2ESNA

The crystal structure of probable transcriptional regulator pa0477 from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
301
structure length
299
Chain Sequence
PLLRRLDLNLLLVFDALYRHRNVGTAASELAISASAFSHALGRLRQGLDDELFLRQGNRMQPTQRAEHLAAAVAAALRALGEGLEEWRPFVPGQSQRTFVFAATDYTAFALLPPLMNRLQHSAPGVRLRLVNAERKLSVEALASGRIDFALGYDEEHERLPEGIQAHDWFADRYVVVARRDHPRLAGAPTLEGYLAERHAVVTPWNEDSGVIDRLLARSGLRREVAVQLPTVLAALFLAGSTDFLLTAPRHAARALAEAAGLALYPAPFDIPPYVLRLYSHVQGRDAHAWMIGQLKGLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structure of putative transcriptional regulator Pa0477 from Pseudomonas aeruginosa
rcsb
molecule keywords probable transcriptional regulator
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 89
structure length 299
sequence length 301
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-10-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 2esnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2esnA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2esnA03
2OAZA 2OZ6A 1DTGA 3J80K 3O9PA 2KJCA 5HS8A 1MM7A 3QYTA 2HCAA 2REJA 3EHUA 2DWHA 1QUIA 1ZTYA 1M5EA 2E1SA 3Q26A 4DE8A 2ZXJA 1POY1 4IO7A 2HKOA 2G7HA 5ICEA 2WWYA 3COAC 1SFUA 1HSLA 4ONYA 2WV0A 5IT3A 5DCFA 3CUQA 2R9JA 1C0WA 1JVXA 5TJJA 1REPC 2IEEA 3C18A 4F2QA 3B73A 1YIOA 1CE2A 5LGNA 3CUQB 1B9NA 4WXDA 4Q8RA 1QZYA 3VLVA 5H8HA 1R7JA 4Q30B 1Z05A 1KQ0A 1LEAA 2DQLA 1FNNA 1P4XA 2CMOA 1TTYA 4O3CA 1U5TC 5H8HB 5BPIA 3KJTA 5FLXK 3N97A 2QMXA 2I48A 1LFHA 4Y13A 3ZPLA 3TZAA 3CUQC 2KIMA 2EB7A 2E7WA 1AOVA 4PFTA 2A69F 2XD2A 3TEPA 2LF8A 3GF2A 3GXOA 2QQAA 5H6QA 2F34A 1PB8A 2EK5A 3C3WA 2F6GA 3DP8A 3F72A 1TLHB 2VOZA 2Y7IA 3CR9A 1B2HA 5DYMA 3CI8A 2O51A 1YG2A 4EVIA 3P7NA 1GHCA 2UYFA 3B02A 3HN0A 3W9WA 3I71A 1WDNA 2CQKA 3Q25A 2O84X 3CUOA 2F7AA 2MH9A 3L2CA 5ILVA 4K3FA 3OD7A 2VOOA 2Q8JA 2Z9OA 2E7XA 4GGGA 3UN6A 2O68A 1G3YA 4QWQA 3O2AA 3U93A 1LDJA 3BPXA 4KHZE 3ISPA 2ONKE 1RYOA 1BN5A 4MEYF 4H1XA 3SEVA 1OVTA 1ZJLA 1W7PA 3TQLA 1R36A 2VT3A 3BOQA 1PBQA 2LNBA 2M8CA 1BLFA 3IKTA 1W7PB 3OSRA 1J75A 3HRUA 4UV8A 3U1DA 2BBYA 4CXFA 1NNPA 2PVUA 1B3GA 3TPAA 4G68B 4XKPA 3HSTA 4FJPA 1ZLQA 4U0YA 3K0LA 4LATA 3GWZA 3K02A 3VOEA 1K78A 2IP2A 3JSPA 4QSEA 4R2BA 3J81K 2PBIA 1K78B 4ZEIA 4OFJA 3IOVA 1B7ZA 1MQGA 2H4IA 4G2ZA 3LSXA 2HS5A 2AS5F 1NNFA 2J5PA 5HS7A 4C0RA 5JTYA 4F3GA 1XN7A 4EJWA 3RT8A 2QS3A 4F3BA 1PEBA 3M8UA 4GXOA 1BP5A 2CFXA 4GFRA 2HQ0A 2Y7KA 4ZEFA 4ETSA 5JVTA 1T0KA 3WG9A 4E0XA 3H6UA 3OSQA 1SDXA 3H7MA 4HW0A 2GAUA 3LR1A 3TTRA 3KJ7A 1KU3A 1SBPA 1QULA 4GYIA 3H4ZA 2Z23A 4R6KA 3V83A 4Y15A 3H6VA 5TP9A 2VGQA 3CO7C 3KZGA 4GWOA 2ZNTA 4YFKF 3O3KA 2KLFA 3K0VA 1OQHA 2LF7A 1PDAA 5K1YA 3PUXE 4UXNA 3IJXB 3QP6A 3E97A 4RY1A 2R71A 1IUYA 1WSUA 1XVXA 3KFWX 3OOAA 5JI6A 3HIFA 4MBPA 2C6YA 2WTEA 4AB5A 1MZBA 4HZFA 3K4UA 4KR5A 3UORA 4KFQA 1A7LA 2MC3A 1NMUA 1XSXA 2YX4A 2DVZA 3TDZC 1P99A 2M1BA 1HW5A 4XLPF 2ZYKA 3IO4A 2GA1A 4RB3C 3ONMA 3IR1A 4HX7A 2AYSA 3OO8A 5CRYA 2HKXA 1QW0A 4GL0A 1JNFA 3EQ1A 1XOCA 3TTLA 4YICA 5J1DA 1VSOA 3KSJA 4OESA 1MPBA 2CGPA 2RF1A 5H6RA 4JBAA 4HAMA 2EA2A 5HDNA 5CBRA 1FBSA 3J7AO 1QZZA 2I6EA 4FEBA 1BIYA 3ZMZA 3G3KA 3SXYA 1NHAA 1Y4CA 1LFGA 3A3UA 3ILUB 4UUVA 2ZMBA 1R1NA 2EFPA 4IJAA 1W7PD 3IORA 4MTDA 4NE4A 3RPWA 1ULYA 1Q35A 1QGPA 4HTGA 1I1GA 2ZBKA 2VD3A 4EF2A 3MZHA 5DCMA 3PQJA 1WI9A 2NNNA 2FBHA 5KCJA 2PX1A 2G9WA 3I59B 4ESXA 3VEPA 3LSWA 4G8XA 2IW5A 5LRRA 4BDQA 4IRIA 5LHIA 4OINF 1G3WA 5DCMB 3WGHA 4ENMA 4POXA 1M5DA 1Y4TA 3G3GA 2EFQA 4U1OA 4WCGA 4EGZA 3JAMK 1RKMA 4G7HF 5A2QK 4KIGA 4ASNA 3KETA 2QQBA 3HHGA 1O64A 3WAEA 4OENA 5E1ZB 5JR3A 2YU3A 3SEXA 2NRAC 1W5TA 1XSVA 2JPBA 3ABTA 2QUFA 1MXVA 4A5MA 1Z1DA 1URDA 4BHCA 5HLGA 1TFAA 3E5UA 2UZKA 1J59A 2XXVA 1Y3NA 3PUWE 4OZ9A 4F22A 4ESBA 2VE9A 1LBBA 2TDXA 1DPPA 2I4CA 4IO3A 4EJOA 2NOOA 4OU0A 4G9YA 5L3EA 3B6TA 3U2RA 2X7PA 1HBXG 2DVCA 1B1HA 1IXHA 4CDGA 4KUMA 4A6DA 2P6SA 3OV8A 3DLNA 4EJVA 4S04A 3T0YA 1A04A 1LCFA 2COMA 2FEZA 1B9MA 2V3TA 2R7FA 1YW9A 2FMYA 4IRHA 2DI3A 4ESFA 1IITA 3WTVC 2A3SA 5LHGA 2H9BA 1II5A 4IO6A 1YTYA 1ZG3A 3EN3A 3GBAA 2GQQA 1UTBB 3UK4A 5FO5A 5D8KB 4PE5B 2H6CA 3IB1A 5B70A 1BIBA 1BC7C 1MJ9A 1B58A 3DP4A 1HW1A 3GZGA 5AA1A 2HEUA 2RKMA 4KYWA 3RI4A 4U21A 1FTMA 1N04A 2HTSA 1CB6A 3SETA 4KN7X 3HOSA 2VD2A 1U2WA 2XV4S 1N0TA 3MPLA 1B4AA 3F23A 1WODA 3N6UA 5BMZA 2OZUA 5ICFA 3MC2A 4F3PA 4I2OA 5D5UB 3MP8A 1OPCA 3CO6C 1PUEE 3K1MA 2H09A 2QPQA 2KRFA 3FF5A 4PZJA 1MY1A 2XXQA 3VE1B 3GZ6A 4QRZA 1BI2A 2VODA 4EM1A 1FOKA 3ECHA 1SW5A 4ZEBA 4IB2A 4PQJA 1ZGAA 5L3CA 3E6MA 3O6GA 3OEMA 2PMUA 3ULQB 4U22A 4GVOA 3N6TA 4TLMB 4BHBA 5BS6A 4P9FA 1SD6A 3TTNA 2HYGD 4AWXB 5FTHA 2HR3A 5D5VB 1PP7U 3GXAA 1NNKA 5I56A 2CYYA 4EF1A 3G73A 1MXYA 1MPCA 1S7AA 4YFNF 1R9QA 5I56B 4LP2B 3T9UA 5K2YA 4PDKA 4ZECA 1SQYA 1HSEA 1HW2A 4XKQA 4E0WA 1D9YA 1LAXA 3DPLC 1E2XA 3LAJA 3E6CC 1B1BA 2M87A 2JZYA 1B46A 4QFNA 1B7HA 4TOZA 2ZMEA 1CF7A 4RJZA 2Z99A 3NEUA 2GA2A 2RN7A 1MDQA 2ZMEB 1CF7B 2CW0F 1VTNC 2I0CA 4U23A 4H65A 3DV8A 3ZMVA 1Y20A 4QFKA 3GUDA 3R4KA 5DV5A 2OWTA 3CG3A 4LZ8A 2P1SA 1F9NA 2W7YA 2IT0A 2D21A 3KLNA 2DXYA 4F3SA 2RC8A 3VVFA 5HVQC 3EYIA 3UA8A 1SI1A 4DXBA 2V6CA 4HLYA 2ZYOA 1Q1KA 3W6JB 3L7WA 3MPKA 4PFYA 5AA3A 5KZTA 3MEXA 4O5VA 5D8LB 4UHTA 3T9HB 4IF4A 1US5A 2ZNZA 1VFDA 4HA8A 4OETA 3F8NA 3LWFA 2P7CB 1F9BA 4POWA 3AAFA 5E18F 1D8KA 3VFZA 4L9TA 4KN4X 5ISUA 4HV6A 4GF8A 2XKOA 3MVYA 2VBYA 3LFKA 4DLDA 3RKWA 2CZLA 1M5BA 1OLAA 3TMGA 3F8MA 1R1VA 4KMUX 5DDGA 3PU5A 1MXZA 3V8KA 5DVIA 3OEKA 4ZYGA 1URSA 5B7DA 2M30A 1B4ZA 1MS7A 4WXJA 1OYIA 4GLIA 1ZRCA 1JW4A 3C31A 1ZRDA 5HDGA 1PC3A 4LJZF 5FGMA 2UVGA 3BJ6A 2ISZA 2MH2A 4OIQF 5IT9K 3O6BB 4ENJA 2Z5UA 4OQOA 3FJGA 3TAJA 1US4A 5BPDA 3JV9A 4IY5A 2HZKA 2K4JA 2KIFA 2NVUB 3DKWA 4B8XA 5FFZA 1U78A 2NYXA 3CFZA 2A6HF 2XKPA 1FLIA 5CBSA 1R22A 4ND9A 1DOTA 1MH4A 5LGTA 4JWOA 2F5DA 2UVIA 2PN6A 4ZH4F 3V7RA 3R7XA 1G3TA 2UVHA 1CGPA 3LA2A 3ILTB 2ZYMA 3T5XA 1I1SA 3W15C 3DPTA 1S8NA 2O61A 4G8NA 2H6BA 5LBQA 3PQKA 3VODA 3C1DA 5J8CA 1GTKA 3M1EA 5F6FA 1F4KA 1RIOH 4PGHA 3TCHA 3LBSA 4C1TA 4MEXF 2XHDA 3R60A 4G7OF 1F1ZA 4ZZDA 5CVUA 3IKVA 3PMWA 3RYPA 3HTSB 4QHQA 3PPNA 4HX8A 1J1NA 1FYKA 1POTA 4QFOA 1N76A 3KP3A 3IOWA 1JXSA 3IOUA 5BQTA 1XHYA 4L9NA 3TO9A 4Q5SF 3V8LA 4RPOA 4HCYA 5D4SA 1XD7A 3FV2A 3GW2A 1NH7A 2A5SA 1B5JA 5HM4B 4HF2A 3U1OA 5ICGA 1LDDA 1U3EM 5FB2A 1B40A 1D9VA 1ODDA 3KZZA 3HHFA 4YKIA 3RPQA 3PPRA 1YPNA 3O28A 3OO7A 4OMBA 1IN6A 1YTVA 4H5GA 2OQGA 1FP2A 3Q9SA 4MNUA 1MDP1 3K1PA 2H27A 1N3XA 1J2XA 3E4RA 4UNOA 4L18B 1R5HA 1KYZA 3PD9A 4MQVA 4GCVA 1I6BA 4PFWA 1PP8F 2V3QA 2HGCA 1FYMA 1SD4A 2H94A 3IL1B 2STTA 3ZN0A 2ESNA 3Q9VA 2PBWA 3QUFA 5I58A 4OHNA 4HF1A 2ISYA 1YQAA 3C34A 5I58B 3IWZA 3KP7A 4O3BA 1DPUA 3D4GA 4I01A 3F6OA 3S4UA 3P9CA 4AD9A 1DUXC 2FF4A 1IN7A 1R1TA 4MTEA 3M9AA 3TTKA 1P6RA 5FFXA 4DZ1A 4LG0A 4H8JA 5CYVA 2XXUA 3ZKLA 3FGSA 2AIXA 1LB9A 3T9VA 2RINA 1ZLJA 4LG0B 1U5TA 1Z7UA 1NKXA 4H8IA 1Y1MA 2IVMA 5CLSA 2HFHA 1U5TB 3MW0A 2QWWA 1FTLA 1G6NA 4WEPA 4GRKA 4L17A 2XX7A 4NF8A 1EZOA 5HLIA 2EV5A 3WTSC 2VT2A 4ISUA 3FASA 1JVYA 4WKMA 4R6HA 4EJTA 1LAGE 1JEUA 4NF8B 5F64A 5EHSA 4ELQA 4PFUA 4O6JA 1XSDA 1TXFA 2EA4A 4BDOA 2XAGA 4BAYA 1XT8A 4ZE8A 2OU2A 1T39A 3N4MA 1B6HA 2Q88A 1W4MA 4BH9A 5CI5A 3VV5A 1VFEA 2XXRA 3WE2A 2VOPA 3RY3A 4LVQA 3EPEA 3KSXA 3LQQA 2AL4A 2DK8A 1O3RA 5ELVA 2XASA 3C36A 4UV9A 3G3HA 3F6VA 3WTTC 3MAMA 3V5AA 3B7DA 4UACA 2GXBA 3HTUA 4M9SA 4JQFA 3EETA 2DK5A 5CMCA 4CHUA 1EU8A 3H3GA 4DNCA 3FVKA 5CC2A 5F7VA 1FQEA 2Q89A 1TQIA 1JHFA 2I3VA 2L3DA 1PBPA 4ZEKA 4NEDA 1KQ9A 2HWVA 2CG4A 1D3KA 4JSOA 4AQ4A 1MM6A 4N07A 2ABHA 2GHBA 3SERA 2V1UA 2PT1A 3IRQA 2EWNA 2UXXA 1LB2A 3KEOA 4L5JA 2MBFA 5I2KA 3LC8A 3C7JA 3Q28A 1P92A 3MJNA 3QU6A 3TUSA 4EGYA 2FMLA 1GXQA 3WGGA 3MZBA 2XXXA 3BJOA 5JHUA 5K5QA 5I2KB 5ICCA 3T22A 4YKJA 4IY6A 4NF4A 3LUYA 4WEDA 4M73A 4FE8A 3HOTA 2QENA 2Q0OA 2X4HA 3BPVA 3H3ZA 3QPTA 2OCUA 3FVGA 4WWCA 2Y7RA 1B4HA 4DCXA 3HV1A 3SHFA 5ILUA 5E1XA 3SZPA 1MGTA 3C33A 3S2WA 4IO5A 4A2UA 4YKPA 1R6ZA 2LDUA 1Y1ZA 3HO7A 4S05A 1B3FA 2F6PA 2R6GE 2QL3A 4LB6B 3FJMA 5D5XB 1LDKB 4DDDA 2XUBA 1B51A 1MY0A 2FE3A 1N7WA 5JTYB 1Q1HA 4TV7A 5TPAA 2A5YB 2RVCA 2OZZA 4WX9A 3MP6A 3SFZA 4X9TA 1SFEA 3GLXA 4M6YA 4YU0A 4XBFA 3M8FA 5AA2A 3RIRA 4KFCA 2PT2A 4OVJA 1RUNA 3ZP5A 2K7LA 4YG2F 1X3UA 3WTWC 3KBRA 1RUOA 2RC7A 2EFWA 4ZYDA 4WK8F 3C4MA 2XAHA 1H44A 3KEIA 4I98B 3SKPA 1U8RA 1FX7A 2V79A 3ECOA 3I64A 5TP9B 1ZLKA 3S9EA 4FX0A 2ETHA 4R73A 1FQCA 2K86A 2FU4A 1S29A 4IPAA 2Y7WA 3BROA 4N9IA 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