4AB6A 5F1JA 4DW6A 1Q1KA 2RKMA 4NWCA 5B7DA 4IO7A 4ZEDA 3MKLA 4R73A 1HDDC 3PPQA 1I6HJ 2H8RA 2VUMJ 1FQBA 1B8IA 4R72A 3CFXA 1MPDA 2D5WA 3O8HA 4OQOA 5FTIA 2ZMBA 3HBLA 3HM5A 1P1OA 2ID6A 5H8SA 5ICTA 1OLCA 5EF6A 4PFUA 1NTCA 3OSFA 2UVIA 4TOZA 4YMAA 1AL3A 3C33A 4D5FA 4BDNA 4DZPA 1MM7A 4AC0A 1SVXB 3I4MJ 3GZGA 1B3LA 3G3GA 3KN8A 4E0XA 1UMQA 3H3GA 3ZQGA 3G1OA 2GLOA 1GUUA 2R5ZA 4X6AJ 4HCYA 1Y9UA 2X9DA 3G1LA 3MUQA 3LNQA 5K7ZA 4JX4A 1MQIA 4RDUA 1TFDA 4I76A 5B70A 4F1VA 4U2RA 3OIOA 1CQTA 1DMBA 3JYRA 4DYCA 5M3MJ 1BIYA 4R74A 3NARA 3LSLA 2VI6A 1VI0A 2EZLA 4FE4A 4C3JJ 1B3EA 1H43A 3LOCA 1H8AC 5I59A 2Z8DA 1ZK8A 1OVTA 2Y7PA 2DWAA 3G7WA 2LLKA 3IB2A 3CDLA 3CMYA 2HOSA 3TTKA 3N6UA 1OCPA 3FVKA 2Y31A 2LR8A 2REGA 1I3QJ 3Q0VA 3UA8A 1A5JA 2I0CA 3VPRA 2XB0X 1XVYA 5FKMA 3N5LA 4ABZA 2NXOA 2K9SA 1NNPA 1A6IA 1MY1A 3ILUB 3ZQLA 3RGYA 1H88C 5IYBJ 2AL5A 3RT6B 1EU8A 4JYKA 1LSTA 4Z0IA 1ORKA 4IHXA 2B63J 3E9XA 3OEMA 3IB0A 5EZHA 1IEJA 2XHDA 4D7NA 2I6EA 3N26A 2DS9A 4A69C 1OFCX 2O1MA 2Q2AA 5A5XA 3Q29A 2DA7A 4F2OA 1LLSA 1B1HA 1IQ7A 2I49A 4H5GA 2GM4A 2XX7A 3VVEA 3S9MC 2H25A 2OK2A 1SW5A 4H0WA 3JRDA 1ANFA 1URSA 1FQAA 2JA7J 4GWOA 3S16J 2ESNA 2WAQN 1B4ZA 2DE2A 3HSTA 4UUSA 1GVCA 3TELA 4C0RA 4FISA 3SEUA 3JRIA 1P1UA 2HXWA 4YKIA 3FVOA 4G12A 2M8CA 1U9OA 2FA7A 2Y84A 3TW6A 4A3IJ 2F6PA 1IXGA 3B6CA 3U8QA 4GLIA 4EF1A 4FORA 4ZS9A 2DA4A 3Q26A 3KSJA 1B3HA 4M3FA 1FW0A 2DVZA 1B5IA 3HOXJ 4A3JJ 5K2XA 4U4SA 4QIWN 1TFAA 3PGFA 2LFBA 1SQYA 4B4CA 4ZEIA 4DIGA 4IHVA 2RAEA 4OYVA 2AHQA 1FQEA 2ALUA 5EZGA 5K2YA 1I6BA 1B58A 2XXVA 3EQ1A 4CYCA 3L6HA 5J1DA 2AL4A 3UIFA 1A55A 3TTRA 2V84A 1GV2A 1IV6A 5F27A 3LSPA 2XXPA 5F0FA 4OTEA 3MPLA 4QRZA 3W6VA 4E0WA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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