2ESNA

The crystal structure of probable transcriptional regulator pa0477 from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
301
structure length
299
Chain Sequence
PLLRRLDLNLLLVFDALYRHRNVGTAASELAISASAFSHALGRLRQGLDDELFLRQGNRMQPTQRAEHLAAAVAAALRALGEGLEEWRPFVPGQSQRTFVFAATDYTAFALLPPLMNRLQHSAPGVRLRLVNAERKLSVEALASGRIDFALGYDEEHERLPEGIQAHDWFADRYVVVARRDHPRLAGAPTLEGYLAERHAVVTPWNEDSGVIDRLLARSGLRREVAVQLPTVLAALFLAGSTDFLLTAPRHAARALAEAAGLALYPAPFDIPPYVLRLYSHVQGRDAHAWMIGQLKGLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The crystal structure of putative transcriptional regulator Pa0477 from Pseudomonas aeruginosa
rcsb
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule keywords probable transcriptional regulator
total genus 89
structure length 299
sequence length 301
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-10-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 2esnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2esnA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2esnA03
4BH9A 2XUBA 5J8FA 4NWDA 4IRHA 2A69F 3W15C 3OXNA 3KOSA 2FOKA 3B6QA 3RDIA 3U93A 3P9CA 5ITOA 3TDZC 3DEUA 2QYOA 3FVGA 4KFCA 2L02A 2EFNA 3LAJA 3QAXA 3MP1A 2EA4A 3ZN1A 2XVCA 3BFUA 3D4CA 4ZEFA 1A55A 1MD0A 3T9XB 3ZQ7A 2P4WA 4EJVA 3O29A 3O66A 4G6DA 5CRYA 1O3SA 2I58A 1MDQA 3HPIA 2LF7A 1T39A 2O1LA 2DYXA 3CFLA 4IF4A 3OEKA 3I64A 2YPRA 1J75A 2A61A 2DOJA 3BOQA 3IR1A 2UVJA 3R26A 1ZHFA 2P6SA 3CRBA 1OKRA 4PFUA 1GV8A 1O7TA 4JWYA 5L3DA 1UIVA 1NH8A 3G73A 3MVXA 1I27A 4MF3A 2QUFA 5HOOA 3J81K 3EQLF 4JDFA 4P0IA 2M8CA 2HYFA 4RY1A 5L9SA 3QP5A 3VOEA 2RGVA 1A40A 1O7LA 1UTHB 3GWZA 3M1EA 2P5LC 2THIA 2KIFA 1OLCA 2A5SA 3M3KA 5JTYA 1POY1 2UVHA 1KU2A 3MBPA 4I98B 4AIHA 4IGTA 4F3BA 4KHZE 1LJ9A 5K2YA 5IAIA 1QJMA 4XBFA 2QQAA 1P1NA 2H6CA 4ASNA 2EJRA 1Y4CA 5JK4A 3U2RA 4NMYA 3IORA 1B1XA 2KJBA 1PB8A 2RC8A 4A5MA 1NNKA 4PE5B 3IOVA 5JI6A 2G93A 1I6BA 2XXWA 3PMVA 2PG4A 3QPTA 1S7YA 3IC7A 2OLBA 3MWBA 4H5GA 1LDJA 3RQTA 3VXBA 4BYYA 2FQ3A 1DMBA 1JE8A 1OMPA 4IO2A 2KLFA 4DIGA 4OMBA 4LUBA 2QQBA 2F5FA 5ICTA 2FSWA 3PQJA 3V4GA 1LDKB 4WEPA 1MXYA 4AD9A 3GVAA 2F35A 2ALUA 1N3WA 2FA5A 3IL2A 3FWEA 2DXYA 3ZS6A 3FVNA 4H67A 5JHUA 4JWOA 4POXA 4DZ1A 4TV7A 1D5VA 4JB7A 3E13X 1B9JA 2IA1A 3JTGA 4DXBA 5ICQA 2V3TA 3RGYA 2H94A 1MXVA 4LB6B 1M5DA 2HTSA 3T9HB 1SD7A 4A6DA 1DTGA 3VVDA 3E6DA 3TO6A 4A2UA 5BMZA 4DDDA 3V8JA 4F39A 3I3VA 1XGOA 3IRRA 3P7IA 4UV9A 1ZARA 4JBAA 3I53A 1UQWA 4IO5A 1ZG5A 5CMBA 3F8NA 1EZOA 3FATA 3H06B 4EXLA 3GFJA 5D8KB 1LB8A 3RYRA 1OYWA 2OAZA 1XOCA 3OD7A 2K4BA 6PAXA 4KICA 3SQNA 1BC7C 4F18A 3DQVC 4R72A 3HV1A 2DWJA 2MH2A 5BPDA 5KZTA 3MP8A 1TQMA 2I0BA 2O6AA 3HSRA 3WTWC 1BKAA 2W7YA 1RUNA 5L3FA 3EHTA 3K0LA 1T0FA 2JT1A 2ZCWA 3VB2A 1MPBA 1H9TA 4YFKF 4FJPA 3T93B 3I6VA 1WVJA 2F5CA 3SEVA 1Y0UA 2UWMA 1P1WA 1PB7A 3L00A 1V4RA 4HF0A 3K1MA 1J2XA 1MQIA 4N0BA 1NHAA 1STZA 4LA9A 3RUMA 2OBGA 1MY1A 4OWDA 3V7CA 1XSDA 1MQDA 3O3KA 4GF8A 2NWJA 4EV0A 4GD5A 3ELKA 4GFRA 2E7WA 4AQ4A 1FBQA 2R71A 4G9YA 3MCZA 3L9FA 3DPLC 5FLXK 1O64A 1HW5A 3ECRA 3S9MC 2K4JA 1R5GA 3MWMA 5HLIA 4UACA 1LQ1A 4LATA 4K3FA 4UVAA 1IUDA 1AL3A 1YQAA 1SVXB 4FORA 3HHFA 2HEUA 4ELPA 4KMFA 1JHHA 3JAMZ 1TQPA 1LDDA 4HDVA 4Z2YA 4LJZF 3LQRA 5CVUA 4HW8A 3B73A 4N13A 1H9GA 3VE1B 1MQHA 2PLYA 1URDA 3GO5A 1ZRCA 5ED4A 2Q89A 2F7AA 5AA4A 5F6FA 2WWYA 3EYYA 3K9TA 1G3SA 5D5WB 4RGXA 1FT9A 1MZBA 4XLPF 2GXGA 1S6LA 4M73A 4PFTA 1MY3A 4DCXA 2BE5F 3KP3A 3PUXE 2A3SA 2UXXA 1T6SA 4B8XA 3TDJA 1N7XA 4KNYA 2DS9A 5ELVA 2MC3A 2Q2AA 3L6GA 4ENMA 3GLBA 3KEIA 4L0YB 2ZYMA 1Z91A 1W5SA 3U1DA 4H8JA 4RGSA 2X0LA 2Z8FA 3LUYA 4LP2B 1QUKA 2HKXA 2XD3A 2RNJA 5A2QK 1GGGA 3R6UA 1GTKA 3BFTA 3SEYA 3Q5FA 5AA4B 1KWHA 4RGRA 3R6SA 4UVCA 3TCGA 4PFYA 4DLDA 4AIKA 1I6QA 4XKPA 3WTZA 1F9NA 1DPEA 4U2RA 3W6KB 1BP5A 3JW4A 2DO7A 3ZMVA 2ADUA 2BYVE 2VONA 4Q48A 2EB7A 3H6UA 3KP5A 4E0XA 2QRYA 3M9AA 1FTJA 3ABTA 3HSTA 1MDMA 4HZFA 4HQMA 5J1DA 2Z99A 4LQ5A 1ZKBA 1QZZA 3IRQA 2XAGA 3AAFA 4A5NA 1UTBA 5EHMA 3LC8A 5H6QA 2Z5UA 1B3FA 1LGBC 2O1MA 3MVWA 2AYSA 2JTVA 1GHCA 3SDFA 4LGWA 2XGXA 1HKSA 5IT9Z 5I84A 1LEBA 1TW2A 1U3EM 1P1UA 2HQRA 3QU3A 3TOBA 1PP8F 1VE4A 4RPOA 4WKMA 4F31B 3USDA 2XASA 5D5VB 1IN4A 5FHNA 3REOA 4HS7A 3LA2A 1Y4TA 4NF5A 5I59A 2GHBA 4R9FA 2DE3A 4S05A 1URGA 3K69A 2CQKA 1B6AA 3PPQA 2DI3A 4ZYEA 4WWCA 1V3FA 1IXIA 1TXFA 3M8UA 2V79A 1ZN2A 4OHNA 3HRUA 1FQBA 3LSXA 4KI0E 2COMA 5FO5A 4ZYGA 2DWHA 1OMIA 2GHAA 1II5A 2ZFWA 4XLNF 1IXSB 3F8BA 5H6RA 3KETA 3GBAA 3H6TA 4NF5B 5I59B 1QZYA 1QQIA 3S4UA 2GA2A 1MM7A 2XXRA 3VLUA 1YS7A 1CF7A 1B6HA 2DU9A 1SI1A 3S2VA 4EXKA 4QWQA 2E1SA 5A5XA 3ZMSA 5K1YA 5HDKA 3E5XA 2EFPA 4HX4A 1EH8A 3BJ6A 2J5OA 1I1SA 1W7PB 3RLFE 3TYHA 4YZZA 4HV5A 2P0SA 4OVJA 4YICA 5B7DA 5KDTA 2O7UA 2QL3A 2OWTA 4LG0A 2NRAC 5D5XB 1NKXA 2F97A 4BDRA 1ULYA 3PPRA 4I7HA 2CMOA 3KZGA 4WK8F 3PGFA 2LSOA 2GQQA 3KEOA 1B52A 2EV6A 3D4GA 4R1HA 4ESFA 1CF7B 3R0AA 3P9KA 3LSFB 1FTKA 4K2EA 1LLSA 2L3DA 5H8FA 3ML6A 3WE3A 2W24A 3I71A 3IO4A 1JEVA 4RB3C 3K1NA 4ZDMA 1FQDA 3CFXA 4QFOA 3FASA 2VD3A 4OENA 3I59A 1LEAA 4YB6A 1U6GA 2OZ6A 3SFZA 3DP6A 4I0BA 3KG2A 5HM4B 1USYE 2H4IA 1QUIA 4RS8A 3DF8A 3H7MA 3WAEA 2F5XA 2XXVA 1B3HA 4LG0B 2CGPA 2ONKE 3MW0A 2NAZA 3SKPA 4ISUA 1XGNA 3ILUB 1SFEA 4KIFA 2ZMEA 3C18A 2IJLA 4G7ZF 1YLFA 3F72A 4WEDA 5I56B 5H8FB 3GXAA 5AA3A 4JK1X 2F5EA 2LDUA 3U8QA 4RB0A 2PX1A 2FRHA 2O0YA 4A12A 3R4KA 3I59B 1IQ7A 4JBZA 2F8DA 3J80Z 1TFDA 1YTVA 4R6YA 1BI3A 1JW1A 3DLNA 3PUZE 4H0EA 2XAJA 2O6GE 3IK6B 4F2QA 1B0LA 3C1DA 3OO9A 2EV0A 5CVIA 5F1RA 2Q2CA 3KN3A 4HBLA 4DE8A 1B2HA 2ZYNA 3GF2A 1D9VA 5H8SA 1KYZA 3I5UA 1OQGA 3IJOB 1WWXA 2XX9A 3C32A 1TWYA 3ULQB 4QFKA 3O97A 4ESXA 2ONSA 1IUYA 2A6HF 1PDAA 2OJTA 4HCWA 5E17F 2O84X 2PMHA 2I48A 1FPQA 4UA8A 3C31A 1MXZA 4OETA 5KVRA 4LVQA 5D6FA 4BDQA 2A5TA 3IO6A 4Z0IA 1R22A 1IN7A 1L3LA 5ICCA 2K27A 2A6EF 2W85A 5E1ZB 2FA7A 4THIA 3V89B 1YYVA 1B46A 2V3UA 3WAFA 1B1HA 4EM0B 3E97A 1N3XA 2VC0A 2WKYA 3DXJF 1HQCA 4OEUA 2E1NA 3GFLA 4HV6A 4LQ2A 4I2OA 4G6QA 3C3WA 4G8HA 1SFUA 4MTEA 1HSEA 5DVFA 3TTRA 2Z23A 3MQ0A 1IZ1A 4L9JA 3ZPLA 4L0ZB 4RXLA 4Y13A 1D3YA 4M74A 3JSOA 1REPC 1T2KA 2V1UA 4G7OF 5LGTA 1J9IA 4L9TA 3I58A 2A5TB 4LFUA 3QP6A 4H0WA 4AIJA 2EFQA 3ZMZA 2EV5A 1KA8A 2V9VA 5HPQA 1G4DA 2X7PA 5HDNA 4HF1A 1AOYA 3TUSA 1DUXC 4IVNA 3MZ1A 4C1UA 1ZGJA 3F8CA 4R6HA 2VE8A 1HSLA 3H6VA 2IA0A 4ZECA 4KYSA 2DLLA 1FQAA 1MY0A 1MXWA 2GZWA 1B3GA 1SYIA 4QFNA 4MEYF 3UP9A 2W84A 2XROA 4QFLA 3T5XA 2V25A 3BKIB 2GIVA 1US5A 4L5IA 4JQFA 3L09A 2HEOA 3CTAA 1A54A 3TTKA 1AWCA 1IN8A 3TTMA 2HGCA 1O7FA 3M8FA 3WTVC 2FNAA 5I58A 2ZYOA 3QPHA 2M1BA 3HOSA 1P99A 1TNTA 1MXXA 1N84A 3K2ZA 1HBXG 1S9TA 1MS7A 2EA2A 4I09A 5ITPA 5I2NA 2ANJA 5FGMA 4L9VA 3JSPA 3OO8A 5D8LB 5LHIA 1VTNC 4ETSA 1FNNA 2L54A 3IL1B 4RAZA 4ZYHA 3HRMA 2XV4S 4BLAA 2PBWA 5ICFA 4FEDA 2O7IA 3LSWA 3WE2A 1FYMA 2F6GA 4N9IA 1XN7A 3RPWA 2CSOA 4QSEA 1I6AA 1LBCA 1RYXA 2Y84A 2H6BA 4H65A 1B7ZA 1LAFE 1BIAA 4G8MA 3ZN0A 4NF8A 2RCBA 1TT1A 1Z6RA 2G9WA 1RI7A 2ZYKA 4IO4A 3MPKA 2D45A 3BJAA 4UNOA 2HAUA 2HQNA 1B05A 4M6YA 3WTYC 1R1UA 1PBQA 2ISZA 3ZMDA 4MQVA 2A07F 2E7XA 2PBIA 4WXDA 2GRVA 3FJMA 4YKKA 4WX9A 1JXSA 1BOAA 4KMUX 4U88A 1BJAA 5H20A 1R1NA 4RAYA 2HZTA 2J5PA 2OZUA 5LLQA 3IB0A 3VDFA 1Z7ME 3G3IA 4U1ZA 1FCKA 4NF8B 2F78A 1LNWA 4RNSA 4X1BA 3TDUC 1MY2A 2M5WA 3HTUA 1B7UA 2DE2A 4BDOA 1X3UA 3E4RA 5E18F 3DELB 3B02A 1Y3NA 4IHTA 1IXHA 1N76A 3LSLA 5L3GA 4P9UA 1DDNA 1E2XA 2QS1A 4KFQA 4ONYA 2LKPA 1TFAA 3FF5A 2H25A 3OELA 5K5QA 3H03A 1PDNC 5LBQA 3QRFF 3GBBA 4ELRA 5L9MA 1Y20A 4OINF 2P7VB 4G68C 3T22A 2BGCA 4ZE9A 2DVZA 3GLXA 2EFWA 5ICGA 5JTYB 1SBPA 2VT2A 1JHFA 1NNFA 2MBFA 4G68A 4NF4A 5HLHA 4O5VA 1F4KA 3WGGA 1USTA 1WODA 1ZG1A 2RCAA 2OQGA 1SMTA 4ZZEA 2HZLA 4F1UA 4OFOA 3MJNA 4MLVA 4XKRA 3G7WA 2TDXA 2YX7A 3IKVA 3UN6A 1BIBA 2Z33A 1H43A 3UIFA 4U0WA 4OFJA 4UHTA 3WTSC 4KDPA 4U0YA 3PD9A 2Q0OA 4AB6A 3U92A 3KSXA 3PMXA 2FMLA 2ZNYA 1SYHA 2HR3A 4YU0A 4P0GA 3T8RA 2F6PA 1MM6A 2OK2A 4NF4B 2G7UA 2AL5A 4L18B 3PD8A 1DP7P 1BLFA 1E17A 4Q0CA 3CG3A 4U22A 4IHSA 3DKWA 4IJAA 2Q8JA 5J8CA 2V1XA 5E8IA 4F3GA 4C0RA 3OOPA 2RQPA 1I69A 4Q30B 4BDMA 3MAJA 2XXTA 4RK2A 3LSTA 2QS3A 3LWFA 1R58A 4EQQA 2IA4A 1C0WA 4HOBA 1AIVA 3KFMA 3TODA 3LQQA 3T0YA 5LEKA 3N97A 1BTJA 5E20A 2UYEA 4U0VA 2Z9OA 2KJCA 3GZ5A 1AMFA 4FIMA 2ZXTA 3KLOA 1G6NA 3K4UA 1SQYA 1OYIA 4PGGA 1U78A 2VBZA 2D1VA 1FW0A 2UYFA 3J81Z 3G3ZA 1MPCA 1J1NA 1P4AA 5D4SA 3IWZA 3TEPA 3SEWA 1M5FA 2JPBA 1OPCA 3PPPA 4U4XA 1J7KA 2RVCA 1FTMA 2P5VA 2QJEA 3VFJA 3MFKA 3D5LA 1MGTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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