1MH4A

Maltose binding-a1 homeodomain protein chimera, crystal form ii
Total Genus 136
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
136
sequence length
418
structure length
418
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTAAAAAISPQARAFLEQVFRRKQSLNSKEKEEVAKKCGITPLQVRVWFINKRM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Insights into binding cooperativity of MATa1/MATalpha2 from the crystal structure of a MATa1 homeodomain-maltose binding protein chimera
pubmed doi rcsb
molecule keywords maltose binding-a1 homeodomain protein chimera
molecule tags Sugar binding, dna binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 136
structure length 418
sequence length 418
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF00046 Homeodomain Homeodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.60 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Homeodomain-like 1mh4A03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh4A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh4A01
3FASA 4ISUA 3K1PA 2X9DA 3MAMA 1ETXA 1JTXA 3MPLA 3OENA 1OLAA 3OSQA 5JK4A 5JLWA 3M3YJ 3K6XA 3CRBA 5L8DA 2F97A 5FLVA 1M5CA 3KN3A 5TU0A 2G29A 1SVXB 3K02A 4FEDA 4GOTA 3GTLJ 5I84A 3H7MA 2I10A 1H88C 1QVTA 3HB9A 2PMZN 4XICA 2XB0X 4MLQA 4XRMA 5AA2B 1RR7A 1SW5A 1Y4CA 1JW1A 3UIFA 2X48A 3LSJA 2I3VA 3BFTA 1SBPA 3CMYA 3S9NC 1G2HA 4P0IA 2QPQA 5FKKA 3D4GA 5AA1A 5M5YJ 4F31B 5F7VA 2M9HA 1H43A 1ZU0A 2XXVA 2P81A 4I62A 2XXRA 2JMWA 1IDZA 3Q29A 3KJ7A 4PFTA 1GVDA 5FJ8J 3LSGA 2DWIA 2NWJA 3G3HA 3PD9A 4N07A 4A3IJ 4AC0A 2LKXA 1MXUA 2XXHA 2DVZA 3BTJA 3TMGA 3TQWA 4H6DA 4LATA 5DVJA 1SANA 2Y30A 3TTNA 1P7IA 4ZZAA 3T22A 3THIA 4OQOA 4MFEA 4XXUA 4QFKA 3GZGA 1VE4A 4KQPA 5H8QB 4XIGQ 4U4XA 3PUVE 4NF4B 4A3EJ 1MQJA 4NDLA 1FQBA 1MRPA 1SQYA 3K4UA 1MXZA 2DA6A 2O1LA 2PBWA 4GQOA 1VFDA 2VGQA 5CI5A 2DQVA 3I4NJ 3KBRA 3HGYA 3PMVA 3ZQIA 4R73A 2HXOA 5CMMA 1YRNA 4X1DA 3TYHA 1A8EA 2RINA 3A3CA 3KEIA 4Q5TA 1VF9A 3HM5A 2XPUA 1N0TA 4GFRA 4H8IA 2V3QA 4R9FA 2JA7J 3NAUA 2XXQA 1EZ9A 4ESXA 2ZB9A 4Z0IA 4LVQA 3U1OA 1JKOC 2JK3A 3S9LC 3DEWA 2HZLA 1HDDC 2RF1A 3CIJA 3S1QJ 2NUVA 4Z7EA 2ANJA 5E3NA 4R2FA 3VVFA 1HCRA 1APLC 3IOTA 5AA2A 2ONSA 3FIRA 2D5WA 1B0LA 5CMCA 3DELB 1OCPA 3O29A 4H5FA 3UGWA 5I2NA 2WKYA 2XXPA 3HV1A 3K1NA 3C33A 1JNFA 1JQFA 3TELA 3IJOB 3VPRA 2LP0A 4O3CA 3O66A 1X2MA 4MF3A 3HOZJ 3USDA 4A93J 4OMBA 4XKNA 5ITOA 4I8CA 2XGCA 1ZIUA 2Y31A 3RT8A 1NNTA 1B5HA 4EXLA 3OSFA 2K40A 2Y2ZA 4X6AJ 3JRDA 3UORA 4OTEA 2HQ0A 2OCUA 4RPOA 3GBGA 3A09A 3K2DA 4ZS9A 4QSDA 2FD5A 5K2XA 4DLDA 2B3FA 3CSGA 1TXFA 4H65A 4P11A 4FISA 5IAIA 4LZ5A 1Y3PA 1B72B 1LLSA 4UACA 3FKIJ 5H8QA 3HCQA 1S7EA 3IH4A 3DP8A 3U72A 4AUXA 4AQ4A 1OCTC 1H45A 4OERA 4JP0A 3RGYA 3LSPA 4EF1A 4H1XA 4DZ1A 1B3LA 1JEVA 2XXXA 1Y1ZA 3PMXA 1O7TA 2YLNA 5C3EJ 4O3BA 4RNSA 3IB1A 1K83J 2Q88A 3HPIA 4N13A 1IITA 2R92J 4MLVA 4C3JJ 1P7JA 2LVSA 3KOSA 4WEDA 1ETWA 1B9JA 1Q1KA 3TP0A 4HCYA 1LB9A 1P99A 1LB8A 3FJMA 1NH7A 1JUSA 1MY0A 4B1RA 2OZZA 5M5WJ 3OO7A 2R9JA 3IAZA 5M5XJ 3MP8A 4KI0E 2NVXJ 3CFLA 3FVOA 4YB6A 4QFLA 3ZQFA 5L9SA 3RZOJ 5I2KB 5H8NB 2YPNA 5GPAA 1JW5A 3F11A 5DTDA 2JN6A 2COBA 1LFIA 1W0TA 1IIWA 2X26A 3GBBA 5M2VA 2NVQJ 2DA1A 1Z7ME 4K3FA 3H3VK 3OO6A 3WAFA 3LSXA 4OYVA 2L7FP 4LQ5A 2HAVA 3S2HJ 1AIVA 3UA8A 4Y7NJ 4OETA 1RYOA 1T0KA 2XB5A 1B5IA 2H1KA 5HBCA 4OHNA 1ZKGA 2AIXA 1X2NA 1AU7A 5AA4B 2VPRA 4JX5A 3FJGA 4KYEA 4OENA 3QYTA 2MGQA 4XTCQ 2I4CA 3FV1A 5CBSA 1LAHE 1DU0A 2JA5J 3KJTA 1FIPA 2O9LA 4TLMB 2IA4A 3UK4A 3VVDA 4DIGA 1B1XA 2Y7RA 4OXVA 1MPBA 3VFJA 2R93J 4A3BJ 4NTLA 5IP7J 4NMYA 3N6TA 3TODA 3C2BA 2W48A 1B72A 1B46A 1IXIA 1MDP1 3B6WA 1EZOA 1I6HJ 4BBSJ 2UVJA 4BDQA 4LP2B 5FTHA 3K1MA 3PUZE 3I3VA 4D5CA 3LSLA 3I5OA 3M3LA 2Z23A 1UTHB 4JX4A 4JWOA 4F2OA 1MBGA 2A5TB 4NE4A 2GM4A 3IV5A 3Q0VA 4KR5A 2HAUA 3OD7A 2RAEA 3VV5A 3OO9A 1Y1MA 2CUEA 4QSCA 1R9TJ 4M3FA 1A6IA 1XS5A 1B7HA 1TFDA 2R6GE 4IGRA 3SEVA 1NK2P 2XX9A 4HTGA 2GH9A 5L9MA 3ZKLA 3LBSA 3LC8A 1NMUA 1ZGWA 2DWJA 3JRHA 1IGNA 1FTTA 2XPWA 1KWHA 2GHAA 3PD8A 1ZJLA 3RT6B 1N76A 4KYDA 2Z8FA 4U1ZA 1PB7A 5HM4B 5EG0B 1Z0XA 4QHQA 3JYRA 4YMAA 4YKKA 4HNVA 4RY1A 4ZE8A 1QVUA 5H8NA 4MIMA 3PMWA 2LY9A 1MBFA 3GTQJ 1WI3A 4CYCB 1P1NA 1BL0A 1GV2A 3Q28A 4IHYA 5ISUA 2EQRA 3LSRA 3S14J 4DYQA 3CDLA 2XSDC 4WKMA 4N6PA 3H6VA 3OMBA 2F6GA 1MBKA 1PUFB 2CU7A 1N84A 4QFNA 4E0WA 4WEPA 1JKPC 1WH5A 3KG2A 5F08A 4EEFG 1B58A 1M5FA 4JBZA 2TRTA 1N04A 2DE3A 3JREA 5AA4A 4U4SA 3MWBA 3VXCA 3BFUA 3TPAA 3Q0UA 1D4NA 1B3EA 2ZYKA 2DA4A 1WGXA 3MJNA 2O84X 3HO7A 5EHMA 1GTKA 1B51A 4PE5B 3PM1A 2E2HJ 3MP6A 1VFEA 3SKPA 1B8IB 4V2GA 3QQAA 1FEXA 5EYRA 1IUFA 2VHAA 5A5XB 3TFLA 4EQ9A 4A3JJ 3SDGA 3MKLA 2XD3A 4R75A 3T9XB 3F0CA 4C0RA 4DYCA 2LTPA 4W1UA 1URSA 4GXSB 1UHSA 2A5TA 1IJWC 4G68C 1UTBB 4RA1A 1P1QA 1I6AA 3RLFE 3CSBA 3GTMJ 3K7AJ 1IQ7A 3S1MJ 3FV2A 3R26A 3PPPA 4IEJA 4YAHX 2ZMBA 5TP9B 4M3GA 3ILUB 3QSLA 2F35A 1LBCA 2IEEA 1WCMJ 4FIMA 3A01B 5F04A 1JJ8C 2HOAA 5I58B 4IY5A 4AYBN 3MZ1A 5FHMA 1RYXA 1SW4A 2REJA 1IV6A 4ELPA 1RESA 5HODA 4IHXA 1NNFA 4G8MA 5EG0A 3OXNA 3VXBA 1JJ6C 2DA2A 1PC3A 2F36A 1DTZA 3FK7A 1D9YA 3U93A 1SI1A 4GRKA 3JRCA 1H76A 2O7IA 4CYCA 4PFYA 4BDRA 4KCDA 1R9QA 3HOUJ 3VLWA 2DYXA 4YICA 4OFOA 2GBYA 3B6TA 2O69A 1N3XA 1PUFA 4IO2A 2NVTJ 1ENHA 3RTFB 1D9VA 1F36A 1MH4A 5IYDJ 1O64A 4POWA 3HOVJ 4F39A 2HCAA 5E3MA 3FVNA 3K0VA 1FIAA 2REGA 1VSOA 1OQHA 3HSTA 3SEUA 4JDFA 1B5JA 1WODA 3C9HA 4LOCA 2DE2A 1SW1A 2DWHA 1JETA 2Q2CA 4R72A 2F8DA 1B8IA 2RCAA 2IAIA 5FHNA 5A5XA 1GVCA 2D21A 3OSGA 2MG4A 4OWDA 1QKAA 1TWCJ 2NOGA 2L0KA 1MSFC 4QF9A 4MBPA 1DPPA 3PU5A 1JKRC 4OFLA 4IO3A 3QUJA 3LSFB 2HOTA 3G1MA 1UTBA 1GUUA 5TPAB 1RKMA 4R6KA 4POXA 3TAJA 1SW2A 1XG1A 2HXWA 4G12A 3CR9A 3BR0A 4U21A 5TP9A 5JLXA 4TLLB 5DVFA 5CMKA 3A01A 1Y3QA 2K9QA 4XIDA 1FQDA 3TEDA 2XRLA 5I58A 1HDPA 2PT2A 4M6VA 1U9NA 1F43A 1VI0A 1DU6A 3FISA 1AOVA 3DCFA 1EU8A 4FE8A 2R5YB 4DCYA 3O28A 3IH3A 3ZS6A 3ZKKA 4FORA 3MN2A 3GTKJ 1GV5A 2HFBA 4ZZEA 1LFBA 3PUWE 1XC5A 3BKIB 4JWYA 2ECCA 1D3KA 3IX1A 4A3KJ 3OEMA 1U8BA 2OJTA 1B6HA 4H5GA 4GL8A 2GFEA 2XD2A 5EEAA 1RETA 2ZNTA 4BXXJ 3TTMA 3AXFA 2Q8JA 2MW8A 3FATA 2ID6A 1RKWA 1A55A 3N5LA 4NF6A 1K61A 1ETOA 4F3GA 5H8SA 4GWOA 4NF5B 4I6ZA 5J3LA 1QKBA 1X58A 1LSTA 2WB1N 1Z77A 3ZQCA 4OVJA 2DS9A 4QSHA 2OWSA 4UA8A 4QTRA 5K7HA 1J1NA 4M3BA 5J1RA 4MH5A 5IP9J 1Y9UA 4XKQA 4GD5A 1TT1A 2DMQA 2VKVA 2GLOA 3C36A 4YB7A 4PETA 2PYYA 1ORKA 3ZOBA 4R2BA 4F18A 4Q0CA 3PPNA 2E1OA 1DMBA 3HBLA 2DP8A 5GP9A 2DE4A 1B3HA 2DXRA 4JB7A 3KFMA 3TCHA 3IORA 1A40A 3QPSA 3MBPA 5IOYA 1LFGA 1N7XA 5C4XJ 3O9PA 1MPCA 3TEPA 2LFBA 5TPAA 1NH8A 3T9HB 4FTHA 1NKXA 3SETA 4EQBA 1ZR4A 5IOZA 5EZGA 4U22A 3ZSFA 4LUBA 3MVWA 3PUYE 3MUQA 3TCFA 4KCCA 4ELRA 4IO6A 2OWTA 4Q30B 3ZQLA 1OIBA 3K6VA 1GGGA 1POGA 2XXWA 1GR2A 3HOWJ 1LGBC 2DA5A 2R5YA 2O51A 2HOSA 4NEDA 4RK2A 4JWXA 5K2YA 3KZGA 5FLMJ 2QRYA 1Y1VJ 3S1RJ 1FTMA 2ONKE 2H4IA 2NVYJ 4BLAA 4GL0A 2TCTA 5AA2D 2O6AA 3JRFA 4U2RA 4ESWA 3BT9A 1UIVA 2N8GA 2E2JJ 1E3OC 4NF4A 2GHBA 3C31A 1ZKBA 1MXWA 3G3KA 1A54A 2VOZA 3I4MJ 2L9RA 3U92A 4ZEDA 1PEBA 5HPQA 1R1NA 1FJLA 4P0GA 1EZPA 3IB0A 2UVIA 1PB8A 4NF5A 1XC1A 2K9SA 4PP0A 3JV9A 4LQ2A 1MQDA 5J1YA 3GXAA 1LCFA 1QUKA 2UVHA 4B3AA 1DSNA 1OQGA 4V2FA 5IP6A 3DLNA 4OFJA 4JXIA 4XRSG 2Y9ZA 1TC3C 3O97A 5DS9A 1JEUA 2WV1A 4G68B 2O7OA 2CMOA 2B63J 3W9VA 1QPIA 1ETQA 2M34A 2D5VA 2M0CA 3IOWA 2UYEA 4DZJA 2HYJA 3SDFA 2EZHA 4O3AA 2VD3A 2Q89A 4Q8RA 2XXYA 1WVJA 4A3GJ 5LOMA 3BBRA 3IJXB 2F7AA 2I6EA 4PFWA 4MO7A 3FUZA 1A99A 1M5EA 1U78A 3BQZA 2YS9A 4H8JA 4M3DA 1SI0A 1I3QJ 1YCJA 2FA7A 1AH5A 4H67A 3CG3A 5ICQA 1MM7A 1LAGE 5M3MJ 1LE8B 3HEFA 4MFIA 3H6TA 2ID3A 1TWFJ 4JX6A 2VKEA 5AA3A 1A7LA 1ETVA 1UIUA 3S16J 2Y7PA 5BWJA 5F0FA 1QUIA 3RTWB 3P7IA 2I0BA 2DVCA 3RZDJ 4YKPA 3S17J 2H5YA 3PGFA 2DN0A 4PFUA 1AL3A 3QIMA 3VLVA 1JT6A 5FKLA 3LNQA 5L9OA 3KSXA 5EHSA 5BUUA 4F2QA 2XXIA 2XXUA 3B6CA 4NF8B 2VP1A 4F29A 3OIOA 4BY7J 4QRZA 2O7UA 3E9XA 4XRSA 4ONYA 5M3FJ 4F1VA 3FJ7A 2QMXA 3A3UA 1FTJA 4KPTA 2AHQA 2NS7A 1OLCA 2EZLA 3WHBA 1MM6A 3OEKA 3FD3A 5B70A 1SYHA 3RN8A 3RQIA 4QFOA 3ONMA 3TW6A 3LSWA 3IH2A 5C4JJ 5FKMA 2PVUA 4M4GA 1JKQC 3N94A 5C44J 3ZQHA 3BR6A 2VUMJ 2ME6A 4ELOA 1VR5A 3CVGA 4FE7A 4GXAA 4G68A 3SJMA 4FECA 4EDPA 1TWAJ 3O2AA 3TCGA 4DDDA 5I2KA 1DTGA 3FVKA 3FXQA 2CUFA 4J19A 1B4ZA 1OMPA 5CC2A 2DXYA 2LK2A 3JRIA 1XHYA 2LD5A 1CB6A 1T56A 1LAXA 3S15J 2A5SA 4EQ7A 4FJPA 3TUSA 4JSDA 3S9MC 1N3WA 3PUXE 4S0HB 2PX1A 3T96B 1NL5A 3MQ9A 3RQTA 3V5AA 1LE8A 1FTZA 1PDAA 3LR1A 2DMNA 1NK3P 5H8HB 3W9WA 2QCOA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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