1MH4A

Maltose binding-a1 homeodomain protein chimera, crystal form ii
Total Genus 136
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
136
sequence length
418
structure length
418
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTAAAAAISPQARAFLEQVFRRKQSLNSKEKEEVAKKCGITPLQVRVWFINKRM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into binding cooperativity of MATa1/MATalpha2 from the crystal structure of a MATa1 homeodomain-maltose binding protein chimera
pubmed doi rcsb
molecule keywords maltose binding-a1 homeodomain protein chimera
molecule tags Sugar binding, dna binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 136
structure length 418
sequence length 418
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF00046 Homeodomain Homeodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.60 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Homeodomain-like 1mh4A03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh4A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh4A01
3HSTA 5IYBJ 3DELB 1SFOJ 5CM6A 3H6WA 1JJ6C 2RC7A 3O28A 2HXIA 3O2AA 4W1UA 5BNGA 5H8SA 1NNKA 3ZQFA 4DDDA 3ZKLA 1Y1WJ 4KCCA 3NAUA 4RPNA 4MO7A 1RPWA 4LQ5A 3CDLA 1Y1VJ 3IOTA 3CVGA 1SBPA 4JSDA 4OMBA 2EH3A 3M3KA 5ISUA 3PPQA 2XB5A 4JWOA 4U22A 1USYH 2O51A 5E3OA 2WB1N 1LFBA 2O7OA 2PBWA 1OIBA 3H3GA 4A3CJ 3MZ9A 3OEMA 2RKMA 3MP1A 1YTVA 4ONYA 5KDTA 5H8HB 1ETQA 3PUVE 1OQHA 3FKIJ 3H0GJ 2FX0A 2JA8J 4ZE9A 3IX1A 1MBEA 1IGNA 1UTHA 2P2AA 3G1LA 4IEJA 1NFTA 5H8QB 1T0KA 5F27A 2JA5J 2K40A 1B9JA 3HN0A 4OESA 3CIJA 5K7ZA 3IORA 1B7HA 4AYBN 3TFLA 5JEIA 3B6AA 2OZZA 1IIWA 3UA8A 1O7TA 4DW6A 4LQ2A 1ETWA 1IEJA 3G3KA 3S2VA 4I76A 5CRYA 1Z7ME 2XSDC 2XX8A 1MXXA 5CMMA 5DVJA 3K6UA 4TOZA 3BR2A 4AQ4A 3TEDA 1X58A 3V8XB 4X1BA 3BTJA 3BTCA 1KWHA 3M3YJ 1MM6A 5J1DA 1WI3A 1H8AC 1I6HJ 1XS5A 1H88C 1US4A 2I3WA 1UQWA 1N3XA 3H7MA 4R2BA 5I58A 4B3AA 1Y3NA 2X6OA 4YKJA 3GLBA 3MWBA 1ORKA 1H44A 2UVIA 5TPAB 1HOMA 3HOVJ 2THIA 3KN7A 4ZE8A 5M3FJ 2ZYOA 1N84A 4QIWN 2QS4A 3ZOBA 3VLWA 4F18A 1H45A 1B3LA 3G3FA 5GPCA 4AB6A 2R5ZB 3K7AJ 3H3VK 2ECCA 4KR5A 1Q1VA 1FTKA 4EQBA 5CI5A 1VR5A 5DEXB 1LAGE 1VF9A 4MLVA 2E19A 2DN0A 3KGCA 4R2FA 4PFUA 2CZLA 3HDDA 3IO6A 3T9UA 3EHTA 1J1NA 2Y7KA 1SW2A 3OO7A 2R71A 3OXNA 4XK4A 1WH7A 1YCJA 3K2DA 3RZDJ 2Y7PA 5I56B 5AA3A 2ONRA 1M5BA 2XXVA 5ICQA 3EN3A 1LFUP 3S16J 1B51A 2NVUB 3TP0A 3L1PA 1MPBA 1XVYA 3O6IA 2H5YA 4CYCA 4W97A 3VPRA 4QRZA 1PUFA 2NVYJ 4GWOA 2NS7A 1MY1A 5DT6A 2KDZA 2N8GA 4BBSJ 2H98A 4FISA 1OLCA 2Y0SN 3PV0E 3MQ9A 4F39A 1B3HA 1SYHA 1TWCJ 1SW4A 4IHVA 3B6WA 1DTZA 2DWAA 2GBYA 2ZB9A 3U92A 4UACA 5DVIA 2JK3A 4QFPA 1Z7NE 1MBFA 3MPKA 3OENA 4R74A 5EGOB 4FJPA 4DIGA 3BKIB 1IXCA 1LGBC 2H25A 3DLNA 5I2KA 1M5EA 3PU5A 3JRBA 2DWJA 4XKPA 1MXUA 1BIYA 3KJ7A 2V3QA 3LOCA 3A09A 2LFBA 2Y84A 4I8CA 1B7UA 2AIXA 3O8HA 4LP2B 1QUJA 4JYKA 3KOTA 3SDFA 5E3MA 3CFLA 3BTIA 4F3SA 2PX1A 1QPIA 3FZVA 4KYDA 3ZQHA 4U1ZA 5KCJA 4FECA 4YZZA 5EZHA 4H1XA 1YRNA 4F22A 2DTZA 3E7LA 2HZKA 4POXA 4ZEIA 3MP6A 1FQAA 3TYHA 1APLC 1MBKA 1IQ7A 1LBCA 2COBA 2OBGA 5AA2B 2CJJA 2E2HJ 4U1OA 3IB0A 2D3IA 2IA4A 3GBAA 4NF8B 3GTLJ 2K9SA 5AA1A 5GPAA 2OWSA 4DXBA 3BG9A 1P1WA 2XXWA 3SFIA 1H76A 4EXLA 1JTXA 2GH9A 3FVGA 3FVKA 3KZGA 1LFIA 1B8IB 3ILUB 2DA6A 2LTPA 1FJLA 4EEFG 2NOOA 3MVYA 4KQPA 1HSEA 1JKRC 2Q9TA 3H6TA 2R5YA 4L17A 2R7ZJ 2K9QA 3IK6B 3PMVA 4QFOA 3T22A 3HKZN 1XG1A 3LUYA 1HCRA 4QSHA 2H8RA 1DOTA 5K2YA 4A3KJ 1IUDA 4JDFA 3N26A 3V5AA 3JRDA 5M2VA 4A69C 2L7MP 1NK3P 4C3JJ 4R75A 1B32A 1Z77A 3M3FA 4N07A 1MY3A 1RR7A 4BLAA 1Y9UA 1MSEC 1OCPA 4OERA 1QW0A 2Y7WA 2XGCA 2ALUA 4NDLA 1B0LA 3ILTB 3CSBA 2HYJA 4ZDMA 2X48A 3U8QA 3HEFA 5FTIA 1B1HA 5DTBA 3MVZA 1OQGA 3MP8A 1ZGWA 1AL3A 3PPRA 2HXOA 2RCBA 1WGXA 4Y7NJ 1BTJA 4KD5A 1Z0XA 1JETA 3N5LA 3EQ1A 1Q35A 3SEYA 1EH3A 3MC2A 3JRCA 5F0HA 1MXVA 4V2FA 4BKXA 1B2HA 3PUYE 4XKQA 3FATA 4WEDA 3S9MC 1ZK8A 3HHFA 3K4UA 2YS9A 1UTBB 4M3EA 4QSCA 3GTPJ 2XXIA 5F08A 3V89B 2UVGA 1QULA 3T9VA 3JZJA 1MNMC 3RUMA 3SESA 4QFNA 3PD8A 4UUSA 2DA2A 5EG0B 4I9DA 4UUTA 4Q30B 3CCYA 1LFHA 3Q28A 3GTMJ 1ETKA 5E3NA 1JKQC 4ELPA 1EF4A 2ABHA 1B5IA 2QL3A 3K0VA 3OELA 2HOSA 1MQHA 1GV2A 3ZSFA 2F34A 3G3JA 5IYDJ 3MAMA 2DWIA 1HDPA 2ID3A 1YAEA 3MPLA 5FJ8J 3A3UA 4NF5A 2XB0X 5J1YA 2VD3A 2P1SA 4POWA 1ZKBA 5GP9A 1MBGA 3R7XA 3IOUA 2LY9A 9ANTA 3UP9A 5J3LA 1DPPA 4JXIA 2ID6A 2CU7A 4A3DJ 2K9NA 4FATA 4MIMA 2F7AA 5J1RA 3VVEA 3GXAA 1LSTA 3JRAA 3HOZJ 2NVTJ 3ZKKA 1LE8B 1U8BA 3JREA 1OLAA 4G68B 1TWHJ 3ZQIA 3FK7A 4Z0IA 4D5FA 1SDXA 2KLFA 2IBDA 4WKMA 1U78A 3S2HJ 2M8GX 1IXGA 3U72A 3JYRA 4NWDA 4BDOA 3LSJA 1OCTC 3T93B 2CQQA 1CE2A 3FIWA 3GTOJ 3C31A 3WHCA 2LLKA 1ZIUA 4G8MA 3FVNA 3G7WA 1EZOA 2L0KA 3BFUA 2XXRA 1Y3QA 4PE5B 4I1DA 1JT6A 2ONSA 2E2JJ 3KSJA 2Y7RA 2F35A 3QAXA 5IOZA 4LATA 2W48A 1MXYA 2F7BA 3B6CA 1VFEA 2PYYA 2QS1A 1ITYA 1PB8A 3LR1A 1OMPA 1POGA 1MXWA 4ESXA 1RETA 1IUFA 1P1NA 3D1NI 3IB2A 3UIFA 5IP6A 2B3BA 1OJLA 2VHAA 1QVUA 3LSRA 3LSWA 2QSXA 4N13A 2HZLA 2DXYA 2F6PA 5LOMA 2ECBA 2Y31A 1B3EA 5ITPA 1PDAA 4XIDA 4JSOA 1JTYA 3FV1A 1R9QA 3VVFA 3HGYA 2LKXA 5I2NA 2REJA 3I6VA 3S15J 5F7VA 1PBPA 2GM4A 2Y7IA 3PPPA 4F1VA 1LAXA 1VFCA 1D3KA 1S9TA 4PP0A 1Y4CA 2I6EA 5EYRA 4LZ8A 1II5A 1OVTA 2YPNA 3DP4A 3VXCA 1URSA 1GTKA 3Q0UA 1FQDA 4F3BA 2M8CA 4NF4A 4FORA 5C4JJ 5TP9A 3IAZA 3FV2A 2VOZA 3OOAA 1D9VA 1URGA 2E2IJ 4KCDA 3BR0A 3S14J 1VE4A 5A5XA 4R9GA 4DCXA 1ANFA 4IO2A 2DVZA 4HS7A 1NL5A 1LAHE 1ZBMA 2W7YA 1PBQA 4A3IJ 2XGEA 1LBBA 2LVSA 1MPCA 1NKXA 4UA8A 3CR9A 2X7QA 3Q29A 2ZMBA 3PMWA 4O3AA 3SJMA 3A03A 1T33A 3HHGA 1SANA 3MVWA 3TKDA 2B65A 1HLVA 4LOCA 3HM5A 1QUIA 1R9LA 1Y1ZA 2HFBA 2F5XA 4EQ9A 1B58A 5IYCJ 2UVHA 5F0CA 1QKBA 3TW6A 4JB7A 4OEUA 1S7YA 2OF7A 1B05A 3H03A 3C34A 3U94A 3O29A 1QVTA 3BQYA 4XRSA 3QUFA 3JR9A 4M3BA 5L9OA 3HOYJ 2EBIA 1I3QJ 3W9WA 2DSFA 2ZYKA 3B6QA 4C1UA 1NNFA 4MFIA 1LAFE 1BA5A 4QFKA 2HOTA 2XXXA 3PPNA 3KG2A 3D4CA 4BXXJ 1MBHA 3C32A 1FQCA 5KDTB 3OSQA 3FASA 4QSEA 5H8FA 5HM4B 4HCYA 5FTHA 4MFEA 4IY5A 4EDPA 4LONB 1B4HA 1ZR4A 1JJ8C 2Q2CA 3IOWA 1UTHB 4ESWA 3C9HA 1N76A 1BP5A 2RINA 4DZ1A 3BG3A 3G1MA 4GRKA 3S4UA 2VI6A 2HEUA 2DMNA 1MQGA 5JK4A 4FE4A 2KT0A 3FXQA 4F1YA 4OYVA 4YB6A 2QJEA 3BFTA 1F36A 2YLNA 1MQJA 1FTOA 2VKEA 1B72A 4U4XA 3TTRA 4G77A 3FUZA 2PMSA 3PGFA 1FQFA 2XHDA 1GT0C 2R9JA 1A8FA 5DYHA 3ECRA 4WEPA 3KFMA 4XKNA 3BR3A 2X7PA 4XTCQ 1HSLA 1ZQ3P 2I49A 2DVCA 1I50J 4TQUQ 2QF7A 4RNSA 4H0WA 5CMBA 2DOJA 4C1TA 2M34A 4ZEKA 5I58B 3TPAA 3A02A 1IC8A 3S1MJ 3RNNA 4DZPA 3K1NA 2GLOA 1PB7A 2HQ0A 1H89C 3CSGA 4FIMA 1RYOA 1ZMGA 2UVJA 3VXBA 4ND9A 5C44J 1HF0A 2EZLA 2EZIA 1ZU0A 5DVFA 5FKOA 5K7HA 2REGA 5IKBA 1FCKA 5AA2A 1JVXA 2CMOA 4GVOA 2QRYA 3TODA 2LR8A 4IGTA 3O97A 4GFBA 4RYAA 1IZ1A 4PFYA 4A3JJ 3LSLA 2XD2A 5FHOA 3MJNA 5DTDA 4HW8A 4XRMA 2H9BA 4GQOA 3TEPA 4C0RA 4EQ7A 4G4PA 3PPOA 4R6HA 4P0IA 4DYQA 3VVDA 4NF6B 2CUFA 4XRSG 4FCYA 2NVQJ 1JEVA 3K00A 4CYCB 3T96B 1ELJA 4ISUA 1PUFB 3BR5A 4ZEDA 4A93J 1R6ZA 4LUBA 3TCFA 1GV8A 4H6DA 4OVJA 1FTZA 3EPEA 1WPKA 3RKQA 2X9DA 3QPSA 3O6HA 3BR1A 3LSFB 1B5JA 2UYEA 1FIAA 4H5FA 2AHQA 2A5TA 2ONKE 2VP1A 5J1UA 4KFQA 3PD9A 3R26A 2QS2A 1HSJA 4FTHA 1JUMA 2YUSA 1N04A 1X2MA 1D5YA 4KYEA 2AO9A 3IJOB 3FXUA 1SW1A 5ELVA 4ELRA 3IB1A 4BDLA 2DE3A 4O3CA 4M6VA 1AKHA 3HOUJ 2CQXA 2LP0A 3U1OA 3MW0A 2XGDA 2M2EA 3RLFE 3IH2A 1B4ZA 3ZQLA 2XXTA 2RC8A 3Q0WA 4X1DA 4RBOA 5AA2D 2F78A 3K6WA 5K7FA 4C3IJ 5I57A 2O69A 3UORA 2V3TA 2P0SA 5KCJB 2JJ7A 4LVQA 3S1QJ 4FEDA 4HNVA 1YRNB 1MH3A 2ZNSA 4A3EJ 5H8NA 2MW8A 3P7IA 5TU0A 2L7ZA 2ZXTA 2XD3A 2ME6A 2ANJA 2NWJA 4S0HB 4JX5A 3MN2A 4ABZA 5L9SA 2ZNUA 4NWCA 4M4GA 3QXMA 1FTJA 1POY1 5M5YJ 2TRTA 4C2MJ 3ODBA 1Q1KA 4D5CA 1PB9A 1N0TA 1SD3A 3I5OA 4JX4A 3WHBA 2ZYMA 2AL4A 2L9RA 3RPWA 2Z22A 1D9YA 1TXFA 2CRGA 1JVYA 2HOAA 4YKPA 2R5YB 1FEXA 2O1MA 4ZEBA 5HODA 1P99A 3TDJA 1ZJLA 2JN6A 3RTFB 4A3GJ 2FD5A 1JW5A 3S9NC 1UHSA 1US5A 1SVXB 3SDGA 1JKPC 2XX7A 2H99A 4F2OA 1M5CA 2ESNA 1TT1A 1ETVA 1MQDA 4DE8A 3WAFA 4EUOA 1JQFA 5CMCA 3OO8A 3TUSA 2I10A 2VKVA 1M5DA 1A8EA 3OSFA 1AH5A 3S9EA 1AIVA 3Q3SA 1IXHA 1DPEA 3MVXA 4IGRA 5DS9A 3H6UA 2XPUA 2GHAA 2DA3A 1I6QA 4KPTA 3BQZA 1MG1A 3U93A 2OWTA 2LK2A 4OEVA 2G0EA 4F31B 4OENA 4EF1A 3A01B 4WXJA 4J19A 3DP8A 3A3CA 2Y9ZA 3FVOA 5AA4A 1AOVA 3LNQA 2L7FP 1FQBA 2DXRA 2Y2ZA 2O84X 2QS3A 4OTEA 4H8JA 3TAJA 3QSLA 2PMZN 4KI0E 3L6GA 1NNPA 4B1RA 1EU8A 2Q8JA 3C4MA 1F43A 3QQAA 3KN8A 4M3FA 2F6GA 2ZNTA 1FW0A 3FGSA 2RC9A 2V25A 1FTLA 1P7JA 2XPWA 3JRIA 2GHBA 5L8DA 3VLVA 5I59A 1JEUA 4ZECA 1LB9A 3I4NJ 1P1QA 1JW1A 2O7UA 3SEWA 5HPQA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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