3FXRA

Crystal structure of tsar in complex with sulfate
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
296
structure length
296
Chain Sequence
MLKLQTLQALICIEEVGSLRAAAQLLHLSQPALSAAIQQLEDELKAPLLVRTKRGVSLTSFGQAFMKHARLIVTESRRAQEEIGQLRGRWEGHITFAASPAIALAALPLALASFAREFPDVTVNVRDGMYPAVSPQLRDGTLDFALTAAHKHDIDTDLEAQPLYVSDVVIVGQRQHPMANATRLAELQECRWAFSSAPRGPGAIIRNAFARYGLPEPKLGLVCESFLALPGVVAHSDLLTTMPRTLYERNAFKDQLCSIPLQDALPNPTIYVLRRHDLPVTPAAAGLIRWIQHHAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural studies on the full-length LysR-type regulator TsaR from Comamonas testosteroni T-2 reveal a novel open conformation of the tetrameric LTTR fold
pubmed doi rcsb
molecule tags Transcription regulator
source organism Comamonas testosteroni
molecule keywords LysR type regulator of tsaMBCD
total genus 86
structure length 296
sequence length 296
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3fxrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fxrA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fxrA03
5DCMB 2VONA 1URGA 1MXUA 2V9VA 4LVQA 4RGUA 1YCJA 2PI0A 4R74A 5J1DA 1BIAA 2QMXA 1LDJA 2PFBA 2P4WA 1N3WA 2MD5A 1I27A 4U7BA 4RS8A 5ICTA 1UCRA 3I5UA 1T2KA 1YTYA 1VFEA 2B3FA 1YW7A 4LB5A 1EH3A 2VE9A 1XGSA 1US5A 2R71A 5FTIA 3PPOA 3MFKA 3IKTA 2VBZA 2IP2A 3PUXE 5DYMA 3T22A 4KMUX 3COAC 1D5VA 1Y1MA 2XXWA 3HPIA 4M1VA 2XHDA 3HSRA 1B4AA 2XXQA 3KN3A 4NF4A 2D45A 3FV1A 5H8NB 4G8XA 2H25A 3IWZA 3VLUA 4EQQA 2QSXA 3WTYC 1MY0A 5D6FA 5H8HA 3EN3A 1FQDA 1ZMGA 3KLNA 2VHAA 3QYTA 2ZNYA 3ZN0A 1IRFA 5LOMA 1T0FA 3VEPA 5FO5A 1PUEE 3E6DA 2MA3A 3SHFA 1D4NA 3KP4A 4OIOF 1NL5A 3HSEA 4I02A 4P96A 4U7DA 5IT9Z 1HKTA 5CMKA 3F8MA 1ZREA 4OEUA 5ICGA 4AVPA 1D8KA 3S4UA 1B3GA 3C31A 3W9VA 5IT9K 4LMYA 1N76A 2HKOA 3HRUA 3KG2A 1KGSA 2H94A 1R7JA 2J5PA 1QPMA 4QF9A 1B1HA 1ZTYA 3SZTA 3H6WA 3BPVA 3ZMTA 2HEUA 3ZN1A 3J80K 2JT1A 1IUDA 1Q35A 3N4MA 4XKQA 5E1ZB 3Q26A 2MLKA 1Z6TA 3TO9A 5CVVA 3IRQA 3KBRA 4FEDA 4NF4B 3S9EA 2KIUA 2QUFA 2Y75A 3KN7A 4UNOA 2RCAA 3IOVA 3CUQC 1SQYA 1TBXA 2O6AA 5H8HB 5JFRA 3P7IA 1NMUA 4R1HA 3WGGA 3H92A 1JETA 1FBQA 3HRTA 3NEUA 4EXLA 1BM9A 4Q47A 2D2WA 1IXSB 5DVIA 1B5IA 3T5XA 3IOTA 3L9FA 3TTLA 3A3CA 2DWHA 5EHMA 4ZYHA 1R1VA 1LCFA 3LBSA 3FMSA 1SW4A 4FJPA 2ZCWA 5BOXA 4N9IA 4R75A 2Q89A 1YLFA 3RYPA 2P2AA 3F22A 1TXFA 3ZKKA 3EQ1A 3BPXA 4LZ5A 5DV5A 2NNYA 5I57A 2F2EA 4AB6A 1NNFA 4BDMA 2NS0A 1RUOA 3QU6A 1F4KA 1O63A 4DCYA 2XUBA 1DP7P 3JW4A 4I98B 4G7HF 3BZ6A 1PDNC 1BN5A 2P5LC 3V7RA 1IXCA 2TDXA 1SW1A 1K6OA 2XD2A 2J5OA 2PBIA 3PPRA 4PP0A 3R0JA 2PX1A 4A2UA 5LBQA 3IJXB 1AIVA 2UXNA 3C35A 1XT8A 4RB1A 4I01A 1R23A 3BOQA 1XC1A 4UVAA 2KJBA 1MQIA 3GFLA 3E6BA 4ISUA 3BP8A 3TEPA 4MH5A 5L3BA 4PETA 2F5EA 1G3SA 2QYOA 1FY7A 1GGGA 4H65A 2DWAA 4OFLA 2ESHA 1P92A 3H6UA 2GAUA 2O0YA 4ZECA 4WXCA 4HX4A 2A5YB 2NRAC 4GXOA 2PG4A 1FPQA 5ILSA 4Q0CA 1S29A 1FTOA 1FQEA 1IN5A 1MH3A 5I57B 3DLNA 1GHCA 3CRBA 4IO4A 4CGZA 3ISPA 1HSEA 3RY3A 1N0TA 4LQ2A 3UORA 4ND9A 5HS7A 3IO6A 3IOWA 3TOAA 4BXUA 2Q0OA 1VFDA 2M5WA 2DE3A 2ZNTA 3HOTA 4BH9A 2DQVA 3RYRA 1XSVA 2FBHA 4WK8F 1LVAA 5AIPA 2VE8A 3OD7A 3GWZA 4RAYA 3LSWA 4Z0IA 5HVQC 1OLCA 1HKSA 2DAOA 1J5YA 1Y4TA 4YICA 5DD4A 3T8TA 3HOSA 4IGRA 1MDMA 1B5HA 1A55A 1URDA 4EM0B 1PC3A 4CDGA 4U0YA 5ILVA 2G93A 3SESA 2XKPA 4XKPA 4G9YA 1DMBA 1WKMA 4XSZF 1Y4CA 1MY4A 3KFMA 1XVYA 4R6YA 5D8LB 3E6CC 2YJPA 3C33A 1OMIA 3VODA 1ZAOA 3QPTA 1N04A 4BDQA 2OCUA 2LF7A 2F34A 4HV6A 2O7IA 4HDVA 3TDZC 1U78A 4YMAA 1G3WA 2B0LA 4ELRA 3PMWA 4XRFA 1ON2A 4M9XA 3VXBA 4IVNA 3PUVE 3VFJA 5HBCA 4MTEA 2RVCA 2M1BA 2RV8A 2XROA 4B09A 3MP1A 2XX7A 4R79A 2QQAA 4UVCA 4JWOA 5CC2A 2H98A 3LC8A 5JK4A 3F6VA 2W25A 2Y84A 3BROA 1DPPA 2VODA 4PZJA 3KSXA 3R6UA 2XV4S 1MDMB 1BI3A 2AXLA 1MGTA 4I7HA 2A69F 3JTGA 4EGYA 1LNWA 2RQPA 5AA3A 3HHGA 5H20A 1UHMA 1MXXA 2ZYNA 1WRJA 3EYYA 4F29A 4KFCA 3JSOA 5I2KA 4MEXF 1S7YA 3V89B 1BC8C 1BP5A 1W5TA 2HS5A 4G7ZF 1KU9A 1V4RA 1IAWA 1U8RA 3DELB 4JDFA 3A3UA 2H09A 3DPLC 3FUZA 3MW0A 3UA8A 4P11A 3AAFA 5HDKA 4Y15A 4MTDA 2ZMBA 1O7TA 3T0YA 2I4CA 1ANFA 4YB7A 1XCVA 4PFTA 4KUMA 2F35A 3ZMVA 2KLFA 2ZXTA 3ZPLA 2F8DA 2P6TA 2DQRA 4OIRF 3I54A 1MXWA 1OVBA 1FTJA 1MRPA 1B40A 1D9VA 1DUXC 4GCVA 1MDP1 3NRVA 3CO6C 3U92A 2A6EF 1L3LA 3G3JA 1T39A 1BOAA 2DLLA 2QBYA 1TTYA 2CMOA 2O7UA 1W7PA 3OELA 1H9TA 1V3FA 4RY1A 3HHHA 1P1OA 1NNKA 2Z33A 2F7CA 1TNTA 2DVCA 2DW4A 1UB9A 1ZGAA 3FIRA 1O7FA 2HR3A 5I2KB 2Y48A 1A40A 4F7ZA 4BHCA 4OFJA 3TOBA 3C7JA 1A8EA 4LJZF 3LSXA 1LAHE 4ECFA 2CG4A 1MXZA 4GD5A 2FYIA 2FA5A 1R1UA 4K3FA 1ZRDA 1UTHA 2DI3A 1EZ9A 4HYEA 2A61A 2EFWA 3D5LA 4R9FA 1HSTA 1BIYA 4Q5TA 4RPOA 3JTHA 1ELJA 4Y17A 2PLYA 1MJ9A 2IA1A 1S50A 3OO7A 1IF1A 1IN8A 3H3UA 1WDNA 3T9HB 2QS3A 2QBYB 5HLHA 3FMRA 3R6SA 1W7PB 1I1SA 3IKVA 3ZP5A 3B02A 1II5A 1OQGA 2GH9A 1TQMA 3KJTA 3F8CA 3O3KA 3O66A 2W7YA 2Z23A 2F36A 4ZZLA 3WU0A 3B73A 1FQFA 1RI7A 3ZMSA 3FJGA 3N26A 4JSOA 3IX1A 2FNCA 3GLXA 2C6YA 4EJWA 2DOJA 3VVEA 2F6PA 1B05A 2NOOA 2QQ9A 1H76A 2QLZA 4OMYA 1WVJA 2A5TA 1R00A 2DT5A 2Y0MA 3R26A 5LRSA 1P1UA 4PE5B 4BHPA 4HX7A 1FZPB 2EFQA 2A68F 4PGHA 2YSRA 3P9IA 5K1YA 4M73A 1UTHB 2LAOA 1OPCA 4MQVA 3FF5A 1VR5A 3PPPA 4UV9A 4LA9A 5JEIA 1SFEA 3DKWA 3ERED 5HS8A 3RTWB 2PT1A 3TPAA 2Q2CA 3E3KA 2AL5A 2VBXA 3LWFA 3IL2A 3V8LA 1DDNA 2L01A 4MBPA 5CMBA 3SEWA 2DWJA 3HIFA 1MY3A 4IJAA 2YLNA 2ZNUA 4BAYA 1FX7A 4YFXF 2V84A 3HRSA 1P1NA 2FBKA 4UUVA 1FTKA 4U88A 2H4IA 2V25A 4MF3A 4C0RA 3E3VA 4UA8A 2VC0A 1H44A 3SXYA 5I58A 5JTYA 2PMSA 2QPQA 3O97A 2M8CA 3WU1B 2O6GE 4HLYA 2AIXA 3KSJA 1C0WA 1I6AA 3U93A 4KIFA 2I3VA 3O6BB 4OMZA 4OZ9A 4ELOA 1B6HA 2A5TB 1KYZA 3WTZA 3PMVA 5TRDA 3LR1A 3V8XB 2GHAA 2PMHA 1LFIA 5DD8A 4M4GA 1ONVA 1MDQA 1KQ8A 2ZBKA 1IXRC 3U94A 1FSEA 1JW5A 4XKRA 4EJUA 3KN8A 4BDOA 1LDDA 4M72A 3EF7A 3WE2A 2V6CA 4UV8A 3MZBA 2M45A 1PBQA 1BTJA 3RGYA 1SD7A 4F22A 1OR7A 2H6BA 4O3AA 3KZYA 5IAIA 3PQKA 1XVXA 2HFBA 4HA8A 4L18B 4H0EA 2M30A 4L5JA 3VFZA 2XASA 5HOOA 5A2QK 2RKHA 4TLLB 4F31B 2O51A 2REJA 3M8UA 1XSXA 1IIWA 4HLXA 1MY2A 2VOPA 1TT1A 4EM1A 3GZ5A 5I58B 4JXIA 5JTYB 4JSDA 3WAFA 3ONMA 1JQFA 4YKPA 3AXFA 3OENA 4ZEBA 2XXHA 2P5VA 3MEXA 3GO5A 1ZRCA 2QS4A 5FD5A 4G77A 3NQOA 3DXJF 2BEOA 3K4UA 2VGQA 2A5SA 3OO9A 3M8EA 1H3DA 2ZO4A 2I0CA 4C1UA 4GVOA 1RIOH 2Z99A 2OWTA 2B3BA 3RPUA 3O9PA 2Q2EA 2GXBA 3C3WA 2EWNA 3O6IA 4ZZEA 2ZJ2A 4X1BA 1ZGJA 2ACJA 1SDXA 3R60A 2HCAA 2RINA 3CVGA 3LQQA 4DE8A 1H0MA 4WXDA 5IKBA 3KP6A 4WF2A 1J59A 4NF6A 3L00A 5EYFA 3MVYA 3CFLA 1USYH 3OXNA 5KCJA 2VC1A 1STZA 3RTFB 1B1BA 2L3DA 4LK0F 5HM4B 4KFQA 1P1QA 3OEMA 1FT9A 5DUIA 3CFZA 2CZLA 2Z8FA 1IUYA 1FCKA 3KP5A 3MZ9A 3OOAA 3V7SA 4F1YA 4N9HA 2FMLA 4KICA 4IRGA 4AIHA 4NTLA 4OERA 1WI9A 4S05A 3BWGA 2G9WA 4F1UA 2KRFA 1TFDA 2VBWA 5M2VA 5D5UB 2ONRA 3T1BA 4U23A 4H5FA 1JW4A 1Z7ME 3FVKA 1LFHA 5AA1A 3FZVA 2Z9OA 2O61A 1J9IA 4TLMB 1O3SA 3I0TA 3H3GA 3H06B 1YAEA 3KCCA 2V3QA 1N7XA 4O3MA 3B6QA 2LF8A 1WODA 4BYYA 2HEOA 4XKNA 1FYLA 4NWCA 1QO0D 3N97A 3IB0A 3THIA 4HW0A 3U2RA 3TCFA 3KZZA 3IB2A 4NF6B 1NH7A 2FSWA 3LSLA 2OQGA 4KNYA 4ZS9A 4IHSA 2Q8JA 5KCJB 4U4XA 5L3EA 3TODA 3F3XA 2ELHA 4MLQA 4LLGF 2RC9A 4WXJA 1T38A 4GF8A 3EYIA 4LG0A 4PFWA 5L3GA 1DPUA 3TMGA 1QZYA 1Y3QA 2ZKZA 5FHMA 3CG3A 4EXKA 3MC2A 3K0LA 2Z8DA 3VB2A 3G7WA 4Q8RA 3WG9A 4A6DA 3H7MA 1FNNA 1TW2A 1FW0A 2W57A 4M9ZA 1XMAA 1JNFA 3T9VA 2XAQA 3IORA 3VV5A 2HYFA 3J80Z 5AA2B 1RNLA 3L09A 3ROUA 1B7UA 2BYVE 2HAUA 2P5KA 4GO1A 4IO3A 5CVUA 1SI0A 2DS9A 1NNPA 3T9UA 2W84A 3G3KA 4TOZA 2K02A 1FP1D 4H1XA 4ZYEA 4WKMA 1D9YA 2GQQA 2MH9A 3MVXA 3ULQB 3I64A 2E7XA 3OOPA 4G8HA 3F23A 4G6DA 4DDDA 1Z05A 2VOZA 1SD3A 2YPNA 3PD8A 1CGPA 5IT3A 3K6XA 3LUYA 2B65A 3TYHA 3GZ6A 3GUDA 1N3XA 3UGWA 1XHYA 3MUQA 1Q1KA 1GVCA 4LQ5A 1B6AA 5FHOA 4F19A 1HKQA 3K2DA 4LG0B 5JI6A 2ANJA 2RCBA 1J7KA 4OU0A 1ZN2A 2NWJA 2QZ8A 4DNCA 2ONKE 1B3LA 3OO6A 1TW3A 4Y13A 5KZTA 1W5SA 2F97A 3FMQA 3E4RA 3FVGA 3QIMA 4RXLA 1R6ZA 3VDFA 1WSUA 5ITOA 4CHUA 1J0RA 2ABHA 3H6VA 4KMFA 3VLVA 1UIUA 3I71A 2G7UA 3O29A 4I62A 4CO8A 3SKPA 1KU2A 3RLFE 4EQ7A 5CVIA 5LLQA 1ZYRF 1IQ7A 1HSLA 1UQWA 4JWYA 3EPEA 4YIFA 1R9LA 1Z1DA 3TTKA 3S9NC 4QFLA 1US4A 1SVXB 2UXXA 1ULYA 3E13X 3CJNA 2OZZA 5J8FA 2UVIA 2WKYA 3K6VA 3R4KA 4PCQA 5ISUA 5CMMA 3QUFA 3I5OA 3K00A 4NF8B 5EHSA 1ZU0A 1HW5A 4U21A 3FJMA 2VD3A 2YPRA 1DTGA 2GFEA 4E0WA 4OHNA 3BY6A 3DF8A 4FATA 1YPNA 3K1NA 1PP8F 2IPQX 1R9QA 3FXQA 1PB8A 2Y7KA 4OXVA 3I3VA 4LONB 2VN2A 1I6QA 2HAVA 3GX4X 3C34A 1MS7A 3DEUA 3LA7A 4EMSA 2JZYA 1O3QA 2L54A 2K4BA 3SDFA 3U72A 2Q88A 4ONYA 3G3HA 4U4SA 4I9DA 4BLAA 3S2VA 3MWMA 1KU7A 1M5DA 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