3HHGA

Structure of crga, a lysr-type transcriptional regulator from neisseria meningitidis.
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
KTNSEELTVFVQVVESGSFSRAAEQLAMANSAVSRIVKRLEEKLGVNLLNRTTRQLSLTEEGAQYFRRAQRILQEMAAAETEMLAVHEIPQGVLSVDSAMPMVLHLLAPLAAKFNERYPHIRLSLVSSEGYINLIERKVDIALRAGELDDSGLRARHLFDSRFRVIASPEYLAKHGTPQSTEELAGHQCLGFTEPGSLNTWAVLDAQGNPYKISPHFTASSGEILRSLCLSGCGIVCLSDFLVDNDIAEGKLIPLLAEQTSDKTHPFNAVYYSDKAVNLRLRVFLDFLVEELG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The structure of CrgA from Neisseria meningitidis reveals a new octameric assembly state for LysR transcriptional regulators
pubmed doi rcsb
molecule keywords Transcriptional regulator, LysR family
molecule tags Transcription regulator
source organism Neisseria meningitidis serogroup b
total genus 69
structure length 293
sequence length 293
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3hhgA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3hhgA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3hhgA02
2NVUB 3M1EA 2G93A 3TO7A 3MZBA 2XV4S 5HDKA 3IRQA 1IXRC 2H5YA 3S4UA 4ECFA 5AA3A 2ZCWA 4IY5A 4U88A 4OEUA 4UVCA 2EFNA 3WU1B 4DZ1A 2V1XA 2V3QA 3AAFA 3LQQA 5LEJA 2V1UA 3GFMA 2D3IA 2VHAA 2X26A 3OENA 4QSCA 1SD5A 2L01A 4PFTA 4RB0A 2GRVA 2B3FA 2GIVA 4ZEDA 4UHTA 4TQUQ 1P4AA 4IVNA 3DF8A 1WQ2A 4PFWA 5LBQA 1BC8C 3HTUA 2DQLA 3ECHA 2EFQA 2HAUA 3N6UA 3C35A 3ONMA 2VONA 5LLQA 1N76A 1K78A 3L9FA 1AOVA 5H8NB 2R9JA 3T8RA 4LLNA 3V4GA 1RZ4A 2NOOA 3TMGA 2DXYA 1QZZA 5DD8A 4EF1A 1MDMB 1S50A 3G3KA 4NF4B 1FP1D 1QO0D 3GZGA 5AA2A 3OSQA 1Z05A 4ESJA 1Y3PA 1Z7NE 2ANJA 4HOBA 5LHHA 2EA4A 1FBSA 4E70A 1B59A 1SYIA 3HO7A 1GVCA 2O7UA 3PU5A 3SZTA 4AD9A 3GZ5A 1PDAA 2Q88A 2KJBA 4KIBA 3HN0A 3HUGA 3IWZA 3BJOA 4XKQA 3A3CA 1FQDA 3VLVA 5DCMA 4FIMA 3CG3A 3MCZA 1FBUA 3TKYA 4DCYA 2UXNA 5EHMA 1LEAA 4DQ2A 2ESNA 4JBZA 3TZAA 1T98A 3OV8A 1M5CA 1FW0A 3KSXA 3T1BA 1UB9A 3T5XA 3FIRA 1R23A 4TOZA 1IRGA 5H8QA 2CWEA 2DYXA 3IO6A 2VBYA 4GGGA 4YAHX 5DTBA 4LP2B 3VDFA 3DKWA 4HYEA 2UYFA 3O6BB 2HCAA 4S05A 2D21A 1ONVA 5JI6A 3FM5A 1B4HA 2AXLA 1P2FA 1YQAA 4NE4A 2D2WA 3FD3A 1A8FA 4F1UA 3ZP5A 4FEBA 5K2XA 1AIVA 2DS9A 3HCQA 5FFZA 3MVZA 4GFRA 2AL4A 4HX4A 4L9NA 3TO9A 3IOWA 1YLFA 3NRVA 4Z0IA 4IO4A 5H8HA 3WTTC 4NF5B 3CG1A 2O7IA 4NTLA 3FMSA 2IJLA 2HGCA 4G6QA 2HXWA 3PPPA 3TELA 2CFXA 1FBQA 2P6TA 3R7XA 4DNCA 4CDGA 2A5TB 1SW2A 3F8NA 3B7DA 3FVNA 2RCBA 2KRFA 5LRSA 1VFDA 3PMVA 5D4RA 1IN8A 1B9MA 3KE2A 1XCVA 3QAXA 3H7MA 1E17A 4LZ7A 5L3GA 1US4A 4GYGA 3DPLC 1YW9A 4GVOA 2Z5UA 1WDNA 2YSRA 4YKJA 3ZKLA 3SHFA 3A3UA 1G3TA 2ISYA 1TQIA 2QWWA 2M30A 1ZBMA 1B3FA 1FYKA 4BLAA 1Y0UA 4RK2A 2JPCA 3RTFB 3TPAA 4MEYF 3KP7A 1NKXA 1P4XA 4UNOA 3GWZA 1Y20A 3GUDA 2AL5A 2FU4A 3HRTA 3IK6B 3G3GA 2OJTA 1I69A 3VFJA 2IPQX 3WGGA 4R6HA 3F3XA 3FF5A 3D0SA 5ICQA 3M9AA 1YYVA 5BQTA 4F31B 4YFKF 1BI1A 4KA4A 3GO5A 3U8QA 1SFEA 5K5RA 2IW5A 2P0SA 1TWYA 4G8XA 4UACA 1QKBA 1J5YA 3CDHA 1UTBA 3T8TA 1ULYA 4NHJA 4L17A 1A8EA 2F34A 3CSGA 4ZH4F 2ZNUA 1YS6A 5F7VA 1AL3A 4L18B 4F1VA 2P1SA 3CIJA 1Z6TA 2Y84A 1LVAA 4HQMA 1G4DA 4OFOA 3TQNA 2OBPA 3BY6A 4O3MA 3J80Z 1XSDA 2R3SA 2XXYA 3N5LA 2DBBA 3KOSA 4YKIA 4QFPA 1T38A 3I54A 4MLQA 1NHAA 2F6GA 3QP6A 5IT9K 1B7UA 3SFZA 4EJUA 3RPWA 2I48A 5D5UB 1PDNC 3EQ1A 2DVCA 3T22A 2O8XA 1OQHA 3KP3A 4YIIA 2GWRA 1J59A 1MS7A 3GEZA 1WSUA 1W5SA 3E9XA 1LFGA 2EV0A 1FTLA 3CTAA 5D6EA 2PLYA 2OWTA 2ZKZA 2DLLA 1Z9CA 4QFNA 4HF0A 3JTHA 1DPUA 2RCAA 3CLOA 5K1YA 4XTCQ 5HS7A 3K6VA 4MF3A 2DK5A 4U0WA 1IN7A 3P9KA 5TJJA 4HQEA 2M8EA 3T66A 1R5GA 2KJCA 3O2AA 4YKKA 4LLGF 3D5LA 3TFLA 5DVIA 2GH9A 1H76A 4P9FA 4KYWA 4HLXA 2NNYA 1XD7A 1B5IA 2IA0A 4FAJA 2KIMA 4I7HA 1USSA 3U1DA 2BJJX 5JEIA 4QRZA 3L2CA 4F19A 1BBYA 4KMFA 3BOQA 4YFNF 3MP6A 4AQ4A 2HTSA 1AMFA 2HEOA 1B3HA 4EJOA 3EN3A 2IA2A 2DK8A 2WWYA 3H3ZA 3G3IA 3MPLA 4THIA 3C33A 1AOYA 1H3DA 3PPNA 4QWQA 2RC8A 3MEXA 5L3FA 4O6JA 3FJGA 2XASA 1D8JA 1K78B 2M45A 2QS3A 4I02A 4FEDA 3V8JA 3V8KA 2O84X 4GLIA 4RJZA 3TTRA 3WE2A 4CZZA 2R71A 5CVUA 3IRRA 5AA2B 1JQFA 4L9JA 3C3WA 3W9VA 1EH8A 1M5DA 1ZIUA 3RJPA 3MVXA 1SMYF 2C6YA 6PAXA 4EF2A 4H1XA 4ETSA 1IQ7A 2H6BA 2F5CA 3ILTB 2XD3A 4Q0CA 3K1PA 4M9XA 2UVHA 5DV5A 2L4MA 4L9VA 1O64A 1F9BA 3L6HA 1ZU0A 1D9VA 1R58A 3ECOA 2ZMBA 4C1TA 3PPRA 1B6AA 1ZLQA 1IW7F 1U6GA 4G4PA 1FT9A 4OYVA 2FA7A 3KJTA 1DSNA 3MFKA 3N6TA 4X1DA 1HSTA 4HW8A 3TOBA 1G3YA 2PMHA 3GFLA 1FZPB 1MH3A 5HM4B 5JTYA 1OIBA 4F29A 1ZYRF 3J81K 1A55A 2DT5A 5E8GA 2W7YA 1II5A 4PCQA 1V3FA 3LA2A 1NNFA 2O1LA 4QFOA 1PC3A 5JFRA 4QF9A 3IL1B 2Z8FA 4YG2F 3RIRA 1IITA 1G3SA 3I59A 1YCJA 1HXDA 2QM3A 5BPIA 4N6PA 1LBCA 3WTZA 5IAIA 1FSEA 3E5XA 1RIOH 1P99A 4NQWA 1LEBA 3BKIB 1J1NA 1S7OA 4HBLA 1MJAA 3GVAA 4XIGQ 4HCYA 2OWSA 3E5UA 4LG0A 3NQOA 2Y7PA 2JT1A 5H8HB 3SZPA 4GL0A 5H8NA 3S2VA 4RB3C 1FYMA 1YFHA 3E97A 2P2AA 2L4AA 5F64A 1YG2A 2L02A 5CVVA 1R36A 4NF8A 1QNTA 2P8TA 4CGZA 1M5FA 3WU0A 5J8FA 3K00A 3IO4A 4M6YA 1S7YA 2QRYA 5HLIA 4UXNA 1BOAA 3QOPA 3V7SA 4YIFA 4F2OA 5D5XB 1R9QA 3OEKA 1GV8A 4ZEIA 3MVYA 3IOTA 1A04A 2LF7A 4KN4X 3TEPA 1UHMA 1BI2A 3VB2A 2REJA 2G7UA 2FBIA 1BI0A 1EU8A 2DPUA 2XXIA 2A6HF 2CMOA 1R1TA 1B46A 2FA5A 3HSRA 1D5VA 1SD3A 1VR5A 3IORA 4H5GA 4UUVA 1SFUA 2P7VB 4YKPA 3V83A 2EV6A 4JWXA 3ZN1A 4IB2A 3EPEA 1REPC 2PVUA 4K3FA 1BI3A 4TLMB 2R7FA 3OEMA 2ETHA 4EQQA 1URDA 2Q8KA 2QENA 3WE3A 3B6QA 3FM3A 3LSLA 3MAMA 3SERA 3Q26A 1FYLA 1UTBB 1W7PB 2VD2A 4G8MA 4NF6A 2XXWA 1ON1A 2VBZA 1KQ0A 2PBIA 1T0KA 2NUVA 2Y7IA 4GXSB 4HW0A 2H94A 4MQ9F 4FX4A 1H9TA 3QK6A 5H8SA 1MD0A 4GL8A 1QGPA 3T9XB 2VBXA 2MD5A 4GWOA 2STTA 3QIMA 4QSDA 2VP1A 3R26A 1OYWA 2I0CA 2X0LA 4KUMA 1IXGA 1KU2A 3F23A 5E20A 3RN8A 4GXOA 3T9UA 3FXUA 3H03A 3MWBA 3VXBA 2MA3A 2XRNA 2BBYA 3WAFA 2L3DA 1N3WA 5TP9A 2PJPA 3UORA 3U9GA 1I1GA 3QYTA 1IXIA 2G29A 4KD5A 3O66A 4R73A 4H0WA 1BIYA 3R60A 3ILUB 4F3GA 2ONKE 2K02A 1QBJA 3KSJA 1UFMA 2E7WA 3KEOA 1YW7A 3F21A 5H20A 2UXAA 2FMLA 3O3KA 1IXHA 4LQ5A 3TTKA 4LVQA 3BP8A 5L9SA 1QULA 3ZN0A 3KN3A 5IT3A 3I58A 2PN6A 2LAOA 4ZZDA 4AIJA 1POY1 2ZBKA 1GVJA 1D3YA 1FY7A 5FD5A 4CYDA 4EGYA 1F1ZA 2OD5A 3ELKA 5CVRA 3ZMZA 1KYWA 3H3GA 3VV5A 2A3SA 3KG2A 3CI8A 3L09A 4G6DA 1MKMA 3KGCA 3TTMA 5FGMA 2M5WA 4OXVA 1HKSA 4O3AA 3VVFA 2DWHA 1GTKA 1IN6A 1YO5C 4JB7A 2OK2A 1Q1KA 3DEUA 2V6CA 2RKMA 3JYRA 2B3BA 3Q28A 5FHMA 3J81Z 3DXJF 1N04A 1ZRFA 3RT8A 3LSWA 4OTEA 4XKNA 3HRSA 4FE8A 4IPAA 2IA1A 4HV6A 1P1QA 3QUFA 4HX7A 4A12A 2ADUA 2GFEA 1XGMA 3EYYA 4N0BA 2HQNA 2RF1A 2PT1A 2NWJA 1TFAA 5CM6A 1IF1A 2JZYA 2A61A 3HRMA 3V5AA 4OOIA 4U0YA 3SESA 1I27A 2Y7WA 4R8HA 3N97A 1HKTA 3JSPA 2K4BA 1MQIA 2A07F 3SDFA 1LDJA 3V8XB 3MJNA 4I1DA 1XGNA 2XXTA 3VXCA 3K2ZA 2GZWA 2OAZA 5DCFA 1MPCA 4ZE9A 3PPQA 2QUFA 3PUXE 2E7XA 1B4ZA 1ZGAA 2HFHA 3UP9A 5KZTA 1R1NA 5TRDA 5D5WB 1B7ZA 5JTYB 5AA1A 1BM9A 1O63A 4XKRA 3MPKA 3ZQ7A 3K4UA 3O6GA 3CFXA 1KU9A 1D9YA 3P7IA 4XBFA 5AA4A 3MZ1A 4A2UA 4MTEA 1CF7B 1LAGE 2HYGD 2VBWA 2PT2A 3IB1A 4RGSA 3RKYA 1OVTA 4IO6A 1BLFA 2W84A 3WGHA 1KYZA 5LGTA 2E1CA 1IUYA 3I59B 1MDQA 1PP8F 1B7HA 3H4ZA 3ZMUA 4RGXA 3FHZA 3RPUA 3MP1A 3VFZA 1SD4A 4OINF 1Z7ME 1SQYA 4PFUA 4LG0B 4KQPA 2DXRA 2O51A 3DV8A 4ENKA 2EWNA 5BS6A 1LAHE 3KOTA 1R9LA 1JHFA 2O1MA 4IO3A 3RTWB 2J5PA 3ABTA 3PV0E 3SEUA 5A5XA 2A5SA 2NRAC 1T39A 1OQGA 5TPAA 2G7HA 4IO7A 2FRHA 3F8FA 4NF8B 4QSEA 1A99A 3RDIA 1IXCA 4ASNA 2OBGA 4PZJA 4P5OA 2FBHA 2Z9OA 4KI0E 1OLAA 3W6KB 3BBRA 1H0MA 4Q5TA 3FMQA 2HOEA 4LLLA 1FQFA 4XSZF 2STWA 2DOJA 1KWHA 3S9EA 5CI5A 2QS2A 1KU7A 1SDXA 4IO2A 5I56B 4P96A 1MXVA 1OYIA 4KN7X 2EJRA 3WODF 4F18A 3LAPA 3RY3A 2K7LA 4BH9A 1XT8A 2A69F 4HZFA 1BC7C 1JXSA 1AWCA 1XN7A 4OHNA 1MM6A 3LSTA 4QHQA 1ZLKA 1F5TA 2XXPA 3JSOA 2QSXA 3QP5A 1RYXA 4POWA 2F5EA 4RPNA 3VVEA 2VOPA 1OVBA 4NF6B 3WAEA 4DXCA 1LQ1A 2XAHA 2YLNA 5JR3A 1OR7A 2P5KA 5LGNA 2CYYA 1H45A 1Q1HA 3PD9A 5DYHA 5L9OA 2GA2A 3KN8A 5D5VB 3F22A 2CG4A 3LBSA 4NB5A 4ELQA 4U4XA 2V9VA 2RQPA 2BEOA 4BDQA 4IHSA 4PP0A 4GO1A 1ZG1A 3TCHA 1WRJA 1T6SA 3TDUC 3OOPA 4ZYGA 2D5WA 3FVOA 1JGSA 2ONSA 3TCFA 4LK0F 5ITPA 2B0LA 1ZAOA 2FE3A 3GLXA 3LR1A 3WTSC 3PUZE 4BYYA 2VT2A 4KMUX 3HTSB 4OETA 2IEEA 3VEPA 3SEVA 5TP9B 2EB7A 4Y15A 1LB2A 1Y9UA 4P0GA 3WTXC 2Q9TA 4KIFA 4ZYEA 2I4CA 4TLLB 4E0WA 1B5JA 4OU0A 1NNPA 1B9JA 4AB6A 1ATGA 3KEQA 5J6XA 3SXYA 4LQ2A 4GIZA 3M3KA 2Q2EA 4IJAA 4F1YA 5HBCA 4EVIA 2Y75A 1NMUA 2IVMA 4KCDA 3HOTA 3GFIA 1P1NA 3FVKA 2LF8A 2YR2A 4OMBA 1LLSA 4PGGA 2ZNSA 4EV0A 3FATA 5D6FA 2FXAA 2Q89A 3C34A 2UVJA 2LKPA 2IA4A 3GXAA 2O3FA 3C18A 3K1MA 4F7ZA 1W7PA 4AB5A 2HKOA 3GFJA 4C1UA 1TNTA 4CICA 2ZYNA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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