1MH4A

Maltose binding-a1 homeodomain protein chimera, crystal form ii
Total Genus 136
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
136
sequence length
418
structure length
418
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTAAAAAISPQARAFLEQVFRRKQSLNSKEKEEVAKKCGITPLQVRVWFINKRM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into binding cooperativity of MATa1/MATalpha2 from the crystal structure of a MATa1 homeodomain-maltose binding protein chimera
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding, dna binding protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords maltose binding-a1 homeodomain protein chimera
total genus 136
structure length 418
sequence length 418
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF00046 Homeodomain Homeodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.60 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Homeodomain-like 1mh4A03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh4A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh4A01
5K7HA 3PPRA 2DA6A 3LSGA 3C32A 2OK2A 3MVZA 2TRTA 1W0UA 1NFTA 3ODBA 5HM4B 2O1MA 4UUSA 3B6AA 3HM5A 4IHWA 1GV8A 1T56A 4DZPA 2THIA 4FISA 2M8CA 2HZKA 1POGA 3LSJA 2Y9ZA 1ZBMA 3A3CA 1Q1VA 2R71A 5I2NB 1HDPA 1LCFA 2H4IA 2V3QA 2Z8DA 1JKQC 5FLMJ 2I3WA 4KYDA 2F7BA 1NMUA 4MLVA 1NNFA 4WKMA 1TXFA 3G3FA 5F04A 2F36A 2RAEA 2XX8A 1MQJA 1FQEA 2COBA 1RR7A 5ICQA 1JNFA 4A3CJ 4B3AA 3L1PA 1P1UA 3OOUA 4H8IA 1QUKA 2G29A 3RZDJ 1X2NA 2LAOA 2NOGA 1MDQA 3ZKKA 3T9UA 1B46A 2Y31A 3IJXB 1NNPA 1UTHA 5IYBJ 1O4XA 5J1RA 4A93J 3UORA 4IEJA 4QSCA 3VLVA 1MXVA 2Y7KA 4FEDA 1SQYA 4F29A 2OJTA 3MVXA 4GF8A 3A3UA 3HBLA 1H44A 3VDFA 5ITPA 3ZKLA 3E7LA 4A69C 4LVQA 2JN6A 3ZQCA 1BLFA 4OERA 3H4ZA 1DU0A 5I58A 3PUZE 4RPNA 2GRVA 2P81A 1GV5A 1USYH 1R1NA 2L7ZA 1B3HA 4QHQA 2H1KA 2D3IA 4M4GA 5F08A 1AOVA 4UUSB 4JBZA 3FVNA 3RY3A 1IXHA 4W1UA 4G68C 1MXUA 1I3QJ 1JETA 3N94A 5TP9A 1PUFB 4HNVA 2HOAA 4XICA 5FKMA 3BR2A 4IHXA 4D5CA 1GVDA 4RXLA 4PETA 1JVXA 4DYQA 1X2MA 4M3GA 3JRGA 4F2OA 1SYHA 3QXMA 3CFZA 1P7IA 2WAQN 2QS3A 4Y7NJ 3A09A 2I3VA 1FEXA 2XGDA 1UQWA 5L9MA 3VXCA 1B72A 3RZOJ 2X7PA 2R5YB 3SDGA 3TZAA 1ORKA 4FECA 3BBRA 4R74A 2DP8A 4TLLB 5CC2A 1D3KA 5IYDJ 3PUXE 1MXYA 4OESA 3HOVJ 1JEUA 2DWHA 4ELRA 2QS4A 2LP0A 2F35A 2DSFA 2NVQJ 3ECRA 3SDFA 5EGOA 3GLBA 2REJA 3GTLJ 1P1WA 1POY1 2PBWA 4QF9A 2NVXJ 1ZR4A 1XOCA 2DWIA 4DLDA 5BUUA 3VXBA 4XRMA 1FW0A 2K40A 2TCTA 3QYTA 3IX1A 3MC2A 3U93A 4AB5A 1QKBA 4YMAA 1GR2A 3TPAA 2XXUA 1DSNA 3UA8A 2Q2CA 2OWTA 3V83A 4S0HB 4AB6A 1A99A 5I58B 4EUOA 1W0TA 5IP6A 4IY6A 3HOZJ 2XB5A 1HSJA 2M0CA 5IYCJ 4EEFG 3LBSA 1B7UA 3EHSA 3KSJA 1LAHE 1QKAA 3K00A 4Q30B 1U9NA 1XT8A 2ABHA 4LZ7A 1CE2A 4LP2B 4OFOA 3CIJA 2DTZA 2DYXA 3U92A 4FORA 3I3VA 3IAZA 5L9OA 4GXSB 2HOTA 3PUYE 1QJMA 2VGQA 2MG4A 3TMGA 3G3HA 3HKZN 2DJNA 1RPWA 1I50J 1BW5A 1I69A 2LK2A 1B72B 1WGXA 3Q0WA 4A3BJ 4NDLA 1LSTA 1Y1WJ 2H9BA 3MZBA 3TUSA 5ELVA 1GVCA 1Y3QA 1YCJA 4DXUA 4R9GA 3C9HA 4DE8A 1NK3P 1LFGA 2DOJA 1Y1MA 2D5WA 4ZEDA 2R9JA 1N7XA 3ZQFA 3U1OA 4ABZA 3OSGA 4X6AJ 1JJ8C 5EGOB 2EBIA 3B6TA 2JMWA 3BFTA 1Y1VJ 2L7FP 2I49A 3MZ9A 3GXAA 2UVHA 5FHOA 4F18A 4CYCA 4QTRA 4RNSA 1AU7A 3H6WA 4N6PA 4JSOA 3KSXA 2B65A 3IOWA 2UVIA 1D4NA 1MSFC 3TQLA 3CG3A 3O2AA 4K3FA 2F78A 3OO6A 4R75A 2PVUA 3IK6B 2QCOA 3K2DA 5CMBA 2VKVA 3B6WA 2ELKA 1B7HA 3C36A 1Y9UA 5B7DA 3Q25A 3K4UA 3S15J 1FCKA 2I48A 4H5FA 3OSQA 2F8DA 3LSLA 3SKPA 3BTCA 3HSTA 3ZQGA 2XPVA 1JJ6C 1APLC 1TFDA 1NTCA 2ONKE 5EHSA 1Z7NE 2HAVA 4QRZA 3RQIA 3G3GA 3FD3A 1R9TJ 3W15C 1QUJA 3ONMA 4OQOA 3SEUA 4XIGQ 5DTBA 1RKWA 3S2VA 1O63A 1US4A 4FCYA 1MBFA 1DOTA 5EHMA 4OETA 3LOCA 4XIDA 2K9SA 4FTHA 4LQ2A 2E2JJ 1QVSA 2F6PA 3OEMA 4JWYA 5C44J 1JW4A 4F1UA 3K0VA 2DVCA 3TQWA 5H8QA 2OF7A 4YICA 5F1QA 2Y9YA 4X1DA 3QK6A 3IO4A 3CSBA 5ISUA 4TOZA 5H8SA 1B1HA 1GT0C 2VD3A 2EZLA 2RC9A 4FAJA 3S2HJ 3G3IA 1DU6A 2H99A 5I84A 3HV1A 3TP0A 4CYCB 1MQIA 4N13A 4PFYA 5IKBA 3V89B 1P7JA 1GTKA 1ANFA 5TPAB 1RKMA 3BR3A 4OXVA 2R92J 1GUUA 2LY9A 3MPLA 4M6VA 4YKJA 3T96B 4P0GA 4PFWA 2O6AA 2YJPA 4X1BA 1Y3PA 3PO3J 2F7CA 1B3LA 3UN6A 4KYEA 4OENA 2LVSA 1H88C 3O9PA 3KOSA 1IDYA 2H98A 4E0WA 2Y2ZA 3IO6A 1OLAA 2ESNA 2XB0X 2XXPA 3S17J 3E13X 5E3OA 4BDLA 3DEWA 5B70A 4YU0A 1H8AC 2ECCA 5KCJA 4ZE8A 2I0BA 3KN7A 4GD5A 4IO2A 5AE4A 3GTPJ 3E3KA 3TKDA 2KDZA 2HFBA 4NE4A 1SW2A 4RBOA 4XK4A 4NTLA 3PV0E 3S1QJ 3K2AA 4F1VA 3PD8A 2NVUB 1H3DA 5H8QB 3MBPA 5F0HA 3TTMA 3HGGA 4ESWA 3O8GA 4Q0CA 3HO7A 1USYE 4ZS9A 3FXUA 1VI0A 2M9HA 4BDOA 4H5GA 1HDDC 3MWBA 3TODA 2VKEA 4NF4A 1IUFA 1K61A 2H5YA 3T9VA 1P1OA 1S7EA 1GGGA 2UVGA 4G4PA 3C34A 3FJ7A 1A40A 3MAMA 1JKOC 2JA8J 2F6GA 2F7AA 2JWTA 3G7WA 4F1YA 2R5ZA 3H3GA 5IPAA 3LNQA 4OZ9A 1FQBA 4KCCA 2ZYKA 3RTWB 2NOOA 4U23A 1PB7A 1AKHA 1ATGA 5K7ZA 4G12A 4G68A 3N26A 3IOUA 3LSXA 4JX5A 3ZQLA 3CI8A 3PMXA 3HOWJ 4XRSG 4IGTA 2B3BA 3HOXJ 1IJWC 2W48A 1F9BA 5LOMA 2DE3A 2ECBA 3O6IA 4GVOA 1IQ7A 3V8XB 2L7MP 1MDP1 4EQ7A 3RUMA 3R26A 2UVJA 2EQRA 3K6XA 5KCJB 4A3DJ 4RY1A 3TP3A 1SBPA 1ETVA 5E3LA 1PUFA 1LBCA 4ND9A 4L17A 3DP6A 4BBSJ 4XKRA 3LSFB 3LSPA 4AQ4A 3DM0A 5GPCA 3FUZA 3TCHA 4DIGA 5FKNA 3EPEA 4F3PA 1Q35A 5A5XA 2PYYA 3BTJA 1PDAA 3EHUA 2I6EA 3JRAA 3PGFA 1EZOA 2R5YA 4P0IA 1FQCA 1AIVA 4NF4B 4YB7A 4IHVA 4R6YA 2HXOA 5CRYA 9ANTA 4G2ZA 1IITA 2I58A 1VNDA 2QPQA 2DMUA 1B6HA 2R5ZB 5CMCA 1Y3NA 2FNCA 3LUYA 3DP8A 1IG7A 1IRZA 5FHNA 3VVFA 3C31A 4KI0E 2FA7A 4I1DA 1EZ9A 3EHTA 2WB1N 4HW8A 4B1RA 1DTGA 2W7YA 3O28A 3MKLA 4GL0A 4IO7A 3OIOA 1SFOJ 1MBHA 4BY7J 3RT8A 2R93J 3N6TA 1AKHB 1SI1A 4R6HA 1O7TA 1P1NA 4G68B 4IGRA 3VV5A 4JX4A 1HF0A 1EU8A 1FIPA 2XXVA 3SEVA 1LCTA 1XG1A 3OELA 3HOYJ 4DZJA 5E3MA 4NF6A 2XGCA 3FK7A 2M2EA 3DP4A 3UIFA 1ZQ3P 4M3FA 2XXHA 1ETYA 2PT2A 1I6BA 1MQDA 1JKRC 1MBGA 1ZLQA 2DS9A 4RA1A 1OLCA 1I6HJ 4THIA 4AC0A 4F3SA 1B1XA 4MO7A 4N07A 2NVTJ 1F43A 4MLQA 5IAIA 2JA5J 2XRLA 3KBRA 4KYSA 3IORA 3JRIA 5A5XB 3BG5A 1LBBA 1QUIA 3TELA 1RYOA 2XGEA 3MVWA 3H6VA 2G93A 2WV1A 4JP0A 1J1NA 2AHQA 1WCMJ 2Q2AA 3D4GA 1ETQA 2DWJA 3E9XA 3TAJA 2ZMBA 3MVYA 3K6UA 4IO3A 2CUFA 1MY1A 1WPKA 4QSHA 4IHYA 4HS7A 3OSFA 4MFEA 2NXOA 2HXIA 2L9RA 4C3HJ 4NMYA 2KT0A 1I6QA 3IOVA 2ZYNA 1BW6A 3BTIA 1TWHJ 3CR9A 4DZ1A 3IL1B 1QRYA 2PT1A 3OD7A 4EQBA 1TC3C 5J1YA 3W6VA 4JWXA 4ONYA 1D9YA 4PQJA 3PMWA 1H45A 4XKPA 2F34A 1XVXA 1JVYA 3PO2J 3CG1A 4R73A 3TFLA 2Q88A 1WH7A 1UG2A 2A5SA 2GFEA 3DCFA 2CRGA 2BJJX 4H6DA 3G1LA 4MIMA 3HOUJ 5CMKA 1VE4A 4KPTA 1IXIA 4TLMB 1Q1KA 1B4ZA 3GTKJ 3QUJA 4MF3A 4NF6B 3LSRA 1OCTC 1GDTA 2QJEA 2O7UA 3C4MA 1MH3A 5HBCA 2HQ5A 3KGCA 3CQZJ 3TCGA 3S9NC 4X9TA 5FKLA 1MBEA 2HZLA 1SANA 2H25A 5JTYA 2PX1A 4I62A 3S16J 2MW8A 1A54A 4G8MA 2XXQA 5DS9A 4JYKA 3M4OJ 1BL0A 2Y7WA 3PU5A 4ISUA 2IA4A 1MPCA 3I5OA 3C2BA 3LSWA 1MPBA 2XPWA 4EXLA 3KOTA 3ILTB 3EF7A 3U72A 4A3JJ 3F0CA 2OWSA 3JRFA 3TEDA 1MG1A 3B6CA 2CMOA 3BFUA 2FYIA 2AYSA 3QAXA 3GBAA 1WI3A 2I4CA 3M3FA 4HCWA 3O6GA 1YRNA 3QPLA 2V84A 2V3TA 1M5FA 3TTNA 5I56A 5J3LA 2XXRA 1Y20A 3GBBA 2LR8A 2D5VA 3H0GJ 1JW1A 1S50A 2F5XA 4LONB 3G1OA 2Q89A 4DXCA 3OO7A 2ONRA 1OQHA 5H8NA 1JKPC 3I6VA 2O7OA 3VE1B 2D21A 4IY5A 1XS9A 2Y7IA 4U22A 5TPAA 3WHBA 4NWCA 2DA7A 2O9LA 3CFXA 1ZR2A 2UYFA 3Q29A 4DYRA 4U2RA 3RT6B 5EEAA 1JUPA 2RC8A 1MM6A 3R7XA 4DXBA 1BIYA 4M1VA 4D7MA 2XPUA 5FTHA 2CZLA 5IP9J 2F97A 3MP8A 2DA3A 3A02A 2Q9TA 1EZPA 1B7ZA 1Z77A 2FJ1A 1MSEC 4ZZEA 5JTYB 2X48A 5C3EJ 1UMQA 3OOAA 4RYAA 3GTJJ 3IB2A 3A01A 4MFIA 1TT1A 2WKYA 4GIZA 5FLVA 1MM7A 2ALUA 3RGYA 2E1OA 1AMFA 2AL4A 4O3AA 4XKQA 4G8NA 4V2GA 3BR1A 4ZECA 1MXWA 4EF1A 3VFJA 2IEKA 3T9XB 1HSLA 1OVTA 2EZIA 2VUMJ 2HYJA 2CJJA 3Q28A 4YB6A 3OENA 4X48A 2Y84A 5CI5A 2OZZA 1H43A 1PBPA 1M5CA 2AIXA 1SW4A 4KCDA 3H03A 5CBRA 5GPAA 1A8EA 4B4CA 3HEFA 1VFDA 1B0HA 4XRSA 1MQHA 1U8BA 3K6VA 4OHNA 2PMZN 3M3KA 1Z0XA 1KWHA 1YRNB 2CQQA 4OWDA 2QRYA 5I56B 4ECFA 4LUBA 1MY4A 2DQVA 4OYVA 3N5LA 3T22A 3L6HA 5L8DA 4A3GJ 1M5BA 1UTBA 1URGA 2UYEA 4XXUA 5F0FA 4M3EA 4AYBN 4IO5A 3FV1A 2CU7A 4C1UA 3O29A 3GTQJ 1LB8A 1AH5A 3WHCA 2OLBA 5H8NB 1JT6A 3G3KA 1T0KA 3JRHA 1H76A 2XX7A 1CB6A 4JB7A 2E2IJ 2IAIA 4OFJA 1U9OA 3G3JA 1ENHA 1RETA 2K9NA 4C0RA 3RN8A 4U4SA 3TYHA 1ETXA 3FXRA 1MY0A 1NNTA 2DA5A 2JK3A 2XSDC 1M5DA 3S9EA 3PUWE 3IR1A 5BWJA 1NH8A 1B52A 3W9VA 1B3EA 5F7VA 1FQDA 3HHGA 3KN3A 2EZHA 3FXQA 1CQTA 1ZTRA 2NS8A 3A01B 2DA4A 3NARA 2GM4A 5DEXA 1P99A 2M34A 3JR9A 2VOZA 2XXYA 2OCUA 4C1TA 5HODA 1NKXA 3VPRA 3HCQA 2G0EA 3FISA 5EDNA 4F39A 4OTEA 2NUVA 5JLXA 3UK4A 1ZU0A 1JUMA 3K01A 5M3MJ 1FTLA 3FGSA 2LLKA 1MBKA 4WEDA 4Q5TA 1DPPA 2FQ4A 2Q8JA 3BG3A 3KJTA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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