2ESNA

The crystal structure of probable transcriptional regulator pa0477 from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
301
structure length
299
Chain Sequence
PLLRRLDLNLLLVFDALYRHRNVGTAASELAISASAFSHALGRLRQGLDDELFLRQGNRMQPTQRAEHLAAAVAAALRALGEGLEEWRPFVPGQSQRTFVFAATDYTAFALLPPLMNRLQHSAPGVRLRLVNAERKLSVEALASGRIDFALGYDEEHERLPEGIQAHDWFADRYVVVARRDHPRLAGAPTLEGYLAERHAVVTPWNEDSGVIDRLLARSGLRREVAVQLPTVLAALFLAGSTDFLLTAPRHAARALAEAAGLALYPAPFDIPPYVLRLYSHVQGRDAHAWMIGQLKGLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structure of putative transcriptional regulator Pa0477 from Pseudomonas aeruginosa
rcsb
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule keywords probable transcriptional regulator
total genus 89
structure length 299
sequence length 301
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-10-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 2esnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2esnA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2esnA03
2D45A 1JEUA 4X1DA 1LDDA 3T9VA 1MQHA 2FU4A 1DPPA 3TTNA 3E9XA 4EGYA 2V84A 4HDVA 4A0YA 3DEUA 4RNSA 4LONB 3TGNA 4XSXF 4EQ9A 5FHNA 2W85A 2Z99A 1RI7A 3T96B 3QRFF 3BROA 4M9ZA 3GLBA 4IPAA 1B46A 2EFOA 2I49A 2F5EA 4A6DA 4IO4A 3IJOB 5L3DA 3QU3A 1JW1A 3OEKA 4KHZE 5DYHA 4XBFA 2L4AA 1B3GA 5HLHA 5CC2A 1K78A 2OK2A 5I2NB 4N9HA 2RKHA 4EXLA 4LFUA 5D5WB 4O3CA 5FFXA 5BQTA 1U6GA 4JXIA 2Y7RA 1O57A 1IEJA 3DLNA 3QAHA 1MY0A 3QK6A 1HW5A 3I5UA 1J9IA 5CVVA 4U7BA 1T0FA 1ANFA 5I59A 3DFGA 5KCJA 3P7IA 3LR1A 3RJPA 4RGSA 1UIUA 3PPRA 4NF4B 4HCWA 4THIA 1B7HA 1BI3A 2NVUB 3N94A 3F8FA 3H6WA 2K4BA 1WWXA 5DD8A 1P99A 1BTJA 5E1XA 3SKPA 3PUXE 3BFUA 4H0EA 3RN8A 1QVSA 5HLIA 1O3TA 3MQ9A 3A09A 1PDNC 3O6GA 1D4NA 4LUBA 4XXUA 4ELQA 3M3KA 4OTEA 1MG1A 4XIGQ 1SBPA 1S7YA 2DTRA 4AD9A 4R9GA 1GVJA 4OETA 1TQIA 2M87A 3I4PA 5ICEA 1DUXC 2GA1A 5F7VA 3R6UA 3GXOA 4IJAA 3I58A 2B65A 1AH5A 3IRQA 2O51A 4MBPA 2ETHA 3T9HB 4EJVA 2Z3YA 1REPC 1BI1A 1LNWA 3F23A 2F8DA 1TT1A 3PPOA 3VB2A 2XRNA 1VFEA 1W5TA 4OYVA 3PFIA 3JAMK 2I3VA 4XKQA 1GV8A 2GXGA 1IN5A 5L9OA 4UNOA 2QS2A 3WGHA 1P1UA 4Q0CA 3I6VA 5ICFA 2LF7A 4O5VA 1Z9CA 5B70A 1IUYA 4LK0F 1A54A 4G7OF 1S7OA 5AIQA 2OQGA 2O7UA 5I58A 3VVDA 3F8BA 5F1QA 1JNFA 3V4GA 3TOAA 3MVZA 3TCHA 1PB7A 2A5TA 5J8CA 4BH9A 1KA8A 3RUMA 2ACJA 5JR3A 4LLGF 5AA3A 4TV7A 5D5VB 4OOIA 5ERIA 1WQ2A 2VC1A 3E6BA 1ZLKA 3LBSA 4IGTA 3C4MA 4BDLA 4KIBA 4P9UA 1BJAA 1YW9A 1KU9A 1MQJA 2GHAA 3E3VA 1ZHFA 3BPVA 2I6EA 1ZU0A 4NWCA 1SMTA 1LSTA 1G3WA 1E2XA 1A55A 3KCCA 1BI2A 5E20A 5DVIA 1IXRC 1V4RA 5ICGA 1MKMA 2RNJA 2Y7IA 1U5TA 3OENA 3TODA 5DVJA 1D9YA 3DKWA 4Q5TA 2REJA 4RPOA 1URDA 2XXYA 3ECRA 4KFCA 4KYSA 4DXUA 1Y3QA 2STTA 3K01A 1FOKA 2FBIA 5ICTA 4A2UA 3O6HA 4HAMA 1NMUA 1LAGE 3V7CA 1LCTA 3IKVA 2Y7PA 4LB6B 1P1NA 3ECHA 3AAFA 2DLLA 2C6YA 2HCAA 2YPRA 1OVBA 4F3GA 5BPDA 3WTTC 4IO7A 4DXBA 4POXA 1G4DA 3FUZA 3F6OA 3G3GA 3V8XB 4EJUA 3EYIA 2E1SA 3KETA 4EVIA 3GX4X 2RC4A 4WF2A 3PUVE 1FY7A 3C7JA 3MZ1A 3B6TA 3H4ZA 4P11A 4G7HF 3PMXA 4G77A 3KP6A 3RT6B 2M8CA 1R1UA 4Z7EA 2JSCA 4BXUA 2OCUA 3V7SA 4GOTA 3CRBA 4HF1A 2DO7A 4IHSA 4N9IA 3CFLA 1XMKA 3WODF 4FORA 4OMBA 2QENA 3S9LC 4B8XA 5EEGA 3FXRA 3K69A 3L00A 5LRRA 2VODA 2PX1A 1J2XA 2NNYA 1GXPA 2X0LA 4L18B 3WTZA 2HKXA 3WTXC 4H0WA 2QQ9A 4ZEBA 3L9FA 2AYSA 4U2RA 2GWRA 2HTJA 2VP1A 1HKTA 4I0BA 2DSFA 4HYEA 3LSFB 2ONRA 4GYGA 2F36A 1FBSA 2P6SA 3O29A 2DWJA 3VLWA 3CG3A 1IRGA 3L2CA 1MXYA 2QQAA 4U21A 3KP5A 1JE8A 1B1XA 4GLIA 4ZZDA 4ND9A 4YB5A 3IJXB 2FRHA 3QPHA 2CYYA 3S9NC 2Y84A 4G68A 1GHCA 1B59A 2A69F 3V8LA 2G29A 2YX7A 2ZYKA 4H67A 3I53A 4KYEA 2RC7A 2OD5A 5TU0A 1POY1 3KFMA 2QS3A 3FMSA 3ZN0A 5L3FA 1WDNA 5DCMB 2HOEA 2DPDA 2O69A 1MDMA 4ESWA 1MDQA 5DYMA 4HW8A 4R75A 3BPXA 3OO9A 4CHUA 1MQDA 5H8NB 3ISPA 2DFIA 3MVXA 2O68A 4E70A 3WU1B 3FM3A 4IY5A 2EFNA 3HIFA 1OVTA 5DDGA 5EYFA 1XOCA 5ITOA 4JDFA 4K3FA 4P0GA 2Y75A 3B02A 2G7HA 1T2KA 5HS9A 3T8RA 1Y4CA 3N4MA 2F5DA 4YAHX 1UB9A 2EV6A 4P5OA 1FZPB 3HSRA 2AIXA 2XAJA 2ISZA 4EJTA 1U8RA 4JBZA 1UIVA 2BJJX 1S3JA 4RY1A 4MTEA 5TPAB 1TW3A 3TTRA 3TO7A 1WKMA 1A99A 3DV8A 1MZBA 4IO6A 4OINF 2W57A 3K0LA 5LEJA 3USDA 1N76A 1DMBA 3M8EA 4UVCA 5IAIA 1MXUA 4DZ1A 4QF9A 3DQVC 4NB5A 5HOOA 2MD5A 4F3BA 1XVYA 2RC8A 5CI5A 2A6EF 3IORA 3U92A 4BNCA 1ZH5A 1MJBA 1BBYA 1U78A 1R00A 2Q2CA 2UVGA 1NNTA 1G6NA 4G7ZF 2VOZA 4EQBA 4IHTA 3CUQA 2HEOA 2NYXA 3MUQA 2YU3A 1HW1A 4GYIA 1B6HA 4RA1A 4YIFA 1UHWA 3H7MA 1LFHA 3IR1A 2A3SA 3MAMA 1VSOA 1KU7A 5ELVA 2IJLA 3KEIA 1SW2A 1UQWA 4F1YA 4N13A 2Q8JA 1HSTA 5CBRA 4M4GA 2DXYA 3HRSA 4YKKA 1NNPA 1XS5A 1OPCA 3EUHA 3LQRA 1Y20A 1H9GA 5FLXZ 4DXCA 3QP5A 3ZMSA 1ZGAA 1ELJA 1BKAA 4ZZLA 3H3ZA 3H6UA 4YIIA 3EN3A 3OO6A 2NNNA 2EFWA 1W7PA 4WEDA 5JK4A 1FBUA 3NQOA 2H6CA 2AXLA 4U88A 2VONA 2QM3A 2P5LC 4ZECA 4UVAA 2DYXA 4FEDA 3GFJA 3PMWA 2LKPA 1EH6A 2HFBA 4Q48A 3GW2A 2H94A 3U1OA 2X7QA 3P9IA 2IA0A 2PMUA 4TLLB 2DVCA 3I0TA 1FP2A 1RZ4A 1JQFA 2PMHA 3FM5A 5FD6A 4JBAA 5F64A 4PFTA 1FW0A 4Z2YA 3BZ6A 1NL5A 1IN8A 3EDPA 1IXGA 3DELB 3KG2A 3QXMA 1J7KA 2NS0A 2BYVE 3U72A 4XSZF 3TEPA 1P92A 1G3TA 4ECFA 3SERA 4G8HA 4L0ZB 1BC7C 1N04A 3F8CA 3VFZA 4RXLA 4U0VA 4WWCA 4OEUA 2MLGA 4I0AA 4LLNA 1YLFA 3LQQA 2H4IA 2FOKA 5CMCA 2I58A 1ULYA 2REGA 1J5YA 3OOAA 1TTYA 1XT8A 2FNPA 1FQBA 1BC8C 2XXPA 1USSA 3F8NA 4A6EA 4M9XA 4QFKA 1G3SA 2JPBA 1D5VA 4F3PA 5KDTB 3M1EA 4P9FA 2VBWA 5FO5A 5L3BA 4KIGA 1VTNC 4KUMA 3WGIA 5D8KB 5J1DA 3VXCA 3F8MA 4TQUQ 2WKYA 2LAOA 1WSUA 2ALUA 4RPNA 3SXYA 4MLQA 5DEXB 2FNCA 5CM6A 3K6UA 1LAXA 3Q25A 1T98A 2LDUA 1XVXA 3EHSA 1F9NA 4IGRA 5A5XB 3WE2A 2UVJA 4HOBA 3LAJA 4AQ4A 2JZYA 1H9TA 3KZYA 3FVOA 4N07A 3R6SA 3IB0A 2ZYNA 3QPTA 2DQRA 2GFEA 3ZS6A 4WXHA 3ZSFA 1LBBA 1J0RA 1FLIA 2JRTA 3LWFA 1SW4A 5LGTA 1B1HA 4DIGA 3MP6A 4ENJA 2QVOA 2H98A 3K02A 1R1NA 1UFMA 1UTBB 1XN7A 1IXSB 5HS7A 4OZ9A 4ZYHA 3CI8A 3PD8A 3TO9A 3HTUA 4N6PA 2ZNSA 1USTA 5CVJA 1MS7A 2UZKA 4OIQF 2FMYA 1Z7NE 3EQ1A 2D1HA 2L3DA 1GTKA 3MJNA 4FHTA 4KQPA 4LA9A 5AA2B 3RPUA 2UVIA 3R26A 1EV7A 1VE4A 2QMXA 5ICQA 2OA4A 3RPQA 2Z8FA 2L4MA 2YJPA 4R9FA 2QQBA 2A07F 4QSEA 1LJ9A 4EQ7A 1DPRA 5AE4A 1Y1MA 4XKRA 4LG0B 1KU3A 2QLZA 3KGCA 4Q30B 1B3EA 1A8FA 2E7WA 3MQ0A 5EHSA 1N0TA 4NMYA 4ASNA 3G7WA 4F29A 1B9NA 3OOPA 4PFYA 2P2AA 3O66A 4ZH4F 3SZTA 4ZYGA 4C1UA 3C34A 3F6VA 3JV9A 3CG1A 4ZE8A 4WXJA 1Y0UA 3G3JA 4H1XA 4QHQA 1R58A 5EHMA 4F31B 1QQIA 3C3WA 4IRGA 4RB0A 4EF1A 4YKJA 3V8KA 4OIOF 3U9GA 4PFUA 2OBGA 3TELA 1HSEA 2LSOA 3O6IA 2YR2A 4HV6A 4LVQA 3E97A 1XGMA 2F34A 4RB3C 3B6QA 2Z8DA 3KP2A 3WTWC 4OWDA 2Y7KA 3PQKA 4YMBA 2Z9OA 3VXBA 1R22A 4U0YA 3I71A 1I1GA 1HXDA 1ZN2A 3UIFA 2F7BA 3MZ9A 3L09A 3TTKA 4HQEA 2DVZA 4CYDA 4E0XA 1DOTA 2PT1A 3L6HA 1ZG5A 2FF4A 1HW2A 1RUNA 4AVPA 3UN6A 3VLUA 3C9HA 4GF8A 4M72A 2Q2AA 2VT3A 4JWXA 4HQMA 4G94A 3FXUA 1Z91A 5ILVA 3HCQA 2PBWA 4KYWA 2FNAA 4LQ2A 1FTMA 3W6JB 2XROA 2YPNA 5LLQA 1YW8A 1JETA 3KN8A 3SEWA 1F9BA 1ZGJA 4ON0A 1ZREA 2EWNA 1A8EA 4GWOA 2B3FA 3TFLA 1C0WA 2DI3A 2EK5A 5I56A 2ZXJA 2O6AA 4XRFA 2QL3A 3MWMA 2XKOA 2DK5A 3ECOA 4PGGA 4MH5A 3K0VA 3B73A 4ZEFA 2VT2A 3K2DA 1SAXA 1MRPA 2H99A 4LK1F 3TDJA 1IZ1A 1YS6A 2VBZA 2HFHA 4I7HA 5CYVA 4P55A 1DTZA 1ZLQA 3EQLF 3J80Z 5FHOA 3BDDA 3G3ZA 4R2FA 4X9TA 3RKYA 5JHUA 1GVCA 1MXXA 2RQPA 2KIMA 3WG9A 5L3GA 4MGRA 4LLLA 2H25A 3C1DA 1Q35A 3G3IA 3T1BA 2R9JA 3BJ6A 1H45A 1SI1A 3RQTA 1WRJA 2G93A 3KBRA 3PQJA 5BOXA 3LC8A 4F1VA 1AWCA 3QAXA 1ZIUA 2Q8KA 1Y4TA 3FMRA 1FWZA 2H5YA 3JW4A 4GL0A 3BFTA 2WTEA 3U2RA 1SD6A 4LZ8A 4YICA 2QUFA 4PCQA 2A6HF 3KEQA 1NNFA 5DT6A 1V3FA 5CVIA 1B5IA 1IUDA 1SD4A 4FX4A 3U94A 4E0WA 3GF2A 1CB6A 2V9VA 5ED4A 2VBXA 3K6XA 4HZFA 2ZCWA 2ZXTA 2K02A 5H8HA 1EZPA 5JEIA 1QBJA 3ZKLA 3HTSB 1BOAA 1F4KA 3LSTA 4CDGA 1SFEA 1H44A 2ANJA 1B4AA 1OKRA 2HYGD 4HLXA 2XD3A 4X1BA 3RDIA 4UUVA 1CF7B 3FJ7A 1FTOA 1B32A 3IX1A 2EB7A 4B09A 4QWQA 1SVXB 4HS7A 3N6UA 2OBPA 2YX4A 2EFQA 1OIBA 3R4KA 1O7TA 2MA3A 2XD2A 5DCFA 4IO3A 3CJNA 2NXOA 1XGSA 1IF1A 2DS9A 4KICA 2Z8EA 1YYVA 2W25A 2XX7A 1IAWA 5D6EA 4TOZA 2FYIA 1A7LA 1ZLJA 3O2PE 1K6OA 3LFKA 2A5SA 4L0YB 1B7ZA 2V3TA 3VDFA 1UTHB 2RV8A 3ELKA 3GBAA 1B5HA 2FMLA 2OZUA 3P9CA 2QPQA 5IKBA 2OLBA 1STZA 3E6DA 3HHGA 2XXVA 1U2WA 5JVTA 1N3XA 2WC2A 2PG4A 3R61A 3ILTB 3HSFA 3IAZA 2PVUA 4TLMB 5FTHA 2HTSA 2I0CA 2D21A 1D9VA 3J7AO 2M45A 2XXTA 1D3KA 4MF3A 4ZZEA 4G9YA 4KMUX 1LAHE 2AL5A 3CSBA 3RYPA 1USYH 3GZ6A 4UHTA 2HZLA 1LB2A 4HA8A 1EZ9A 2HGCA 5I57A 3BY6A 2XX9A 2VN2A 1B4ZA 5BPIA 2PLYA 2RN7A 4NWDA 2QJEA 5JTYB 4U23A 3FVKA 2PJPA 4KNYA 4NHJA 2VE9A 1FC3A 4BAYA 1R36A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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