1MH4A

Maltose binding-a1 homeodomain protein chimera, crystal form ii
Total Genus 136
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
136
sequence length
418
structure length
418
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTAAAAAISPQARAFLEQVFRRKQSLNSKEKEEVAKKCGITPLQVRVWFINKRM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into binding cooperativity of MATa1/MATalpha2 from the crystal structure of a MATa1 homeodomain-maltose binding protein chimera
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding, dna binding protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords maltose binding-a1 homeodomain protein chimera
total genus 136
structure length 418
sequence length 418
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF00046 Homeodomain Homeodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.60 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Homeodomain-like 1mh4A03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh4A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh4A01
1SI1A 4IO7A 3PU5A 3FK7A 5C44J 2X26A 4DCYA 2F7CA 4OENA 1Q1KA 3B6QA 3BQYA 5F0CA 4B3AA 4QTRA 4FIMA 3NAUA 4I76A 3IB0A 4JB7A 4F3SA 1WH7A 3BR2A 3TEDA 3QYTA 3Q29A 3FVGA 2F6GA 1FTTA 4YU0A 2L7MP 5FHNA 1N0TA 1NNFA 1B52A 3SESA 5I57A 3TUSA 2XXWA 3RPWA 1QUKA 3GBAA 1LE8A 4EUOA 4M4GA 5F04A 1WODA 2ZXTA 2GH9A 2DA1A 2LP0A 1P1OA 3CR9A 1OJLA 4KYEA 5LOMA 1VE4A 2RINA 5BUUA 2L9RA 3F0CA 4FECA 2IA4A 2I4BA 1Q35A 3RT6B 2DSFA 1MY4A 4BY7J 2I4CA 2DXRA 1J1NA 1ELJA 1I3QJ 2JA5J 4JWXA 2V3UA 4R73A 2F78A 2Y9ZA 3GTJJ 4U1OA 4K3FA 5JTYA 2WV1A 1NH8A 2DA3A 1ZMGA 1SYHA 1QVTA 4H0WA 3OOUA 1O7TA 1JW5A 3KN8A 3P7IA 4F3GA 3O2AA 2D3IA 4QHQA 4Q8RA 1RPWA 5IOZA 4JSDA 4YMBA 1G2HA 2H8RA 2H5YA 4D5CA 4O3BA 3U8QA 3FKIJ 2O1LA 3H4ZA 4LQ5A 5H8HA 3KJTA 2YPNA 1A6IA 1B05A 2NVXJ 4BDQA 1VNDA 4WKMA 2TCTA 4FISA 2R92J 3FVNA 1OMPA 4G2ZA 2LAOA 5FKNA 3VE1B 5E3NA 1X2MA 3T93B 3JYRA 1RETA 2E2HJ 4UUSA 4BY1J 5E3LA 4XKQA 3IL1B 3HEFA 4NEDA 1MQHA 4ECFA 3AXFA 4YAHX 5L9MA 4IHXA 5I2NA 1HSJA 3BG9A 3CRBA 4IY6A 3B6TA 3TTLA 3QK6A 3OSGA 4F1UA 5JEIA 2QRYA 2V3TA 4EF1A 5IYDJ 3K6UA 4DZJA 3PUYE 4U21A 4PE5B 1MDQA 4G77A 1GUUA 1JGGA 1I6AA 3IJXB 1MNMC 4MFDA 3FGSA 2Y0SN 3DELB 5M5YJ 5IKBA 2R5YA 3E9XA 3W9VA 1JJ8C 3PO2J 3Q0WA 3JV9A 2Y31A 4GIZA 4NF6B 3VVFA 2EZHA 2F7AA 4F2QA 3S9MC 2QMWA 4Q0CA 2GRVA 3OO9A 3SKPA 1SW4A 4U22A 4GL8A 1LBBA 2HQ5A 1JW4A 1VFDA 5I58B 4QSCA 3IH4A 1S7EA 4F1YA 1FEXA 1AH5A 3PV0E 2ZNSA 3C34A 2VKEA 4F31B 4BBRJ 2R5ZB 3S2HJ 3SDFA 3OMBA 1ZLQA 4FE4A 1B0LA 1ZIUA 5B70A 3S16J 1K83J 3S17J 2L7FP 2NXOA 3ZS6A 5FHOA 3I4MJ 4W97A 4TOZA 1MPBA 1FIPA 1FCKA 4RDUA 4NTLA 4RYAA 2MG4A 4RY1A 1MBHA 4M3GA 4RBOA 4A3LJ 3HOXJ 4OHNA 1Y1MA 3O66A 3G3GA 2HEUA 3T22A 2LTPA 1DSNA 3VXCA 2ESNA 3ZQCA 4N07A 3U94A 4C0RA 1T33A 4KYDA 5H8NB 2QCOA 5H8FB 3SEVA 4JSOA 2OWSA 1ZJLA 2AHQA 5DT6A 2XXPA 1ZKBA 2UVGA 1MY1A 4QFPA 4BBSJ 3RTWB 4GFRA 1MXXA 1IDYA 1KWHA 1Z7ME 4RK9A 3GBGA 3VLWA 4R6YA 1AU7A 4MO7A 3TODA 2PYYA 1ETOA 5IPAA 4DDDA 5F0FA 1WH5A 1DMBA 4Q5TA 1QW0A 1I6HJ 2X48A 4IO3A 2XXTA 4ELRA 1P7JA 4ZDMA 1MPDA 3C4MA 2XHDA 2YUSA 5M2VA 1M5EA 3FD3A 3UN6A 9ANTA 4ESWA 1TWFJ 2YLNA 1Y4TA 1A40A 4L5EA 3O6HA 5K2YA 4DYCA 1LAFE 1LAHE 1GR2A 4I9DA 1IIWA 4G12A 5E3OA 3KSXA 2M2EA 2ME6A 3S1QJ 4GLIA 4Z0IA 2Y2ZA 1TWCJ 2W48A 1H8AC 4H6DA 4FJPA 2FYIA 1B3FA 2H98A 3FXUA 3VVEA 4A3IJ 2HDDA 2RC9A 3KSJA 1Z0XA 3PUXE 2UVIA 4GF8A 1B5IA 1JVYA 4IY5A 3OIOA 4H65A 1I69A 1MBGA 2ZYMA 3WAFA 4NF6A 1S7YA 3ZOBA 2JA6J 1MH3A 3HKZN 2K9NA 2G93A 4PFWA 3C35A 4Q30B 4PQJA 1MG1A 3H6UA 4QSEA 4KHZE 4OERA 1MBFA 1A5JA 3S14J 5I58A 2REJA 3CMYA 1AL3A 2HOAA 1HDPA 1DU6A 4AB6A 3ZQGA 5TU0A 4W1UA 1RKWA 2Y7IA 5F08A 4XIGQ 1H44A 4HNVA 1O64A 3BBRA 3B6AA 5GPCA 3W9WA 2GHBA 2R5ZA 2ZNUA 4C3HJ 2FX0A 1Y3NA 4ZZEA 1OFCX 1NL5A 3V8XB 1ETVA 1MQJA 1BLFA 3IK6B 3ILUB 3PUZE 2HAUA 3O6GA 4QSDA 3W15C 3K6WA 5CRYA 2HI3A 4OTEA 3Q25A 3BR1A 1X2NA 3U1OA 3MVZA 3T9XB 1IC8A 1A7LA 3HSTA 1Y1WJ 2O7UA 2M8CA 4XRSG 4OQOA 1XVXA 3PD8A 2NVYJ 3DP4A 4H5FA 4BDMA 4AQ4A 3C32A 4KR5A 3H3VK 5IP6A 4OZ9A 1MXYA 3PUWE 5H8NA 1LLSA 3MVPA 5H8FA 1PC3A 2NWJA 2H1KA 2X6OA 5EGOB 1JQFA 3LSWA 1B3LA 4Y7NJ 2V93A 1JEVA 1LFGA 3BR5A 3CFZA 3KFMA 4P11A 4JBZA 4XRMA 1P1UA 4Y52J 3MPKA 2VPRA 2QPQA 5FJ8J 5E3MA 4I1DA 4U2RA 2DYXA 3U92A 5DTBA 3DP6A 4C3IJ 5J1RA 1OQHA 3RTFB 4G68C 1XHYA 3FXQA 3G3HA 1IV6A 2QF7A 3FASA 4L17A 3BR0A 5F0HA 3MUQA 5HODA 3BTIA 4NF5B 3TEPA 3GXAA 1TXFA 1USYH 4B4CA 3K00A 1HF0A 3OELA 2V84A 2XD3A 1IQ7A 5CC2A 4OYVA 4OMBA 1SVXB 4BDOA 5EEAA 5I84A 3TCFA 3PGFA 3ZKKA 1YTVA 3ZQFA 5F1QA 1MPCA 1N84A 3UK4A 1LFHA 1A8FA 1B0HA 4FE8A 2I10A 3IR1A 1CQTA 3OXNA 1B2HA 2YS9A 2EH3A 1MXUA 4QSHA 3LSFB 4PP0A 3JZJA 4KCCA 1BTJA 1XC1A 4EQ9A 1M5BA 4NWDA 4X6AJ 3R6UA 1IG7A 3CG3A 3MWBA 4GQOA 1ANFA 3FV2A 1POGA 2ABHA 2XX8A 2XX7A 4U23A 4GXAA 5BWJA 2F97A 3BQZA 1XC5A 1QPIA 4OXVA 2DXYA 3GTMJ 3HOZJ 5FKLA 2R0QC 3M8UA 5KCJB 4OWDA 1POTA 3MC2A 5HM4B 2CQXA 3FXRA 2JA8J 3BKIB 3T96B 2O7IA 1D9YA 4HS7A 2DMNA 3GTLJ 3FISA 3H06B 3L1PA 1FW0A 3K1MA 1AOVA 1ITYA 1WCMJ 4DXUA 2DWJA 2I3WA 2R9JA 1NNTA 1BP5A 4I6ZA 4LONB 1VFCA 4QIWN 1NK2P 4DCXA 1MM7A 3K6VA 3I5OA 2L0KA 1B3HA 2DA2A 3K6XA 5H8SA 2I0CA 3KZGA 3M3YJ 1H3DA 2F8DA 1Y1VJ 5M3FJ 4BKXA 5EGOA 2DA4A 5J3LA 3MVYA 4IGTA 1B72B 3LSGA 3FVOA 3O29A 4AUXA 2JJ7A 2KDZA 2NVUB 5CM6A 4ZEDA 1B1XA 1DOTA 2EZIA 3Q26A 4XICA 5IYCJ 3H03A 3M4OJ 3HPIA 1UG2A 4M3EA 3RNNA 1HSLA 1XT8A 1TWGJ 1BIYA 5ITPA 1DTGA 5KDTB 3IB2A 1B51A 2DVZA 1MSFC 5TP9B 5J1DA 3TTKA 1ZGWA 4RA1A 3HN0A 3ONMA 2YU9J 4JP0A 1B7ZA 1ETYA 2R7ZJ 2H99A 2NS8A 3PUVE 4LUBA 2PMSA 4C1UA 4NF5A 2XPVA 3M3FA 2O51A 5AA3A 2O7OA 2ELKA 2CZLA 1SW5A 4YB7A 2F5XA 3HV1A 2M9HA 4KI0E 3VXBA 2XGCA 3QPSA 3IO6A 1FTJA 1TT1A 3GTOJ 4F29A 5I56B 2L7ZA 1YCJA 1JUPA 2UVJA 3H6WA 1APLC 4DLDA 1Y9UA 3QPLA 1OCTC 3PD9A 4U4XA 4MF3A 4XK4A 1HLVA 2QS4A 3HGGA 4PFUA 3S1NJ 2DE3A 4MBPA 4IB2A 2ONKE 5DVIA 2UYFA 3OSQA 4Z7EA 1YPNA 3RLFE 1QUJA 1PUFB 2DE4A 1N76A 4QFKA 1LGBC 3N26A 2RCAA 1B5JA 3TQWA 2UVHA 1JT6A 1GV8A 2ZYOA 1XS5A 3B7DA 4ZECA 2VD3A 3SETA 2TRTA 1F43A 2AIXA 5KCJA 3JRGA 1F36A 2O1MA 3JRAA 3RQTA 4FCYA 1RESA 1JTXA 1QRYA 4NF4B 3WHBA 1HDDC 2I58A 3JRDA 2GLOA 4BDRA 5ISUA 3GBBA 1WVJA 1H76A 4MIMA 4M3FA 1S9TA 4M3BA 5EYRA 3CSGA 2OK2A 4A3EJ 1Z7NE 2CQQA 2XRLA 4D7MA 4F22A 1W0TA 1P99A 2Y9YA 4KD5A 2DWAA 3Q3SA 3CI8A 5M3MJ 1VFEA 4R9GA 4ZS9A 3Q27A 4X1BA 2GBYA 5J1YA 1DPPA 2FJ1A 2QSXA 3TTRA 2DWHA 1B32A 3KN7A 2IEEA 3LC8A 3MZ1A 2M34A 3HO7A 1Y20A 1ZQ3P 2HYJA 1BL0A 1EZPA 1B72A 3SEYA 4MLVA 4I62A 4RK2A 2RAEA 4XIDA 4F2OA 3O6IA 3SERA 1TC3C 2F36A 4C2MJ 4NF8B 3MVXA 1T0KA 3RT8A 3NARA 4H5GA 2JN6A 2OCUA 3CQZJ 4A3MJ 1JW1A 5ICQA 2DS9A 5FKOA 1JETA 1GGGA 1FQFA 5FTHA 1Y3QA 5KDTA 3A09A 2HQ0A 3TP3A 4JXIA 5TP9A 1QJMA 4GFBA 3THIA 1IJWC 4IHYA 1PDAA 2XPWA 2AO9A 2DA5A 3TAJA 2I6EA 1R1NA 2P81A 2NVTJ 3HOUJ 2Y7RA 3VLVA 2Z8DA 4U4SA 3E3KA 2XSDC 2LKXA 3M3LA 3VDFA 1VSOA 4FATA 4A3KJ 4CYCB 2VOZA 4XRSA 4HCWA 1US5A 4DZ1A 3DM0A 4G68B 1RKTA 2Q2AA 2B65A 4KFQA 5I56A 4PFYA 3HM5A 1MY3A 4O3CA 2NOOA 2HXWA 1UQWA 2QJEA 2CUFA 1B4ZA 2DWIA 3O9PA 4ZEBA 2H4IA 5CBRA 1ZBMA 3BR6A 3FUZA 1OIBA 3I4NJ 3BTCA 2P2AA 1D4NA 1PUFA 3SFIA 1RKMA 4LP2B 3TCHA 1RR7A 3FV1A 3DCFA 5CBSA 3TFLA 5JLXA 3LUYA 1VR5A 1ENHA 5DVJA 5H8QB 1Q1VA 1BJZA 5ICTA 2R93J 4GL0A 2RF1A 3U93A 1JKQC 4I8CA 1JVXA 3A01B 3CG1A 2KT0A 3IOTA 2BJJX 3MJNA 2LY9A 4NF4A 3VVDA 4R9FA 2PT1A 3L6GA 2QS2A 5L8DA 5ITOA 1ZK8A 1IXCA 3OD7A 3R7XA 4HW8A 1NFTA 4IGRA 2O9LA 5CMMA 4DE8A 3JRFA 2F34A 2DA6A 1QULA 2OWTA 2EZKA 4X1DA 4XKRA 1LCFA 2NVQJ 5HPQA 3FVKA 4H1XA 4A3FJ 1LAXA 2NUVA 4M3DA 1P1WA 3K2AA 3MW0A 1LB8A 1P1QA 2P0SA 1MQDA 2AL4A 3I3VA 4EQ7A 3DP8A 2FQ4A 2OBGA 3OSRA 2NS7A 2B3FA 3S2DJ 2LR8A 3H0GJ 3G1LA 2DMQA 3OO6A 5CMKA 4GVOA 3GTQJ 3MN2A 2P1SA 2QS3A 4NF8A 3A3UA 3N5LA 3IJOB 4C3JJ 3TW7A 3MP1A 2K9SA 3MQ9A 1DPEA 4D5FA 2YJPA 1NNPA 4MFIA 1II5A 3TTMA 1UTHB 2I3VA 4MH5A 2W7YA 3IH2A 3A03A 1QKBA 2ME0A 1WDNA 4TQUQ 1TWYA 4DYQA 4MLQA 3UORA 4OETA 4G4PA 5DYHA 1MBEA 4QRZA 4WXJA 2VD2A 2Q9TA 2QS1A 3CIJA 3HHFA 3V5AA 1GTKA 4YB6A 2HCAA 2ID3A 2GHAA 5ELVA 4FE7A 3LSJA 3HB9A 1N04A 2IAIA 1FTOA 4CYCA 3LBSA 1JUMA 2OLBA 1O4XA 1A99A 3KBRA 3VFJA 2DQVA 3JRBA 4GWOA 4M1VA 1EZ9A 3SEXA 4G68A 3QSLA 3QAXA 4XKPA 4YMAA 3O8HA 3Q0VA 1JKRC 5F7VA 5IYBJ 3FK6A 5HBCA 2DMUA 2F6PA 4OEUA 2O8KA 2THIA 1QUIA 2Y7PA 3R26A 1NNKA 5J1UA 1Y1ZA 1B4HA 1PBPA 4PETA 4UA8A 4AYBN 1OCPA 4X9TA 3RUMA 3OEMA 3KEIA 1JT0A 4IHWA 3IB1A 1MM6A 2XGEA 3DEWA 3HDDA 1QVUA 2Q88A 3H6TA 5EHMA 3TYHA 3CDLA 4FTHA 1PB9A 1LB9A 4R6KA 5H8QA 5K7FA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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