3FXUA

Crystal structure of tsar in complex with its effector p-toluenesulfonate
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
296
structure length
296
Chain Sequence
MLKLQTLQALICIEEVGSLRAAAQLLHLSQPALSAAIQQLEDELKAPLLVRTKRGVSLTSFGQAFMKHARLIVTESRRAQEEIGQLRGRWEGHITFAASPAIALAALPLALASFAREFPDVTVNVRDGMYPAVSPQLRDGTLDFALTAAHKHDIDTDLEAQPLYVSDVVIVGQRQHPMANATRLAELQECRWAFSSAPRGPGAIIRNAFARYGLPEPKLGLVCESFLALPGVVAHSDLLTTMPRTLYERNAFKDQLCSIPLQDALPNPTIYVLRRHDLPVTPAAAGLIRWIQHHAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural studies on the full-length LysR-type regulator TsaR from Comamonas testosteroni T-2 reveal a novel open conformation of the tetrameric LTTR fold
pubmed doi rcsb
molecule tags Transcription regulator
source organism Comamonas testosteroni
molecule keywords LysR type regulator of tsaMBCD
total genus 90
structure length 296
sequence length 296
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3fxuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fxuA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fxuA03
1GVJA 1XGMA 1ULYA 5E8IA 3GFJA 3PD8A 2AYSA 5JVTA 3G3IA 3PD9A 4EM0B 3KG2A 3ZN0A 1KQ9A 3MC2A 2A5YB 2MBFA 3VXCA 1Z05A 2RC7A 1DDNA 3C7JA 4XKRA 4EJTA 1BI1A 2P4WA 3C1DA 2ACJA 2F6GA 4QFPA 4M6YA 5BUUA 4DCXA 3R60A 4U1ZA 1F1ZA 2RC9A 1SW2A 4F3PA 2W85A 3JSOA 1CGPA 3FXUA 1J75A 2UYFA 3BBRA 2PLYA 4IO3A 3L2CA 1MZBA 3Q26A 3TCGA 3UA8A 3CRBA 3H03A 3IX1A 5KZTA 5D8KB 3VFZA 1XDUA 2FOKA 3GUDA 4FIMA 1B7HA 3CVGA 2I48A 5DEQA 4MTDA 2UXXA 3ZQ7A 3HRTA 2RV8A 4G4PA 4HBLA 4OIQF 2RGVA 1EZPA 4ZS9A 2XAGA 3TGNA 5CMMA 5EYFA 3M9AA 1B3GA 2VGQA 3ROUA 1NFTA 2F2EA 4MF3A 3SERA 2ZXTA 1US5A 3CDHA 1Z9CA 1ATGA 1ZJLA 1SD4A 4EM2A 1R1VA 1B3FA 3T5XA 1B58A 2XD3A 5DD4A 4NHJA 1Q1KA 2RN7A 1FBSA 4OIOF 1TNSA 2EWNA 1FQDA 2TDXA 2HAVA 5D6FA 1REPC 4DQ2A 4I1DA 1CF7B 3RT8A 2VT3A 3P9KA 5J6XA 4RA1A 5D4RA 2PG4A 3KE2A 3B02A 2UXAA 2K4JA 3KLNA 1LQ1A 1P4XA 4H1XA 4RXLA 4H5GA 4QSCA 4O3CA 3M3FA 3PFIA 4GFRA 2VD2A 1F5TA 4OVJA 2F78A 4ZEFA 3ECOA 2Q2AA 2GHBA 3HOTA 1BC8C 1WQ2A 1V4RA 5BS6A 3O6GA 2NVUB 4F3BA 1QPMA 2ONKE 4I01A 3W6JB 3VLWA 4YG2F 4M9XA 5DV5A 3L6GA 4H0WA 4IVNA 2DPUA 2CO5A 2ISZA 4EUOA 1ZG3A 4PCQA 1XCBA 4LD5A 5KDTB 2YU3A 1JVXA 1YTYA 1MXYA 4GRKA 3E97A 3ECHA 3BP8A 2X7QA 2W24A 4QSDA 1BBYA 3CJNA 4ZEIA 3W15C 5K1YA 4LP2B 3V7SA 5BMZA 3S2WA 2P5VA 2ZNSA 5I57A 1GXPA 2RNJA 3GZ6A 3GLBA 2ZMBA 5K2XA 4BHBA 4G68B 4RY1A 2XUBA 4LVQA 2L54A 4AVPA 1S50A 4MEXF 3T9HB 3E5QA 4LJZF 3HRMA 4WXCA 4HYEA 1OMIA 3J81Z 3EF7A 1KYZA 5JI6A 1B32A 1YQAA 4U0YA 4OIRF 4JB7A 5ICGA 2PVUA 2OQRA 3N97A 2H6CA 3RTWB 3TTRA 1B3LA 3UORA 5FD5A 4UXNA 2H99A 1J7KA 2F35A 1R1UA 4IRIA 1FTLA 5FTHA 1T0KA 2Y0MA 2OA4A 1GXQA 3HUGA 2QBYB 1TW3A 2UXNA 1MY3A 4ZE9A 1XC1A 3K4UA 1O57A 3WGHA 2VXZA 4RNSA 3V83A 2L4AA 2A3SA 4C1UA 3EHUA 3N5LA 3EYYA 1ZGAA 4HDUA 2QPQA 1KU9A 3VODA 4WXJA 2LNBA 3IL2A 1Y3QA 2OU2A 2ADUA 2Z9OA 2JT1A 1KA8A 5ICFA 1IF1A 1MJAA 3F23A 1PC3A 1Y3PA 3W6KB 2H25A 2PQ8A 2XXYA 4R72A 1Z1DA 4EJOA 5ILVA 1B40A 2ZO4A 3QUFA 4IY6A 2COMA 3P9CA 1R9QA 4KIBA 2VC0A 3HIFA 2XXXA 1Y4TA 4EVIA 3KOSA 2E7XA 3CO7C 5CLSA 4HX8A 4UA8A 3K6XA 3O29A 1CF7A 1RI7A 5CYVA 2DVCA 2UWMA 2YPNA 4UNOA 2VN2A 3E6CC 1OYWA 1KU3A 1RUOA 1ELJA 4IGTA 4MLVA 3F8FA 5HDNA 2GIVA 3PPRA 4A0XA 2QJEA 3JV9A 3D4GA 3TCFA 2B65A 3DP8A 1R58A 2HZTA 2IA2A 3GYHX 4X9TA 4EQQA 3K02A 2DLLA 1N04A 1BTJA 1I1GA 1PDNC 3TCHA 3MZHA 3GO5A 2FEZA 3MPLA 2DWHA 3RTRA 2Q89A 1W7PB 2B0LA 3TO9A 1T2KA 2VOOA 2I4CA 3FVOA 5KDTA 4FECA 3I5UA 2D3IA 4XBFA 5KK1A 3PMXA 5ICCA 2C6YA 1Y3NA 3FASA 5BOXA 5FHNA 4FHTA 4KICA 3SEUA 2Y48A 3JW4A 1POTA 1Z7UA 3FJ7A 3VLUA 1B1HA 2YX4A 5AA4B 4LB6B 4EGZA 1A40A 1FTJA 1YW8A 3MZBA 3MP8A 3G7WA 1QGPA 4G68A 1FYMA 3MVXA 1LGBC 5D5WB 1FWZA 3W9WA 3PQJA 2FYIA 2NNNA 1MXUA 1MY1A 1RKMA 5HLGA 4P0GA 2O1LA 4GYGA 2V9VA 1B3EA 3BZ6A 4BLAA 4RAYA 3GFLA 3SKPA 4F19A 1RZ4A 3HRUA 3COAC 3FVKA 4IO7A 1AOVA 2YJPA 4Z2YA 1B51A 1FX7A 2QBYA 3MWBA 3RTFB 2NOOA 2EV5A 1F4KA 5K5OA 4L5IA 2DQVA 2XAQA 2FQ3A 5FD6A 5TJJA 3RPUA 3T8TA 1HBXG 2PBWA 4O6JA 3IB2A 3MP1A 3KJ7A 3V8JA 1ZN2A 1H3DA 2O7IA 4ZYHA 5I56B 5DVFA 1FQBA 5DCMB 4HW8A 3C31A 2ABHA 2XX7A 3K1MA 2Z33A 2UVIA 3SFZA 3C32A 4DLDA 2Q8JA 3TELA 3MAJA 1T6SA 3DPLC 3KN3A 1ZRCA 4OFLA 1B52A 4JSDA 3KFWX 3ZKKA 1NHAA 3GFMA 4RAZA 2A6EF 1B4HA 3FV2A 2W57A 2OZUA 4OESA 4NQWA 4TLLB 4OMYA 4AB6A 3M8FA 4BDRA 4EJWA 2VBYA 1YFHA 1L0OC 4OEVA 1V3FA 4LZ7A 3EQ1A 2R71A 3FMSA 3M3KA 2GXGA 5FLXK 5H8FB 4NF4B 3JAMZ 2DO7A 4U2RA 4CO8A 4DE8A 1QJMA 1SW1A 2DWIA 5KCJB 3TUSA 2OD5A 4UHTA 2V84A 4U23A 4ENMA 2Z8FA 3FZVA 1VTNC 1W7PA 3EPEA 2F36A 3TTMA 3LWFA 3E4RA 1VE4A 4ESBA 5DDGA 1UHMA 5DEXB 4POXA 2I0BA 3PUVE 1P92A 2DYXA 2V6CA 1IAWA 4EV0A 5J8CA 4KIGA 4YIFA 4ZE8A 1LB8A 4ESFA 2PI0A 1NNPA 3H3UA 2DXYA 3T96B 5AA4A 3WGGA 5LEJA 2MD5A 1D8JA 3WTWC 3MW0A 4ZYGA 3T0YA 3O2PE 4G68C 4Q0CA 2LSOA 1I6QA 4ENNA 4ISUA 4Y15A 5HS8A 3Q9SA 1LDJA 2CFXA 1SW4A 4XKNA 2DK5A 1XGOA 1TTYA 2MH9A 2O84X 2DI3A 3CSBA 5ILSA 4GVOA 2GWRA 1TQPA 1P1QA 5LHGA 3F6VA 3V7CA 2K86A 4OWDA 1IEJA 1OYIA 3J80Z 1YO5C 2K4BA 4P5OA 3C34A 1O7FA 4ON0A 1MY4A 2IEEA 3IB0A 3SXYA 5CI5A 4YB5A 2M5WA 3QIMA 4JQFA 1OLAA 4R6YA 3I4PA 2CQKA 2PMHA 4IB2A 2M30A 2E1CA 3C35A 4BHCA 1QZYA 2A5SA 3FVGA 4X48A 1TWYA 5EEGA 2RCAA 1PEBA 3BJOA 3H3ZA 4A2UA 1SD7A 3LC8A 2IA4A 2HEOA 2EFNA 1R9LA 1T98A 2D1HA 3KZGA 4M1VA 3L09A 4M72A 4KCCA 1HSJA 4YMBA 5LGTA 1DPUA 1LAHE 3FMQA 2Q88A 5J8FA 2Y84A 4PDKA 3LUYA 1S7OA 4HCWA 4OFJA 4F2OA 1G3YA 5IT3A 2XRNA 4EJVA 3K6WA 5H8HA 2I3VA 4NF5B 1U2WA 4KMUX 3PUZE 1PB7A 1UIUA 4QFNA 3N6TA 2H09A 2I49A 2I58A 3MVYA 3K2ZA 1D3KA 3L6HA 4O3MA 4HLYA 3CUQB 3V89B 5H8FA 4NF4A 1OPCA 3RKXA 1OLCA 1ZTYA 4L5JA 1T38A 3TTNA 4KT5C 4ELQA 1BI0A 4I8CA 1B7ZA 2VBXA 3RPWA 2PFBA 1N7WA 2ZNZA 5KCJA 1ZYRF 3FGSA 4HX4A 3CTAA 3O66A 5LOMA 3HRSA 3LSLA 3EDPA 1BJAA 5H8QA 1MJBA 2RKHA 1ZG5A 5EHMA 1ZAOA 5DEXA 4KCDA 5DD8A 4I98B 4KYWA 2QENA 2O0YA 4N9IA 1XDSA 1FQFA 3H3GA 1A55A 2EA4A 4RPNA 1TLHB 2PBIA 4RB0A 3I54A 1XT8A 1UCRA 2WC2A 3TO7A 1IXGA 3IC7A 3CG1A 4UV9A 2V1UA 2OCUA 2HFBA 3FF5A 2P6SA 1DP7P 3Q27A 3WGIA 1B7UA 3J7AO 1BI2A 1SVXB 3CG3A 1R5GA 1JNFA 2E7WA 5M2VA 3WODF 5LGUA 1M5BA 2QM3A 2OWTA 1P6RA 3V8LA 5A5XB 4G6QA 2LKPA 4FE8A 3D5LA 3HV1A 3FV1A 1QQIA 1IQ7A 4PFUA 5HBCA 2K27A 4P0IA 3PUWE 1MQHA 1AMFA 1OYYA 3PPNA 3I53A 4G9YA 3SHFA 3R26A 4A5MA 5AIQA 1JEUA 3ZP5A 1SI1A 4GXAA 3OSRA 2F7CA 1R7JA 2F7BA 1UTBB 2X0LA 1D8KA 2Z23A 4YKIA 2DWAA 2CG4A 1OQHA 1I27A 4GCVA 1TXFA 3KLOA 4CICA 2FA7A 1AH5A 4ESJA 3A3UA 4G8MA 2NYXA 3OO7A 4FJPA 4NF5A 3MWMA 3PMWA 4JSOA 2OQGA 3JZJA 4DIGA 4WX9A 2R3SA 2ESHA 2Q8KA 1QW0A 4PZJA 2F34A 2XXRA 4KHZE 4ZECA 1KU7A 3CFLA 2HFHA 2OBPA 4L17A 3CUQA 4RGRA 1DSNA 1IN8A 3WTYC 3CUOA 4EXLA 1FTKA 1NNFA 3GEZA 1A8EA 4BQAA 2ZYNA 1P1OA 4JWOA 1Q35A 2GHAA 3HO7A 2IT0A 4PGGA 2KIMA 3Q29A 4GXOA 4GQOA 1B4AA 2Z3YA 3VVEA 5I57B 3QPHA 1XHYA 4RYAA 1EH7A 4MEYF 3WTXC 3TDJA 4HZFA 1TNTA 3TYHA 1HW2A 2HGCA 4DXUA 1Y20A 1YYVA 2RCBA 3C3WA 1OIBA 5DYHA 3I6VA 4POWA 5KVRA 1KWHA 1HKSA 2CSOA 3F21A 3E13X 4BDQA 4YFNF 1L3LA 3PUXE 1YG2A 1R5HA 5BPDA 4KFCA 3ZMSA 3MQ9A 5AA3A 1CE2A 4FEBA 3ELKA 4F39A 3FMRA 2H9BA 3QAXA 2AIXA 4RGXA 3UP9A 4Q48A 1U5TB 3G3JA 3TDZC 1ODDA 2XXPA 3FJGA 3LSTA 1SQYA 3J81K 2PMUA 4LQ2A 1BN5A 1LFIA 2QS4A 1DTGA 5A5XA 3DP7A 3ZN1A 1MH4A 3LSXA 3E6BA 4C1TA 2V3UA 1A04A 1HQCA 2QLZA 2QWWA 4G7ZF 1POY1 2B3BA 1HKTA 1I69A 3OEKA 4K3FA 2OZZA 3SEXA 2E1SA 3HCQA 2BE5F 5L9SA 5F7VA 3I64A 1G4DA 5L3FA 4M9ZA 1YTVA 4MH5A 5L3BA 2VONA 3KEOA 3WTZA 3UIFA 1MJ9A 5CM6A 3ZPLA 1VSOA 3WAEA 3CI8A 1UTBA 4KYDA 1E17A 2XHKA 2V79A 4ZZLA 1ZBMA 4KDPA 3MZ9A 3IORA 2F5FA 2YSRA 1B59A 4LMYA 3V8KA 4ECFA 5A2QZ 4ZH4F 3H6TA 1JW4A 4IO2A 5EEHA 3LQRA 1QUJA 2GFEA 3R0JA 4L9VA 1B46A 3KEIA 3IRQA 3AAFA 1MDMA 2GA2A 4OINF 1B4ZA 1MPDA 3CUQC 4NWDA 3EHTA 1O3QA 5H6RA 2QUFA 3DEUA 1DMBA 4YKKA 3FATA 1ZU0A 4M74A 2Z22A 1U3EM 3GXOA 1SD3A 2V3TA 3TTKA 3TKDA 1FT9A 4XTCQ 2O8XA 4GYIA 1IN6A 5LGNA 4ZDMA 3U1OA 3IOVA 4YMAA 4LK0F 4A6EA 2X4HA 2KKOA 4G8XA 2O03A 2RINA 2MC3A 3HTSB 1JXSA 1P4WA 1URDA 3FIRA 4EQBA 3SESA 3FM5A 4R79A 4HQEA 3ZS6A 3HHGA 3E6DA 1P4AA 5I58A 3O6BB 3MQ0A 1LCFA 1CB6A 2XXIA 2ZYMA 3R7XA 5BPIA 5IKBA 3IKVA 3PUYE 4NWCA 4Z0IA 3K9TA 1B9MA 1FYKA 5H6QA 3HSEA 1K78B 4OENA 4RPOA 3V8XB 1QO0D 2BEOA 4D0PA 3TEPA 4G77A 4JWYA 1S9TA 2QZ8A 5TP9B 4ESXA 1EH6A 4LQ5A 1XB4A 4WKMA 3LAPA 2ALUA 3K1PA 4IXAA 1ZLQA 1FQCA 3CIJA 1U5TA 1B3HA 1IXIA 1G3SA 3RYRA 3V4GA 3TOAA 2M87A 1H44A 1J9IA 3KSXA 1J0RA 1VFDA 2IRFG 2EV0A 5E1ZB 2CW0F 5DYMA 5FTIA 3KCCA 1P1NA 3G3HA 1GTKA 2VOZA 2KJCA 5TU0A 2XKPA 2DQLA 2EFPA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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