2ESNA

The crystal structure of probable transcriptional regulator pa0477 from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
301
structure length
299
Chain Sequence
PLLRRLDLNLLLVFDALYRHRNVGTAASELAISASAFSHALGRLRQGLDDELFLRQGNRMQPTQRAEHLAAAVAAALRALGEGLEEWRPFVPGQSQRTFVFAATDYTAFALLPPLMNRLQHSAPGVRLRLVNAERKLSVEALASGRIDFALGYDEEHERLPEGIQAHDWFADRYVVVARRDHPRLAGAPTLEGYLAERHAVVTPWNEDSGVIDRLLARSGLRREVAVQLPTVLAALFLAGSTDFLLTAPRHAARALAEAAGLALYPAPFDIPPYVLRLYSHVQGRDAHAWMIGQLKGLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structure of putative transcriptional regulator Pa0477 from Pseudomonas aeruginosa
rcsb
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule keywords probable transcriptional regulator
total genus 89
structure length 299
sequence length 301
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-10-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 2esnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2esnA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2esnA03
2XGXA 2UZKA 4LLLA 3K01A 3R0AA 3Q29A 3KG2A 3MVZA 3TODA 3VXBA 4C0RA 3C4MA 2P5LC 4F29A 1QBJA 2VD3A 1FWZA 5IT9K 1Z1DA 1XOCA 1R1UA 3PPOA 2QMXA 1MJBA 3CUQA 1XS5A 3JAMK 3FM5A 5D6EA 1WQ2A 1HSLA 3PFIA 4GCVA 2DI3A 2RC7A 2PVUA 1S3JA 2NNYA 3OSQA 3FMQA 3RKWA 3TOBA 2O68A 3U94A 1H9TA 3HUGA 4HF2A 3VLUA 1MH3A 5JHUA 5DVFA 1MQGA 4EQ7A 5ICQA 1RNLA 1ZRCA 1IF1A 2FU4A 1SAXA 1PBQA 5TPAA 4FAJA 3WTUC 1LFIA 1MDQA 4KICA 4ZEIA 1B4HA 2WKYA 2H6BA 4YB7A 1YG2A 1FY7A 5E17F 2RNJA 3DV8A 1B9JA 4JBAA 2Z99A 4LUBA 2E7XA 5A2QZ 4QFLA 3DP4A 2P6TA 3GBBA 3MC2A 1O7LA 3E5QA 4MFIA 1E2XA 2XAQA 4HA8A 4IHTA 3IC7A 1VR5A 3T8TA 4XLPF 2EV6A 1U3EM 1K78B 4IO4A 4FT8A 4GD5A 5LHGA 2O6AA 4MQVA 5LHIA 1IXCA 3F6VA 2A69F 2H6CA 4XBFA 4AIKA 3WTSC 3KP4A 4H0EA 3GFLA 1JEUA 1Y3NA 2K02A 2EA2A 3WE3A 1MM6A 2GXGA 5H6QA 1TQPA 3FF5A 1DPEA 1D3YA 1P1QA 2BEOA 2DU9A 1JW1A 2IA2A 2NNNA 2XIGA 4YMBA 3LA3A 1USTA 2VOZA 4ZYGA 1T6SA 1LB2A 4G68C 1YIOA 3HTSB 3G73A 1B3HA 3VV5A 2EFNA 4A2UA 3PQKA 4O3MA 3BROA 3K4UA 4ELRA 1FT9A 4WXHA 5DEXB 1KYZA 2X26A 1XVXA 3MWBA 3RGYA 4YB5A 2KIUA 1XMAA 5KDTA 1FTJA 3O6HA 2UYFA 4CGZA 3A3CA 3PMVA 5CYVA 3I59B 3PU5A 5LEJA 2AYSA 2PMHA 2J5OA 4EVIA 1N0TA 3OOPA 3I58A 2QQBA 1HW1A 2ZNYA 1FSEA 3PMWA 4JDFA 3ABUA 1YS7A 1TNSA 3FV2A 3FVNA 4ENJA 1ZBMA 5LRRA 1EH3A 2RCBA 5I2KB 3SKPA 2DQRA 4P9UA 3KN7A 3TTLA 2F7AA 4FX0A 3RKYA 2X7PA 3BFUA 5CBRA 4CDGA 2BGCA 1F9BA 1HSTA 3S9NC 5AA2B 1SVXB 3B6TA 5E8IA 2IJLA 4WCGA 5ELVA 3KZGA 2XVCA 2QUFA 1IN6A 2HTSA 2F5EA 5AA4A 4HCYA 4G7ZF 2H94A 2V9VA 2O84X 2OZ6A 5BS6A 3IK6B 1G3SA 2STTA 2DFIA 1AWCA 4O3AA 3B6WA 1OYIA 2OQRA 1B2HA 1DUXC 3AXFA 4AWXB 2C6YA 4MTDA 1P1OA 1MG1A 3J80K 5AIQA 2GHBA 4MQ9F 3CFXA 4ESBA 4UVBA 4TLLB 4RPOA 2RKHA 4HW8A 2VC1A 1H76A 3T22A 5L3FA 2YR2A 4F3GA 4RGRA 3I53A 3BDDA 3KSXA 3JTGA 2O1MA 3KZZA 1MPCA 1BC8C 1TTYA 3M8EA 2V1UA 2YU3A 4GL0A 3C33A 4K2EA 1WDNA 4HF0A 3K02A 2D3IA 2HKOA 5DDGA 3IJOB 4HDUA 4ETSA 2F7CA 1NH7A 3IOTA 4GXSB 3V7CA 4ESXA 1YTVA 2Y7WA 2F2EA 1DMBA 2QS4A 2VONA 1BM9A 2FXAA 2HQRA 3H3UA 4G9YA 4BDNA 4X48A 2OJTA 5F6FA 3HSRA 1MQDA 2VOPA 3Q26A 1D3KA 3LA7A 4G6QA 2JPBA 3G3ZA 3GEZA 4F19A 1U5TB 1QKBA 2DK8A 4M4GA 3CR9A 4NF5A 1XHYA 3E13X 3UGWA 3KLOA 3K6UA 1BIAA 1S9TA 3KETA 2F5DA 4P0GA 3OSRA 3OMBA 5H8FA 3OO9A 3UIFA 4LB6B 2B3FA 1B6AA 2ISYA 4R1HA 1ANFA 3IWFA 1GXPA 1D8JA 5HLHA 4IVNA 4KIFA 3MZ1A 3MVXA 4PDKA 4RYAA 2XROA 4MEYF 2ZNUA 4M73A 2H9BA 4GLIA 4F2OA 3CI8A 3ERED 3EHUA 4JK1X 3RKXA 4BHBA 1QVSA 2ZKZA 4RGSA 1H3DA 2GQQA 4QSEA 3BBRA 1GHCA 2QBYA 3K1NA 4HQEA 2V3TA 1R22A 3I5UA 4E70A 4C1UA 3HRTA 3WU1B 4HLXA 1B5JA 5H8QB 4ONYA 1HQCA 4ZEDA 1B51A 2XXVA 4BDOA 4M6XA 1WVJA 3IJXB 4OZ9A 4R74A 5BMZA 1LDDA 4BNCA 1B58A 2XXPA 1IXGA 4U88A 4DDDA 3M7GA 3LA2A 2XXHA 4IO6A 4JWXA 2B0LA 1W7PB 4BDMA 1ELJA 3C3WA 2D5WA 3SETA 3RPUA 2D21A 2ANJA 2ISZA 2F6GA 4O3BA 2F34A 5H8HB 1J7KA 3LSXA 3TTNA 4QSCA 4YKKA 1Q35A 5AE4A 3G3IA 2E1NA 1YO5C 3OENA 4QHQA 5M2VA 1P4XA 1TW2A 1ZLQA 2V1XA 5J8CA 4Z2YA 4LZ8A 1O3SA 1G3YA 1JNFA 2ZFWA 2HYFA 4YFXF 2KIMA 1SD5A 4ZEFA 3U1OA 4NHJA 3KLNA 5KVRA 3F21A 1QUJA 3GFIA 2K86A 4G8HA 1RI7A 3ZKLA 3CJNA 4QLCU 5BUUA 2JSCA 3SDFA 5D8LB 4H0WA 2GXBA 3OO8A 4R2BA 1PUEE 1WWXA 4KFCA 1LAXA 5EEHA 3WAEA 3F8FA 2KJCA 2VE8A 2XASA 4H8IA 1BIYA 2Z23A 2ZXTA 3KJ7A 3R0JA 1ZG5A 5DTBA 3F3XA 3MZBA 1OQGA 4L0ZB 5FO5A 2H25A 4OEUA 3DP6A 4L9VA 4GYIA 2J5PA 3M1EA 5HS7A 3MCZA 2P6SA 2VBWA 3FJMA 4F7ZA 5L9SA 5DUKA 3G3FA 2WWYA 1DTGA 3E3KA 4L5JA 3M8FA 3QK6A 2I49A 2F8DA 3O6GA 5LHHA 3RTWB 2M30A 5IKBA 2JZYA 3DP7A 1MY2A 3UORA 3U72A 4X1DA 2VP1A 1BJAA 4TQUQ 2HQNA 1B7UA 1FQEA 3F23A 1V3FA 1K78A 1KQ8A 2FBKA 1B7HA 1PDNC 2QS2A 3MZYA 1XB4A 3H6TA 3N5LA 1MM7A 2XXXA 1N84A 5TP9B 3U92A 4R72A 5KK1A 3ECOA 4EGYA 3VOEA 2NVUB 2HQ0A 1FQBA 1D9VA 3ZQ7A 1ZYRF 5DYHA 1U5TC 3KP5A 4M72A 5BPDA 3GWZA 1PEBA 3Q9SA 5JVTA 1PB9A 2FF4A 1B0LA 2XUBA 3QPHA 1OLAA 3R61A 2IRFG 4OYVA 1PP8F 3C32A 1UTHB 3IRQA 3ML6A 1JHFA 2G7HA 1FYLA 1MY1A 2DQVA 4QFOA 5DEXA 3TQLA 2FEZA 1MY4A 4U1OA 1SD4A 3M9AA 3RI4A 2DWAA 1AH5A 5E1XA 3IKVA 2OZZA 3TAJA 5E1WA 1AIVA 4IY5A 4YB6A 2UVHA 2UVIA 3I59A 4IRHA 4WXCA 3T5XA 3K1PA 4ESFA 1RUOA 3C34A 1EU8A 3MQ0A 1R58A 2IP2A 4NF4A 2PBIA 5FTHA 5CJ9A 1K6OA 3GVAA 3MZHA 2R7FA 3FMRA 2P8TA 2LSOA 2Y75A 2XHDA 4U0VA 4KI0E 4ZH4F 2F36A 1LAHE 4LA9A 1OR7A 5AONA 4TV7A 3ROUA 1FTOA 4EM1A 1AL3A 3I6VA 5EHSA 1LNWA 1RKMA 2Y84A 3CUOA 1Y9UA 3IOWA 4PGHA 3ONMA 3L9FA 2MLGA 2A61A 2CO5A 1ZMGA 3FJGA 5I58B 2RKMA 1WI9A 2D1HA 2GH9A 3QAXA 3ZKKA 4RXLA 1Y1MA 4KIBA 1Y4TA 3TCFA 3ECHA 2UXAA 1US5A 1EH7A 3K6VA 4F1VA 1O7FA 2D2WA 2IPQX 3GFJA 4U23A 4ELQA 1OYYA 3TMGA 3WODF 2L4AA 3WTVC 3TZAA 1B5IA 4GYGA 2DO7A 2Z8EA 5A5XB 2V3QA 3LC8A 2O7UA 3MP1A 3TTMA 2E1CA 1B3GA 1Z7NE 3RUMA 3R6SA 2MLKA 4FJPA 1VFEA 3QP6A 4IXAA 3U9GA 4LG0B 3PPNA 3B7DA 1LCTA 1B9MA 3L7WA 1FPQA 2PJPA 1LCFA 3HSTA 1R7JA 5H8SA 3GX4X 2REJA 1FSHA 4GQOA 2PEXA 3AAFA 4H1XA 1NFTA 3COAC 5K2YA 4XLNF 4RB3C 1HSEA 3K0LA 4EM2A 1P99A 1IXHA 2NAZA 2FRHA 3QU6A 2V1DA 3BPXA 2KIFA 2HCAA 2STWA 4CXFA 3FVKA 3IO4A 2UXXA 5DEQA 2JPCA 4G68B 2H4IA 2NOOA 2QLZA 1K79A 4BHPA 1ZHFA 1M5DA 4RB1A 1BBYA 3V5AA 2H98A 4YFNF 5IT9Z 1I5ZA 2ZMEB 1URGA 2UWMA 3LUYA 4KR5A 4G8XA 4F1YA 4N9HA 5AA2D 1EH6A 2V3UA 4DE8A 4PZJA 1PBPA 5D5UB 4HLYA 5LEKA 1EZPA 3M3FA 2MH9A 3CRBA 4U4XA 1ZTYA 5HM4B 4P9FA 1Z7ME 1EZ9A 5FGMA 4R6YA 4EQBA 3RTFB 4S05A 2BE5F 4UUVA 3OEMA 4AIJA 5ERIA 5L3BA 4IO3A 5CVIA 3F8NA 1IRGA 1SW5A 3VFJA 4MHGA 3H92A 1KA8A 3ZS6A 5H8NB 2O51A 1B4ZA 4EQQA 1QKAA 1OMPA 3FD3A 4FEBA 4H5FA 2LAOA 3IR1A 2W85A 2FE3A 2DAOA 2H09A 3B02A 3KOTA 5H8QA 1IUYA 3VEPA 3N4MA 2R71A 2F7BA 5FD5A 2RVCA 1J1NA 4I02A 2XXQA 3OOAA 3N94A 4LP2B 1P1WA 3I54A 4IGTA 2VODA 3D4GA 3CG3A 2AS5F 2B65A 1B3FA 1FP1D 2D45A 3MWMA 5FLXK 1B05A 4P0IA 2O69A 5TJJA 4GFRA 3I71A 5FFXA 3KP3A 1SBPA 4G77A 3PUYE 1KU3A 3W9VA 1QJMA 1L0OC 3T8RA 2HEOA 1XGSA 1RUNA 1XDSA 3H6UA 4OEVA 1W4MA 1B6HA 1I69A 1BIBA 4WKMA 5CMBA 4RB2C 3IB0A 1FP2A 2OBGA 4A0YA 3VLWA 2COMA 3BP8A 4R9GA 1IAWA 2DPUA 5JTYA 2DE3A 3CSGA 1HW5A 3JSOA 2QS1A 4A5MA 1SI0A 2P1SA 4GL8A 5DVIA 3HTUA 4YKJA 3WTWC 4XXUA 2QYOA 4CZZA 4ESJA 3IL1B 1CF7B 3L00A 4GO1A 1ON1A 1CE2A 4EF1A 1LB8A 4KN4X 1Q1HA 2K7LA 1TQMA 4AB5A 2FOKA 4ZZLA 5FHOA 2I6EA 1GV8A 1ZLKA 2DLLA 2DE2A 2G29A 3GZGA 3GXAA 1FBUA 5HDNA 2REGA 1MY3A 2VT2A 4EV0A 2EK5A 2GA2A 4R2FA 1SMYF 2ZXJA 4UVAA 4OIRF 3FVOA 5ITPA 3MZ9A 2PG4A 2A5TB 4OESA 3QUJA 5I57B 4AIHA 4PCQA 1REPC 2M45A 1VFDA 1T2KA 3BJAA 3EN3A 3IB1A 2R9JA 3FIRA 4UV9A 5D5XB 3J80Z 3PMXA 1YW7A 2W7YA 3VLVA 3KP2A 4U2RA 4U21A 2V6CA 1J0RA 4XIGQ 4YU0A 1VTNC 4DNCA 3C35A 3PV0E 1BP5A 1M5BA 5ILUA 2CGPA 5FB2A 4GGGA 2RV8A 4OFJA 4DXUA 3FX3A 4XRFA 3JSPA 3ZMZA 2K4JA 3HRMA 3R4KA 1LDJA 1SFUA 3E4RA 1BTJA 2XHKA 4UXNA 1CGPA 2EV0A 1A7LA 1R36A 4Y13A 3UA8A 3WGHA 2O1LA 3OEKA 3EQLF 1X3UA 2V93A 4NWCA 4Q4ZF 4QF9A 1UTHA 1DPUA 3ZMVA 3RT8A 4N0BA 3P7IA 2XRNA 1XCBA 4PFYA 3E6MA 4R75A 2PQ8A 2I0CA 3P9KA 1LEBA 2Z8FA 3QRFF 5DVJA 4R6HA 1B7ZA 2I4BA 2XD2A 3DF8A 3C31A 3IOVA 4MLVA 1IITA 2DP8A 1A54A 1ZIUA 3PGFA 4QWQA 1IW7F 1I6XA 4MF3A 3KOSA 3CO6C 5ICFA 4F2QA 2LKPA 2X0LA 2ZBKA 3U8QA 1IUDA 2FNAA 3KCCA 5CMMA 3VODA 3BJOA 3RT6B 1XN7A 2Z5UA 5J8FA 1UCRA 4WK8F 2QWWA 1J5YA 1GR2A 2CYYA 2PLYA 3IKTA 1IRFA 4HCWA 5I58A 3FHZA 4I0AA 3TPAA 3HIFA 2QL3A 1PP7U 2ZNZA 1MDP1 1XGOA 4LJZF 5CVUA 1H45A 3ZPLA 3FXQA 2RN7A 3HV1A 3KSJA 4OHNA 2VBZA 4HF1A 1QO0D 3WGIA 5A5XA 4XKNA 3LQRA 5F7VA 4OETA 4ZE9A 3PD8A 3DM0A 3G7WA 2OK2A 5HPQA 4LG0A 3GZ6A 1NH8A 4P55A 2ONSA 3K2ZA 4F3SA 3EPEA 4ESWA 3GZ5A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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