1MH4A

Maltose binding-a1 homeodomain protein chimera, crystal form ii
Total Genus 136
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
136
sequence length
418
structure length
418
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTAAAAAISPQARAFLEQVFRRKQSLNSKEKEEVAKKCGITPLQVRVWFINKRM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into binding cooperativity of MATa1/MATalpha2 from the crystal structure of a MATa1 homeodomain-maltose binding protein chimera
pubmed doi rcsb
molecule keywords maltose binding-a1 homeodomain protein chimera
molecule tags Sugar binding, dna binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 136
structure length 418
sequence length 418
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF00046 Homeodomain Homeodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.60 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Homeodomain-like 1mh4A03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh4A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh4A01
1JUMA 4QFLA 2DA2A 4FE4A 4RPNA 3RN8A 1Z0XA 4F39A 2PYYA 5F7VA 1ZKGA 2MW8A 3DP4A 4M3GA 1H44A 1A55A 3R6UA 1M5FA 3Q28A 2F5XA 3H06B 3TTNA 1DSNA 4L17A 5M5YJ 5ITPA 2XXYA 2PX1A 4IO6A 4NF5B 4H6DA 1OQHA 3IX1A 4ZEBA 1H76A 2LP0A 5EF6A 4U4SA 3QAXA 3EF7A 2OK2A 2LY9A 4ABZA 4QFPA 1QKAA 3HHGA 2DMTA 1MBGA 1OFCX 3S16J 5IP7J 4HTGA 5C4JJ 3M4OJ 4YZZA 1B46A 4M3FA 3HOYJ 1A54A 2XPWA 4POXA 4BY1J 1CB6A 4U22A 3BKIB 2CZLA 1RKWA 4QRZA 1YPNA 1B4ZA 2H4IA 2RKMA 1VR5A 1LFUP 2F6GA 1MBKA 1R6ZA 3N6TA 2FD5A 4ZECA 2I4BA 3VVDA 2H98A 2WB1N 2Z8DA 3MUQA 2XB0X 4Q5TA 3HB9A 4M3BA 3UGWA 2Y0SN 2DWJA 1B3FA 1SYIA 5H8NB 4H0WA 3KBRA 5EZGA 1A6IA 2Q89A 1FIPA 3KJ7A 2N8GA 4A3CJ 1B9JA 5TP9B 1MY2A 4F3BA 5IAIA 4XK4A 3BQZA 4JX4A 4EXLA 3GTOJ 4BDOA 1IUFA 1ETXA 4TOZA 5EZHA 1QUJA 5AA2B 1JTYA 3CFZA 5H8FA 4LQ2A 2LFBA 3CIJA 4NWCA 3MWBA 4G12A 1R9LA 1QULA 1N84A 5I2NA 4OZ9A 1Y3QA 4XTCQ 3UIFA 3TKDA 5L9MA 3LSJA 1N0TA 1P1QA 1ETKA 2XXTA 2VP1A 2NVQJ 1GVCA 5K7ZA 4JXIA 1M5BA 3QYTA 1FEXA 4WXJA 3M3FA 4ELPA 1B2HA 2R9JA 5I84A 5KCJB 4GL0A 4LZ8A 4PFWA 3FXUA 5I57B 1Y1VJ 3S9MC 3LC8A 1Y1WJ 4OENA 1B3LA 1Y1ZA 2H8RA 4DCXA 1N7WA 4LUBA 1JTXA 3MVPA 4BBRJ 1D9VA 2Y7RA 2F78A 4O3CA 2RC9A 2VHAA 3IOVA 2G93A 4KI0E 4OVJA 2JJ7A 3TEDA 3LR1A 2NOOA 1MH3A 1UTHB 4TLMB 4D5FA 2DN0A 1T0KA 2RAEA 3S9NC 2JA6J 4GD5A 4AYBN 3DEWA 5I2KA 3A01A 4IO3A 3KN3A 2NVUB 2YU9J 3IO4A 3EHSA 4ZDMA 4DW6A 2DMQA 1USYE 1UQWA 3VV5A 2GLOA 1LGBC 1FQDA 3IOUA 4O3BA 3D1NI 1ETWA 3CFLA 2V25A 3IB0A 2EZHA 2QPQA 4GFRA 2DA3A 3M8UA 2HXIA 1Y4CA 3EPEA 2OCUA 1T33A 2MSYA 5IYBJ 4KYDA 4C1TA 3PPNA 2FX0A 2OWSA 3HOZJ 2F35A 2O7OA 5DTBA 3CFXA 4W1UA 2XX9A 1CQTA 3G1MA 3OOAA 9ANTA 2NVYJ 2CUEA 4NF6B 2P81A 2FQ4A 1FJLA 2R92J 4I62A 4U2RA 1VSOA 1PUFB 2XXRA 5DYHA 1MS7A 3L6HA 2D21A 1EZ9A 2EZKA 3FXRA 4G8NA 1FQBA 1T56A 3PMWA 1X2MA 2ELKA 3MQ9A 3IK6B 3G3IA 2VUMJ 1B3GA 3SDGA 3K00A 3P7IA 1ETVA 3OSFA 4N6PA 3RTWB 1MQHA 3I4MJ 4IO7A 4U1ZA 1QRYA 3VXCA 1S7EA 1OCTC 1FQFA 5H8NA 5IYDJ 2ONSA 2EZLA 3O8GA 1JW5A 2ID6A 1JGGA 1X58A 1A8FA 3BTLA 4U1OA 3ZQGA 4FEBA 1JEUA 4RPOA 5TP9A 4V2GA 5ITOA 3KSXA 3MVZA 1SI0A 1QVSA 2ONKE 1ZMGA 3A3UA 1AHDP 3SJMA 1B32A 4FEDA 3UP9A 1MQIA 2H9BA 4F3GA 2MG4A 2F8DA 1XC1A 3U8QA 3QUJA 5CMBA 1MSFC 3TUSA 3KN7A 2DVZA 2Q88A 2B65A 1IXCA 3MC2A 3M3YJ 2ECCA 3GTPJ 4B1RA 2QS2A 1BKAA 3S14J 4P0GA 3RKQA 1LAFE 3OO9A 5F0HA 1BW5A 3HM5A 3IB1A 4OHNA 5KCJA 2NVXJ 1AL3A 1ZU0A 2ZNTA 1Q1VA 3JR9A 4HS7A 3DCFA 3H6VA 3A09A 1HOMA 3LSGA 5JEIA 2ABHA 4UUSB 4EQ7A 3TPAA 3G3JA 2ANJA 4B4CA 4C1UA 2HXOA 2BJJX 1B5IA 2I3WA 4ZEFA 3CCYA 4FCYA 4XIGQ 2DA6A 3BR6A 1UTHA 1I69A 3WHBA 2DWHA 4R74A 2E2IJ 3GTKJ 1TWFJ 3RQTA 2I0CA 5I58A 3N5LA 1M5EA 1EZPA 3IH2A 5H8HB 3H6WA 5C3EJ 1I50J 5ICQA 3LBSA 5BUUA 4JDFA 3OO8A 5H8QB 2DA1A 1VFCA 1IJWC 2DA5A 1VNDA 1LSTA 3IO6A 1JVYA 2VD2A 3Q3SA 2V3QA 4M1VA 4A3MJ 4RNSA 3EHUA 5HPQA 3H7MA 3LNQA 1MPDA 4OYVA 4E0WA 2E2JJ 3PPPA 1LFBA 2DYXA 3RGYA 4AB6A 3FVNA 1BA5A 5HODA 4LOCA 4HNVA 3HKZN 4IHYA 4A3FJ 3MKLA 1SI1A 1PB9A 4PP0A 2X6OA 3TDJA 1PC3A 2EBIA 3FK6A 3DELB 3U93A 4EQ9A 1WODA 4GL8A 4H1XA 3BR3A 2H1KA 2AHQA 2CQQA 1AH5A 2RCBA 4RA1A 3QPLA 4A3EJ 2Z23A 1B6HA 1AU7A 1FW0A 3MBPA 1FTMA 5GPCA 1HF0A 5GP9A 3RY3A 4QSDA 3S2VA 4BDMA 3JRDA 3Q26A 5TPAB 2CUFA 3GBBA 3FJ7A 4NEDA 5FHNA 4UUTA 3U94A 3ONMA 1MY4A 4I9DA 1HSEA 4X1EA 5FKLA 4MIMA 1MBEA 4UA8A 4RK9A 4F18A 2HFBA 2HZKA 2RC8A 4XKRA 1NMUA 5EDNA 1TWHJ 2Z8FA 3LSFB 2X26A 4NTLA 4MLQA 4ECFA 4F19A 4JYKA 4FISA 4RJZA 2LR8A 3HGYA 3BR1A 2RCAA 2Y2ZA 4R72A 1OLCA 1SDXA 3LSWA 1IXGA 1N76A 3E9XA 1JKRC 5FKOA 1NK3P 3BR2A 4QSHA 3JRAA 3OO6A 1TT1A 4DCYA 1ZK8A 3CSGA 3HOUJ 5H8FB 2F7CA 5CMMA 4U21A 5J1RA 2YUSA 1ZTYA 1XG1A 2R5YB 1JEVA 3G3KA 4R9FA 1DTZA 1MY1A 1MXWA 2YJPA 2DE2A 2XGEA 2L9RA 3S4UA 4W97A 1K83J 2XXUA 1B40A 1QJMA 3RT8A 2CU7A 3WAEA 1TFDA 3NARA 3PUVE 4GXSB 2O8KA 3D4GA 1DOTA 4GQOA 3JRFA 2JA5J 1PEBA 3QIMA 3UK4A 4MH5A 4O3AA 1SANA 3R7XA 1YCJA 3PD9A 1JT0A 3H6TA 4JWYA 1TWAJ 3K2AA 4QF9A 4NMYA 1O63A 5EYFA 3KFMA 2O9LA 5AA1A 1P1UA 1B5JA 4Z7EA 3MVYA 2GHBA 5FLVA 2O1LA 2PMSA 1OJLA 2K40A 2Y84A 2M0CA 2I10A 4XICA 1XC5A 2AL4A 2OZZA 3TEPA 4N13A 4FTHA 3ILUB 4KD5A 3QPSA 1POY1 3T22A 4ND9A 5I2KB 3A01B 1VFEA 1MH4A 4KCCA 2JA8J 2V3TA 3HBLA 1MSEC 2HOTA 1QVTA 3VPRA 3K02A 2VI6A 1N04A 1WCMJ 2DWIA 4A3DJ 1TWCJ 4MBPA 4IHWA 3SKPA 3VLUA 3IORA 4TLLB 5BNGA 4JX6A 3T96B 3FGSA 3C32A 1ZKBA 1ATGA 2HAUA 3H3GA 4OFJA 3T9UA 4N07A 4GLIA 1NL5A 5F0FA 2QS3A 1XHYA 5FKMA 2ZYNA 4KQPA 3JRBA 3PPRA 3I6VA 1GTKA 3PD8A 2O68A 3UN6A 1NFTA 3V5AA 1TXFA 4EDPA 2JWTA 4D5CA 4P0IA 3QXMA 5KZTA 5K2YA 1D9YA 5TPAA 3OO7A 3K6VA 2GH9A 4I1DA 3T93B 2GM4A 3O2AA 1FQAA 2F7AA 4Y7NJ 3SFIA 2GBYA 3K1MA 2FA7A 1MRPA 2HI3A 4BDNA 3GTLJ 5LOMA 3BTCA 1GV2A 3GTJJ 1PB8A 5B70A 1Z7NE 4YKKA 5AA4B 4BLAA 3TTLA 1TFAA 1DPEA 2B3BA 4EXKA 1RPWA 2DA4A 4RY1A 3B6WA 4H8JA 4QFKA 4R2FA 4F2OA 2OLBA 4GF8A 4ZZEA 4BXXJ 1URSA 2R5YA 1SYHA 5FHMA 4OTEA 1XVXA 3B6QA 4ONYA 1WDNA 1W0TA 4C3HJ 5ISUA 5EEAA 3IJOB 4YB7A 3H6UA 5HBCA 5AA3A 3FJMA 2CRGA 3A02A 4DE8A 5A5XB 1LE8A 3CVGA 4K3FA 1JQFA 3HN0A 2KLFA 5J1UA 2DA7A 5M5WJ 3OXNA 4MF3A 3ZQLA 1A8EA 4F1YA 2AO9A 1JT6A 1NKXA 5KDTA 2ZB9A 4H5FA 4QSCA 5FJ8J 1B51A 1S50A 1FTJA 1B5HA 3EQ1A 1URDA 2Y7WA 4IO2A 2XGCA 3FKIJ 2NXOA 3THIA 2DOJA 4DYCA 2X48A 1IGNA 4HCYA 1QKBA 3D4CA 5FKNA 4E0XA 4LA9A 3GLBA 2HOAA 2HXWA 4RBOA 3HO7A 5J1YA 3HOVJ 5C44J 4X9TA 1H3DA 5I58B 3BG5A 1LB9A 3H3VK 5E3NA 3C35A 4G8MA 1DU6A 4MO7A 2G0EA 1NH8A 1MBHA 2DMPA 3JRIA 1B8IA 3IL1B 4FIMA 1Y4TA 2FYIA 2ZYKA 4DXBA 4GOTA 1ZGWA 1IC8A 3VLVA 1JJ8C 1B7HA 1GDTA 3E3KA 2D5WA 1XOCA 3R26A 2F36A 3I3VA 2QMXA 3TODA 2GRVA 2XXXA 3BQYA 2E1SA 3O97A 3CI8A 1U8BA 1TWGJ 5K7HA 2ZNUA 2I0BA 4OEVA 3TTKA 1H8AC 1ANFA 2RINA 4YB5A 4I8CA 2IEEA 3IOWA 5AE4A 5F27A 4GVOA 3TP3A 5M3FJ 5I56A 1B7UA 2UXAA 2JA7J 3SEUA 4ZS9A 1NNPA 1L5TA 4R9GA 3O9PA 4NE4A 1Y20A 1MNMC 2LVSA 1APLC 1IUDA 1F9BA 3V89B 1VF9A 3TQWA 4DIGA 1IV6A 1QUKA 2Q8JA 3Q27A 5EYRA 5AA4A 3RZOJ 5CM6A 2V84A 3S9LC 1Y3PA 4BBSJ 3W9WA 1QVUA 1IG7A 5F04A 1S7YA 3F11A 3JYRA 1IRZA 1AOVA 1GT0C 3JRCA 1VE4A 2UVGA 2DE4A 3TTRA 1R1NA 3H0GJ 1MXXA 1OVTA 3OIOA 3CG3A 3ODBA 1HSLA 5FLMJ 2VOZA 3TP0A 3IH3A 1B7ZA 2LKXA 3PPOA 3G1OA 3OSRA 3ZOBA 1ZQ3P 4MFDA 3K6XA 1ZTRA 4D7NA 2XXPA 2L7MP 1MM7A 1SW1A 1O64A 3BR5A 4YB6A 4M3EA 4F22A 4M3DA 3E7LA 2QS1A 3UA8A 4OEUA 3VDFA 3PUYE 3M3LA 5A5XA 2WAQN 1LAHE 5TU0A 2ZYMA 3CR9A 4DYQA 5FKKA 4YMBA 2ALUA 3HOWJ 4R2BA 1Z7ME 1H45A 4PFTA 4Z0IA 3GXAA 1LLSA 2RC7A 3KG2A 4WEDA 2R93J 2VPRA 4DXUA 2LLKA 1TWYA 4P11A 1SW5A 3JREA 2Y7PA 1MQGA 5I59A 1PBQA 3LUYA 5CC2A 1BL0A 1WVJA 1OCPA 1MXYA 2DMUA 3Q0WA 5DT6A 2V3UA 3A3CA 2AL5A 5DVIA 1IXHA 1M5DA 1SFOJ 1MG1A 2DVCA 2KDZA 2HCAA 3QSLA 4FATA 2AIXA 4XRMA 2UVJA 1US4A 3B6CA 4H5GA 3FK7A 3O28A 4G2ZA 4IY6A 2G29A 2A5TA 2DP8A 4LVQA 3FD3A 2UYFA 3JZJA 4IGTA 1U9NA 2MGQA 3S1RJ 5IOYA 1J1NA 3IR1A 2RF1A 4C3IJ 3MZ9A 1K61A 3RPWA 1POGA 1P1NA 3V83A 2I6EA 4OETA 2PT2A 2CJJA 4OESA 4DZJA 3WHCA 1VFDA 2ZYOA 5CBRA 1LFHA 1H88C 1BJZA 2H99A 3AXFA 4IGRA 3KOTA 3BG3A 3PMXA 4QIWN 1O4XA 2NWJA 1BP5A 4QSEA 1ITYA 1FQEA 1ZBMA 4GIZA 2TRTA 1EF4A 2O69A 2QL3A 4LP2B 4BDLA 3CDLA 1AKHA 4X1DA 3S1QJ 1JW1A 3GTMJ 3SEYA 1UHSA 1RR7A 2M2EA 3MP1A 3PO3J 4F3SA 4XKQA 3W15C 2OPTA 2XPUA 2Q2CA 3FV1A 1X2NA 1PB7A 2B3FA 2H5YA 2OWTA 1SW4A 2PMZN 2GHAA 2XX8A 5L9SA 2W7YA 2VKEA 4OFOA 1EH3A 3ZKKA 1WI3A 5ICTA 4FE7A 1G2HA 1ZR4A 1JKQC 3IJXB 1JW4A 3QK6A 1I6HJ 4UACA 4ELRA 1TC3C 1PBPA 2WKYA 3TCGA 3H03A 5IOZA 2L7FP 2UVIA 3Q25A 1SVXB 5E3MA 2I48A 2I4CA 3VFJA 3B6TA 1SBPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2IP2 A;  1JUM A;  4QFL A;  2XKP A;  2DA2 A;  4FE4 A;  2L9S A;  4RPN A;  2KIU A;  5LBQ A;  3RN8 A;  4CIC A;  1Z0X A;  4F39 A;  2PYY A;  3AG2 H;  1ZKG A;  2MW8 A;  1HA8 A;  3DP4 A;  3QYE A;  5F7V A;  1D1B A;  2XF6 A;  4M3G A;  1IME A;  2HQR A;  1H44 A;  2VJJ A;  1A55 A;  1K9Z A;  1X1A A;  2RQQ A;  1VQN I;  3R6U A;  1M5F A;  3TKY A;  3U2R A;  3OYD A;  3Q28 A;  4NG7 A;  2F5X A;  4UNO A;  1ZH5 A;  3H06 B;  1RZ4 A;  3J7Z I;  5L9S A;  4CSW A;  3PQJ A;  2VXD A;  3TTN A;  2BOL A;  1DSN A;  1O57 A;  4L17 A;  5LGT A;  5M5Y J;  4HYE A;  2XXY A;  2PX1 A;  1MJA A;  5ITP A;  2CV2 A;  4HG2 A;  4IO6 A;  4NF5 B;  2VKD A;  5CJ9 A;  4H6D A;  1OQH A;  3IX1 A;  5ILU A;  4ZEB A;  3AL0 C;  4PFP A;  3ZMU A;  2LP0 A;  5EF6 A;  1T8I A;  1H76 A;  4F92 B;  3MYU A;  5LD2 C;  4M9Z A;  2LY9 A;  4ABZ A;  4BH9 A;  5IT9 K;  3P5J A;  1QKA A;  2B7E A;  2DMT A;  3HHG A;  3OL4 A;  1FBC A;  3IFA A;  1MBG A;  1OFC X;  1JI8 A;  3S16 J;  1BR1 A;  2F48 A;  5IP7 J;  2GOM A;  4HTG A;  2LF7 A;  5C4J J;  3M4O J;  1YLF A;  1J9I A;  4YZZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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