3FXUA

Crystal structure of tsar in complex with its effector p-toluenesulfonate
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
296
structure length
296
Chain Sequence
MLKLQTLQALICIEEVGSLRAAAQLLHLSQPALSAAIQQLEDELKAPLLVRTKRGVSLTSFGQAFMKHARLIVTESRRAQEEIGQLRGRWEGHITFAASPAIALAALPLALASFAREFPDVTVNVRDGMYPAVSPQLRDGTLDFALTAAHKHDIDTDLEAQPLYVSDVVIVGQRQHPMANATRLAELQECRWAFSSAPRGPGAIIRNAFARYGLPEPKLGLVCESFLALPGVVAHSDLLTTMPRTLYERNAFKDQLCSIPLQDALPNPTIYVLRRHDLPVTPAAAGLIRWIQHHAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural studies on the full-length LysR-type regulator TsaR from Comamonas testosteroni T-2 reveal a novel open conformation of the tetrameric LTTR fold
pubmed doi rcsb
molecule keywords LysR type regulator of tsaMBCD
molecule tags Transcription regulator
source organism Comamonas testosteroni
total genus 90
structure length 296
sequence length 296
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3fxuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fxuA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fxuA03
1XSXA 4KD5A 4ENNA 1USTA 1VE4A 2UVIA 5I56A 5E1WA 2XHDA 4UXNA 3TO6A 3OO8A 5CM6A 4RPOA 5FHOA 1UCRA 3C32A 2FEZA 2UVGA 3Q28A 5AA4A 2HAUA 1VSOA 1J0RA 3JW4A 4KYEA 3U2RA 5LRRA 1FBSA 1QZYA 4FAJA 2BYVE 4QF9A 2PI0A 1NNPA 2XAQA 4UACA 1N3XA 1DSNA 3S9EA 1G3WA 2XX7A 3RT6B 2XIGA 1AWCA 2V1UA 2PJPA 4GWOA 3K1MA 3ULQB 3I59A 1M5FA 1USYH 4R75A 3IO4A 3FJ7A 3JAMK 3RPUA 5DYMA 3R60A 1USYE 1UHMA 2QQ9A 3I0TA 5LGUA 4RXLA 4U7DA 5CBRA 1G4DA 3LFKA 4M74A 4HV5A 3E5QA 2EFWA 2Z8FA 1B6AA 1LGBC 2QQBA 1PBPA 1EZPA 1JVYA 2GFEA 1WRJA 2J5OA 1XMKA 4HCYA 4AB6A 1XN7A 4O5VA 1ZRCA 4F19A 3SKPA 5CI5A 3DM0A 3E4RA 1AL3A 3KG2A 5E8IA 3CFXA 1SYIA 1MPCA 2QJEA 4G4PA 5AE4A 2DE4A 2R6GE 1NNTA 1MDQA 3CG3A 1K78B 3IWZA 1IITA 1XB4A 4GXSB 5I59A 3U93A 1TLHB 3U72A 2K4BA 1ZIUA 2HWVA 3WGGA 3KLNA 3T96B 1O3TA 4PP0A 1QW0A 3PUYE 2Q0OA 3I4PA 2RCAA 3H6VA 3H3UA 1QGPA 4YIIA 2THIA 4Z7EA 3KBRA 4OMZA 1SDXA 2F35A 2G7UA 5L3FA 2DT5A 2AYSA 4R2FA 3T1BA 4ESFA 4HLYA 2V25A 2Y7PA 5DCMA 2CG4A 1IIWA 1WODA 5DT6A 1L0OC 2ZYMA 2FBKA 3S2WA 3EHTA 3OXNA 2XXUA 2FNAA 4RNSA 4JK1X 4IO7A 2XXPA 3TCGA 3DFGA 1R00A 5EEHA 1S50A 4EXLA 3C3WA 1FP1D 2VD3A 1XVXA 4QSCA 5I2KB 1IW7F 4GYGA 2O3FA 3G73A 1ZREA 3FV1A 3RPWA 1N7WA 1GVCA 2ZKZA 4F3GA 3SERA 5ICGA 3GZGA 1FWZA 2HEOA 3Q26A 4K3FA 1Y3PA 1R1TA 1DUXC 1XC1A 3E6DA 3F8FA 4H0EA 5DTBA 2ZO4A 1TTYA 3LA7A 2QBYA 1YAEA 5H8SA 4L9NA 1SMTA 1RKMA 5D8KB 4ZDMA 4FE8A 3G7WA 2H6BA 5ED4A 1U5TC 4RY1A 4P5OA 5A2QZ 3PQKA 5JTYB 2M1BA 3HSRA 3ZS6A 2DVZA 2RC8A 3DQVC 4IO5A 3GFMA 4TLMB 3J81K 3MZ9A 3T66A 1LVAA 5E1ZB 2ESHA 3IR1A 3PUWE 1KGSA 2ZFWA 4QFOA 3GFIA 5DDGA 2ELHA 4PCQA 2ZXTA 1IUDA 1TNSA 1FT9A 3F23A 1P4WA 1URSA 2O1LA 1B0LA 5BQTA 3BPVA 3L9FA 3BZ6A 5CMKA 4DXBA 3GZ5A 3CO7C 1TQMA 5TP9A 2KIFA 1HW1A 3CUQC 2ISZA 1W7PB 3S4UA 1HW2A 3HV1A 1B3LA 3H6UA 2L4AA 5HS8A 1D8JA 4HCWA 4YKPA 3T0YA 2D3IA 4TV7A 4BNCA 4LZ7A 2QM3A 4Y17A 1N0TA 4ZZDA 3IORA 4HQMA 3RDIA 4TQUQ 5A5XB 1MY3A 1UTHA 1R58A 1FTKA 3KP5A 1LB2A 4HOBA 2CO5A 4HW0A 3B02A 4YKKA 5CRYA 5M2VA 3BP8A 3UP9A 4A0XA 4GD5A 2RCBA 1LBCA 3CTAA 4GCVA 4U4SA 1B58A 1URGA 2F2EA 3M8FA 1IN8A 1Q35A 5ERIA 5I2NA 3T9HB 2GWRA 5B70A 2O7IA 3OEKA 2QUFA 1B40A 1GXQA 2IA4A 1ZN2A 3W9WA 1ZJLA 1URDA 3K6WA 1ZYRF 1JW5A 2XXXA 1BN5A 2XAJA 3SZPA 2F36A 1B51A 3FV2A 2UXAA 4NB5A 2QL3A 3PV0E 4N9IA 1ZGJA 5ILVA 3P7NA 1KU3A 4KYWA 3EYIA 2Y7IA 1AIVA 2CW0F 4JWOA 3PQJA 2P5LC 1N04A 3V8KA 3VFZA 1MXXA 1KWHA 1FY7A 2EJRA 2DYXA 1UIUA 4WWCA 4RAZA 4M72A 3DLNA 4LD5A 3CFZA 1SD4A 4G8MA 4O3CA 3V8JA 4XKPA 3SDFA 2G93A 1FSHA 5AIQA 3KN8A 4NF4B 1J5YA 1KQ9A 4P96A 4KPTA 2DK5A 1I6AA 3OELA 4JB7A 3NEUA 1N84A 2FBHA 4MGRA 4GXAA 4G9YA 1B5IA 1UTBA 4U22A 4G7ZF 3R6UA 2KKOA 3FD3A 1Z9CA 2MLKA 2VOOA 4C1TA 3IJOB 1LB8A 1ZG1A 3O6HA 3LQRA 1QVSA 5H8NA 2B3FA 2V1DA 1BJAA 1O3SA 1IUYA 4HTGA 2YX4A 4NHJA 1FYLA 4M6XA 4WEPA 3TDUC 2Y0MA 2O84X 2I6EA 3IAZA 1A99A 5EYFA 4ZEBA 3ZN0A 2O51A 5K5OA 4Q30B 4RPNA 4O3BA 3FMRA 4OIPF 5KCJB 4YFKF 4F3PA 3MZYA 5ITOA 1OVTA 2Z22A 4XIGQ 2WV0A 1HKQA 4R1HA 2UZKA 1SW4A 3HCQA 1R1VA 2PQ8A 3MJNA 2RKMA 4HF2A 4G6DA 2BBYA 5JHUA 2R3SA 3KJTA 5AA3A 1TW3A 3SZTA 4XBFA 3N6TA 5D5XB 2DS9A 3FF5A 3HN0A 3HPIA 3K6UA 2GXGA 3J81Z 3RNNA 3KZGA 3TMGA 4CXFA 4OYVA 2XKOA 1FTOA 2XUBA 4KIFA 3WAFA 3WTZA 4ZYHA 2M87A 2OA4A 1A8FA 3LSXA 2D1VA 5FB2A 2P6TA 3IB1A 1SI0A 2IJLA 3HO7A 5CMCA 3H92A 5ITPA 4NWCA 4BH9A 2K4JA 2QYOA 3IJXB 4IVNA 5H20A 3G3GA 4KA4A 1H0MA 2B0LA 2L01A 1PB9A 5IAIA 5ICEA 1U2WA 2ZYOA 5D4SA 2Y7RA 1JVXA 3FJMA 3QUJA 3SEVA 1PP8F 4IY6A 3RN8A 5D4RA 4OIQF 3MPLA 3K2DA 4P0GA 1XD7A 5HBCA 1B4HA 3FMSA 3B6WA 1CE2A 5J6XA 3FMQA 1GR2A 3LSLA 4OFJA 4M6YA 1BI0A 4L5JA 5TJJA 3QP5A 2Q89A 4P11A 1Y3NA 1QKAA 2ACJA 4TOZA 4OIRF 4XRFA 1H3DA 4IF4A 5BOXA 1DTGA 3TO9A 4OOIA 3MC2A 4NF5A 2MA3A 4U7BA 1B2HA 2W24A 4IO2A 5F1QA 4ZEFA 4XKRA 1M5DA 2GHAA 3QPTA 2XXVA 4R6KA 2YPRA 2F8DA 2A61A 3VVFA 1R36A 3SXYA 4L0YB 1ZU0A 4LZ5A 4NF6B 3T9UA 5K2YA 3M1EA 4YAHX 3EQLF 1IXIA 4NF8A 2M8EA 2QZ8A 1MQJA 3REOA 4LA9A 3JV9A 4LQ5A 3LA2A 4KYSA 1O3QA 4UVAA 4F18A 4OINF 2Z33A 2RC7A 2CFXA 1MXWA 4M73A 2Q2EA 3ZP5A 1A55A 1FW0A 4IGTA 3CI8A 2XXWA 5FHNA 4P55A 4Q8RA 4LFUA 3ONMA 1IN6A 2QS2A 4KHZE 3EHUA 1F1ZA 1M5EA 3CFLA 4ELPA 2BV6A 4YFXF 4BDNA 3RYPA 5L3BA 1ZG5A 3R0JA 3WE2A 4H0WA 4L9JA 4YMBA 3FGSA 2Y7KA 1MM7A 3QUFA 2WC2A 4JSOA 1FYKA 1MKMA 1IN5A 3MW0A 2TDXA 5DEQA 2ZNTA 1KQ0A 1B7ZA 1ZTYA 3TCHA 4ZE9A 3MPKA 5ICFA 3RKWA 4MF3A 3RTFB 4KCCA 4KICA 3MVWA 1MPDA 4ZS9A 4O3MA 1B0HA 1MXZA 2ABHA 1G3YA 1LEAA 2HAVA 3HSEA 2NS0A 2L4MA 1Y9UA 1IXHA 1G3SA 2ZMBA 2DP8A 3IOUA 4RB3C 1BOAA 5L3EA 1Z1DA 3KSJA 5KK1A 1B1XA 4BXUA 1B5HA 2GAUA 3DKWA 3Q9SA 5HVQC 3KEOA 4ZYGA 1DPEA 1OKRA 1S7AA 3VEPA 5DUIA 1O7LA 3H3GA 5L9OA 2JT1A 3K1NA 5J8CA 3QXMA 2XXHA 2Q9TA 3GXOA 2KLFA 4H67A 2A69F 3TGNA 5L3DA 3TTRA 1F4KA 2JRTA 1B9NA 3V4GA 1T2KA 2QS1A 3K00A 3KFWX 3UA8A 3P7IA 4KFQA 1GXPA 2L3DA 1U78A 1MDMB 3KN7A 1HKSA 4H65A 3PUZE 2F7BA 2NNNA 1H9GA 1ZLQA 1TNTA 2DO7A 1YFHA 3Q5FA 4MHGA 1L5TA 2A5TB 2JPBA 4RS8A 1LBBA 1XSDA 1TWYA 2E7XA 1XGSA 2YX7A 4Y15A 3VDFA 1K6OA 1HSTA 3I5UA 5TU0A 2E7WA 3AXFA 3ECRA 3DPLC 4F1UA 4OENA 2FOKA 4D0PA 1ANFA 3GXAA 3IL2A 4G8HA 5AA2A 1SI1A 4IRIA 2JSCA 3VODA 1Z05A 1Y1MA 4OZ9A 3V8LA 1ZHFA 3PMWA 4XTCQ 4EJVA 3K4UA 3F8CA 4AD9A 4JQFA 3RQTA 1LJ9A 5HM4B 3GW2A 5ELVA 3G3HA 1ZLKA 2FMYA 3MBPA 3VXCA 4KDPA 1J2XA 3P9KA 5K1YA 2RC9A 1MY0A 3RKXA 1U3EM 3WTTC 3FXQA 1SD3A 5L9MA 4OEVA 3WTYC 2NUVA 2AIXA 4HX7A 3A09A 4ENMA 3SETA 1D9VA 1YPNA 4HBLA 4R8HA 1S3JA 2OZZA 4YICA 1FQCA 4L18B 4EDPA 1WQ2A 4HF1A 4E70A 3L00A 3H7MA 1FQEA 4OFLA 3TCFA 5AA2D 2CYYA 5BUUA 4IRGA 5FGMA 4XKNA 3TTLA 3L6GA 3W6KB 3HRMA 4IGRA 1W5TA 1MY4A 3LSTA 1MRPA 2X4HA 2XAHA 4ISUA 4A5NA 1GVJA 4UV8A 1B46A 1I27A 1ZMGA 3DP8A 2HYGD 2KJCA 2O68A 2MH9A 1MXYA 2EB7A 1ZRDA 4ZE8A 3VLUA 1TFAA 3R6SA 2ONKE 3U1OA 2OK2A 3EN3A 4YZZA 4PZJA 1IRGA 1ELJA 3GEZA 3C4MA 3TOAA 1Q1HA 4DCXA 1O7FA 1RUNA 3H06B 1NL5A 5L3CA 5I57B 1S7OA 3WGIA 4O3AA 4KFCA 4EQ7A 4RB0A 1IEJA 3O2PE 4XSZF 4A2UA 2HFBA 3IRQA 2FU4A 4NQWA 3ZMUA 3RT8A 5H8FA 4OXVA 5D6FA 2OJTA 3PFIA 1MY2A 4EGZA 3PPOA 4HW8A 3WE3A 3GZ6A 2OZUA 4RK2A 1Z91A 4EF2A 4KI0E 3V7RA 3E6MA 1D9YA 3D4CA 4N9HA 3U94A 5L8DA 2R71A 4BDQA 4OFOA 2RC4A 4L5IA 4RGSA 4Y13A 1R23A 2QS3A 1VTNC 5HPQA 3OO6A 2DWJA 2UYFA 4DXCA 5F64A 1HSJA 1XGMA 1LFIA 2YLNA 1S29A 1HKTA 1M5CA 2HQRA 1DMBA 4JWXA 1TBXA 3M9AA 1QBJA 2XXIA 3Q27A 2DE3A 5KDTA 4CYDA 4ZH4F 2BE5F 2PG4A 5EEGA 3MVXA 3LAPA 3TOBA 4ZZEA 3WTSC 3DELB 4I7HA 3F22A 1I6BA 2V3QA 4GLIA 4F3BA 2F7CA 1ATGA 2PEXA 4L9TA 1V4RA 5AIPA 4EGYA 4ECFA 4Q47A 1XOCA 3JSOA 2X26A 3EQ1A 3LA3A 3H4ZA 2X7PA 3HHFA 3OO9A 2H4IA 5H8QA 5E18F 5BPIA 2ZNZA 2BJJX 3IB0A 1T0FA 1CF7B 1T39A 4BQAA 2O7UA 4HF0A 4LB6B 3K1PA 3C33A 2VC1A 1Y4CA 2P1SA 4AIJA 3QIMA 5HLGA 2MD5A 4RYAA 1IN4A 1FOKA 4CGZA 1SQYA 1IXRC 5FFXA 2JTVA 1EV7A 2RQPA 5LHGA 2PBWA 4QSDA 3F8MA 1ZGAA 4BHPA 1MS7A 4I02A 4MBPA 2ZMEB 2H09A 3AAFA 4PFTA 1VFEA 1SW5A 2EV5A 4PGGA 4R79A 5JFRA 2EFPA 2Y84A 2OQGA 3C18A 1OMPA 3IB2A 2NXOA 5LLQA 1ON1A 2FA7A 2MBFA 3TQLA 2H94A 3MEXA 4I0BA 3MWBA 4JWYA 2KRFA 4JBZA 2V84A 3K02A 1N7XA 2PVUA 4WXJA 1FP2A 4EXKA 3FJGA 1MD0A 1N3WA 1FBUA 5LGTA 3MQ9A 3BFUA 1STZA 2LKPA 4OWDA 2RVCA 5IT3A 3QAXA 1UB9A 1S7YA 4B09A 1MQHA 1P6RA 1ONVA 3JSPA 5H8HB 2REGA 3VFJA 3CJNA 3RI4A 1I1GA 3ZMTA 3O6GA 3F6OA 3TDJA 3K6XA 4GGGA 4PETA 2XRNA 3JTHA 1P1UA 1IN7A 4UHTA 4XXUA 2I58A 2V3TA 4BLAA 3L7WA 2M45A 4M9XA 1CGPA 1R6ZA 2QS4A 3M3KA 3IKVA 2OWTA 2PMSA 2ADUA 3O28A 3ZSFA 4C0RA 3N97A 3I6VA 4OETA 1MQIA 4QFNA 1B9JA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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