3HHGA

Structure of crga, a lysr-type transcriptional regulator from neisseria meningitidis.
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
KTNSEELTVFVQVVESGSFSRAAEQLAMANSAVSRIVKRLEEKLGVNLLNRTTRQLSLTEEGAQYFRRAQRILQEMAAAETEMLAVHEIPQGVLSVDSAMPMVLHLLAPLAAKFNERYPHIRLSLVSSEGYINLIERKVDIALRAGELDDSGLRARHLFDSRFRVIASPEYLAKHGTPQSTEELAGHQCLGFTEPGSLNTWAVLDAQGNPYKISPHFTASSGEILRSLCLSGCGIVCLSDFLVDNDIAEGKLIPLLAEQTSDKTHPFNAVYYSDKAVNLRLRVFLDFLVEELG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The structure of CrgA from Neisseria meningitidis reveals a new octameric assembly state for LysR transcriptional regulators
pubmed doi rcsb
molecule keywords Transcriptional regulator, LysR family
molecule tags Transcription regulator
source organism Neisseria meningitidis serogroup b
total genus 69
structure length 293
sequence length 293
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3hhgA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3hhgA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3hhgA02
2EV0A 5L3GA 4QSCA 1FOKA 3GYHX 5B70A 2HTJA 2Z8DA 3OEMA 2FBKA 2ZYKA 4FX4A 3R0JA 3ROUA 4OFLA 1B51A 4Y13A 5KDTB 4ZZEA 1UHWA 2XV4S 1H43A 1SQYA 5ICFA 1FQEA 2MLGA 4ESXA 1Y3PA 3KEOA 1Z1DA 1TQIA 2F5FA 2PT1A 1QKBA 1M5EA 1G4DA 2HQRA 1O64A 4YKJA 3LQRA 4P55A 4GYGA 4QLCU 3H3GA 1K78B 4E0XA 1N7WA 1AOYA 2DW4A 4KN7X 5DD4A 3DP6A 4GD5A 5ICTA 3ECOA 2XXIA 3FJGA 3RKWA 2E1NA 2PX1A 2STWA 3TYHA 2RQPA 4ZZAA 2EWNA 3GFMA 2K27A 3KZYA 1B58A 1FYLA 4JWYA 2VD3A 1XVYA 2F35A 3FMRA 4EM2A 5LGTA 3PMXA 2I4BA 5H8QB 2ZMBA 3CSBA 1W7PB 3D5LA 2B3BA 5F64A 3QIMA 1ZG1A 1Z91A 2VOZA 4EJUA 1GXQA 2XXQA 1QZYA 3DV8A 2RN7A 5I57B 1Y1MA 2F34A 5AA2D 3PMWA 3ILTB 4DXCA 2B0LA 2GQQA 2O61A 4KMUX 2DYXA 3KJTA 2OU2A 4XKRA 2W25A 2DQLA 1I6AA 1Y3QA 3I71A 1Q1HA 3VXCA 2DWAA 4JDFA 2P7VB 3ZS6A 1SFXA 4KYSA 5I58A 2ESHA 1HBXG 4GO1A 1SVXB 1L3LA 1RNLA 4LA9A 4IHSA 1W5SA 3MPLA 1USSA 3T96B 4R6YA 1R9LA 2VC1A 3S2WA 3LA7A 1J5YA 1Y0UA 4H65A 2YR2A 1XD7A 3E6MA 3B6TA 3KJ7A 1GV8A 2XUBA 1UTHB 1H9GA 4JBZA 4RAYA 1HSEA 3QPTA 3QRFF 4CDGA 3FHZA 4YIFA 1URGA 3FMQA 3KFMA 4KICA 1KYZA 3MZ9A 5JK4A 4K3FA 4GCVA 3O6GA 2VOOA 3C4MA 4A2UA 3IC7A 3KP4A 4FIMA 5HOOA 1ONVA 2EFOA 3K02A 1I6XA 2ZNZA 1I1SA 3LFKA 2CWEA 2XIGA 2V1XA 3WGIA 3K6UA 3PQKA 4HF2A 4PFTA 1POTA 3SEWA 2XKPA 1FPQA 4EVIA 1LDDA 1L5TA 4UACA 3BROA 1MXYA 2WC2A 3QSLA 1GXPA 3L09A 1B4HA 3L2CA 2XASA 3EHTA 5I2KA 3E6BA 4ENMA 2Q2EA 3OSRA 3K6XA 4BDLA 3IJXB 4YFNF 3HHHA 1L0OC 3HIFA 4ESJA 1QBJA 5CI5A 1ZH5A 2UYFA 3HO7A 2H5YA 4HA8A 2R71A 3GWZA 3QP6A 3IL1B 3DM0A 2NOOA 1T0FA 2P2AA 3SHFA 3HSRA 4PETA 1BJAA 3MP8A 1N04A 2Q2AA 1P1QA 2LF8A 4DNCA 3CLOA 1EH6A 1EZOA 4KA4A 4LONB 1XGOA 2LAOA 1T98A 1P99A 4U0YA 2UYEA 2D5WA 1R58A 5L9MA 1KQ0A 3L00A 4RNSA 4C1UA 2Q89A 1FZPB 3JV9A 1MDQA 3OO7A 4F3PA 1PC3A 5BPDA 2IA4A 3TTKA 3RGYA 1FSEA 3DPTA 3ONMA 3MPKA 1SW5A 2QBYB 2UVHA 1B40A 1B4ZA 3F6VA 4GL8A 4OZ9A 3VB2A 2X4HA 4OWDA 2H94A 2QMWA 2AYSA 1BOAA 4BDOA 4JB7A 2P5VA 4H1XA 2DVCA 2E1CA 1BLFA 3QUFA 2HQNA 4U7BA 2YLNA 3KEQA 2XAGA 2UZKA 3T0YA 2FF4A 5D4SA 6PAXA 3G3HA 2XXWA 1VSOA 4KFQA 4I02A 2FRHA 3CVGA 4YB5A 2VC0A 1IN5A 2QENA 3WTSC 1H44A 1LAGE 2RV8A 3H06B 3TELA 3SQNA 3CO6C 4U0VA 2R3SA 5H6QA 3MAMA 1LEAA 2HWVA 1UB9A 1EH8A 3OEKA 1FP2A 5CJ9A 5D8LB 5L3FA 4PFWA 2ZYNA 1N3XA 5E18F 5HS9A 4ETSA 3KZZA 1A40A 1ZRCA 2KRFA 2OWSA 2ESNA 2K4JA 4Q30B 3IOTA 4HF0A 2VHAA 3CRBA 5CVIA 3S9EA 2MLKA 3RTRA 5LHIA 1REPC 1B1HA 3HUGA 4EDPA 2V3TA 2RCAA 4IXAA 4ZZDA 1R5HA 1B3GA 2RC9A 4BDNA 2GAUA 4ZE9A 5I2NA 5I56B 2VE9A 1FQFA 4NF5B 2EA4A 4NTLA 3PPOA 3TCHA 2NVUB 3VLWA 5BPIA 4L9TA 3O66A 3L6HA 3R7XA 1IEJA 5F6FA 3H3ZA 1YPNA 4UV9A 1S3JA 3RKXA 1ELJA 4OETA 4U1OA 3TTLA 3K6VA 1FT9A 1XT8A 3I59B 5HM4B 4EF2A 1HW2A 4EXLA 3VLUA 3RYPA 5BQTA 3IRRA 4L5IA 4HQMA 2ZYMA 4OEVA 4MQ9F 2DI3A 2OWTA 2L3DA 1IRGA 4ZE8A 5EYFA 3E6DA 2VBZA 4F3BA 3SEUA 2XXVA 1B46A 1HKTA 3TTMA 3KLOA 4HTGA 4G8NA 2F5XA 2JPCA 4LK0F 1SMTA 2UVJA 2CFXA 1RIOH 1DP7P 2AL5A 4F22A 1TQPA 2V3QA 2EV5A 1AOVA 4HLYA 1URSA 3BP8A 3IB1A 1OIBA 4O3BA 4NF8B 1B7HA 4NE4A 4EQBA 5AONA 1G6NA 2XHDA 2KIFA 3U2RA 3I4PA 3MFKA 3OO8A 4G8XA 1O63A 1R5GA 4IRGA 3R61A 3K00A 4P9FA 2HAUA 3MP6A 2P0SA 3T9UA 5KDTA 1IXGA 4RB3C 2QL3A 4A6EA 2HKXA 3M8EA 1XHYA 5J8FA 3F3XA 3WU1B 3QPHA 2XX9A 2OZUA 4UNOA 4EF1A 1FNNA 2LF7A 2Q8JA 1FBSA 3RPQA 1P1WA 3ZSFA 1K78A 3CUOA 3WTTC 2HQ0A 5CVVA 1FBQA 5EEHA 5FFZA 4TOZA 1D9YA 1TQMA 1LB9A 1MPCA 3L6GA 5CBRA 1JW1A 4YMAA 3K2ZA 4ASNA 2G9WA 1KA8A 2I6EA 2K4BA 1MDMB 5HBCA 2HZKA 1PEBA 1YG2A 5H8QA 5D4RA 2OA4A 3TGNA 1W7PA 1G3YA 1P6RA 2RVCA 3E3KA 1DPUA 5J8CA 1MJ9A 2LNBA 3F6OA 3F8NA 1YW8A 1MQJA 3V4GA 2X7QA 3PUVE 3LQQA 3WE2A 4R73A 2HYFA 1SDXA 4M9SA 2BE5F 2PMSA 4M6YA 4EJOA 2RDPA 4AVPA 5I57A 3C36A 3ABTA 2PYYA 3FJMA 4BHCA 3MBPA 2QMXA 4P9UA 3MZYA 4XXUA 2PG4A 1US4A 4HQEA 1MS7A 2M5WA 2NYXA 2Y7RA 2RC8A 1CGPA 1JW5A 3OXNA 4JQFA 2FU4A 3HPIA 4OEUA 1IXRC 3Q29A 2OZZA 4ND9A 3O9PA 1S8NA 1S7YA 1BKAA 1N0TA 4BNCA 4M73A 3H6WA 1MXUA 1SAXA 4EGZA 2RNJA 5HDNA 5EHMA 2EFNA 2XXRA 2WV0A 3T5XA 1KU7A 3HRUA 1ZTYA 4NMYA 2UWMA 2FNAA 4QHQA 3UN6A 4IO4A 2W85A 3VVDA 1FTJA 2DE3A 2Q88A 2ZNTA 2O0YA 1R9QA 2FBIA 1UTHA 1XCBA 4E0WA 4KNYA 3TO6A 4THIA 2QYOA 1HXDA 3EQ1A 4BLAA 4YICA 3LR1A 2XRNA 1VFDA 3R60A 3V8KA 5EEGA 5H8HB 3VV5A 1MPDA 4ZECA 1MXVA 2I3VA 2V79A 2HEOA 4N6PA 3IAZA 1M5DA 4HS7A 3CUQC 2BYVE 4ZYHA 1YTYA 3LBSA 2PFBA 3TQWA 4EQQA 3RYRA 4H5GA 1XSVA 3GBAA 4O5VA 2HS5A 1JQFA 1SW2A 4RS8A 4R72A 2L4AA 4EV0A 2ZCWA 3KSJA 4G68B 5ILVA 5DV5A 3CFXA 1O7FA 5ICCA 1QGPA 4PCQA 2GHBA 1IXSB 2GH9A 5JR3A 5FLXZ 4Z7EA 4X9TA 1R36A 2HEUA 4MBPA 4MGRA 4Q8RA 3V89B 3WTUC 1HW1A 5DYHA 2D1VA 4IO2A 1YLFA 4OHNA 1SD5A 3ZQ7A 1YIOA 2DK8A 5CMMA 1KQ9A 4BAYA 1BI2A 3GLBA 1RYOA 4C0RA 4POWA 2CQKA 1QPMA 1PB7A 1N3WA 3CUQA 4F1YA 3FVOA 3ERED 3FX3A 1D8KA 4R75A 2GA2A 4EGYA 5AA4B 1RI7A 2KIUA 3CSGA 1BBYA 1UFMA 1LDKB 3IKVA 2DXRA 2ISYA 4L5JA 2K7LA 3PPPA 1O3RA 3G3KA 2VONA 1JNFA 2RC4A 4MFIA 3RPUA 2QBYA 1RZ4A 3GFLA 4Z2YA 4HF1A 2ONRA 4LG0B 1FYMA 1XCVA 1LAXA 3USDA 2NNNA 1LB2A 2VP1A 2CW0F 1D9VA 1QULA 3DPLC 4NHJA 4OXVA 2VE8A 1SD6A 1QUJA 2A6EF 3TKDA 3I5UA 4GWOA 2B65A 3NQOA 2IA2A 2H6BA 3H7MA 1F1ZA 3DKWA 4KCCA 1O3QA 4KIFA 3TTNA 4DZ1A 4LZ5A 1YTVA 4AIKA 1YO5C 3EF7A 3VE1B 3RTFB 4GL0A 3ZMZA 5L3BA 3CR9A 3CFZA 3BPXA 1NNKA 5E1WA 5E8IA 1M5BA 4ZH4F 1B9NA 4I0AA 2V25A 2O6GE 3A3UA 1FX7A 3GZ5A 4PZJA 1HSTA 4IGTA 5I84A 1EH7A 3UORA 4ZEIA 3CIJA 4ENJA 3N6TA 4LLLA 1N7XA 3GXAA 4DXBA 1LEBA 5JHUA 2F6PA 3GBBA 4I01A 1F9NA 1ANFA 3S9MC 1QKAA 4PQJA 4CICA 4Q4ZF 3SZPA 1JXSA 2FMLA 1S7OA 5TP9B 2QWWA 5LHHA 1QJMA 3WTYC 1H0MA 3TO7A 5DDGA 3V8XB 5I56A 2ZFWA 4NF5A 1ZAOA 4IF4A 4LGWA 1IW7F 4LB5A 1SFEA 1YS7A 1NH8A 4ONYA 4X1BA 2OQGA 4DLDA 2VD2A 2ETHA 2XAFA 2DWHA 2MH9A 4G94A 3WG9A 3KZGA 4F3SA 2RGVA 4I98B 3I59A 2QJEA 1H45A 3DELB 4CHUA 1S29A 1MJBA 2HGCA 5LEKA 3MVZA 3BJOA 4LZ7A 4MH5A 1J2XA 4G6DA 2GFEA 4OENA 5H8FB 1LJ9A 4PFUA 2YPRA 4GGGA 1P4WA 3SEYA 4ELQA 4R6HA 3TODA 1ZKBA 1W5TA 1N84A 4NQWA 3DLNA 1LFIA 1IIWA 1GTKA 2I3WA 4R74A 1PDNC 2F5EA 4MNUA 2V1DA 4OINF 3KSXA 5DUKA 4G8HA 2H25A 4IRHA 1MH3A 1NFTA 2VODA 4NF8A 1XB4A 3BJAA 2DFIA 5H6RA 4YKPA 3IRQA 2VBXA 5BWJA 2P5KA 4ESFA 4RGSA 2FBHA 4HV5A 3TDZC 3JSOA 1FQDA 1TW3A 3FIRA 1ZLKA 4ZEDA 2G29A 3QK6A 1EH3A 1IN4A 1D3YA 1O3SA 4KIGA 2H4IA 2G7HA 1WODA 2UXNA 3O2AA 3K0LA 4WK8F 3H92A 3KOTA 2ZXJA 1T39A 4F2QA 1IQ7A 1Z6TA 5ERIA 2GXBA 2QLZA 1H9TA 1HW5A 1A54A 1P1NA 4I8CA 4LJZF 1MJAA 4R6KA 2E1SA 2A61A 2QZ8A 4ZYDA 4PDKA 1WQ2A 1BIAA 4JWOA 3PPNA 3C32A 3E4RA 3LSLA 2FQ3A 1Y20A 4S05A 1K6OA 3PUZE 4U22A 1O7TA 5CRYA 3MJNA 2YPNA 2QM3A 2I4CA 4FJPA 3KG2A 3JW4A 5AIQA 5ED4A 2RINA 2VN2A 3J80Z 1A99A 3SKPA 2H27A 2DSFA 1F5TA 2EFWA 1UTBB 3S9LC 3LC8A 1W7PD 2EFPA 3I6VA 5CYVA 4OTEA 4QFOA 3C35A 2A68F 4H5FA 2VT2A 4EQ9A 3WODF 3C33A 2FNPA 3UK4A 4JK1X 1TNTA 3PV0E 5DVIA 2OCUA 3KN3A 3LSFB 1TFAA 1U5TC 4KN4X 2OLBA 2W84A 1FC3A 1R00A 3JTGA 2OZ6A 2YSRA 5DYMA 4DXUA 5K5RA 1B5IA 5IT9Z 1UIVA 1D4NA 5KCJB 4LZ8A 3GZGA 2HTSA 4A5MA 1NHAA 1B3HA 2A5SA 5E20A 1NNFA 2Z22A 1MY2A 1ZU0A 2REGA 4IB2A 4XKQA 1KU2A 1NNPA 1U78A 3B6QA 4G8MA 1HSJA 2Z9OA 3D4GA 1A8FA 4QFLA 1R1NA 2JTVA 1DTGA 1OYYA 2BGCA 4G4PA 4HYEA 1BN5A 1LBBA 4F3GA 2QVOA 4KD5A 4U21A 3P7IA 3V83A 4YB6A 1GVCA 5H8HA 2HOEA 5JFRA 1JETA 4XBFA 5CM6A 1YCJA 4I09A 1B59A 2NWJA 3HOSA 5F1RA 3U92A 1IZ1A 3K4UA 5BMZA 2O1MA 2P5LC 3G3FA 4G77A 3KP6A 4FE8A 3TMGA 3THIA 2FEZA 3TQLA 3JAMK 1U5TA 3GVAA 4KR5A 2JZYA 5ICQA 3HHFA 3Q5FA 1VTNC 4FORA 3J80K 1BM9A 4H0WA 1BI3A 5L3CA 3MWMA 3PPRA 2VOPA 3Q28A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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