2ESNA

The crystal structure of probable transcriptional regulator pa0477 from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
301
structure length
299
Chain Sequence
PLLRRLDLNLLLVFDALYRHRNVGTAASELAISASAFSHALGRLRQGLDDELFLRQGNRMQPTQRAEHLAAAVAAALRALGEGLEEWRPFVPGQSQRTFVFAATDYTAFALLPPLMNRLQHSAPGVRLRLVNAERKLSVEALASGRIDFALGYDEEHERLPEGIQAHDWFADRYVVVARRDHPRLAGAPTLEGYLAERHAVVTPWNEDSGVIDRLLARSGLRREVAVQLPTVLAALFLAGSTDFLLTAPRHAARALAEAAGLALYPAPFDIPPYVLRLYSHVQGRDAHAWMIGQLKGLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Pseudomonas aeruginosa
publication title The crystal structure of putative transcriptional regulator Pa0477 from Pseudomonas aeruginosa
rcsb
molecule keywords probable transcriptional regulator
total genus 89
structure length 299
sequence length 301
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-10-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 2esnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2esnA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2esnA03
3SESA 1DPRA 2KIFA 4PGHA 2DOJA 2O6AA 4OOIA 1QUIA 4H0EA 3O97A 2FNPA 2PBWA 3WTYC 4I8CA 3FMQA 2A5SA 3FVKA 4HX7A 3OENA 3MVWA 4N6PA 4PZJA 1TQMA 2CWEA 5F1QA 2HZKA 2Y7IA 3LR1A 1WWXA 2O7UA 4KYDA 3B6WA 1LAFE 3K2ZA 1BIAA 3QK6A 1ZLJA 1G3YA 4PFWA 1R00A 2F36A 1MY3A 3DXJF 2RCAA 1Y0UA 3ZMDA 4RGXA 2XAJA 1MGTA 3G7WA 4UUVA 1FOKA 1I6QA 2BGCA 3F11A 1OR7A 4KYEA 5HPQA 3PD8A 5JTYA 3CUQB 4RA1A 3HSTA 2BYVE 4EJVA 3J81Z 2XXQA 3EUHA 2UVIA 3N97A 2DE4A 2ONSA 2IA0A 4Q30B 4AIJA 1AIVA 1S8NA 1SD4A 1TXFA 1FQCA 3C32A 3SEYA 3CFZA 3Q25A 2LNBA 1DOTA 4YFKF 2F97A 2DVCA 1XB4A 4B09A 1MPCA 4AB5A 1P99A 1US5A 2XXRA 4F3PA 4IPAA 4MQVA 1QW0A 1KQ0A 1MJ9A 3IL2A 1B59A 2DTRA 5TU0A 4DXCA 4KIFA 4G7OF 1LFHA 3KP4A 1QPMA 3QRFF 3QPHA 5LLQA 3QAXA 3ABTA 3DFGA 4L9JA 5AONA 5F6FA 3PUYE 3ZQ7A 5K5QA 2OU2A 4KN4X 2NXOA 3KP2A 3V7SA 2PJPA 2PT2A 3WAEA 3CFLA 3I5UA 5BWJA 5D6EA 4O3CA 3MBPA 3IWFA 1XS5A 1XCBA 4UACA 4KFCA 4FORA 1D5VA 5CBSA 4CGZA 1D8KA 3MW0A 3V4GA 4KCDA 4UVAA 5HDKA 4KMUX 4HF1A 1JHFA 2ZNTA 3B02A 3I0TA 1U8RA 3LSWA 4ZEBA 3V8JA 4UXNA 2K4JA 1H44A 3MZBA 4XKRA 2H98A 4EQBA 1QUKA 4RB2C 3PGFA 2BE5F 5JHUA 1DTGA 4G8HA 4TV7A 4EJUA 1FNNA 2VP1A 5KZTA 1EZPA 3RPQA 2G93A 3IOVA 3F8NA 1RYXA 1MJAA 5KDTB 1Z05A 5DEXB 2V25A 1T98A 3VEPA 2ISZA 2LF7A 4HCWA 1ZG5A 2C6YA 4CYDA 2KJCA 4HV5A 4O3AA 3IWZA 1SFUA 2CW0F 1OLCA 5I2KA 4U23A 2XXXA 4RB1A 5DVJA 2OZ6A 2Y84A 4I0BA 3C18A 3P9CA 3DEUA 3BROA 4OESA 4I01A 4LK0F 2HEOA 3BFUA 4F2OA 4ZDMA 5CRYA 1MS7A 2HOEA 3WAFA 1EZOA 2O03A 2XAHA 1SI1A 2AL5A 4GQOA 3EHUA 5TPAA 3MPLA 2STWA 3U8QA 3K4UA 4ZE9A 1UIUA 2FMLA 5DV5A 4HX4A 1FQDA 4E70A 1L0OC 1JE8A 1AH5A 1DMBA 2V6CA 3C9HA 1US4A 3FV2A 3SDFA 4E0WA 1ZAOA 2ESNA 1ZIUA 5K1YA 1A8EA 4IJAA 2NNYA 2YU3A 1IXRC 2QMXA 5D5VB 4R72A 3RT8A 2DWAA 1FTJA 2NS0A 3CO6C 2MC3A 4M9XA 4CO8A 1XMKA 3HHHA 4N9HA 4XSZF 3TDZC 1MQGA 1XVYA 2RC8A 2EJRA 5CMMA 1XN7A 1ODDA 2ZFWA 1ZTYA 2LSOA 4H1XA 5ICQA 2O51A 3V7CA 4ELPA 3PMVA 3MVZA 2MH9A 2A68F 2QZ8A 5AA2D 1FZPB 4LLNA 2QM3A 5DD8A 3OO7A 2D5WA 4OMBA 4IY6A 2OK2A 5ILSA 3B73A 4OEUA 1UQWA 2XXIA 1P1NA 4DCYA 2HQNA 3FMSA 3KN3A 4NF5A 4O3BA 1ZGAA 4RK9A 1YPNA 3U92A 3TDUC 2IEEA 1HSTA 1OQHA 1L5TA 3W6JB 3O29A 4BYYA 4LUBA 1JXSA 3TCGA 3ULQB 2FNCA 1TQPA 5A2QK 3HO7A 1P4WA 3A3CA 4LZ8A 3NRVA 3FJ7A 4CXFA 3D5LA 1ZRDA 4KHZE 2OQRA 2ZO4A 2K86A 2DP8A 4WXHA 4FAJA 4ZZDA 3MJNA 4I09A 5F7VA 1LB2A 1KGSA 2QQBA 3IHUA 1REPC 5CVVA 1MQDA 2D1VA 1DPPA 4YMAA 2I48A 4GLIA 1YW9A 1O7TA 4BDOA 4M72A 4F39A 3IB0A 5CVIA 4L0YB 2VT3A 3SQNA 3K0VA 1ZBMA 2DXRA 2Y7KA 3N4MA 1A7LA 3DP6A 4U22A 4UHTA 1AWCA 2A5TB 4I98B 3W15C 4QSCA 2A3SA 1TBXA 3T93B 4P9UA 1B3EA 2R3SA 5BUUA 3I3VA 4EQ9A 4P55A 6PAXA 2Q0OA 1YYVA 2DBBA 2ZYNA 3S9MC 4LG0B 2UYEA 3PUVE 3ZS6A 4HYEA 4HV6A 1GVCA 4RAZA 3W9VA 5DTBA 1USSA 4XIGQ 1EZ9A 4KR5A 1JVYA 3VFZA 4G8XA 4F3SA 4ZYDA 4NHJA 4JQFA 3J80Z 3OEMA 5KVRA 4G2ZA 3IO6A 2Z22A 2EFWA 4ELRA 4K2EA 3H4ZA 1STZA 2HXWA 2PMUA 5D6FA 3KZGA 2YPRA 3VXCA 3K0LA 4F3BA 3SXYA 1YQAA 3I71A 3KEQA 3WGIA 3KETA 1Z91A 3BJOA 2QLZA 3HTSB 4PCQA 2NYXA 4WCGA 1O3RA 4YIFA 2Z9OA 3FIRA 3RJPA 4GXAA 4RXLA 3HSRA 1WI9A 3VVFA 4EV0A 4F31B 3L6GA 2PMSA 2F78A 3N6TA 5DD4A 1HKTA 1RUOA 3LA7A 3MFKA 2HDCA 2CG4A 1LEAA 2AIXA 1HKQA 3F8BA 1B5IA 1IITA 1NNPA 3T96B 3TO6A 1W5SA 2DPDA 4ENKA 1VSOA 3FXUA 2O61A 4LK1F 1B1XA 3GO5A 4G7HF 2HAUA 4POWA 3T8RA 3WU1B 1FCKA 5L3FA 4DLDA 3O2AA 1IIWA 3ZMTA 1M5BA 3D0SA 3QOPA 3MZYA 4S04A 3IRQA 5DCMB 4G68C 1R58A 3LQRA 2DE3A 4G68A 4OHNA 1ZG1A 1JVXA 1FSHA 4QSEA 3FM3A 2F7AA 2Y0MA 4BAYA 3P7NA 1J2XA 4L17A 2DFIA 4X48A 1Q1HA 2BBYA 2NVUB 3TFLA 3RYRA 2OZUA 3FGSA 4RS8A 2M45A 3T0YA 3VLVA 4NWDA 2VONA 1S7AA 3OMBA 3HOTA 4MNUA 1R1VA 1OYWA 2QS3A 3KP5A 4YG2F 3QU6A 4ZS9A 2MH2A 3SEWA 3PU5A 4PETA 4KIGA 1QZZA 2PT1A 2DQLA 4GD5A 3FJMA 4NF4A 1U5TC 5FGMA 3VVDA 5DYMA 2P7CB 1Z6TA 1U5TA 1M5DA 2PBIA 1SBPA 2O7IA 2QUFA 3QPTA 1NHAA 3E5QA 4WXDA 4KNYA 2XGXA 2EK5A 1SW4A 3S9NC 4LLLA 5DT6A 3QU3A 4ZZEA 3QAHA 4JSDA 2RQPA 1WODA 2D21A 3IORA 3A3UA 1XGOA 4GWOA 1DPEA 3K6UA 4M9SA 4U7DA 2DWHA 2UVGA 4KQPA 3ZMZA 3E9XA 4YFXF 2DT5A 2WV0A 1WSUA 1BTJA 4Z0IA 3MP8A 2FBIA 2K02A 1P6RA 3C33A 2HS5A 3O6HA 3J7AO 3H92A 3HRUA 2F7CA 1V4RA 4I02A 1IXCA 1R1UA 3MP6A 3PV0E 1VFEA 4RJZA 1SI0A 3LSFB 1JNFA 2QENA 5DUIA 1B7UA 1BM9A 3MZ1A 3EDPA 3RKWA 3TUSA 3TQNA 3TOAA 3GZ5A 5BPDA 3I6VA 3KCCA 4NTLA 1LJ9A 3AXFA 3EPEA 4IB2A 4UV8A 3TGNA 2EV0A 3WTUC 4M6YA 2AS5F 1FQBA 2P2AA 4YKIA 3JV9A 5AA4A 4HLYA 4C1TA 2CSOA 3ECRA 4MBPA 1DPUA 3A09A 1QVSA 4H65A 5H8NB 3DP8A 4THIA 2F5DA 1IN4A 2W84A 2E1CA 3E6DA 3GBAA 3Q9SA 4HQMA 3B6QA 1XSXA 3GYHX 1IXIA 2M30A 3LUYA 1DSNA 1B52A 2XXTA 3JTGA 1YTYA 4EGYA 1FTLA 4R74A 4B8XA 5JVTA 1RIOH 4BDLA 1QQIA 2EV6A 2P6TA 3HSEA 4P5OA 4EVIA 2ONRA 5K2XA 4YB5A 4OTEA 5DYHA 4ZYEA 3PPQA 3OO8A 1CGPA 3IOWA 4KT5C 1MQIA 5CVJA 4DNCA 5I57A 3TQLA 3TDJA 1MY0A 2GIVA 3RYPA 4LB5A 5H8HA 5AA2A 3R6SA 4H6DA 1L3LA 1YG2A 2M87A 2F35A 4YKPA 5ICCA 4RAYA 4EF2A 3MWMA 4WWCA 4EMSA 5TP9A 1F9BA 4M1VA 2GRVA 1KYWA 3SZTA 3JYRA 2PVUA 1D9VA 2A6HF 2FBKA 1OYIA 2Q2EA 4L0ZB 2RC7A 5A5XB 4JBAA 3IB1A 1UTBA 1XSVA 1MPDA 2XASA 5CJ9A 1TT1A 2OWTA 2Z99A 5LOMA 5L9MA 2DW4A 4R1HA 3TKYA 4MTEA 3WGGA 3OOPA 2UWMA 1USYE 2JPCA 2QWWA 4DE8A 5HM4B 2IP2A 3DLNA 4JBZA 3ROUA 1MDMB 3HIFA 3MZHA 4GXSB 1I6XA 2NUVA 1B7ZA 1UTHB 2VBXA 3G3FA 1QGPA 3T9XB 4Q4ZF 1IRGA 3KGCA 2G7HA 4CZZA 1Z7NE 4Q8RA 1LBBA 5J1DA 2ESHA 2PLYA 3Q27A 4PFTA 5CVRA 3CFXA 4EM1A 1BP5A 3O6IA 3SFZA 4I9DA 1I1GA 4F18A 5ICTA 1E2XA 2OBPA 5HS9A 4RYAA 2I3WA 3ZP5A 3U72A 1LGBC 4MGRA 2ONKE 4NF6A 5DVIA 4Y17A 1FYKA 3F3XA 1F9NA 1J0RA 3HRSA 4ISUA 3K6XA 1IN5A 3M3FA 4U4XA 3BJ6A 4CICA 2Q9TA 2VE9A 1B5JA 3CUQC 3CUQA 2ZMEB 3OEKA 5ICFA 2RC9A 2M5WA 2CO5A 4M74A 2LF8A 3E6MA 3TZAA 4U0YA 4GYIA 2CQKA 3REOA 3O9PA 3UP9A 1OLAA 1UHWA 1HW2A 4ESXA 3BBRA 3JSPA 4S05A 1QKAA 2XX8A 5CMKA 4WK8F 3JAMK 1F1ZA 4G77A 4LA9A 1D3KA 1H9TA 5I58A 1BC8C 4Z7EA 2HQ0A 2Z8EA 2XAFA 1J5YA 1GVJA 2A5YB 3I64A 1H43A 3GLBA 2X4HA 2GQQA 4RGSA 1MQHA 3GVAA 1J1NA 4AD9A 2O6GE 1M5EA 5B7DA 2VN2A 1Y3PA 2XIGA 1BBYA 4BDNA 4F2QA 2WWYA 1OYYA 2X7QA 3N6UA 1D8JA 4WXJA 5I84A 2PQ8A 1R1NA 1UB9A 4DXUA 2QRYA 4YICA 4IVNA 5BPIA 4Q5TA 3PPNA 3CTAA 1NNTA 1DUXC 4ASNA 4LATA 3DQVC 1PB9A 4JK1X 5LEJA 2GHBA 1H9GA 4O3MA 1IQ7A 3HOSA 4ESWA 5FB2A 4F7ZA 1U2WA 2EFQA 5ILVA 2OLBA 1CF7A 4A6EA 5EHMA 5I59B 1EH8A 2DK8A 1A04A 2EV5A 4BQAA 3K69A 2H5YA 4IHTA 3N26A 1FTKA 3B6TA 3OO9A 2DVZA 4FJPA 5DEXA 3BKIB 1HBXG 3PUXE 2FMYA 5D5UB 3CLOA 5H8FA 1XGNA 1AMFA 4OVJA 3RGYA 3VVEA 5EEGA 3DKWA 3BFTA 2DPUA 3V7RA 3DF8A 1JW5A 1LDJA 1K6OA 1QULA 4K3FA 1WQ2A 4ZYGA 3F8FA 3NQOA 3IAZA 1POY1 3KFWX 3VODA 1Y20A 1PP8F 4UV9A 2GA1A 1LCTA 2VODA 2UYFA 4JDFA 3ILUB 4IXAA 3IR1A 2Y7WA 1MZBA 2YPNA 3OOAA 1KWHA 4XBFA 4QWQA 4KA4A 2O8XA 3JSOA 1QUJA 1LAHE 2RINA 5CMCA 2HTSA 4POXA 3FX3A 3U2RA 2F5EA 3JZJA 2L54A 5JTYB 1B5HA 3MAJA 3B7DA 3PD9A 2M8EA 2H94A 1FY7A 2V79A 3CO7C 5FLXK 1KYZA 2FU4A 4O6JA 3K2DA 3R0AA 5HDNA 1FYMA 3T9VA 5TRDA 1IXGA 5DCFA 3C4MA 3MAMA 4BDMA 1XSDA 4GF8A 3GBBA 1LBCA 3DV8A 4GIZA 3RY3A 1Q1KA 4OIPF 4QFPA 4R73A 3H6UA 2DQVA 1S3JA 4QFLA 1PC3A 5B70A 2W57A 5FFXA 4Y15A 4WKMA 4HF2A 4QRZA 1K79A 3BPXA 4GYGA 3TO7A 1LQ1A 3PUWE 5A2QZ 4QLCU 2HFHA 1H3DA 2RNJA 1FQEA 4GRKA 1IW7F 1D4NA 4G6QA 4BHBA 4OINF 4R9GA 2KRFA 2EB7A 1U78A 5ILUA 2QBYA 3GZGA 4OERA 3GW2A 4EF1A 1ZGJA 1Q35A 1OKRA 3ZSFA 5D8LB 2XROA 3FZVA 2HWVA 3FVNA 2MBFA 1NNFA 1FBSA 2OBGA 1N76A 4MF3A 2GWRA 1SMYF 5KCJB 3D4CA 3K1MA 4WEPA 2P5KA 1B7HA 2XXPA 1P4XA 2VBZA 1BN5A 3T22A 3CI8A 5E8IA 4UA8A 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