1MH3A

Maltose binding-a1 homeodomain protein chimera, crystal form i
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
421
structure length
421
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTAAAAAISPQARAFLEQVFRRKQSLNSKEKEEVAKKCGITPLQVRVWFINKRMRSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Insights into binding cooperativity of MATa1/MATalpha2 from the crystal structure of a MATa1 homeodomain-maltose binding protein chimera
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding, dna binding protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords maltose binding-a1 homeodomain protein chimera
total genus 144
structure length 421
sequence length 421
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF00046 Homeodomain Homeodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.60 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Homeodomain-like 1mh3A03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh3A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh3A01
4JSOA 4YB7A 2VI6A 1B72A 3TEPA 4H8IA 3LSFB 1Y3NA 1QVSA 1TT1A 2HXWA 2JJ7A 2P1SA 1JETA 4ELRA 4R2FA 2OF7A 4R6YA 3D4CA 4XTCQ 1USYH 2K9QA 4DXCA 1MQJA 5AA2B 4GXSB 1YPNA 3G1OA 2MSYA 3ZOBA 3USDA 2Z8EA 2I49A 3GTKJ 4JX4A 1BKAA 4M3EA 3JV9A 4A3GJ 1LCFA 3EN3A 4ELOA 3KG2A 4RK2A 1U78A 2X7QA 1XC1A 5EZGA 2X48A 3I4NJ 1WGXA 1MBHA 2E1SA 3ZS6A 2ZYMA 3A3CA 2OCUA 3O6HA 4A3CJ 4YZZA 1U8BA 4LOCA 3V89B 4MFEA 2ECBA 4GFBA 2XXQA 3THIA 3VLUA 2FQ4A 5FHNA 5I57A 1MPBA 3CVGA 1Y1ZA 3SEVA 1M5BA 4ND9A 4R75A 4ZEDA 4XRSA 3FKIJ 3TP3A 2DE3A 1UHSA 2JA5J 2YJPA 3QPSA 2DE2A 3VE1B 5K7FA 5IYCJ 3K6XA 3IOVA 4C3HJ 5C4JJ 4M3FA 1MG1A 5IOZA 4R74A 4BBSJ 1ZU0A 4I8CA 1APLC 3BR1A 4U23A 4A93J 4QSHA 1MXUA 2AIXA 3FJMA 5EEAA 2DA6A 1IUDA 2ELKA 2M0CA 2F78A 4JBZA 1D9VA 2HOSA 1B52A 2FX0A 2I3WA 1ETXA 1MM6A 4OYVA 4IHXA 1IIWA 1I6QA 3CSGA 1XVYA 4AB5A 5IAIA 2EZHA 2Y84A 2PBWA 1SI1A 3I3VA 1B58A 3TYHA 4V2GA 1EU8A 2Y7PA 1LFUP 1P7JA 1OLCA 2O7IA 1DTZA 4OESA 1B7ZA 5DEXA 1SBPA 4OVJA 3PMVA 4DXUA 2FYIA 1TWAJ 3KSXA 3UA8A 3HCQA 4FECA 3L6HA 1NNFA 3K4UA 5M3MJ 3SEWA 1M5CA 1IDYA 3TTMA 2H25A 3MN2A 1HLVA 3GXAA 4XKQA 4MLOA 4UACA 1GR2A 3B6WA 1MM7A 3IX1A 2ESNA 3RGYA 3OEMA 4YU0A 1UTBB 1D5YA 3RZOJ 2OBGA 1TXFA 4I1DA 4EQ7A 2IEEA 4PFUA 5BWJA 3MVPA 4Y7NJ 1A55A 4CYCA 1JT6A 3RKQA 4RA1A 2F36A 4QF9A 2JA8J 1Q1KA 4H65A 1JT0A 4BDLA 1AKHA 1HOMA 3FD3A 4LZ5A 5KCJA 3CCYA 2DOJA 3V5AA 4ZECA 2RC7A 4KYSA 2QMXA 5AA4A 1SYIA 2A5TB 5I56A 2G93A 3ZSFA 1MXYA 3PUWE 4F29A 5H8SA 1B8IA 4GLIA 2QS2A 1DPEA 1UTHA 5CC2A 4U21A 2F6GA 2XHDA 2XPWA 3PD8A 4PFTA 1K83J 2DXYA 3IAZA 4K3FA 3BG9A 3FV1A 4KR5A 5H8NA 4I6ZA 3K7AJ 1FTTA 2ECCA 4M3GA 1N3WA 1NMUA 4XIGQ 4LONB 2XPVA 1US5A 3OO6A 3FK7A 3CR9A 3BR5A 3E9XA 4MLVA 1OQGA 3PD9A 4A3BJ 1ANFA 2R7ZJ 2NWJA 5AE4A 3IH3A 2HFBA 1DU6A 4X48A 2AO9A 3Q28A 1MSFC 3MP8A 5A5XB 5JLXA 2NOGA 2R5ZA 1N3XA 1Z7ME 3W9VA 5FKMA 3RQTA 4X9TA 2ZYNA 3S1QJ 1IXCA 4X1DA 5L9OA 5KDTA 1YAEA 2DJNA 3K1PA 1IRZA 3BR2A 1TWCJ 3R6UA 4DYCA 4N07A 3A02A 3F11A 2CRGA 1B72B 3HOWJ 3Q29A 3K1MA 2GLOA 1LB8A 4MBPA 1W0UA 1JVXA 2ANJA 2O9LA 4KPTA 2V84A 1MPDA 1RR7A 4IHVA 3K0VA 2OK2A 1XC5A 3SFIA 2DA5A 4DE8A 2PT2A 3W15C 2XXIA 1PC3A 2ZB9A 1RYOA 4UUSA 2M8GX 4NF4A 1GUUA 4H5FA 2I4BA 3SJMA 1S7EA 2VP1A 5IP7J 1FQDA 4AYBN 5H8HB 4DCXA 3IK6B 1DOTA 1IV6A 2LK2A 1BP5A 3QIMA 4NMYA 1UIVA 1ETYA 1N7WA 5CRYA 3KN3A 4A3DJ 2DMQA 3VLWA 1UMQA 3N6UA 2H4IA 1VF9A 1IDZA 2UVIA 3QSLA 3OSFA 3O6IA 1D9YA 1FQCA 3N6TA 3CG3A 4YB6A 1LB9A 2QS3A 3DEWA 3S4UA 1Y20A 1MH4A 2CQQA 1MY4A 1GV5A 3U8QA 5J1RA 3QAXA 1ITYA 1SW4A 3PV0E 4DIGA 4C2MJ 3ZQFA 1H3DA 3MBPA 1PB7A 4FE7A 4NE4A 2LY9A 2M34A 2V3TA 3KEIA 5TU0A 3EHUA 3HKZN 4I62A 5IOYA 1CB6A 4FCYA 3TMGA 1PBPA 2ZYKA 4Z7EA 1NH7A 4E0WA 3L6GA 4PE5B 3TW7A 2XX9A 2ABHA 3MVZA 1F43A 1QUIA 4FEDA 5GP9A 4BLAA 2R92J 3QK6A 4L17A 5HM4B 1HSLA 2F7BA 2PMZN 5ITOA 2REJA 3HOVJ 4G2ZA 1MBFA 4XICA 3KZGA 3QUJA 4F31B 4QFKA 4FEBA 1AMFA 4OTEA 4F39A 4WEDA 3BG3A 4IO6A 1B9JA 2DA4A 4Z0IA 3FASA 1MY0A 1QVUA 3C35A 4NWDA 4ABZA 4R9GA 2F5XA 4H5GA 5I2KB 4HW8A 1Y4CA 3LSXA 4NF5A 2FJ1A 1LLSA 5F04A 4IO4A 4EDPA 2DSFA 3H6UA 4R9FA 1Z77A 2RC9A 5FHOA 3S1MJ 2I4CA 5F0CA 3KJTA 4Q0CA 3K01A 3HGYA 5B7DA 3PUVE 3PO3J 2R5YB 4QRZA 3ILUB 3LNQA 3O8GA 4NF8B 4I9DA 2X7PA 1B3HA 2ONKE 3HOYJ 3DP4A 3FXUA 2HDDA 2Z8FA 2Y31A 4JYKA 4BDNA 4EEFG 2DWAA 4AUXA 1ZR2A 1II5A 3GTOJ 3FXRA 2DXRA 4NTLA 2DMPA 3QPLA 3MPLA 1PDAA 4OXVA 1BA5A 3AXFA 4LQ5A 4R2BA 3JRAA 2HXIA 1WODA 1MXXA 3Q0VA 4HNVA 3O28A 1MBEA 2EZKA 1IGNA 3NARA 3MW0A 3CFLA 1PBQA 3B7DA 2HAVA 1ELJA 1N84A 1HSJA 4ESXA 1D4NA 3CQZJ 1EH3A 3A01B 1M5FA 2NOOA 2M2EA 1HSEA 3EHTA 2EZLA 3ODBA 4YKIA 3G3HA 2L9RA 1MSEC 1SW1A 2LFBA 5IYBJ 4XXUA 5H8FB 1LAXA 2B65A 3OSQA 1FQAA 5H8QA 3IH4A 2H5YA 4DXBA 2CJJA 2Z8DA 2E2JJ 1BTJA 2Q8JA 3FVNA 2LP0A 2MW8A 3M3LA 1OLAA 4RXLA 5EHSA 2JMWA 1H8AC 1SVXB 1PUFA 3UORA 2L7ZA 1VFCA 3P7IA 4YMBA 5EGOA 1IZ1A 1OJLA 3IJOB 2ALUA 2F6PA 3T9XB 5AA3A 2I0CA 2HEUA 5IKBA 3QYTA 4NF6B 1URSA 5JTYA 4G68A 4NF4B 3JREA 5TP9A 1AIVA 1NNPA 1B40A 2N8GA 4EXKA 3FIRA 3E13X 1T0KA 1LE8A 3BBRA 1EZPA 1X58A 5F1JA 1Z7NE 1G2HA 1QKAA 4D5FA 4ONYA 3JRGA 4QHQA 1JKQC 1SI0A 1FQBA 2W48A 2UVHA 5ISUA 3K00A 1H88C 2I0BA 1JUPA 3CG1A 1GVCA 4A69C 1B3EA 1QJMA 5FTHA 1QULA 4MH5A 1ENHA 1I50J 4MLQA 4M6VA 4LATA 1GVDA 4IO3A 3A03A 4KHZE 5EHMA 1Y1WJ 1MY3A 3K02A 3JRBA 1WVJA 2DMUA 4OETA 4V2FA 4IHWA 2XGCA 2VOZA 1R1NA 5I2NB 2A5SA 4HCWA 3PUYE 2XB0X 3DCFA 3E4RA 3LOCA 1SDXA 1B5IA 2NVTJ 3S1NJ 2RCAA 3SDGA 1KWHA 3S2DJ 3FIWA 4Q30B 2M9HA 1QRYA 4IHYA 4A3LJ 3H06B 4A3MJ 3G1LA 5I58A 3BKIB 3EF7A 2O69A 3JRFA 4FISA 3GTPJ 1B7HA 1BIYA 3BT9A 1F9BA 1LFGA 2K40A 1R9QA 1YTVA 3VXCA 2R71A 3UP9A 2XPUA 2VUMJ 1LSTA 1PEBA 3Q26A 2JA6J 2EBIA 2G0EA 1POTA 4Y52J 2F7AA 4D5CA 1LCTA 4BBRJ 3LSJA 4Q5TA 4RBOA 3C32A 5I59A 2QF7A 1ATGA 4RK9A 2K9SA 3EHSA 4DYQA 1RETA 4NDLA 5F0HA 5DT6A 3CMYA 2Y7KA 1EZOA 4O3CA 2XGDA 4M3BA 3A3UA 1MY1A 3IOUA 1OCPA 5E3MA 1ZLQA 2ZMBA 3BTIA 5F08A 5LOMA 2F35A 2Y2ZA 5DTDA 1OVBA 3OOAA 1FIPA 2DVCA 3BQZA 2E1OA 3GBBA 5EG0A 3U94A 2CQXA 5TPAB 3TAJA 1B05A 4G4PA 3SETA 4GRKA 1MXWA 3N94A 3KSJA 3E7LA 3TPAA 2DN0A 3LSRA 2D5VA 1H43A 2YPNA 1P1NA 3VV5A 2XXRA 2UYFA 1RKTA 4EF2A 5CBRA 2HAUA 4GWOA 3GTJJ 3C33A 2KT0A 4EQBA 4KFQA 4MFIA 3K6VA 3TTKA 5HBCA 3UK4A 2YUSA 3H03A 1CQTA 4OFOA 2ME0A 2QS1A 4XKRA 1NH8A 4B1RA 3MZ9A 2VGQA 2X9DA 3T66A 4LZ8A 4O3AA 4TQUQ 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4QFPA 3LC8A 3PPNA 1VR5A 3TCGA 2E2IJ 4JWYA 1POGA 3I6VA 2IA4A 1IJWC 5EYRA 3MVYA 4BXXJ 3K1NA 5AA2A 1OVTA 3C9HA 1A40A 1Q35A 3H3VK 4IGRA 3C2BA 4LZ7A 1ORKA 4FJPA 3C36A 2B63J 2JK3A 3PPRA 2XXUA 3FATA 2ZNUA 4H6DA 2XXHA 5CBSA 1TWGJ 4DCYA 3OMBA 1R9TJ 1NFTA 1VSOA 5BNGA 3JRCA 1JVYA 3IB0A 2XXPA 2I6EA 2O7UA 1XT8A 2M8CA 5DVIA 2Q2AA 3B6QA 2V3QA 3LBSA 4N13A 3FV2A 3T9HB 3QXMA 1P99A 4KYDA 1AHDP 3M3KA 1NL5A 4C0RA 3S9MC 1UG2A 1U9OA 1NK3P 2YU9J 2O84X 1JW5A 1P7IA 2DA7A 3G3IA 4EQ9A 3GTGJ 1FTZA 2L7FP 3B6TA 5DEXB 3LR1A 3PPOA 3TW6A 1AL3A 2QS4A 1JQFA 3PUXE 3TQWA 4ELQA 2BJJX 4IGTA 1QUJA 1IQ7A 1QW0A 1FEXA 3G3GA 4FTHA 3B6AA 1B1XA 3I5OA 4U22A 1IITA 2G29A 3O2AA 2LAOA 3OOUA 4CYCB 4XIDA 1WPKA 5J1UA 4FE8A 3G3JA 1N0TA 3EQ1A 3VVEA 1B5JA 5J3LA 4M1VA 1AKHB 2THIA 5KCJB 5FKOA 3K2AA 1I69A 1LBBA 1JUSA 4KCDA 1B3GA 4GQOA 2JA7J 3KBRA 4IO5A 2L0KA 4B3AA 2CZLA 1FQEA 5AA4B 1OCTC 5I56B 3D1NI 1YCJA 5AA1A 3B6CA 2XB5A 3MZBA 3HPIA 1MQIA 2V93A 1O4XA 4X1BA 3CDLA 3PPPA 1MDQA 1ZJLA 4GIZA 1B8IB 3MVWA 2GBYA 2XXXA 1ETWA 4JWXA 1UTHB 3MP6A 4RPOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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