3HHGA

Structure of crga, a lysr-type transcriptional regulator from neisseria meningitidis.
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
KTNSEELTVFVQVVESGSFSRAAEQLAMANSAVSRIVKRLEEKLGVNLLNRTTRQLSLTEEGAQYFRRAQRILQEMAAAETEMLAVHEIPQGVLSVDSAMPMVLHLLAPLAAKFNERYPHIRLSLVSSEGYINLIERKVDIALRAGELDDSGLRARHLFDSRFRVIASPEYLAKHGTPQSTEELAGHQCLGFTEPGSLNTWAVLDAQGNPYKISPHFTASSGEILRSLCLSGCGIVCLSDFLVDNDIAEGKLIPLLAEQTSDKTHPFNAVYYSDKAVNLRLRVFLDFLVEELG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The structure of CrgA from Neisseria meningitidis reveals a new octameric assembly state for LysR transcriptional regulators
pubmed doi rcsb
molecule keywords Transcriptional regulator, LysR family
molecule tags Transcription regulator
source organism Neisseria meningitidis serogroup b
total genus 69
structure length 293
sequence length 293
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3hhgA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3hhgA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3hhgA02
4MNUA 2HFBA 4KYDA 1FCKA 4C1TA 5AA4B 1GXQA 2K4BA 2Z5UA 3WGIA 1B58A 2P8TA 5CI5A 3DXJF 1OLAA 4R6YA 1L3LA 2HS5A 3IHUA 3ZS6A 3Q9VA 4I0AA 2Z9OA 3Q28A 3WE2A 3KP4A 1LFGA 2V3TA 4R8HA 2QLZA 1R1NA 5BQTA 4DCXA 4GL8A 3EETA 1MD0A 1TW2A 4NTLA 1ZU0A 1JEVA 2F5XA 1N04A 1VFEA 3IX1A 3HTUA 4KN7X 5CC2A 2OZUA 4ESWA 4JB7A 3EHTA 2FA5A 1DDNA 4NWCA 1WODA 5H8QB 2YPRA 4HX4A 4FAJA 2UZKA 4ZEBA 3P9KA 5AONA 3FVNA 3SHFA 1S8NA 4X1BA 4E0WA 4NF8B 1MDP1 3ZMSA 4Z0IA 3ECOA 4Y17A 4ZH4F 3WTWC 4UUVA 4GXAA 1CB6A 1OR7A 1DPPA 1MZBA 1IEJA 2ONSA 1XVXA 1F5TA 4BXUA 5DVJA 4M6YA 3O66A 1OYWA 1ZARA 3UORA 3WTZA 1US5A 1J0RA 2X0LA 4E0XA 3CFXA 2CSOA 4I9DA 4OMZA 2XXRA 3SETA 3ZMUA 4ZEIA 3KN8A 3PUXE 4HZFA 2VBZA 3FMRA 3VFZA 2DT5A 3WE3A 3R6UA 3BDDA 4P96A 3TKYA 3THIA 3R26A 1QPMA 5AA3A 3HN0A 4LQ5A 1USSA 1F9NA 3H6WA 3HRUA 5L3BA 4H5GA 4MLQA 2FMYA 4GD5A 4F31B 2YSRA 2RKHA 5I57A 1OYYA 2HYGD 1J2XA 3QIMA 3E13X 1MJAA 1ZG1A 2F36A 2K7LA 4Q30B 3QYTA 3BPXA 4PDKA 1D3YA 1LFIA 1XGMA 1Z7UA 1MG1A 4IF4A 2KIUA 1HSJA 2ZNZA 3WGHA 1Z9CA 1B6AA 4IO3A 1LDDA 2QYOA 2VN2A 2V9VA 1H3DA 2H94A 3FVOA 1VR5A 1HSLA 4L0YB 1IXRC 3LR1A 2IRFG 3CG3A 4KMFA 2XRNA 1OMIA 4GRKA 2BV6A 1MQHA 2CWEA 5ICCA 1KGSA 4G6DA 3WTXC 4XKQA 4RB0A 3EN3A 4MLVA 1MQJA 2OA4A 5LOMA 2EV5A 5TP9A 2QZ8A 2Q2AA 3KEIA 3LQRA 1P4AA 3IRQA 3U2RA 4YB6A 3JAMK 3EF7A 1KA8A 2FEZA 5CMMA 3GFMA 3I59B 1U6GA 2GZWA 2XX9A 3MVYA 1P4XA 3QAHA 2ZYMA 1NHAA 3R6SA 3JTHA 3TKDA 3FV1A 5E8GA 1O3TA 4N13A 1VFDA 3FX3A 1KYWA 4IXAA 3IRRA 1SFXA 1ATGA 2ZXTA 1LCTA 5AIPA 2RC7A 4UVAA 2MBFA 1TWYA 3NEUA 2XXUA 2A68F 1ZH5A 5B7DA 2GH9A 1O3QA 1A7LA 1H44A 3RTFB 2HTJA 3G3GA 1QZZA 2K27A 3DP7A 1I6QA 1XOCA 2FYIA 4DIGA 3GBAA 2P5KA 1JEUA 5K2XA 3FJ7A 3K69A 2QM3A 3MEXA 2A6EF 2XHKA 3VEPA 4XKRA 3I4PA 3FWEA 4EQQA 4F7ZA 2A5TA 1U5TB 2CQKA 2P7VB 2H4IA 4F1UA 4A0ZA 4KPTA 2XROA 3ZP5A 2CG4A 2F97A 3QP6A 4G8HA 3GWZA 1BJAA 4BAYA 1I6BA 1MY3A 4WXCA 4ND9A 1QZYA 4LLNA 2MH2A 1LB2A 4PCQA 3PFIA 3WODF 2PMUA 3FM3A 5H8FA 3L6HA 2EFNA 3KEOA 1JVYA 1B3FA 4H65A 2XXQA 5CMBA 2PFBA 4F39A 2E1NA 2GIVA 2OQRA 2AL5A 4G9YA 5EYFA 2FNAA 2GXGA 1M5EA 4LONB 3TTMA 3FXUA 3OV8A 4WEDA 4FHTA 3MWMA 3TDZC 4ZZLA 4B09A 1USYE 4OWDA 3FUZA 1U5TC 4H0EA 4AB5A 2NYXA 4OMBA 1O7FA 1ON2A 1PDAA 4ECFA 4ZE9A 3KZYA 4G94A 1BM9A 4O5VA 4XSZF 3V8XB 1T39A 3W9WA 5CVRA 4JWOA 3R4KA 3MVZA 1YO5C 2P5LC 1MY4A 4OMYA 2ACJA 3H6UA 1L5TA 4LJZF 4L9TA 4EJTA 3ZQ7A 5A5XA 1IAWA 2V25A 4IRGA 1EH8A 2O3FA 1S7OA 4YFXF 3QOPA 5LBQA 2VP1A 4GOTA 1STZA 1P6RA 4NF4A 4XLNF 4U2RA 1RUNA 2EFOA 1IN8A 3K1PA 2QMWA 5ICTA 4ZEDA 3CJNA 3LAJA 4P11A 3G3FA 2ANJA 1QUIA 1GV8A 2W84A 3S2VA 2IT0A 2RN7A 3DFGA 4M1VA 3DM0A 4IY6A 4FATA 3S9NC 2XIGA 5A2QK 1AH5A 1H9TA 4HS7A 2XX7A 4HW8A 5J8FA 3MW0A 5DCMB 4KDPA 3C7JA 5K5RA 2OBPA 2UWMA 4UV8A 4YAHX 1QBJA 3VDFA 3MFKA 4FEBA 5BOXA 2WC2A 3IB1A 3B73A 1S7AA 2G9WA 1AOVA 5I2NB 2FSWA 3MZ9A 3GO5A 1MXUA 1FTLA 2P7CB 3JW4A 2Q8KA 5I2KA 5ICEA 1D8JA 3K2DA 2OAZA 2BGCA 5JR3A 5ITPA 4NF6B 3V89B 1OQGA 3ROUA 4YIIA 2UYFA 4RXLA 3RYPA 2Z99A 3Q5FA 3EPEA 1TW3A 4KIGA 4L9JA 1B9JA 3RIRA 1LAXA 2HR3A 5E17F 2HXWA 1CF7B 4UXNA 4YB5A 4P9FA 2I49A 3IC7A 1Z7NE 1DMBA 4YKPA 2A61A 1MQGA 1HQCA 2O7UA 3U72A 4R79A 3WG9A 3P7IA 3VLWA 1FP1D 1ZYRF 4I62A 3HV1A 4PP0A 3QRFF 3JSOA 1ZIUA 1O57A 2DVCA 1TLHB 2CW0F 2V1XA 3M8FA 1Y20A 4HF2A 1B59A 3OMBA 2BBYA 4EF1A 2QS1A 1ONVA 4OIQF 4GCVA 3WTTC 3VLUA 4ETSA 2BE5F 3B6QA 2O69A 2B65A 4N07A 1B7HA 1W7PD 3BPVA 2PJPA 3UK4A 2V93A 2XHDA 4OU0A 1R5GA 2RGVA 1XC1A 2I4BA 1JGSA 2NUVA 1IZ1A 5DT6A 4GYIA 2PYYA 3KCCA 4I98B 2KKOA 3M7GA 1XMKA 1DPRA 1B1BA 1H76A 4H8IA 1YS6A 2GHAA 1BC7C 3MUQA 4G7ZF 3J7AO 3E6CC 4MTEA 1JW4A 3N6UA 2FNPA 1SDXA 1ZG5A 3PQKA 1XVYA 3SESA 3EYIA 2Q2EA 4FEDA 1H9GA 1XN7A 3H03A 3I71A 3CSGA 1R22A 2FE3A 4R2BA 3FXRA 1U3EM 1IXIA 2QSXA 2ZKZA 3IL1B 2EFPA 2ZMBA 3O6IA 2CFXA 5DUKA 4CHUA 4A0YA 1O3RA 4KYEA 4A5NA 1B4HA 1QJMA 4RJZA 2DFIA 3DLNA 4ZYDA 2W7YA 3O97A 2FBKA 3DPLC 5TJJA 5L3FA 5HM4B 5FO5A 4ENNA 4JBAA 4KICA 2V79A 1MS7A 1FLIA 2FU4A 1CE2A 5FTHA 1IUDA 2DTRA 4RK9A 1XGSA 1PC3A 2DXYA 4QFPA 4PFYA 5ILUA 2TDXA 5D4SA 1B5JA 1MXVA 2I4CA 2X7QA 1WI9A 4HQMA 4OETA 2THIA 3FJMA 2L02A 2Y48A 4L18B 2DQRA 3DV8A 3PPPA 3NQOA 3K6VA 4TV7A 2PT1A 4KHZE 3L6GA 3H3UA 5FHMA 1SVXB 5FD6A 4KUMA 4RPOA 2DW4A 2HAVA 1OQHA 2Q89A 3SEYA 3IJOB 1YCJA 5HLGA 2WTEA 4LZ8A 2FNCA 4HX8A 5F1QA 4M9ZA 3K9TA 1XSXA 2MH9A 4HLXA 5DV5A 1KU3A 2QL3A 3I64A 3ECHA 4WXJA 3IJXB 4QFKA 2IA2A 4PETA 5DVIA 5I58A 2D21A 3O6HA 1R9QA 4WCGA 4H6DA 4IY5A 1MQDA 3WTYC 2CYYA 3B02A 2D1HA 3MWBA 4GL0A 4EVIA 2A5SA 3PPRA 3CUQA 1MY0A 2ADUA 3F6VA 4F18A 3HSFA 3ODBA 1GR2A 1PB8A 1IRGA 3O3KA 1JHFA 1QGPA 1BI0A 4YKKA 3KFWX 4A6DA 1NNTA 1UB9A 1BP5A 3C34A 1Z05A 2W57A 3CFZA 3IWFA 4C1UA 3VVFA 5DEXB 3R60A 2OQGA 5K5QA 2P2AA 1X3UA 5HDGA 5BMZA 2K02A 2QMXA 3VXCA 2PMHA 3F22A 1T6SA 1W5SA 3HO7A 2PQ8A 1AMFA 1ZMGA 1UHWA 1TFDA 3OD7A 1XCVA 1A8EA 3MBPA 2HZTA 1FOKA 2Z33A 5JVTA 4B8XA 5A2QZ 4N9HA 2EB7A 1WQ2A 5FTIA 1MXYA 1PB7A 4MBPA 1OPCA 4TLMB 1Y3NA 5LGTA 3F8MA 3ZN0A 1NNKA 3LBSA 4ON0A 4THIA 5AA4A 1LGBC 4MH5A 2UXNA 5EEGA 2Z8FA 1RNLA 4DE8A 2DU9A 2IA1A 3KP3A 3BP8A 4H0WA 5TRDA 3V4GA 1XB4A 3Q9SA 3MAMA 3PPNA 2NWJA 4KN4X 5ICQA 3BJAA 1YIOA 4C0RA 4WK8F 4BHPA 3OO7A 3LA7A 4A2UA 3RTRA 3B6TA 2CGPA 1EV7A 3T5XA 3CG1A 3DKWA 1ZAOA 4XKNA 5HS9A 3T9HB 3KSXA 3OELA 2JT1A 3W6JB 2RC9A 2L54A 3GZ6A 2B3BA 5M2VA 1I1GA 2MD5A 5HDNA 2STWA 1G3WA 4HCYA 1XGNA 1MQIA 2DWIA 1M5DA 3BWGA 4NF8A 3KLNA 1YFHA 4Q8RA 1N7XA 4ZDMA 3FHZA 1Y1ZA 1SD5A 4LATA 4WKMA 1IXCA 2ZCWA 5JHUA 5FLXZ 2F5EA 3Q26A 3MC2A 1I1SA 2O51A 5LLQA 2NAZA 4DXUA 2ZYKA 1B2HA 4Z2YA 3WU0A 3P9IA 1FTOA 1LJ9A 4RA1A 1UTHA 2XAQA 4OOIA 3HOSA 3IK6B 2DVZA 3EQLF 1T0KA 4X48A 2QBYB 4H8JA 4F22A 1W7PB 2KLFA 1PUEE 5F64A 1R00A 5ILVA 1XDUA 4LGWA 2STTA 3G3HA 4ELRA 5E8IA 4OIRF 2ZMEB 4FE8A 1PP7U 4XTCQ 4G68C 2XD3A 3C4MA 4LD5A 3GF2A 1I27A 3V7RA 5EHMA 1TT1A 3ULQB 1HKQA 4HDVA 2G29A 3IR1A 1KQ0A 3H6TA 1RKMA 2W25A 2XKPA 4CICA 4QRZA 4A0XA 3MVWA 2YR2A 5E1ZB 4I0BA 3QXMA 1SD4A 3BJ6A 4LK1F 4LLGF 1HBXG 2QS2A 3PD8A 3SZTA 2WV0A 1A40A 4R9GA 3GUDA 3PMXA 3EHSA 3WTSC 4HW0A 2KRFA 2DE2A 2WWYA 4XSXF 2D5WA 2XX8A 2RKMA 5ED4A 4NEDA 3KN7A 5I56A 1Q1KA 2GHBA 2C6YA 2K86A 4P55A 1DPEA 1ZLKA 4UACA 3HSEA 1JQFA 2V1UA 1ZHFA 3KG2A 4KA4A 3SFZA 4LG0B 3RPUA 2NS0A 5H6RA 3I59A 3BFUA 4ELPA 1FYLA 1KWHA 4M72A 3IOVA 3RJPA 3CO7C 2LF7A 3N94A 2QRYA 2F7CA 4LQ2A 2DE3A 3CSBA 3E4RA 3A09A 1YYVA 3H4ZA 4WXHA 3D4CA 4MQ9F 1TNSA 3CFLA 1J5YA 4QFNA 1IN7A 3V8KA 5HVQC 2Z8EA 4RB3C 2FA7A 1JVXA 3F11A 1UHMA 3TCGA 4QSDA 1O63A 3L7WA 3MZYA 4Q5SF 3VODA 3FVGA 1JXSA 3ABUA 3MP6A 4O6JA 4G4PA 5ISUA 5JK4A 1LCFA 4RAZA 3IOUA 3T8TA 4U4SA 5H8HB 2M87A 4EJOA 3UA8A 1NNPA 6PAXA 4ENMA 2F5DA 1A54A 2AXLA 1SYIA 4G6QA 2DQVA 4EJUA 3GZ5A 3M3KA 5JTYB 3AXFA 1AWCA 3IORA 1AOYA 4RNSA 2VOPA 2XGXA 3G7WA 4ELQA 3RT8A 4PFTA 3S9MC 1YTVA 3U1DA 5IKBA 4NWDA 5E20A 2OJTA 3FD3A 5BPDA 2F2EA 4Y13A 2HOEA 3M1EA 5CLSA 1SI1A 5CMKA 4L9NA 2QQ9A 4YKIA 3H3GA 2UXXA 2IA4A 1B0LA 1YW9A 4I1DA 3L2CA 3C31A 4Q5TA 2KJCA 2E7WA 3WAFA 5ERIA 2QS3A 1PEBA 1FSEA 2DSFA 2O6GE 4RYAA 1ZJLA 3IOTA 4E70A 1SD7A 2LNBA 2VT3A 3I0TA 3DEUA 3C18A 4P5OA 1BTJA 1WSUA 4YB7A 3W15C 3VFJA 1LVAA 5L9MA 5IT3A 2QJEA 1WKMA 4DQ2A 1HW1A 1KU7A 4OZ9A 3V5AA 3COAC 1EZ9A 4S04A 4GO1A 1LFHA 1FTMA 2XXIA 3RUMA 5IT9Z 1P2FA 1QKBA 2WKYA 3GYHX 1GVJA 4G7OF 1HW2A 1FBQA 3I3VA 4HF1A 1RYXA 4P0GA 5CMCA 1LEAA 1N7WA 4R74A 3V83A 3FMQA 1URSA 1TNTA 4RGXA 4LFUA 1DOTA 3TMGA 2F6PA 1S50A 1NNFA 3Q27A 5I57B 1MM6A 3RYRA 3S4UA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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