3FXRA

Crystal structure of tsar in complex with sulfate
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
296
structure length
296
Chain Sequence
MLKLQTLQALICIEEVGSLRAAAQLLHLSQPALSAAIQQLEDELKAPLLVRTKRGVSLTSFGQAFMKHARLIVTESRRAQEEIGQLRGRWEGHITFAASPAIALAALPLALASFAREFPDVTVNVRDGMYPAVSPQLRDGTLDFALTAAHKHDIDTDLEAQPLYVSDVVIVGQRQHPMANATRLAELQECRWAFSSAPRGPGAIIRNAFARYGLPEPKLGLVCESFLALPGVVAHSDLLTTMPRTLYERNAFKDQLCSIPLQDALPNPTIYVLRRHDLPVTPAAAGLIRWIQHHAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription regulator
source organism Comamonas testosteroni
publication title Structural studies on the full-length LysR-type regulator TsaR from Comamonas testosteroni T-2 reveal a novel open conformation of the tetrameric LTTR fold
pubmed doi rcsb
molecule keywords LysR type regulator of tsaMBCD
total genus 86
structure length 296
sequence length 296
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3fxrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fxrA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fxrA03
2V1UA 4KIBA 4FX0A 5FLXZ 1NMUA 5AA1A 5E1ZB 5E20A 4L17A 4NF5A 1YLFA 3MPLA 5L8DA 3CG3A 3K6XA 2O03A 4CDGA 2O69A 1FPQA 3HOTA 1Z7UA 3K02A 2QS4A 3QXMA 3MJNA 2XD2A 4P9FA 2DWHA 3OEMA 1Y3QA 3PPOA 5CRYA 4ZZEA 3KSJA 3KZYA 3Q9VA 1O3SA 5KDTA 1DPPA 3DXJF 1XMKA 3LC8A 1PDNC 1R5GA 5H8QB 3JAMZ 1Q1KA 3PUXE 3SEWA 4F39A 2UVGA 4LGWA 3N4MA 3EHTA 4YKPA 4JK1X 3T96B 2BEOA 1P1OA 4MTDA 5HS8A 2AXLA 3RT8A 4YAHX 2D1VA 5E17F 3V7RA 4G6QA 4F18A 1LJ9A 2AL5A 2PT1A 4EVIA 2RGVA 4XLNF 3KN8A 1H9TA 2QPQA 1N0TA 4OMBA 4FATA 4DXUA 3MQ0A 2DWAA 2P5VA 4ELRA 3ZMSA 1W7PA 5CJ9A 3K0LA 1N84A 1JEVA 5B7DA 4XKPA 2YJPA 4TLMB 2O61A 2FF4A 4U0WA 4JSOA 3LSWA 2VXZA 1FTMA 3DP6A 5KCJB 3TKYA 3MZ9A 1NHAA 2OZ6A 2ONSA 2LF7A 5I58A 4UV8A 2F5FA 1MXZA 3PUYE 2VONA 3ML6A 4EM0B 4N9HA 5IT9Z 4M9ZA 4HX8A 4A0YA 1L3LA 1EH8A 2F34A 4LB6B 4S05A 3PMVA 1H44A 4YFNF 5H6RA 2R3SA 1H0MA 3SQNA 3C18A 3U2RA 4HCYA 4ZEKA 3U1DA 3DPLC 2OQGA 1MXUA 2RNJA 4ZZDA 3ZPLA 3KP6A 2XXRA 1LNWA 1O7FA 1SW5A 4ND9A 1ZLQA 1TFAA 4UVAA 1PP7U 4KIGA 3RDIA 3ZN0A 1UFMA 2W85A 3PD9A 4L18B 2E7XA 3VVEA 1MXYA 5BQTA 2FBHA 4IO3A 1G3WA 1Q1HA 4AQ4A 3CSGA 1SMTA 2G93A 1FQEA 3U9GA 2PJPA 3LA3A 3PFIA 3O6HA 2P6TA 1IXHA 4EGYA 3OOPA 4HV6A 4RS8A 4ZYEA 5ITPA 2ZNTA 2XIGA 3KETA 1LSTA 2ESHA 2EV6A 1YS7A 3Q25A 1WSUA 4N07A 1RI7A 5M2VA 3RTFB 3RNNA 2RF1A 4LLLA 3KSXA 3V8JA 2DSFA 3BJOA 2YSRA 5HOOA 5DD4A 2Y7WA 1UHMA 3VDFA 3IC7A 3NRVA 2ZYNA 3C3WA 4QFLA 1EZOA 5H8FA 1S8NA 3H92A 1OPCA 4EF2A 1B1HA 4UNOA 3FJGA 2Y48A 1Z7ME 3K2ZA 2F5EA 4H1XA 3CTAA 3E5UA 3F6VA 1B5IA 5F7VA 1VR5A 4R72A 1LFHA 2V9VA 3IO6A 1USYE 1ZGJA 4AWXB 2OCUA 3N97A 4UV9A 4RNSA 5FHMA 2V3UA 3MW0A 2FRHA 3ECHA 3EF7A 1R22A 2H6CA 1VE4A 2C6YA 2XXVA 2VD2A 4FHTA 1RUOA 3F72A 1PUEE 1FP2A 4HZFA 2A69F 2ZYMA 1B2HA 3RKYA 1OYIA 4OVJA 2XUBA 2PQ8A 3D5LA 3FVGA 1ZHFA 4R6YA 1OVBA 1QPMA 2K7LA 1S7AA 3RT6B 5CYVA 4Q48A 4E0WA 3QU3A 1GVCA 5DEQA 1MXWA 3QRFF 4G8HA 4H0WA 5FD5A 1SI0A 4OHNA 4KICA 3ELKA 1B58A 1CF7B 1B1BA 3SESA 2P8TA 3JSPA 3SDFA 1HKQA 3LBSA 2LDUA 4PGHA 5H8NB 1Y1MA 2G29A 1O3RA 1QKBA 1A8EA 3IL1B 3E5QA 2A5YB 3SEVA 2M8CA 2JT1A 1N3XA 1B6AA 1DMBA 3ZMVA 2A5TB 1UHWA 2G7HA 4BHCA 2G9WA 2GA1A 4O3CA 3DM0A 1GVJA 2IT0A 3OSRA 4A6DA 2CYYA 4OEUA 4G7HF 1ANFA 3O97A 5TP9B 2K86A 1IXRC 3LAPA 1BI3A 2XXWA 4XTCQ 3V7CA 3RKXA 5K5RA 1IIWA 3WU1B 4F3BA 1MPBA 1GR2A 3GW2A 3N94A 3WG9A 2DQVA 2DFIA 1JHHA 1LB9A 4IO2A 3ZMTA 1B7HA 1N7XA 4I1DA 2BGCA 1Y3NA 4PDKA 5H8HA 4Q30B 1CE2A 2LSOA 2UYFA 3TPAA 1A8FA 4P9UA 1JQFA 5CLSA 3JYRA 4DDDA 2V6CA 3KOTA 4QFKA 1B40A 2OWTA 3MBPA 4E70A 2BE5F 5KDTB 2XX7A 1R58A 1IN4A 1XDUA 2NAZA 3VE1B 4FAJA 4I62A 4G6DA 4RY1A 2IW5A 1SW4A 4HS7A 3IKVA 4BDRA 1NL5A 3HSEA 1J1NA 4ZEIA 3WTTC 3LSLA 5I2KB 1R1NA 4GXSB 3M7GA 3CLOA 3T5XA 5D5WB 5CMKA 3ECRA 3CFLA 4MNUA 3USDA 1UCRA 1W7PB 3RKWA 2X7PA 4G8XA 2F36A 1R6ZA 4CZZA 4JBZA 4L9NA 4OXVA 3S9MC 2O7IA 2Z8DA 5BOXA 1BN5A 2OD5A 3LA2A 1XVXA 1QW0A 1BC8C 1DP7P 5I58B 5D4RA 2O1MA 4KI0E 3NEUA 1SYIA 2ISZA 2R6GE 5I84A 5JTYA 1AOYA 2XXPA 4NQWA 2GHBA 2BV6A 1X3UA 1BTJA 1SBPA 5DVFA 1FQDA 3FXUA 4MLQA 1WDNA 2O51A 5HM4B 4LQ5A 2GRVA 4EV0A 4ZDMA 4M4GA 2KIUA 1I27A 2PMUA 2WC2A 1Z6RA 3EQLF 1NNKA 1A55A 3BDDA 2Z8FA 4I02A 1MXVA 4FEBA 1OQHA 2I0BA 1R1VA 4MBPA 3PUVE 2XRNA 2JPBA 3QK6A 3I5OA 3RI4A 3COAC 2PFBA 1N04A 4FECA 3MWMA 1P2FA 2I48A 2XAQA 1MPDA 2P7CB 1XDSA 3HN0A 1TT1A 4LZ8A 2PX1A 4X1DA 1BP5A 1OLCA 3W9VA 1DPRA 4FORA 2GWRA 1MM7A 1FTOA 3IL2A 1IQ7A 5CVVA 2F7CA 3KJTA 3ROUA 3L6HA 2XKPA 4ZZAA 2Z33A 3R0JA 2X7QA 3HO7A 1B5HA 2E0SA 4HTGA 4YB7A 2DOJA 3TOBA 3ISPA 1B9MA 4F29A 3WODF 1ZRCA 3Q29A 1HW1A 2RN7A 1T6SA 1QUJA 3IOWA 3HTSB 1YPNA 5KZTA 3TQLA 2GXBA 1LLSA 2EFOA 4PZJA 1USYH 1J9IA 1J75A 1T98A 2ZMBA 1T0KA 4RK2A 3DLNA 5H8QA 5JEIA 4R79A 2EV0A 4AIKA 2O8XA 1U5TC 2O3FA 4OIOF 1BI2A 4R2FA 4P0IA 1A04A 3F21A 4BLAA 3G3ZA 4PFWA 4RYAA 2XX8A 4U21A 2IJLA 5ILVA 1I6QA 3CI8A 1LBBA 1S50A 3TKDA 4M1VA 4F3GA 5FTIA 4I0BA 2K02A 1JNFA 2HYGD 3S2WA 4RA1A 3WGHA 1IXCA 1XGOA 4EUOA 1B4AA 1WWXA 1M5EA 2XXQA 3WAEA 3R6UA 1QKAA 3ILUB 3U93A 1UB9A 3WTUC 1BI0A 2XXUA 3DKWA 4YICA 1F1ZA 1PB8A 3OO9A 1T39A 2ZYKA 3FIRA 5KCJA 4G7OF 2P6SA 1MY0A 3H3UA 3LQRA 1URSA 3QPTA 4YKIA 4OZ9A 2XVCA 5ELVA 3E5XA 3WE3A 4WXHA 4R6HA 1P4AA 4U2RA 3OD7A 1MS7A 2PYYA 3IB2A 2RC9A 3K0VA 2QM3A 3H7MA 3M3FA 2DVZA 1XGNA 2NYXA 3R26A 2HFHA 2Q88A 3QAXA 2GQQA 2L54A 1T2KA 1ZMGA 3F11A 1I5ZA 5J8FA 1DTZA 1K7AA 2KRFA 1YTYA 4MH5A 4LONB 4ISUA 4OFOA 2KLFA 1FCKA 2WWYA 4OMZA 4PCQA 2F6PA 3IJXB 2Q2CA 4KUMA 3GF2A 3TDJA 3L09A 1QUKA 3BFUA 4OINF 5CBRA 4HYEA 2H98A 4A2UA 1N76A 4LUBA 5DEXB 4DCXA 2CW0F 3C1DA 2THIA 3U72A 2P1SA 1F9NA 1S6LA 3IB1A 2PEXA 1FBSA 3H6UA 4G77A 2CWEA 1NNFA 5FGMA 2FNPA 4QFOA 5B70A 1ELJA 3LSTA 1UTHA 5F6FA 3VXCA 3MZ1A 4U1OA 5LHHA 1MY1A 3OMBA 1OR7A 1SD5A 4XKQA 4BQAA 2XV4S 3GUDA 1MDQA 4KYSA 1D4NA 4Z7EA 5H8HB 3LUYA 3W6KB 3Q5FA 1IXGA 1B52A 5LHIA 3U8QA 1ZLJA 2IEEA 2MA3A 1ZU0A 1Z05A 3RLFE 3JTHA 2HDCA 1EU8A 2MH2A 3J7AO 3FHZA 2W57A 5L3CA 3K6UA 4U22A 3BP8A 2ZKZA 5HS7A 2PI0A 3VLVA 5CVJA 5ERIA 1TW2A 2GXGA 3IR1A 2YX4A 2UVIA 4HF2A 4ZYGA 1RKMA 4XSXF 1D3KA 5D5XB 2Z3YA 3J81K 2NS0A 1ZKBA 3JAMK 4XKRA 2FA5A 4QHQA 2UVJA 3P9KA 2DVCA 3ILTB 2ETHA 3D0SA 1Y4TA 3DFGA 4KT5C 5AA4B 2DO7A 2AS5F 5DCMB 3I64A 2D21A 3GX4X 3LSXA 5CM6A 2L4MA 3KOSA 1JVXA 2XX9A 4K2EA 1MDMA 3R60A 4OIPF 1VFDA 4NF8A 4NEDA 4Y15A 3KZZA 1LCFA 4ZEFA 4F31B 2QMXA 3PUZE 3JW4A 4MEXF 3WTSC 1P6RA 1S9TA 3DP7A 2GHAA 3VVFA 5F64A 2D5WA 3D4GA 2VOZA 5H8NA 2J5OA 2OBGA 4ZE8A 2F6GA 2O84X 2I3VA 1ZARA 3THIA 3CUQB 4GOTA 3UORA 1M5DA 3IWZA 3IWFA 2ESNA 1MPCA 3ZSFA 2ELHA 5AIQA 4HF1A 3MVXA 2Z9OA 4AIJA 2A3SA 1B7ZA 1FBUA 2GIVA 5TPAA 3MVYA 1AOVA 4IY5A 3K01A 1G6NA 3QOPA 2V79A 1O3TA 2A07F 3MWBA 1I69A 4IRHA 1U6GA 3GLBA 3FMQA 2M30A 4G68B 1P1QA 2JRTA 4WK8F 4JBAA 5LLQA 1ZTYA 1DPUA 3OELA 1TTYA 3RTRA 3F8CA 4IY6A 3L2CA 2FA7A 1IN6A 4TV7A 5LGTA 5BS6A 3GFMA 3J81Z 5DT6A 1FX7A 2DE3A 2UWMA 3WTWC 4KN4X 3SZPA 1KA8A 3SEYA 3L9FA 3N26A 4JDFA 2XHDA 3VV5A 1FP1D 1QNTA 4XRFA 1B0LA 3V8LA 1M5FA 4G7ZF 2A5SA 4O3MA 1NNPA 2QJEA 4OYVA 5I2KA 1KQ8A 4C1UA 4ZH4F 2YR2A 1RIOH 2QWWA 4HDVA 1ZLKA 4D0PA 1CB6A 4GWOA 4R2BA 1BM9A 3MFKA 3MEXA 3RGYA 4BHPA 2X0LA 1P1WA 2HKXA 3V89B 4IVNA 1LGBC 2W84A 2RINA 1LB8A 3F8BA 3CFXA 4EXKA 3PMWA 4EJTA 4MF3A 1REPC 3KEIA 1I6XA 3IRRA 4MQ9F 3OO7A 4POWA 2M8EA 1G3YA 3ZMUA 1SMYF 4I2OA 4RAYA 2XXYA 4UUVA 1ZIUA 3QUFA 1SD3A 3GLXA 3MAMA 4LVQA 1D9YA 3S9NC 1B51A 4G8MA 5ICFA 4RB1A 3C36A 3EHSA 1QO0D 1XCBA 1AIVA 4NTLA 1D9VA 1S3JA 3HRMA 1B32A 2VC1A 3ABUA 3FM5A 4IO4A 4HLXA 4RPNA 2UYEA 4JWYA 2CG4A 4BH9A 5AA2B 4O6JA 4A5NA 1QVSA 3ZMDA 2EFPA 1HXDA 4I7HA 3F23A 5K1YA 5AIPA 4NWDA 3QP5A 1S29A 3FXQA 1XB4A 2F97A 2XXTA 4MGRA 2ZFWA 4KMUX 4LZ5A 3H03A 4Q8RA 3ECOA 1LBCA 3T8TA 3WTYC 5ISUA 2VOOA 1ZH5A 3FASA 4OMYA 3MCZA 4RGRA 3E6CC 3B7DA 3IJOB 4BDNA 5CC2A 1R23A 4LMYA 2DAOA 2HAUA 4O5VA 4F2QA 4WXCA 5ICEA 1BIAA 5JHUA 1QJMA 3SZTA 5FD6A 1P99A 1UTHB 2EA4A 3TELA 2ZMEB 3BPVA 4CO8A 4ZEBA 3FVNA 1I6AA 1KU9A 1UIUA 5DYHA 3G3HA 1PB9A 1F4KA 2MD5A 2OQRA 4QFNA 2HZTA 4HQMA 2XROA 3HRUA 4YB6A 2Y7RA 3ZS6A 1D5VA 1U8RA 4GLIA 4GCVA 3FMSA 1UTBB 1FW0A 4UXNA 2KJBA 3G3FA 3R7XA 4N13A 4WF2A 3EYIA 1B3HA 2IA2A 1VSOA 1LCTA 2PMHA 2PG4A 5DTBA 4H67A 1LAHE 2ZNZA 3F3XA 3FGSA 3HPIA 2MLGA 4WWCA 3QSLA 1R9LA 2VGQA 5LGNA 2HFBA 3FVKA 2IA4A 3RPQA 1SDXA 5LOMA 1B3EA 2B0LA 3CDHA 2AIXA 1F9BA 5A2QZ 2VBZA 2QENA 4I8CA 4F1VA 1BC7C 4X48A 5I59B 3LFKA 4M74A 4U88A 3O66A 4R74A 4R9GA 3SEXA 1MDMB 4NF8B 3TZAA 1MXXA 4C0RA 4IF4A 2RCAA 5AA3A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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