1MH3A

Maltose binding-a1 homeodomain protein chimera, crystal form i
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
421
structure length
421
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTAAAAAISPQARAFLEQVFRRKQSLNSKEKEEVAKKCGITPLQVRVWFINKRMRSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into binding cooperativity of MATa1/MATalpha2 from the crystal structure of a MATa1 homeodomain-maltose binding protein chimera
pubmed doi rcsb
molecule keywords maltose binding-a1 homeodomain protein chimera
molecule tags Sugar binding, dna binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 144
structure length 421
sequence length 421
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF00046 Homeodomain Homeodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.60 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Homeodomain-like 1mh3A03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh3A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh3A01
3H3GA 4NF5A 4GQOA 2I3WA 1TWHJ 5EGOA 2AO9A 4GFRA 1YTVA 1AL3A 2PT2A 1I69A 2QF7A 4BKXA 1N7WA 1QPIA 3B6WA 4FECA 1B72B 2O9LA 2QL3A 5E3LA 2Y7IA 3MZBA 2P0SA 4POXA 2DWAA 2XXWA 3A09A 4OXVA 3SEWA 3KGCA 3FXUA 2DVCA 4LZ8A 1OQHA 3OSRA 3MPLA 2DTZA 4MIMA 4IY6A 4LZ5A 3TPAA 3HEFA 4RYAA 4A3EJ 4DDDA 2Z23A 4I6ZA 1XC1A 2F6PA 3QAXA 4KQPA 4DXCA 1U78A 2H98A 4DYCA 4R9FA 3MKLA 2NVQJ 3QUJA 3WAFA 1SW1A 2YU9J 2R71A 1QVUA 4GIZA 2FJ1A 2Y2ZA 3QIMA 5AA4B 1ETQA 4XIGQ 1EZPA 1MSEC 4M1VA 1N0TA 2H4IA 2ZNSA 4OZ9A 2EZKA 2K9SA 4IHXA 5L9MA 5J1YA 1B2HA 1L5TA 1NL5A 1POTA 4ECFA 2OPTA 4ELQA 2JK3A 5H8HB 1CB6A 4R9GA 1LB9A 1Z7NE 1MQIA 2H1KA 2F7CA 1LFHA 1TWCJ 4XXUA 3B6QA 1IG7A 4DZ1A 2XXHA 1SYIA 3GXAA 1D9VA 4HS7A 1JUPA 4E0XA 3IB0A 1B6HA 4IO2A 1ZKBA 3SERA 3UIFA 3QYTA 3T22A 4LQ2A 4A3BJ 3FD3A 3F0CA 1OJLA 3N5LA 5KCJB 2DMPA 4G68B 3DELB 4FORA 2H99A 2CJJA 1DSNA 1ZQ3P 1AKHA 3O2AA 2MGQA 1RETA 1M5DA 1FTMA 1SQYA 4XRMA 3C35A 4F3GA 3H6VA 4FTHA 4IO7A 4ABZA 3QQAA 3EN3A 3UK4A 1NH8A 2NVUB 2HOAA 1MM6A 2LD5A 3CIJA 1ZGWA 1Q1KA 5DVFA 3ZQIA 2GM4A 2QPQA 2Q8JA 3HSTA 4XTCQ 2E0SA 1FCKA 2Z22A 3PO2J 2I4CA 1LAXA 1BJZA 3RT6B 4H6DA 3MAMA 4G8NA 4YAHX 1IXHA 2QCOA 1IC8A 2OWTA 5E3MA 4C1TA 5EHSA 1FTOA 2LAOA 1B05A 1NK3P 2Y0SN 1ZIUA 2O68A 1GV5A 5AA2D 1FQAA 4A93J 4O3CA 3GTKJ 2ABHA 3OSGA 3FK6A 1B5HA 2F5XA 4IGTA 3PM1A 1ANFA 4JSDA 1FTLA 1VSOA 2YJPA 4EDPA 4OYVA 1DPEA 1JKOC 2PT1A 5L9OA 1A6IA 2MG4A 3SKPA 1JKPC 2B3BA 1X2MA 1IZ1A 4TQUQ 2VP1A 3DEWA 2HEUA 4PFWA 2F8DA 3C33A 5JLXA 3S1NJ 2EBIA 3AXFA 2F36A 3CI8A 1IXIA 1QUIA 1LE8A 4FCYA 2ZYOA 3H4ZA 2H8RA 2Y7WA 4NF8B 3BR2A 5BNGA 3OENA 3WAEA 1XS9A 5DYHA 5EZGA 1XVYA 5IPAA 3FATA 4NE4A 1JW5A 5L8DA 4BDNA 4Z7EA 2M0CA 2UVJA 1B52A 1JT0A 3HHGA 2ELKA 3A01B 2DJNA 1SVXB 3RKQA 3FIRA 5ELVA 1HDPA 3USDA 3OOUA 1B8IB 3S2VA 3HOXJ 3K1MA 5IP6A 1UG2A 3O6HA 1A8EA 3JRHA 3TZAA 3KOTA 3I6VA 4H5GA 5EHMA 5HPQA 2YPNA 4OFJA 2Y7KA 1B3FA 4UUSB 1JTYA 2ME0A 2R5YB 2NVYJ 5FKOA 1GVDA 1FIAA 1B46A 1ZR4A 2FNCA 2WAQN 4LA9A 3IB2A 3Q28A 5EG0A 4THIA 2CUFA 4GOTA 3N26A 1N76A 3N94A 2DWJA 4LUBA 1APLC 5H8FB 4JDFA 3M3FA 3CMYA 3KEIA 2R93J 3U93A 3FASA 1JKRC 2QJEA 2ONKE 1MPDA 2DA2A 1Y20A 4F39A 2PBWA 4QF9A 3HOVJ 1OIBA 2D5WA 3Q25A 2HQ5A 1M5FA 4EQBA 3CDLA 4A3LJ 5FKMA 1M5BA 4C3HJ 4XKQA 2HOTA 4A3MJ 3EF7A 1B1HA 4WXJA 5J1UA 1D5YA 1MY0A 4BLAA 5AE4A 1XG1A 1EZ9A 5EEAA 3W15C 1VNDA 2ZNTA 2ECCA 4EXKA 2E1SA 3KFMA 1FQCA 1MXXA 4DXUA 1ETYA 4PFUA 5FLVA 1OLCA 5K7FA 4FE7A 4U1OA 3VLWA 2KDZA 4ZDMA 2VOZA 4BDMA 5K7HA 4MLOA 2IA4A 1Q35A 3GBGA 2JJ7A 3ZOBA 3PMWA 4N07A 4D5FA 2Z8EA 3MJNA 5F08A 2A5TB 2D21A 5F0HA 2Y9ZA 2Q2AA 2DMQA 5CRYA 1JW1A 4OWDA 4U21A 2THIA 1OFCX 1Y1WJ 1UTBB 4F1VA 3LSWA 3EQ1A 1X58A 4AQ4A 1ATGA 3MP8A 1PB9A 1EU8A 3PUWE 2WV1A 4QFKA 1VF9A 1XT8A 5IAIA 3SDGA 1LB8A 1H45A 2XX7A 5A5XB 2DA5A 1ZJLA 2CQQA 4ELOA 1MQHA 1BKAA 1MBGA 3JR9A 3IJOB 1B5JA 1DOTA 2O7IA 4G8MA 3ONMA 4QFOA 2VD2A 3EHTA 1VI0A 1IRZA 2DXRA 2RCAA 1XHYA 1ETWA 1MS7A 2HQ0A 2X7PA 5IP7J 2K9QA 1QUKA 4YB6A 2G29A 5AA2A 1FJLA 3OSQA 2L7FP 4PE5B 3KSXA 3MQ9A 4IHYA 3FV2A 4LONB 3BTLA 3OELA 3UKGA 3RPWA 2D5VA 1O63A 3P7IA 4QRZA 4NTLA 1B9JA 2UVIA 1BP5A 5FHOA 1AMFA 4A3JJ 4GL0A 2QS3A 3TYHA 3GTLJ 1B3EA 5EZHA 1SYHA 2DA7A 1US5A 2B63J 2X26A 1CQTA 2LTPA 5FLMJ 1IQ7A 3QXMA 1I6HJ 1B7ZA 2V84A 4I9DA 1O4XA 3O6IA 2Y84A 1IUFA 4EQ9A 3O9PA 2UYFA 2HXWA 4H65A 1JVXA 3BG3A 2DA6A 1GGGA 4ZEIA 4DW6A 3RTWB 4GFBA 4HTGA 4G12A 5GPAA 2M9HA 4NF5B 4EF1A 3S1QJ 5EGOB 5IYBJ 2HZKA 4ZEFA 1GV8A 3HDDA 4D7NA 3VPRA 5M3FJ 4I8CA 4YKJA 4YMBA 1H43A 2EH3A 4R6HA 4IO3A 5FHNA 1ETOA 1BW6A 2R0QC 1GUUA 1TC3C 2R6GE 3S2DJ 4F22A 1A99A 1MXUA 5DEXA 1URSA 5C3EJ 1ZLQA 1QUJA 1U8BA 3ZQFA 3K00A 3DM0A 2M8CA 4OVJA 3FXQA 3TAJA 2HOSA 2V3QA 3VV5A 4XK4A 1B51A 4DCXA 4RK2A 1RR7A 3HPIA 3JZJA 5I58A 3IJXB 3JRIA 3E13X 2XPUA 3FK7A 3JRBA 2O7UA 3IR1A 4TLMB 1I50J 3MZ1A 5EYRA 4IHWA 2MSYA 4JWYA 3S9NC 1Z7ME 5ICQA 4ZEBA 1XVXA 4FIMA 1LFIA 1B40A 1DU0A 3S14J 4R75A 1MDP1 3TW6A 2AHQA 3S2HJ 2ZMBA 4FE8A 4IB2A 4QIWN 4RPOA 2YS9A 2K9NA 4C2MJ 1XOCA 3ILTB 4DZJA 2I49A 3VVDA 3QSLA 3HCQA 3TFLA 4F3BA 5ITOA 3H0GJ 4AB5A 4LVQA 1NTCA 4RNSA 1D3KA 1H3DA 3TQLA 3IX1A 4Y7NJ 1JKQC 3OEMA 2LKXA 1SI0A 1RYXA 1MXZA 1JEVA 4AB6A 4EXLA 4XRSA 4MFIA 2JA5J 1YRNB 2I0CA 5BWJA 3PD8A 3IOTA 3KJ7A 4X9TA 5ICTA 3I4MJ 1AKHB 4JSOA 1LFGA 3CSGA 4C3JJ 1IGNA 4YICA 4TOZA 3V8XB 4M3FA 4R6KA 3FVOA 3PUZE 1LAFE 3A3UA 3ZQLA 4FEBA 3BR3A 3TKDA 4YKPA 2I48A 4ZZAA 1N84A 4KYEA 5M2VA 3BG9A 3TTMA 3R6UA 2IEKA 3HOYJ 3F11A 1M5CA 2L0KA 3HBLA 2RF1A 5CC2A 3SEVA 4DXBA 3JREA 5B70A 5HBCA 2P81A 4HCWA 4KYSA 1GDTA 4A3FJ 5E3OA 3TTRA 4NEDA 2AIXA 4XKNA 2Y31A 2ECBA 3O28A 3M3YJ 1TXFA 1Y1VJ 5FTHA 3QK6A 1VR5A 4ELRA 2QMXA 1WVJA 3TDJA 3B6TA 5IYCJ 4F31B 4GD5A 4BDQA 1HDDC 3OO9A 3BTCA 3M4OJ 2UVGA 1Y1ZA 2V25A 3C36A 3LC8A 2Z8FA 1Z77A 3G1LA 2M34A 3TW7A 3SFIA 2FD5A 1URGA 3PPOA 5TU0A 3CFZA 1MQJA 4KHZE 3PV0E 3S9LC 1LE8B 4B4CA 1B7UA 1YRNA 1AU7A 4H67A 1A5JA 2QS2A 1P99A 3K02A 4JP0A 3U94A 2NOOA 4A69C 4KI0E 2DA3A 1ORKA 4G68C 1NNTA 2WB1N 4I1DA 4YU0A 3T9VA 1ZBMA 3EHUA 3FJ7A 1FW0A 1ZMGA 2H5YA 4DLDA 2D3IA 4MFDA 2X7QA 2DA1A 4BBRJ 3N6UA 1K83J 1BLFA 1B4HA 4IHVA 3MPKA 2G93A 5CM6A 4YKKA 3T96B 4OENA 4IGRA 4Q30B 4E0WA 3UN6A 3BTIA 3VXCA 3C32A 3OD7A 2ZYMA 1KWHA 4JWOA 3MZ9A 1EZOA 3H6TA 4R72A 4ELPA 1JNFA 4GXSB 3IOVA 5EG0B 2OBGA 1USYH 4C0RA 4AC0A 3O8HA 2ID3A 1FTKA 5FHMA 4G8HA 4OQOA 1UHSA 2I0BA 2AL5A 2OK2A 2Y30A 3K7AJ 3CRBA 4GF8A 3PMXA 5F7VA 4ESXA 3K6UA 1NNPA 2DMUA 1ZK8A 4F1UA 2CRGA 3LSLA 5TP9A 3FIWA 3HOUJ 4NF4A 1YPNA 5H8NA 3G3JA 3ZQHA 3B7DA 4MF3A 2JMWA 3S4UA 3FXRA 1ZKGA 1ZTRA 4ZZEA 3JRDA 2LK2A 1RYOA 4BDLA 1NFTA 3H6UA 4X1BA 1UIUA 5HODA 1MQGA 3GTOJ 4WEDA 2FQ4A 3OEKA 1Z0XA 4M4GA 3E7LA 5HM4B 2RC7A 2E2JJ 4V2FA 3I3VA 2R92J 3TCHA 4BDOA 3Q0VA 2O1MA 4N13A 4LOCA 1TFDA 2O1LA 2GLOA 1WGXA 3OO6A 2DYXA 4LQ5A 1JVYA 3TTLA 1WODA 4GXAA 3T9UA 3H3VK 4OFOA 3MN2A 2CZLA 2VKEA 4OERA 1QW0A 4I76A 1O64A 1Y4CA 1QKBA 3G3IA 3D4CA 1II5A 4AYBN 2OWSA 5ISUA 1ZU0A 4RA1A 4U4XA 1MRPA 2XXVA 2O84X 3GTJJ 5M5WJ 2X48A 4JX6A 5L9SA 3W9VA 5ITPA 1DTZA 4IO5A 4OEVA 5H8SA 5H8QA 4ISUA 3HGYA 1FQDA 1CE2A 4A3KJ 1Y4TA 2XRLA 3RN8A 2NUVA 2HZLA 2GRVA 4F2QA 2O6AA 3C2BA 5IOYA 3TUSA 3TCFA 4FEDA 1VFEA 3IOUA 3PPNA 3SEUA 3K1PA 3CQZJ 3V5AA 3SJMA 1IIWA 1B3LA 3RT8A 4G2ZA 2TRTA 1Y1MA 3U92A 4JYKA 3UP9A 2XB0X 2F6GA 2H25A 5AA2B 1UMQA 1SDXA 4ZECA 5BUUA 2XPVA 1NNKA 2RINA 1TWGJ 2RC8A 1G2HA 2CU7A 2FYIA 4PETA 2XHDA 1W0TA 3ZKKA 3GTPJ 2ALUA 3BQYA 3U1OA 3NAUA 4XKRA 2Q9TA 1UTHA 2Z8DA 3K01A 1LAGE 4EUOA 3PPRA 3LNQA 1WH5A 3TEDA 1T56A 2B65A 1FTZA 3MVWA 5JTYA 4F3PA 1B7HA 1H89C 3CCYA 1R9TJ 3MP6A 3IOWA 2XXXA 1PEBA 4W97A 1VFCA 1ZR2A 2VD3A 3MVPA 4Q0CA 1MBEA 4O3AA 3TCGA 3QPSA 3JRAA 5DVJA 2EQRA 2OCUA 2DWHA 4YB5A 4YMAA 1B0HA 1BTJA 1HSEA 1PBQA 3Q0UA 4Q8RA 4NF6A 3VVEA 4WEPA 5TPAA 3HGGA 4M3EA 3GBBA 4F2OA 2HI3A 2HXIA 5CBSA 2F7AA 3LSGA 2F78A 2P2AA 1PDAA 3IK6B 4ZE8A 5I59A 1BA5A 3PGFA 1ITYA 5EYFA 3O29A 1QULA 3LSRA 3UORA 2DP8A 3BQZA 5DEXB 2HAUA 2XXUA 5FKLA 3CVGA 2DE2A 4H8IA 5I2NA 1P1WA 4RY1A 3GLBA 4ONYA 4DE8A 2XXRA 5JEIA 1H76A 4OHNA 3V89B 1I3QJ 3WHCA 3B6CA 1SW2A 3RZDJ 3PO3J 2XGEA 4GLIA 3K4UA 1YAEA 5I58B 3A03A 3KN7A 3D1NI 1JGGA 3VDFA 3CG1A 4U1ZA 1R1NA 3O66A 3KZGA 1BIYA 1YCJA 4DYQA 3IO6A 3ODBA 1A40A 4BDRA 2XXTA 4Q5TA 1MXWA 4JWXA 5CMKA 2NVTJ 1OMPA 2DMTA 4KCCA 3SEYA 3PU5A 4HW8A 1WI3A 3HOWJ 4LP2B 3IH4A 4QFPA 3JYRA 2NOGA 2W48A 4KPTA 2R5ZA 1TFAA 3K6XA 1ETVA 3G3FA 2RKMA 5GP9A 3GTGJ 2ONSA 3TELA 2PYYA 3HHFA 4H5FA 2ZB9A 5IP9J 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1TT0 A;  3V7C A;  1B1X A;  4AD9 A;  1P1N A;  3F3X A;  4MAG A;  4MLV A;  4DIG A;  2ZME B;  3GF2 A;  2E2H J;  4NC8 A;  1US4 A;  3KG2 A;  4P1L A;  2IA1 A;  4H8J A;  4C2U A;  3HUG B;  3VLV A;  2EA4 A;  4NHB A;  3OSF A;  1AA7 A;  1PBP A;  3K0V A;  3LA3 A;  1E3O C;  3MUQ A;  4GL8 A;  4BQQ A;  2BJJ X;  1LFU P;  4GRI A;  1LBX A;  1MH3 A;  2V93 A;  3L6G A;  3LSJ A;  1LUJ B;  4PJN A;  4E4H A;  3IH3 A;  2M45 A;  5GPC A;  1P1Q A;  2Q88 A;  5LHG A;  2L01 A;  3K4C A;  3OMY A;  4Z6Y A;  4KR5 A;  4X48 A;  3E9X A;  1WJE A;  3FZV A;  2IGO A;  2PN6 A;  4YIR X;  2R7T A;  2XXP A;  2JUC A;  4F3S A;  1BBY A;  5JVT A;  3K0L A;  4A5N A;  3FVN A;  5CI5 A;  4V2G A;  3BTJ A;  2ZBK A;  2AL4 A;  1JUM A;  4N4N B;  1G3S A;  1P4A A;  2HZD A;  3HOZ J;  3HV1 A;  4JB7 A;  4RK9 A;  1FBU A;  4PFY A;  1WDN A;  4A0X A;  2PMU A;  3CDI A;  4LMY A;  1U3E M;  1NV0 A;  1IDZ A;  5J4Y A;  4F52 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 3H3G A;  4NF5 A;  4GQO A;  2I3W A;  1TWH J;  5EGO A;  2AO9 A;  4GFR A;  1YTV A;  1AL3 A;  2PT2 A;  1I69 A;  2QF7 A;  4BKX A;  1N7W A;  1QPI A;  3B6W A;  4FEC A;  1B72 B;  2O9L A;  2QL3 A;  5E3L A;  2Y7I A;  3MZB A;  2P0S A;  4POX A;  2DWA A;  2XXW A;  3A09 A;  4OXV A;  3SEW A;  3KGC A;  3FXU A;  2DVC A;  4LZ8 A;  1OQH A;  3OSR A;  3MPL A;  2DTZ A;  4MIM A;  4IY6 A;  4LZ5 A;  3TPA A;  3HEF A;  4RYA A;  4A3E J;  4DDD A;  2Z23 A;  4I6Z A;  1XC1 A;  2F6P A;  3QAX A;  4KQP A;  4DXC A;  1U78 A;  2H98 A;  4DYC A;  4R9F A;  3MKL A;  2NVQ J;  3QUJ A;  3WAF A;  1SW1 A;  2YU9 J;  2R71 A;  1QVU A;  4GIZ A;  2FJ1 A;  2Y2Z A;  3QIM A;  5AA4 B;  1ETQ A;  4XIG Q;  1EZP A;  1MSE C;  4M1V A;  1N0T A;  2H4I A;  2ZNS A;  4OZ9 A;  2EZK A;  2K9S A;  4IHX A;  5L9M A;  5J1Y A;  1B2H A;  1L5T A;  1NL5 A;  1POT A;  4ECF A;  2OPT A;  4ELQ A;  2JK3 A;  5H8H B;  1CB6 A;  4R9G A;  1LB9 A;  1Z7N E;  1MQI A;  2H1K A;  2F7C A;  1LFH A;  1TWC J;  4XXU A;  3B6Q A;  1IG7 A;  4DZ1 A;  2XXH A;  1SYI A;  3GXA A;  1D9V A;  4HS7 A; 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