2ESNA

The crystal structure of probable transcriptional regulator pa0477 from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
301
structure length
299
Chain Sequence
PLLRRLDLNLLLVFDALYRHRNVGTAASELAISASAFSHALGRLRQGLDDELFLRQGNRMQPTQRAEHLAAAVAAALRALGEGLEEWRPFVPGQSQRTFVFAATDYTAFALLPPLMNRLQHSAPGVRLRLVNAERKLSVEALASGRIDFALGYDEEHERLPEGIQAHDWFADRYVVVARRDHPRLAGAPTLEGYLAERHAVVTPWNEDSGVIDRLLARSGLRREVAVQLPTVLAALFLAGSTDFLLTAPRHAARALAEAAGLALYPAPFDIPPYVLRLYSHVQGRDAHAWMIGQLKGLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structure of putative transcriptional regulator Pa0477 from Pseudomonas aeruginosa
rcsb
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule keywords probable transcriptional regulator
total genus 89
structure length 299
sequence length 301
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-10-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 2esnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2esnA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2esnA03
2LKPA 1S7OA 4N13A 4UA8A 4Q5SF 1XDUA 2O51A 3IK6B 1FC3A 3PMVA 3H6WA 1Y9UA 4X1DA 2YX4A 1U6GA 4U21A 5AIPA 3VXCA 4AIKA 2LAOA 2RF1A 5FFZA 1B3HA 3WE2A 1R7JA 3M9AA 5K5QA 3ZQ7A 1CB6A 3UP9A 3C34A 1E2XA 3A09A 2DOJA 1LAXA 5I58B 2DSFA 2PVUA 3PV0E 2JT1A 1WWXA 5BPIA 1BC8C 2QMWA 3MJNA 3FMQA 4IJAA 2WWYA 2Z8DA 4D0PA 4L5JA 4LK0F 3RKWA 1SVXB 4NF6B 2YPNA 4HBLA 3WAEA 4JDFA 3PFIA 4A6DA 3O6BB 1LEBA 1JGSA 3KOSA 4QRZA 1XGNA 4PP0A 2OZZA 2IEEA 1FQAA 3W6KB 3M3KA 1HKTA 3C1DA 3KP5A 3ZMZA 5JFRA 3J80K 4A12A 2G9WA 5CYVA 3C4MA 3WTUC 1YTVA 2ZNSA 1N3WA 4JK1X 3BDDA 3EN3A 3PPRA 4WX9A 3I0TA 2ISYA 4H5GA 2PG4A 1YYVA 2DI3A 4U4SA 2L02A 4FJPA 3DQVC 1SYHA 3LA3A 5L8DA 1UIUA 4S04A 1YW7A 3HV1A 2FBHA 3KBRA 3SERA 1MDMB 2FYIA 4NHJA 3RYPA 1KU7A 5CC2A 2BE5F 3LSFB 1STZA 2P6TA 1M5CA 2Z22A 5F7VA 5J1DA 2V1XA 3RDIA 3I71A 1UFMA 3N4MA 3DLNA 3VXBA 2M5WA 1XB4A 3RT8A 1I6QA 2XKPA 3I64A 4ONYA 1VFEA 2PFBA 4A2UA 1T0KA 1MD0A 1FBQA 3RLFE 5D4SA 2RVCA 1BIBA 2IT0A 1JXSA 3N97A 2DWIA 2HZTA 1MQGA 3B73A 3V7CA 3I58A 2V1DA 2NXOA 4IVNA 1B05A 3IO6A 3WGHA 5FHMA 1XCBA 4EM1A 4G8XA 4X9TA 1FYKA 2NOOA 1YLFA 2PX1A 3BPXA 3TKDA 2QENA 3FATA 3HO7A 2JPCA 1AMFA 3GX4X 5DT6A 3FXQA 1P99A 2IA4A 5H8QB 4BYYA 4KNYA 4HF1A 2OJTA 4H0WA 4ETSA 1USYE 1DDNA 2HQNA 3RT6B 3KETA 1AOVA 3M8UA 3RPQA 2VOOA 2BJJX 2QJEA 1MGTA 3R0AA 3O2AA 4G2ZA 4UV8A 4OFLA 4Z0IA 1OLAA 3LSXA 4LGWA 2LSOA 5ICTA 2EV6A 3SZPA 3DKWA 1H45A 3SEWA 2G29A 2KJCA 1XT8A 1XD7A 4BH9A 4DNCA 4GGGA 3F8FA 1DPPA 2BV6A 4GVOA 2XASA 3VLUA 2QL3A 2ZYKA 4IY5A 5H8FB 3SKPA 2OBGA 1OR7A 1A7LA 3EHUA 5FTHA 4RAYA 2NYXA 4ZE9A 1LSTA 1P92A 1BLFA 2DE2A 5AA4A 2XXUA 2EA4A 1O63A 3TCGA 2QPQA 4R2BA 2FSWA 2IA2A 1HW2A 1P1QA 4X1BA 1Z05A 1URSA 2I0BA 3G3JA 5TRDA 3MP8A 4F3SA 5A5XA 5BWJA 1W5SA 4R79A 3VEPA 2MH2A 3KZZA 2XXTA 3O6GA 5FD5A 3T22A 1RUOA 4RB3C 4WXDA 2F97A 3QIMA 4BDRA 4P11A 1MXYA 4FIMA 3RKYA 2KLFA 2OD5A 5LHHA 1XN7A 4CDGA 3R61A 1G3TA 4QSEA 3SEUA 3SHFA 4L9NA 2C6YA 3ZN1A 1FPQA 4UV9A 3JSPA 5CMCA 2PLYA 3HHGA 3C9HA 3OELA 3VDFA 1UTHA 2AL4A 4HDUA 4I0AA 3GVAA 3FUZA 2I3VA 3MCZA 4PFYA 2GQQA 4P9FA 2R9JA 3F6VA 4WF2A 2DBBA 5ITPA 3F72A 5L3DA 4DLDA 3IRQA 4ZECA 2GA2A 4YB6A 4ZYHA 2REGA 2NWJA 2QZ8A 3OO8A 3BWGA 4ZH4F 3QAHA 4XSXF 1ZRFA 1QNTA 3HOSA 4R9FA 4PGGA 5ICCA 2VD2A 3LA7A 4IGRA 4GO1A 1F5TA 4U23A 3TDJA 1RUNA 4FT8A 1U78A 5BUUA 3MWBA 2DQVA 3HTSB 2XXVA 4QFOA 3RY3A 1REPC 1AH5A 2F8DA 3H6UA 3ZMUA 2Q2CA 3IKTA 4ZYDA 2WV0A 1DMBA 3VE1B 1POY1 1EH7A 3KZGA 4GFRA 1FTKA 3L6HA 5LGUA 5TP9B 5CVRA 2QS3A 1BJAA 1F9NA 3BFUA 3PUZE 3BFTA 3PD9A 3WODF 3MPLA 1IIWA 4G7ZF 3DP8A 4HQEA 2DAOA 1ODDA 4OVJA 1H9GA 2E1NA 3WTSC 1YW9A 1N7XA 3CSBA 5ED4A 2XXXA 3SESA 3VFZA 4GWOA 2COMA 2Z5UA 4F29A 2E1CA 1N76A 4C1UA 2XIGA 3W6JB 2DPDA 1B9JA 3GBBA 5DEQA 4E70A 2NNNA 4IF4A 1JNFA 2HXWA 3GF2A 1S7AA 1MQHA 2Q88A 3PPNA 3QPHA 3B6TA 2O8XA 3U94A 4R6YA 4F7ZA 5KVRA 2O68A 4GXAA 1Q1KA 2ABHA 1P4WA 1NFTA 3FMRA 2G93A 3T66A 5L3GA 3V89B 3KG2A 4I8CA 4OMYA 3V8XB 1QUJA 1BI3A 2HOEA 3OD7A 4ESXA 3TYHA 3EPEA 3TO7A 3ZS6A 4M72A 3D5LA 3OV8A 1OKRA 4F2OA 3SZTA 4L0ZB 2F7AA 3JAMZ 5E8IA 3GFIA 3O97A 1J1NA 4TQUQ 2GXBA 4NF8B 5AA2B 1YG2A 2DE3A 3S2WA 1P4AA 3ZMSA 1URDA 3SDFA 4DXBA 5I57A 3HSTA 4XIGQ 4P0GA 2PMUA 4LVQA 1KU3A 1D5VA 4QFKA 2P6SA 1RKMA 4PQJA 3BY6A 4HAMA 2VC0A 1RI7A 4G7HF 1SW1A 3UK4A 4P55A 4BDLA 1YS7A 2BYVE 1SQYA 2GRVA 5H8NB 3O29A 3M8EA 3SFZA 4I01A 4LG0B 4HQMA 5LGNA 5ILUA 5A2QK 3B7DA 4OETA 2Q89A 2FBIA 1WODA 1T0FA 4OIRF 2QVOA 4OQOA 5JHUA 4ZZLA 2P7CB 1KU9A 4EJVA 2H27A 3LA2A 1T39A 5L3FA 5DCFA 3TDUC 5AONA 2EB7A 2PMHA 3V5AA 1VFDA 4KI0E 3J7AO 1SMTA 5FFXA 4UUVA 2F7BA 2QWWA 3N6TA 2MC3A 1OPCA 2Z23A 4FE8A 3IB2A 5DEXA 2PBIA 1AIVA 2ISZA 4FEDA 4LZ5A 1L0OC 1QZYA 5CRYA 1ZG1A 5DDGA 5HOOA 4JSOA 3S2VA 4BDQA 3CUOA 1R23A 2OAZA 3QPTA 5H8HA 3F8MA 2THIA 4GCVA 3VFJA 4EF2A 5ISUA 4ND9A 1Y20A 1UIVA 5F6FA 1TLHB 3S9LC 3JW4A 3MZYA 3RQTA 3E6DA 3RTRA 4KMFA 2QUFA 2GWRA 5IT9Z 4MLQA 3T96B 4YMBA 3V7RA 4EDPA 3DM0A 3FX3A 2QS1A 1PBPA 4IRIA 3GUDA 3K0VA 4AIHA 3UGWA 2VODA 2Y0MA 3H3GA 3S9NC 1K6OA 2M8EA 5E1XA 2MD5A 3SXYA 4UVAA 1RYXA 2K02A 4RGXA 3LUYA 3PMXA 4IXAA 3CTAA 2H99A 1A8EA 2EWNA 5I2NA 2H5YA 3V4GA 3JYRA 2DS9A 3UORA 4LP2B 4Z7EA 2ZKZA 3TPAA 5LBQA 4FORA 2ZMEB 2Q2EA 1HKSA 1MKMA 4A5MA 4DIGA 2ONSA 1Z6RA 3REOA 4GRKA 2OK2A 4KCDA 1OQGA 4MQVA 4LQ5A 1R6ZA 2FNAA 1VR5A 5JI6A 2RN7A 2ZNTA 1LLSA 3T5XA 3ABTA 1Y4TA 3CLOA 1ON1A 1ZARA 2R3SA 5ILSA 2H09A 4FATA 1NL5A 1UQWA 2FA7A 4WXHA 1N0TA 2UXXA 4C0RA 1B9NA 2GAUA 1QQIA 3IORA 4IO6A 1SW2A 4HF0A 3N94A 5HDGA 1USSA 5KZTA 2W25A 1FCKA 2XUBA 3V83A 5CVUA 4XKRA 1A04A 4RGUA 1U5TB 3PD8A 1R5HA 4F1UA 3LAPA 1IN4A 1XHYA 4HF2A 2XD2A 2O6AA 3J81K 2WC2A 4A0ZA 1MDP1 1Q1HA 3BJAA 3WGGA 5FB2A 1ZIUA 4XKNA 4LB6B 3TTRA 2EJRA 1FLIA 2BEOA 5E18F 4HX4A 3CVGA 4TLLB 3CUQB 5DCMA 3SEXA 2YPRA 3TKYA 1SFXA 2BGCA 4Q30B 3ML6A 3S9EA 3ZMTA 2A69F 1FQDA 1US5A 4H8IA 3NRVA 3R26A 1LJ9A 1LGBC 1R1VA 1SD4A 2Q9TA 2V93A 2A3SA 3T9HB 2FRHA 3QXMA 1MY4A 3HRSA 4YKJA 3U9GA 4HCYA 2E7XA 5DUIA 4S05A 2F35A 4KYDA 2D21A 4H6DA 4EGYA 2VT3A 3NEUA 1B5JA 3KP6A 3JZJA 4U0YA 2JPBA 4YAHX 2R7DA 3OEKA 2XXWA 2PI0A 1FT9A 1DSNA 4WEPA 1BM9A 3EUHA 3TODA 4OYVA 4FHTA 3RN8A 4POWA 4YB5A 4YIIA 1B6HA 3UN6A 1NH7A 4EJWA 2CGPA 5HS7A 1UTBA 3PUWE 2Q0OA 3GXAA 3OO9A 2F2EA 1EZPA 5HDNA 2V3UA 1WKMA 2HDCA 3WG9A 1SD7A 5I58A 3BBRA 1B6AA 1B3EA 1Q35A 4GQOA 1M5FA 1LQ1A 1FBSA 1ZGJA 1H9TA 4TOZA 2O03A 5JTYB 4ON0A 3ONMA 1K79A 2BBYA 2H94A 3F22A 2O7IA 2ETHA 1FW0A 2DYXA 3H3ZA 2X7QA 3HN0A 4RXLA 1IF1A 2O7UA 3GEZA 4KYWA 2D3IA 1XGOA 3G3IA 2B65A 3COAC 4IHTA 4IHSA 4F1YA 1UCRA 2A6EF 3LAJA 5E20A 2D1VA 3OOAA 4MHGA 3U92A 2DO7A 4L9VA 2M30A 2VE9A 3OO7A 1OMIA 1EU8A 1S50A 4KHZE 1PUEE 1IUDA 4QF9A 2F34A 2YU3A 4RGSA 1O57A 3MZBA 4QFNA 5IKBA 3K9TA 1KQ9A 2P7VB 4O3BA 4H67A 3T8RA 2A5SA 2HYFA 4G8HA 1SD6A 3FXRA 2K86A 1Z7UA 2XX8A 5LGTA 1MDMA 4F39A 3IHUA 1D3KA 4N0BA 3OSRA 4I62A 1K78B 3H6TA 1MXZA 4ZYGA 1PB9A 2F5FA 1B52A 1JVXA 4NE4A 2ACJA 3PUYE 3JV9A 2PBWA 4KIGA 1W4MA 3DEUA 1MXVA 1U3EM 2X7PA 4M6XA 4MTDA 1AL3A 1PEBA 2EA2A 3PGFA 4PGHA 4HW8A 2UVGA 2XAFA 3LC8A 3A3CA 1H44A 3I59A 4ISUA 2R6GE 2QQ9A 3I6VA 4Q48A 4HOBA 3IL1B 4PZJA 3LSWA 4I02A 3GZ5A 1B32A 3FMSA 2CMOA 4IY6A 1MG1A 4QHQA 1PP8F 2NAZA 1O3TA 5TJJA 2XGXA 2VXZA 4XTCQ 1JHFA 5HM4B 5DYMA 3L00A 3R6SA 4Y13A 1TXFA 4N6PA 3KSJA 5H8QA 4IO3A 5JR3A 4F31B 2XAHA 4NB5A 4QLCU 4KN7X 4THIA 4ELPA 4OIPF 1MM6A 4KYEA 1HSTA 4HX7A 4CZZA 1VTNC 1VSOA 4R1HA 4ZE8A 1XOCA 5CM6A 4YZZA 4L5IA 5FLXK 3O2PE 5AE4A 3FVNA 3P9IA 1ZBMA 5LOMA 3F8BA 2PT2A 4NTLA 3TDZC 4ZZDA 2STWA 3FD3A 4ZDMA 1XSDA 1J7KA 4KPTA 3J80Z 3GO5A 1ZMGA 5I84A 4BHCA 2UVIA 3E3KA 2J5PA 4NQWA 2VHAA 3IR1A 1W7PB 1NNPA 1HXDA 4RGRA 4G68B 2R71A 5JK4A 1Z6TA 4AVPA 1IZ1A 3P7IA 5M2VA 3WE3A 4EXKA 1B7ZA 4M6YA 1TQMA 3CDHA 1QGPA 2F5DA 1GHCA 1A54A 3W15C 3HUGA 1LB8A 4M9ZA 3R4KA 1MY3A 3L2CA 1MY1A 1FYMA 2XAGA 1UB9A 5KCJB 3KOTA 3P7NA 4L18B 3DXJF 2PJPA 2OU2A 3JTHA 3K2ZA 1RNLA 3D4GA 1B5HA 1QW0A 4ECFA 4TLMB 1LDDA 5I2KA 4RK2A 3GXOA 4EGZA 1IN8A 1W5TA 4HTGA 3WU0A 1SYIA 2RC8A 2I6EA 2VOZA 4GLIA 3ZMVA 4OFJA 3QOPA 2O0YA 5AA1A 3TOAA 3KN8A 4ELQA 4G77A 3FV2A 1HKQA 3K1MA 2CWEA 2F78A 4FX0A 3MP1A 1QBJA 5FTIA 3ECRA 1Y3NA 1OIBA 4DCXA 2XXRA 4LMYA 2HQRA 1S6LA 4R73A 4R9GA 4LATA 1IXRC 5TPAA 3QP5A 1TBXA 1DPEA 1F9BA 3G3HA 2EFNA 3KE2A 3C36A 1YO5C 4EV0A 2DU9A 3SQNA 1ATGA 1LBBA 2L4MA 4EQ9A 4K3FA 4U88A 3RTFB 2O3FA 5D4RA 4PCQA 3BROA 4RYAA 4HLXA 2DTRA 2GA1A 5FD6A 4BQAA 4WEDA 4YICA 4N9IA 4I7HA 1G3WA 1A99A 4AB5A 3LFKA 1PP7U 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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