3FXUA

Crystal structure of tsar in complex with its effector p-toluenesulfonate
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
296
structure length
296
Chain Sequence
MLKLQTLQALICIEEVGSLRAAAQLLHLSQPALSAAIQQLEDELKAPLLVRTKRGVSLTSFGQAFMKHARLIVTESRRAQEEIGQLRGRWEGHITFAASPAIALAALPLALASFAREFPDVTVNVRDGMYPAVSPQLRDGTLDFALTAAHKHDIDTDLEAQPLYVSDVVIVGQRQHPMANATRLAELQECRWAFSSAPRGPGAIIRNAFARYGLPEPKLGLVCESFLALPGVVAHSDLLTTMPRTLYERNAFKDQLCSIPLQDALPNPTIYVLRRHDLPVTPAAAGLIRWIQHHAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription regulator
source organism Comamonas testosteroni
publication title Structural studies on the full-length LysR-type regulator TsaR from Comamonas testosteroni T-2 reveal a novel open conformation of the tetrameric LTTR fold
pubmed doi rcsb
molecule keywords LysR type regulator of tsaMBCD
total genus 90
structure length 296
sequence length 296
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3fxuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fxuA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fxuA03
5ICEA 2FBIA 1Y4CA 4UVBA 5HS9A 2F35A 1WKMA 1B4AA 2PQ8A 1DPRA 1TBXA 4U4XA 4Z2YA 1O3QA 4TV7A 2P6SA 2DAOA 3CG1A 2L54A 3Q28A 5H8QA 5EEGA 1YIOA 2DWAA 1FWZA 1GXPA 4YKKA 4WEPA 3MAMA 1PDNC 2V25A 3KP6A 2QYOA 4HLYA 2OQRA 3SQNA 1YW8A 1M5DA 1MQJA 1FQFA 2AIXA 3L6GA 3IOWA 4F1UA 4YFXF 1LAHE 3EDPA 1P6RA 2DQLA 1MZBA 3EHUA 4U4SA 2IP2A 2VONA 1B3HA 3KFWX 3WTXC 1LCFA 5D4RA 3TO9A 3FXUA 4WX9A 1ZG1A 2FNCA 2G9WA 1WI9A 5H8QB 3P9KA 2WTEA 4Q5SF 2P0SA 4ZZLA 1CB6A 1JETA 3WTWC 1QGPA 4I62A 1ANFA 3CR9A 5CI5A 3MVWA 2XX9A 4P96A 4MFIA 2VHAA 3OO9A 4R1HA 2OBGA 2QM3A 3ABUA 2XAHA 1P1UA 2NRAC 1F4KA 1EH3A 2O51A 3HOSA 3VOEA 1Z7NE 1BIAA 3JTGA 4PDKA 3QOPA 2I3VA 2MLGA 1BIYA 3ZPLA 4X48A 1FQDA 4GVOA 3F6VA 4WCGA 5AA2D 3QP5A 2HZTA 2HYGD 5D6FA 1V4RA 1ZU0A 3LSFB 1DDNA 2IA4A 3O66A 4KYWA 2D2WA 3N6UA 4AB6A 1OLCA 2HWVA 3V83A 3KFMA 1BI1A 4QFLA 2TDXA 3WTYC 1SYHA 2BE5F 2ZFWA 1HW5A 3B02A 3MCZA 5ERIA 2ZNZA 3F11A 4U0WA 3DPTA 2D1VA 2VBZA 2XUBA 3JAMK 1ZMGA 4L9VA 3T96B 3E6MA 5L9OA 2NVUB 4CICA 1Q1HA 3FV2A 1B3FA 2DTRA 5LGTA 1S9TA 4NF4A 1XVYA 3JYRA 5BPDA 3KCCA 4G7ZF 1MRPA 3L09A 3ROUA 1POTA 4U22A 5HS8A 1TT1A 2VBXA 2W57A 2ELHA 5HDNA 4ELQA 1YPNA 3UP9A 4U2RA 3DP4A 1YQAA 3WTUC 2UVGA 4OTEA 4QSDA 1LJ9A 2GHAA 3KOSA 2A69F 4M9SA 3N5LA 2AL5A 2PVUA 3HTUA 4A0ZA 1JHHA 1MPCA 4FEBA 4F31B 3WGIA 3JW4A 2OBPA 4EGYA 3LFKA 4OIQF 1Y3NA 4BDQA 5IAIA 4NF4B 2ZJ2A 3IRRA 3QAHA 4KHZE 4CYDA 3LBSA 2V3QA 2REGA 3AAFA 4DXUA 2EK5A 3FV1A 5FLXZ 4LK0F 3SETA 3H3ZA 2X26A 3U1OA 1UIVA 3VDFA 3REOA 2O7IA 2HGCA 3MUQA 3FZVA 3UGWA 1XSXA 4ON0A 3MVZA 5FGMA 1FX7A 3OO6A 2KIUA 2QUFA 5CVIA 3I71A 1XDUA 4A2UA 4OMBA 2QL3A 3ZMSA 3SZTA 4GCVA 3OMBA 4GO1A 4JQFA 1Y0UA 1US5A 3WGGA 1R36A 5FD6A 5LHHA 1IXSB 5FHOA 1BI3A 2CW0F 2YX4A 1SW4A 1P99A 1N76A 5JI6A 2DXRA 2AS5F 1O64A 2LAOA 3FGSA 4LB6B 4G68C 4ZECA 2F5EA 2NUVA 3V7SA 2O1MA 2Q9TA 3B7DA 1P1QA 1B1BA 1WWXA 5HDGA 1O7FA 1WQ2A 1E17A 5LBQA 4HOBA 1ZAOA 4G94A 3TZAA 1QQIA 3SFZA 1ZRFA 4Q47A 2OZUA 1M5BA 2X4HA 2RCBA 4QFPA 4XIGQ 5CBSA 3I54A 4TLLB 5H8SA 3TEPA 1CE2A 4HX8A 3TOBA 2V1XA 5DYHA 3FX3A 4GGGA 3MPLA 2BBYA 1B52A 2FQ3A 4EJUA 3IL1B 4I2OA 4K3FA 3G3HA 2P7CB 2XRNA 4POXA 4X1BA 4O3AA 3VV5A 2DI3A 4HDVA 5IKBA 3CJNA 2M45A 1OQGA 1LAFE 2DO7A 4OZ9A 2O68A 1HW2A 2MA3A 5JFRA 4F29A 4L0YB 2F6GA 1JXSA 3H6UA 4AVPA 3TCFA 5LEKA 4L17A 5I57A 3FIRA 3FJMA 2Q2AA 4KYDA 5LOMA 3OD7A 2EV0A 3BOQA 4KN7X 4JSOA 4BLAA 4I0BA 3S9LC 3IOTA 1MM6A 5EHMA 3G3IA 1SW5A 4WF2A 4UVCA 4IRIA 5DTBA 1OMIA 5BWJA 1G4DA 2YU3A 1QO0D 4QWQA 3J7AO 3QPHA 4RGRA 4KIBA 2UWMA 1D4NA 1R1NA 4OWDA 4MQ9F 2ANJA 3C36A 2DBBA 5I57B 4WXHA 5BQTA 2Q0OA 4TLMB 3FJ7A 2QS4A 2HR3A 2YLNA 2PLYA 4BDOA 5FO5A 5K2XA 2Y84A 1SFEA 4M74A 2RC8A 4GF8A 5I84A 3VFZA 4RY1A 1E2XA 1Z6TA 3K69A 2OAZA 5A2QZ 1SFUA 3OENA 3RT8A 1VR5A 4LUBA 3PUZE 4YKIA 4QFKA 1YS6A 1IAWA 3JZJA 1TW2A 3CUQA 2D1HA 2A5YB 1FZPB 4HQEA 1WODA 5F64A 4GL0A 4WEDA 1T6SA 4RAZA 1FNNA 1JQFA 4HF1A 3R0JA 4XXUA 5KCJA 1SI1A 1U78A 4EJOA 3LSLA 1S7OA 2HAVA 4S05A 5CVVA 3TTLA 1SD6A 3GO5A 4EM1A 5ICGA 4R9GA 3FF5A 1O7TA 3Q25A 1R00A 1DMBA 1EU8A 3CVGA 3TCGA 3VVDA 2DYXA 1FSHA 2ZNUA 4U23A 1LB8A 3CUQB 3CO6C 2P2AA 3SDFA 2XAQA 2NNNA 2E1SA 1BOAA 4G8NA 2ZCWA 4ZYDA 4LJZF 3BFUA 4F1VA 3TKDA 1UIUA 5KCJB 1LCTA 4AD9A 4PZJA 4GLIA 1L5TA 3QU3A 3KEOA 4A0YA 3F21A 4BQAA 2DLLA 3SERA 2P8TA 3KP5A 3KG2A 5AIPA 2A5SA 3MFKA 3M3KA 2VE9A 4IB2A 3KZGA 2R9JA 4ZEFA 1Q1KA 5CMBA 2ACJA 4KNYA 2L4AA 2KLFA 3FATA 3FASA 2GRVA 3DKWA 2OK2A 2RC9A 2HKOA 1MY3A 1XCBA 4AIKA 2QQ9A 3IWZA 3HCQA 3D4CA 3ML6A 5M2VA 2XX7A 4UV9A 1QULA 5ILSA 3DP7A 3GEZA 1LNWA 4BDLA 1I6XA 3PPPA 4FAJA 4WXCA 1HSLA 4G6DA 5FFZA 5AIQA 1J2XA 5D8LB 3MQ0A 3J80K 4EM0B 3GZ5A 3RYRA 2ETHA 3PD9A 1N3WA 3L9FA 1TQPA 3K1NA 3C7JA 1LDDA 2YPRA 1MY4A 3OELA 3C32A 4P9FA 4P0GA 3N4MA 2OZ6A 5ITPA 1UHMA 1P92A 3FD3A 4JBZA 4LQ5A 4N0BA 3CG3A 2HKXA 4G4PA 3O6BB 1R1VA 3R4KA 2F5CA 1HSTA 2D5WA 5L8DA 3HYIA 3P7NA 3TMGA 3IOUA 4ESJA 1H9GA 1W4MA 3ZMZA 1Y1MA 4LQ2A 3KJTA 3RNNA 4LA9A 1H44A 2F97A 5D5WB 5ED4A 4TOZA 3Q9VA 1XMKA 3TPAA 3L00A 3C31A 1IXHA 1Z6RA 1AIVA 1B3LA 1MD0A 1SVXB 2UYEA 3HOTA 5F6FA 2O1LA 4YU0A 2I0CA 2J5PA 1VTNC 1PC3A 1RIOH 3E5QA 3BPVA 5BPIA 1M5CA 1SW2A 2DVZA 2VP1A 1AMFA 2CZLA 3F8CA 3GLXA 2YX7A 1O3RA 2YR2A 1QVSA 2DE3A 4KR5A 4OESA 1O3SA 2DQVA 3V7CA 3WTSC 1USSA 2G7HA 1LFIA 3ZKKA 5E1ZB 1T38A 2HDCA 4ELPA 3USDA 3EF7A 5DD4A 3D5LA 2YPNA 4DZ1A 4U0YA 2NOOA 4IO2A 2HFHA 3K1MA 2DPUA 4XKNA 5E17F 3RT6B 3GUDA 4L0ZB 2MH9A 3JTHA 3F8NA 2GAUA 1JW4A 2NAZA 3M7GA 3IJXB 4XLPF 2ZYMA 3WAEA 4OHNA 4CZZA 3PMXA 3GXOA 3UORA 1SFXA 3O97A 3A09A 5BMZA 3TQLA 1J5YA 1V3FA 3IK6B 2AYSA 3IB2A 3EETA 2X7QA 2RDPA 4ZH4F 2DK5A 1QZYA 3MQ9A 3BFTA 1SD3A 3E97A 1MXZA 3VB2A 1FQCA 3GFIA 3ZQ7A 1ZG3A 1HKQA 1UB9A 4ZZDA 1RNLA 1LSTA 5L9SA 3V8LA 3FXQA 1JW5A 3RQTA 1X3UA 3DQVC 3M1EA 3E6CC 5H8NA 2V9VA 1DPUA 4UHTA 3DV8A 2A3SA 5DD8A 4ZS9A 1OMPA 1L3LA 5L3GA 2BJJX 2OLBA 3KZZA 4OINF 1T98A 1UTBA 3I3VA 3MW0A 4LMYA 5E20A 2JRTA 2UYFA 5H6RA 3B6QA 3I5OA 3R0AA 2I49A 4A6DA 2F34A 5H8NB 3IAZA 4H65A 4KQPA 1XOCA 1KA8A 4HF2A 1XC1A 1R5HA 3ZMTA 2G29A 2H4IA 5CLSA 1FC3A 3P9IA 3CSBA 4FIMA 4K2EA 1MQHA 4KFQA 1FBQA 1KQ9A 3WU1B 4OU0A 2FEZA 2QENA 1UTBB 3DELB 4MF3A 4PGHA 2H94A 3SKPA 2NXOA 2VXZA 2Z3YA 3T5XA 1IXCA 3E6BA 4BYYA 4Q48A 3GXAA 3ZS6A 2JTVA 4LATA 1I5ZA 2XV4S 4DXCA 4HCYA 4JSDA 2O69A 3IORA 3UN6A 3HPIA 4RJZA 5CRYA 3CO7C 3T8RA 4L18B 3OEMA 1RKMA 1B05A 3C35A 3T9HB 4MBPA 4GYIA 2Q8KA 1B6AA 3GX4X 2MH2A 1NKXA 2VE8A 3JAMZ 1W5TA 2HTJA 2KIMA 4ISUA 2Y48A 2Y75A 4FEDA 3OOPA 1IXRC 3FMSA 3C4MA 1Z1DA 4R75A 2PT2A 2Q8JA 3T66A 1B7UA 2ZXTA 2H9BA 3ZP5A 1S8NA 1SQYA 3HIFA 3TDZC 4H5GA 1IN6A 2K27A 2Q2EA 5ICQA 1B7ZA 3MC2A 3OSQA 2JPBA 5BOXA 1MY0A 4KI0E 3H03A 3ONMA 2X7PA 2Z8FA 1YLFA 3CDHA 1NL5A 3GYHX 3T0YA 5L3CA 3PPOA 1XHYA 3MP1A 2A5TA 1NH8A 4OFJA 2HYFA 4YZZA 1URSA 5J1DA 2RC7A 4OFOA 1OYIA 1UHWA 2ABHA 3U9GA 3S9NC 1QW0A 4CGZA 4HS7A 3HSEA 3WODF 2RINA 2Y7KA 4KCDA 1LB2A 3GF2A 3RTFB 3TDUC 4YAHX 2YJPA 1XCVA 1H76A 2ONSA 1F9BA 3MP6A 5JVTA 2RKHA 1KU9A 1ON2A 1FTJA 1B1HA 4RPNA 2A5TB 4KYEA 1RYXA 2LSOA 4EQBA 3K6XA 3MZYA 4FE8A 5JEIA 4H67A 2BGCA 3DEUA 3PQKA 2XVCA 1J59A 4KPTA 4HDUA 3SZPA 4N07A 1Z91A 4JXIA 4RPOA 1TQMA 3WE3A 1U3EM 2XGXA 1R22A 2H6CA 4ZYHA 3RLFE 1ZLQA 2PYYA 5FHNA 2E7XA 4XLNF 1QPMA 3KP2A 4KMFA 3EPEA 1ZYRF 1BI2A 2FNPA 3K00A 5L3DA 4Q30B 5HBCA 4PGGA 2DE4A 2HCAA 5L3EA 5DUIA 3MP8A 3WGHA 3OV8A 2ISYA 4UA8A 3QSLA 1MPBA 3UIFA 1B5IA 3S2VA 5HLHA 4DCYA 3ILUB 3KE2A 2JPCA 3IL2A 1XGSA 2EFWA 2F8DA 5L9MA 1JHFA 2OWSA 2J5OA 1P4AA 5FFXA 4PFTA 2DS9A 4P55A 3EN3A 3PPQA 3RPWA 4HQMA 4ONYA 4GIZA 4YFKF 2CG4A 1U6GA 1IEJA 2F36A 3K2DA 1QUKA 4G7HF 1XN7A 3OXNA 2GIVA 5K5OA 1H3DA 1CF7A 2WWYA 2B3BA 2RC4A 5JHUA 4FATA 1POY1 3P9CA 1T0FA 1W7PA 2FXAA 2CQKA 1LLSA 4KN4X 3IO6A 3CFXA 4POWA 3H7MA 3PMWA 5FTIA 3O6HA 1JVXA 2A6HF 1FQAA 2FBKA 4FJPA 3O2AA 4Q5TA 3ISPA 4MTEA 3TTRA 1CF7B 5D5UB 1FBUA 3CLOA 1O3TA 2FA7A 3H3UA 1FYMA 4LZ5A 4ZZAA 4IO7A 2OD5A 3ABTA 1W7PB 2M30A 4G8MA 4G68A 2HEOA 2D3IA 2F2EA 1R23A 4F18A 4EVIA 3N94A 3TQWA 3ZMDA 3TUSA 3EUHA 3DFGA 2EV6A 5EEHA 4JB7A 5HLGA 1GVJA 1YTYA 2MC3A 1J7KA 1OVBA 1I27A 1PP7U 1SD7A 3HRUA 4ZEDA 1BC7C 3E4RA 3U93A 1DOTA 3ZKLA 4M72A 1P2FA 2KJCA 2V1DA 4HLXA 1IUYA 3BWGA 4FORA 3HRSA 2DXYA 2UVIA 1I6QA 2ESHA 1I69A 4WWCA 5L3BA 3K0LA 3I58A 4I7HA 4A12A 4G68B 1KYZA 4LFUA 1R58A 2GXBA 2V84A 4ZE9A 2HZKA 3BP8A 1ZIUA 3MAJA 3EQ1A 1G3SA 2ZBKA 4GFRA 5I2NA 4YIFA 2Z5UA 4U21A 5F7VA 5LLQA 2KJBA 1FQBA 3VVFA 3R6SA 1WRJA 4RB3C 3IOVA 3GW2A 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