3FZVA

Crystal structure of pa01 protein, putative lysr family transcriptional regulator from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
sequence length
297
structure length
285
Chain Sequence
YTLRQLKYFVTTVECGSVAEASRKLYIAQSISTAVKGLEESFVQLFLTPAGARFYRKAQELLRMAHEFEQNLADNDVIAGQIDIGCFETVAPLYLPGLIAGFRQAYPGVEIRIRDGEQQELVQGLTSGRFDLAFLYEHDLDSTIETEPLMPPQRPHALLPEGHRFAGQAQVSLRDLCLEPMILLDVQPSRTYFVSLFEELGLTPNIAFSSPSIEMVRGMVGQGFGFSLLVTRPHSECTYDGKKVVMVDLAEPVSTSGLAAAWLKRAQLTKPARLFVDYCREQLGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of PA01 protein, putative LysR family transcriptional regulator from Pseudomonas aeruginosa
rcsb
molecule keywords Probable transcriptional regulator
molecule tags Transcription regulator
source organism Pseudomonas aeruginosa pa01
total genus 68
structure length 285
sequence length 297
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3fzvA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fzvA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fzvA03
1PP7U 4MBPA 3ZN1A 3U2RA 3H7MA 2XXTA 2MA3A 2UWMA 2IA0A 3W6KB 1J2XA 2B65A 5AA2B 2BJJX 3CFXA 4BDQA 4PFTA 1YG2A 4UV8A 4UA8A 2WWYA 3PPNA 2DW4A 4JB7A 4EQBA 5AE4A 2QLZA 3T9VA 4EXKA 1DTZA 3ROUA 5D5WB 1QGPA 2OCUA 1VSOA 4O3CA 3HV1A 1B5HA 4Q48A 2ADUA 5FLXZ 4POWA 2CW0F 5I59B 4HTGA 3TELA 2DSFA 3W9VA 4FJPA 4UVCA 4NWCA 2GA2A 1FNNA 4WXHA 2PVUA 4MFIA 3TFLA 3MAMA 1UB9A 3HRTA 5CMMA 2OZUA 3C9HA 4GRKA 4A5MA 2VE8A 2YR2A 2XXVA 3ECOA 2H99A 4WWCA 1MQIA 2DWIA 1X3UA 1B3HA 1LSTA 2STTA 1SVXB 2THIA 2DS9A 3V7RA 4PFYA 4HF1A 1XS5A 2PI0A 1BI3A 3ABTA 5JK4A 3O3KA 4I01A 4R2FA 3OXNA 3HRUA 1D3YA 1DTGA 1U5TC 2F5CA 4MHGA 1ZU0A 1KYWA 2HZKA 3KGCA 5BQTA 1KWHA 3ZMVA 1AWCA 3HIFA 2YSRA 3JSOA 1N04A 4GFRA 1FC3A 2P7VB 3F22A 1S29A 2DFIA 1YTYA 3SETA 5EHMA 3R61A 4GCVA 2AL5A 4KFQA 1OPCA 3C33A 2WV0A 4BDNA 1MRPA 1A7LA 1W4MA 3PQJA 2FA7A 2B0LA 5K2YA 3I64A 3IX1A 3PU5A 4WXJA 1UIVA 1L5TA 4E0XA 3ZQ7A 3QSLA 4KNYA 2PMUA 2EFOA 4LB6B 1AL3A 1K79A 2RC9A 4U7DA 3V7CA 1TWYA 2XXQA 2ZJ2A 4RPOA 3OSRA 4JBZA 1A04A 3JAMZ 3RUMA 5I57B 2VD3A 2F5FA 3KLOA 3T5XA 2Q2CA 2KIMA 1ZBMA 4DE8A 3GLBA 2Y7KA 4YICA 1LAXA 4KCDA 2EJRA 3QRFF 3C1DA 2O7UA 1LLSA 4BDRA 1N0TA 3HSRA 4OOIA 5K5QA 2XXPA 4R6KA 2VN2A 3E13X 1KQ9A 2ZXTA 2HOEA 1ZN2A 1B59A 1SMTA 1QVSA 4KIFA 3FZVA 3KZYA 4KQPA 3U72A 1O7FA 4ENNA 1LQ1A 2O6GE 1GR2A 3J81K 3F8BA 2QRYA 1LNWA 4OERA 1TQMA 3A3UA 4UXNA 1T98A 3TTLA 2X0LA 5DUKA 3MPKA 3S9NC 4PETA 3HRSA 3NEUA 5HS7A 1G3SA 1XC1A 1MKMA 3IB1A 1IXGA 1HSJA 3H3UA 2PG4A 2PT2A 1FBQA 3DPLC 4KN4X 3MP8A 3LR1A 2WKYA 1CGPA 2G7HA 5E1WA 1UFMA 3K6WA 5I57A 4H0EA 2AS5F 3QPHA 3J80Z 5LRSA 2JPCA 1LDKB 3C35A 1Z9CA 3B6QA 1B3GA 3A3CA 1WI9A 3SZTA 4PZJA 1RNLA 5JFRA 1YYVA 1OLAA 2XV4S 4ZE9A 1BIBA 1G3TA 4KHZE 3P9CA 3KN8A 4DLDA 4ENKA 4YIFA 3EPEA 5L3GA 5LLQA 3IWZA 4EQQA 2FEZA 5FFZA 1SFXA 1W5TA 2RGVA 4H65A 4KYSA 2F5EA 1IZ1A 2H98A 4ZEKA 2XROA 3H03A 1YFHA 4CICA 2QZ8A 2D3IA 3L9FA 1MXWA 3TPAA 1PBQA 3FJMA 1FX7A 1HKQA 2L3DA 5AA1A 4WEPA 3TDZC 4GXSB 2R9JA 2XX9A 3FWEA 1F4KA 2FSWA 4YMBA 3GZ5A 4G94A 3CVGA 1VE4A 3KCCA 3TKYA 2FU4A 4P9UA 3LAJA 1EZ9A 3D4GA 2FQ3A 3EDPA 1ZH5A 3ULQB 4GWOA 3IO6A 3F6VA 4JBAA 2F8DA 3FXUA 3CR9A 4BYYA 1FY7A 3EUHA 1WDNA 4NE4A 2ONSA 4F1YA 1BP5A 4HQEA 1SYIA 4OFJA 3DEUA 1JETA 2GXBA 2ZO4A 4M6YA 5E8IA 2M30A 4DNCA 3BY6A 2VHAA 1CF7B 3SDFA 3PUVE 1KU2A 4ON0A 3FVNA 3FMRA 3PUXE 1B6HA 1JW4A 1HKSA 1Y4TA 3SHFA 2O1LA 4XKPA 3P7IA 1JXSA 3EN3A 3G3FA 4O3MA 2PEXA 3FV1A 2VBWA 4U0WA 3FMQA 3LQRA 4GIZA 2REJA 2XAQA 1POY1 4RGRA 2QPQA 5E17F 4M71A 4Q47A 2PX1A 3QU6A 4FECA 1NL5A 2M5WA 2Z99A 4L0ZB 1MY4A 5LHHA 1I5ZA 2GZWA 3UN6A 4HW8A 1N7XA 3M7GA 3GFMA 2OU2A 2OA4A 4L0YB 1B5IA 1OQGA 4AIJA 3WE3A 3K4UA 4H5GA 2WC2A 4M1VA 3VODA 3QK6A 2V1XA 2FOKA 1B0HA 2ETHA 2RDPA 3CIJA 2UVGA 1WVJA 2NVUB 1CF7A 1L3LA 1IN8A 3CSGA 4X48A 2F6GA 4LVQA 5J6XA 4H67A 4OYVA 2MH2A 1U5TB 3WTZA 4ESXA 4A0YA 4NQWA 1STZA 3ZN0A 4L9VA 1FSHA 4RK9A 5EHSA 1MPBA 3W9WA 5TJJA 2XVCA 4PGHA 3T93B 2XRNA 4RGUA 4WCGA 3S9EA 3E97A 2Y0MA 3O6BB 3L6HA 4OVJA 1Z05A 1YLFA 4M74A 5AIPA 3ML6A 4THIA 3C4MA 3ZKLA 2P1SA 1MJBA 5I2KB 1XVYA 1F9BA 5CBRA 5JR3A 1T0FA 2Q2EA 5A2QK 3E6DA 4PGGA 1T38A 4N9HA 2NYXA 5D6EA 2Y84A 1O7TA 1VFDA 3HN0A 4G4PA 1USYH 1D4NA 3D0SA 3FVOA 1JVXA 1YIOA 4XKNA 3U94A 3K0LA 2X4HA 4WXCA 4X1DA 2GQQA 2FE3A 1R1TA 3MCZA 1M5FA 4WKMA 4QFPA 4Y17A 4I09A 2ZCWA 1U5TA 4QFKA 2QYOA 5CI5A 2UXXA 3QUJA 4ZYHA 2XX7A 1IF1A 3OO8A 3F23A 3CUOA 4JQFA 5TU0A 5CRYA 4L9JA 1MH3A 1TFAA 3BBRA 2AYSA 4LQ5A 3K01A 3O29A 4G7OF 1B3EA 1XVXA 1NH7A 3RGYA 2CYYA 3G3IA 4CZZA 1ZLJA 4F19A 3BJ6A 1SD6A 2P6SA 4QHQA 5ICQA 3TAJA 4HBLA 3KZGA 3RY3A 2QENA 5J8FA 5I2KA 2LF7A 2MBFA 2PBIA 3GFJA 3Q25A 2Q89A 2ZYOA 1SMYF 3MVYA 2E1SA 5H8NB 4OZ9A 2CSOA 3FATA 4BXUA 5LBQA 1H44A 1ZHFA 1MH4A 3Q28A 1D9YA 3O66A 4ZDMA 3VLVA 3TODA 5B70A 1FT9A 2GFEA 5FD6A 3K6XA 5LGNA 5DEQA 2HS5A 5DV5A 2Y7IA 4GXOA 3FIRA 5TRDA 1SW4A 4AIKA 1UHMA 3RN8A 1R5GA 4E0WA 5CVVA 2H94A 4HOBA 2F7AA 2FMLA 1O3SA 4FT8A 4G6DA 1Y1ZA 4N6PA 1B4ZA 3I0TA 1O63A 4KPTA 5H6QA 3C3WA 2QS1A 4EUOA 1F1ZA 3E5QA 4EDPA 1W5SA 2X7QA 1IXHA 3U92A 3S9LC 3KP5A 1JQFA 2W85A 3E3VA 5I56B 2UXNA 4F3SA 5FFXA 4OEVA 1B58A 2UVHA 5KDTB 1SFUA 4QSCA 5KVRA 1S50A 3WGHA 1REPC 1ZARA 2M1BA 3WODF 3LBSA 3GW2A 3R7XA 1ZGAA 1SQYA 3MP1A 3S4UA 4FIMA 2GH9A 5I2NB 3MZ1A 3B6TA 4PE5B 4EF1A 2VC0A 2EV5A 2QBYB 2PJPA 4GL0A 5CBSA 1B51A 5K5RA 4L18B 4RB1A 3FM5A 4G68C 2ZKZA 5L9MA 3GBBA 4IO3A 5FHMA 3FASA 3UIFA 2YJPA 3PGFA 2NNNA 5JEIA 1EH3A 1P1NA 4A5NA 3KSXA 4R73A 1EZPA 4NF5B 5HS8A 3GYHX 4QRZA 3IOTA 1SW2A 4NEDA 5I58B 4HLYA 4U21A 5DYMA 4S04A 1J75A 2PT1A 2F5XA 2W57A 2UVIA 5L3BA 1EH8A 5F6FA 2C6YA 1PB9A 5I56A 5CC2A 3CG3A 4P0IA 4Y15A 1PB8A 4OMYA 1B7ZA 3V8JA 1G4DA 5F7VA 5KDTA 4EJWA 1XCBA 3ZPLA 4RXLA 4NF8B 1QKAA 5IKBA 5CVRA 2PMSA 1NNTA 4LK0F 2YU3A 5H8QB 4GYIA 4RPNA 1JHFA 1YW9A 2FF4A 4R74A 4RAYA 1I27A 1RIOH 5D8LB 5AIQA 1USTA 4LJZF 1ZRDA 2QBYA 1IQ7A 4TQUQ 1EZOA 2VODA 1Z7ME 1O3TA 3LAPA 1GHCA 1MY0A 1Y20A 5DVJA 4AB5A 5ICCA 5E1XA 1OMPA 3THIA 2V84A 4F18A 1E17A 4P55A 1ODDA 3PMVA 4IHTA 5AA2D 1BBYA 2HYGD 4OIQF 2D1HA 4I2OA 2A5TA 3OOPA 5HLHA 1XCVA 3WAFA 4HX7A 4KCCA 4NMYA 1IN7A 3J81Z 4BAYA 3G3GA 1UTBB 5DTBA 1XGMA 4IB2A 3N97A 5I58A 3J7AO 2W25A 4GQOA 3KP2A 4ZYDA 3GLXA 4LB5A 2DVZA 1QNTA 4B09A 3RPQA 4KYWA 4XXUA 4UNOA 3MQ9A 1ZAOA 4AB6A 2OZZA 1MY2A 1LDJA 3PFIA 2YPNA 4NF8A 1VTNC 4OFOA 3RKYA 2OLBA 3BFTA 4U1ZA 4XLPF 3KEQA 2QL3A 4TOZA 3H4ZA 1QUKA 2ZBKA 1B46A 3FJ7A 3E4RA 3T96B 2RC4A 5BPDA 1ON1A 2DQLA 2HKXA 3TOAA 5K1YA 2HQNA 4KYDA 2F36A 4R79A 3W6JB 4L9TA 3QAHA 5L3FA 1B7UA 1SI1A 4BDMA 3DELB 3TYHA 2W84A 2HEOA 3HUGA 4BNCA 1QZYA 2V3UA 3I5UA 3PQKA 4K2EA 2DPUA 1MXUA 3KE2A 5D4SA 5H20A 2RKMA 3ECHA 1UTBA 3HHFA 3TO9A 5ISUA 3I71A 3WTXC 4IO7A 1JEUA 4N13A 4I02A 2KJBA 1ZRFA 1FTOA 2Q2AA 2M8EA 2XKOA 1FZPB 1OLCA 2QQAA 3MVZA 4XIGQ 3LWFA 3L6GA 2FBKA 2ZNUA 3ELKA 3OO6A 5JVTA 4HYEA 4D0PA 3GZGA 3EYYA 3KP3A 2DQVA 1ZLQA 2ZNTA 3FF5A 4LGWA 2Q0OA 2O8XA 4HZFA 2IEEA 2GA1A 4QWQA 2DXRA 2KIFA 3OEMA 1MQHA 4XRFA 2DWHA 4IJAA 3RLFE 5L8DA 1B9JA 1AOVA 5KK1A 4U0VA 1I1SA 5DCMB 3KP7A 3MWMA 3JZJA 4M9SA 2XHKA 3HYIA 2QJEA 3EETA 5HLGA 4DIGA 4RGXA 1SD5A 2RKHA 1T2KA 3QPTA 3H6WA 2EV6A 5FTHA 4GGGA 1R1VA 1USYE 3UP9A 4A2UA 1MPDA 2D21A 2R6GE 2CWEA 1OKRA 1ZYRF 1U2WA 4BHBA 4ELPA 4Z0IA 4OMBA 4EGZA 5F1RA 1QKBA 1PDAA 3COAC 2O1MA 2VXZA 1OYIA 2ZMEB 3IJOB 5CMBA 2LAOA 2NOOA 2E7XA 4R72A 2OD5A 5L9SA 2EWNA 5DCFA 4MTDA 1KYZA 5LHIA 4PP0A 3A09A 1O3QA 1MQJA 3C18A 4L9NA 3SEUA 3U1DA 2VT2A 2OAZA 3CJNA 1S7YA 1S9TA 3T9UA 1ZRCA 1P2FA 5HDNA 2CG4A 4GF8A 1K78B 4RAZA 1ZIUA 2DE3A 1B7HA 4NB5A 1Y0UA 3M3FA 5DCMA 2QS4A 1HSLA 3WG9A 3UK4A 4NF6A 3MJNA 1ONVA 4RS8A 4YB5A 3BKIB 5H8SA 3QIMA 1B6AA 1P4WA 1D5VA 2XD3A 2V3TA 4EJTA 1CB6A 1UIUA 2XUBA 4OESA 5F1QA 3RT8A 5HOOA 1N3XA 5KZTA 5AA4B 4POXA 2MD5A 4BLAA 3ZMTA 1N76A 4HF0A 1BKAA 5HVQC 3H6VA 1IRGA 2RCAA 4F22A 1O7LA 1TW3A 2OBGA 1AIVA 2ONRA 2O6AA 1Y9UA 1URGA 4H6DA 4F1UA 3V83A 4XLNF 4G68B 5HPQA 3E6BA 5TPAB 1NMUA 2ZMEA 1IXCA 4IRIA 2HZLA 2QS3A 3T66A 4QF9A 4UACA 4CGZA 3N5LA 4OENA 3NRVA 5JHUA 2Z5UA 3TGNA 4KMUX 3HSEA 4MTEA 3WU1B 1M5CA 5CYVA 1N3WA 2DYXA 3HSTA 4NWDA 2XAFA 2HTSA 1D8JA 4IO5A 4ZYEA 3M8FA 1JNFA 1NNKA 2ZYMA 1K78A 1HBXG 3GX4X 2UVJA 1SD3A 2ZYNA 3IO4A 1OYYA 3SXYA 2J5PA 5A2QZ 4OEUA 2OWTA 3LFKA 3QP6A 2BBYA 4HX8A 4G2ZA 4L5IA 1ZG1A 5AA4A 3G3JA 3BROA 3SEVA 4HV6A 3PPRA 1P99A 4IO4A 4YKJA 5KCJB 2IJLA 4HV5A 5L9OA 5HS9A 1LGBC 2LF8A 2GHBA 2NS0A 4DXUA 2QMXA 1EH7A 2ESNA 4IHSA 1LBCA 2I49A 2GWRA 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