1MH4A

Maltose binding-a1 homeodomain protein chimera, crystal form ii
Total Genus 136
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
136
sequence length
418
structure length
418
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTAAAAAISPQARAFLEQVFRRKQSLNSKEKEEVAKKCGITPLQVRVWFINKRM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into binding cooperativity of MATa1/MATalpha2 from the crystal structure of a MATa1 homeodomain-maltose binding protein chimera
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding, dna binding protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords maltose binding-a1 homeodomain protein chimera
total genus 136
structure length 418
sequence length 418
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF00046 Homeodomain Homeodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.60 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Homeodomain-like 1mh4A03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh4A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh4A01
3KGCA 3FXUA 3H7MA 5L9OA 1XOCA 3O6IA 3SEYA 4I8CA 1JEVA 1B3EA 1FEXA 1EZPA 1LB9A 3PGFA 3G7WA 2ZYMA 3FJMA 4P0GA 4R6YA 4B4CA 1DTGA 2G0EA 4R72A 4YAHX 3RZDJ 1S9TA 3PUXE 1N84A 4JBZA 2DA3A 1FTKA 2QS3A 4IEJA 4JX6A 4UUSA 3CFLA 5JLWA 1H88C 1P7IA 2X48A 2XPUA 4BY7J 2XX7A 5AA4B 1PC3A 1IXGA 3K2AA 4BDLA 2FQ4A 1ZTRA 2XB5A 2Z22A 2ID6A 3C36A 4KHZE 5EYFA 3QUJA 3EHSA 1GV5A 3HOXJ 3BR2A 4M3DA 1JKRC 1SW1A 2B3BA 2ZYKA 1UQWA 1MXYA 1GTKA 4IHVA 1URSA 4NF4A 1ZIUA 3C35A 5EGOB 2F7AA 5H8SA 3JRCA 2XHDA 1MQGA 4Z7EA 2ME0A 5BUUA 2XD2A 1ETOA 2Y31A 2Y7IA 1TT1A 3MZ9A 1WDNA 2EZHA 1SQYA 3N26A 2XXXA 1N04A 1CE2A 4ABZA 4CYCB 4QSEA 4TLMB 3MJNA 3SESA 4YU0A 4ELOA 3GBBA 3ZKLA 5AE4A 3TW6A 3VVEA 3RPWA 1JT0A 5H8NB 3PUVE 1B9JA 4M3FA 5C3EJ 4BY1J 4I1DA 5DTBA 3HDDA 1I6QA 4XK4A 4MFIA 4YKPA 3KJ7A 3CIJA 3CSGA 1ETQA 3CVGA 3RNNA 2LY9A 4OENA 4EQBA 2N8GA 3C9HA 4MLVA 4KCCA 2E19A 1SYIA 5J1DA 4B3AA 1NTCA 2F8DA 2XXHA 1US5A 5I56B 3IB1A 1SD3A 3S9NC 2AIXA 3C32A 3S2DJ 3NARA 1OMPA 3HOUJ 1PB9A 1JNFA 2DMUA 2R5ZB 2ZNUA 4LP2B 3CCYA 2HOSA 3TTMA 2REJA 4N13A 1MBKA 1P1OA 2ECBA 5AA3A 2PBWA 2XPWA 1Z0XA 2OK2A 1JKPC 3PPPA 3PUYE 4OEVA 3U8QA 3EHUA 4S0HB 1A5JA 1DTZA 3BG5A 1FJLA 3A01A 3H3GA 3HGYA 4F18A 1B3GA 4DYCA 2HCAA 1XVYA 4A3KJ 4GRKA 4HS7A 2RC9A 1EZ9A 4XRMA 4OFOA 5I57B 2A5SA 1RKMA 3ZQFA 4EF1A 4MIMA 1ZU0A 4NTLA 2PMSA 1TWGJ 2LLKA 1Y4TA 1XS9A 2XGCA 1SVXB 3UN6A 2O7OA 2I3VA 2Y9YA 4JX4A 4KFQA 1A8EA 3TW7A 3CR9A 4QFNA 2PVUA 3TDJA 5IP7J 3O9PA 1MQJA 1H76A 3G1MA 3BR1A 3CFXA 2W7YA 5B70A 2X9DA 3T9XB 1B7ZA 5AA2A 4Q30B 3BTLA 3HO7A 4ZEDA 3IR1A 3OOUA 2R9JA 2HZKA 1B4ZA 1D3KA 3KN8A 3N5LA 4R6HA 3S4UA 2YS9A 4GF8A 1Y1WJ 4RA1A 5TPAA 1M5BA 3OMBA 3IOTA 5TP9A 3JZJA 3G3HA 2I10A 1FW0A 3TTNA 1I6HJ 3BQYA 3GTMJ 4Y7NJ 3HOVJ 1I3QJ 4RPOA 2MW8A 3HHFA 2QS1A 1X2NA 2PYYA 5L8DA 1ANFA 4FJPA 1B2HA 5EEAA 4ONYA 2VD2A 2ONSA 4EEFG 3I5OA 3O97A 1B46A 1RESA 4EUOA 5H8QA 3UORA 2VHAA 3HGGA 2VUMJ 5IYDJ 2XXPA 5JEIA 5FLMJ 1JW4A 2R71A 1VF9A 2Q9TA 3LNQA 1MXXA 1MS7A 1IG7A 5EZGA 3RQTA 1A99A 3S17J 4R2BA 4PFTA 4FIMA 3HEFA 3MUQA 3PU5A 2DE3A 3RKQA 1MSEC 4QFOA 2QL3A 1US4A 3K6WA 4EXKA 4A3IJ 4U2RA 4D5FA 5CC2A 5HPQA 2RCAA 4ECFA 2CRGA 5H8HA 4JSDA 2AHQA 3K6UA 4KPTA 5EZHA 4LONB 2NVQJ 3M3KA 3TQLA 4OETA 3OO9A 2F78A 4RXLA 1D9VA 3S14J 1MM6A 3RZOJ 1ENHA 2L7MP 4PQJA 5ELVA 3ZQGA 2VKEA 1WODA 4GFBA 1Y3QA 3TYHA 2NS7A 3L6GA 5J1YA 4R75A 5IP9J 4QSDA 3MZBA 1PDAA 4F22A 1O64A 4BDQA 1JEUA 1QUJA 4L17A 1MBFA 1D9YA 1UMQA 2ZYOA 1H43A 5M3FJ 1UIUA 2HZLA 1HF0A 1G2HA 1WGXA 1HSLA 3S1QJ 1NNPA 1SFOJ 1VFDA 5I84A 3Q26A 2MSYA 1B5IA 1QW0A 1ZLQA 2WAQN 1GR2A 5FHOA 4M3BA 3K1MA 3MN2A 3TCGA 2Y30A 1XC5A 4DIGA 3JRIA 2AYSA 2GRVA 3N6UA 5M3MJ 2F36A 2KLFA 4LUBA 5J1RA 2HOTA 2RCBA 2PMZN 3HCQA 1JW1A 3ONMA 2QSXA 3A02A 3KZGA 2HQ0A 3TMGA 3O2AA 2I6EA 3E7LA 1OQGA 3IO4A 1ETYA 4C3HJ 5I2NB 1B1XA 2LD5A 5I58B 2FYIA 1O63A 4Q5TA 3S9MC 1OFCX 5AA4A 4ZZAA 2DA1A 5AA2D 3GBAA 5FHMA 4LVQA 3QIMA 5FKOA 2I48A 4OTEA 4JWYA 1QUIA 1USYE 2ONRA 1U9NA 1T0KA 1HCRA 1UTHB 3IB2A 1IZ1A 2L7ZA 4WKMA 4NF8B 5EGOA 1GVCA 4KYEA 3PO2J 2VI6A 4NMYA 3SDFA 3Q3SA 2Y84A 2H25A 4CYCA 3M3YJ 4R73A 2AL5A 1KWHA 2DP8A 5A5XB 2W48A 2HXIA 1O4XA 2QPQA 1LCTA 2E2JJ 3FKIJ 3U1OA 1DMBA 3FATA 5H8NA 3I6VA 3B6AA 5F1QA 4IHXA 2QF7A 4EQ7A 2CZLA 1QKAA 2D5VA 5H8FB 3K6VA 3ZS6A 2EQRA 2L0KA 4H8JA 1FTLA 3BG3A 5BNGA 3TEPA 1OVTA 2HI3A 3O66A 3OO7A 4G77A 1ATGA 1MSFC 3FXQA 5I56A 1HLVA 3G1OA 4DZPA 3HOYJ 5DT6A 4H67A 1LLSA 3IH2A 2DN0A 2YUSA 2HEUA 2E0SA 3SEVA 1MY2A 3T9VA 4C1UA 2R5ZA 1MQDA 3PV0E 3RTFB 1JT6A 4A3JJ 3UGWA 1MBGA 3HN0A 2DJNA 1Z77A 3DELB 4FEBA 3TTKA 3GBGA 4U4XA 3SKPA 3JRBA 3PMWA 3GTGJ 2E2HJ 1FTZA 5J1UA 3H03A 2ONKE 2DWAA 2XXQA 4PFWA 4IB2A 5M5XJ 1E3OC 1POGA 2XGEA 2B3FA 3Q27A 1UIVA 4P11A 2M9HA 4X1EA 3KBRA 1P7JA 2XGDA 3B6CA 2F97A 4FTHA 1HSJA 3OEKA 1VFCA 4C1TA 3R26A 5FKNA 1JKOC 1B8IB 4XIDA 5I57A 1R9TJ 1MPBA 2ABHA 1QRYA 3UK4A 5L9MA 1VFEA 3M4OJ 2L9RA 3RLFE 3CSBA 1SDXA 2NVTJ 2XB0X 3BR0A 5IOZA 2Q2CA 1ZTYA 5ICTA 2H9BA 1S50A 3E13X 3K00A 2CJJA 5FKMA 3WAEA 1MM7A 4BDMA 3ZOBA 4ESWA 1B3FA 1OVBA 2OPTA 3F11A 1HSEA 3JV9A 5CMCA 5IPAA 1IUFA 1HOMA 3HKZN 1OLCA 2OJTA 1B32A 4PFUA 5IOYA 4I76A 4NF5B 2FD5A 1AH5A 2DSFA 4FORA 4FEDA 1B0HA 3Q0WA 5ICQA 3JRHA 2HQ5A 2ZNSA 1T33A 1TWAJ 1B3LA 2V93A 1NH7A 2DXYA 1MY0A 4GQOA 4DZ1A 2EH3A 4PETA 2JN6A 2O51A 3L6HA 1A40A 2XXTA 1P1NA 2FA7A 3MP6A 5FLVA 1MY4A 3G3IA 1FCKA 1HDPA 4AUXA 4H65A 1AKHB 4ZZEA 4I9DA 5CBSA 4BDNA 3ZQHA 2DE4A 4N6PA 2ANJA 3GTOJ 4FE4A 3PO3J 3HHGA 1F43A 3QSLA 1M5DA 1JJ8C 3OEMA 1I69A 3IOWA 1OCPA 3ECRA 3OOAA 3CFZA 3K7AJ 4LQ5A 2Y7KA 1W0TA 5K7ZA 3JR9A 5E3MA 1IGNA 4OXVA 4G8NA 3KJTA 3FUZA 4AQ4A 4MO7A 2EZLA 3W6VA 1F36A 1YAEA 3VVDA 3T93B 2P81A 1MDP1 5CI5A 3SDGA 1JJ6C 2HAVA 3S1RJ 4F31B 1NNKA 1IDYA 3G3KA 3TP0A 3B6WA 3BFTA 3JRDA 2IA4A 5CM6A 4A3FJ 4FISA 3FASA 2K40A 1TWYA 1FTJA 3IORA 1VI0A 1ZR4A 4H6DA 1LGBC 2DMQA 3L1PA 1APLC 5CMKA 3TTLA 4A3LJ 3HB9A 1DU0A 3MW0A 3OSFA 5ISUA 3FV1A 4LZ8A 3VLVA 5K2XA 2Q89A 2CUEA 1B5HA 3C34A 4NF6B 3JYRA 3SJMA 3W15C 3IJOB 2EBIA 1BL0A 3JRGA 4LA9A 3CG3A 1BKAA 2CQQA 3KSJA 5EYRA 1DPEA 2F6GA 5C4XJ 2VP1A 5K7HA 2WKYA 4XTCQ 2DMPA 4IO3A 2DE2A 2V3UA 1LE8B 1SI0A 2ZYNA 4YZZA 4KYDA 1BW6A 2NVUB 5M2VA 1B05A 1P1UA 4RJZA 1ZK8A 3ILTB 4GWOA 3UKGA 4P0IA 4H8IA 2F34A 1MH4A 2IEEA 1DU6A 1FQBA 3IK6B 2TRTA 3C31A 3D1NI 4OFLA 2JJ7A 1SANA 2KT0A 5I2NA 5I58A 1R1NA 4DZJA 2XXIA 1QKBA 5HM4B 2PT1A 4ELRA 3JREA 3E4RA 2GHBA 4YKJA 2GFEA 1AMFA 3RT6B 1JTXA 4ZEBA 4QHQA 1MH3A 1SYHA 4B1RA 4NWCA 1FTTA 1IITA 3PUWE 3ODBA 3ZQIA 2O9LA 1R9LA 4OFJA 1H45A 5L9SA 1FQEA 2WB1N 1UTHA 3HBLA 3ZQCA 1ETKA 4NF8A 3P7IA 3OELA 2DWIA 4EDPA 4XICA 3EQ1A 4HNVA 5DTDA 1P1QA 2V84A 4DE8A 3FVNA 4KYSA 1PB7A 4QFKA 1II5A 2D21A 4RY1A 5A5XA 4LATA 1RPWA 2DWJA 1EF4A 2I3WA 4YKKA 3PUZE 3NAUA 3VFJA 2ZMBA 3MVYA 4FATA 4ND9A 3TQWA 1ZMGA 2UVJA 1X58A 3CG1A 1MXVA 3MPKA 1N7WA 4GXAA 1NNTA 2GH9A 5H8FA 3T22A 3KEIA 4LZ7A 3QQAA 3IAZA 4GXSB 1D5YA 1PUFB 2X7QA 1QPIA 4IGRA 3FXRA 1GGGA 4HW8A 3IX1A 5EDNA 4PE5B 2Y7WA 1A7LA 3KG2A 5BWJA 3M3LA 1SW4A 4M6VA 3H3VK 1Y3PA 3IH3A 3IJXB 4KCDA 4M3GA 2WV1A 2XSDC 2ALUA 3A09A 1B72B 2JA6J 4C0RA 1B52A 2G93A 2H4IA 1ZGWA 4Q8RA 4U1OA 1MDQA 3C4MA 4ESXA 1GV8A 5IAIA 2NUVA 1ITYA 3EPEA 1H44A 3GZGA 1Y1MA 1QULA 2M34A 1AIVA 3TCFA 2XX8A 5FHNA 2E1OA 3DP6A 3HM5A 4YICA 4THIA 2ECCA 4ZDMA 3Q28A 3QYTA 2HXOA 3MVPA 3W9VA 3O8GA 5F0FA 1XG1A 1MY3A 3V89B 1FTMA 1LSTA 3CMYA 1M5CA 4D7NA 4ZE8A 1M5EA 2HXWA 1B8IA 1Y1VJ 2OCUA 3WHBA 3O28A 2AO9A 1RETA 3MP8A 3E9XA 1BIYA 4HCYA 5F0HA 1PEBA 3MBPA 2A5TB 3D4CA 1VNDA 3T9UA 3ZSFA 4IY5A 4OQOA 1GVDA 4ZEKA 2RINA 4XKPA 4FE7A 1LAHE 5DEXB 3RY3A 2JA7J 1IJWC 4AYBN 5IKBA 3A3UA 3S2HJ 2JA8J 1BLFA 3MC2A 1RKTA 2RAEA 3U94A 3BBRA 4DCXA 2FJ1A 1GV2A 3S9EA 4O3AA 2CQXA 1AOVA 3IOUA 3GXAA 5F1JA 3B6QA 4NF5A 3CRBA 1R6ZA 4AB6A 1UHSA 4DLDA 2XX9A 4GVOA 4NWDA 1IV6A 4OEUA 1ZJLA 1QVTA 3K0VA 4BDOA 1MG1A 1B1HA 3A3CA 3Q0VA 2Q8JA 2OLBA 4U4SA 2O1LA 3U93A 1IXCA 3PD8A 1B7UA 1MXUA 2RKMA 3TUSA 1EU8A 1H89C 3A03A 2F5XA 1AKHA 3G3FA 4DYQA 2DA6A 1JUPA 5IYBJ 1URGA 4BXXJ 2JA5J 3TEDA 2XXVA 4I6ZA 4L5EA 2H99A 1BW5A 2NS8A 4XKNA 5F27A 3UIFA 4QSHA 2CMOA 2Y7RA 2R5YA 2UYEA 4F3PA 1WCMJ 1B0LA 5AA1A 3IV5A 1UTBB 2DA4A 3T66A 3PPRA 3O8HA 2LAOA 3U72A 4ZEIA 4X48A 2XXYA 4F2QA 1U78A 1MY1A 2M0CA 4OERA 1IRZA 4I62A 4YB7A 3BQZA 2LTPA 3FISA 3MKLA 5DYHA 1N3XA 1H8AC 3RT8A 2YPNA 4OVJA 4OESA 4OYVA 2JWTA 2QMXA 1YRNB 3OO6A 2O69A 2ZB9A 5KDTB 1K61A 1FQFA 2IAIA 1TWHJ 4GOTA 1CB6A 3M3FA 1LFHA 4A69C 2JK3A 1Q35A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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