3FXRA

Crystal structure of tsar in complex with sulfate
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
296
structure length
296
Chain Sequence
MLKLQTLQALICIEEVGSLRAAAQLLHLSQPALSAAIQQLEDELKAPLLVRTKRGVSLTSFGQAFMKHARLIVTESRRAQEEIGQLRGRWEGHITFAASPAIALAALPLALASFAREFPDVTVNVRDGMYPAVSPQLRDGTLDFALTAAHKHDIDTDLEAQPLYVSDVVIVGQRQHPMANATRLAELQECRWAFSSAPRGPGAIIRNAFARYGLPEPKLGLVCESFLALPGVVAHSDLLTTMPRTLYERNAFKDQLCSIPLQDALPNPTIYVLRRHDLPVTPAAAGLIRWIQHHAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural studies on the full-length LysR-type regulator TsaR from Comamonas testosteroni T-2 reveal a novel open conformation of the tetrameric LTTR fold
pubmed doi rcsb
molecule keywords LysR type regulator of tsaMBCD
molecule tags Transcription regulator
source organism Comamonas testosteroni
total genus 86
structure length 296
sequence length 296
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3fxrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fxrA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fxrA03
1R1TA 2UVHA 3KEQA 4WWCA 1HW1A 1N7XA 2MH2A 3TQLA 2GZWA 1HBXG 3U92A 5I2KB 3REOA 4DIGA 5LHIA 3WTVC 4IRGA 1RUNA 2H5YA 1IN7A 1G3YA 4GCVA 1SW4A 3NQOA 1GGGA 2RINA 3EYIA 1P1WA 2A5TA 5CBSA 4TQUQ 3EN3A 5AA3A 1B0LA 4M4GA 1L3LA 4QHQA 1SI1A 1G3SA 4H0EA 2UVJA 4OEUA 3N26A 4HCWA 3ERED 2IA2A 1BIBA 1B9MA 3WU0A 4F1VA 2B65A 3B73A 4R6HA 1MJAA 2QBYA 1M5DA 1CF7B 1I69A 1OYIA 3F6VA 4F31B 3TO7A 2THIA 2IP2A 4OVJA 3I53A 3M8EA 2HFBA 1XVYA 2DXYA 2M45A 3LA2A 1B6AA 2G7UA 3ODBA 5F7VA 1Y3QA 3TMGA 4KYSA 3OO7A 4HF0A 3HRTA 1L5TA 1RYXA 4EJWA 4O5VA 1SAXA 2X7PA 1A54A 2V1UA 1G3WA 2DSFA 3WG9A 3PPRA 2F97A 1B3HA 3R7XA 2PQ8A 3I0TA 4IO3A 2QJEA 2VODA 2H4IA 2FU4A 1KQ0A 4LB5A 5H20A 4IGTA 5E8GA 2P7VB 3H6TA 3TPAA 2DAOA 4NWCA 2FYIA 1BIAA 3H3ZA 2A68F 4AVPA 3FVKA 2XXIA 2HEUA 3W15C 4O6JA 1FTJA 3S2VA 4E70A 5DCMA 2PEXA 4MTDA 2R7DA 3H06B 1YTVA 5ERIA 1MGTA 1ELJA 4LUBA 3MFKA 2W84A 5EEGA 4WXCA 3F21A 1IITA 1B5JA 2VHAA 1KWHA 1H43A 4MHGA 2G93A 2BE5F 2DWIA 3TAJA 4P0GA 5D8LB 5ICTA 5F1RA 2VBZA 2Q8JA 4Z7EA 1DOTA 3L6HA 2OU2A 3MUQA 2AL5A 3RPQA 4EF1A 2EV6A 5M2VA 3T22A 3FUZA 5D5VB 4MTEA 2L4AA 1CF7A 3LA7A 3IO4A 3IJXB 5IKBA 1W5TA 2DP8A 3GFMA 4U0WA 4PE5B 2QZ8A 4XRFA 1LFGA 5DVFA 3V7CA 4EUOA 3G73A 2PFBA 2QM3A 2BJJX 5FLXZ 2L54A 2HAUA 4DCXA 4IRIA 3K01A 5EYFA 4BDOA 2D3IA 3LC8A 2QLZA 3EHUA 1QUKA 3FXQA 5TPAA 2HGCA 3F11A 4WXHA 4XBFA 2Q88A 4OOIA 2KRFA 4A0YA 4IJAA 4HF1A 2R3SA 2ZXTA 2VN2A 1M5EA 2XHKA 2O6AA 3Q9VA 1SFEA 4LZ8A 4HX8A 1IN5A 1U3EM 3BBRA 1JNFA 4HYEA 1LLSA 3QYTA 2EA2A 2RKHA 1TW2A 3GW2A 1XT8A 2NWJA 1I6QA 2O6GE 2NXOA 2YPRA 3DEUA 3B02A 5D5UB 1T39A 1P1NA 4O3BA 4ZEBA 4XLNF 5I59A 5H6QA 4LK0F 4JWYA 4EGYA 4ND9A 3BFTA 3L6GA 3V8JA 3SZTA 4AD9A 1SD7A 4N07A 1PUEE 2DWJA 3EYYA 1A7LA 4ASNA 4CHUA 4MNUA 2COMA 3B6TA 1HKTA 1B5HA 4U0VA 2R7FA 4P0IA 3KG2A 5JFRA 2Z23A 2QUFA 3BJAA 1XDSA 1DPUA 4KUMA 3TQWA 4PZJA 4M72A 3SEWA 1XSDA 2O69A 3H4ZA 5J8CA 3U1DA 1RYOA 3P9KA 1S7OA 3R6UA 4Z2YA 4DDDA 1FT9A 2DQRA 3O6GA 1KU7A 4NF4A 1BM9A 4F1YA 5I58A 2DE4A 2O3FA 1DTZA 3P7IA 2XKPA 5AIPA 1PDNC 4PCQA 1Z7ME 1JW5A 5EHSA 4CZZA 4IVNA 4M9XA 4LQ5A 3MWMA 5DYHA 1I1GA 4BDMA 3VVFA 4AB5A 4QSCA 1SD6A 1B51A 3C7JA 1W7PD 3GYHX 1HSEA 4RPOA 3F3XA 3M9AA 1IRFA 4RAZA 2XAHA 2I58A 1R5GA 3GX4X 1MD0A 1BI1A 2W25A 3FVNA 4XKQA 4XSXF 1O63A 2VXZA 1J5YA 4OWDA 2JT1A 4FHTA 1FTOA 2QMWA 5KK1A 1FTLA 2AL4A 4LG0B 4Y15A 4JBAA 1I6AA 3ONMA 2H98A 4KICA 3CO7C 4ECFA 4PFUA 3GFJA 3QAHA 1ZMGA 4EJTA 4ZH4F 3T66A 3J80Z 3CUQB 2Y48A 2L01A 2HQNA 4KIBA 1P92A 4HDVA 2IT0A 2DPDA 2CWEA 4OFLA 2VBWA 5DT6A 1SYIA 4UNOA 2GWRA 4FX0A 2L4MA 1FP1D 2DBBA 3GZ5A 1Z05A 3TCHA 2E1NA 4LONB 5E1WA 3PV0E 1MY0A 5CMMA 1Y0UA 1USYH 4U7DA 4JWXA 5JI6A 4PFTA 2O8XA 3USDA 4PQJA 4L17A 1FSEA 2DYXA 3TZAA 1KU9A 3K02A 2XAQA 3IB0A 5I57B 1K6OA 3E9XA 1YS6A 4MEXF 3VE1B 4RAYA 3H6UA 2J5OA 1J1NA 2P7CB 1TWYA 2Z8DA 2DU9A 1GXPA 2C6YA 5AA4A 4WCGA 3MCZA 1IUYA 3KSJA 4TLMB 2NS0A 3FZVA 4MQ9F 4X1DA 3DPTA 3E5UA 4YU0A 1R36A 2ADUA 3WAEA 2NUVA 1MQJA 1LAFE 4QSEA 3HRSA 1H9TA 1B2HA 2K27A 3RY3A 5HS7A 4DE8A 3KN3A 2EFNA 4CDGA 1MDP1 1ZU0A 1LCTA 2GFEA 1FWZA 1ANFA 1IN8A 4UVAA 5L3EA 1T0KA 5ITPA 3OENA 2QVOA 1OR7A 2XKOA 3C32A 3CUQA 5AIQA 5L3GA 4I09A 4ENNA 3LSTA 1B3GA 1STZA 2H6CA 2JPBA 2A5YB 1NH8A 1Y3PA 3DF8A 1GR2A 1FOKA 1Y9UA 4M73A 1V3FA 1IXIA 3HPIA 4OIPF 3CSGA 3B7DA 4WK8F 1B0HA 1YS7A 2GA2A 3KE2A 2YX4A 2ZNYA 4B09A 1AOVA 4KR5A 5AONA 3ILTB 1FSHA 3LSLA 4BDQA 1XN7A 1K78A 2EB7A 3VFJA 3PFIA 4RNSA 1FY7A 1O7TA 1LFHA 5I57A 3HSFA 2I49A 2K02A 1DPRA 1P4AA 2GQQA 2WV0A 5L3CA 2K86A 2GRVA 4FAJA 1EH6A 4F3BA 1MKMA 3F8CA 2V6CA 5DEQA 2ZKZA 2RC4A 3O2AA 3HHGA 2Q2CA 3F8BA 3N94A 1OMPA 1K79A 1FQFA 5EEHA 4QSDA 1J2XA 5HDKA 1SD5A 3KFMA 1C0WA 5DD4A 1LB8A 1TLHB 4NF6B 3IL2A 2DPUA 2XXQA 1VFEA 4A6DA 4N0BA 2DK5A 1ZLKA 2FA7A 5AA2A 5L9SA 3OSQA 3C3WA 1WWXA 1NNKA 1O3QA 3WTWC 4U1ZA 2VE9A 2BV6A 4G8XA 2KLFA 4CYDA 2WTEA 3TDZC 4H67A 3CFXA 2M1BA 4KT5C 3QP6A 3O28A 3G3JA 2A61A 1N7WA 3NRVA 1YO5C 3E6BA 2QS2A 5ILSA 3V5AA 3MZYA 3LA3A 5I56B 1US5A 4O3AA 3Q27A 4YFKF 2VT2A 3MVXA 2V1XA 3V7SA 1A8EA 1URDA 3EDPA 1ZRDA 4G68B 3BY6A 4HOBA 2M87A 1DPEA 3K2ZA 4R75A 2DWAA 2VC0A 1S7AA 1Z91A 3KP6A 3KETA 3BROA 5CI5A 1F5TA 3WGGA 2A07F 2L3DA 2JTVA 1DSNA 2VC1A 2NNNA 2DVZA 1EH8A 3V8XB 2CQKA 2FA5A 2P1SA 4LD5A 3HOTA 4UV8A 1TQMA 3ZMUA 3J7AO 2DE2A 4EGZA 1LAHE 3HUGA 2F5XA 1WSUA 4KFQA 1FBSA 4R1HA 1BTJA 4OIQF 4GXAA 1FTMA 3MPKA 5DCFA 1P4WA 2ZCWA 2EFWA 2I4BA 1O7FA 2P6SA 4GYGA 3CIJA 1BN5A 2HWVA 1UFMA 5HVQC 1B5IA 1H44A 3T8TA 2F36A 3VXCA 1BLFA 2A5SA 4Q30B 3QOPA 4G2ZA 1Q35A 3JSPA 4Y17A 1AH5A 2PI0A 1AIVA 3SHFA 1JETA 5LOMA 3R60A 2P5LC 4H5FA 5K5QA 3KZZA 3D4CA 3IOWA 4I2OA 3VOEA 3BZ6A 4HV5A 1MG1A 2H25A 1B4AA 1OYWA 2EWNA 2X26A 2XD2A 4HBLA 1F9BA 3T9XB 3QRFF 3KCCA 3GZ6A 4XSZF 2EA4A 3D5LA 1QBJA 4HZFA 2DW4A 2RCBA 2VOPA 1D3KA 2XX9A 2P8TA 3IC7A 1ODDA 2G9WA 1Q1HA 3U94A 1FQAA 1MY3A 2GXGA 4YKIA 2ZMEB 1HSTA 4BLAA 5DUKA 1IRGA 2FMLA 1R1UA 1USYE 3KZYA 4GXSB 4KMUX 3U1OA 1U78A 1HW5A 1YPNA 1B9NA 1R00A 2CG4A 1MDQA 2Y7IA 3SESA 4ESJA 1M5FA 2BBYA 1B7HA 2YSRA 2D45A 4R2FA 5L9MA 3LFKA 4KYEA 1AOYA 3FASA 3U72A 1VR5A 1O3RA 5AE4A 2HQRA 1B40A 1SD4A 2X7QA 1DDNA 2KIFA 4RGRA 1KGSA 1QVSA 1UTBB 2VD2A 4U0YA 5CVUA 2WWYA 1MPBA 3JTHA 1B1HA 3M8UA 4F19A 3MVZA 1GV8A 2XAJA 3HHHA 1N3XA 1PBPA 2ONSA 4GXOA 4PGHA 2Z8EA 2H6BA 1U6GA 1A8FA 3H3GA 4F18A 3HRMA 3HSTA 3TEPA 1IZ1A 2PMHA 1R58A 4O3CA 2IA1A 2ESHA 5FB2A 2XAFA 1JE8A 3IJOB 3MP1A 4DNCA 3DXJF 1QULA 2QSXA 2PJPA 5HBCA 3RLFE 3R0AA 1IXGA 3ML6A 2NRAC 2A3SA 2QS1A 5FFZA 3OD7A 4LLGF 3TTLA 3J81K 1ZG1A 4GO1A 1HQCA 2ZMEA 5L9OA 4Z0IA 1JHHA 4KYWA 4QFKA 5FHOA 2UZKA 4P9FA 4OMYA 4OMBA 3O6IA 5HM4B 1FQCA 1H76A 3VVEA 2RGVA 3BP8A 4KD5A 1NNFA 5H8NB 2ZJ2A 3FD3A 3R4KA 3O6HA 3UA8A 3S4UA 1KYZA 4U7BA 3QXMA 3IOUA 4P5OA 4DXUA 2MBFA 2ZYMA 4GF8A 1BBYA 3UORA 1XCVA 2CYYA 1SW2A 1A40A 4HQEA 1OQGA 3Q28A 2O03A 3Q26A 2DI3A 1SMTA 2PBIA 4IGRA 1MRPA 1F1ZA 1Y20A 1YYVA 3ZMDA 1YCJA 5ICGA 3H6WA 4G94A 3E3KA 3KJ7A 1VE4A 2I0CA 3HCQA 3KSXA 4AIJA 4F22A 4ETSA 5JHUA 3E97A 2PBWA 2GA1A 5FTIA 2QMXA 5K2XA 4FT8A 3KN8A 3KLOA 1POY1 3P9IA 1SMYF 5BMZA 3WTSC 3WAFA 2NVUB 3RDIA 1XVXA 4R73A 2STWA 4RB1A 4JSDA 4DLDA 3JAMK 5BPIA 3I4PA 4JB7A 4ELPA 3IB1A 1S29A 4ZYGA 3N6UA 5KZTA 5FD6A 4F3SA 2HZTA 1POTA 3BOQA 3LAJA 3Q9SA 2DO7A 5I2KA 5E1ZB 1A04A 3D0SA 3T9HB 3EHTA 4GLIA 1QGPA 3KP5A 1AWCA 3F8NA 1IIWA 4EM0B 1WQ2A 1ZKBA 4WEPA 2REGA 4NF8B 3MAMA 5ITOA 1UTHB 3DV8A 1MS7A 4LATA 4ZYHA 1VSOA 4ZECA 2AXLA 5ILVA 1R9LA 3BJ6A 2FSWA 1ZAOA 2FMYA 1ZHFA 3BFUA 1LVAA 3LSFB 1AL3A 2VOZA 5KDTB 1DMBA 2I4CA 3VODA 2QWWA 1SFUA 4LB6B 5J1DA 1XOCA 3IB2A 1LGBC 2TDXA 1SW1A 2PG4A 2DE3A 4GWOA 3ZSFA 3JW4A 1FTKA 5HLGA 1A55A 1PB8A 4R72A 4L5JA 4G7HF 4I0AA 5E18F 5IT3A 3HHFA 3L00A 4L9NA 3SZPA 4AB6A 3IRQA 4GQOA 1MDMB 2R71A 1JXSA 3TKYA 2GHBA 3U8QA 3V89B 3PQJA 3GFIA 1UB9A 2D5WA 1SD3A 2W57A 5KCJB 3HTUA 1ZGAA 3I58A 3C31A 3FVGA 2EJRA 1FQDA 3QIMA 5I2NB 2UYFA 4BHCA 2CW0F 2VT3A 2FRHA 2OZUA 2QQ9A 2IEEA 1BP5A 2VP1A 3K0VA 1B1BA 1ZIUA 1TXFA 1MXUA 2QYOA 4LFUA 1OPCA 5ICCA 4OZ9A 2QQAA 1U5TB 4OFOA 4R6YA 1LJ9A 4F7ZA 3HSRA 2F8DA 4XTCQ 3D4GA 5I84A 3T96B 3OMBA 4RXLA 5CMBA 4XKNA 1UTHA 2KJBA 3OOAA 2O68A 3O6BB 2R6GE 3RJPA 3QU3A 2ESNA 3T1BA 1RI7A 1S7YA 4H65A 5ISUA 4EQQA 2F5FA 2STTA 3MP6A 3SEVA 3H6VA 5LLQA 1MY1A 2OBGA 3GFLA 4NB5A 3EPEA 2VBYA 2PYYA 4DQ2A 4M6YA 3T0YA 2OZZA 3JYRA 1YG2A 3KGCA 3AXFA 4ENMA 3OELA 2RCAA 1IEJA 2F34A 4BHBA 2FBKA 3F23A 3SERA 1E2XA 3RKYA 3K1PA 5TP9B 1ZTYA 3PMVA 4MLVA 2DS9A 3F6OA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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