1HSJA

Sarr mbp fusion structure
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
487
structure length
487
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALAAAQTNAAAEFMSKINDINDLVNATFQVKKFFRDTKKKFNLNYEEIYILNHILRSESNEISSKEIAKCSEFKPYYLTKALQKLKDLKLLSKKRSLQDERTVIVYVTDTQKANIQKLISELEEYIKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of the SarR protein from Staphylococcus aureus.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transcription/sugar binding protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords FUSION PROTEIN CONSISTING OF STAPHYLOCOCCUS ACCESSORY REGULA
total genus 143
structure length 487
sequence length 487
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-12-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF12802 MarR_2 MarR family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 1hsjA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1hsjA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1hsjA01
3RI4A 1RUNA 2PVUA 1M5BA 2HYGD 3I54A 3R0JA 1T6SA 1KQ8A 2BGCA 4NTLA 3G73A 4ECFA 1T38A 2THIA 1UTHB 3HOTA 1ZG3A 1YLFA 4F3BA 3E9XA 1B1XA 1MG1A 3N6UA 4ETSA 3RYRA 2VOPA 3IB2A 2YX7A 3S2VA 4HZFA 3DP4A 2L3DA 2GXBA 3WU0A 5DEXB 5HOOA 1OQHA 3KOSA 2GQQA 2VT2A 4OESA 5H8NB 2OQRA 2K02A 3C9HA 1UB9A 4U4SA 2DO7A 4AB6A 1YG2A 5D8KB 3O6GA 4EGYA 2VC1A 4LB5A 4FEDA 4WKMA 4AD9A 1FQFA 3KP4A 5EYFA 2AXLA 1MS7A 4Q8RA 2I0CA 1GV8A 3CDHA 3C35A 4BQAA 1JW5A 4I62A 2XD3A 4MLVA 5D8LB 1O3SA 2STTA 4RYAA 5IAIA 3KLOA 4ESJA 2XIGA 3GEZA 3FZVA 2GZWA 1IN8A 1OPCA 1UHMA 3N6TA 5FTIA 5JEIA 1YFHA 2RC9A 3WODF 4F2QA 1ZN2A 3EQLF 2D45A 4DXBA 1T0KA 3WGIA 3ILUB 2NAZA 1B51A 3TQWA 2A5YB 4A6EA 2E1NA 2W7YA 3LUYA 4NF4A 2RC4A 2PBIA 5B7DA 2Z22A 4XBFA 2E7XA 5TRDA 2QENA 2R7DA 4O3MA 1OMIA 1NKXA 3U94A 1MM6A 1LB9A 3GF2A 1Z7UA 2O1LA 5CI5A 4TLMB 1Z6TA 3IRRA 1OIBA 2H98A 1BM9A 5DVIA 4KD5A 1LAGE 1HKSA 1O57A 1REPC 3ONMA 5AA4A 2JPCA 3QOPA 2DQLA 2Q2AA 4DLDA 2O03A 1MQHA 1LFHA 4OXVA 5ED4A 1HSEA 4EM2A 3DLNA 1MRPA 1OVTA 4HDVA 5CYVA 3CO7C 3FJGA 2DWIA 3ZN1A 5I2NA 3QU6A 2CZLA 4XLNF 3LSWA 4G9YA 5H8HB 3SEYA 1V3FA 4ZE9A 3ZSFA 2B3FA 4YKPA 5CBSA 1XCBA 3OOPA 5DUIA 2AL5A 4OTEA 4Q5TA 3O2AA 5ILUA 1FLIA 2DWJA 5D6FA 4GO1A 4N9IA 3ILTB 3WAEA 4AIHA 3KP6A 5JFRA 2PJPA 4YB5A 4LONB 3G3GA 3IL1B 3MVYA 4ZH4F 2Z8DA 2VN2A 4A5MA 1B1HA 4CO8A 1UTBA 4I0AA 2DXRA 4PGGA 1Y0UA 2I3WA 2O3FA 4G4PA 4Q0CA 4OIOF 4GL8A 4IY6A 4PFYA 2PBWA 1LCTA 3QU3A 3MAMA 4XKNA 4DQ2A 2ZNSA 4MBPA 4Y15A 1I27A 2JTVA 2IT0A 4ZZLA 1M5DA 5AA2D 2V84A 4CHUA 5LHGA 3C3WA 3WTXC 5A5XB 4ZYDA 1IRGA 5HDGA 5TP9A 3CTAA 2YSRA 4PFTA 1SVXB 1Y4CA 3REOA 2O8XA 3SEVA 1U2WA 2RKMA 3LSLA 5A2QK 1K7AA 1R7JA 4Q5SF 3PUWE 2Z33A 4MH5A 5KZTA 1MPBA 1KU9A 3VLUA 1KGSA 3HPIA 4IJAA 3CFZA 5I59B 1MY3A 3CSGA 3TUSA 3Q29A 3N26A 2GFEA 3PUZE 3SETA 3VLVA 1R9LA 1B9MA 1SMYF 5H8FA 2DBBA 3TTRA 3I59B 5HLGA 2XXRA 4HV6A 3Q9VA 3ZQ7A 4OFLA 4K3FA 3F8MA 1QQIA 2Q2CA 5I57B 5J1DA 3R26A 1AWCA 3OSRA 2KRFA 4Z7EA 4YFNF 1ULYA 3TTNA 1ZRCA 5FTHA 3TDUC 3F21A 1B6HA 1GVJA 3SESA 2W57A 1XGNA 2FXAA 1JHFA 1XCVA 4CZZA 4KMUX 3MJNA 2XAHA 4RGXA 1G3YA 2PYYA 1XGOA 1ZREA 1IAWA 1Z7NE 3DELB 3BPVA 3T9VA 4M74A 2KIUA 2O69A 4JB7A 1GHCA 2M5WA 1AOVA 1BIBA 3RPQA 2XHKA 3ZPLA 1SMTA 2XVCA 3A3UA 4OZ9A 5CMKA 3H3GA 3PQJA 2IA2A 4B09A 3SERA 1P99A 5L9SA 4PFUA 1XMAA 1Y3QA 1Y9UA 2CG4A 1HQCA 4DXUA 4KPTA 2RV8A 3ECOA 1TBXA 2REGA 2DPDA 1R23A 2HQ0A 5E18F 1M5EA 2F97A 4PFWA 3V7SA 2KKOA 2Y75A 3B02A 3K0LA 5F1RA 4BHBA 1U3EM 3C7JA 3ML6A 3ZMZA 4F3PA 4LUBA 1LGBC 2YU3A 1G3WA 3DF8A 5CVIA 2H09A 4G8HA 4A12A 3IHUA 3TMGA 3PUVE 1QGPA 1QPMA 4AIKA 1S50A 4R74A 1LDJA 4Z0IA 3KN3A 4UHTA 3COAC 1CE2A 3FGSA 4YU0A 4UV9A 5FHOA 4AB5A 2ZYNA 1DPRA 1ZLJA 4RA1A 4FECA 2YLNA 2D5WA 4DZ1A 4G68A 1S29A 1Z9CA 3JYRA 3JZJA 2EA2A 3JW4A 1FSHA 1XGSA 3USDA 5H8QA 2L02A 2X0LA 2CSOA 3CSBA 4U7BA 3VOEA 4MNUA 3SKPA 2HKXA 1MY0A 2FBIA 4UV8A 3FMSA 3RT6B 2ONKE 3PPOA 4G77A 4L5JA 3TAJA 3KP7A 3MP8A 2FMLA 2ZKZA 3JSOA 4CGZA 2P8TA 4RB0A 1QBJA 4POWA 2FU4A 4X9TA 5TPAA 1KA8A 4O5VA 1JVXA 4OMZA 2PX1A 1B46A 4E70A 1FBSA 1B3LA 3SEUA 4ONYA 2FMYA 3GXAA 1J5YA 1FNNA 4NEDA 2YR2A 3O66A 3C18A 3LAPA 3L2CA 2Q0OA 1QKBA 2TDXA 3C32A 3UK4A 1ATGA 4U4XA 3GZGA 3IX1A 1YQAA 2DWHA 1YTYA 4FHTA 1A40A 2XKPA 5DEQA 1IW7F 4LZ5A 4UACA 1N0TA 3RNNA 3LBSA 3KZYA 4A0ZA 4RB3C 4ZZDA 1O63A 5I2KB 3L6GA 3S9EA 2H94A 3TCHA 5LGTA 1LBBA 1L5TA 1HSLA 3OO6A 1I69A 3SZTA 4EVIA 1NNTA 2B0LA 4I2OA 1ANFA 5DTBA 1B6AA 1SI0A 2WV0A 3CIJA 3FVOA 2DSFA 4WXDA 4LP2B 2IA4A 1B3GA 3V5AA 4M9XA 3KZGA 1MDMB 4XLPF 1HW2A 5I84A 1L3LA 4F1VA 1PP7U 4RJZA 3DM0A 3QAHA 3MPKA 5FLXK 1DOTA 1AMFA 4QSCA 5E8GA 2HFHA 2HTJA 3RJPA 4EGZA 4P11A 5H20A 3KN7A 5I58B 5F1QA 1QUKA 1LSTA 3E5QA 2FNCA 3QP5A 4OIPF 5LHIA 1FTJA 2MBFA 3K02A 3VXBA 1XN7A 2MD5A 1H3DA 2HCAA 4DCYA 5FHNA 2EFPA 3NRVA 3TOBA 3KP3A 5JHUA 3FVNA 2MA3A 5HS7A 3H4ZA 2V3QA 4L9VA 3FMRA 3L7WA 4U22A 3KJ7A 4N13A 2XAJA 4U88A 3GO5A 4F1UA 4GIZA 4LQ2A 3QRFF 2Z8FA 4O6JA 1SW2A 2JSCA 1J59A 3EYIA 3TTLA 3N4MA 1WQ2A 4HCYA 3BPXA 4XSXF 3TO6A 1OLCA 2M45A 3HHFA 4WWCA 1S7OA 1OYYA 4YB7A 1B9NA 1F9NA 4U21A 4KUMA 2DAOA 3PMXA 4G7HF 4RK2A 5DYHA 1A55A 4YMBA 3LSXA 2F7AA 4RK9A 4ZEFA 1Y1MA 4N9HA 1YYVA 1EZOA 2GRVA 1BI2A 2O68A 1IN4A 1NL5A 3BFUA 4YFKF 2V3TA 1IQ7A 1B4ZA 3EHSA 2BE5F 4KYSA 2RN7A 1SBPA 2ISYA 4H65A 4IO6A 5I56A 3OEKA 4TLLB 4ESXA 4EXLA 2F5DA 4G8XA 4H0EA 2VD2A 2ZYMA 5AONA 4I0BA 2VE8A 3HCQA 2HYFA 2DLLA 4P96A 1ELJA 1ZU0A 5BUUA 5CBRA 4P0GA 3WE2A 4UVAA 2VOOA 1ZG1A 2KIMA 1FT9A 4RXLA 2KJBA 4ELPA 2HZTA 4G7ZF 3VVFA 5F7VA 1II5A 1J7KA 4RPNA 2VE9A 1P6RA 3U8QA 5HS8A 3FV2A 1FYLA 2FA5A 4IRIA 5LEKA 3OELA 4F22A 3WAFA 1K78A 5A2QZ 1SFUA 4R75A 4NQWA 1G3SA 3IWZA 1MXVA 2ZMEB 2LKPA 3CR9A 5DDGA 1NNPA 4H67A 2ZO4A 5K5QA 4IHTA 4BDNA 4CYDA 3KG2A 1HW1A 1Q1HA 3K1MA 4LLGF 1MQIA 3SXYA 2DOJA 1VE4A 3ROUA 2NWJA 2UYEA 3MQ9A 4RGRA 4M6XA 2O6GE 4BAYA 4KMFA 5CLSA 2IW5A 3EYYA 1FPQA 1IN5A 1YIOA 1P4AA 4UVCA 4OINF 4EJUA 2Z99A 1KU2A 4PQJA 3O6BB 1PDNC 1H0MA 4KYWA 1S8NA 3C33A 2DS9A 4R8HA 3CFLA 4BH9A 4YMAA 4XKPA 1BJAA 3PPPA 3IWFA 4EJTA 3QUFA 3OXNA 4A6DA 2IA0A 4P9FA 2IPQX 1P1WA 2P5KA 1TTYA 2F8DA 5D5WB 1D8JA 3RTWB 1KYZA 3KZZA 4NF8A 3B6WA 4MLQA 2F2EA 4FX0A 3VVEA 4HLXA 2R6GE 1IXGA 1PB9A 4A0YA 1EH6A 1URGA 3KEOA 1I6AA 2FA7A 5KCJA 4NF4B 1MPCA 2GWRA 1Z1DA 3Q28A 2HWVA 4N0BA 1KU7A 1CF7B 4ELQA 2F5FA 4PDKA 4HLYA 2DP8A 2QBYB 4HX8A 2CMOA 2I58A 1U6GA 2XAQA 5KDTB 3K9TA 1ZMGA 3G3KA 3RQTA 4LMYA 3TFLA 4N6PA 1ZYRF 3WGGA 2IVMA 1XC1A 1SD5A 3E5XA 3CUOA 1MY1A 3F8CA 2LSOA 5L3FA 2REJA 4M6YA 3LWFA 1FCKA 3HUGA 2KLFA 1B5JA 2UYFA 1LAXA 3U9GA 2X7PA 4LZ8A 1FP1D 2Y84A 4XRFA 2QUFA 2AYSA 2XAGA 5FD6A 4A0XA 1UHWA 1R22A 2R71A 1ZAOA 3F6VA 3K2DA 3Q27A 3SQNA 3FVKA 2F5CA 2G7UA 1U5TA 2MH2A 5AA2A 4U0VA 1W5TA 3FV1A 4ENJA 4YKIA 1W4MA 3J80K 1PEBA 3TTKA 5DT6A 3KOTA 3DP8A 1XDUA 2GIVA 4ZYGA 4A5NA 4KFCA 2A07F 1LVAA 2OD5A 3RIRA 2UVJA 2XXHA 2ONSA 1WI9A 1LFIA 3LAJA 3M7GA 1QO0D 4BYYA 4KCCA 1MH4A 4ISUA 1FQCA 4GFRA 2QQ9A 2F6GA 4YIFA 4UNOA 5CMMA 1HSJA 3Q5FA 3TKDA 3WTWC 1ZH5A 3LQQA 2XKOA 2RGVA 4QSDA 2P6SA 2ESNA 3FX3A 4QFNA 2QRYA 1S3JA 4HQEA 1B7ZA 2ZCWA 2OZUA 1LAFE 4XTCQ 3TQLA 5CC2A 3PQKA 3T8TA 1ZTYA 1QUIA 2D21A 2Z8EA 1CGPA 1XDSA 3DV8A 5DCMA 1PP8F 4H5GA 2A5TA 2BEOA 3TO7A 3PUYE 1NH8A 2EFWA 1P2FA 1C0WA 2OA4A 3LA7A 4LG0B 2VONA 2GAUA 3R4KA 5JTYB 3ZMVA 2ZXTA 3UA8A 2D1VA 2QMXA 3B6TA 4MF3A 3IORA 3V83A 1SD4A 4YAHX 4PZJA 3N97A 4HF1A 1OQGA 3I5UA 1F1ZA 4R9GA 5L8DA 3HSFA 5FLXZ 1LDDA 3QP6A 1CB6A 3VFZA 1FQEA 3VDFA 1N3XA 5ITOA 2XXUA 1DTZA 3W6JB 5E17F 1R36A 3CJNA 3T9HB 2OZZA 2I4CA 3V8XB 1SW5A 4C1TA 4GYIA 3HYIA 1U8RA 2AIXA 1ZARA 1UTHA 2COMA 4RAYA 3IO6A 2YPNA 4JWYA 1D8KA 2QYOA 3OO8A 3MW0A 1VFDA 4FIMA 2KIFA 1D9VA 2XHDA 2O51A 1R5HA 1O7LA 3V8JA 5DEXA 4TQUQ 4H8JA 1WVJA 3HTSB 4ZYHA 5H8NA 2OU2A 2PFBA 4PP0A 2IEEA 3KP5A 1B3FA 4YIIA 3RTFB 4EQ7A 2ONRA 3BDDA 2IJLA 5J8CA 1D5VA 2XXPA 2EFOA 4ZECA 1MXXA 1RKMA 3OO7A 2DI3A 4HDUA 2XXTA 2FEZA 1FY7A 2QQAA 3PPRA 4F19A 3K6UA 2W84A 3T0YA 1DUXC 2EV6A 2PEXA 1VTNC 5E8IA 4DE8A 3L09A 4OETA 1US4A 3KBRA 4BLAA 3QXMA 4YFXF 3FHZA 1W7PB 1B58A 1ON1A 3GBAA 1DPUA 2A68F 1ODDA 3F3XA 5ILSA 4KIGA 5EEHA 4Q30B 4FORA 5ERIA 3GLXA 1S6LA 2ZFWA 2G29A 1QNTA 1R1TA 4BDQA 3J7AO 3GUDA 4I09A 3PMVA 4LK1F 4IVNA 2UXXA 4L18B 3G3FA 1FX7A 3RKYA 2P6TA 2NOOA 4F39A 4WCGA 5BWJA 3F6OA 1LJ9A 2L4AA 2RKHA 1MM7A 2LDUA 2RC8A 5E1XA 1I1SA 3PD8A 4M73A 1FQAA 3FD3A 3U2RA 3GFIA 2UVHA 4IO5A 2D2WA 5DCFA 1FTOA 4Z2YA 2MLKA 4I7HA 5D6EA 3ABTA 1P1QA 1EH7A 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