3FXRA

Crystal structure of tsar in complex with sulfate
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
296
structure length
296
Chain Sequence
MLKLQTLQALICIEEVGSLRAAAQLLHLSQPALSAAIQQLEDELKAPLLVRTKRGVSLTSFGQAFMKHARLIVTESRRAQEEIGQLRGRWEGHITFAASPAIALAALPLALASFAREFPDVTVNVRDGMYPAVSPQLRDGTLDFALTAAHKHDIDTDLEAQPLYVSDVVIVGQRQHPMANATRLAELQECRWAFSSAPRGPGAIIRNAFARYGLPEPKLGLVCESFLALPGVVAHSDLLTTMPRTLYERNAFKDQLCSIPLQDALPNPTIYVLRRHDLPVTPAAAGLIRWIQHHAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural studies on the full-length LysR-type regulator TsaR from Comamonas testosteroni T-2 reveal a novel open conformation of the tetrameric LTTR fold
pubmed doi rcsb
molecule keywords LysR type regulator of tsaMBCD
molecule tags Transcription regulator
source organism Comamonas testosteroni
total genus 86
structure length 296
sequence length 296
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3fxrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fxrA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fxrA03
2OJTA 4PE5B 5ITPA 4A5MA 1D8JA 1OR7A 1XT8A 4KYDA 1Y3PA 4XKNA 3HSTA 4KFQA 3E4RA 5D6FA 3TTKA 1SYIA 5FTIA 4U4XA 4OTEA 3IL2A 2MH2A 1B6AA 5LHHA 3MPKA 3PU5A 2O03A 3C34A 4CICA 3MP1A 3TELA 4ZYHA 2CQKA 4PGHA 4NB5A 4HTGA 1O3TA 4L9TA 1KWHA 4NF4B 4BDMA 1AWCA 2P7VB 4XKRA 3C33A 1NL5A 3KN3A 1S7AA 2AL5A 2ZNSA 3FJ7A 1D3YA 2M30A 2NYXA 5LHGA 1URDA 2DAOA 4OMBA 5HBCA 4YMBA 3HRTA 2ESHA 2LDUA 2A61A 3H03A 5BOXA 1R7JA 1SW5A 3ZKKA 3PGFA 1USYH 4IRGA 5I56B 2F35A 3IWFA 2VN2A 4O3MA 3MP6A 4JSDA 1R1NA 1DUXC 3C31A 2L4AA 1NFTA 1TFAA 4U2RA 2IP2A 5LLQA 3ZMTA 4LONB 3T9VA 2KIFA 1XOCA 3LWFA 5D4RA 2RDPA 3U92A 1T6SA 4EGZA 5A5XB 3MBPA 1MPCA 3H4ZA 4AWXB 3L00A 3IHUA 1AMFA 2DK5A 2Z23A 1UTBB 3K02A 4C1TA 3CSGA 3DM0A 1B9MA 2E1CA 1MH3A 3E5UA 1LAXA 5K1YA 5TP9B 3QOPA 4F18A 4NF8B 3K6UA 5BUUA 4EVIA 3AXFA 4F1YA 5H8FA 3BJOA 4EJOA 2UVJA 3LSXA 4LQ2A 2GXBA 4IO3A 5LRRA 3VOEA 1FTOA 3MZBA 2O7UA 2DE3A 1ZAOA 3QP5A 1YW8A 3RJPA 5JHUA 1B3EA 5HDKA 3U1OA 1MJ9A 2JPCA 2ZYKA 4R6KA 5CMMA 2O68A 4BQAA 1YPNA 1JW1A 2DXRA 4G94A 3PD8A 3VE1B 1NNFA 3SFZA 1Y0UA 1FC3A 3K6VA 2DYXA 1YW9A 2PBWA 4HS7A 1FYMA 1L3LA 4KMFA 4Y13A 3ECOA 4RB1A 1UHMA 4DLDA 1CE2A 3ZMZA 5FO5A 1XGOA 1D5VA 1OMIA 4TOZA 3LR1A 2XXYA 3CG3A 4OWDA 3U93A 4YB5A 3BROA 2HZKA 4I02A 1LFHA 1AOYA 1LSTA 2ZNZA 1QVSA 1RKMA 1TTYA 4O3BA 2XRNA 5ILSA 1MQJA 2JPBA 1XSXA 3ILUB 2A68F 2LNBA 4A6DA 4I09A 3OV8A 4U23A 5KZTA 2HAVA 1OPCA 3CLOA 1Z7ME 2FA7A 1FBUA 3FGSA 3OO7A 2P0SA 4O6JA 4YIIA 4IGTA 2B65A 5F6FA 2W57A 1IN8A 2QMXA 2BGCA 4U4SA 3USDA 3KETA 3WG9A 3FVGA 4MF3A 5DTBA 4HLXA 1LBBA 4ZECA 1B05A 2KKOA 3FUZA 1FPQA 1UTHB 3SEUA 1QUKA 2ZJ2A 2GFEA 3T22A 3U2RA 2OQGA 2VHAA 3COAC 3FVKA 2VBXA 2P7CB 4KUMA 3ZMUA 3TDJA 1OQHA 4OIPF 3WGHA 4F2OA 3FATA 4OQOA 4OESA 3WGIA 4Q5SF 1N04A 1OQGA 2ZXJA 4IJAA 1ZRFA 3RLFE 2H9BA 4CDGA 4L18B 1A99A 5AA3A 2DT5A 2ZFWA 3G3ZA 3BY6A 4H0EA 4BNCA 2OLBA 4BDLA 4A0ZA 3THIA 5ICFA 1B32A 4H8IA 4H6DA 1Z7UA 4KIGA 1AL3A 5I59B 4HV5A 2I58A 3LA2A 3M3FA 1XCVA 3T1BA 1W4MA 1N84A 1QPMA 2K4JA 2QM3A 3MWMA 1US5A 3MQ9A 2QS2A 4M74A 1QZZA 4ZDMA 4EMSA 2IT0A 1QW0A 4M6YA 5IT3A 1SYHA 5KDTB 2V6CA 3MVZA 2F5FA 2J5PA 3OEMA 3ZN0A 3J7AO 2V3QA 3IOWA 3IRRA 3JW4A 1FBSA 3B7DA 5I2KA 2FA5A 4N13A 1FY7A 2XKPA 3FVOA 2FSWA 3GEZA 1J75A 2F5CA 1SI0A 4BYYA 1ZG5A 3N4MA 1YTVA 1WWXA 3K1PA 2PBIA 2AS5F 3FD3A 4MHGA 1LNWA 1A55A 2ZYMA 2K86A 3MQ0A 2E0SA 1BI2A 1JQFA 5J8FA 3JAMZ 5JFRA 1J7KA 3I5UA 3KFWX 1II5A 1SD3A 5HS7A 1Y3QA 3F6VA 3U72A 2G7UA 3LSLA 5AA4B 5I57A 3CTAA 2XV4S 1I1SA 5K2YA 3A09A 3R26A 5D5UB 3DPLC 3ERED 2ESNA 1G3SA 3VV5A 4OMYA 1ANFA 5CMKA 5ICTA 2LF7A 1EH6A 5L3FA 3PV0E 2IVMA 4EM1A 4I0AA 1B51A 5CYVA 5FD5A 3TOAA 3BKIB 2OZUA 5EEGA 1Y20A 3KN7A 4A0YA 3LQRA 2X7QA 1K78B 2CSOA 3KP3A 4P0IA 3P9CA 1RYOA 3D5LA 5FLXK 3FIRA 1LCFA 3OSRA 4OIOF 4R2FA 2XXWA 2I4CA 1UB9A 3J80Z 1DSNA 3L6GA 2AIXA 3HTUA 3L2CA 1ZLJA 1QUIA 3DP4A 2DLLA 3CRBA 4U88A 2YX4A 3L6HA 1P4AA 2I3VA 3KOTA 1KU7A 1RNLA 1SFUA 4BHCA 3TMGA 5DVIA 5K2XA 2EK5A 1LCTA 5B7DA 4R9FA 1BM9A 4DIGA 1V4RA 1PBQA 2CMOA 2DE4A 4LJZF 1U8RA 3FX3A 2FYIA 4XSZF 2PLYA 1UHWA 1R22A 3OEKA 3NQOA 5DCFA 3U94A 2UXNA 3BPVA 4D0PA 2QQ9A 4QSDA 3RIRA 4ZZAA 2H27A 2ACJA 3N94A 3VVDA 4AB5A 3RPWA 1HKTA 3W6JB 4MQVA 5BWJA 1WI9A 2I49A 3Q26A 1IN5A 2HYGD 5D4SA 2O84X 1EH8A 1OVBA 4KN4X 3HHGA 5CJ9A 3TPAA 3CVGA 4GRKA 5JEIA 5FHMA 2PEXA 1LLSA 5AIQA 1TFDA 4YB6A 2Y0MA 2EFNA 3JSPA 3W6KB 4ON0A 3HSEA 4KI0E 1BBYA 5LOMA 2EB7A 5L8DA 3C4MA 3FMQA 1X3UA 4NF6B 1WKMA 1MJAA 2A3SA 2PX1A 3SZTA 1QJMA 3Q9SA 3LC8A 2Q9TA 3DXJF 4LG0B 3TFLA 3OSQA 4FECA 2MD5A 2XAGA 3CUQA 3O66A 3EUHA 1SBPA 3E9XA 1NNPA 4P0GA 3WODF 4G2ZA 1BI0A 2QVOA 5F1RA 4GYIA 2UYEA 3TTMA 4G7HF 3IB1A 2ANJA 3KSXA 3I54A 4I98B 2QS1A 3R6UA 3S2VA 3WE2A 4OXVA 1GTKA 4UA8A 4L17A 1IRFA 1R9LA 3IL1B 1SW1A 2R6GE 1LB2A 4ZEFA 1L0OC 2O6GE 3V89B 1MXVA 4CXFA 3KJTA 1LBCA 2O6AA 4RB3C 3K1NA 5TPAA 3BP8A 1S7OA 3Q5FA 3OMBA 3LA7A 2XXUA 3E5XA 2O8XA 3OD7A 2Q2EA 1B7HA 2DWJA 4QFOA 4MEYF 2DWAA 3LFKA 3SERA 5ITOA 2VGQA 5ILVA 1MXUA 2AXLA 1I6XA 5K5RA 4YFKF 4XKQA 1MXZA 3OENA 3GO5A 4RGUA 1DTZA 4IO6A 2OZZA 1YO5C 3EYIA 4NWDA 4A12A 4XTCQ 2KRFA 4I2OA 3SZPA 1H3DA 3UP9A 1KA8A 1MY4A 2XHKA 4HX7A 1KU3A 2A69F 2NUVA 3WTUC 1IUDA 4NF4A 2DQLA 3PPOA 5L3GA 1P2FA 4LVQA 4L0ZB 3FJGA 5BMZA 2F36A 2ZNUA 3G7WA 1FCKA 2XVCA 1B46A 2QQAA 2X7PA 1VSOA 4X1BA 5I57B 1W7PB 3J81K 2ZNYA 1MM6A 5I56A 3QRFF 3E5QA 5D6EA 2V84A 1RZ4A 1T2KA 2ZO4A 4R6HA 4Q4ZF 1GXQA 4B09A 4HQEA 2ZMEB 3QU6A 3GBBA 3RT6B 1FNNA 1FW0A 1IW7F 3O9PA 4L9NA 5HLHA 2B0LA 2X4HA 1Y1MA 1OLAA 1IIWA 3KOSA 4NWCA 3RUMA 4UVCA 5A5XA 1LDJA 2RKMA 3EHTA 3D0SA 2XXVA 5ICQA 2F34A 1H9GA 1HW1A 1S6LA 2OAZA 5DD8A 2NNNA 1R00A 3DP7A 1NNKA 2QQBA 4G4PA 1HSEA 3QPTA 3IK6B 5CVRA 2W24A 2QSXA 3KBRA 3C18A 4H5FA 4NF8A 3K0LA 4BDOA 4TQUQ 4S04A 4M6XA 4HDVA 2NS0A 4GL0A 3M8UA 2RC7A 2QS4A 1DMBA 1O7FA 2IRFG 3IWZA 2V3UA 4UVBA 4IXAA 2AYSA 5DV5A 5DYHA 3F22A 1LB9A 2WTEA 4KIFA 5E8GA 2STWA 2P5VA 2QPQA 2WKYA 2DK8A 3HHFA 4G8XA 4KDPA 2IA0A 4FORA 2EFQA 4EF2A 2OWSA 3MWBA 2H25A 3SEVA 3FM3A 1F9NA 1ZG3A 3KP7A 3PFIA 4LB6B 4HX8A 4R74A 4WKMA 3V8XB 4FATA 2HQ0A 3B6QA 4Z0IA 2UXXA 3FMSA 4N9HA 3SKPA 4C0RA 3SESA 3R0JA 2VOOA 1LGBC 4RY1A 5KCJB 1YIOA 3RYRA 3KE2A 2V93A 2FBHA 4EQ9A 2JRTA 3BWGA 1C0WA 3ZN1A 3LSFB 4OEVA 4IGRA 5E20A 3GF2A 2Y75A 4CO8A 3E3KA 3TUSA 2UYFA 2OD5A 2E7WA 1STZA 3OOPA 3SHFA 4KR5A 1VTNC 4JSOA 1ON1A 3W15C 5DEXA 1R5GA 1UIUA 4IO4A 3HRUA 1YAEA 2GA2A 5HS9A 3CUQC 4ZH4F 4FIMA 4EXKA 3M7GA 3M8EA 5FGMA 4R6YA 3F23A 4XLNF 2UWMA 2DWIA 3DPTA 5D5VB 2DE2A 4QLCU 2HDCA 4KCDA 2IPQX 2OZ6A 3GFIA 2HGCA 4EJWA 4A0XA 3ZMDA 5CM6A 2F78A 1M5FA 4L0YB 4FT8A 5AONA 3H06B 3QYTA 2FRHA 3FM5A 1U6GA 4F1UA 4ELRA 3WAFA 5H8NB 1CB6A 1MPBA 4IO5A 1XGNA 2BEOA 5I59A 3K6XA 2I0BA 2A07F 3BJ6A 5ELVA 3M3KA 5CBRA 2VBWA 1MRPA 3N26A 4U7BA 3R6SA 1KU9A 2NAZA 5KDTA 2A5TB 3MZ1A 4IHTA 1ZN2A 2H99A 2MLKA 1TXFA 1FTJA 5D8KB 2PVUA 2H6CA 3KZYA 2UXAA 4HX4A 3RKXA 4DNCA 4TLLB 5L9OA 5ICEA 3UN6A 2M5WA 5E8IA 2VBYA 1I5ZA 1J5YA 3I53A 2Z33A 3O2AA 2DP8A 4ZYDA 5FHNA 2D5WA 2F5EA 3CI8A 3QSLA 3V8LA 4BDRA 2QUFA 4QSEA 3ZP5A 4IPAA 5E17F 3CUOA 3HPIA 5AA4A 3ELKA 4EDPA 1YLFA 1MQGA 4MBPA 2D1HA 1QO0D 4F19A 2PMSA 5EHMA 1VE4A 1FQFA 3N97A 3HV1A 2XXTA 1I6QA 4ZZEA 4OOIA 2ZMBA 2EJRA 4I7HA 4I8CA 1ZIUA 2F5DA 1BI3A 3HSFA 1CGPA 1HW5A 4FAJA 4Q48A 4IRIA 3QK6A 1KGSA 4RB2C 2V1DA 4O3AA 3WU1B 4OENA 4YKPA 4M9XA 2PJPA 5IKBA 2R9JA 3S9NC 3OELA 1UFMA 4I01A 1XN7A 1K78A 3TDZC 4RXLA 3RKWA 3O6GA 1JGSA 2WC2A 3CFLA 4R1HA 4F31B 2DI3A 2XX9A 1GHCA 3PD9A 1E2XA 3MC2A 5DCMB 3VLVA 1ZYRF 4R8HA 2V1UA 4FEBA 3W9WA 2XXIA 5K5QA 3MPLA 2Y48A 3KEQA 1BP5A 3QAHA 3VLWA 2O0YA 3H3GA 3HN0A 1W7PD 3QUJA 1AOVA 2VODA 2FNPA 2IJLA 2GRVA 1LFGA 1IN6A 3GZ5A 5FLXZ 1YCJA 3G73A 2YPRA 2I6EA 3A3UA 4XXUA 3K2DA 2QS3A 5HLGA 3A3CA 1ZKBA 5CI5A 3GFMA 4XBFA 1U3EM 1F5TA 2F8DA 5HS8A 1T38A 4OETA 1XGMA 1IXIA 4HF2A 4HCYA 5IT9K 4ESFA 4IF4A 2RQPA 4X9TA 1H0MA 4UV9A 1ZMGA 4RA1A 3KFMA 1HBXG 3HYIA 3V7CA 3TKDA 1W5TA 1ZLKA 2G9WA 3AAFA 3K69A 3H7MA 4F3SA 2LKPA 3HOTA 1UCRA 3SXYA 3IOTA 5CBSA 1BIBA 4LMYA 3M1EA 2P5KA 3UK4A 2EFOA 5D5XB 4ENJA 3C36A 4NF6A 4NE4A 5DEXB 4LLNA 4PDKA 3HUGA 4LLLA 5TRDA 3FZVA 4LG0A 3OO9A 3EHSA 4G7OF 1RUNA 2F97A 5HDNA 2BV6A 2QWWA 3DFGA 2EV0A 4IHSA 2HAUA 3VFZA 3I4PA 3PQJA 2YSRA 2A6EF 2VONA 3O2PE 4KYSA 3MVWA 3LUYA 3CR9A 1DPEA 1U2WA 1OVTA 1MY2A 2V3TA 2K27A 1EU8A 4P96A 4UHTA 2ZBKA 1LEBA 4Q47A 2DTRA 3SQNA 1TQIA 1MPDA 3QAXA 5TJJA 5A2QK 3WE3A 2OK2A 3OO8A 1I6AA 2NWJA 4N0BA 4LK0F 3T0YA 1G3WA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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