3FXUA

Crystal structure of tsar in complex with its effector p-toluenesulfonate
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
296
structure length
296
Chain Sequence
MLKLQTLQALICIEEVGSLRAAAQLLHLSQPALSAAIQQLEDELKAPLLVRTKRGVSLTSFGQAFMKHARLIVTESRRAQEEIGQLRGRWEGHITFAASPAIALAALPLALASFAREFPDVTVNVRDGMYPAVSPQLRDGTLDFALTAAHKHDIDTDLEAQPLYVSDVVIVGQRQHPMANATRLAELQECRWAFSSAPRGPGAIIRNAFARYGLPEPKLGLVCESFLALPGVVAHSDLLTTMPRTLYERNAFKDQLCSIPLQDALPNPTIYVLRRHDLPVTPAAAGLIRWIQHHAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural studies on the full-length LysR-type regulator TsaR from Comamonas testosteroni T-2 reveal a novel open conformation of the tetrameric LTTR fold
pubmed doi rcsb
molecule keywords LysR type regulator of tsaMBCD
molecule tags Transcription regulator
source organism Comamonas testosteroni
total genus 90
structure length 296
sequence length 296
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3fxuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fxuA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fxuA03
3C4MA 3H03A 1CB6A 3MW0A 1MXYA 3COAC 3T96B 4KMFA 3ZPLA 1Z7UA 3B6QA 4GF8A 1YO5C 3K1PA 4AIJA 3PUXE 5CMMA 3IOUA 1TQIA 3F8MA 4DXUA 4XLPF 1JEVA 4A5MA 1X3UA 2Y48A 1ZGJA 3FGSA 3E6DA 4ESBA 3OV8A 5JHUA 2BEOA 3BPXA 2OQRA 3GFIA 3ROUA 3CFLA 3GFJA 3WTSC 1TXFA 2ONSA 2ZNUA 2PFBA 1KQ0A 2AXLA 4LD5A 4F3GA 4JB7A 4A5NA 1MY3A 2Y7PA 5DVFA 3GWZA 1R5GA 1PDAA 4GLIA 3GLXA 1XS5A 2F6GA 1QNTA 2E1SA 4MGRA 4F29A 1Y1MA 3GZ5A 1YTVA 1J7KA 3EPEA 4G94A 3Q25A 2Q0OA 4KD5A 3EN3A 1FBUA 2F35A 3HTUA 3V83A 1T0KA 2PEXA 4P5OA 1P2FA 3LQQA 2OLBA 1IXHA 5BUUA 3VVFA 3W9WA 1R6ZA 2D1HA 4EGZA 3DF8A 4EJVA 1HSLA 3N26A 4XLNF 1K78A 1SW2A 5F7VA 1OQGA 1IRGA 1IXSB 3P9KA 2UVJA 2I49A 4NF4B 2XXWA 3J80K 1KA8A 2UYEA 3J7AO 2VC0A 2HTSA 3QU3A 2ZNTA 1OMIA 1MXXA 1M5BA 2Y7KA 3OSQA 1USYH 4FIMA 1SW4A 4NF8B 4I02A 5DUKA 4I8CA 1I27A 2QLZA 2VGQA 5CC2A 3G3FA 4MHGA 4PP0A 4E70A 3WTYC 1NMUA 2WWYA 3PQKA 4JBAA 4M6YA 3CVGA 3R60A 1XGSA 4IHTA 1Q1HA 2IVMA 3IB0A 5LBQA 1PUEE 3EDPA 2O51A 5DD8A 2RVCA 2XXTA 1J5YA 1ONVA 2HKXA 3GF2A 1DSNA 2VT3A 2CQKA 2D1VA 3K01A 3GUDA 4EV0A 3SEUA 1FW0A 5CMBA 2F8DA 3VE1B 2VC1A 1P1OA 2I48A 1YQAA 2FU4A 1FCKA 2STTA 5E18F 1IN4A 3ECOA 3N97A 3E9XA 1R58A 5L3EA 3I6VA 2HDCA 3ZMUA 3PPNA 4NEDA 1Y9UA 4FT8A 2I4CA 1R1UA 4NF8A 1QUJA 1ANFA 2V6CA 4KPTA 3B73A 2EA4A 1JEUA 2DLLA 1H0MA 5L8DA 4THIA 2B0LA 4XBFA 4DIGA 3QPTA 3BY6A 2X7QA 1A99A 2ZYOA 3PD9A 5BOXA 3CUQB 3C32A 1LCTA 1QKAA 4OTEA 1Z7ME 4YICA 5CJ9A 5I2NB 1D3KA 3GVAA 1BI1A 3EQ1A 1USYE 2I6EA 2PBIA 3BDDA 2AS5F 2D3IA 2XKOA 1MJ9A 4KIGA 3QXMA 4G7ZF 5D8LB 4BHPA 1PP8F 2GA1A 2GIVA 4ZEKA 1GTKA 3ONMA 2F5CA 2QQBA 4X48A 1J2XA 3FMQA 2O1LA 1A7LA 1XGMA 3WAFA 3TTMA 3TZAA 4EDPA 5J8CA 2REGA 2HXWA 1ZRCA 1SI0A 4NMYA 4R6KA 5E1XA 2DVCA 4PFTA 3MEXA 2VBYA 4BXUA 1GGGA 1B5IA 4GYGA 4QFLA 4DCXA 2DWJA 1KU9A 2H98A 2O7IA 3BKIB 1UIUA 4U0VA 4F3PA 5AA2A 4R1HA 2PLYA 3ML6A 1WKMA 3KEOA 1BP5A 4OMYA 2DYXA 1PBQA 5CMCA 3TMGA 4N13A 1B32A 3Q29A 2CW0F 4L9TA 3HOTA 3T8TA 3N6UA 5DVJA 3RGYA 4I01A 1G3SA 1KYWA 1R9LA 3GBBA 3HSRA 4M4GA 3TAJA 1B9NA 4YKJA 4NWDA 2O6GE 5HPQA 2F5DA 3MQ0A 1SW1A 3BJ6A 5JI6A 2Q88A 2THIA 4U2RA 2HAUA 1U6GA 1G3WA 4O3MA 4UV8A 2D2WA 4AB5A 3F6OA 5H6QA 3DQVC 1VFDA 1IN6A 4E0WA 5J1DA 6PAXA 5KVRA 3RKXA 1HW2A 1SD5A 2VBXA 1QKBA 3HRUA 4H6DA 5E1ZB 2OZZA 3ECHA 2C6YA 4A12A 4BDRA 1XGNA 3I71A 4MEXF 1WRJA 2L02A 5HDGA 2XXHA 1Y4TA 3L00A 1BN5A 1MZBA 2OAZA 1TNSA 5DTBA 4KT5C 3MPKA 2F7AA 1IN8A 4KMUX 5ILUA 5L9SA 4G68C 1DOTA 3KP2A 3E97A 1DPRA 2EV0A 4HF1A 1B05A 2O7UA 5IT9K 3TDZC 1KQ9A 1MH4A 4HTGA 2DI3A 4OZ9A 5I56B 1JNFA 1ZIUA 4U1ZA 3JYRA 3RYPA 2OQGA 4PZJA 5CVUA 2A5TB 3OO9A 2NS0A 4GOTA 4DXCA 1FQBA 2EFPA 4IVNA 2W24A 4OXVA 4DLDA 5FO5A 2XXPA 3K6WA 1B1XA 3PPPA 1TNTA 3EQLF 1HSEA 5LGNA 4G7HF 1JW4A 2QENA 4YG2F 4M9ZA 3JTHA 2DOJA 4M9XA 3H06B 3MPLA 1LQ1A 4JWXA 2FQ3A 4C0RA 1FPQA 5HDKA 3S9EA 3C18A 4U23A 4YB6A 3MWBA 3SZPA 2EFQA 1J59A 3CSBA 3CG1A 2E0SA 2Z22A 4M73A 4LUBA 1J9IA 3ULQB 1IXGA 3EYYA 5ILSA 4C1TA 1KU2A 2MBFA 3M8EA 3I0TA 3N5LA 4CHUA 3HHFA 5E20A 5D5UB 1H9TA 3FM3A 3FJ7A 4I7HA 1O7FA 2LSOA 1R00A 5CVVA 2Z33A 2VODA 3JAMZ 5FTIA 1W7PD 1Y0UA 3F8FA 3FXUA 4KYWA 4P55A 2G93A 4MTEA 4TV7A 2TDXA 5K5OA 2P1SA 2HZKA 1MJBA 5LRSA 2R3SA 4U7BA 5A2QK 3E6BA 2IEEA 2D5WA 4RGXA 1ODDA 3K69A 3PQJA 4IRGA 4DCYA 1H44A 1WDNA 3H6TA 3RNNA 1D9YA 2ALUA 2R6GE 3T9XB 1EH3A 3PU5A 5DUIA 3BWGA 2QMXA 2V25A 1PB7A 4Q5SF 3VOEA 1AIVA 5EHMA 2CWEA 2RGVA 3V7SA 3S9LC 3VVDA 1Z7NE 1BBYA 4F1UA 2O68A 2J5OA 3A3CA 1ZLJA 1N7WA 5H8HA 5KDTA 4YMAA 2A6EF 3QAHA 4GD5A 3RY3A 3VVEA 3CO7C 1PDNC 4OFOA 1FTJA 4R9GA 3H7MA 4BAYA 1KGSA 2Z3YA 2XAHA 3CI8A 2DU9A 1W5SA 2XGXA 1ZRDA 3D4GA 2Q8KA 3I64A 3DLNA 2D21A 3IAZA 1NNKA 2EWNA 3C34A 1TT1A 1KWHA 5E8GA 2HYFA 2PX1A 3UK4A 3W15C 4ONYA 4F22A 5JK4A 4ZDMA 4EJTA 2O8XA 4LG0B 4WXHA 1MXVA 3IC7A 1XD7A 4H5GA 2DK8A 3KP3A 1D4NA 1BC7C 2BBYA 2DWHA 2FOKA 4WCGA 1B51A 2QS1A 1R5HA 2YLNA 3RIRA 3DEUA 2CGPA 3MAMA 1O7TA 3RN8A 3F3XA 5BQTA 3H92A 2ZMBA 3LSFB 4WXCA 1MDP1 1JVXA 3ZMZA 1B7HA 5CBRA 2DPDA 3G7WA 2HZTA 3OOAA 3K4UA 3K6VA 3O2AA 2O1MA 1FZPB 5I2KB 3PD8A 4FATA 3K2DA 4KR5A 3MVWA 1ZREA 3HRTA 1Y1ZA 3V8LA 2Y75A 2XHDA 5ELVA 4P11A 5I58B 4LG0A 4U22A 4ZEDA 3IX1A 5CRYA 2EFWA 5LLQA 4IJAA 2VE9A 1II5A 3CLOA 5ITPA 3O2PE 4I1DA 2QS2A 3PFIA 4CXFA 1TTYA 1N3XA 1SFEA 1G6NA 2XD3A 2HEUA 5K5QA 4BNCA 3MVXA 3LA2A 2ZMEB 4PETA 4LLGF 3VLWA 4ON0A 3UIFA 4OHNA 4RYAA 1LFGA 2YPRA 3ZN1A 4I09A 3K9TA 2VOZA 2FNCA 5L3CA 3WTXC 1MQHA 2EV5A 3TTKA 4TOZA 1HQCA 5I2KA 1ZH5A 1FLIA 3K00A 1Q1KA 2W25A 2DQLA 4LP2B 2Q89A 3DP4A 1EZPA 1AOYA 4H0WA 3IOWA 4IF4A 1ZMGA 5LOMA 4ZZDA 2W84A 3CTAA 1FNNA 3CIJA 3D5LA 3FWEA 1BIYA 4H65A 1FTMA 3JTGA 1F9NA 1LB2A 2X4HA 1XSVA 1NNFA 1TFAA 2Y7WA 3L9FA 3DKWA 5L9OA 4FEDA 2L3DA 5FGMA 4GL0A 3FMSA 2V3TA 5ITOA 1TQMA 1I1SA 1QJMA 3Q27A 2H5YA 4OFJA 3C36A 5DEXB 3HIFA 3ZP5A 2IA4A 2Q9TA 1U5TA 1H9GA 4UVAA 3Q5FA 2PVUA 3VLUA 5ICQA 4BYYA 3ECRA 3V89B 3SETA 3E4RA 1LDJA 2DTRA 3F6VA 2KIMA 4Q5TA 1KU3A 3IHUA 3R0AA 1UTHB 3M9AA 4G77A 3KCCA 1MY2A 5DYHA 1FT9A 2XUBA 3TQNA 3GXOA 1H45A 3E6CC 4KNYA 3TYHA 1BIAA 2DT5A 1IF1A 3BBRA 5KZTA 2RV8A 1UCRA 4YKKA 2B3FA 3WTUC 4ELPA 3M8UA 3VDFA 3WODF 2FMLA 2XV4S 3IOTA 2V84A 3O66A 4A0XA 4MLVA 4BDMA 2VP1A 1U78A 4RGUA 1N0TA 3CUQC 1BC8C 3DFGA 4BDNA 4UNOA 3LFKA 5A5XB 3KSXA 3T93B 3NEUA 1G3YA 4KYSA 4IO4A 1MXUA 3HHGA 5EEGA 2V1DA 4PE5B 3UORA 1A54A 3ZSFA 4LZ8A 3LSXA 1XMKA 2ZXJA 4PFUA 1O3SA 4WXJA 1MJAA 3T9UA 3LSWA 3CFXA 1NH8A 4KCCA 2EV6A 2AIXA 3RT8A 3OO8A 2PN6A 5CMKA 4QRZA 5HOOA 1EU8A 4X1BA 2Z8EA 2AL4A 1MKMA 1B52A 2VBWA 5ERIA 3BFUA 1GR2A 1IXIA 2JPBA 3IRRA 3SESA 2DW4A 2DPUA 2WKYA 3GO5A 3SEWA 1IUYA 2GZWA 1M5DA 2XKPA 3BROA 5DCMA 2R9JA 2ADUA 3CR9A 1A04A 4DQ2A 5A5XA 3MWMA 3KE2A 1DPPA 3BOQA 3VB2A 1FY7A 1OYYA 4RB0A 1BLFA 5DEQA 2ZKZA 2HQRA 2IP2A 1US5A 3ISPA 4KQPA 3HRMA 3HSFA 2M30A 4IPAA 1XCVA 4LFUA 1B2HA 1RYXA 3TODA 1GVJA 1LSTA 4BQAA 1Y4CA 4U4SA 4G7OF 1T6SA 2FA5A 2MH2A 1IEJA 5H8QB 4I0BA 4IHSA 4C1UA 1KQ8A 3SEXA 3HOSA 3RPWA 1IITA 4JXIA 4EQBA 3RPQA 2Z8FA 1OLAA 4EXKA 5TPAA 3LWFA 3VFJA 2FE3A 5JTYB 3JZJA 3M1EA 1W5TA 4GXOA 3MFKA 4L5IA 2IA0A 4ZYEA 1H43A 1S50A 4PFYA 4HBLA 4E0XA 4P0IA 5AA4B 4RNSA 2XXXA 1ZYRF 4GRKA 4BHBA 3K1MA 4P9UA 4GXAA 4IO3A 1NHAA 2CYYA 2E7XA 5BPDA 5H8FA 1B7ZA 2H25A 1IIWA 3VLVA 5BS6A 3HV1A 3K1NA 2RC7A 3IK6B 1B1BA 1JETA 3ZMVA 4L0YB 2ZYNA 2QVOA 1L0OC 2DXRA 1S7YA 4Y15A 4ESWA 2YSRA 1R23A 3F23A 4ZEBA 5CBSA 2R7FA 3I4PA 4OWDA 2A69F 3EF7A 2HR3A 2QJEA 4HA8A 4N0BA 2FYIA 4LK0F 3IWFA 4GXSB 3G3IA 2HZLA 1R9QA 2DP8A 2PI0A 2UVHA 2XAQA 3V4GA 1UHMA 2PQ8A 4ESJA 4U4XA 3CSGA 3PPRA 3S2WA 2YX7A 2OBGA 3TGNA 3RJPA 1O3RA 4F39A 3FD3A 3B02A 2UXAA 2NWJA 1G4DA 1EH8A 3G3KA 4OEUA 4ENMA 4PGGA 1MPBA 2EFNA 3E5QA 3W6KB 1R22A 1OVBA 2DE4A 2F6PA 2RN7A 2HGCA 1FTKA 2XVCA 2I0CA 3I58A 2I58A 1Q35A 1GVCA 3IKTA 2KLFA 4OU0A 3E3VA 1YAEA 2FNAA 4EVIA 3P7NA 4F31B 4OIOF 3TEPA 1MXZA 2K27A 1D5VA 1OLCA 2R71A 2IA1A 4YU0A 5DYMA 4BH9A 4G2ZA 4HCWA 4NF4A 2RCBA 3HTSB 3GFMA 2FBKA 5CVJA 1UFMA 1V4RA 2KIFA 3J80Z 2RNJA 3FXQA 5ISUA 3GXAA 2QPQA 4A6EA 3ZN0A 1DTGA 2O84X 3FIRA 5AA2D 3B6WA 4R75A 4LZ7A 4WEPA 1O7LA 1JW1A 5E1WA 4RB1A 1O63A 1CE2A 1B3LA 1TW2A 2P7CB 2H09A 4GCVA 3V5AA 2VONA 4M6XA 5F64A 4O3BA 3T66A 3DPTA 4GFRA 1IAWA 1XOCA 1USTA 2NNNA 1XGOA 3MAJA 3SFZA 2P2AA 4RY1A 1UHWA 5KCJB 3KEQA 3O28A 4QFPA 1U2WA 4N6PA 1K79A 4WWCA 2HS5A 3FASA 4L9JA 5H8NB 4R73A 2JZYA 4IO2A 3OSRA 1B0HA 1ZLKA 4JBZA 4M71A 4PDKA 4QFOA 4EJWA 4K3FA 3FUZA 4YKIA 1R7JA 4HX4A 2VOPA 5EHSA 5HBCA 3MP8A 2P6SA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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