3FXRA

Crystal structure of tsar in complex with sulfate
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
296
structure length
296
Chain Sequence
MLKLQTLQALICIEEVGSLRAAAQLLHLSQPALSAAIQQLEDELKAPLLVRTKRGVSLTSFGQAFMKHARLIVTESRRAQEEIGQLRGRWEGHITFAASPAIALAALPLALASFAREFPDVTVNVRDGMYPAVSPQLRDGTLDFALTAAHKHDIDTDLEAQPLYVSDVVIVGQRQHPMANATRLAELQECRWAFSSAPRGPGAIIRNAFARYGLPEPKLGLVCESFLALPGVVAHSDLLTTMPRTLYERNAFKDQLCSIPLQDALPNPTIYVLRRHDLPVTPAAAGLIRWIQHHAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural studies on the full-length LysR-type regulator TsaR from Comamonas testosteroni T-2 reveal a novel open conformation of the tetrameric LTTR fold
pubmed doi rcsb
molecule tags Transcription regulator
source organism Comamonas testosteroni
molecule keywords LysR type regulator of tsaMBCD
total genus 86
structure length 296
sequence length 296
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3fxrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fxrA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fxrA03
4U7BA 4XLPF 1FPQA 3FM3A 2Q9TA 4G8MA 3BY6A 3P7NA 3R26A 1ZG1A 2CO5A 3KN3A 2D21A 4U7DA 5K1YA 1B40A 1MM7A 3T0YA 4MLVA 1A54A 3EF7A 5FTIA 4D0PA 5LBQA 1I27A 2L02A 3V89B 2UVGA 1O3TA 3HIFA 4MTDA 2ZXJA 2FNPA 1U5TB 1OIBA 3PUYE 5TJJA 4U22A 2M30A 5D5XB 2W57A 2DU9A 4G2ZA 2P6TA 3HRSA 2L3DA 3OELA 2FNAA 2VONA 4KYDA 4H8JA 1HKQA 4MHGA 3IRQA 2VXZA 1R9QA 5L8DA 2XUBA 4EF1A 1AOVA 4OMZA 2ADUA 1SD4A 1YCJA 2ESNA 3TODA 1QKBA 1XDSA 1U3EM 1FSHA 1JHFA 3MAJA 2HQNA 5DVJA 1N7WA 4P9UA 1M5CA 4NHJA 1KU3A 3UN6A 2ZNSA 3U72A 3WTUC 2R6GE 3KOTA 1D4NA 1W5SA 2P5LC 4ZEIA 3ZSFA 1ZAOA 2F7CA 3LBSA 3SEXA 2ZO4A 4G7ZF 4A5MA 3GWZA 1XC1A 4YAHX 2GHBA 1B0HA 1YO5C 1R1VA 2L4MA 1QGPA 3V5AA 5AIQA 2P0SA 4B8XA 1U8RA 3DP4A 4U23A 2LSOA 3G3HA 4ESBA 4K3FA 4GGGA 3HHHA 1IZ1A 4O6JA 1RI7A 3N97A 2VE8A 2BV6A 3GLBA 1OLAA 3MBPA 2NAZA 4EJVA 2DWHA 3FM5A 3TCGA 1P4AA 1R5HA 4U21A 3T8RA 2Y48A 1FQAA 1FP2A 2FF4A 4WWCA 4OIPF 1MRPA 3EPEA 3TZAA 2RKHA 1T38A 1EH8A 5ICEA 4KIGA 1H76A 3HSRA 3H3GA 3OO7A 1FTKA 2TDXA 2ELHA 3V7SA 3JV9A 5AONA 4YB5A 4ASNA 1OVBA 3C34A 3TO9A 5HDNA 4L5IA 3VFZA 3COAC 6PAXA 1HW5A 1LAFE 5D6FA 4KNYA 4YU0A 3WTSC 5JTYA 2NS0A 2O8XA 2K02A 1HW2A 4XKPA 2RQPA 5DCFA 1B51A 2Z33A 1TNSA 4IO6A 1B32A 4GXAA 5E1WA 1ZHFA 3UORA 5L3BA 4KCCA 4N07A 4ELPA 1JW5A 3TDJA 4IGTA 4BHCA 2XIGA 3BJAA 2RVCA 3KFMA 1MY1A 1QNTA 3D0SA 4I7HA 4HQMA 5E20A 1R9LA 2ZJ2A 3HN0A 3K6VA 4NWCA 1UTBA 4NF6A 5EEHA 4ENJA 3ISPA 1NNKA 4GOTA 2EV5A 4NMYA 1GGGA 3MP1A 2XXVA 1TXFA 1ATGA 2E0SA 3CG3A 3SKPA 3RPUA 4C1UA 2O68A 1AL3A 2G9WA 1ZJLA 5I57B 2VOPA 1U5TA 1R7JA 2PMUA 3HSFA 5J6XA 4YICA 3H7MA 3GXAA 4ZS9A 1BIBA 4Q0CA 3PPPA 5JHUA 2FOKA 5DV5A 2XXYA 4EV0A 4AIKA 4LP2B 1RUOA 4QFOA 2A5TA 4M9XA 1MH3A 4GL0A 4YZZA 2XXXA 3BPVA 1JGSA 4ESJA 3FMQA 5ICTA 3S9LC 5E8IA 1EH3A 1HBXG 3TTNA 4EUOA 1JNFA 2XD3A 2HTJA 1YPNA 2F6GA 4EGZA 4Z0IA 4QRZA 3UA8A 2BBYA 1WI9A 2O6GE 3IWZA 3F72A 2FA5A 1Z1DA 1MXWA 5BPDA 2QWWA 4THIA 1MKMA 3FWEA 3OOPA 4A5NA 4HQEA 5FHNA 3SESA 1T0FA 5HPQA 2QPQA 2A6HF 1RKMA 1SQYA 3Q25A 1XMKA 5ICCA 2RGVA 2QS4A 1YW8A 1FQFA 4YKKA 5AA2B 3BFUA 2CZLA 4R6KA 4G6DA 5IT9K 4RAZA 3QU6A 1PP7U 3E4RA 2CSOA 4BDLA 2OLBA 4NTLA 2QENA 3SFZA 5A2QZ 3WGIA 2IA4A 4I8CA 3WE3A 1PB7A 2OD5A 3GZ5A 2Z22A 1NFTA 1NHAA 3MZ9A 3OEKA 2H99A 4XSXF 2LAOA 2A68F 2P7CB 4KIBA 3HTUA 3G3GA 4BLAA 3ZMDA 4NF5B 4R2FA 3KP7A 4HA8A 2BJJX 2RINA 1EZPA 2L4AA 2XX9A 1URSA 3IR1A 3UGWA 2A5YB 1MD0A 1Y0UA 2DK8A 3FVOA 4ZEFA 2XXUA 3RQTA 4LD5A 4DCXA 1GVJA 4P96A 2Y7KA 2REJA 1SD7A 2F5CA 4PP0A 4M6YA 4M1VA 1RYXA 2OZ6A 3QPTA 1IEJA 4KPTA 5H8HB 4LB6B 1ZIUA 4OEVA 4MFIA 1TFDA 5ED4A 2WWYA 1B2HA 1KGSA 2B3BA 1LB9A 2OK2A 4NF4B 4UVBA 5LRRA 4WCGA 3UK4A 2RC9A 4NQWA 1CGPA 2DVCA 2Z23A 1HQCA 1T6SA 5BOXA 1O3QA 4N13A 3V4GA 3HTSB 1YLFA 4S04A 4KFCA 2E1CA 2F5XA 4KICA 1B1XA 4MTEA 3GVAA 4A0XA 2XXTA 4U0VA 4FX4A 3KP6A 1USSA 3VV5A 2F8DA 2LF7A 4L0YB 1F9NA 4HZFA 2UVJA 1B5HA 5H8NB 2HZTA 2QJEA 1IN6A 3OO9A 4WKMA 5K5RA 4XXUA 1RIOH 1FLIA 4G94A 4CXFA 2ANJA 3EHUA 3SERA 4OXVA 3V8JA 1BI1A 5I57A 2DWAA 3TQWA 3VVDA 5I59B 3PPOA 2VBWA 4G7OF 3I6VA 3KCCA 3S4UA 2IA1A 4S05A 3ABUA 3TDUC 3TQLA 1DTGA 1XOCA 3KP5A 4ZDMA 5KDTB 2DE4A 3L6HA 4WXJA 3CDHA 3LC8A 4WEDA 2DO7A 3QU3A 1CE2A 1P2FA 2VBXA 1MPDA 3KG2A 1ZLQA 3K2DA 1R5GA 4YG2F 2FEZA 2XKPA 5TP9B 3EQ1A 1HXDA 2ONRA 2RC7A 2X4HA 4L17A 4RS8A 3R0AA 4WXCA 5I2NB 3FVKA 3K1MA 3HHFA 1AWCA 2XD2A 1DP7P 1DTZA 1PDAA 4GWOA 2ZNUA 1ZRDA 5CVJA 3FGSA 2NXOA 2GA1A 3U2RA 4EF2A 1EV7A 3DEUA 1XS5A 4KQPA 4OHNA 4A6DA 4I02A 1GTKA 5TRDA 1HSJA 3OSQA 1QJMA 4ZE8A 1FT9A 2RCBA 3M7GA 3BP8A 4LATA 3TTLA 5HLHA 3I5UA 1UB9A 1TQMA 4Q48A 4CYDA 4ELOA 1VE4A 3I53A 2F36A 4QF9A 5AA2A 2QBYB 2IA2A 3PMXA 3TTRA 3TGNA 4H0WA 3LFKA 4OQOA 1BI2A 1XGMA 2QS2A 4UHTA 5JR3A 2FQ3A 1I6BA 5FD5A 4N0BA 1BJAA 2STTA 1JW4A 3C32A 3RGYA 2R7FA 3IOWA 3SZTA 3F8CA 3I58A 3FASA 4IB2A 2Z3YA 3HRMA 1CF7A 3FXRA 4TLLB 2ZYNA 5KZTA 4F3PA 1SAXA 1SFEA 4OOIA 2PFBA 4P0GA 1XB4A 3IKTA 4OMBA 1QW0A 1R6ZA 5AA3A 4FEDA 3G3JA 1QBJA 2PVUA 1H45A 3PU5A 1YYVA 4Z7EA 1YW9A 4ESFA 2PYYA 3RYRA 2VT3A 4CGZA 3JW4A 2J5PA 3GBAA 5FO5A 4FT8A 5EEGA 3S9EA 5DEQA 2MBFA 4P0IA 5CM6A 4NF4A 3MQ9A 3VFJA 2JZYA 5H20A 3CUQA 4HAMA 2JTVA 3DELB 3T9VA 1WQ2A 4YKIA 3IB2A 1S29A 1SD5A 4N9HA 2G93A 2E7WA 3O2PE 2ABHA 2XHDA 4WX9A 2QYOA 1T0KA 2JT1A 3VVFA 2L01A 4U4SA 1EU8A 2MC3A 2JPBA 3NEUA 1PEBA 2V79A 2ZYKA 5H8NA 3T22A 4OETA 3CTAA 5DDGA 2V3UA 1O3SA 2V3TA 1YG2A 3GFIA 4UV8A 1GHCA 5E1XA 2Y0MA 1P1UA 1G6NA 3DPLC 4I0BA 1OR7A 3CIJA 1W5TA 3IK6B 3LA7A 1MPBA 1MQIA 3F8FA 4YB7A 4R1HA 2HDCA 1N76A 2I4BA 3LQRA 4PFUA 3MQ0A 1R1TA 2GFEA 3FIRA 5B70A 5CC2A 2VBYA 3IJOB 2HKOA 4JBZA 2V9VA 4BXUA 1NNTA 5LEJA 3LSWA 1UHWA 4DXCA 5TP9A 4IGRA 3MUQA 2PI0A 1TT1A 2EFQA 4F3BA 5IAIA 3GFJA 4YFNF 4GRKA 5I56B 5I2NA 1JEUA 3F22A 3H6TA 3MWMA 5JVTA 1WDNA 1DPEA 2Q2AA 1J5YA 1ZG3A 1RZ4A 4RYAA 1P4XA 4DXBA 1QPMA 3VLWA 2VOOA 5JK4A 2VC1A 4F1YA 3MPKA 2UXXA 4WF2A 3WTYC 2HZLA 1Y3PA 5HS7A 2P5KA 3T9HB 3B6WA 2Z99A 1QQIA 2YSRA 4I2OA 4A0YA 4EVIA 2QBYA 4WEPA 4H65A 2AL4A 2EB7A 5JI6A 3PMVA 4B09A 1TFAA 4G8HA 1FZPB 2V84A 3CRBA 2DTRA 5AA2D 2QM3A 3C36A 1MDMB 2NNNA 3FXUA 4LB5A 3TKDA 3KP4A 4QFKA 4LZ8A 2RF1A 5ELVA 2IP2A 3CJNA 5AA4B 1L5TA 2H9BA 4FIMA 2OQRA 1IIWA 1BOAA 3ILUB 2HQ0A 3ILTB 2CWEA 2VODA 5EYFA 3K2ZA 5A2QK 1FTLA 1YAEA 4EJOA 4R9GA 2GZWA 2BGCA 1UIUA 3M8UA 4JB7A 4YMBA 1G3YA 2O69A 1DPUA 4XSZF 3WTZA 1GXPA 3RKYA 1KWHA 4QSDA 3M1EA 2VD2A 4OMYA 3ZMZA 4F18A 4F19A 3FUZA 3C9HA 2RV8A 1B1HA 2I48A 1LJ9A 2VHAA 4XKNA 2P8TA 3O9PA 1SYHA 4YKPA 1XSVA 3RN8A 2KKOA 3OO8A 4TOZA 3MWBA 2AL5A 2MA3A 1PBQA 2FU4A 3O6IA 1Z91A 4JSOA 1MJBA 1UHMA 3MVWA 2XRNA 1JQFA 1Y1MA 3FVNA 5EHSA 1B05A 3E5XA 4U1OA 2AIXA 4YMAA 1SI1A 3LSFB 1W4MA 3E3VA 3B02A 1PB8A 4DCYA 1XGOA 3BFTA 2XAQA 3F11A 4RXLA 3R7XA 3BROA 1I69A 2F5FA 3E97A 5DD8A 3SEYA 4M72A 5CYVA 3K6UA 1UTHA 2HAUA 5CJ9A 4OIQF 2ZFWA 4H5GA 4RB1A 4U0WA 3WGGA 3I3VA 2D45A 1MDQA 2H6BA 3WG9A 1N84A 3JSPA 5D4RA 3QP6A 2I4CA 4POXA 4A0ZA 2DT5A 3RUMA 2HTSA 2M45A 1H9TA 3SETA 2XVCA 1JEVA 3K69A 2DFIA 3GUDA 3GF2A 1J75A 3VE1B 3TTKA 5A5XB 1XCBA 4KMUX 3T8TA 5J8CA 1ZLJA 4HDVA 1C0WA 3TPAA 4FE8A 1I6XA 1SW5A 2DXYA 5H8SA 1LBBA 1P99A 1TTYA 2KJBA 1M5BA 4HX4A 4KR5A 4HTGA 2J5OA 4UVAA 1JE8A 4GVOA 3FMRA 2QS3A 3ZMTA 2DP8A 3L09A 3CFXA 2RDPA 2O51A 1EZOA 5HM4B 4G6QA 3HOTA 4PE5B 3HUGA 1O7LA 4R72A 3RTWB 4DQ2A 4MEYF 2H27A 1QKAA 3P7IA 1B46A 3ZPLA 4BDQA 4ON0A 2Y7IA 5D8LB 3VB2A 1XGNA 3ECOA 2W24A 3T93B 1GR2A 1ZARA 4F2OA 3SEWA 3IO4A 2W25A 2NRAC 2UXAA 1MQJA 4KMFA 3CO6C 3VOEA 3Q26A 2ZMBA 1XCVA 2Q8KA 4FHTA 1MQDA 5D5VB 3U1OA 3Q29A 1LNWA 4KYSA 3KFWX 2IEEA 2PT2A 2PX1A 3EHSA 3IC7A 1B6HA 4F2QA 4KCDA 1HW1A 2BEOA 4BHPA 1EH7A 1A8EA 5AA4A 1LAHE 3WAFA 3O66A 4MLQA 3K00A 3MZYA 4ZH4F 2X0LA 4EGYA 3LR1A 3BJ6A 3FJ7A 4MNUA 3MPLA 2DLLA 1E17A 4TV7A 5FGMA 2QMXA 5FHOA 1A99A 1IUYA 1VFEA 2HS5A 2QZ8A 1LAGE 3TO7A 1MXXA 4QHQA 1B9MA 2RC8A 2QVOA 1QO0D 4IRIA 3IB0A 3JZJA 5K5QA 4R75A 2DXRA 1KYWA 1KQ0A 2EFOA 4E70A 4BH9A 1D9YA 2DPDA 3JTGA 2V1DA 1B52A 2VOZA 3L6GA 3TKYA 1ON2A 4KYEA 3V8XB 2L54A 5AE4A 2QSXA 4G68B 2DK5A 2UZKA 2A3SA 3KEOA 4ZYHA 1KU7A 2B65A 3V7RA 1EZ9A 3MVXA 5CVVA 4PFTA 4IJAA 3JTHA 3SXYA 2PG4A 1LB2A 2XGXA 1VR5A 1XVXA 1SFUA 2XAFA 3N4MA 1B7HA 1D8KA 4RJZA 3RPWA 2QQBA 1B3LA 2F34A 1SW4A 2K86A 3WU1B 4RB3C 3PMWA 1MH4A 3SZPA 1FTOA 3QUJA 4GF8A 1ON1A 2QMWA 3KOSA 3MW0A 3J81Z 1HSLA 4O3AA 1US4A 3E5QA 2UYEA 2DI3A 3A3UA 3JYRA 5BUUA 3KN8A 4POWA 1Y1ZA 2FXAA 3C3WA 2DW4A 4LZ5A 5L9SA 1Y4CA 4HLYA 1Q1HA 2ONKE 2FBIA 2AS5F 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